全 文 :葎草内生真菌 SS3 的分离与鉴定
张慧茹 李 帅 赵红月 刘来亭
张慧茹,河南工业大学生物工程学院,副教授,450001,河
南工业大学莲花街校区 322信箱。
李帅、赵红月、刘来亭,单位及通讯地址同第一作者。
收稿日期:2011-10-14
摘 要:植物内生菌是产生新型抗生素的微生物资源。试验欲从中草药葎草中分离具有抗致病菌
的内生真菌,为防治畜禽疾病提供新型抗菌药物的微生物来源。试试从葎草中分离出 21株内生真菌,
通过平板对峙试验筛选出 SS3具有良好的抗菌活性。对该内生真菌进行形态学和分子生物学鉴定。结
果表明:内生真菌 SS3具有镰刀菌属的表型特征,经过 rDNA的 ITS序列(GenBank登录号:JF262912)
分析,该菌与镰刀菌属的同源性达到了 99%。本试验首次分离药用植物葎草的内生真菌,其中具有抗
菌特性的内生真菌 SS3经形态学和分子学鉴定,其属于子囊菌亚门 [Amon Ascomycetes]、镰刀菌属
[Fusarium]。
关键词:葎草内生真菌;抗致病菌;鉴定
中图分类号:S811.6 文献标识码:A 文章编号:1001-991X(2012)01-0026-03
植物内生真菌能产生大量具有生物活性的次级
代谢产物,特别是药用植物内生真菌可以产生与宿主
植物相同或相近的药性成分,是新的天然产物类药物
的重要来源[1-2],因此,植物内生真菌成为微生物资源
开发的一个热点。
葎草属于桑科植物,可以全草入药,种子中含有
多种酮类物质,具有良好的抗菌消炎效果,可以用来
治疗皮肤瘙痒、水肿以及常见炎症;其叶子中含有多
糖,具有抗氧化、清除自由基、抗衰老的作用。已有许
多对于葎草的研究[3-5],但尚无从葎草中分离抗致病菌
的内生菌的研究,因此,本研究旨在从葎草中分离具
有抗致病菌作用的内生真菌,为进一步开发以及在饲
料中充分利用葎草提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 材料
葎草:采自郑州高新技术开发区东史马村和河南
工业大学校园内,挑选新鲜、生长旺盛的葎草,用保鲜
袋包装,送实验室备用。
致病菌:鸡大肠杆菌(Escherichia coli., O78),菌
株编号:CVCC1490;鸡金黄色葡萄球菌(Staphylocco-
cus aureus),菌株编号:CVCC2241。
1.2 试验方法
1.2.1 内生菌的分离
将采集的葎草全草用自来水冲洗干净,置无菌操
作台中紫外灯照射 5 min后晾干。用 75%酒精进行全
草消毒 1 min,将葎草剪成根、茎、叶各组织块,不同组
织升汞消毒时间分别为:根 65 s、茎 50 s、叶 35 s。再用
无菌水冲洗干净,将上述组织块剪成 0.5 cm×0.5 cm
大小,置于马铃薯葡萄糖琼脂(PDA)培养基中,28 ℃
恒温培养箱中培养约 5~7 d,待内生菌长出后,挑取单
个菌落进行纯化,PDA培养基斜面保菌。
1.2.2 表面消毒效果的检测
分别取各种组织最后一次冲洗的无菌水,涂布于
营养琼脂平板上;将表面消毒处理过的完整的根、茎、
叶各组织贴压在 PDA培养基平板内;在超净工作台
内放置一敞开的 PDA平板。将上述 3种对照平板置
于 28 ℃恒温培养箱内培养 7 d,用于检查表面灭菌效
果。若没有菌落出现,说明植物表面菌被彻底消毒,所
生长的菌为植物内生菌。
1.2.3 抗致病菌的内生真菌的筛选
通过平板对峙抑菌试验筛选具有抑制致病菌作
用的葎草内生真菌。分别将致病性大肠杆菌和葡萄球
菌活化,配制致病菌浓度约为 106 CFU/ml的菌悬液,
取 100 μl涂布于营养琼脂平板上。用直径为 0.7 cm的
打孔器自生长旺盛的葎草内生菌菌落上打孔,挑取带
菌丝的菌饼贴放到涂布过致病菌的营养琼脂平板上,
37 ℃培养 24 h,观察内生真菌对两类致病菌的抑制
情况。每个内生真菌菌落至少挑取 3个菌饼。抑菌圈直
径采用游标卡尺测量,抑菌直径为 3个菌饼的平均数。
1.2.4 形态学鉴定
将 PDA培养基滴于消毒的载玻片上,冷却后接
种葎草内生菌,盖上盖玻片,置于培养皿中,28 ℃恒温
《饲料工业》·2012年第 33卷第 1期试 验 研 究
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培养约 10 d,显微镜下观察菌丝和孢子形态,并照相。
1.2.5 分子生物学鉴定
PCR引物:由上海生物工程技术服务有限公司合
成的通用引物 ITS4、ITS5扩增真菌 rDNA片段。ITS4:
5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′。ITS5:5′-GGAAG-
TAAAAGTCGTAACAAGG-3′。
采用 CTAB法提取葎草内生真菌的总 DNA,将其
作为模板,利用 ITS通用引物扩增 SS3的 rDNA片段。
通过经典 PCR试验扩增,PCR扩增程序为:94 ℃预变
性 3 min,94 ℃变性 30 s,56 ℃退火 1 min,72 ℃延伸
3 min,循环 30 次,在相同温度下延伸 10 min,最后
4 ℃保温。用 1%琼脂糖凝胶电泳检测扩增的目的片
段,并将条带回收,送与上海生工测序,将所得序列提
交 GenBank获得序列号。用 BLAST比对分析,采用
Clustalx1.83软件进行序列分析并构建系统发育树,以
确定其种属地位。
2 结果与分析
2.1 葎草内生真菌的分离
经表面消毒效果检测,冲洗的无菌水、组织印迹
培养及环境培养基均无菌生长,证明表面消毒彻底,
植物切口培养的菌落为内生菌。从新鲜的葎草中共获
得 21株内生真菌,命名为 SS1~SS21。
2.2 抗致病菌的内生真菌的筛选
通过平板对峙抑菌试验,发现 SS3对大肠杆菌和
金黄色葡萄球菌均具有较强的抑制效果,对大肠杆菌
的抑菌和金黄色葡萄球菌抑菌直径分别为 26 mm和
19 mm。
A
B
图 1 内生真菌 SS3对大肠杆菌(A)和金黄色
葡萄球菌(B)的抑菌效果
2.3 SS3的形态学观察
菌落形态:表面蓬松如絮状,气生菌丝生长旺盛,
单菌落直径约为 4.7 cm,呈同心圆状生长,反面无色,
质地均匀,如图 2所示。
A
B
注:A 正面;B 反面。
图 2 内生真菌 SS3的菌落形态
菌丝和孢子形态:菌丝细长,分生茂密;菌丝顶端
有簇状孢子,孢子椭圆形,粒感明显,周围亦有散落的
孢子,如图 3所示。
A
B
注:A为扩大 40 倍;B 为扩大 100 倍。
图 3 葎草内生真菌 SS3的孢子形态
根据 SS3菌落形态、菌丝和孢子着生状态,通过
查阅《真菌鉴定手册》[6],将其归属于子囊菌亚门[Amon
Ascomycetes]、镰刀菌属[Fusarium]。
张慧茹等:葎草内生真菌 SS3的分离与鉴定 试 验 研 究
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2.4 SS3的分子鉴定
通过提取 SS3的总 DNA,以设计的引物扩增出 SS3
的 rDNA的 ITS序列,大小为 547 bp,提交 GenBank,
获得序列号为 JF262912。
使用 BLAST 程序比对于 Genebank 中同源性在
95%以上的真菌序列,应用 Clustalx1.83软件,用邻位
相连法(Neighbor-Joining)绘制葎草内生真菌 SS3 的
系统发育树,结果如图 4所示。
0.006
图 4 葎草内生真菌 SS3的系统发育树
由系统发育树可以看出:菌株 SS3的 ITS序列与
镰刀菌的序列相似度达到了 99%,结合形态学鉴定结
果,最终确定葎草内生真菌 SS3为子囊菌亚门[Amon
Ascomycetes]、镰刀菌属[Fusarium]。
3 讨论
目前,国内外尚未发现有关葎草内生菌的报道。
该试验首次从葎草中共分离出 21株内生真菌,其中,
SS3菌株具有良好的抑菌活性,具有潜在的应用价
值。因此,对 SS3菌株进行形态学和分子生物学鉴定。
经形态学和分子学鉴定均将其归属为子囊菌亚门
[Amon Ascomycetes]、镰刀菌属[Fusarium],这一结果填
补了葎草内生真菌研究方面的空白,增强了葎草的实
用价值。
表面消毒是内生菌分离的重要环节[7-9]。以下两种
情况可能引起杂菌污染:植物组织表面灭菌不完全和
超净工作台内含菌。针对以上问题,试验中采用设立
三种检测方法进行检验:最后一次漂洗液无菌检验对
照;组织印迹无菌检测对照;超净工作台无菌状态对
照检测,在三者均无菌生长的情况下,证实试验中分
离的菌为内生菌。
传统真菌分类方法是根据真菌形态学及其主要
的生理生化特征而建立的,包括培养特征、菌丝形态、
产孢结构以及孢子形态微观形态特征等。这种分类方
法存在一定的缺陷,有些微生物基因型相同,但不同
的个体、在不同的环境下发育,表型可能会出现一定
的差异,导致形态学分类的误差。随着分子生物学技
术日益发展和成熟,在微生物分类鉴定方面采用核糖
体 rRNA中 ITS保守序列进行分析和比对[10-11],这在一
定程度上避免了形态学分类的误差,GenBank中庞大
的比对数据库,提高了分子生物学鉴定的分辨能力,
使其在真菌分类鉴定领域得到了广泛应用。
参考文献
[1] Stierle A, Strobel G, Stierle D. Taxol and taxane production by
Taxomycesandreanae, an endophytic fungus of Pacific Yew[J]. Sci-
ence, 1993, 260:214-216.
[2] Hong-sheng Yu, Lei Zhang, Lin Li, et al. Recent developments and
future prospects of antimicrobial metabolites produced by endo-
phytes[J]. Microbiological Research, 2010, 165:437-449.
[3] 郭万华. 野生葎草饲用和药用价值的评价及利用研究 [D]. 河北:
河北农业大学, 2009.
[4] 刘来亭, 张慧茹, 马秋刚, 等. 葎草醇提物对草鱼生长性能的影
响[J]. 河南工业大学学报(自然科学版), 2008, 29(2):27-30.
[5] 刘来亭,张慧茹,冯建新,等.葎草醇提取物对草鱼非特异性免疫功
能的影响[J]. 中国畜牧杂志, 2008, 44(9):29-31.
[6] 魏景超.真菌鉴定手册(9版)[M].上海:上海科学技术出版社, 1979:
5-201.
[7] 何佳,刘笑洁,赵启美,等.植物内生真菌分离方法的研究[J]. 食品
科学, 2009, 30(15):180-183.
[8] 李伟南, 张慧茹.3株蒲公英内生真菌的分离鉴定及抗禽类致病
菌活性的初步研究[J]. 安徽农业科学, 2008,30(22):9540-9542.
[9] 李瑾,张慧茹,刘诺阳,等.金银花内生真菌的分离鉴定及抑菌活性
研究[J]. 中国抗生素杂志, 2010,35(3):236-240.
[10] 匡治州,许杨.核糖体 rDNA ITS序列在真菌学研究中的应用[J].
生命的化学, 2004, 24(2):120-122.
[11] 郑雪松,杨虹,李道棠,等.基因间隔序列(ITS)在细菌分类鉴定和
种群分析中的应用[J].应用与环境生物学报,2003,9(6):678-684.
(编辑:王 芳,xfang2005@163.com)
试 验 研 究 张慧茹等:葎草内生真菌 SS3的分离与鉴定
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