作 者 :谢文传
期 刊 :中山大学 2013年 02期 页码:75
关键词:拟南芥;花模式建成;基因共表达;支持向量机;
摘 要 :研究背景:花是研究植物器官发育过程的良好实验系统。对花模式建成的研究具有重要的进化、发育和生态学意义。拟南芥是国际上第一个完成全部基因组序列测定的高等植物。迄今拟南芥属仍有30%的基因功能未知。花的发育是一个受体内外多因素综合影响的复杂过程。有关拟南芥花模式建成分子机制的系统生物学研究尚未见报道。本文通过整合拟南芥芯片数据和蛋白互作数据等,利用系统生物学方法,探索拟南芥花模式建成可能的分子机制。 研究方法:从TAIR数据库下载拟南芥相关芯片数据,包括27组非花器官和27组花器官芯片。从BioGRID、IntAct、TAIR、BIND、MINT数据库中下载拟南芥实验验证蛋白互作数据,从SU...