作 者 ：张琳
期 刊 ：福建农林大学 2011年 12期 页码：68
关键词：深度测序；拟南芥；种子发育；转录组；数据分析；
摘 要 ：种子是植物新一代的开始,是农业生产的基本资料,也是人类营养和工业原料的主要来源。种子的结构复杂,其发育过程涉及到大量不同的基因。分析种子发育过程中的基因表达谱,将有助于阐明种子发育的遗传调控机制。本研究对加拿大国家研究委员会植物生物技术研究院提供的模式植物拟南芥三个种子发育阶段(授粉后第9、12和15天)的mRNA深度测序数据进行分析,旨在挖掘其中包含的各种生物学信息,为植物种子发育遗传机理的深入研究提供参考。主要研究内容和结果如下: (1)数据的基本分析:将Illumina测序的原始数据进行格式转换、去除杂质序列,然后匹配到参考拟南芥基因组(TAIR9)中。有76.41%的读段定位到...