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作 者 ：高平平,王健,席玉英,赵立平

期 刊 ：生态学报 2003年 23卷 6期 页码：1095~1100

关键词：群落结构ERIC-PCR指纹图；特征性条带；基因组片段测序；

Keywords:ERIC PCR community fingerprinting, signature band, genomic fragment sequencing,

摘 要 ：对可能代表活性污泥中两个时期的主要苯酚降解菌群的 ERIC- PCR指纹图谱中的两条 2 .1 kb的条带 ( P1和 P8)中的 DNA片段进行克隆、转化 ,得到 1 93个转化子。 H inf I物理图谱分析得到 35种酶切类型 ,将两端各进行 1次测序后 ,同源性大于 90 %的克隆归为一类 ,共得到 1 0种序列类型。对各类型的代表克隆进行了全长测序 ,5种类型为 P1条带所有 ,3种类型为 P8所有 ,二者共享的类型为 2种 ,丰度最高的片段为 S3,P1条带中 76.3%的转化子和 P8条带中 66.7%转化子属该类型。对所得序列进行检索分析 ,它们与 Gen Bank中已知基因序列均无显著同源性。用 S3特异性引物对活性污泥样品及其它在 LB、d CGY、MP和 FWM培养基上的回收菌进行扩增 ,除 LB上的回收菌没有显示目的条带外 ,活性污泥和其回收菌中均检测到带有该基因组片段的菌种的存在。研究为专一性分离降酚活性污泥中的优势菌提供了分子探针。

Abstract:One 2.1 kb signature DNA band whose intensity was correlated to phenol degrading efficiency of activated sludge was identified from ERIC PCR DNA fingerprints after one month monitoring of structural dynamics of microbial communities in a phenol degrading activated sludge system. The DNA fragments from the signature bands (P1and P8) of ERIC PCR profiles at first and eighth monitoring stage (three weeks apart) were eluted from the agarose gel and cloned into pGEM T Easy vector. A total of 193 transforman...

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