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Simulation of the branch biomass for Chinese fir plantation using the linear mixed effects model.

利用线性混合效应模型模拟杉木人工林枝条生物量


基于福建省将乐林场45株人工杉木解析木的572组枝条生物量数据,采用线性混合效应模型方法,建立杉木人工林枝条总生物量和枝、叶生物量的预测模型,并利用独立样本数据对模型进行检验.结果表明: 线性混合效应模型比传统多元线性回归模型的拟合精度高.不同随机效应参数的组合,其混合模型的精度不同.考虑异方差结构的混合模型能够消除数据间的异方差性,其精度更高,其中,对于枝条总生物量和叶生物量模型,以指数函数作为异方差结构时的模型精度最高;对于枝生物量模型,以常数加幂函数作为异方差结构时的模型精度最高.模型检验结果表明:对于杉木人工林枝条生物量预测模型,考虑随机效应和异方差结构的线性混合模型的检验精度比传统多元线性回归模型的精度有明显提高.

Based on data obtained from 572 branches of 45 Chinese fir trees in Jiangle Forest Farm, Fujian Province, southeast China, prediction models for branch, foliage biomass and total branch and foliage biomass of individual tree were developed by linear mixed effects (LME) method, and tested by independent samples. The results showed that the LME models provided better performance than the multiple linear regression models for the branch, foliage and total biomass prediction of Chinese fir plantation. The LME models with different combinations of the random effects parameters had different fitting precisions. The LME models including variance structures could effectively remove the heteroscedasticity in the data and improved the precision. The LME model with the exponential function as the variance structure had better fitting precisions for the total biomass and foliage biomass models, and that with the constant plus power function as the variance structure had better performance for the branch biomass model. Model validation confirmed that the LME models with the random effects and heteroscedasticity structure could significantly improve the precision of prediction, compared to the multiple linear regression models.


全 文 :利用线性混合效应模型模拟杉木人工林枝条生物量∗
许  昊  孙玉军∗∗  王新杰  方  景  涂宏涛  刘素真
(北京林业大学林学院, 北京 100083)
摘  要  基于福建省将乐林场 45 株人工杉木解析木的 572 组枝条生物量数据,采用线性混
合效应模型方法,建立杉木人工林枝条总生物量和枝、叶生物量的预测模型,并利用独立样本
数据对模型进行检验.结果表明: 线性混合效应模型比传统多元线性回归模型的拟合精度高.
不同随机效应参数的组合,其混合模型的精度不同.考虑异方差结构的混合模型能够消除数
据间的异方差性,其精度更高,其中,对于枝条总生物量和叶生物量模型,以指数函数作为异
方差结构时的模型精度最高;对于枝生物量模型,以常数加幂函数作为异方差结构时的模型
精度最高.模型检验结果表明:对于杉木人工林枝条生物量预测模型,考虑随机效应和异方差
结构的线性混合模型的检验精度比传统多元线性回归模型的精度有明显提高.
关键词  枝生物量; 叶生物量; 线性混合模型; 杉木
文章编号  1001-9332(2015)10-2969-09  中图分类号  S758.1  文献标识码  A
Simulation of the branch biomass for Chinese fir plantation using the linear mixed effects
model. XU Hao, SUN Yu⁃jun, WANG Xin⁃jie, FANG Jing, TU Hong⁃tao, LIU Su⁃zhen (College
of Forestry, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China) . ⁃Chin. J. Appl. Ecol., 2015, 26
(10): 2969-2977.
Abstract: Based on data obtained from 572 branches of 45 Chinese fir trees in Jiangle Forest Farm,
Fujian Province, southeast China, prediction models for branch, foliage biomass and total branch
and foliage biomass of individual tree were developed by linear mixed effects (LME) method, and
tested by independent samples. The results showed that the LME models provided better perform⁃
ance than the multiple linear regression models for the branch, foliage and total biomass prediction
of Chinese fir plantation. The LME models with different combinations of the random effects parame⁃
ters had different fitting precisions. The LME models including variance structures could effectively
remove the heteroscedasticity in the data and improved the precision. The LME model with the expo⁃
nential function as the variance structure had better fitting precisions for the total biomass and foli⁃
age biomass models, and that with the constant plus power function as the variance structure had
better performance for the branch biomass model. Model validation confirmed that the LME models
with the random effects and heteroscedasticity structure could significantly improve the precision of
prediction, compared to the multiple linear regression models.
Key words: branch biomass; foliage biomass; linear mixed effects model; Cunninghamia lanceolata.
∗引进国际先进林业科学技术项目(948)(2015⁃4⁃31)和林业科学技
术推广项目([2014] 26)资助.
∗∗通讯作者. E⁃mail: sunyj@ bjfu.edu.cn
2015⁃01⁃07收稿,2015⁃06⁃17接受.
    森林生态系统是陆地生态系统的主体,其在维
护全球生态平衡和减缓 CO2浓度上升等方面具有重
要作用.森林生物量作为森林生态系统结构和功能
的基本特征之一,受到世界各国越来越多的关注和
研究[1-3] .树木生物量作为森林生物量的重要组成部
分,一般包括干、枝、叶、根 4个分量,虽然枝、叶生物
量所占比重较小,但由于枝条(分为枝、叶两部分)
是树木进行光合作用的主要场所,对其生物量的全
面了解可以更好地研究森林生态系统生产力以及树
木干物质的积累.
目前,常通过建立生物量模型来测算森林生物
量[2,4-5],其基本原理是用简单的林分或林木因子
[如胸径(DBH)、树高(H)等]建立线性或非线性模
型推算树木的生物量.建立这些模型所采用的数据
多是从不同样地或不同林木中,通过树干解析及枝
条解析方法[6]获取,数据之间普遍存在相关性,而
应 用 生 态 学 报  2015年 10月  第 26卷  第 10期                                                         
Chinese Journal of Applied Ecology, Oct. 2015, 26(10): 2969-2977
且由于样地之间和林木之间也存在相关性,使得所
建立模型的误差无法满足正态分布且相互独立的条
件,因此,利用最小二乘法(OLS,其前提条件是假定
误差均服从正态分布且相互独立)建立的模型势必
会降低模型的预估精度.为更精确地预测树木生物
量,一些学者利用 BP 神经网络[7]、相容性模型[8]等
建立树木的生物量模型,虽提高了模型的预估精度,
但无法反映各单株树木之间生物量的差异,而混合
模型的发展为生物量模型的建立提供了新的研究方
法.混合模型是由固定效应和随机效应两部分组成,
固定效应可以反映研究对象的总体变化规律,而随
机效应与总体中不同个体的变化规律有关[9-10] .混
合模型的发展为具有层次性和随机性数据的拟合提
供了有效方法.由于这种优势,混合模型已经被广泛
用于林分生长与收获预估模型的研究中,并取得了
较好的拟合效果[11-15] .
目前,国内外均利用混合模型对枝条特征进行
了研究.如 Hein 等[16]利用线性及非线性混合模型
对德国西南部的美国花旗松(Pseudotsuga menziesii)
枝条特征模型进行了研究;Sattler 等[17]考虑样地及
样木水平,利用广义混合模型建立了加拿大白云杉
(Picea glauca)的枝条特征模型;董利虎等[12]、董灵
波等[18]利用线性混合效应模型( linear mixed effects
model, LME)研究了红松(Pinus koraiensis)人工林
枝条生物量及枝条基径、长度、着枝角度等;姜立春
等[14,19]考虑树木效应,建立了兴安落叶松 ( Larix
gmelinii)枝条基径、长度和着枝角度的线性混合模
型,均取得了较好的拟合结果.鉴于此,本文基于福
建省将乐国有林场采集的 45 株杉木(Cunninghamia
lanceolata)人工林枝条生物量数据,利用 LME 模型
方法,考虑林木间的随机效应及数据间的异方差性,
建立枝条总生物量和枝、叶生物量的 LME 模型,并
利用独立样本数据对模型的精度进行检验,以期为
LME模型的应用和杉木人工林枝条生物量的预测
提供方法和理论依据.
1  研究地区与研究方法
1􀆰 1  研究区概况
研究区位于福建省将乐国有林场 ( 26° 26′—
27°04′ N,117°05′—117°40′ E).林场内以中、低山
为主,海拔高度在 180 ~ 500 m,年平均气温为 18.7
℃,年均降雨量约 1672 mm.境内气温较高,夏季时
间长,冬天较暖和,霜冻较少,生长期长.土层深厚,
土壤较为肥沃,土质较好,分布最广的为红壤,其次
为黄红壤,适宜培育以杉木、马尾松(Pinus massoni⁃
ana)为主的用材林和乡土珍贵树种.林场内杉木纯
林面积 445.68 hm2,占有林地面积的 43.1%,具有重
要的经济、社会和生态价值.
1􀆰 2  数据材料收集
本研究以福建省将乐国有林场杉木人工林为研
究对象,于 2011—2013年在研究区域内选择具有代
表性的杉木人工林设置面积为 400 ~ 600 m2的标准
地共 15个,实测标准地内每株林木的胸径、树高、冠
幅和冠底高等因子(表 1).每个标准地内选 3 ~ 5 株
优势木,其胸径算术平均值作为优势木胸径,树高算
术平均值作为优势木高.依据林分平均胸径和林分
平均高,在每个标准地内选择 3 株平均木作为解析
木,枝条生物量采用“标准枝法” [6]进行调查取样,
并在 105 ℃恒温烘干称量,共获取 45株解析木,572
组枝条生物量数据.按随机抽样从 45 株解析木中选
取 31株(404组枝条生物量数据)作为建模数据,用
于模型的建立,其余 14株(168组枝条生物量数据)
作为检验数据,用于模型的检验.杉木人工林解析木
和枝条特征调查因子的统计量见表 2,其中,枝条宽
幅指枝条在自然状态下所能达到的最大宽度.
1􀆰 3  研究方法
1􀆰 3􀆰 1基础模型  根据学者们的研究[12,17]及树木枝
条生长的特点,树木枝条的生物量与枝条的着枝深
度(枝条着生位置距离树梢的长度,DINC)关系密
切,一般随着DINC的增加而增加,同时,枝条的生
表 1  标准地林分调查因子统计
Table 1  Summary of stand description attributes of sample
plot
指标
Index
平均值
Mean
最小值
Minimum
最大值
Maximum
标准差
Standard
deviation
平均胸径
Mean DBH (cm)
17.5 4.8 28.9 7.6
平均高
Mean height (m)
14.5 4.2 22.1 5.9
优势木胸径
Dominant tree DBH (cm)
24.0 8.0 38.6 9.4
优势木高
Dominant tree height (m)
18.8 6.9 30.9 7.7
每公顷断面积
Basal area per hectare (m2·hm-2)
23.2 10.8 32.4 10.5
林分密度
Stand density (trees·hm-2)
1540 387 4183 975
海拔
Altitude (m)
231 176 320 32
坡度
Slop (°)
33 21 44 7
地位指数
Site index (m at 20 years)
16 10 24 4
林分年龄
Stand age (a)
25 7 49 13
0792 应  用  生  态  学  报                                      26卷
表 2  杉木人工林解析木和枝条特征调查因子统计
Table 2  Summary of sample tree and primary branch attributes for Cunninghamia lanceolata
指标
Index
建模数据 Fitting data
平均值
Mean
最小值
Minimum
最大值
Maximum
标准差
Standard
deviation
检验数据 Validation data
平均值
Mean
最小值
Minimum
最大值
Maximum
标准差
Standard
deviation
胸径 DBH (cm) 16.8 7.3 38.4 7.0 15.7 13.5 9.9 1.5
树高 Height (m) 15.6 6.6 31.8 6.6 5.1 4.1 1.3 0.5
着枝深度 Depth into crown (m) 11.5 1.4 30.2 6.1 27.7 22.3 21.6 4.2
基径 Basal diameter (cm) 1.6 0.2 4.4 0.8 7.2 5.8 5.3 0.9
枝长 Branch length (m) 1.3 0.2 3.8 0.6 1.2 0.1 3.4 0.7
枝条宽幅 Branch width (m) 0.5 0.1 1.7 0.3 0.5 0.1 1.5 0.2
着枝角度 Branch angel (°) 51.6 10.0 110.0 20.5 52.6 15.0 105.0 17.2
总生物量 Total biomass (kg) 170.9 1.1 1534.8 215.6 150.4 1.4 855.9 178.6
枝生物量 Branch biomass (kg) 110.5 0.2 1456.3 177.9 88.1 0.8 643.5 125.4
叶生物量 Foliage biomass (kg) 60.4 0.04 504.1 69.3 61.9 0.02 428.7 65.6
物量还与林木的 DBH、H 以及枝条的基径(BD)、长
度(BL)、枝条宽幅(BC)、着枝角度(BA)等因子有
一定的相关性.在本研究中,以平均胸径(Dm)、平均
树高(Hm)、优势木胸径(DD)、优势木树高(DH)、林
分密度(SD)、林分年龄(A)、DBH、H、DINC、BD、BL、
BC、BA 等因子作为自变量,分别以枝条的总生物
量、枝生物量和叶生物量作为因变量,利用非线性方
程来建立杉木枝条生物量(w)模型:
    w=ϕ0x1ϕ1x2ϕ2x3ϕ3…xn ϕn (1)
式中:xn为模型的自变量;ϕ0 ~ ϕn 为模型参数.为方
便参数估计,将方程进行对数转换:
lnw=ϕ0+ϕ1 lnx1+ϕ2 lnx2+ϕ3 lnx3+…+ϕn lnxn (2)
利用 R语言的逐步回归功能建立多元线性回
归模型.为避免自变量间的多重共线性和过参数化
问题,采用方差膨胀因子(VIF)对自变量的共线性
进行检验,一般 VIF<10 说明自变量间的共线性比
较小,基于上述方法最终确立杉木人工林枝条生物
量模型.另外,由于模型采用对数转换会产生偏差,
故通过校正系数(CF)校正后获得生物量无偏估计
值[20-21]:
CF=exp(MSE / 2) (3)
式中:MSE为模型的均方根误差.
1􀆰 3􀆰 2线性混合模型  线性混合(LME)模型指在模
型中,固定和随机效应与因变量呈线性关系.其函数
形式为[9]:
yij =X ijβ+Z ijbij+εij,bij ~N(0,D),εij ~N(0,R ij)
(4)
式中:i= 1、…、m,m 为解析木的数量;j = 1、…、ni,ni
为第 i株解析木的枝条数量;yij为枝条生物量的对
数;X ij和 Z ij是 ni ×p(p 为模型中固定效应参数的个
数)和 ni×q(q为模型中随机效应参数的个数)维的
设计矩阵;β是 p×1维的固定效应向量;bij是 q×1 维
的随机效应向量;εij是残差向量;R ij是其 ni ×ni维正
定的协方差矩阵;D 是 q×q 维随机效应间的协方差
矩阵.
在本研究中,LME 模型是以多元线性回归模型
为基础模型,考虑固定效应参数和随机效应参数的
个数以及协方差矩阵进行构建的.因此,需要确定以
下 3种结构[22]:
1)混合参数的个数.基础模型中哪些参数作为
固定参数,哪些作为混合参数,依据 Pinheiro 等[9]的
建议,将不同参数组合作为混合参数进行模拟,选择
模型收敛及模拟精度最高的作为该水平最优的混合
模型,即比较赤池信息量准则(AIC)、贝叶斯信息准
则(BIC)和负二倍的对数似然值( -2LL),这 3 个指
标值越小越好.为了避免模型的过参数化问题,不同
参数的 LME 模型需进行似然比检验(LRT).LRT 用
以比较简单模型与复杂模型间的差异性.
2)误差矩阵.误差矩阵(R ij)反映了数据间的异
方差性,本研究以指数函数(Exp)、幂函数(Power)
和常数加幂函数(ConstPower)3 种结构形式[18,23]消
除数据间的异方差性,其结构表达式为:
R ij =σ2G0.5i IiG0.5i (5)
VarExp(εij)= σ2exp(2δxij) (6)
VarPower(εij)= σ2x2δij (7)
VarConstPower(εij)= σ2(δ1+xs2ij ) 2 (8)
式中:σ2为剩余方差;G i是 ni ×ni维的反映随机效应
异方差性的对角矩阵;Ii是 ni×ni维的描述随机效应
179210期                        许  昊等: 利用线性混合效应模型模拟杉木人工林枝条生物量         
自相关性的方差矩阵.在本研究中,数据间不存在时
间序列的自相关性,因此,Ii简化为一个 ni×ni维的单
位矩阵;xij为第 i 株解析木中第 j 根枝条的着枝深
度,δ、δ1和 δ2为估计参数.
3)随机效应间的协方差矩阵.随机效应间的协
方差矩阵(D)反映了随机效应之间的变化性.其结
构依据随机效应参数个数的不同有所不同[29],以包
括 3个随机参数(μ1、μ2、μ3)的协方差矩阵为例,其
结构如下:
D=
μ1
μ2
μ3
é
ë
ê
ê
êê
ù
û
ú
ú
úú

σμ1
2 σμ1μ2 σμ1μ3
σμ2μ1 σμ2
2 σμ2μ3
σμ3μ1 σμ3μ2 σμ3

é
ë
ê
ê
ê
êê
ù
û
ú
ú
ú
úú
(9)
式中:σμ1
2、σμ2
2、σμ3
2 分别为随机参数 μ1、μ2、μ3 的
方差;σμ1μ2 =σμ2μ1为随机参数 μ1 和 μ2 的协方差;
σμ1μ3 =σμ3μ1为随机参数 μ1 和 μ3 的协方差;σμ2μ3 =
σμ3μ2为随机参数 μ2 和 μ3 的协方差.
当利用混合模型进行预测时,需估计随机效应
参数值.在本研究中,随机效应参数值可依据已知数
据的部分信息,如 w、DINC、BD、BL、BC、BA 等,通过
最优线性无偏估计(BLUPs)进行预测,其表达式如
下[23]:
b^ij≈DZTij(R ij+Z ijDZTij)
-1 ε^ij (10)
式中:b^ij为随机效应向量 bij的最优无偏估计值;D为
随机效应协方差矩阵的估计值;Z ij为随机效应参数
设计矩阵;ε^ij为剩余向量.
1􀆰 3􀆰 3模型检验   本研究利用平均偏差(Bias)、均
方根误差(RMSE)和调整后的决定系数(adj⁃R2)等
指标对基础模型和 LME模型进行精度评价,Bias和
RMSE的值越接近 0、而 adj⁃R2的值越接近 1,说明模
型的精度越高[24] .
Bias =| ∑

i = 1

ni
j = 1
(yij - y^ij) | / ni (11)
RMSE = ∑

i = 1

ni
j = 1
(yij - y^ij) 2
ni - r
(12)
adj⁃R2 = 1 - (ni - 1)


i = 1

ni
j = 1
(yij - y^ij) 2
ni - r


i = 1

ni
j = 1
(yij - 􀭰y) 2
é
ë
ê
ê
ê
êê
ù
û
ú
ú
ú
úú
(13)
式中:y^ 为因变量的观测值;􀭰y 是因变量观测值的平
均值;ni为因变量的观测数;r为模型参数个数.
2  结果与分析
2􀆰 1  基础模型的构建
基于建模数据,利用 R 语言的逐步回归方法建
立杉木人工林枝条生物量的多元线性回归模型,公
式如下:
lnw tij = ϕ0 +ϕ1 lnDING ij +ϕ2 lnBDij +ϕ3 lnBLij +ϕ4
lnBC ij+ϕ5 lnBAij+εij (14)
lnwbij =ϕ0 +ϕ1 lnDINC ij +ϕ2 lnBDij +ϕ3 lnBLij +ϕ4
lnBAij+εij(15)
lnw fij =ϕ0 +ϕ1 lnDINC ij +ϕ2 lnBDij +ϕ3 lnBLij +ϕ4
lnBC ij+εij (16)
式中 wt、wb、wf分别为杉木人工林枝条总生物量、枝生
物量和叶生物量;ϕ0、ϕ1、ϕ2、ϕ3、ϕ4、ϕ5 为模型预估参
数;εij为模型的误差项.逐步回归统计结果见表 3.
2􀆰 2  随机效应参数的确定
以树木作为随机效应,考虑不同随机效应参数
的组合,利用 R语言 nlme 软件包中的 lme 功能,以
模型 14、15 和 16 作为基础模型建立枝条总生物量
及各部分生物量的 LME模型,并对模型的拟合精度
进行比较.不同随机效应参数组合的最优模型拟合
精度见表 4.对于枝条 w t模型,共 28 种 LME 模型收
敛,其中以参数 ϕ0、ϕ1、ϕ4 同时作为随机效应参数
模型(模型 14.3)的 AIC、BIC和⁃2LL值最小,拟合效
表 3  逐步回归统计结果
Table 3  Results of the gradual regression analysis
公式 Equation ϕ0 ϕ1 ϕ2 ϕ3 ϕ4 ϕ5
14 3.4501 0.2447 1.0531 0.6148 0.3090 0.0956
(标准误 Standard error) (0.3315∗∗∗) (0.0697∗∗∗) (0.1263∗∗∗) (0.1196∗∗∗) (0.0807∗∗∗) (0.0855∗)
15 1.9695 0.3093 1.1891 1.0890 0.1751 -
(标准误 Standard error) (0.3247∗∗∗) (0.0645∗∗∗) (0.1236∗∗∗) (0.1081∗∗∗) (0.0836∗) -
16 3.6105 0.1198 0.6190 -0.0090 0.7312 -
(标准误 Standard error) (0.2328∗∗∗) (0.1132∗) (0.2039∗∗) (0.1958∗) (0.1319∗∗∗) -
2792 应  用  生  态  学  报                                      26卷
果最好;对于 wb模型,共 16 种 LME 模型收敛,其中
以参数 ϕ0、ϕ3 同时作为随机效应参数模型(模型
15.2)的 AIC、BIC 和⁃2LL 值最小,拟合效果最好;对
于 w f.模型,共 16种 LME模型收敛,其中以参数 ϕ0、
ϕ1、ϕ2、ϕ4 同时作为随机效应参数模型(模型 16.4)
的 AIC、BIC和⁃2LL值最小,拟合效果最好.因此,将
模型 14.3、15.2和 16.4分别作为杉木人工林枝条总
生物量、枝生物量、叶生物量的最优 LME模型:
lnw tij =(ϕ0+μ0i) +ϕ1 lnDINC ij+(ϕ2+μ2i) lnBDij+
ϕ3 ln BLij+(ϕ4+μ4i)lnBC ij+ϕ5 lnBAIJ+εij
(14.3)
lnwbij = (ϕ0 +μ0i) +ϕ1 lnDINC ij +ϕ2 lnBDij +(ϕ3 +
μ3i)lnBLij+ϕ4 lnBAij+εij (15.2)
lnw fij =(ϕ0 +μ0i) +(ϕ1 +μ1i) lnDINC ij +(ϕ2 +μ2i)
lnBDij+ϕ3 lnBLij+(ϕ4+μ4i)lnBC ij+εij
(16.4)
式中:μ0i、μ1i、μ2i、μ3i、μ4i分别为 LME 模型中参数
ϕ0、ϕ1、ϕ2、ϕ3、ϕ4 考虑树木效应的随机效应参数.
2􀆰 3  考虑异方差结构的 LME模型
由于数据间存在异方差性,本研究用幂函数、指
数函数和常数加幂函数作为异方差结构消除数据间
的异方差性,对模型 14.3、15.2和 16.4 进行改进,并
与未改进模型进行比较.从表 5 可知,无论是枝条总
生物量模型还是各部分生物量模型,添加异方差结
构建立的 LME模型均能提高模型的预估能力,且与
不考虑异方差结构的 LME 模型差异极显著
(P<0􀆰 0001),其中,对于 w t和 w f,以指数函数作为
异方差结构的 LME 模型 (模型 14. 3. 1 和模型
16.4.1)的拟合效果最好;对于 wb,以常数加幂函数
作为异方差结构的 LME 模型(模型 15.2.3)的拟合
精度最高.利用建模数据,对模型 14.3.1、15.2.3 和模
型16.4.1进行拟合,最终得到杉木人工林枝条总生
物量和各部分生物量模型:
表 4  基于不同随机效应参数组合的枝条生物量模型拟合精度比较
Table 4  Comparison of LME models’ fitting precisions with different combinations of random effects parameters
模型编号
Model No.
随机效应参数
Random effects parameters
AIC BIC -2LL LRT P
14.1 ϕ0 865.92 897.82 849.92
14.2 ϕ0、ϕ3 813.15 853.01 793.15 56.78 <0.0001
14.3 ϕ0、ϕ2、ϕ4 806.79 858.61 780.79 12.36 0.0063
14.4 ϕ0、ϕ1、ϕ2、ϕ4 809.83 877.60 775.83 4.96 0.2913
14.5 ϕ0、ϕ1、ϕ2、ϕ3、ϕ4 819.21 906.92 775.21 0.61 0.9873
14.6 ϕ0、ϕ1、ϕ2、ϕ3、ϕ4、ϕ5 826.70 938.32 770.70 4.51 0.6077
15.1 ϕ0 870.42 898.34 856.42
15.2 ϕ0、ϕ3 843.79 879.69 825.79 30.63 <0.0001
15.3 ϕ0、ϕ2、ϕ3 847.14 895.01 823.14 2.64 0.4501
15.4 ϕ0、ϕ2、ϕ3、ϕ4 853.24 917.07 821.24 1.90 0.7539
15.5 ϕ0、ϕ1、ϕ2、ϕ3、ϕ4 862.18 945.94 820.18 1.07 0.9569
16.1 ϕ0 1165.81 1193.74 1151.81
16.2 ϕ0、ϕ3 1145.53 1181.43 1127.53 24.28 <0.0001
16.3 ϕ0、ϕ2、ϕ4 1125.40 1173.26 1101.40 26.135546 <0.0001
16.4 ϕ0、ϕ1、ϕ2、ϕ4 1123.82 1187.64 1091.82 9.579752 0.0481
16.5 ϕ0、ϕ1、ϕ2、ϕ3、ϕ4 1133.77 1197.59 1101.77 4.062977 0.5404
表 5  考虑异方差性结构的 LME模型拟合结果比较
Table 5  Comparison of fitting results of the LME models with variance structures
模型代码
Model
异方差结构
Heteroscedasticity structure
AIC BIC -2LL LRT P
14.3.1 指数函数 Exponential Function 675.72 731.53 647.72 133.07 <0.0001
14.3.2 幂函数 Power Function 742.55 798.36 714.55 66.24 <0.0001
14.3.3 常数加幂函数 Constant Plus Power Function 719.80 779.60 689.80 90.99 <0.0001
15.2.1 指数函数 Exponential Function 668.62 708.51 648.62 177.17 <0.0001
15.2.2 幂函数 Power Function 673.31 713.20 653.31 172.48 <0.0001
15.2.3 常数加幂函数 Constant Plus Power Function 650.82 694.70 628.82 196.97 <0.0001
16.4.1 指数函数 Exponential Function 1089.12 1156.93 1055.12 36.70 <0.0001
16.4.2 幂函数 Power Function 1107.43 1175.24 1073.43 18.39 <0.0001
16.4.3 常数加幂函数 Constant Plus Power Function 1091.17 1162.98 1055.17 36.64 <0.0001
379210期                        许  昊等: 利用线性混合效应模型模拟杉木人工林枝条生物量         
表 6  基础模型与混合模型模拟结果比较
Table 6  Comparison of based models and LME models
模型代码
Model
建模数据 Fitting data
Bias RMSE adj⁃R2
检验数据 Validation data
Bias RMSE adj⁃R2
14 1.42E⁃15 0.7158 0.6483 0.0149 0.8740 0.5144
17 2.28E⁃16 0.5050 0.8249 0.0185 0.5840 0.7832
15 1.57E⁃16 0.7012 0.7491 0.0326 0.7925 0.6724
18 9.10E⁃17 0.5843 0.8258 0.0389 0.6197 0.8737
16 3.45E⁃16 1.1715 0.2146 0.0044 1.5190 0.1193
19 8.32E⁃17 0.7383 0.6880 0.0103 0.8765 0.6568
图 1  杉木枝条生物量观测值与预测值
Fig.1  Fitted values of different equations for total, branch and foliage biomass against observed values.
    lnw tij = (3.3604+μ0i) +0.4517 lnDINC ij+(1.1224
+μ2i)lnBDij+0.5591 lnBLij+(0.4217+μ4i)
lnBC ij+0.0143ln BAij+εij,CF= 0.2550
(17)
bij =
u0i
u2i
u4i
é
ë
ê
ê
êê
ù
û
ú
ú
úú
~N



é
ë
ê
ê
ê
ù
û
ú
ú
ú
ì
î
í
ïï
ïï
,D=
0.3016  0.4642 -0.0014
0.4642  0.2769 -0.0011
-0.0014 -0.0011  0.0002
æ
è
ç
çç
ö
ø
÷
÷÷
ü
þ
ý
ïï
ïï

εij ~N(0,R ij = 2.1742G0.5i IiG0.5i ),
VarExp(εij)= 2.1742exp(-0.6667DINC ij).
lnwbij =(2.4698+μ0i) +0.3131 lnDINC ij +1.3327
lnBDij+(0.9834+μ3i) lnBLij +0.0296lnBAij
+εij,CF= 0.3414 (18)
bij =
u0i
u3i
é
ë
ê
ê
ù
û
ú
ú ~N


é
ë
êê
ù
û
úú ,D
0.1939  0.2081
0.2081  0.3614
æ
è
ç
ö
ø
÷{ } ,
εij ~N(0,R ij = 7.3957G0.5i IiG0.5i ),
VarConstPower(εij)= 7.3957(0.0463+DINC
-3.5314
ij )2.
lnw fij = (3. 4947 +μ0i) +(0. 4487 +μ1i) lnDINC ij +
( 0. 3363 + μ2i ) lnBDij + 0. 0880lnBLij +
(1􀆰 1361+μ4i)lnBC ij+εij,CF= 0.5451
(19)
4792 应  用  生  态  学  报                                      26卷
图 2  杉木枝条生物量预测值与残差
Fig.2  Residual distribution of total, branch and foliage biomass
    bij =
u0i
u1i
u2i
u4i
é
ë
ê
ê
ê
ê
ê
ù
û
ú
ú
ú
ú
ú
~N




é
ë
ê
ê
ê
êê
ù
û
ú
ú
ú
úú

ì
î
í
ï
ï
ï
ï
D=
1.9503 -0.9955 -0.9985 0.7021
-0.9955 0.8535 0.9936 -0.6418
-0.9985 0.9936 1.1714 -0.7173
0.7021 -0.6418 -0.7173 0.5290
æ
è
ç
ç
ç
ç
ö
ø
÷
÷
÷
÷
ü
þ
ý
ï
ï
ï
ï

εijk ~N(0,R ij = 1.9789G0.5i IiG0.5i ),
VarExp(εij)= 1.9789exp(-0.5286DINC ij).
2􀆰 4  模型检验
基于独立的检验样本数据,利用 Bias、RMSE 和
adj⁃R2等 3个指标对建立的杉木人工林枝条生物量
最优 LME模型进行指标检验.对于基础模型的检验
只需将各自变量代入到模型方程中计算因变量,并
与实际因变量的测量值进行比较,而对于混合模型
的检验,由于树木随机效应的影响,需先利用式 10
计算树木的随机效应参数值,再根据式 17、18 和 19
计算枝条基径和长度的理论值,并与实际值进行比
较.目前,对于随机效应参数值的计算可利用 SAS 软
件中的 PROC IML模块[15]和 Excel 实现[25] .本研究
利用 SAS软件对 LME模型的随机参数值进行计算.
从表 6可知,枝条生物量的 LME 模型(模型 17、18
和 19)均优于基础模型(模型 14、15 和 16)的拟合
精度和检验精度.
3  讨    论
本研究利用单水平 LME 模型方法基于对数转
换后的多元线性回归模型建立了福建省杉木人工林
枝条生物量的预测模型,并考虑不同随机效应参数
的组合,用 AIC、BIC和⁃2LL及 LRT对模型的拟合精
度进行检验.结果表明,考虑随机效应(树木效应)的
单水平 LME模型能够显著提高模型的预估精度(表
6,图 1),其中,以参数 ϕ0、ϕ2、ϕ4 同时作为混合参数
建立的枝条总生物量 LME模型拟合效果最好,而以
参数 ϕ0、ϕ3 作为混合参数建立的枝生物量 LME 模
型拟合精度最高,以参数 ϕ0、ϕ1、ϕ2、ϕ4 作为混合参
数建立的叶生物量 LME模型拟合效果最好.
579210期                        许  昊等: 利用线性混合效应模型模拟杉木人工林枝条生物量         
为解决数据间的异方差问题,本文将 3 种函数
(式 6、7、8)添加到 LME模型中,对于枝条总生物量
模型和叶生物量模型,指数函数能够较好地描述数
据间的异方差现象(表 5、图 2);对于枝生物量模
型,常数加幂函数能够较好地消除数据间异方差性
对模型精度的影响.对建立的 LME 模型进行独立样
本检验(表 6),结果表明,枝条总生物量和各部分生
物量的预测精度均能得到显著提高,与传统的多元
线性回归模型相比,考虑随机效应和异方差结构的
混合模型不仅能反映总体的变化趋势,还可以反映
个体间的差异,同时消除数据间的异方差性,进而提
高模型的预估精度.
本文利用 R 语言 nlme 软件包中的 lme 功能建
立的枝条生物量 LME 模型基本能反映杉木枝条生
物量随着枝深度等的变化规律,具有一定的生物学
意义.除树木效应对模型的预估能力有影响外,林分
或样地效应也是影响模型预估能力的一个重要方
面,一般认为,嵌套两水平比单水平的 LME 模型拟
合精度要高[26],因此,对于嵌套两水平(林分或样地
效应嵌套树木效应)的 LME 模型也是日后研究的
重点.
树木枝条生物量的大小与树木种类、起源、立地
条件、林分密度、经营管理措施等因子密切相关,因
此,本文所建立的杉木人工林枝条大小模型仅适用
于与本研究地立地条件相似的区域,且可为当地经
营者编制科学的经营管理方案提供依据,而对于更
大尺度地区模型的建立还需考虑更多的影响因子.
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作者简介  许  昊,男,1988年生,博士研究生. 主要从事森
林可持续以及多功能经营. E⁃mail: xhao0202@ 163.com
责任编辑  杨  弘
779210期                        许  昊等: 利用线性混合效应模型模拟杉木人工林枝条生物量