全 文 :2015年11月 四川大学学报(自然科学版) Nov.2015
第52卷 第6期 Journal of Sichuan University(Natural Science Edition) Vol.52 No.6
收稿日期:2014-02-26
基金项目:国家自然科学基金(31171586);国家转基因重大专项(2011ZX08009-003-002)
作者简介:杨昊(1989-),男,硕士,研究方向为植物遗传与分子生物学.
通讯作者:杨毅.E-mail:yangyi528@vip.sina.com
doi:103969/j.issn.0490-6756.2015.11.29
拟南芥中参与盐胁迫应答的基因
At1g14260的功能初探
杨 昊,杨凤玺,袁德志,刘志斌,杨 毅
(四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064)
摘 要:拟南芥中未知基因At1g14260的表达受到多种非生物胁迫的诱导,特别是在 NaCl
的诱导下,At1g14260的表达量明显增加.对T-DNA插入突变体at1g14260(salk-118406)的
分析表明,敲除了基因At1g14260的拟南芥相比野生型对盐胁迫更加敏感.此外,构建了融
合表达载体PBi221-At1g14260-GFP并且成功转入拟南芥原生质体中,在荧光显微镜下观察
到融合蛋白定位于原生质体细胞核中.因此,At1g14260可能参与了拟南芥中盐胁迫的过程.
关键词:拟南芥;盐胁迫;萌发率;幼苗生长;根长;亚细胞定位
中图分类号:Q945 文献标识码:A 文章编号:0490-6756(2015)06-1347-06
Primary exploration of genes At1g14260 participate in salt stress
response in Arabidopsis thaliana
YANGHao,YANG Feng-Xi,YUAN De-Zhi,LIU Zhi-Bin,YANG Yi
(Key Laboratory of Bio-resources and Eco-Environment of Ministry of Education,
Colege of Life Sciences,Sichuan University,Chengdu 610064,China)
Abstract:The expression of Arabidopsis unknown gene At1g142600was induced by a variety of abiotic
stresses.The expression of At1g14260was significantly increased under the treatment of NaCl.The re-
sults suggested that At1g14260was involved in the process of salt stress response.Analysis of the T-
DNA mutant of at1g14260(salk-118406)demonstrated that knocking out At1g14260in Arabidopsis re-
sulted in plants more sensitive to NaCl than the wild type.In addition,fusion vector PBi221-At1g14260-
GFP was constructed and transfected into Arabidopsis protoplast.The observation by fluorescence mi-
croscope revealed that the fusion protein localized innucleus of the protoplasts.Therefore,At1g14260
may participate in the process of salt stress in Arabidopsis thaliana.
Key words:Arabidopsis thaliana;Salt stress;Germination rate;Seedling growth;Root length;Subcel-
lular localization
1 引 言
土地盐渍化是由于自然因素和人为不合理的
措施而引起的.目前,土壤盐渍化已经成为困扰
多行业专家的一个世界性问题,盐渍化的土地严
重影响了当地的农作物生产和经济的发展,选育
对盐耐受的植物品种从而适应盐碱化的土地,是
一种从根本上解决土壤盐渍化的方法.据数据统
四川大学学报(自然科学版) 第52卷
计,我国现有的耕地中,有多于800万hm2的土地
由于不科学的灌溉、施肥,导致土壤中大量盐分积
累,从而形成了土壤盐渍化,进而严重影响了农
作物的正常生产[1].
同时大量研究表明,植物对高盐土壤环境的
应答涉及多基因家族的复杂调控网络[2-5].大量研
究发现,含有RING结构的基因与植物抗逆性关
系密切.比如,含有RING结构的RGLG2基因对
拟南芥的干旱胁迫具有负调控作用[6],DREB2A
是含有RING结构的一个基因,它编码的蛋白与
其它蛋白相互作用,对拟南芥的干旱胁迫具有负
调控作用[7],RHA2a是含有RING结构的一个基
因,在种子萌发于以及幼苗的生长阶段起作用,
在盐胁迫与干旱胁迫下以及对 ABA的响应起到
正调控的作用[8].本研究发现拟南芥中未知功能
基At1g14260含有一个保守的 C3HC4的 RING
结构域,且该基因在高温,干旱,盐,渗透胁迫等
多种条件胁迫下表达量均有所改变,而在盐胁迫
条件下,表达量明显升高.以NaCl作为盐胁迫因
子,探讨其对野生型及突变体拟南芥生长的影响.
研究结果发现,At1g14260突变后对盐胁迫非常
敏感.突变体种子萌发率明显低于野生型,且萌
发后的根长伸长也比野生型要短,在幼苗的生长
过程中,突变体幼苗更容易出现萎黄,枯萎的症
状.这些结果说明该基因在拟南芥盐胁迫应答过
程中起重要的作用.同时,该基因亚细胞定位发
现其集中在细胞核内表达,为进一步功能分析奠
定基础.
2 材料和方法
2.1 实验材料
拟南芥(Arabidopsis thaliana)野生型采用
Columbia生态型,其种子为本实验室保存.突变体
种子是从拟南芥生物资源中心(Arabidopsis Bio-
logical Resource Centre,ABRC)购买的编号为
SALK_118406拟南芥种子.
各种 DNA 内切酶、连接酶、聚合酶均购于
Takara公司.植物RNA提取试剂盒和反转录试剂
盒购自天根生化科技有限公司.引物合成与测序由
Invitrogen生物技术有限公司完成.
2.2 试验方法
2.2.1 植物培养 将营养土与蛭石按照1∶2的
比例混合拌匀后用高压湿热灭菌25min,取出冷
却.将要花钵洗净、晾干后高压灭菌25min,取出冷
却.将营养土分装到花钵中备用.将消毒后的拟南
芥野生型种子和突变体at1g14260的种子于 MS
平板上,在组培室中生长5~7d后,分别移栽至花
钵中,培养于22℃恒温,光照16h,黑暗8h的组培
室中.
2.2.2 生物信息分析 利用NCBI资源库找到基
因 At3g47550(TR1)(GenBank:BT029525.1)和
At5g62460(NCBI Reference Sequence:NM_125640.
3)的同源基因At1g14260(GenBank:DQ059090.1)
和At2g02960(GenBank:AY091335.1),并利用软件
MEGA分析四个相关基因的同源关系.之后利用序
列分析软件预测了目标基因At1g14260及相关基因
序列中可能存在的调控元件,并比对了四个同源基
因的蛋白质序列.
2.2.3 RT-PCR 将饱满的拟南芥种子春化处
理,然后消毒洗净.将处理后的种子播种于 MS培
养基平板上生长5d后,将幼苗分别移至MS,Ms+
300mM Mannitol,Ms+10μM ABA,MS+250mM
NaCl的平板上处理8h,并将一个 MS平板置于
37℃烘箱中热处理8h.分别提取各种处理后幼苗
的RNA,用RT-PCR分析目的基因在几种处理下
的表达情况.RT-PCR中所使用引物序列为上游引
物 s (5′-TGCGACATGCACTGACTATACCA-
GA-3′)与 下 游 引 物 as (5′-CCGAGTGGC-
CAAGTCCGCTG-3′).内参引物 Tub-2上游引物
(5′-ACATCCCACCTACTGGTCTGAAG -3′)与
下 游 引 物 (5′-GCATCTTGGTATTGCTGG-
TACTCT-3′).使用荧光定量PCR仪,数据经电
脑分析直接生成较为直观的柱状图.
2.2.4 突变体的鉴定 DNA水平的检测:剪下生
长一个月的突变体幼苗叶片,提取总DNA并以之
为模板采用三引物PCR法,进行PCE扩增检测.
At1g14260基因特异的引物 LP (5′-CCAAGG-
GAGAGAGCAAATACC-3′)、RP (5′-TATTGC-
CAAGAGACGTGGATC-3′)与 T-DNA 的 LB
(5′-TCAAACAGGATTTTCGCCTGCT-3′)进行
PCR扩增反应.
RNA水平检测:利用提取植物 RNA试剂盒
提取拟南芥突变体at1g14260幼苗RNA,将提取
的RNA反转录为cDNA,用突变基因at1g4260的
特异引物LP与RP进行扩增,同时以actin基因表
达作为对照,actin基因引物为(5′-GTTGGTGAT-
GAAGCACAATCCA-3′)和 (5′-GTTGGTGAT-
GAAGCACAATCCA-3′).
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第6期 杨昊,等:拟南芥中参与盐胁迫应答的基因At1g14260的功能初探
2.2.5 盐胁迫处理 在预实验中,将拟南芥野生
型与突变体的种子在加有 100mM Mannitol,
10μM ABA,250mM NaCl的 MS平板上做表型实
验,结果只有在 MS+150mM NaCl的平板上观察
到了野生型与突变体表型的明显差异.因此主要对
盐胁迫下的拟南芥野生型与突变体进行表型实验
分析.
将同一时期收取的拟南芥野生型和突变体
at1g14260的种子春化后消毒洗净,播种于 MS平
板,在 MS平板生长5d后,分别将幼苗移苗至 MS+
125mM NaCl和 MS+145mM NaCl和空白对照的
MS培养基平板上,在组织培养室中培养10d,观察
苗期生长情况及根长差异并拍照,实验重复3次.
将处理后的种子播种于 MS平板,在 MS平板
生长5d后,分别将、幼苗移苗至 MS+125mM
NaCl和 MS+145mM NaCl和空白对照的 MS培
养基平板上,在组织培养室中培养10d,观察苗期
生长情况及根长差异并拍照,实验重复3次.
2.2.6 数据分析 萌发率试验、幼苗生长试验及
根长试验均使用软件SPSS分析数据的统计学差
异,x2 检验P<0.001,统计学上有明显差异,所有
试验均重复3次以上.
2.2.7 构建融合载体At1g14260-PBi221-GFP定
位目标基因 构建融合载体At1g14260-PBi221-
GFP.利用植物原生质体试剂盒提取正常生长3w
的拟南芥野生型幼苗的原生质体.在已构建好的融
合载体转入原生质体,在共聚焦显微镜下观察荧光
的位置.
3 结果与分析
3.1 At1g14260的表达谱分析
拟南芥基因At4g19430位于1号染色体上,
全长 798bp.利 用 MEGA 软 件 的 分 析 基 因
At1g14260,发现其与本实验室之前发现的耐热基
因At3g47550(TR1)具有高度同源性(图1-A).相
关基因序列中的调控元件分析(图1-B),蛋白质多
重序列比较(图1-C)也显示了他们之间的联系.
3.2 野生型拟南芥在非生物胁迫下的表达情况
将在 MS培养基平板上生长5d后的幼苗分别
移至 MS,Ms+300mM Mannitol,Ms+10μM
ABA,MS+250mMNaCl的平板上处理8h,利用
RT-PCR技术分析目的基因表达量的变化.从图2
可以看出,目标基因At1g14260在受到NaCl的胁
迫时,表达量对比正常情况下的拟南芥明显上升.
说明基因At1g14260受到NaCl的诱导.
3.3 At1g14260纯合突变体的获得和鉴定
为了分析基因At1g14260的功能,本实验室
通过ABRC购得 T-DNA插入株系,使用目标基
因两端特异性引物LP与RP扩增后,野生型中有
条带,鉴定的突变体无条带,而使用RP和突变体
特异性引物LB1作为引物扩增时突变体中有特异
条带,而野生型中没有出现(图3-A).转录水平检
测,用基因特异的引物,在野生型中能扩增出预
期大小的条带,而在突变体中则没有(图3-B).这
些结 果 说 明 T-DNA 的 插 入 使 得 突 变 体 中
At1g14260基因完全被敲除.图中col表示拟南芥
野生型,mut表示拟南芥突变体at1g14260.
3.4 盐胁迫条件下突变体at1g14260萌发率表型
分析
将春化3d后的拟南芥野生型与突变体的种
子播于正常 MS培养基下,发现萌发率无明显差
异,播种7d后的终萌发率均为100%.而在加有
50mM NaCl的 MS 平 板 上,拟 南 芥 突 变 体
at1g14260的萌发率明显低于正常的拟南芥野生
型,播种7d后,拟南芥野生型的终萌发率为84%
而突变体at1g14260仅为71% (图4-A,左).为
了进一步验证,在加有750mM NaCl的 MS平板
上重复试验,结果表现出更大的差异,野生型在
1w后的终萌发率为68%,而突变体的仅为34%
(图4-A,右).表明突变体种子对盐胁迫更为敏
感.
3.5 盐胁迫条件下突变体at1g14260幼苗生长表
型分析
为了进一步研究At1g14260在植物苗期生长
中起到的作用,将在 MS平板上生长5d的幼苗移
至 MS平板、加有125mM NaCl的MS平板及加有
145mM NaCl的平板上生长10d后,可以看出拟
南芥野生型和突变体在正常的 MS平板上没有显
示出明显的生长差异(图5-A,左).而在加有
125mM NaCl的 MS 平板上可以看出突变体
at1g14260的生长情况明显差与拟南芥野生型,并
出现枯萎、变黄的状况,而野生型的生长基本正常
(图5-A,中).这一差别在加在加有145mM NaCl
的 MS平板上显得更加明显,突变体at1g14260
的生长受到严重抑制,枯萎、变黄的特征非常明
显,而同样情况下的拟南芥野生型则能基本正常
生长(图5-A,右).同时观察三种生长环境下的拟
南芥野生型和突变体的根长差异, 可以看出突变
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四川大学学报(自然科学版) 第52卷
图1 At1g14260与At3g47550(TR1)同源性分析
A.At1g14260与At3g47550(TR1)进化树关系图;B.At1g14260与At3g47550(TR1)及相关基因序列中的调控元件分析;
C.与TR1同源的四个基因的蛋白质多重序列比较
Fig.1 Genes At3g47550and gene At1g14260(TR1)has a homology
A.Phylogenetic;B.Analysis of regulatory elements in gene sequence;C.Protein Fingerprinting
图2 RT-PCR分析基因At1g14260及相关基因受到非
生物胁迫后的表达情况
Fig.2 RT-PCR analysis of genesAt1g14260and their relat-
ed genes expression by abiotic stress
体at1g14260的根长明显短于拟南芥野生型(图5-A,5-
B).进一步证实突变体种子不仅在萌发阶段,而且在
萌发后生长阶段也对盐胁迫处理超敏感.表明
At1g14260在拟南芥盐胁迫应答过程中发挥重要作用.
3.6 At1g14260的亚细胞定位
为进一步研究 At1g14260亚细胞定位,采用
GFP作为报告基因构建pBi221-At1g14260-GFP载
体.将生长3w的幼苗使用试剂盒制作原生质体,将
构建好的载体转入,通过共聚焦显微镜观察观察到
At1g14260-GFP的荧光集中在细胞核的位置(图6).
图3 突变体at1g14260的纯合分析鉴定
A.DNA水平下检测突变体at1g14260的纯合性分析;
B.转录水平下突变体at1g14260的纯合分析
Fig.3 Mutant at1g14260homozygous analysis
A.DNA levels detecting mutant at1g14260homozygosity a-
nalysis;B.Transcriptional level detecting mutant at1g14260ho-
mozygosity analysis
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第6期 杨昊,等:拟南芥中参与盐胁迫应答的基因At1g14260的功能初探
图4 拟南芥野生型和突变体at1g14260在NaCl胁迫下
萌发率的对比
A.加有50mM NaCl和75mM NaCl的 MS平板上,拟南芥
野生型和突变体at1g14260的萌发情况;B,大量拟南芥野生型
和突变体at1g14260种子萌发情况统计,星号表示x检验,对比
野生型而言生存率显著降低
Fig.4 The contrast of germination rate in arabidopsis wild type
and mutant at1g14260under NaCl stress
A.The germination situation of arabidopsis wild type and mu-
tant at1g14260in MS medium with 50mm NaCl and 75mm NaCl;
B.statistical of germination of A large number of arabidopsis wild-
type and mutant at1g14260seed.Asterisks indicate significantly low-
er survival rates than WT plants as determined byχ2 test(P<0.001)
图5 拟南芥野生型与突变体at1g14260苗期生长情况
对比
A.为正常生长5天后移至加有125mM NaCl(中)145mM
NaCl(右)和的 MS平板上的拟南芥野生型与突变体at1g14260
生长差异,左图为对比;B.三种环境下生长的拟南芥野生型和
突变体at1g14260根长统计,星号表示X检验,对比 WT型而
言生存率显著降低
Fig.5 the difference of Seedling growth between arabi-
dopsis wild type and mutant at1g14260
A.Normal growth for five days,the difference of Seedling
growth in 125mM NaCl MS(middle),145mM NaCl MS(right)
and MS(left);B.The root length statistics.Asterisks indicate
significantly lower survival rates than WT plants as determined
by x2 test(P<0.001)
图6 基因At1g14260的亚细胞定位.白线约代表10μm
Fig.6 subcelular localization of At1g14260.Bar=10μm
4 讨 论
众所周知,较高浓度的盐胁迫甚至会直接导
致植物的死亡.盐胁迫降低了植物的光合作用速
率、减少了能量的供给、抑制了植物的生长发育[9],
可以说几乎所有与植物生长相关的所有过程都收
到了盐胁迫的影响[10].
本研究选取受盐胁迫显著诱导的Ring finger基
因At1g14260,研究其在受到盐胁迫时表达量的变
化.并进一步研究At1g14260纯合突变体在不同浓
度的NaCl胁迫下,种子萌发率、幼苗生长情况及侧
根生长情况的差异.并在植物细胞中定位该基因.
在组培实验中明显看出在正常 MS培养基下
的拟南芥野生型和突变体at1g14260的萌发率、生
长及根长情况基本一致.而在存在NaCl胁迫时野
生型和突变体的萌发、生长及根长均受到抑制,但
是相比野生型,突变体受到抑制的效果更加明显,
表现为萌发率低于野生型;幼苗生长过程过更容
易出现枯萎、变黄的症状;根长明显短于野生型.
这些结果都说明了缺失了基因At1g14260的突变
体对盐胁迫更加敏感,符合RT-PCR结果的预期.
根长的实验则暗示了基因At1g14260可能与拟南
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四川大学学报(自然科学版) 第52卷
芥侧根的生长有关.
近年来大量研究表明RING结构是一种广泛
存在于植物体内的保守结构域,其在植物的非生
物胁迫应答中发挥着重要作用.而含有RING结
构域的基因大多具有E3连接酶的活性,泛素E3
连接酶在蛋白的翻译后修饰中起着至关重要的作
用,在植物体内E3连接酶参与多种生物和非生物
胁迫应答[11,12].本实验的研究对象含有一个
C4HC3的RING结构域,又涉及拟南芥盐胁迫应
答的过程,但实验未能完成体外泛素化实验,尚
无法证明其具有E3连接酶活性,故推测其可能通
过泛素化的途径来降解目标蛋白从而参与到盐胁
迫应答信号通路中.此推断需进一步实验证明.
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