作 者 :陈文新;李明浩;孙静松;蒋广龙;姚建庄;吴俊;万平;Organ-单位: 首都师范大学生命科学学院;
期 刊 :生物信息学 2009年 01期 页码:25-27+36
关键词:小立碗藓;microRNA;结合靶位预测;
摘 要 :利用857条植物miRNA序列对27546条小立碗藓mRNA序列进行搜索,预测出162个植物miRNA家族在小立碗藓中存在结合靶位。miRNA结合靶位数目和miRNA协同作用网络分析结果同时显示,miR482和miR1168在小立碗藓中结合靶位多、协同作用广,提示它们对于小立碗藓可能具有重要生物学功能。52个莱茵衣藻特有的miRNA被预测在小立碗藓中存在结合靶位,显示小立碗藓在从藻类向种子植物进化过程中处在独特演化位置。