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Expression of microRNA-483 and microRNA-486 in the Cloned and fat-1-transgenic Bovine

microRNA-483和microRNA-486在克隆和转fat-1基因牛组织中的表达



全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2016, 32(3):105-108
miRNA 表达分析和功能探索在转基因生物领域
中已成为热点问题。microRNA(miRNA)是一类内
源性的 21-25 nt 大小的单链非编码小分子 RNA,在
生物体内广泛存在,能够在转录后水平调控基因的
表达,与机体的生长、发育、繁殖、疾病等活动相
关[1]。miRNA 在不改变基因结构的基础上影响基因
的表达,成为表观遗传学的重要组成部分。目前对
于 miRNA 在生殖发育中的研究已逐步展开,包括
对 miRNA 高通量分析,特异性的组织或细胞中特
定 miRNA 的表达、调控靶基因和功能研究[2]。fat-1
基 因 来 源 于 秀 丽 线 虫(Caenorhabditis elegans,C.
elegans),又名 ω-3 多聚不饱和脂肪酸脱氢酶基因。
其产物 ω-3 多聚不饱和脂肪酸脱氢酶以 ω-6 多聚
不饱和脂肪酸(Omega-6 polyunsaturated fatty acids,
收稿日期 :2015-06-12
基金项目 :国家基础研究计划(2012CB722306);国家级大学生创新训练计划项目(201410126034)
作者简介 :吕洋,男,博士研究生,研究方向 :哺乳动物生殖生物学 ;E-mail :lvyang678762006@163.com
通讯作者 :李光鹏,男,教授,研究方向 :哺乳动物生殖生物学、胚胎生物技术 ;E-mail :gpengli@imu.edu.cn
microRNA-483 和 microRNA-486 在克隆和转 fat-1
基因牛组织中的表达
吕洋1  王煜1,2  孙佳佳1  弓春玲1  李光鹏1
(1. 内蒙古大学实验动物研究中心,呼和浩特 010070 ;2. 内蒙古医科大学附属医院,呼和浩特 010050)
摘 要 : 利用荧光定量 PCR 比较正常受精牛、克隆牛和转基因牛的心、肝、脾、肺、肾、胎盘、子叶、子宫内膜中 miR-
483 和 miR-486 的表达水平。结果显示,miR-483 和 miR-486 在正常受精牛、克隆牛和转 fat-1 基因牛的组织中均有表达,其中在心
脏中表达量显著高于其他组织。而转 fat-1 基因牛心脏中 miR-483 和 miR-486 表达量均低于正常牛。miR-483 和 miR-486 在不同组
织中表达量存在一定差异,在心脏中呈现高表达,提示 miR-483 和 miR-486 表达降低可能与心肌肥大、心肌梗死等病理生理过程有关。
关键词 : miR-483 ;miR-486 ;转基因牛 ;心脏
DOI :10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.03.017
Expression of microRNA-483 and microRNA-486 in the Cloned and
fat-1-transgenic Bovine
LÜ Yang1 WANG Yu1,2 SUN Jia-jia1 GONG Chun-ling1 LI Guang-peng1
(1. Research Center for Laboratory Animal Science,Inner Mongolia University,Hohhot 010070 ;2. The Affiliated Hospital,
Inner Mongolia University,Hohhot 010050)
Abstract: The expression levels of microRNA-483 and microRNA-486 in heart,liver,spleen,lung,kidney,placenta,
cotyledons,endometrium from normal,cloned,and transgenic bovine were measured by real time quantitative PCR. The results showed that
microRNA-483 and microRNA-486 were expressed in all tissues of normal,cloned and fat-1-transgenic bovine ;significantly higher in the
heart than other tissues. However,the expression levels of microRNA-483 and microRNA-486 in transgenic bovine were lower than normal one.
Further,the expressions of microRNA-483 and microRNA-486 varied in different tissues and high in the heart,indicating that the expressions
of microRNA-483 and microRNA-486 may be correlated with pathophysiological process of myocardial hypertrophy and myocardial infarction.
Key words: microRNA-483 ;microRNA-486 ;transgenic bovine ;heart
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2016,Vol.32,No.3106
ω-6 PUFAs)为底物,将其脱氢转化为 ω-3 多聚不饱
和 脂 肪 酸(Omega-3 polyunsaturated fatty acids,ω-3
PUFAs)[3],ω-3 PUFAs 作为重要生物活性物质,对
人体健康尤其在预防和治疗心脑血管、癌症等多种
疾病方面有着重要作用。增加膳食中 ω-3 PUFAs 的
含量,能够显著减少冠心病发病率与死亡率,并且
能延缓动脉粥样硬化进展[4]。本研究利用荧光定量
PCR 分析转 fat-1 鲁西黄牛、克隆牛和正常受精牛主
要器官组织中 miR-483 和 miR-486 的表达情况,旨
在探讨 miR-483 和 miR-486 可能的作用。
1 材料与方法
1.1 材料
转 fat-1 基因鲁西黄牛的制备 :构建 fat-1 基因
pST200 表达载体,转染牛胎儿成纤维细胞,G418
筛选后挑选转基因单克隆,核移植获得供体细胞,
得到转基因克隆胚胎,通过胚胎移植到代孕鲁西黄
牛体内,出生后经鉴定为转 fat-1 基因牛。采集 3 例
正常受精、2 例克隆、2 例转基因鲁西黄牛心脏、肝
脏、脾脏、肺脏、肾脏、胎盘、子叶、子宫内膜组织,
迅速放入液氮保存。动物实验经内蒙古大学动物实
验伦理委员会批准。
1.2 方法
1.2.1 各 组 织 总 RNA 的 提 取 将 组 织 从 -80℃ 取
出 后, 用 RNAiso for small RNA kit(TaKaRa) 提 取
组织 RNA,取 2 μL 在 1% 琼脂糖凝胶电泳上检测
总 RNA 的质量并利用 Nanodrop 测量浓度并测定总
RNA 的 A260/A280 的值在 1.8-2.1 之间。
1.2.2 合成 cDNA 利用 Primer 5.0 引物设计软件分
别根据 miRBase 提供的 miR-483 和 miR-486,以及
内参 U6 的序列设计 microRNA 定量引物(表 1),根
据 One Step PrimeScript® miRNA cDNA Synthesis Kit
(TaKaRa)反转录试剂盒说明书合成 cDNA。反应结
束后产物保存于 -20℃条件下备用。
表 1 microRNA 引物序列
引物名称 引物序列(5-3)
Bta-miR-483 CGTCACTCCTCTCCTCCCGTCTTAA
Bta-miR-486 TCCTGTACTGAGCTGCCCCGAG
U6 TGCGGGTGCTCGCTTCGGCAGC
1.2.3 microRNA 实 时 荧 光 定 量 PCR 使 用 SYBR®
premix Ex TaqTM Ⅱ(TaKaRa)检测 miR-483 和 miR-
486 在牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胎盘、
子 叶 和 子 宫 内 膜 组 织 的 表 达 水 平, 美 国 Bio-Rad
7300 公司进行定量 PCR 反应参数为 :95℃预变性
30 s;95℃ 5 s,60℃ 31 s 荧光检测 1 次,共 40 循环。
记录每个反应管中的荧光信号到达所设定的阈值时
所经历的循环数 Ct 值,反应结束后根据熔解曲线分
析产物特异度,每组均设 3 个复孔,分析 miR-483
和 miR-486 的相对表达量。
1.2.4 统计学分析 以 U6 作为内参,miRNA 的相
对表达水平的数值通过 2-ΔΔCt 法进行计算。运用统
计学软件 SPSS16.0 进行单因素方差分析。
2 结果
2.1 miR-483在正常受精、克隆、转基因鲁西黄牛
不同组织中的表达
miR-483 在心脏中表达量最高,约为在肺脏中
表达量的 10 倍,其次在肾脏中的表达量是肺脏中的
6 倍左右,在肺脏中的表达量最低(图 1)。
㛍㜿bta-miR-483⴨ሩ㺘䗮

㝮㜿 ᗳ㜿 㛮㜿㛪 㛾ⴈ ᆀਦ ᆀᇛ޵㟌
10
8
6
4
2
0
图 1 miR-483 在牛不同组织中的表达
2.2 miR-486在正常受精、克隆、转基因鲁西黄牛
不同组织中的表达
miR-486 在心脏中表达量最高,约为在肝脏中
表达量的 13 倍(P=0.021,具有显著差异);其次在
肺脏中表达量是肝脏中表达量的 2 倍左右 ;在肝脏
和子叶中表达量最低(图 2)。
2.3 miR-483和miR-486在正常受精、克隆、转基
因鲁西黄牛心脏表达的比较
miR-483 和 miR-486 在克隆牛、转基因牛心脏
2016,32(3) 107吕洋等:microRNA-483 和 microRNA-486 在克隆和转 fat-1 基因牛组织中的表达
中的表达要低于正常受精牛的心脏(图 3)。 方法。miRNA 的表达具有时序性和空间特异性,王
家骥等[8]通过对靶基因进行调节从而实现对动物发
育的调控。随着研究的不断深入,人们逐渐认识到
miRNA 在进化过程中的保守性以及在生物进化和疾
病发展过程中起着重要的调控作用,通过抑制靶基
因的表达产生基因沉默的效应。
近年来研究发现,miRNA 参与调控心脏病理生
理过程,推测 miRNA 在心肌肥大、心肌梗死中扮
演重要角色[9-11]。目前,在生物体内已鉴定出超过
6 000 个 miRNA 分子,而在人类基因组中约 30% 的
基因受 miRNA 调控[12],其在心脏、肝脏及脑等不
同组织中都具有特异性表达,有研究通过分析 6 个
心衰胎儿和 4 个正常胎儿心脏 microRNA 芯片[13],
获 得 110 个 显 著 差 异 microRNA, 其 中 miR-483 和
miR-486 表达量显著下调,推测与胎儿心衰有关。
Sucharov 等[14] 通过对 6 个非心衰、5 个缺血性扩
张型心脏病和 5 个特发性扩张型心脏病的病人的
microRNA 芯 片 分 析, 也 得 出 miR-483 和 miR-486
在非心衰病人组中表达量显著下调的结论,证明
microRNA 可能调控心肌疾病中关键性重编程重塑基
因的表达,参与到心肌疾病中。郝艳坤等[15]筛查
肥胖大鼠心脏 microRNA 的表达变化,寻找与肥胖诱
发心肌损伤及心律失常相关的 miRNA,发现在肥胖
模型组的 miRNA 表达谱中明显差异表达的 miRNA
共有 7 个,其中 miR-483 表达下调,提示 miRNA 可
能参与肥胖诱发心肌损伤和心律失常的调节作用。
Zhang 等[16]研究发现 miR-483 在怀孕和哺乳期喂养
母体高脂肪(HF)饮食的子代中表达显著降低。
miRNA 的差异表达及对基因的调控机制已成
为当前科学研究的热点之一。miRNA 可能参与调控
多个靶基因,而一个基因也可能受多个 miRNA 调
控。从 miRBase 数据库中预测出人源的 miR-483 定
位于胰岛素样生长因子 2(insulin-like growth factor
2,IGF2)的第 2 内含子[17]。Zhang 等[16]的研究结
果提示 miR-483 在喂养高脂肪饮食的小鼠后代中表
达量显著降低,同时伴随着 IGF2 mRNA 表达水平显
著提高,预示着 IGF2 可能是 miR-483 的靶基因。小
鼠胎儿体重可能受 IGF2 基因上的多态性的影响[18],
低浓度 IGF2 可能涉及增重和肥胖[19]。
miR-486 在哺乳动物中是保守的,富集于心肌、
a
㛍㜿bta-miR-486⴨ሩ㺘
䗮䟿
㝮㜿 ᗳ㜿 㛮㜿㛪 㛾ⴈ ᆀਦ ᆀᇛ޵㟌
50
40
30
25
35
45
20
15
10
5
0
图 2 miR-486 在牛不同组织中的表达(a 代表 P<0.05)
a a
a
a a
bt
a-
m
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-4
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⴨ሩ㺘䗮䟿 ݻ䲶⢋-ᗳ㜿 䖜สഐ⢋-ᗳ㜿 ↓ᑨਇ㋮⢋-ᗳ㜿
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0.6
0.4
0.2
0
bt
a-
m
iR
-4
86
⴨ሩ㺘䗮䟿 ݻ䲶⢋-ᗳ㜿 䖜สഐ⢋-ᗳ㜿 ↓ᑨਇ㋮⢋-ᗳ㜿
1.2
1.0
0.8
0.6
0.4
0.2
0
A
B
图 3 miR-483(A)和 miR-486(B)在正常受精、克隆和
转基因鲁西黄牛心脏表达(a 代表 P<0.05)
3 讨论
ω-3 PUFAS 能提高心肌细胞的电稳定性,而心
肌细胞的电稳定性的提高能防治心率不齐[5],对体
内 ω-6/ω-3 PUFAS 比值的改变和对体内脂代谢的调
节,能有效的降低血压、血脂[6]。武珅等[7]发现增
加 fat-1 基因在体内的表达是预防心血管硬化的有效
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2016,Vol.32,No.3108
骨骼肌和平滑肌中,肌肉生长抑制素(Myostatin)
是骨骼肌生长的负调控因子,可降低肌肉中蛋白合
成,Hitachi 等[20]在敲除 myostatin 小鼠后发现 miR-
486 表达水平显著提高,证实 miR-486 可能是连接
肌肉生长抑制素信号和调控骨骼肌通路中的调控分
子。Small 等[21]证明同源性磷酸酶 - 张力蛋白(PTEN)
可能是 miR-486 靶位点,PTEN 是磷酸肌醇 3 激酶 /
Akt 信号通路的负调控基因,后者是胰岛素受体下
游的主要通路,推测 miR-486 能在骨骼肌中调节胰
岛素依赖的葡萄糖摄取。本研究结果表明,miR-483
和 miR-486 在正常受精和转 fat-1 基因牛心脏中差异
表达,提示其表达变化可能与 fat-1 表达有关。
4 结论
通过检测 miR-483 和 miR-486 在正常受精、克
隆、转 fat-1 基因鲁西黄牛不同组织中的相对表达
水平,发现 miR-483 和 miR-486 在正常受精牛、克
隆牛和转 fat-1 基因牛的组织中均有表达,其中在心
脏中表达量显著高于其他组织。而转基因牛心脏中
miR-483 和 miR-486 表达量均低于正常受精牛。
参 考 文 献
[1]Sun K, Lai EC. Adult-specific functions of animal microRNAs[J].
Nature Reviews Genetics, 2013, 14(8):535-548.
[2]Dhahbi JM, Atamna H, Boffelli D, et al. Deep sequencing reveals
novel microRNAs and regulation of microRNA expression during
cell senescence[J]. PLoS One, 2011, 6(5):e20509.
[3]Spychalla JP, Kinney AJ, Browse J. Identification of an animal
omega-3 fatty acid desaturase by heterologous expression in
Arabidopsis[J]. Proc Nat Acad Sci USA, 1997, 94 :1142-1147.
[4] Wu Y, Zhang C, Dong Y, et al. Activation of the AMP-activated pro-
tein kinase by eicosapentaenoic acid(EPA, 20 :5 n-3)improves
endothelial function in vivo[J]. PLoS One, 2012, 7(4):e35508.
[5]Kang JX, Leaf A. Antiarrhythmic effects of polyunsaturated fatty
acids :Recent studies[J]. Circulation, 1996, 94 :1774-1780.
[6]Howe PR. Dietary fats and hypertension. Focus on fish oil[J]. Ann
N Y Acad Sci, 1997, 827 :339-352.
[7]武珅 , 杜卫华 , 等 . Fat-1 基因在 n-3 多不饱和脂肪酸功能研究
中的应用[J]. 中国生物工程杂志 , 2008, 28(8):136-141.
[8]王家骥 , 贾竹青 , 周春燕 . microRNA 在心脏发育和心脏疾病中
的作用[J]. 中国科学 :生命科学 , 2012, 42(12):957-966.
[9]van Rooij E, Marshall WS, Olson EN. Toward microRNA- based
therapeutics for heart disease :the sense in antisense[J].
Circulation Research, 2008, 103(9):919-928.
[10]Care A, Catalucci D, Felicetti F, et al. MicroRNA-133 controls
cardiac hypertrophy[J]. Nat Med, 2007, 13(5):613-618.
[11]van Rooij E, Sutherland LB, et al. Dysregulation of microRNAs
after myocardial infarction reveals a role of miR- 29 in cardiac
fibrosis[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2008, 105 :13027-13032.
[12]Lewis BP, Burge CB, Bartel DP. Conserved seed pairing, often
flanked by adenosines, indicates that thousands of human genes are
microRNA targets[J]. Cell, 2005, 120 :15-20.
[13]Thum T, Galuppo P, Wolf C, et al. MicroRNAs in the human
heart :a clue to fetal gene reprogramming in heart failure[J].
Circulation, 2007, 116 :258-267.
[14]Sucharov C, Bristow MR, Port JD. miRNA expression in the failing
human heart :functional correlates[J]. Journal of Molecular and
Cellular Cardiology, 2008, 45 :185-192.
[15]郝艳坤 , 姜兴 , 郎临川 , 等 . microRNA 在大鼠肥胖模型心肌中
的变化[J]. 哈尔滨医科大学学报 , 2008, 42(6):568-570.
[16]Zhang J, Zhang F, Didelot X, et al. Maternal high fat diet during
pregnancy and lactation alters hepatic expression of insulin like
growth factor-2 and key microRNAs in the adult offspring[J].
BMC Genomics, 2009, 10 :478.
[17]Veronese A, Lupini L, et al. Oncogenic role of miR-483-3p at the
IGF2/483 locus[J]. Cancer Res, 2010, 70(8):3140-3149.
[18]Gaunt TR, Cooper JA, Miller GJ, et al. Positive associations
between single nucleotide polymorphisms in the IGF2 gene region
and body mass index in adult males[J]. Human Molecular
Genetics, 2001, 10 :1491-1501.
[19]Sandhu MS, Gibson JM, Heald AH, et al. Low circulating
IGF-II concentrations predict weight gain and obesity in
humans[J]. Diabetes. 2003, 52 :1403-1408.
[20]Hitachi K, Nakatani M, Tsuchida K. Myostatin signaling regulates
Akt activity via the regulation of miR-486 expression[J]. Int J
Biochem Cell Biol, 2014, 47 :93-103.
[21]Small EM, O’Rourke JR, Moresi V. et al. Regulation of PI3-
kinase/Akt signaling by muscle-enriched microRNA-486[J].
Proc Nat Acad Sci USA, 2010, 107 :4218-4223.
(责任编辑 马鑫)