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拟南芥中一个参与盐胁迫应答基因的T-DNA插入纯合突变体的鉴定及表型分析



全 文 :2014年5月 四川大学学报(自然科学版) May.2014
第51卷 第3期 Journal of Sichuan University(Natural Science Edition) Vol.51 No.3
收稿日期:2013-03-21
基金项目:国家自然科学基金(31171586);转基因重大专项(2011ZX08009-003-002);中央高校基本科研业务费(2011SCU11107)
作者简介:赵成(1986-)男,四川成都人,硕士,研究方向为植物遗传与分子生物学.E-mail:498612906@qq.com
通讯作者:杨毅.E-mail:yangyi528@vip.sina.com
doi:103969/j.issn.0490-6756.2014.03.37
拟南芥中一个参与盐胁迫应答基因的T-DNA
插入纯合突变体的鉴定及表型分析
赵 成,杨 昊,刘志斌,杨 毅
(四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064)
摘 要:本研究以拟南芥为试验材料,探索基因at5g66070在受到非生物胁迫的表达情况,
并研究其抗逆特性.结果表明,在NaCl处理下,该基因的表达量明显升高,表明该基因受到
盐的诱导.通过PCR和RT-PCR在DNA和RNA水平上筛选鉴定at5g66070基因T-DNA
插入纯合突变体.分析了野生型拟南芥与突变体在不同浓度NaCl处理下,其萌发率,根长以
及苗期的生长差异.结果发现,相对于野生型来说,突变体对盐更敏感.具体来说,在含有
150mMNaCl的 MS培养基中,突变体的萌发率比野生型要低,根长比野生型要短,同时突变
体幼苗更容易出现枯萎,萎黄症状.
关键词:拟南芥;盐胁迫;幼苗生长;at5g66070;萌发率
中图分类号:Q37   文献标识码:A   文章编号:0490-6756(2014)03-0615-06
Identification and phenotypic observation of gene T-DNA insertionalmutant
which involved in salt stress response in Arabidopsis
ZHAO Cheng,YANG Hao,LIU Zhi-Bin,YANG Yi
(Key Laboratory of Bio-resources and Eco-enviroment of Ministry of Education,Colege of Life
Sciences,Sichuan University,Chengdu 610064,China)
Abstract:In this work,the expression and the function of gene at5g66070in various abiotic stress were
studied.The results showed that the gene expression was significantly increased after NaCl treatment,
indicating that the gene was induced by salt stress on the other hand.One homozygous T-DNA mutant
was identified at DNA and RNA levels by PCR and RT-PCR.Then the germination rate,root length
and seedling growth were analyzed between wild-type and mutant under the treatment of different NaCl
concentrations.The results showed that the mutant is more sensitive to salt compared to the wide-type.
The mutant's germination rate is lower,and their root lengths were shorter than that of wt Meanwhile,
the mutant seedlings were more prone to be chlorosis when they are growing on the MS medium with
150mM NaCl.
Key words:Arabidopsis;Salt stress;Seeding growth;at5g66070;Germingtion rate
  四川大学学报(自然科学版)   第51卷
1 引 言
土地盐渍化是指由于自然因素和人为不合理
的措施而引起的土壤盐渍化.比如说由于蓄水工
程使得蓄水区域变成了水面,拦截了径流,减少
了下游水量,增加了水面蒸发,并且使库区周围
地下水位上升,导致了土壤盐渍化.土壤盐渍化
是一个世界性问题,严重影响着农业生产和经济
发展,选育和培育耐盐植物品种适应盐渍环境,
是缓解土壤盐渍化对农业生产影响的最经济有效
的方法[10,11].据统计,我国现有耕地中,至少有
800万hm2的土地由于不当的灌溉和施肥,导致土
壤中盐分积累,严重影响了农作物的产量.
大量研究表明,植物对盐胁迫环境的应答反
应涉及了多种基因和复杂的途径,盐分对植物最
普遍和最显著的效应就是植物抑制生长[1,2].因此
通过分子生物学的手段研究耐盐基因显得非常的
重要[5].根据前人的大量研究表明,发现含有
RING结构的基因与植物抗逆性关系密切[4].比
如,含有 RING结构的 RGLG2基因对拟南芥的
干旱胁迫具有负调控作用[6],DREB2A 是含有
RING结构的一个基因,它编码的蛋白与其它蛋
白相互作用,对拟南芥的干旱胁迫具有负调控作
用[7],RHA2a是含有RING结构的一个基因,在
种子萌发于以及幼苗的生长阶段起作用,在盐胁
迫与干旱胁迫下以及对 ABA的响应起到正调控
的作 用[8].本 课 题 研 究 拟 南 芥 中 未 知 基 因
at5g66070在其 C端有一个保守的 RING结构,
分析了该基因在受到各种非生物胁迫后,基因的
表达情况,发现该基因在盐胁迫下,表达量明显
升高.然后以 NaCl作为盐胁迫因子[5,9],探讨其
对野生型及突变体拟南芥生长的影响.研究结果
发现,在盐胁迫条件下,突变体种子萌发率明显
低于野生型,并且根长也比野生型要短一些,同
时,在幼苗的生长过程中,突变体幼苗更容易出
现萎黄,枯萎的症状.这些结果说明该基因可能
参与拟南芥中盐胁迫信号通路.
2 材料和方法
2.1 实验材料
拟南芥(Arabidopsis thaliana)Columbia生态
型种子为本实验室保存.突变体种子为从拟南芥
生物资源中心(Arabidopsis Biological Resource
Centre,ABRC)购买的编号为SALK-148182C拟
南芥种子.
DNA聚合酶购于Takara公司.植物RNA提
取试剂盒和反转录试剂盒购自天根生化科技有限
公司.引物合成与测序由Invitrogen生物技术有
限公司完成.
2.2 试验方法
2.2.1 培养拟南芥 将营养土和蛭石按照1:1混
合后加入1/2MS大量元素、微量元素、铁盐拌匀至
适当的湿润程度后高压湿热灭菌25分钟,冷却,
同时将所有花钵洗净,高压湿热灭菌25分钟,冷
却.将灭好的营养土分装到花钵中备用.将在 MS
平板上生长了一周左右的野生型及突变体拟南芥
幼苗分别移栽至花钵中,培养于22℃,光照16h,
黑暗8h的培养箱中.
2.2.2 突变体纯合子鉴定 DNA水平检测:突
变体幼苗在培养箱中生长1个月后,提取叶片总
DNA,以所提取的总DNA为模板,采用三引物
PCR法,进行PCR扩增.At5g66070基因特异的
引物 LP(5'-CATGACGACATCACTGTGGTC-3
'),RP(5'-CTAAGTGCCGTCCAGAGTCAG-3)'与
T-DNA 的 引 物 LB (5 '-TCAAACAG-
GATTTTCGCCTGCT-3')一起进行PCR扩增.
RNA水平检测:使用天根提取RNA试剂盒
提取突变体幼苗RNA,将其反转录为cDNA,用
RT-PCR分析其转录水平,得到的cDNA用突变
基因at5g66070的特异引物LP与RP进行扩增,
同时以actin基因表达为对照,actin基因引物为
(5'-GTTGGTGATGAAGCACAATCCA-3')和(5'-
GTTGGTGATGAAGCACAATCCA-3').扩增产
物用1.0%的琼脂糖凝胶电泳分析.
2.2.3 半定量分析野生型拟南芥在非生物胁迫下
的表达情况 将若干饱满的拟南芥种子在4℃春
化4d,然后用升汞(0.1%)消毒10min,75%乙醇
灭菌30s,然后用无菌水将种子洗涤5次,将种子
播种于 MS培养基平板上,在 MS平板上生长七
天后,将拟南芥幼苗分别移至经 MS,MS+10%
Sucrose,Ms+300mM Mannitol,Ms+10μM
ABA,及 MS+250mMNaCl的平板上处理8h,
用天根RNA提取试剂盒分别提取RNA,用RT-
PCR分析目的基因在几种处理下的表达情况.半
定量所用引物为up(5'-TCTTCTTCGCTTTAGT-
GG-3')与dn(5'-TCTGTGATTCGGACCTTA-3'),
其产物长度为462bp.
2.2.4 NaCl处理条件下野生型与突变体种子的
616
第3期   赵成等,拟南芥中一个参与盐胁迫应答的基因的T-DNA插入纯合突变体的鉴定及表型分析 
萌发分析 选取若干同一时期播种,同一时期收
集的饱满,圆润,大小一致的野生型拟南芥种子
与突变体种子在4℃春化4d,然后用升汞(0.1%)
消毒10min,75%乙醇灭菌30s,然后用无菌水
将种子洗5次,将种子播种于 MS,MS+100
mMNaCl,MS+150mMNaCl培养基平板上,观
察野生型与突变体株系的萌发情况,实验重复3
次,每个株系的播种数目均为100颗.
2.2.5 NaCl处理条件下野生型与突变体的根长
分析 用同样的方法春化野生型与突变体种子,
并消毒.将种子播种于 MS平板上,在 MS平板生
长两天后,分别将野生型与突变体幼苗移苗至 MS
+100mMNaCl,MS+150mMNaCl培养基平板
上,倒立放置培养,每天观察根长生长情况,并记
录,7d后拍照,实验重复3次.
2.2.6 NaCl处理条件下野生型与突变体的苗期
生长状况分析
用同样的方法春化野生型与突变体种子,并消
毒.将种子播种于MS平板,在MS平板生长七天后,
分别将野生型与突变体幼苗移苗至MS+150mMNaCl
培养基平板上,在组织培养室中培养两周,观察苗期
生长情况,两周后拍照,实验重复3次.
3 结果与分析
3.1 T-DNA插入位置与At5g66070基因缺失纯
合突变体的鉴定
经 http://signal.salk.edu/分 析,SALK-
148182CT-DNA插入在At5g66070基因的第4个
外显子处(图1,a).在DNA水平上,用基因的两
端引物LP与RP扩增后,野生型中有一条带,与
此对应的突变体中没有条带,当用RP与LB一起
扩增时突变体中有一条特异条带.而野生型中没
有出现条带,其中col表示野生型,mut表示突变
体(图1,b).而在转录水平上,用基因特异的引
物,野生型中能够扩增出预期大小的条带,但在
突变体中没有(图1,c),表明T-DNA的插入使得
突变体中At5g66070基因完全被敲除,这一株材
料是At5g66070基因缺失的纯合突变体,供后续
实验使用.
3.2 目的基因At5g66070受非生物胁迫后表达量
的变化
用RT-PCR分析目的基因在受到 H2O、蔗糖、
甘露醇、ABA、NaCl处理下的表达情况.从图中可
以看出,等量Actin的条件下,H2O、蔗糖、甘露醇、
ABA处理后的条带与野生型中的差异不大,而在
NaCl处理下,扩增的条带亮度远大于野生型.
图1 纯合突变体的鉴定
Fig.1 Identification of homozygous mutant
A,T-DNA的插入位点,位于基因的第四个外
显子上;B,DNA水平上的鉴定;C,RNA水平上
的鉴定
A.The at5g66070gene is disrupted by the in-
sertion of the T-DNA in the four exon;B.Analysis
with agar gel electrophoresis;C.RT-PCR analysis;
In the picture at5g66070means col(wild type)and
Mutant's total RNA reverse transcribe into cDNA by
OligodT primer,then amplified with at5g66070
gene special primer pair,Actin means RNA ampli-
fied with Actin primer pair.
图2 RT_PCR分析该基因受到非生物胁迫后的表
达情况
Fig.2 RT-PCR was conducted to determine the lev-
el of at5g66070transcripts under a range of
stress treatments.
CK (no treatment),H2O,Suc(10%);Man
(300mM);ABA(10μM);NaCl(250mM).
3.3 野生型与突变体在NaCl胁迫下的萌发情况
在正常 MS培养基下,春化4d后的野生型与
突变体的萌发率基本一致,在第3d即可看到有
90%以上的种子萌发,第6d时,均完全萌发.而
在含有100mM NaCl的 MS平板上,突变体相比
于野生型萌发率要低,第六天时野生型的终萌发
率为90%,突变体仅为78%.在150mM NaCl的
MS平板上,这种影响更大,野生型的终萌发率为
51%,突变体仅为23%,见图3.
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  四川大学学报(自然科学版)   第51卷
图3 NaCl处理下野生型与突变体的萌发率
Fig.3 Seed germination rate of wild type and mutant exposed to different concentrations of NaCl
A.野生型与突变体在含有不同浓度的NaCl的 MS平板上萌发;B.野生型与突变体种子最终萌发率统计,野生
型与突变体种子萌发率在盐胁迫下差异显著P<0.05
A.Seed germination of wild type and mutant plants in different concentrations of NaCl MS plates for 6days;B.
The final seed germination rate of wild type and Mutant plants,the seed germination rate of al mean values are signifi-
cantly different between the wild type and mutant after the salt stress(P<0.05).
图4 盐胁迫对野生型与突变体根长的影响
Fig.4 Root length of wild type and mutant plants exposed to different concentrations of NaCl
A.野生型与突变体幼苗在不同浓度的NaCl的 MS平板上生长六天后的根长情况;B.野生型与突变体的根长统计,
野生型与突变体根长在盐胁迫下差异显著P<0.05.
A.Root length of wild type and mutant plants in different concentrations of NaCl MS plates for 6days;B.The final
root length of wild type and mutant plants,the root length of al mean values are significantly different between the wild type
and mutant after the salt stress(P<0.05).
3.4 野生型与突变体在NaCl胁迫下的根长情况
在正常的 MS培养基条件下生长9d,野生型
与突变体的根长基本一致,均为70mm左右.100
mM,150mM 的 NaCl的平板上,二者根长均变
短,在同一浓度的盐平板上,突变体根长比野生
型的更短.在 MS上生长两天将其移到含有100
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第3期   赵成等,拟南芥中一个参与盐胁迫应答的基因的T-DNA插入纯合突变体的鉴定及表型分析 
mM,150mM 的 NaCl的 MS平板上,在100
mMNaCl的 MS平板上,野生型的根长为48mm,
突变体根长为26mm.在150mMNaCl的 MS平
板上,野生型的根长为21mm,突变体根长为11
mm.
3.5 野生型与突变体在NaCl胁迫下的苗期的生
长情况
在 MS上生长了7d的野生型与突变体拟南
芥幼苗移至150mMNaCl的 MS平板上生长两周
后,发现有75%的突变体幼苗表现出萎黄,枯萎
的症状,而大部分野生型幼苗仍能长势良好,见
图5.
图5 盐胁迫对野生型与突变体幼苗生长的影响
Fig.5 The influence of NaCl stress on germination and development of WT and Mutant plants
A.野生型与突变体幼苗分别在含有不同浓度的NaCl的 MS平板上生长21天,在含有150mM NaCl的 MS
平板上,与野生型相比,突变体更容易出现萎黄、枯萎的症状;B.野生型与突变体的存活率统计,野生型与突变
体的存活率,野生型与突变体根长在盐胁迫下差异显著P<0.05.
A.Germination and development of wild type and mutant plants in different concentrations of NaCl MS plates
for 21days,Compared with the wild type,the mutant seedlings are more prone to be chlorosis when they are
growing on the MS medium with 150mMNaCl.B.The final Survival rate of wild type and mutant plants,the sur-
vival rate of al mean values are significantly different between the wild type and mutant after the salt stress(P<
0.05).
4 讨论
在突变体鉴定实验中,首先从DNA水平上鉴
定,在LP,RP作为引物时,突变体没有检测到条
带,野生型看到有明显的条带,表明T-DNA有插
入到突变体中,同时在LB,RP作为引物时候,突
变体检测到条带,野生型中没有看到条带,这表明
在DNA水平上这一株突变株是纯合的.然后用
PT-PCR分析了野生型与突变体的转录水平,结
果显示突变体中没有检测到条带,这表明在RNA
水平上,目的基因没有转录.然后通过 RT-PCR
分析了目的基因的表达谱,在水,蔗糖,甘露醇,
以及ABA处理下,该基因的表达跟野生型的表达
量基本一致,然而在NaCl处理下,该基因的表达
量明显升高,表明该基因受到盐的诱导[13,15].该
基因可能参与拟南芥中盐信号通路[12].
在正常的 MS培养条件下,野生型与突变体
的萌发率,根长以及幼苗的生长状况基本一致.表
明该基因的突变体与野生型正常条件下生长没有
差异,说明该基因不影响正常的生长过程.在NaCl
胁迫下,二者的萌发率均受到抑制,但是突变体的
萌发率比野生型低,同时,突变体的根长在盐胁迫
下比野生型要短,并且在幼苗的生长过程中,想对
于野生型,突变体对盐胁迫更加敏感,更容易表现
出萎黄,枯萎的症状.由这些结果表明,该基因在
拟南芥中NaCl的胁迫应答中[9,14],是参与该途径
的一个调控因子.当然,该基因更加明确的作用机
制还有待于进一步研究[16].
近年来,越来越多的研究表明,RING结构是
植物体内广泛存在的一种保守结构域,RING结构
在植物非生物胁迫应答中发挥着重要作用.先前
的研究表明,含有RING结构的基因很多具有E3
连接酶的活性,参与泛素降解途径.本研究的研究
对象也含有RING结构,同时该基因参与盐胁迫
途径的应答过程,因此推测该基因参与盐胁迫过
程可能是通过泛素途径而发挥作用的[6-8],具体是
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如何发挥其功能的,当然还需要更多的研究进行
验证补充.
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