免费文献传递   相关文献

拟南芥干旱诱导型启动子RD29A 驱动花生AhNCED1 基因双元表达载体的构建



全 文 :植物生理学通讯 第 43卷 第 2期,2007年 4月 283
拟南芥干旱诱导型启动子RD29A驱动花生AhNCED1基因双元表达载体
的构建
万小荣 1,李玲 2,*
1仲恺农业技术学院生命科学学院,广州 510225;2华南师范大学生命科学学院,广州 510631
提要:从拟南芥基因组中克隆 RD29A基因 5-侧翼 520 bp启动子区域序列,生物信息学分析表明,该启动子片段中存在
脱水胁迫响应元件(DRE)、ABA响应元件(ABRE)、TATA-box、CAAT-box等顺式作用元件。构建了干旱诱导型启动子
AtRD29Ap驱动花生 AhNCED1基因的植物双元表达载体 pAtRD29Ap::AhNCED1。
关键词:RD29A基因启动子;NCED基因;双元载体构建
Construction of Binary Vector Harboring Peanut AhNCED1 Gene Driven by
Drought-inducible Promoter of RD29A Gene from Arabidopsis
WAN Xiao-Rong1, LI Ling2,*
1College of Life Sciences, Zhongkai University of Agriculture and Technology, Guangzhou 510225, China; 2College of Life Science,
South China Normal University, Guangzhou 510631, China
Abstract: In this paper we report the cloning of 5-flanking promoter sequence of drought-inducible RD29A
gene from Arabidopsis and its fusion with peanut AhNCED1 gene. The 520-bp promoter sequence was ana-
lyzed bioinformatically in the database of plant cis-acting regulatory element (PlantCARE). The result showed
that there were several important cis-acting elements, including TATA-box, CAAT-box, DRE (response to
dehydration), ABRE (response to ABA), in the 520-bp promoter region. The binary vector harboring AhNCED1
gene driven by AtRD29A promoter was further constructed to be used in coming plant transgene.
Key words: RD29A gene promoter; nine-cis-epoxycarotenoid dioxygenase (NCED) gene; binary vector con-
struction
收稿 2007-01-08 修定  2007-03-16
资助 广东省自然科学基金(0 6301 202 )、仲恺农业技术学院
博士启动基金 ( G 2 3 6 0 2 2 5 )和广东省自然科学基金
(0 6 0 25 0 4 9 )。
* 通讯作者(E-m a i l:l i l a b@scn u .edu . cn;T e l:0 2 0 -
8 5 2 1 1 3 7 8 )。
生物化学和遗传学实验的结果证明,9-顺式
紫黄质或 9-顺式新黄质裂解形成黄质醛是高等植
物脱落酸(abscisic acid,ABA)生物合成的限速步
骤,催化该反应的 9-顺式环氧类胡萝卜素双加氧
酶(nine-cis-epoxycarotenoid dioxygenase,NCED)
则是调控 ABA生物合成的关键酶(Nambara 和
Marion-Poll 2005;Taylor等 2005)。自从玉米突
变体 vp14 (Tan等 1997)中克隆 ZmVP14基因(即
NCED基因)以来,已相继在番茄、菜豆(Qin和
Zeevaart 1999)、豇豆(Iuchi等 2000)、美国鳄梨、
拟南芥(Iuchi等 2001)、葡萄(Soar等 2004)、柑橘
(Rodrigo等 2006)、龙胆(Zhu等 2007)中克隆了
NCED基因。干旱胁迫诱导植物叶片中 NCED基
因表达与 ABA累积水平相一致(Qin和 Zeevaart
1999;Iuchi等 2000)。烟草中异位表达(ectopic
expression)番茄 LeNCED1基因可提高转基因植物
ABA水平(Thompson等 2000),过表达 AtNCED3
基因则提高转基因拟南芥的内源ABA水平和抗旱
性(Iuchi等 2001)。我们从花生叶中克隆了ABA生
物合成关键酶基因——AhNCED1基因(GenBank
Accession No. AJ574819),发现其表达受干旱胁
迫诱导,在拟南芥中异位表达AhNCED1基因可提
高转基因植物的 ABA含量和抗旱性(Wan和 Li
2005,2006)。早期的研究已查明,不同花生品
种的抗旱性与其体内ABA水平呈正相关,因此综
合适时地调控花生体内ABA水平对提高植株抗旱
性有一定意义(Li和 Pan 1996)。
本文报道从拟南芥中克隆干旱诱导基因
植物生理学通讯 第 43卷 第 2期,2007年 4月284
RD29A启动子片段,将此序列在国际植物顺式作
用元件数据库中进行生物信息学分析鉴定,并构
建RD29A启动子驱动花生AhNCED1基因的植物双
元表达载体,为尔后用植物基因工程技术综合适
时地调控花生体内ABA水平和为花生品种改良及
抗旱育种累积了基础资料。
材料与方法
按W a n 和 L i ( 2 0 0 6 )的方法培养拟南芥
(Arabidopsis thaliana L. ecotype Columbia,Col-
0)。RD29A基因启动子片段克隆时,采用修改的
SDS (十二烷基磺酸钠)法提取拟南芥叶片基因组
DNA (Wan和 Li 2006)。根据Yamaguchi-Shinoza-
ki和 Shinozaki (1993,1994)报道的拟南芥 RD29A
基因序列(GenBank Accession No. D13044)设计一
对特异引物(P1:5 GAATTCATTCAATTT-
TAATTTTAC GTAT 3 ;P2:5 AG ATC T-
GTTTGATCCATTTTCCAAAGA 3),用于从拟南
芥基因组中 P C R 扩增干旱诱导型启动子片段
AtRD29Ap,将 PCR产物克隆到 pMD 18-T载体
(TaKaRa)上,通过 PCR和酶切检测获得阳性克隆
(含 pMD 18-AtRD29Ap载体)后,送上海生工生物
技术有限公司测序,获得AtRD29Ap的序列。构
建 AtRD29Ap::AhNCED1融合基因时,以来源于
pCAMBIA1301的p35S::ORF为基本植物双元表达
载体,p35S::ORF载体含CaMV 35S启动子驱动的
花生 AhNCED1基因完整编码框(Wan和Li 2006)。
以引入的 EcoRI和 BglII两个限制性内切酶酶切
图 1 RD29A基因启动子驱动花生 AhNCED1基因的双元表达载体的构建
Fig.1 Construction of binary vector harboring peanut AhNCED1 gene fusioned with Arabidopsis RD29A gene promoter
植物生理学通讯 第 43卷 第 2期,2007年 4月 285
pMD 18-AtRD29Ap载体,获取 RD29A基因启动
子片段并克隆到p35S::ORF载体AhNCED1基因上
游以替换CaMV 35S启动子,构建成含AtRD29Ap::
A h N C E D 1 融合基因的植物双元表达载体
pAtRD29Ap::AhNCED1 (图 1)。
实验结果
1 RD29A基因启动子片段克隆与序列分析
以拟南芥基因组DNA为模板,P1和 P2为引
物,进行 PCR扩增,结果扩增出一约 500 bp的
DNA片段(图2)。将此片段回收后克隆到pMD 18-
T载体上,通过 PCR (以 P1和 P2为引物)和酶切
(EcoRI和 BglII双酶切)检测(图 2),筛选并获取含
pMD 18-AtRD29Ap载体的阳性克隆,送上海生工
生物技术有限公司测序。测序结果表明 PCR产物
为一532 bp的DNA序列,BLAST分析(http://www.
ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)表明,该序列中 520 bp
的启动子片段(含11 bp RD29A基因编码区序列)与
Yamaguchi-Shinozaki和Shinozaki (1993)报道的序列
完全吻合。将这 520 bp序列在国际植物顺式作用
元件数据库PlantCARE (Lescot等2002)中进行生物
信息学分析,搜寻结果表明(图 3),在该启动子
序列-114~-109 (RD29A基因ATG上游)处有一典
型的 TATA-box (Kurkela和 Franck 1990) ;-144~
-137处有ABA响应元件(ABA response element,
ABRE),核心序列为 TACGTGTC;-252~-225处
为一 C-repeat/DRE元件,响应低温、脱水胁迫
(Yamaguchi-Shinozaki和 Shinozaki 1993) ;-305~
-297处有一典型的水分胁迫诱导RD29A基因表达
所必需的脱水响应元件(dehydration-responsive
el ement,DR E),核心序列为 TACC GACAT
(Yamaguchi-Shinozaki和 Shinozaki 1994) ;-367~
- 3 6 3 处为一推测的 C AAT- box,核心序列为
CCAAT (Yamaguchi-Shinozaki和 Shinozaki 1993)。
图 2 拟南芥 RD29A基因启动子片段的克隆
Fig.2 Cloning of RD29A gene promoter
fragment from Arabidopsis
  M:D L2 0 0 0 D N A ma rk er;1:以拟南芥基因组 D N A
为模板的 PCR扩增RD29A基因启动子片段;2:PCR检测 pMD 18-
AtRD29Ap载体;3:pMD 18-AtRD29Ap质粒(酶切负对照) ;
4:EcoRI 和 BglII 双酶切检测 pMD 18-AtRD29Ap载体。
图 3 PlantCARE数据库中搜寻的拟南芥 RD29A基因启动子片段
Fig.3 The 520-bp sequence of Arabidopsis RD29A gene promoter submitted to the database
of plant cis-acting regulatory element (PlantCARE)
植物生理学通讯 第 43卷 第 2期,2007年 4月286
由此表明,所克隆的RD29A基因上游 5端序列为
包含各种顺式作用元件的启动子片段(AtRD29Ap)。
2 AtRD29Ap::AhNCED1融合基因构建
用 EcoRI和 BglII双酶切 pMD 18-AtRD29Ap
载体,回收酶切得到的 AtRD29Ap启动子片段,
连接于同样经EcoRI和BglII双酶切的植物双元表
达载体 p35S::ORF上,替换 p35S::ORF载体上驱
动 AhNCED1基因的 CaMV 35S启动子,得到含
AtRD29Ap::AhNCED1融合基因的植物双元表达载
体pAtRD29Ap::AhNCED1 (图1)。对pAtRD29Ap::
AhNCED1载体AtRD29Ap与AhNCED1基因结合区
(junction area)测序,结果表明,在 AhNCED1基
因起始密码子 ATG 之前插入了一 1 8 b p 序列
( A T G G A T C A A A C A G A T C T C,其中
ATGGATCAAAC 11 bp序列为RD29A基因编码区序
列,AGATCTC序列是根据 p35S::ORF载体设计
的 ),不会改变 A h N C E D 1 基因的读码框;
AhNCED1基因的功能保守区域在 3端,5端插入
18 bp序列后没影响到 AhNCED1基因的功能结构
域。
对构建的 pAtRD29Ap::AhNCED1载体进行
PCR和酶切检测,结果以 P1和 P2为引物可特异
地扩增出 532 bp的 PCR产物;EcoRI和 BglII双
酶切pAtRD29Ap::AhNCED1载体可切下相应大小
的DNA片段(图 4)。说明已构建了干旱诱导型启
动子AtRD29Ap驱动花生AhNCED1基因的植物双
元表达载体。
讨  论
NCED催化 9-顺式环氧类胡萝卜素裂解成为
黄质醛是高等植物 ABA 生物合成的关键步骤。
AhNCED1是干旱胁迫下花生叶片中调控ABA生物
合成的关键基因,在拟南芥中异位表达AhNCED1
基因提高了转基因植物的ABA含量和抗旱性(Wan
和 Li 2005,2006)。许多研究(刘吉升和李玲
2006;万小荣和李玲 2006)表明,不同花生品种
的抗旱性与其体内ABA水平呈正相关,干旱胁迫
下,抗旱性强的花生品种中 AhNCED1基因表达
水平高于抗旱性相对弱的品种,与ABA累积水平
一致。因而综合适时地调控花生体内ABA水平对
提高植株抗旱性有作用。
选择适宜的启动子来驱动目的基因在转基因
植物中表达已成为植物基因工程研究的热点问题之
一。针对不同的目的基因,人们选用不同的启动
子,从而使靶基因在特定组织或条件下表达,以
利转基因植物的正常生长发育(赵恢武等2000;刘
强等 2000)。拟南芥 RD29A基因的启动子被认为
是干旱、高盐和低温诱导型启动子,具 DRE及
ABRE,在逆境时可驱动靶基因大量表达,从而
提高转基因植物的抗逆性,因此,它已成为植物
抗逆基因工程中首选的启动子。本文克隆了拟南
芥 RD29A基因上游 5侧翼 520 bp序列,此种启
动子片段的生物信息学分析表明,其中包括分别
对脱水胁迫、ABA响应的DRE、ABRE等顺式作
用元件(图 3)。进一步构建了 RD29A基因启动子
驱动花生 Ah NC ED 1 基因的植物双元表达载体
pAtRD29Ap::AhNCED1 (图 1和图4)。干旱虽能诱
导AhNCED1基因表达,但在抗旱性弱的品种中诱
导表达量低,故我们选用拟南芥RD29A基因启动
子,构建 AtRD29Ap::AhNCED1融合基因,使转
基因植物仅在干旱条件下大量表达目的基因,以
利转基因植物的正常生长发育。我们将本文构建
的pAtRD29Ap::AhNCED1载体转入抗旱性较弱花
生品种后的结果表明,干旱胁迫下转基因花生植
图 4 pAtRD29Ap::AhNCED1载体的 PCR和酶切检测
Fig.4 PCR and double digestion check of the binary
vector of pAtRD29Ap::AhNCED1
  M:D L2 0 0 0 D N A ma rk er;1:PCR 系统负对照;2:
PCR检测 pAtRD29Ap::AhNCED1载体;3:EcoRI和 BglII 双
酶切检测 pAtRD 2 9 Ap: :AhN CED 1 载体;4:pAtRD 2 9 Ap: :
AhN CED1 质粒(酶切负对照)。
植物生理学通讯 第 43卷 第 2期,2007年 4月 287
株中内源ABA累积水平明显高于野生型,抗旱性
增强;正常生长条件下,两者无显著区别(资料
未列出)。这些为采用植物基因工程综合适时地调
控花生体内ABA水平、改良花生品种和抗旱育种
奠定了基础。
参考文献
刘吉升, 李玲(2006). 不同品种花生的抗旱能力及其与内源 ABA
的关系. 植物生理学通讯, 42 (6): 1115~1116
刘强, 赵南明, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K (2000).
DREB转录因子在提高植物抗逆性中的作用. 科学通报, 45
(1): 11~16
万小荣, 李玲(2006). 脱水胁迫下抗旱性不同花生品种中某些生
理生化指标变化比较. 植物生理学通讯, 4 2 (6 ) : 1 1 1 7 ~
1118
赵恢武, 陈杨坚, 胡鸢雷, 高音, 林忠平(2000). 干旱诱导性启动
子驱动的海藻糖 -6-磷酸合酶基因载体的构建及转基因烟草
的耐旱性.植物学报, 42 (6): 616~619
Iuchi S, Kobayashi M, Taji T, Naramoto M, Seki M, Kato T,
Tabata S, Kakubari Y, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K
(2001). Regulation of drought tolerance by gene manipula-
tion of 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase, a key enzyme in
abscisic acid biosynthesis in Arabidopsis. Plant J, 27: 325~333
Iuchi S, Kobayashi M, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K
(2000). A stress-inducible gene for 9-cis-epoxycarotenoid
dioxygenase involved in abscisic acid biosynthesis under wa-
ter stress in drought-tolerant cowpea. Plant Physiol, 123:
553~562
Kurkela S, Franck M (1990). Cloning and characterization of a
cold- and ABA-inducible Arabidopsis gene. Plant Mol Biol,
15 (1): 137~144
Lescot M, Déhais P, Thijs G, Marchal K, Moreau Y, Van de Peer
Y, Rouzé P, Rombauts S (2002). PlantCARE: a database of
plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for
in silico analysis of promoter sequences. Nucl Acids Res, 30
(1): 325~327
Li L, Pan RC (1996). Increasing yield and drought resistance of
groundnut using plant growth regulators. In: Achieving High
Groundnut Yields. Proceedings of an International Workshop,
Andhra Pradesh, India, 147~155
Nambara E, Marion-Poll A (2005). Abscisic acid biosynthesis and
catabolism. Annu Rev Plant Biol, 56: 165~185
Qin X, Zeevaart JAD (1999). The 9-cis-epoxycarotenoid cleav-
age reaction is the key regulatory step of abscisic acid bio-
synthesis in water-stressed bean. Proc Natl Acad Sci USA, 96:
15354~15361
Rodrigo MJ, Alquezar B, Zacarias L (2006). Cloning and charac-
terization of two 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase genes,
differentially regulated during fruit maturation and under stress
conditions, from orange (Citrus sinensis L. Osbeck). J Exp
Bot, 57 (3): 633~643
Soar CJ, Speirs J, Maffei SM, Loveys BR (2004). Gradients in
stomatal conductance, xylem sap ABA and bulk leaf ABA
along canes of Vitis vinifera cv Shiraz: biochemical and
molecular biological evidence indicating their source. Funct
Plant Biol, 31: 659~669
Tan BC, Schwartz SH, Zeevaart JAD, McCarty DR (1997). Ge-
netic control of abscisic acid biosynthesis in maize. Proc
Natl Acad Sci USA, 94: 1235~1240
Taylor IB, Sonneveld T, Bugg TDH, Thompson AJ (2005). Regu-
lation and manipulation of the biosynthesis of abscisic acid,
including the supply of xanthophyll precursors. J Plant
Growth Regul, 24: 1~21
Thompson AJ, Jackson AC, Symonds RC, Mulholland BJ, Dadswell
AR, Blake PS, Burbidge A, Taylor IB (2000). Ectopic ex-
pression of a tomato 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase
gene causes over-production of abscisic acid. Plant J, 23 (3):
363~374
Wan XR, Li L (2005). Molecular cloning and characterization of
a dehydration-inducible cDNA encoding a putative 9-cis-
epoxycarotenoid dioxygenase in Arachis hypogaea L. DNA
Seq, 16 (3): 217~223
Wan XR, Li L (2006). Regulation of ABA level and water-stress
tolerance of Arabidopsis by ectopic expression of a peanut
9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase gene. Biochem Biophys
Res Commun, 347 (4): 1030~1038
Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K (1993). Characterization
of the expression of a desiccation-responsive rd29 gene of
Arabidopsis thaliana and analysis of its promoter in transgenic
plants. Mol Gen Genet, 236: 331~340
Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K (1994). A novel cis-acting
element in an Arabidopsis gene is involved in responsiveness
to drought, low temperature, or high-salt stress. Plant Cell,
6: 251~264
Zhu C, Kauder F, Romer S, Sandmann G (2007). Cloning of two
individu a l cD N As encod ing 9 -c i s -epo xyca rote noid
dioxygenase from Gentiana lutea, their tissue-specific ex-
pression and physiological effect in transgenic tobacco. J
Plant Physiol, 164 (2): 195~204