作 者 :王欢
期 刊 :华东师范大学 2015年 10期 页码:64
关键词:突变体;拟南芥;关联网络;表型;朴素贝叶斯;
摘 要 :在功能基因组学研究中,基因对机体生命活动具有十分复杂的作用机理,通过基因的突变使基因功能发生改变或失去相应功能,从而产生相应的可见表型变化,是鉴定基因功能的一种直接有效方法。本文通过检索各大拟南芥突变资源库,收集文献挖掘信息,整合得到了5,665个具明显表型变化的拟南芥突变株系,继而借鉴植物本体(Plant Ontology)分类标准,并联合己有的表型注释资源,对收集的表型资源进行系统的分类注释,最终获得8,119对基因-表型关系对,其中包含3,874个基因和176个表型。针对以上研究数据,本文整合拟南芥中已构建的蛋白质相互作用(PPI)网络,探索了有明显表型的突变基因在PPI网络中的属性。同...