作 者 ：林明志
期 刊 ：浙江大学 2011年 07期 页码：38
关键词：拟南芥；分子相互作用；网络预测；网络分析；数据库建设；
摘 要 ：分子相互作用网络是研究生物分子功能及调控的基础之一。目前,许多大规模实验已经运用于多种模式生物,如酵母、果蝇、线虫和人类,得到了大量的相互作用数据。同时,多个研究机构也相应地建立数据库,收集整理实验得到的相互作用数据。然而,在植物中,即使是模式生物拟南芥,也缺乏足够多的相互作用数据来支持系统的网络分析。因此,我们通过整合多种基因组层面的侧面证据,如基因共表达、蛋白质结构域相互作用、功能注释的相关性、同源相互作用、细胞内共定位以及共进化,对拟南芥相互作用进行了预测,并得到145494对相互作用。并且,我们构建了拟南芥分子相互作用数据平台(PAIR, http://www.cls.zju.edu....