作 者 :陶璐
期 刊 :山东农业大学 2015年 04期 页码:61
关键词:计算系统生物学;拟南芥;授粉;代谢互作网络;差异基因分析;复杂网络;聚类分析;
摘 要 :植物传粉与受精是种子和果实产生及作物产量形成的基础,阐明植物传粉与受精的调控机制是生殖与发育生物学研究领域重要和热点问题之一。本文以模式植物“拟南芥”作为研究对象:(1)收集、整理拟南芥已有的代谢途径数据库及拟南芥花粉管与柱头互作过程中的多组学数据;(2)依据生物生化反应方程式及代谢互作网络构建模式,构建了拟南芥全基因代谢互作网络模型;(3)依据拟南芥花粉管与柱头互作过程中的全基因转录组数据,分别挖掘出拟南芥花粉管和柱头在授粉过程中特异表达的基因,并进一步找到了这些特异表达基因所编码的酶;(4)然后根据代谢网络模型构建规则,将花粉管和柱头中差异基因编码的酶匹配到已构建的拟南芥全基因代谢互作网络...