全 文 ：基因组学与应用生物学，2010年，第 29卷，第 1期，第 63-70页
Genomics and Applied Biology, 2010, Vol.29, No.1, 63-70
研究报告
A Letter
中国西南区扁穗牛鞭草种质遗传多样性的 SRAP分析
范彦 * 徐远东 蒋安 王平
重庆市畜牧科学院,重庆, 400015
*通讯作者, cq_fy001@163.com
摘 要 本研究采用 SRAP标记对主要来自中国西南地区(四川,重庆,贵州和云南)的 43份扁穗牛鞭草种质
资源的遗传多样性进行了分析。试验筛选出了 11对引物组合对 43份供试材料进行扩增，共获得 153条带，
其中多态性条带 140条，多态性条带比率为 91.50%，平均每对引物扩增出条带 13.91，多态性条带 12.73。实验
数据结果表明，43份扁穗牛鞭草材料间的遗传相似系数(GS)为 0.565~0.992，平均值为 0.723，表现出了丰富
的遗传多样性。聚类分析结果表明，各供试材料间的聚类与其地理来源以及形态特征类型具有一定的相关
性。同时，主成分分析结果能够直观的反映了各种质间的遗传关系。5个扁穗牛鞭草地理类群间的分子方差分
析(AMOVA)揭示了供试的扁穗牛鞭草总遗传变异的 85.99%存在于类群内，仅有 14.01%的变异存在于类群
之间，类群间的分化系数 ΦST=0.140。本研究结果为扁穗牛鞭草种质的收集、利用及育种提供了理论依据。
关键词 扁穗牛鞭草, 中国西南区, 遗传多样性, SRAP
Genetic Diversity of Hemarthria compressa Germplasms in Southwest China
bySRAPAnalysis
Fan Yan * Xu Yuandong Jiang An Wang Ping
ChongQing Academy of Animal Sciences, Chongqing, 400015
* Corresponding author, cq_fy001@163.com
DOI: 10.3969/gab.029.000063
Abstract In this paper, we have investigated and analyzed the genetic diversity of 43 Hemarthria compressa ac-
cessionsmainlyfromSouthwestChina (Sichuan,Chongqing,GuizhouandYunnanprovince) byusingSRAP(sequence
-related amplified polymorphism) technology. We have selected 11 primer pairs to identify the polymorphism a-
mong the 43 tested materials. and acquired 153 DNA fragments, 140 distinguishable bands of which were ampli-
fied that accounted for 91.5% polymorphism. The average number of bands of each tested primer was 13.91, and
the average number of polymorphism bands of which was 12.73. Experimental data showed that the genetic simi-
larity coefficient (GS) among all accessions ranged from 0.565~0.992 with the mean of 0.723, which also indicated
that the genetic diversity was comparatively rich among the tested materials. Cluster analysis results also revealed
that the clustering among tested materials was associativity with theirs geographic origins, ecological types and
morphological characteristics. Moreover, the result of principal coordination analysis (PCoA) could be intuitively
showed the genetic relationships among all tested materials. AMOVA (analysis of molecular variance) of five geo-
graphical groups of H. compressa revealed that 85.99% of total variation occurred within the groups, and 14.01%
of total variation occurred among the groups, with 0.140 for ΦST value. The results of this study should be provid
references for the collection, breeding and conservation of H. compressa.
Keywords Hemarthria compressa, Southwest China, Genetic diversity, SRAP
www.genoapplbiol.org/doi/10.3969/gab.029.000063
基金项目：本研究由重庆市重大专项项目(CSTC, 2009AA1008)和国家科技支撑计划项目(2008BADB3B10-2)共同资助
基因组学与应用生物学
Genomics and Applied Biology
扁穗牛鞭草[Hemarthria compressa (L, F) R.Br.]，
别名牛仔草、铁马鞭，为禾本科黍亚科牛鞭草属
(Hemarthria)多年生根状茎禾草(陈默君和贾慎修 ,
2002)。扁穗牛鞭草主要靠根茎和匍匐茎繁殖，是一种
生长期长、生长速度快、再生能力强和产量高的优良
饲草(杨春华等, 2004)。野生扁穗牛鞭草广泛分布在
长江流域地区，且存在多种生态类型。由于其绿期
长、固土能力强且耐粗放管理，具有很强的适应性和
抗逆性，对长江流域退耕还草、种草养畜、水土保持
及绿化等均有广泛应用(吴彦奇和杜逸, 1992;杨春
华等, 2004)。截止到 2009年，四川农业大学已经选育
出了中国仅有的 3个扁穗牛鞭草品种，其中“广益”
和“重高”两个品种在南方各省推广百万余亩，已成
为川渝等地草食牲畜业发展中的当家草种，在南方
草地畜牧业中发挥了重要的作用 (杨春华等, 2004)。
而目前对野生扁穗牛鞭草种质的遗传背景，不同地
域分布的各种生态类型种质的遗传多样性研究及分
子遗传分析方面研究报告较少。
相关序列扩增多态性(sequence-related amplified
polymorphism, SRAP)是由 Li和 Quiros (2001)创建的
一种主要针对开放阅读框 (ORFs) 进行扩增的 DNA
分子标记技术，该技术主要是利用不同个体或者物
种的内含子、启动子及间隔区长度不同而产生多态
性。SRAP技术在应用中表现出简便、稳定、产率高等
特点，在一些农作物的遗传图谱构建、比较基因组学
等中得到了成功的应用(Budak et al., 2004; Li et al.,
2003)。目前，该标记技术在草类植物中的狗牙根、野
牛草以及鸭茅等的种质资源评价及遗传图谱构建中
得到了成功的应用(易杨杰等, 2008; Zeng et al., 2008)。
但是目前还未见到关于扁穗牛鞭草的 SRAP标记研
究的报道，本试验对主要来自中国西南区的不同生
态类型的扁穗牛鞭草材料进行 SRAP分析，旨在为
扁穗牛鞭草的种质资源的研究利用，以及优良新品
种的选育提供理论依据。
1结果与分析
1.1 SRAP扩增的多态性
试验选用 11对引物组合对 43份供试材料进行
SRAP扩增，共得到 153条清晰可辨的条带，其中多态
性条带 140条，多态性条带比高达 91.50%，扩增的
DNA片段大小集中在 100~1 500 bp之间(表 1;图 1)。
其中，单对引物扩展条带数变幅为 10条(Me1+Em8)
到 16 条(Me9+Em8, Me6+Em6 和 Me9+Em4)之间，
每对引物平均扩增条带数为 13.91，多态性条带数
12.73。同时，单对引物的 PIC 值变幅为 0.206 7
(Me1+Em8)到 0.395 6 (Me3+Em7)之间，平均值为
0.244 6，其中引物对 Me3+Em7、Me6+Em9等表现出
了较高的检测效率和重要性。试验结果表明了 SRAP
多态性较高，能检测出较多的遗传位点。
1.2遗传相似性分析
对 43份供试材料进行采用 Nei-Li 遗传相似系
数计算各个材料间的遗传相似系数，种质的平均遗
传相似系数 GS值为 0.723，变幅在 0.565~0.992之
间。其中同来自四川绵阳的 H023和 H025之间的遗
传相似系数最大为 0.992，亲缘关系最近，来自贵州
独山的 H043 和四川都江堰的 H015 之间的遗传相
似系数最小，为 0.565，表现出了较远的亲缘关系。
1.3 聚类分析
基于 Nei-Li遗传相似系数，利用 UPGMA方法
对 43份供试材料进行了聚类分析(图 2)。在 43份扁
穗牛鞭草种质的聚类过程中，各供试材料间并没有
被严格的区分开。但同时我们也可以发现部分来自
图 1引物组合Me3+Em7对 43份供试材料的 SRAP扩增
注: 1~43供试材料见表 1
Figure1 SRAP amplification patterns by primer pair Me3+Em7 for 43 tested materials
Note: 1~43: Materials listed in the table 1
www.genoapplbiol.org
DOI: 10.3969/gab.029.00006364
中国西南区扁穗牛鞭草种质遗传多样性的 SRAP分析
Genetic Diversity of Hemarthria compressa Germplasms in Southwest China by SRAP Analysis
相同或者相似地理的材料能够聚在一起，如分别来
自贵州和云南的材料全部按照地域聚在一起，来自
四川和重庆的材料生态类型复杂多样，聚类中的交
叉也较多。这也可能与四川和重庆两地的地理位置
相近，部分材料的生态环境条件相似有关。
此外，根据陈永霞等(2005b)对西南区扁穗牛鞭
草种质的形态学研究与 SRAP的聚类结果结合又可
以将供试的 43 份扁穗牛鞭草分成 5 类，A 类包括
H002与“广益”两份材料，此类材料形态特征表现为
高大直立型；B类则包括了供试材料的绝大部分，该
类形态特征上基本上都是属于纤细低矮型；C类只
有 H029一份材料，形态特征表现为高大直立；D类
包括 H031、H019和 H068三份材料，该类形态特征
主要表现为粗壮低矮型；E类只有 H015一份，形态
上也表现为纤细低矮。聚类分析的结果表明了供试
的扁穗牛鞭草材料的遗传关系与其地理分布、生态
类型、形态特征等具有一定的相关性。
1.4主成分分析
基于遗传相似系数，在 NTSYS2.1软件上对不
同材料进行主成分分析，并绘制出前两个主成份的
二维散点图(图 3)。从图 3可知，其中的第一、第二和
第三主成分分别能够解释总的遗传变异的 18.09%、
7.46%和 6.48%。
从主成分分析图上也可以看出位置相靠近者表
示关系密切，远离者表示关系疏远。将位置靠近的供
试材料材料划归在一起，结果表明主成分分析结果
与聚类分析结果基本一致，主成分分析结果更直观
地表明了不同扁穗牛鞭草材料之间的亲缘关系。
表 1 43份供试材料 SRAP扩增的多态性
Table 1 The polymorphic amplified of SRAP of 43 tested materials
引物对
Primer pairs
Me1+Em6
Me1+Em8
Me3+Em7
Me5+Em9
Me6+Em2
Me6+Em6
Me6+Em9
Me9+Em1
Me9+Em4
Me9+Em8
Me9+Em9
扩增总条带数
Total number
of bands (TNB)
12.00
10.00
15.00
13.00
10.00
16.00
15.00
15.00
16.00
16.00
15.00
多态性条带数
Number of polymorphic
bands (NPB)
11.00
9.00
15.00
13.00
9.00
13.00
15.00
13.00
15.00
14.00
13.00
多态性比率(%)
Percentage of polymorphic
bands (%)
91.67
90.00
100.00
100.00
90.00
81.25
100.00
86.67
93.75
87.50
86.67
多态性信息含量
Polymorphic information
content (PIC)
0.225 3
0.206 7
0.395 6
0.233 8
0.217 3
0.208 9
0.281 7
0.238 1
0.227 4
0.232 0
0.223 5
图 2 43份供试材料基于Dice系数的UPGMA聚类图
注: 1~43:材料名称见表 1; A: 1,30; B: 11,9,31,12,6,34,35,36,37,24,
25,27,38,28,7,8,22,23,33,39,40,43,41,13,16,17,18,20,19,21; C: 26;
D: 4,15,29; E: 42
Figure 2 The UPAGMA dendrogram of 43 accessions based on
Dice coefficients
Note: 1~43: Materials listed in the table 1; A: 1,30; B: 11,9,31,12,6,
34,35,36,37,24,25,27,38,28,7,8,22,23,33,39,40,43,41,13,16,17,18,
20,19,21; C: 26; D: 4,15,29; E: 42
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基因组学与应用生物学
Genomics and Applied Biology
1.5地理类群遗传结构及聚类分析
根据供试的 43份扁穗牛鞭草的地理来源及生
态环境条件将其划分为 5个地理类群，即重庆(16份,
包括 1份来自四川达州材料)、云南(2份)、贵州(6份)、
四川(15 份)以及攀西地区(4 份 , 包括 H026, H028,
H029和 H053)。为了解不同地理类群之间的遗传结
构，试验基于 SRAP数据矩阵进行了分子变异方差
分析(AMOVA)。AMOVA结构表明在总的遗传变异
中有 85.99%发生在类群内，有 14.01%发生在类群间
(ΦST=0.140)，群体间和群体内的变异均为极显著
(P<0.001) (表 2)。
对地理类群的 AMOVA分析也得到了各个类群
间的 ΦST值，它可以代表标准化的类群间遗传距离
(pairwise ΦST distance) (表 3)。各个类群间成对 ΦST
的变幅为 0.052 0 (四川类群与重庆类群之间)到 0.4741
(云南类群与攀西类群之间)。其中云南类群与其他几
个类群的距离稍远，表现出一定的特异性。同时，为
更好的了解各类群间的遗传关系，基于表 3中各个
地理类群之间的 ΦST 遗传距离进行 UPGMA聚类
分析(图 4)。5个地理群中四川与重庆地理类群首先
聚在一起，其次与贵州、攀西类群聚在一起，最后是
云南类群。地理类群的聚类结果与 43份供试材料的
UPGMA聚类结果具有一定的相似之处。
2讨论
2.1扁穗牛鞭草遗传多样性的 SRAP分析
本研究采用 SRAP对 43 份供试材料进行遗传
多样性分析，结果表明 11对引物组合能够在 43份
供试材料中的 153个基因位点扩增出条带条清晰可
辨条带，多态性条带比高达 91.50%。这些结果都表
明了供试中国西南区扁穗牛鞭草在分子水平上具有
丰富的遗传多样性。该研究结果与中国西南区扁穗
牛鞭草的形态学和生化水平的研究结果相一致，均
表明了中国西南区扁穗牛鞭草具有丰富的遗传多样
性，是扁穗牛鞭草种质资源的重要分化区域(陈永霞
等, 2005;刘金平等, 2006)。
本研究中 SRAP标记检测到了较高的多态性位
点，其多态性位点比率达到 91.5%，高于 ISSR 标记
的 84.2%和 86.21%以及 AFLP标记的 88.60% (范彦
等, 2007; Huang et al., 2008;刘金平等, 2006)。这些也
都说明了 SRAP标记是研究扁穗牛鞭草遗传多样性
的一种简单、有效的手段。
2.2扁穗牛鞭草种质间的遗传关系
在同一气候带，生境条件的差异是影响植物的
生长、发育和分布的重要因素。生态地理环境的差异
对植物的遗传变异有明显的影响。本研究结果表明
部分来自相同或者相近地域的材料的遗传亲缘关系
相对较近，能够聚在一起，其遗传关系呈现一定的地
域性差异。如来自四川和重庆的材料之间的关系较
近，聚类有交叉，而来自贵州和云南的材料都先是本
地区的单独聚在一起。这就与材料来源地的生态地
理条件有关，如四川和重庆地区基本上可以看成是
盆地丘陵类型，生态地理条件相似；而云南和贵州地
区则具有高原的气候特点，形成了特别的生态地理
环境。对于来自不同地理来源的种质能够聚在一起，
具有相对较近的亲缘关系。这可能的原因有：一是在
相同或者相似的生境条件产生了具有相同或者相似
图 3基于 SRAP数据的 43份供试材料的主成分分析二维散
点图
注: 1~43:材料名称见表 4
Figure 3 Two dimensional principal coordination analysis of
43 tested materials based on SRAP datas
Note: 1~43 Materials listed in the table 4
图 4基于 ΦST遗传距离对 5个扁穗牛鞭草地理类群的 UPG-
MA聚类图
Figure 4 UPGMA cluster dendrogram of five geographic groups
of H. compressa based on pairwise ΦST distances
www.genoapplbiol.org
DOI: 10.3969/gab.029.00006366
的选择压力下，形成了相似的生态类型；二是由于扁
穗牛鞭草具有较强的无性繁殖能力，河流等自然因
素以及人类活动等都可能使其转入异地扩展繁殖。
目前在中国西南区扁穗牛鞭草种质中发现有四倍体
(2n=4x=36)和六倍体(2n=6x=54)两种倍性，但是有限
的细胞学的资料还不能给分子水平的研究提供足够
的有效信息，相反本试验得到的分子数据也不能明
显的得出其倍性的差异等。所以，在今后的工作中应
该将分子水平和细胞水平等资料进行进一步的研
究，以期为揭示扁穗牛鞭草种质间的遗传关系提供
必要的信息。
2.3扁穗牛鞭草不同地理类群间的遗传关系
本研究中 AMOVA结果表明 85.99%的变异在
类群内，14.99%的变异在类群间，且类群间的分化系
数 ΦST仅为 0.140。Huang等(2008)分析了我国西南
区 12个扁穗牛鞭草自然居群的遗传分化，研究发现
48.02%的变异存在于不同的居群间，分化系数
0.486，均高于本研究的类群间变异和分化系数。这可
能与不同地理类群的划分有关，同时供试材料类群
并不是严格按照自然居群采样分析，来自不同地点
表 2 5个扁穗牛鞭草地理类群间的分子变异方差分析(AMOVA)
Table 2 Analysis of molecular variance (AMOVA) of five geographical groups of H. compressa
变异来源
Source of variation
类群间
Among groups
类群内
Within groups
总计
Total
自由度
d.f.
4
38
42
方差和
Sum of squares
145.95
618.24
764.19
变异组分
Variance component
2.65
16.27
18.92
变异百分率(%)
Percentage of variation (%)
14.01
85.99
P值
P value
<0.001
<0.001
表 3 5个扁穗牛鞭草地理类群间的 ΦST遗传距离
Table 3 Pairwise ΦST distances among five geographic groups of H. compressa
地理类群
Geographic groups
重庆
Chongqing
云南
Yunnan
贵州
Guizhou
四川
Sichuan
攀西地区
Panxi region
重庆
Chongqing
0.000 0
0.268 9
0.103 8
0.052 0
0.187 0
云南
Yunnan
0.000 0
0.231 1
0.329 0
0.474 1
贵州
Guizhou
0.000 0
0.130 3
0.270 3
四川
Sichuan
0.000 0
0.142 5
攀西地区
Panxi region
0.000 0
的种质划为一个类群的增加了类群内的变异。本研
究中不同地理类群基于 ΦST遗传距离聚类中云南
类群与其他类群的遗传距离较远，表现出一定的特
异性。特别的是云南类群中来自云南巧家的 2份材
料与攀西地区中来自宁南的 4 份材料地理位置较
近，但是在遗传特性上表现出差别，这可能与金沙江
的阻隔、不同的土壤和植被类型等因素导致其具有
了不同的生境有关。同时本文关于西南区地理类群
聚类的研究结果与前面西南区扁穗牛鞭草不同自然
居群的研究结果相一致(Huang et al., 2008)，这也为
扁穗牛鞭草种质的收集、保护提供了理论参考。
3材料与方法
3.1供试材料
供试材料为来自四川、重庆、贵州以及南等地区
的 43份扁穗牛鞭草材料，其中“重高”和“广益”扁穗
牛鞭草为国审品种(表 4)。
3.2基因组 DNA提取
选取幼嫩的扁穗牛鞭草叶片采用 CTAB法提取
中国西南区扁穗牛鞭草种质遗传多样性的 SRAP分析
Genetic Diversity of Hemarthria compressa Germplasms in Southwest China by SRAP Analysis 67
基因组学与应用生物学
Genomics and Applied Biology
其基因组 DNA (Saghai-Maroof et al., 1984)。提取的
DNA用 0.8%的琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计
进行纯度和浓度的检测，并将样品稀释成 10 ng/μL
后在 4℃下保存备用。
3.3 SRAP分析
参考 Li等(2004)发表的引物，试验通过组合筛选
11对扩增效果较好的引物组合进行进一步分析(表 5)。
扩增优化总反应体系为 20 μL：DNA 1 μL (40 ng/μL)，
表 4材料列表
Table 1 The materials used in the study
序号
Serial No.
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
编号
Code
H010
H011
H031
重高
H033
H034
H035
H036
H039
H040
H041
H058
H067
H068
H042
H043
H045
H046
H047
H048
H050
H051
地理来源
Geographic origins
重庆南山
Nanshan, Chongqing city
重庆嘉陵江
Jialin River, Chongqing city
重庆李子坝
Liziba, Chongqing city
重庆巴南区
Banan, Chongqing city
重庆万州
Wanzhou, Chongqing city
重庆梁平
Liangpin, Chongqing city
重庆梁平
Liangpin, Chongqing city
重庆梁平
Liangpin, Chongqing city
重庆梁平
Liangpin, Chongqing city
重庆垫江
Dianjiang, Chongqing city
重庆涪陵
Fulin, Chongqing city
重庆江津
Jiangjin, Chongqing city
重庆奉节
Fengjie, Chongqing city
重庆云阳
Yunyang, Chongqing city
贵州独山
Dushan, Guizhou province
贵州独山
Dushan, Guizhou province
贵州独山
Dushan, Guizhou province
贵州荔波
Libo, Guizhou province
贵州荔波
Libo, Guizhou province
贵州荔波
Libo, Guizhou province
云南巧家
Qiaojia, Yunnan province
云南巧家
Qiaojia, Yunnan provincee
序号
Serial No.
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
编号
Code
H026
H028
H029
H053
H003
H019
H002
广益
H017
H056
H027
H037
H023
H025
H030
H054
H055
H057
H014
H015
H016
地理来源
Geographic origins
四川宁南
Ningnan, Sichuan province
四川宁南
Ningnan, Sichuan province
四川宁南
Ningnan, Sichuan province
四川宁南
Ningnan, Sichuan province
四川雅安
Yaan, Sichuan province
四川雅安
Yaan, Sichuan province
四川雅安
Yaan, Sichuan province
四川雅安
Yaan, Sichuan province
四川乐山
Leshan, Sichuan province
四川乐山
Leshan, Sichuan province
四川广元
Guangyuan, Sichuan province
四川达县
Daxian, Sichuan province
四川绵阳
Mianyang, Sichuan province
四川绵阳
Mianyang, Sichuan province
四川宜宾
Yibing, Sichuan province
四川自贡
Zigong, Sichuan province
四川自贡
Zigong, Sichuan province
四川自贡
Zigong, Sichuan province
四川大邑
Dayi, Sichuan province
四川都江堰
DuJiangyan, Sichuan province
四川眉山
Meishan, Sichuan province
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DOI: 10.3969/gab.029.00006368
10×PCR Buffer 2 μL，Mg2+ 2 μL (25 mmol/L)，dNTP
1.6μL (2.5mmol/L)，Taq DNA聚合酶 0.2μL (5U/μL)，
上下游引物各 1μL(10μmol/L)，灭菌水补齐 20μL。
SRAP-PCR反应程序为：94℃预变性 5 min；94℃
变性 1 min，35℃复性 1min，72℃延伸 1 min，共 5个
循环；94℃变性 1 min，50℃复性 1 min，72℃延伸
1 min，共 35个循环；最后 72℃延伸 10 min，4℃保存。
以上 PCR反应在 PTC-200 PCR (Bio-rad)仪上进行。
最后 PCR扩增产物采用 1.5%的琼脂糖凝胶进行电泳
分离，0.1 mg/mL的溴化乙锭(EB)染色，120 V 电压
(5 V/cm)在 0.5×TBE缓冲液中电泳约 1.5 h，电泳结束
后凝胶在凝胶成像系统(Bio-rad)中照相并保存。
3.4数据分析
对获得的 DNA条带进行统计分析，在相同迁移
位置，有带记为 1，无带记为 0，构成原始数据矩阵。根
据矩阵数据计算 SRAP扩增的总扩增带数(total num-
ber of bands, TNB)、多态性带数 (number of polymor-
phic bands, NPB)、多态性条带百分比(percentage bar
chartercentage of polymorphic bands, PPB)、多态性信
息 含 量 (polymorphic information content, PIC)
(Roldán-Ruiz et al., 2000)。利用 NTSYS-PC 2.10计算
各材料间的 Nei-Li遗传相似系数 GS (即 Dice遗传相
似系数)，GSij=2a/(2a+b+c)，GSij代表种质 i和 j之间
的遗传相似系数，a代表 i和 j种质共有的条带数，b
和 c分别代表 i和 j两种质各自特有的条带数。同时，
基于遗传相似系数进行非加权配对类平均法 (un-
weight pair-group method using arithmetic average, UP-
GMA)聚类分析和主成分分析(principal coordination
analysis, PCoA) (Nei and Li, 1979; Rohlf, 1994)。
表 5本研究使用的 SRAP正向和反向的引物序列
Table 5 Sequences of forward and reverse SRAP primers used in this study
序号
Serial No.
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
引物对
Primer pairs
Me1+Em6
Me1+Em8
Me3+Em7
Me5+Em9
Me6+Em2
Me6+Em6
Me6+Em9
Me9+Em1
Me9+Em4
Me9+Em8
Me9+Em9
正向引物
Forward primers
Me1: 5-TGAGTCCAAACCGGATA-3
Me1: 5-TGAGTCCAAACCGGATA-3
Me3: 5-TGAGTCCAAACCGGAAT-3
Me5: 5-TGAGTCCAAACCGGAAG-3
Me6: 5-TGAGTCCAAACCGGTAA-3′
Me6: 5-TGAGTCCAAACCGGTAA-3′
Me6: 5-TGAGTCCAAACCGGTAA-3′
Me9: 5-TGAGTCCAAACCGGTAG-3′
Me9: 5-TGAGTCCAAACCGGTAG-3′
Me9: 5-TGAGTCCAAACCGGTAG-3′
Me9: 5-TGAGTCCAAACCGGTAG-3′
反向引物
Reverse primers
Em6: 5-GACTGCGTACGAATTGCA-3′
Em8: 5-GACTGCGTACGAATTCTG-3
Em7: 5-GACTGCGTACGAATTCAA-3
Em9: 5-GACTGCGTACGAATTCGA-3
Em2: 5-GACTGCGTACGAATTTGC-3′
Em6: 5-GACTGCGTACGAATTGCA-3′
Em9: 5-GACTGCGTACGAATTCGA-3
Em1: 5-GACTGCGTACGAATTAAT-3
Em4: 5-GACTGCGTACGAATTTGA-3
Em8: 5-GACTGCGTACGAATTCTG-3
Em9: 5-GACTGCGTACGAATTCGA-3
为了解不同扁穗牛鞭草地理类群间和类群内的
变异情况，利用 AMOVA 1.55进行分子变异方差分
析(analysis of molecular variance, AMOVA)，并计算
类群间的遗传分化系数和不同类群间的遗传距离
(ΦST) (Excoffier et al., 1992)。分子方差分析及类群
间遗传距离的显著性采用 1 000次随机置换进行。
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