作 者 ：杨宇飞
期 刊 ：北京师范大学 2013年 03期 页码：87
关键词：内含子丢失；突变风险假说；基因组缩小；内含子获得；拟南芥属；
摘 要 ：尽管内含子丢失是真核生物进化历程中广泛发生的事件，但是作用于内含子丢失的选择压力至今没有得到充分的研究。拟南芥和近缘物种琴叶拟南芥在大约1千万年前分化。之后，拟南芥丢失了大约一半的基因组，同时拟南芥内含子丢失速率显著提高。导致基因组缩小的选择力量被认为同样作用于内含子丢失。但是，基因组缩小的选择压力本身仍然有很大争议。 与前人的工作相比，本研究增加了外类群数量，并使用基因序列比对来代替蛋白质序列比对，从而得到了更多的内含子丢失数据。通过使用转录组数据对内含子丢失和内含子获得进行验证，过滤掉没有转录组数据支持的事件，并且过滤掉不满足共线性的候选直系同源基因。这些标准保证了内含子丢失和内含子...