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拟南芥抗病相关基因T1N6_22的原核表达分析



全 文 :华北农学报·2015,30(1) :73 -76
收稿日期:2014 - 11 - 26
基金项目:国家自然科学基金项目(31200203) ;河北省自然科学基金项目(C2012204032;C2014405010) ;高等学校博士学科点专项科研
基金项目(20121302120007)
作者简介:蒋琛茜(1988 -) ,男,河北石家庄人,在读硕士,主要从事植物抗病研究。蒋琛茜、瓮巧云为同等贡献作者。
通讯作者:邢继红(1977 -) ,女,河北东光人,教授,博士,主要从事植物与病原物互作研究。
董金皋(1963 -) ,男,河北邢台人,教授,博士,博士生导师,主要从事植物病理学研究。
拟南芥抗病相关基因 T1N6_22 的原核表达分析
蒋琛茜1,瓮巧云2,樊锦涛1,王冠宇1,董丽萍1,邢继红1,董金皋1
(1.河北农业大学,真菌毒素与植物分子病理学实验室,河北 保定 071001;2.河北北方学院 农林科技学院,河北 张家口 075000)
摘要:为构建拟南芥抗病相关 T1N6_22 基因的原核表达载体并进行高效表达,获得纯化的 T1N6_22 蛋白,以拟南
芥 Col-0 的 cDNA为模板,扩增获得了 T1N6_22 基因 CDS,对其进行克隆、测序后与含有 GST标签蛋白的 pGEX4T-1 载
体相连,构建 T1N6_22 的原核表达载体 pGEX4T-1-T1N6_22-GST。经酶切和测序鉴定正确后,将构建好的载体及空载
体转化大肠杆菌 BL21。结果表明,在大肠杆菌 BL21 菌株中成功表达了与标签蛋白融合的 T1N6_22 蛋白,大小约
57 kDa。SDS-PAGE分析表明,高效表达的诱导条件为 0. 1 mmol /L IPTG诱导培养 3 h。研究结果为进一步 T1N6_22
互作蛋白的筛选及其调控拟南芥抗病分子机制的研究奠定了基础。
关键词:拟南芥;T1N6_22;原核表达;纯化
中图分类号:S432. 1;Q78 文献标识码:A 文章编号:1000 - 7091(2015)01 - 0073 - 04
doi:10. 7668 /hbnxb. 2015. 01. 012
Prokaryotic Expression Analysis of Resistance-related Gene
T1N6_22 from Arabidopsis thaliana
JIANG Chen-xi1,WENG Qiao-yun2,FAN Jin-tao1,WANG Guan-yu1,
DONG Li-ping1,XING Ji-hong1,DONG Jin-gao1
(1. Mycotoxin and Molecular Plant Pathology Laboratory,Agricultural University of Hebei,Baoding 071001,China;
2. College of Agriculture and Forestry Science and Technology,Hebei North University,Zhangjiakou 075000,China)
Abstract:This study was aimed to construct prokaryotic expression vector of resistance-related gene T1N6_22
from Arabidopsis thaliana and obtain the purified protein T1N6 _22 with high-efficiency expression. The CDS of
T1N6_22 was amplified by RT-PCR technology using the cDNA of the Arabidopsis Col-0 and was fused into a pro-
karyotic expression vector pGEX4T-1. Restriction enzyme digestion and sequencing showed that the recombinant
vector pGEX4T-1-T1N6_22-GST was successfully constructed and transformed into E. coli BL21 cells. The results
indicated that the pGEX4T-1-T1N6_22-GST with the predicted molecular weight of about 57 kDa was successfully ex-
pressed in E. coli BL21 strain. SDS-PAGE indicated that the best expression quantity was induced with 0. 1 mmol /L
IPTG treatment for 3 h. These results would provide basis for screening interacting proteins of T1N6_22 and the reg-
ulation mechanism in Arabidopsis resistance.
Key words:Arabidopsis thaliana;T1N6_22;Prokaryotic expression;Purification
病原菌是影响植物正常生长,使作物减产的最
重要的因素之一,常给农业生产造成重大的经济损
失。分离植物抗病相关基因,研究其抗病分子机制,
为植物抗病信号通路的完善奠定基础,进而培育抗
病新品种是防治病害的有效途径。拟南芥(Arabi-
dopsis thaliana)是研究植物与病原菌互作的典型模
式植物,近年来,所获得的大部分植物抗病基因及抗
性相关基因均是从拟南芥中获得的,如 RPS2[1]、
RPS4[2]、RPP8[3]、RPP13[4]、RAC1[5]、RPW8[6]等。
R2R3MYB[7]家族中的转录因子 BOS1[8],该基因功
能缺失使植物对灰霉病菌更加敏感,对丁香假单胞
杆菌抗性增强。MYB30[9 - 10]是植物过敏反应的正
74 华 北 农 学 报 30 卷
调控因子,过表达 MYB30 的烟草和拟南芥对丁香假
单胞杆菌的抗性增强,MYB30 引起的过敏反应需要
SA的积累但不依赖 NPR1[11 - 12]基因。乙烯响应因
子(ERF)家族中 ERF5、ERF6[13]可以正调控拟南芥
对灰葡萄孢的抗性。河北农业大学真菌毒素与植物
分子病理学实验室前期获得了拟南芥抗病相关基因
T1N6_22,明确了该基因主要通过 SA 和 JA 信号途
径正调控拟南芥抗灰葡萄孢过程,负调控拟南芥抗
丁香假单胞杆菌过程[14],但 T1N6_22 基因抗病的分
子机制尚不明确。本试验通过对 T1N6_22 基因进
行原核表达,获得纯化的 T1N6_22 蛋白,为进一步
T1N6_22 互作蛋白的筛选及其调控拟南芥抗病分子
机制的研究奠定基础。
1 材料和方法
1. 1 试验材料
拟南芥 Col-0 由美国 ABRC 购得;大肠杆菌
DH5α、BL21 由本实验室保存;原核表达载体
pGEX4T-1 由 Pharmacia Biotech 公司购得;RNA 提
取试剂、反转录试剂盒由北京全式金公司购得;PCR
所用试剂、限制性内切酶、连接酶、相对分子量标准
由大连宝生物公司购得;引物合成、基因测序由上海
生工生物公司完成。
1. 2 试验方法
1. 2. 1 T1N6_22 基因 CDS 序列的克隆 从 4 周龄
拟南芥叶片中提取总 RNA,反转录获得其 cDNA。
根据拟南芥数据库 TAIR提供的 T1N6_22 序列设计
基因特异性引物,T1N6_22-F(5-CGGAATTCATGG
CAGACCCAAGAGTT-3)、T1N6 _ 22-R(5-CCGCTC
GAGTCAAAAGTTGGAGACATT-3) ,下划线部分为
酶切位点 EcoR Ⅰ和 Xho Ⅰ。将扩增产物连接克隆
载体 pMD19-T,对 T1N6_22 基因进行测序。
1. 2. 2 T1N6_22基因原核表达载体的构建与鉴定
测序正确的 pMD19-T-T1N6_22 和空载体 pGEX4T-1
分别用 EcoR Ⅰ和 XhoⅠ进行双酶切,回收其目的条
带,并用 T4 DNA连接酶进行连接,连接产物转化大
肠杆菌 DH5α,挑取克隆进行酶切鉴定,构建重组载
体 pGEX4T-1-T1N6_22-GST,将其与空载体 pGEX4T-1
分别转化大肠杆菌 BL21,对阳性克隆验证正确后进
行诱导表达。
1. 2. 3 IPTG不同诱导浓度对 T1N6_22 蛋白表达的
影响 将转入重组载体 pGEX4T-1-T1N6_22-GST和
空载体 pGEX4T-1 的 BL21 大肠杆菌在 LB液体培养
基中培养过夜,按 1 ∶ 50 比例转接到 30 mL LB 液体
培养基中,培养至 OD600约 0. 7 左右,分别加入不同
浓度的 IPTG至终浓度为 0. 1,0. 2,0. 4,0. 8 mmol /L,
37 ℃诱导 4 h,收集菌体,弃去上清,用 4 ×上样缓冲
液和水重悬菌体沉淀,沸水浴 15 min,离心后取上清
进行 SDS-PAGE(5%浓缩胶、12%分离胶)检测目的
蛋白表达情况,从而确定诱导表达的最适 IPTG
浓度。
1. 2. 4 不同诱导时间对 T1N6_22 蛋白表达的影响
按上述方法,以最适的 IPTG诱导浓度,37 ℃诱导重
组载体 pGEX4T-1-T1N6_22-GST 和空载体 pGEX4T-1
的表达,分别在 0. 5,1,2,3,4 h 收集菌体,提取总蛋
白,进行 SDS-PAGE检测目的蛋白表达情况,从而确
定诱导表达的最佳时间。
1. 2. 5 T1N6_22 蛋白的提取及纯化 以确定的最
适 IPTG浓度和最佳诱导表达时间,在 37 ℃进行诱
导表达,收集菌体,弃去上清,用 pH 值 8. 3 的 Tris-
HCl缓冲液重悬菌体,通过超声波细胞破碎仪破碎
菌体,超声波功率 100 W、工作 5 s、间隙 10 s、50 次
循环,至菌液变为澄清,离心收集上清液,以上操作
均在低温进行,上清于 4 ℃保存备用。
使用 GST 亲和的纯化基质对收集的上清液进
行目的蛋白的纯化,吸取 300 μL 纯化基质于 2 mL
离心管中,用冰上预冷的 Tris-HCl缓冲液洗涤 2 次。
在离心管中加入 1. 5 mL上清液,颠倒混匀,90 r /min
冰浴摇动 1 h,使上清液中带 GST标签的 pGEX4T-1-
T1N6 _ 22-GST 目的蛋白与纯化基质充分结合。
12 000 r /min 离心,弃去上清,保留基质,用 1 mL
Tris-HCl缓冲液洗涤 3 次,除去不能与基质结合的
杂蛋白。洗脱液使用 5 mL 0. 1 mol /L Tris、0. 061 4 g
谷胱甘肽还原型、0. 1 mol /L HCl调 pH值至 8. 3,加
水至 10 mL。Tris-HCl 洗涤后的纯化基质,用 1 mL
洗脱液、90 r /min冰浴摇动 1 h,使与基质结合的目
的蛋白脱离,收集洗脱液,进行 SDS-PAGE(5%浓缩
胶、12%分离胶)检测目的蛋白的纯化情况,洗脱液
4 ℃保存。
2 结果与分析
2. 1 T1N6_22 基因的扩增及原核表达载体的构建
T1N6_22 基因原核表达载体 pGEX4T-1-T1N6_
22-GST的构建如图所示(图 1-A)。使用基因特异
性引物扩增 T1N6 _22 基因的 CDS,得到大小约
888 bp的条带(图 1-B) ,与预期大小一致。回收目
的条带,连接克隆载体 pMD19-T 并转化大肠杆菌
DH5α,对阳性克隆测序鉴定,序列与 TAIR数据库提
供的序列一致。使用 EcoRⅠ和 XhoⅠ对 pMD19-T-
T1N6_22 载体和空载体 pGEX4T-1 进行双酶切,回
1 期 蒋琛茜等:拟南芥抗病相关基因 T1N6_ 22 的原核表达分析 75
收相应条带并连接,连接产物转化大肠杆菌 DH5α,
挑取克隆进行酶切鉴定,获得了目的条带(图 1-C) ,
表明 T1N6_22 基因的原核表达载体构建成功。
A. pGEX4T-1-T1N6_22-GST载体图谱;B. T1N6_22 基因的扩增;C. pGEX4T-1-T1N6_22-GST载体的酶切鉴定。
A. Map of pGEX4T-1-T1N6_22-GST;B. PCR amplification of T1N6_22;C. Identification of pGEX4T-1-T1N6_22-GST by restriction enzyme digestion.
图 1 T1N6_22 基因原核表达载体的构建
Fig. 1 Construction of prokaryotic expression vector pGEX4T-1-T1N6_22-GST of T1N6_22 gene
2. 2 IPTG不同诱导浓度对 T1N6_22蛋白表达的影响
为确定诱导表达使用的最佳 IPTG 浓度,接种
后分别用 0. 1,0. 2,0. 4,0. 8 mmol /L IPTG,37 ℃诱
导表达 4 h,收集菌体,以未诱导的菌体作为对照,进
行 SDS-PAGE 检测。结果发现,带有 pGEX4T-1 空
载体的菌株可以诱导表达出大小约为 26 kDa 的
GST蛋白,带有 pGEX4T-1-T1N6_22-GST 载体的菌
株均可以诱导表达出大小约为 57 kDa的蛋白,与融
合蛋白的大小相符(GST 蛋白为 26 kDa、T1N6_22
蛋白为 31 kDa)。IPTG 浓度为 0. 1 ~ 0. 8 mmol /L
时,融合蛋白的表达水平没有明显的变化(图 2),由
此确定 IPTG的工作浓度为 0. 1 mmol /L。
A. pGEX4T-1 空载体的诱导表达;M. 蛋白分子量标准;1. IPTG 未诱
导;2. IPTG诱导 GST蛋白;B. pGEX4T-1-T1N6_22-GST 的诱导表达;
M.蛋白分子量标准;1. IPTG 未诱导;2 ~ 5. IPTG 诱导浓度分别为
0. 1,0. 2,0. 4,0. 8 mmol /L。
A. Expression of pGEX4T-1 with IPTG induction;M. Protein Marker;1.
Expression without IPTG induction;2. Expression of GST with IPTG in-
duction;B. Expression of pGEX4T-1-T1N6_22-GST with IPTG induction;
M. Protein Marker;1. Expression without IPTG induction;2 - 5. Expres-
sion with 0. 1,0. 2,0. 4,0. 8 mmol /L IPTG.
图 2 不同 IPTG浓度与 pGEX4T-1-T1N6_22-GST
表达量的关系
Fig. 2 Relationship between different concentration
of IPTG and pGEX4T-1-T1N6_22-GST
2. 3 不同诱导时间对 T1N6_22 蛋白表达的影响
将带有 pGEX4T-1-T1N6_22-GST载体的菌株接
种 LB液体培养基,使用 0. 1 mmol /L 的 IPTG 浓度,
37 ℃诱导表达,分别在诱导 0. 5,1,2,3,4 h 时收集
菌液,以未诱导的菌体作为对照,进行 SDS-PAGE 检
测。结果发现,在不同诱导时间下均可以诱导表达出
大小约为 57 kDa 的融合蛋白;在诱导时间 0. 5 ~ 3 h
内,随诱导时间的延长诱导表达的蛋白含量逐渐增
高;诱导 3,4 h,融合蛋白的表达量没有明显的变化
(图 3)。由此确定,融合蛋白的诱导时间为 3 h。
2. 4 T1N6_22 蛋白的纯化
以确定的诱导表达最适条件,对 pGEX4T-1-
T1N6_22-GST 蛋白进行诱导表达,超声波破碎菌
体,离心后取上清使用GST亲和的纯化基质进行
M.蛋白分子量标准;1. IPTG未诱导;2 ~ 6. IPTG
诱导时间分别为 4,3,2,1,0. 5 h。
M. Protein Marker;1. Expression without IPTG induction;2 -6. Expression
of pGEX4T-1-T1N6_22-GST with IPTG induction for 4,3,2,1,0. 5 h.
图 3 不同诱导时间与蛋白表达量的关系
Fig. 3 Relationship between different time of
induction and pGEX4T-1-T1N6_22-GST
M.蛋白分子量标准;1. pGEX4T-1-T1N6_22-GST蛋白;
2.纯化前上清液。
M. Protein Marker;1. Purified protein pGEX4T-1-T1N6_22-GST;
2. Supernatant before purification.
图 4 pGEX4T-1-T1N6_22-GST蛋白的纯化
Fig. 4 Purification of protein pGEX4T-1-T1N6_22-GST
76 华 北 农 学 报 30 卷
pGEX4T-1-T1N6_22-GST 蛋白的纯化,SDS-PAGE 分
析纯化后的蛋白,获得了单一的融合蛋白条带(图 4)。
3 讨论
外源基因在大肠杆菌体内中能否高效表达受到
很多因素的影响和限制,如大肠杆菌菌株类别、原核
表达载体、诱导物浓度、诱导时间及诱导温度。一般
诱导蛋白表达的温度控制在 16 ~ 37 ℃,诱导可以用
温度诱导和药物诱导,一般利用药物(如 IPTG)诱导
较多[15 - 17]。李波等[18]将载体 pET-28a 质粒在大肠
杆菌 BL21(DE3)菌株中表达,IPTG 浓度为 0. 2
mmol /L,在 30,37 ℃诱导 3 h 和 16 ℃诱导 12 h 后
收集菌体检测发现,3 种条件下目的蛋白均可以表
达,但均以包涵体的形式存在。在诱导表达 pET-
32a-MYB61 蛋白时,随 IPTG 浓度的提高和诱导时
间的延长,目的蛋白的表达量均为上升趋势,并在
1 mmol /L IPTG诱导 2 h时达到最大值[19]。可见不
同条件、不同基因所表达的蛋白形式不同,因此,对
相应基因的表达条件的摸索十分必要。本研究使用
pGEX4T-1[20]载体进行原核表达,该载体具有 tac 启
动子,可以高效的表达目的蛋白。通过构建
pGEX4T-1-T1N6_22-GST 载体转入大肠杆菌 BL21
进行表达,在 IPTG浓度为 0. 1,0. 2,0. 4,0. 8 mmol /L
时蛋白表达量基本一致,说明 IPTG 浓度对目的蛋
白表达的影响不大,故试验选择了 0. 1 mmol /L作为
后续试验的最适浓度,以减少菌株的表达压力。超
声波破碎菌体后使用 GST 亲和的琼脂糖微球进行
目的蛋白的纯化,SDS-PAGE 检测发现纯化后的蛋
白含量比超声波裂解后上清中的蛋白含量明显降
低,这说明纯化得到了单一的融合蛋白,但纯化条件
仍需要进一步进行优化,以期获得更高含量的目的
蛋白,下一步试验将筛选 T1N6_22 的互作蛋白,为
明确 T1N6_22 基因调控拟南芥抗病的分子机制奠
定了基础。
参考文献:
[1] Belkhadir Y,Nimchuk Z,Hubert D A,et al. Arabidopsis
RIN4 negatively regulates disease resistance mediated by
RPS2 and RPM1 downstream or independent of the NDR1
signal modulator and is not required for the virulence
functions of bacterial type Ⅲ effectors AvrRpt2 or Avr-
Rpm1[J]. Plant Cell,2004,16(10):2822 - 2835.
[2] Gassmann W,Hinsch M E,Staskawicz B J. The Arabidop-
sis RPS4 bacterial-resistance gene is a member of the
TIR-NBS-LRR family of disease-resistance genes[J].
Plant Journal,1999,20(3) :265 - 277.
[3] Mohr T J,Mammarella N D,Hoff T,et al. The Arabidopsis
downy mildew resistance gene RPP8 is induced by patho-
gens and salicylic acid and is regulated by W box cis ele-
ments[J]. Molecular Plant-Microbe Interactions,2010,23
(10) :1303 - 1315.
[4] Rose L E,Bittner-Eddy P D,Langley C H,et al. The ma-
intenance of extreme amino acid diversity at the disease
resistance gene,RPP13,in Arabidopsis thaliana[J]. Ge-
netics,2004,166(3) :1517 - 1527.
[5] Borhan M H,Holub E B,Beynon J L,et al. The Arabidop-
sis TIR-NB-LRR gene RAC1 confers resistance to albugo
candida(white rust)and is dependent on EDS1 but not
PAD4[J]. Molecular Plant-Microbe Interactions,2004,17
(7) :711 - 719.
[6] Jorgensen T H,Emerson B C. RPW8 and resistance to pow-
dery mildew pathogens in natural populations of Arabidopsis
lyrata[J]. New Phytologist,2009,182(4) :984 -993.
[7] Mengiste T,Chen X,Salmeron J,et al. The BOTRYTIS
SUSCEPTIBLE1 gene encodes an R2R3MYB transcrip-
tion factor protein that is required for biotic and abiotic
stress responses in Arabidopsis[J]. Plant Cell,2003,15
(11) :2551 - 2565.
[8] Veronese P,Chen X,Bluhm B,et al. The BOS loci of Ara-
bidopsis are required for resistance to Botrytis cinerea in-
fection[J]. Plant Journal,2004,40(4) :558 - 574.
[9] Canonne J,Marino D,Jauneau A,et al. The xanthomonas
type Ⅲ effector XopD targets the Arabidopsis transcrip-
tion factor MYB30 to suppress plant defense[J]. Plant
Cell,2011,23(9) :3498 - 3511.
[10] Li L,Yu X,Thompson A,et al. Arabidopsis MYB30 is a
direct target of BES1 and cooperates with BES1 to regu-
late brassinosteroid-induced gene expression[J]. Plant
Journal,2009,58(2) :275 - 286.
[11] Canet J V,Dobon A,Roig A,et al. Structure-function a-
nalysis of npr1 alleles in Arabidopsis reveals a role for
its paralogs in the perception of salicylic acid[J]. Plant
Cell and Environment,2010,33(11) :1911 - 1922.
[12] 张红志,蔡新忠. 病程相关基因非表达子 1(NPR1) :
植物抗病信号网络中的关键节点[J]. 生物工程学
报,2005,21(4) :511 - 515.
[13] Moffat C S,Ingle R A,Wathugala D L,et al. ERF5 and
ERF6 play redundant roles as positive regulators of JA /
Et-Mediated defense against Botrytis cinerea in Arabi-
dopsis[J]. PLOS One,2012,7(4) :e35995.
[14] Xing J H,Weng Q Y,Hao C C,et al. T1N6_22 gene is
required for biotic and abiotic stress responses in arabi-
dopsis[J]. Russian Journal of Genetics,2012,48(12) :
1191 - 1198.
[15] Han X Q,Lin X M,Chen H J,et al. The prokaryotic ex-
pression and bioactivity of the recombinant red fire ant
venom allergen soli 4[J]. Agricultural Sciences in Chi-
na,2009,8(2) :182 - 187.
[16] 邓毛子,石春薇,王 芳,等.结核分枝杆菌 Ag85A蛋
白的原核表达、纯化和免疫反应性[J]. 基础医学与
临床,2010,30(2):117 - 121.
[17] Rao C N,Reeder D J,Stack S M,et al. Prokaryotic ex-
pression,purification,and reconstitution of biological ac-
tivities(antiprotease,antitumor,and heparin-binding)for-
tissue factor pathway inhibitor-2[J]. Biochemical and
Biophysical Research Communications,2000,3(276) :
1286 - 1293.
[18] 李 波,倪志勇,范 玲.棉花 GhCOMT3 基因的原核
表达、纯化及鉴定[J]. 华北农学报,2010,25(z1) :
12 - 16.
[19] 杜李继,顾 菊,陈光朗,等.拟南芥 AtMYB50 和 At-
MYB61 蛋白的原核表达研究[J]. 合肥工业大学学
报:自然科学版,2014,37(1):105 - 109.
[20] Wu C,Wang Y Y,Zou M J,et al. Prokaryotic expres-
sion,purification,and production of polyclonal antibody
against human polypeptide N-acetylgalactosaminyl trans-
ferase 14[J]. Protein Expression and Purification,2007,
56(1) :1 - 7.