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拟南芥AtATG8c基因缺失突变体的鉴定及其对非生物胁迫的响应



全 文 :第37卷第5期
2014年9月
河 北 农 业 大 学 学 报
JOURNAL OF AGRICULTURAL UNIVERSITY OF HEBEI
Vol.37No.5
Sep.2014
文章编号:1000-1573(2014)05-006-06  DOI:10.13320/j.cnki.jauh.2014.0105
拟南芥AtATG8c基因缺失突变体的
鉴定及其对非生物胁迫的响应
田丽娟,魏凤菊,高 翔,赵甜甜,刘 刚,侯春燕,王冬梅
(河北农业大学 生命科学学院,河北 保定 071001)
摘要:本研究利用反向遗传学方法研究AtATG8c基因在拟南芥抵抗非生物逆境胁迫中的功能。首先在DNA
水平鉴定获得了atatg8c突变体的T-DNA插入纯合植株,接着在转录水平进一步检测AtATG8c基因的敲除
情况,RT-PCR结果显示atatg8c为T-DNA插入敲除突变体。对野生型和突变体拟南芥在幼苗期与成苗期进
行盐、干旱、营养胁迫试验。结果表明:无论是在幼苗期还是在成苗阶段,atg8c突变体较野生型对不同逆境胁
迫更为敏感,主要表现出在幼苗期根的生长受到了明显抑制,在成苗期叶片表现出萎蔫、枯黄、衰老快的特征。
说明AtATG8c基因在拟南芥抵抗各种非生物胁迫中发挥了重要作用。
关 键 词:拟南芥;AtATG8c;非生物胁迫
中图分类号:Q945.78 文献标志码:A
  收稿日期:2014-06-20
  基金项目:国家自然科学基金项目(31171472);高等学校博士学科点专项科研基金资助课题(优先发展领域)
(2011302130001).
  作者简介:田丽娟(1985-),女,河北省灵寿县人,硕士,主要从事植物逆境生物学研究。
  通讯作者:王冬梅(1963-),女,河北省景县人,博士,教授,主要从事植物逆境分子细胞生物学研究.
Tel:0312-7528276,E-mail:dongmeiwang63@126.com
Identification of T-DNA insert AtATG8cgene mutant in
Arabidopsisthalianaand its response in abiotic stress
TIAN Li-juan,WEI Feng-ju,GAO Xiang,ZHAO Tian-tian,LIU Gang,
HOU Chun-yan,WANG Dong-mei
(Colege of Life Science,Agricultural University of Hebei,Baoding 071001,China)
Abstract:In this study,the function of AtATG8cgene in resisting against abiotic stress was
characterized using reverse genetics method.Firstly,the T-DNA inserted atatg8cmutant was
identified to be homozygous at DNA level by PCR,then the knockout condition of AtATG8c
gene was further identified at transcription level,the RT-PCR result revealed that atatg8cwas
inserted knockout mutant.Drought,salt,and nutritional stress experiments on wild type and
mutant Arabidopsis thaliana at seedling and stocking stage were performed.The results
showed that,atg8cmutants were more sensitive than wild type in different stresses at the
both stage,and the major performance was that the root growth was significantly inhibited in
seedling stage,and the leaves at stocking stage showed the characteristics of wilting,withered
and yelow,and aging fast.These results showed that AtATG8cgene played a crucial role in
Arabidopsis thaliana resisting against various kinds of abiotic stresses.
Keywords:Arabidopsis thaliana;AtATG8c;abiotic stress
 第5期 田丽娟等:拟南芥AtATG8c基因缺失突变体的鉴定及其对非生物胁迫的响应
  自噬(Autophagy)是广泛存在于真核生物细胞
内的一种生命现象,是细胞在营养缺乏或应激条件
下,通过降解细胞内衰老的长寿命蛋白质、受损伤的
细胞结构和细胞器,为细胞的重建、再生和修复提供
必需原料,实现细胞内物质的再循环和再利用,是生
物体中一种重要的防御和保护机制[1]。已有研究表
明,在营养缺乏、植物免疫反应、叶片衰老以及环境
胁迫应答中均有自噬的参与[2-3]。
自噬相关基因(Autophagy-related gene,ATG)编
码的蛋白是参与自噬过程许多阶段的核心因素[4]。
到目前为止在酵母中已经发现了31种ATG 蛋白,其
中18个被证明参与了自噬体的形成(ATG 1-10,
ATG 12-14,ATG 16-18,ATG 29,ATG 31)[5]。这些基
因的编码产物参与到自噬小泡形成的各个过程,包括
自噬的诱导、小泡的成核、延伸、成熟及与液泡的融合
等[6]。其中ATG 8与磷脂酰乙醇胺结合后进入自噬
小泡的膜层,对自噬小泡的延伸与成熟是必需的,在
自噬体的形成过程中发挥重要作用[7],通常ATG 8被
用作自噬体的标记蛋白[8]。已有研究表明,拟南芥无
论在正常生长条件下,还是在饥饿胁迫条件下,都有
ATG8基因的表达,并且在根中的表达量高于茎和
叶,主要在根的成熟区和与土壤接触的根冠中表
达[9]。Oshimoto等人[10]发现,在拟南芥缺氮的条件
下,ATG8a-ATG 8f 在 转 录 水 平 均 呈 上 调 表 达。
Chung等[11]观察到,在黑暗处理与缺氮条件下,玉米
的ATG8均上调表达。目前关于ATG8 的研究多
以酵母为研究材料,来自拟南芥的报道也多集中于
ATG8在转录水平上响应个别逆境胁迫的表达模式
研究。本研究以一份拟南芥 T-DNA 插入突变体
(Atatg8c)为材料,通过对突变体的筛选鉴定,以期
获得该基因缺失表达的纯合突变体;通过对该突变
体与野生型拟南芥在不同非生物逆境胁迫下的生长
表型观察,对AtATG8c在植物抵抗非生物逆境胁
迫中的作用进行探讨,为全面阐释AtATG8c的功
能和作用机理奠定基础。
1 材料与方法
1.1 材料
野生型拟南芥(Arabidopsis thaliana,Colum-
bia ecotype)为河北农业大学生命科学学院植物逆
境生理实验室保存。AtATG8c基因(AT1G62040)
T-DNA插入突变体购自 ABRC(The Arabidopsis
Biological Resource Center),编 号 为 SALK
150631C。
1.2 试剂和工具酶
RNAisoTMplus植物总 RNA提取试剂、RNase
inhibitor、DNA Marker、TransScript First-Strand
cDNA Synthesis SuperMix均购自 TAKARA 公
司。dNTP、Taq DNA聚合酶购自Tiagen公司;其
他生化试剂均为进口分装或国产分析纯试剂。
1.3 拟南芥的培养
种子经消毒液[0.5%(v/v)NaClO + 0.01%
(v/v)Triton X-100]消毒15min,无菌水洗5~6次,4
℃黑暗处理2d。然后点种于 MS培养基上,生长7d
左右,将幼苗移栽到土壤(蛭石∶营养土=1∶1)中,用
透明塑料膜覆在花盆上保持湿度,4~5d后,揭去塑
料膜。生长条件为:光/暗周期为16h/8h,温度22
℃,湿度60%,光照强度80~100μmol/m
2s。
1.4 拟南芥AtATG8c突变纯合体的鉴定
按照 SDS 方 法 提 取 拟 南 芥 叶 片 基 因 组
DNA[12],以基因组DNA为模板,根据http://sig-
nal.salk.edu/网站上提供的 T-DNA 插入位点信
息,设计引物,利用PCR技术检测该突变体是否为
纯合体。引物分别为:LB:TGGTTCACGTAGT-
GGGCCATCG,LP:CTTTCCCTTTGAAAGTCG-
GAC,RP:CCTAGTGGGTGTTCCAACTTG,由生
工生物工程(上海)股份有限公司合成。
1.5 RT-PCR检测AtATG8c基因的表达量
按照Takara RNAisoTMPlus植物总RNA提取
试剂盒的方法提取RNA,将提取的RNA反转录为
cDNA,以此为模板,内参基因 EF1a 作为对照,
EF1a 引物序列为 EF1-F:5’-ATGCCCCAGGA-
CATCGTGATTTCAT-3’,EF1-R:5’-TTGGCG-
GCACCCTTACGTGGATCA-3’。反 应 条 件 为:
94℃5min;94℃30s,55℃30s,72℃50s,18~
25个循环;72℃10min。按照调整内参基因的模板
量,进行目的基因扩增。目的基因引物序列为
AtATG8c-F:5’-TGGCTAATAGCTCTTTCAAG-
3’,AtATG8c-R:5’-CT CCACTGA AAGTCATG-
TAG-3’。反应条件为:94℃5min;94℃30s,55
℃30s,72℃30s,25个循环;72℃10min。琼脂
糖凝胶电泳检测PCR产物。
1.6 非生物逆境胁迫应答表型分析
1.6.1 幼苗阶段逆境处理 野生型和atg8c突变

河 北 农 业 大 学 学 报 第37卷 
体种子点种于 MS培养基上,在温室正常条件下竖
直培养4d。每种基因型的拟南芥选取6棵长势相
同的幼苗移栽到 MS及不同处理(4% PEG、170
mmol/L NaCl、缺蔗糖、缺氮、缺磷)的 MS培养基上
进行处理。14d后,观察幼苗生长状态。
1.6.2 成苗阶段逆境处理 将 MS培养基上生长
7d的幼苗移栽到装有同样重量营养土的小盆中,正
常生长4周后,分别进行盐处理和干旱处理。盐处理
时,将长势相同的不同基因型幼苗浇足水,直到再次
需要浇水时处理组浇含170mmol/L NaCl盐溶液,对
照组定期浇水;干旱处理时,将长势相同的不同基因
型幼苗浇足水,直到再次需要浇水时处理组一直不浇
水,而对照组定期补充水。缺磷处理时,先将 MS培养
基上生长7d的幼苗移栽到装有同样重量蛭石的小盆
中,待正常生长4周后,选取长势相同的幼苗浇足水,
直到再次需要浇水时处理组浇缺磷的Hoagland营养
液,而对照组一直补加全成分Hoagland营养液。对以
上各种处理的幼苗进行植株生长状态观察并拍照。
1.6.3 成苗阶段黑暗处理 取生长4周的第一或
第二片真叶作为试验材料,将叶片按顺序放置在用
3mmol/L MES(pH 5.7)浸湿的滤纸上,之后放置
在黑暗环境下。每隔一天观察叶片变化,并照相。
2 结果与分析
2.1 AtATG8c基因T-DNA插入突变体的鉴定与基
因表达情况
ABRC提供的信息显示,atatg8c突变体的 T-
DNA插入位点为距起始密码子 ATG上游第134
核苷酸处,位于第2个内含子上(图1)。为了检查
atatg8c突变体(SALK_150631C)是否为纯合体,利
用PCR方法在 DNA水平检测 T-DNA插入的情
况。结果如图2所示,用LB+RP引物搭配,1、2、3
号植株可以扩增出约700bp的条带,野生型不能扩
出条带;利用LP+RP进行搭配,1、2、3号植株未见
条带,而野生型样品的泳道可见约900bp的条带。
以上结果表明1、2、3号植株均为AtATG8c基因的
T-DNA插入纯合体。
为进一步检测AtATG8c基因在转录水平的表
达情况,通过RT-PCR技术比较突变体与野生型植
株中AtATG8c的表达水平,结果如图3,野生型材
料中可以观察到很亮的AtATG8c条带,而突变体
中几乎没有AtATG8c的表达,这一结果表明,被检
测的突变体株系为AtATG8c基因敲除突变体。
图1 拟南芥atg8c突变体T-DNA插入位点
Fig.1 The T-DNA insertion site of
Arabidopsis thaliana atg8cmutant
M:Marker;1、2、3,分别代表3个不同的突变体株系;
WT:野生型拟南芥
图2 突变纯合体的PCR鉴定
Fig.2 PCR for homozygous mutation
图3 野生型和突变体中AtATG8c的表达量分析
Fig.3 Expresstion analysis of AtATG8cin
wild-type and mutant seedlings
2.2 幼苗阶段非生物胁迫下的生理表型观察
在正常 MS培养基上,野生型与atg8c突变体的
幼苗生长状态正常且无明显差异(图4A)。当野生型
和突变体幼苗处于4%PEG(图4B)和缺氮培养基(图
4E)上时,幼苗根部和冠部的生长较在 MS上均受抑,
突变体的根较野生型稍短;在170mmol/L NaCl培养
基(图4C)上,突变体和野生型的生长均受到严重抑
制,且突变体受抑制程度更重,根部明显比野生型短,
冠部也表现出较野生型生长更弱的表型;在缺碳(缺
蔗糖,图4D)和缺磷(图4F)的培养基上,拟南芥根部
和冠部的生长相较在 MS上均受到抑制,尤其在缺磷
的培养基上受抑更为明显,且突变体的根长较野生型
受抑程度更重。以上结果表明,在不同逆境条件下拟

 第5期 田丽娟等:拟南芥AtATG8c基因缺失突变体的鉴定及其对非生物胁迫的响应
南芥生长均受到了抑制,但突变体较野生型对不同逆
境胁迫更为敏感,尤其根的生长受抑明显。从中可以
看出,atg8c突变体对上述逆境胁迫的耐受程度不如
野生型,表明AtATG8c基因可能与拟南芥幼苗期抵
抗各种非生物胁迫有关。
A:MS培养基上拟南芥生长表型;
B:含4%PEG培养基上拟南芥生长表型;
C:含170mmol/L NaCl培养基上拟南芥生长表型;
D:缺碳培养基上拟南芥生长表型;
E:缺氮培养基上拟南芥生长表型;
F:缺磷培养基上拟南芥生长表型
图4 野生型与atg8c突变体苗期
在非生物逆境下的表型差异
Fig.4 Phenotypic differences between wild-type and
atg8cseedlings on abiotic stress medium.
2.3 成苗阶段黑暗处理生理表型观察
为了解AtATG8c基因在叶片衰老过程中的作
用,本研究观察了拟南芥野生型与突变体离体叶片
在黑暗处理下的变化。结果表明,atg8c突变体在
黑暗处理的第4天,叶片的近叶柄部出现褪绿,第6
天叶片整体变白,此后随着黑暗天数增加叶片枯黄
趋于严重;而野生型材料在第6天时叶片开始褪绿,
第8天叶片仍呈浅绿色,第10天才开始整片叶变
白。黑暗处理试验显示,atg8c突变体表现出较野
生型加速衰老的表型,说明AtATG8c基因可能与
拟南芥叶片衰老过程中叶绿体的降解有关。
图5 野生型与atg8c突变体的离体
叶片在黑暗处理下的变化
Fig.5 Changes of wild-type and atg8c
mutants detached leaves in the dark
2.4 成苗阶段缺磷处理生理表型观察
成苗阶段进行缺磷处理时,发现在生长后期,
atg8c突变体莲座叶较早出现枯黄、萎蔫的衰老现
象(图6A),突变体的主茎纤细,株高明显低于野生
型植株(图6B,6C,P<0.05)。这说明ATG8c基因
对植物的营养生长至关重要,可能与植物对磷素的
吸收、利用有关。
A:缺磷处理后莲座叶表型;B:缺磷处理后株高表型差异;
图6 野生型与atg8c突变体在缺磷胁迫下表型差异
Fig.6 Phenotype difference between wild-type and atg8cmutant under phosphorus deficiency stress

河 北 农 业 大 学 学 报 第37卷 
2.5 成苗阶段干旱处理生理表型观察
成苗阶段进行干旱处理时,处理组经过一段时
间的干旱胁迫,atg8c突变体植株均表现萎蔫干枯,
而野生型植株与对照组植株长势相近,只是处理组
的叶片略显萎蔫(图7)。说明ATG8c基因在成苗
期拟南芥响应干旱胁迫过程中可能发挥重要作用。
图7 野生型与atg8c突变体
在干旱胁迫下表型差异
Fig.7 Phenotype difference between wild-type
and atg8cmutant under drought stress.
2.6 成苗阶段盐处理生理表型
与对照相比,在盐胁迫下(170mmol/L NaCl处
理1个月),拟南芥atg8c突变体和野生型的叶片均
较对照稍有褪绿现象,两者在植株长势上的差异不
明显。表明ATG8c基因在成苗阶段可能对拟南芥
响应盐胁迫的作用不明显。
3 讨论
在植物生长发育过程中,常会受到盐、干旱等各
种非生物胁迫。通常情况下,高盐往往造成离子胁
迫,而干旱则导致渗透胁迫[13]。这2种胁迫会产生
活性氧(ROS),导致 ROS和氧化相关蛋白的积
累[14-15],进而造成对植物细胞的伤害。有研究表明,
自噬在植物抵抗非生物胁迫中有重要作用,自噬通
过分解氧化相关蛋白和调节ROS水平参与到盐胁
迫和氧化胁迫中[16]。一些自噬相关基因(ATG)在
响应盐胁迫和渗透胁迫时呈上调表达,如拟南芥中
的AtATG8[19]。本研究通过对拟南芥幼苗期与成
苗期atg8c突变体与野生型的表型比较分析,在胁
迫条件下,突变体的生长情况远不如野生型,尤其观
察到幼苗期干旱与盐胁迫下突变体的根长不如野生
型,可见野生型更有利于吸收水分与矿质元素以确
保在 干 旱 与 逆 境 胁 迫 下 的 生 存,更 加 证 实 了
AtATG8c在拟南芥抵抗盐与干旱胁迫中的重要作
用。至于为何在逆境胁迫下突变体的根长不如野生
型的问题,作者拟在以后的研究中通过观察逆境下
突变体根部细胞结构与数量变化以分析原因。
营养胁迫主要是指元素匮乏,比如碳匮乏、氮匮
乏、糖饥饿、黑暗胁迫等。有报道指出,在饥饿和黑
暗胁迫中自噬相关基因在转录水平明显地上调表
达,如 AtATG4a、AtATG4b、AtATG8a-AtATG8i、
AtATG3和AtATG7,自噬提供了细胞不仅适应氮
缺乏而且适应氮过多的机制[17-18]。本研究发现,
atatg8c突变体无论在幼苗还是成苗阶段的营养胁
迫下均表现出较野生型弱的生长状况,尤其在幼苗
期缺碳和缺磷的培养基上野生型的根长明显长于突
变体,说明ATG基因不受损的野生型更有利于从
环境中吸收矿质营养,在营养匮乏条件下较突变体
更利于生长生存。Wada等人[19]的研究发现,黑暗
处理时,野生型拟南芥叶肉细胞的液泡内观察到大
量降解Rubisco的自噬体和3~4μm含部分叶绿体
的结构,而突变体(atg4a、atg4b-1)液泡中则没有观
察到这两种结构,推测在饥饿条件下,植物细胞可以
利用自噬降解叶绿体维持生命活动。本研究也发
现,在黑暗处理条件下atg8c突变体表现出较野生
型加速衰老的表型,说明AtATG8c基因可能与拟
南芥叶片衰老过程中叶绿体的降解有关。
本研究中,拟南芥野生型植株在各种非生物逆
境下均表现出了较atg8c突变体好的生长表型,说
明AtATG8c基因在植物响应各种非生物胁迫中均
表现出了一定的功能,表明AtATG8c基因在植物
抵抗盐、干旱和营养匮乏胁迫中可能发挥重要作用。
这为进一步阐释AtATG8c的功能和作用机理奠定
了基础,对深入研究自噬在植物响应各种非生物逆
境胁迫中的作用具有促进作用。
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(编辑:梁 虹)
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