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拟南芥AtHHR2基因的功能初步研究



全 文 :2016年7月 四川大学学报(自然科学版) Jul.2016
第53卷 第4期 Journal of Sichuan University(Natural Science Edition) Vol.53 No.4
收稿日期:2015-03-06
基金项目:国家自然科学基金(31171586);973计划(2015CB755700).
作者简介:杨皓(1991-),男,甘肃白银人,硕士研究生,研究方向为植物遗传与分子生物学.
通讯作者:杨毅.E-mail:yangyi528@vip.sina.com
doi:103969/j.issn.0490-6756.2016.07.040
拟南芥AtHHR2基因的功能初步研究
杨 皓,刘志斌,李旭锋,杨 毅
(四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064)
摘 要:为了研究拟南芥 Highly Homologous RING domain 2基因(At5g43200)在盐胁迫逆
境的功能,通过DNA及RNA水平鉴定了该基因的T-DNA插入突变体athhr2,并通过根瘤
农杆菌介导法进行遗传转化,筛选获得了athhr2/ATHHR2互补转基因株系.对突变体、互补
转基因株系及野生型进行盐胁迫处理,对其萌发率、脯氨酸及叶绿素水平进行检测,发现盐处
理后缺失突变体的萌发率降低,脯氨酸和叶绿素含量低于野生型,互补株系的萌发率、脯氨酸
和叶绿素含量均高于野生型.以上结果证明AtHHR2基因在拟南芥的盐胁迫响应中起正调控
作用.
关键词:AtHHR2;RING finger E3连接酶;盐胁迫;拟南芥
中图分类号:Q78;Q945   文献标识码:A   文章编号:0490-6756(2016)04-0945-07
Primary Analysis of the Function of AtHHR2in Arabidopsis thaliana
YANGHao,LIU Zhi-Bin,LI Xu-Feng,YANG Yi
(Colege of Life Sciences,Key Laboratory of Bio-Resources and Eco-Environment of MOE,
Sichuan University,Chengdu 610064,China)
Abstract:To study the fuction of Highly Homologous RING domain 2(At5g43200)in response to salt
stress,the T-DNA insertion mutant athhr2was obtained,and 3homozugous complementary transgenic
lines athhr2/ATHHR2were obtained.The mutants,complementary transgenic lines and wild-type of
Arabidopsis were used for salt stress experiment.Germination Rates and resistance-related physiological
indexes of al the plants were measured,including proline content and chlorophyl content.Under salt
treatment,the germination rate,relative proline content and chlorophyl content in deficient mutants are
lower than the wild-type,and those of complementary transgenic plants are al higher than the wild-
type.These results suggested that AtHHR2gene played a positive regulatory role in Arabidopsis thali-
ana response to salt stress.
Key words:AtHHR2;RING finger E3ligase;salt stress;Arabidopsis thaliana
1 引 言
植物生长过程中的非生物胁迫通常包括盐碱、
水缺乏、冷、热、重金属等.其中盐胁迫是在世界范
围内广泛分布,危害较大的一类胁迫.也是当前植
物科学研究中的热点领域.植物体为应对多变的外
界环境,会通过生理上的一系列调节途径以响应这
些胁迫,增强自身的逆境耐受性[1].
泛素化途径属于蛋白翻译后修饰途径,也是植
物在该水平上重要的一类抗逆调控机制[2].泛素是
  四川大学学报(自然科学版)   第53卷
一类真核生物广泛具有、保守性较高的蛋白,泛素
在3种酶的先后作用下完成泛素化过程,分别是泛
素激活酶E1(ubiquitin-activating enzyme),泛素
结合酶E2(ubiquitin-conjugating enzyme)和泛素
连接酶E3(ubiquitin-ligating enzyme)[3].泛素分
子与E1相互作用被激活,并被传递到一系列E2
上,再通过具有特异性的E3转移至底物蛋白上.
E3连接酶可对底物蛋白进行特异性选择,在泛素
化过程中起决定性作用.一些E3泛素连接酶含有
RING(Realy Interesting New Gene)finger结构
域,该类蛋白可分为 C3H2C3和 C3HC4两个亚
型,包含有1个锌指结构[4,5].研究证实E3连接酶
对植物的非生物胁迫响应有重要的意义,其中包括
冷,盐和干旱等多种胁迫[6].AtHHR2 基因是
C3HC4型RING Finger家族蛋白,与 HHR1基因
高度同源,具有1个RING结构,具有体外E3连
接酶活性;在盐胁迫条件下该基因表达量有所升
高[7].推测该基因可能在盐胁迫相关过程中起作
用.
盐胁迫条件下,植物细胞的损害来自离子胁迫
和渗透胁迫两个方面.植物通过积累体内脯氨酸的
含量以适应高盐环境造成的胁迫.脯氨酸是渗透调
节剂,累积脯氨酸可增大细胞质浓度,维持细胞的
渗透平衡.脯氨酸亦有清除胞内自由基的功能,可
部分消除高 Na+离子浓度引起的损伤[8].植物细
胞内的叶绿素在盐胁迫下会受到破坏,在高盐环境
下,脯氨酸和叶绿素含量的变化是衡量植物耐盐性
的重要指标.
本研究以拟南芥突变体athhr2为材料,对突变
体进行筛选获得纯合突变体,并对突变体进行遗传
转化获得了3个独立的athhr2/ATHHR2互补株系
C1-3,C11-6和C19-4,同时检测了盐胁迫下突变体、
互补株系与野生型的萌发率情况和生理指标变化,
对AtHHR2基因在盐胁迫响应中的作用进行初步
探索,为进一步解释该基因的功能提供理论依据.
2 材料与方法
2.1 材 料
野生型拟南芥 (Arabidopsis thaliana)哥伦比
亚生态型(Columbia)植株由本实验室保存,HHR2
基因T-DNA插入突变体SALK_150860种子购买
于ABRC,突变体的背景为Columbia生态型.大肠
杆菌(Escherichia coli)菌株 DH5α、根瘤农杆菌
(Agrobacterium tumefaciens)菌株 EHA105 及
pZH01载体由本实验室保存.
多种限制性内切酶、T4DNA ligase及Prime
Script TMRT reagent Kit with gDNA Eraser反转
录试剂盒购自TaKaRa公司.质粒提取试剂盒购自
Omega公司,RNA提取试剂盒,DNA胶回收试剂
盒购自天根公司,q-PCR mix-SYBR Green购于
Bio-Rad公司.其余试剂为科龙国产分析纯.
表1 本文所用引物序列
Tab.1 Primers
引物用途 序列
athhr2突变体
PCR鉴定
LP:5′-TTGCAAAACCAAGTTAAACCG-3′
RP:5′-AAGTCATGATCGTGGAGTTGG-3′LB
1.3:5′-ATTTTGCCGATTTCGGAAC-3
HHR2片段
PCR扩增
F:5′-CGC GGATCCATGGAAACTGAATCTTT
CAAACTCG-3′
R: 5′-CCGCTCGAGTCACTGTGGTTGTTT-
GTCAACAGG-3′
酶切位点为GGATCC-BamHⅠCTCGAG-XhoⅠ
HHR2qRT-
PCR
F:5′-ATTGACACACAAGGTTTACGTCG-3′
R:5′-GATTCTTCTTCTTCTCCTTGGCT-3
Actin2-F:5′-GCACCACCTGAAAGGAAGTA-
CA-3′
Actin2-R:5′-CGATTCCTGGACCTGCCTCATC-3′
2.2 方 法
2.2.1 蛋白进化树构建 在TAIR拟南芥信息资
源数据库中查找拟南芥中与 AtHHR2同源的
RING Finger家族蛋白的氨基酸序列,并分析其相
似性,于 MEGA5软件中使用Clustal W 进行氨基
酸序列比对,邻接法(Neighbor-Joining)构建蛋白
系统进化树.
2.2.2 纯合突变体的分子鉴定 使用CTAB法
提取植物叶片总DNA,根据拟南芥突变体网站ht-
tp:signal.salk.edu上相关T-DNA插入位点信息
设计引物(所有引物序列见表1),以提取的野生型
DNA为负对照,LP+RP、LB1.3+RP两种引物组
合进行PCR,反应程序为:94℃4min;94℃30s,
59℃35s,72℃1min,30个循环;72℃10min.
按照TIANGEN RNA提取试剂盒说明提取
植物材料 RNA,所提的 RNA 按照 TAKARA
Prime Script TMRT reagent Kit with gDNA Eraser
反转录试剂盒说明反转录为cDNA,以野生型cD-
NA为负对照,内参基因Actin2作为对照基因,引
物见表1进行PCR反应,反应程序为:94℃4min;
94℃30s,55℃30s,72℃35s,30 个 循 环;72℃
10min.
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第4期    杨皓,等:拟南芥AtHHR2基因的功能初步研究  
2.2.3 植物过量表达载体的构建 依照TIAN-
GEN RNA 提取试剂盒说明提取野生型植株
RNA,按 TAKARA Prime Script TM RT reagent
Kit with gDNA Eraser反转录试剂盒说明反转录
为cDNA,对其利用表1所示引物进行扩增,反应
程序为:94℃ 4min;94℃ 30s,58℃35s,72℃
50s,30 个循环,72℃ 10min.PCR 产 物 依 照
TIANGEN胶回收试剂盒说明进行回收纯化.使用
XhoⅠ和BamHⅠ将 HHR2连接到载体pZH01
上,获得pZH01-AtHHR2载体,转化至大肠杆菌
DH5α菌株,贮藏于-80℃冰箱.
2.2.4 拟南芥的转化及阳性植株分子鉴定 利用
冻融法将pZH01-AtHHR2载体转化 EHA105
农杆菌,通过菌落PCR鉴定出阳性克隆.利用花序
浸染法将转化农杆菌浸染突变体花序[10],收取的
种子经含有潮霉素的1/2MS培养基筛选T1,对阳
性苗提取DNA进行PCR鉴定,并继续用潮霉素
1/2MS培养基筛选 T2及 T3代,获得纯合互补株
系.依照Bio-Rad q-PCR mix-SYBR Green使用说
明,以所获得的cDNA为模板通过Bio-Rad实时荧
光定量PCR系统进行反应,定量内参用Actin2使
用引物见表1,q-PCR实验程序:95℃5min;95℃
10s,60℃10s,72℃20s,40个循环.
2.2.5 盐处理下萌发率表型实验 将突变体、野
生型,及互补株系拟南芥种子经0.1%HgCl溶液
消毒后置于含125mM NaCl的1/2MS培养基及
对照组1/2MS培养基中,每个株系点种约50颗种
子,置于4℃冰箱春化2d打破种子休眠,移入22℃
长日照条件的组培室,4d后对其萌发状况进行观
察,检测盐胁迫对以上株系种子萌发率的影响,重
复实验3次.
2.2.6 盐处理下脯氨酸与叶绿素含量的测定 将
突变体、野生型及互补株系拟南芥种子经 NaClO
溶液消毒后置于1/2MS培养基中,竖直培养3周
后取幼苗移入含有0或150mmol/L NaCl的土中
培养14天测定其脯氨酸含量、叶绿素含量.脯氨酸
含量测定采用茚三酮法;叶绿素含量测定采用
95%乙醇提取法.每个株系取10株进行测定,各项
测定重复3次,取结果平均值.
3 结果分析
3.1 AtHHR2蛋白系统进化分析
拟南芥AtHHR2基因位于拟南芥第5号染色
体上,利用 ORFinder分析[9],该基因包含1个完
整的阅读框,编码207个氨基酸,相对分子质量
23.422kD.根据之前的研究,该基因是C3HC4型
RING Finger家族蛋白,具有1个RING finger结
构[7].本研究将该基因所编码蛋白的氨基酸序列与
拟南芥其他14个 RING Finger型蛋白的同源序
列进行比对,并建立系统进化树.如图1的聚类分
析结果显示,HHR2与 HHR1(At2G24480)及
At3G28630具有较高的同源性,与其他的同家族
蛋白亦具有一定的同源性,说明该蛋白序列与
RING finger家族蛋白在结构上高度相似,可能有
相似或相关的功能.
图1 拟南芥ATHHR2同源基因进化树
Fig.1 Phylogenetic Analysis of ATHHR2homo-
logs in Arabidopsis thaliana
3.2 athhr2纯合突变体鉴定
athhr2突变体结构示意图见图2A.为鉴定
athhr2纯合突变体,我们分别用LP+RP,LB1.3
+RP做引物对基因组DNA进行扩增(如图2B),
野生型DNA用LP+RP引物扩增获得目的条带,
而用LB1.3+RP扩增无条带;纯合突变体 DNA
用LP+RP引物扩增未获得目的条带,而用LB1.3
+RP扩增有条带.
为进一步验证athhr2突变体的基因表达情
况,我们提取植株的 RNA进行 RT-PCR实验,
结果显示野生型中HHR2基因正常表达,而在突
变体中检测不到目的基因的表达,说明T-DNA的
插入成功抑制了该基因在植株内的表达.
3.3 athhr2/AtHHR2互补株系的阳性植株鉴定
构建表达载体如图3A所示.运用根瘤农杆菌
对突变体植株进行花序浸染,经潮霉素抗性筛选获
得24株阳性苗.提取突变体和其中4个互补株系
T1代植株,1#,6#,11#,19#的基因组DNA,进
行PCR扩增,电泳结果如图3B显示,互补株系
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  四川大学学报(自然科学版)   第53卷

      

图2 athhr2突变体的分子鉴定
A.athhr2(SALK_150860)突变体 T-DNA插入位置示意.
三角形示T-DNA插入位置,黑色框为外显子.B.利用基因
组PCR及反转录PCR对野生型和突变体分别进行DNA水
平与RNA水平鉴定.
Fig.2 Identification of the athhr2mutant.
A.Schematic structure of theathhr2with the T-DNA inser-
tion.The triangle indicates the T-DNA,dark bars indicate
coding regions.B.Genotyping PCR and RT-PCR analysis of
wild-type and athhr2plants at DNA and RNA level,respec-
tively.
的阳性植株扩增均获得了624bp的单一条带,而
缺失突变体无条带.说明AtHHR2基因在互补株
系中成功表达.
以野生型植株为对照,Actin2为内参基因,对
互补株系进行Real-time PCR,结果如图3C显示
筛选出的三个 T3代互补株系C1-3,C11-6,C19-4
其AtHHR2基因的表达量与野生型相比分别提高
至129,87和303倍.PCR和Real-time PCR的结
果均说明所获得的互补株系中该基因能够表达,且
在一定程度上过量表达.
3.4 盐处理下的萌发率表型
野生型,突变体及三个互补转基因株系的种子
播于0及125mM NaCl的1/2MS培养基上,对萌
发率进行了统计,观察盐胁迫下各个株系之间萌发
率的差异(如图4A,B).当种子于1/2MS培养基
上萌发时,各株系萌发率几乎相同,均为96%以
上.在添加125mM NaCl的培养基上,种子的萌发
均受到明显的抑制,野生型萌发率为50.5%,突变
体的萌发率仅为5%,互补株系C1-3,C11-6,C19-4
的萌发率则分别维持在76%,75%,81%.可以看
出突变体对盐过度敏感,而互补株系对盐的敏感性
比野生型低.



图3 互补转基因株系的分子鉴定
A.互补株系载体示意图,AtHHR2由35S启动子驱动.B.
DNA水平PCR检测AtHHR2在突变体和互补株系中的表
达.C.Real-time PCR检测 AtHHR2在野生型和互补株系
中的相对表达量.
Fig.3 Identification of the athhr2/ATHHR2com-
plementary lines.
A.Schematic structure of the complementary vector,AtH-
HR2was drove by 35Spromotor.B.PCR analysis of AtH-
HR2in athhr2mutant and complementary plants.C.Real-
time PCR analysis of AtHHR2in wild-type and complemen-
tary plants.
3.5 盐处理下脯氨酸与叶绿素含量的变化
植物响应盐胁迫的过程中,脯氨酸是重要的调
节物质,而叶绿素则是植物生长代谢所必需的.为
探究盐胁迫处理下AtHHR2的突变体及互补株系
是否发生渗透物质累积的变化,本文检测了 NaCl
处理下野生型,突变体athhr2及互补株系C1-3,
C11-6,C19-4的脯氨酸与叶绿素含量,如图5所
示.由图可知,在正常条件下,突变体,野生型与互
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图4 野生型、突变体及互补株系在 NaCl处理下种
子萌发表型
A.野生型,突变体及三个互补转基因株系在萌发期对盐的
敏感表型.B.各株系种子在0或125mM NaCl的1/2MS培
养基上的萌发率统计.
*表示差异显著(P<0.05)
Fig.4 Phenotypes of wild-type,mutant and 3
transgenic lines in response to salt during
seed germination.
A.Salt Sensitivity of the wild-type(WT),athhr2and ath-
hr2/ATHHR2during the germination stage.B.Percentage
of germinating seeds grown on 1/2MS medium supplemen-
ted with or without 125mM NaCl.
*represent difference at P<0.05
补株系的脯氨酸含量均较低,且无明显差别.在盐
胁迫处理下,突变体,野生型和互补株系的脯氨酸
质量比均升高,但突变体增加量较低,而互补株系
的增加最为明显.野生型脯氨酸含量升高了1.71
倍,突变体仅升高1.50倍,而三个互补株系分别升
高了2.34,2.37,2.41倍.叶绿素含量在不同株系
中的变化趋势是类似的,与未处理之前相比,野生
型叶绿素含量降低33.7%,突变体降低了43.6%,
3个互补株系分别降低了24.3%,24.7%,23.2%.


图5 野生型、突变体及互补株系在 NaCl处理下脯
氨酸和叶绿素的含量
A.在150mM NaCl处理和无处理对照下野生型、突变体及
互补转基因幼苗的脯氨酸含量.B.在150mM NaCl处理和
无处理对照下野生型、突变体及互补转基因幼苗的叶绿素含
量.
*表示差异显著(P<0.05)
Fig.5 Proline and Chlorophyl contents of seedlings
of wild-type,mutant and 3transgenic lines
under NaCl treatments
A.Proline contents of seedlings of wild-type,athhr2and
three complementary plants with or without150mM NaCl
treatment.B.Chlorophyl contents of seedlings of wild-
type,athhr2and three complementary plants with or with-
out 150mM NaCl treatment.
*represent difference at P<0.05
4 讨 论
在盐胁迫下,植物体细胞的离子平衡受到影
响,胞质中浓度过高的Na+对代谢产生毒害,引起
细胞生长停滞或死亡.而目前的研究表明E3连接
酶广泛参与到植物各类非生物胁迫的应答中,包括
盐、干旱、冷及热胁迫.本研究为探究E3连接酶基
因 HHR2 在耐盐胁迫应答中所起的作用,从
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ABRC购买了 HHR2的 T-DNA插入突变体,对
其进行qPCR 及 RT-PCR鉴定,成功获得了 T-
DNA突变纯合体.随后将AtHHR2作为目的片段
插入到载体pzH01上,构建pzH01-HHR2载体.
采用根瘤农杆菌介导法浸染突变体植株花序,并经
过筛选获得 hhr2/HHR2互补株系.定量 Real-
time PCR结果显示,互补株系 HHR2基因的表达
量远高于野生型,证明目的基因被成功转入互补株
系中,且其表达量超过野生型的表达水平.
在盐处理条件下的1/2MS培养基上,野生
型,突变体和互补株系种子的萌发率表现出较大的
差异.在125mM NaCl处理下,与野生型相比,互
补株系的萌发率更高,而突变体的萌发率几乎为
零,表现出对盐高度敏感的表型.逆境胁迫下脯氨
酸含量的提高对植物的抗逆和维持自身稳态具有
重要作用,本文进行了athhr2突变体和athhr2/
ATHHR2互补株系的生理指标测定,结果表明,
在NaCl处理下,突变体,野生型和互补株系的脯
氨酸含量与未处理相比均有上升,但在处理后突变
体的脯氨酸含量低于野生型,互补株系的脯氨酸含
量则较高.叶绿素含量是植物耐盐性的一项指标,
在外界盐浓度较高时,细胞内色素系统遭到破坏,
叶绿素含量下降[11].生化指标检测说明athhr2/
AtHHR2互补株系抵抗逆境的能力更强,而突变
体对盐胁迫则更为敏感.在对NaCl存在下的叶绿
素含量的测定中,结果显示与野生型相比,突变体
的叶绿素含量更低,而3个互补株系的叶绿素含量
维持在较高水平.这些生理指标的变化暗示了该基
因的功能缺失导致植物体对盐处理更加敏感,而互
补株系经过恢复该基因的表达水平后,对植物体的
耐盐性有明显的恢复,因此推断AtHHR2是参与
到植物耐盐胁迫响应的过程中的基因.
AtHHR2基因编码一种包含RING结构域的
C3HC4型E3连接酶,并受到多种逆境胁迫的诱
导.高等植物在生命周期中往往受到各种非生物胁
迫的影响,而RING finger型E3连接酶被证实参
与多种胁迫的信号通路,如E3连接酶 AtAIRP1,
AtAIRP2,AtAIRP3 等 参 与 干 旱 胁 迫 信 号 通
路[12,13,14],OsHCI1参与到对热胁迫的响应中[15].
拟南芥SDIR1是正调控 ABA 相关胁迫响应的
RING finger E3 连接酶[16].RING finger结构
RGLG2蛋白参与拟南芥干旱胁迫的负调控[17].同
时E3连接酶亦有能力将不同底物进行泛素化,如
KEG可降解CIPK26,ABI5,ABF1,ABF3等多个
ABA信号通路中的重要基因[18,19,20],参与ABA信
号通路的调节.对AtHHR2基因的功能深入探究
需要了解在盐信号通路及其他通路中AtHHR2的
相互作用蛋白,以更加明确地揭示其作用机理,为
通过基因工程提高农作物耐盐性提供理论依据.
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