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叶绿体中Calvin 循环多酶复合体



全 文 :植物生理学通讯 第 44卷 第 3期,2008年 6月392
叶绿体中Calvin循环多酶复合体
李瑞,陆巍 *,周玮
南京农业大学生命科学学院,南京 210095
Calvin Cycle Multi-Enzyme Complexes in Chloroplast
LI Rui, LU Wei*, ZHOU Wei
College of Life Sciences, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China
提要:从Calvin循环、多酶复合体分离及其特性、可溶性酶组合成多酶复合体的优势及其与类囊体膜的结合对Calvin循
环多酶复合体的研究进展作了介绍。
关键词:Calvin循环;多酶复合体;类囊体膜
收稿 2007-12-07 修定 2008-04-10
资助 南京农业大学科技创新基金(Y2 00 52 3)。
* 通讯作者( E -ma i l:l u w @n j a u . e d u . c n;T el:0 2 5 -
8 4 3 9 5 4 2 3 )。
以往的研究认为,细胞及其细胞器内充满了
游离分子,精确的化学反应是通过这些游离分子
的非目的性碰撞而发生的,但现代科学家们对这
个观点提出了质疑。目前,根据蛋白质浓度、蛋
白质在胞液中的溶解能力、酶 -酶之间的相互作
用提出:代谢途径的酶在体内应该以复合体的形
式存在,并且这种复合体与亚细胞结构和生物膜
相结合,为“底物穿梭”提供更加便利的通道,
继而提高体内蛋白拥挤的环境中的代谢效率(Srere
1987)。尽管可溶性酶的组合在蛋白质拥挤的环境
中有显著的生理作用,但是用生物化学和分子生
物学的技术证明这种观点是非常困难的,因此这
种复合体的形成及其代谢重要性遂成为争论的主
题。
一些动物和微生物细胞中的多酶复合体已有
广泛研究(Srere 1980;Ovadi 1988;Keleti等
1989),但关于植物代谢途径中酶的组合信息则很
有限(Hrazdina和 Jensen 1992),且大多数集中于
电子传递链组分的研究。植物生物化学研究的目
的之一就是提高植物体中代谢的效率,其中也包
括作物的光合作用,因此了解体内这种多分子组
合及其对代谢途径的调控就非常重要。本文对叶
绿体基质中可溶性酶之间组合成多酶复合体以及可
溶性酶与类囊体膜结合的研究进展作介绍。
1 Calvin循环
Calvin循环利用光合作用原初反应和氧释放、
光合磷酸化以及电子传递的反应产物 A T P 和
NADPH,将活跃的化学能转换为贮存在糖类中的
稳定的化学能,以供给生命活动的需要,即碳同
化。这个循环在叶绿体基质中进行,需要 11种
酶来催化 13 个连续的反应,分为 3 个阶段,即
羧化阶段、还原阶段和更新阶段,具体的反应过
程如图 1。
长期以来一直认为 Calvin循环中的各个酶都
图 1 Calvin循环[根据Raines (2003)略加修改]
A:1,5-二磷酸核酮糖羧化酶 /加氧酶(Rubisco); B:3-磷
酸甘油酸激酶(PGK) ; C:3-磷酸甘油醛脱氢酶 (GAPDH); D:
丙糖磷酸异构酶(TPI); E:醛缩酶(a ldolase); F:果糖 -1,6-二
磷酸磷酸酶(FBPase); G:转酮酶(transketolase); H:景天庚
酮糖 -1,7-二磷酸酶(SBPase); I:核酮糖 -5-磷酸差向异构酶(Ru-
5-P epimerase); J:核糖磷酸异构酶(RPI); K:磷酸核酮糖激
酶(R PK )。3 -PG A:3 - 磷酸甘油酸;1 ,3 -PG A:1 ,3 - 二磷酸
甘油酸;G - 3 - P:3 - 磷酸甘油醛;D H A P:二羟丙酮磷酸;
Fru -1 ,6 -P:果糖 -1 , 6 - 二磷酸;Fru -6 -P:果糖 -6 - 磷酸;E-
4-P:赤藓糖 -4-磷酸;Sed-1,7-P:景天庚酮糖 -1 ,7-二磷酸;
S ed -7 -P:景天庚酮糖 -7 - 磷酸;R -5 -P:核糖 -5 - 磷酸;X -
5 -P:木酮糖 -5 - 磷酸;R u -5 -P:核酮糖 -5 - 磷酸;R u -1 , 5 -
P:核酮糖 - 1 , 5 - 二磷酸。
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是以可溶性状态游离存在于高等植物叶绿体中的,
直到上个世纪 60年代,Calvin循环中的酶相互结
合形成多酶复合体才被发现(van Noort和Wildman
1964;Mendiola和Akazawa 1964)。目前,许多
实验室已经从叶绿体中分离纯化得到Calvin循环一
些酶组成的多酶复合体。
2 多酶复合体的分离与特性
Müller (1972)认为一些CO2固定酶可能是以一
种易解离的复合体形式存在的,但是一般可溶性
酶之间的相互作用是弱而短暂的,因此它们的多
分子组合的研究比较难,尽管有人曾用不同的手
段观察到了 Calvin循环酶之间的多酶组合。
Sainis和Harris (1986,1987)根据蔗糖密度梯
度离心分离得到的豌豆和菠菜叶绿体基质提取物
中,1,5-二磷酸核酮糖羧化酶 /加氧酶(Rubisco,
EC 4.1.1.39)组分可以核糖 -5-磷酸(R-5-P)为底物
表现出依赖ATP的羧化活性,这表明核糖磷酸异
构酶(RPI, EC 5.3.1.6)、磷酸核酮糖激酶(RPK, EC
2.7.1.19)与 Rubisco可以作为一个整体而纯化出
来,后又发现几乎所有 RPK都可与羧化酶结合。
Gontero等(1988)用离子交换层析、分子筛层
析和羟基磷灰石柱层析方法从菠菜中纯化出一个由
5个酶组成的复合体,这些酶是卡尔文循环过程
中的连续酶,包括 RPI、RPK、Rubisco、3-磷
酸甘油酸激酶(PGK, EC 2.7.2.3)和 3-磷酸甘油醛
脱氢酶(GAPDH, EC 1.2.1.13),这个复合体的分
子量为 540 kDa。由这 5个酶组成的复合体催化的
反应过程如下:
  核糖 -5-磷酸 —→ 核酮糖 -5-磷酸 —→ 核酮
糖 -1,5-二磷酸 ———→ 3-磷酸甘油酸 —→1,3-
二磷酸甘油酸——→ 3-磷酸甘油醛+NAD++H3PO4
Babadzhanova等(2002)在棉花叶片中也分离得
到包括这 5个酶的多酶复合体,此种复合体分为
游离的和类囊体膜结合的两种形式,分子量分别
为(520±20) kDa和(640±25) kDa。2006年他们
(Babadzhanova等 2006)又在生长 15~25 d (6~8真
叶阶段、花芽形成期间、开花期间)的棉花叶片
中分离出分子量分别为(240±10) kDa和(520±20)
kDa的游离多酶复合体,并对发育过程中的 RPI、
RPK和 Rubisco的活性变化进行了比较研究,结
果表明多酶复合体中的 RPI和 RPK与单一酶相比
活性变化不显著,Rubisco活性变化显著,生殖
器官形成阶段复合体酶活性和光合速率最高。
Rault等(1993)研究由这 5个酶组成的复合体
的结构和功能特性的结果表明,此种复合体中每
一酶组分的四级结构都不同于游离的单一酶的四级
结构,其动力学研究(Gontero等 1993)结果表明,
复合体中的酶有较高的 Vmax和较低的 Km。Ricard
等(1994)提出,不同的酶组合成多酶复合体后其
催化特性发生变化,这种变化与不同活化位点之
间的反应中间产物通道无关,而是多酶复合体中
酶彼此之间信息传递的结果( Ri ca rd 等 1 99 4;
Gontero等 1994)。
迄今研究较多的是由GAPDH和RPK组成的多
酶复合体,这 2个酶在 Calvin循环过程中催化不
连续的反应,但也可以结合成为复合体而存在。
Nicholson等(1987)在斜生栅列藻(Scenedesmus
obliquus)中分离得到一个稳定的含有GAPDH和
RPK的复合体,分子量为 560 kDa,这 2个酶呈
结合状态,彼此之间的动力学特性相互影响。在
衣藻(Chlamydomons reinhardtii)的叶绿体中也分离
和纯化出一个含有 RPK和GAPDH的双酶复合体
(Lebreton等 1997;Avilan等 1997),热力学统计
的结果表明其蛋白之间有信息和能量传递。复合
体的稳定或不稳定是通过构象变化来反映的,而
这种构象变化则是通过蛋白质-蛋白质的相互作用
表现出来,最终各组分之间产生互相结合的指
纹。构象变化的热力学研究表明GAPDH和 RPK
即使在分离之后仍然携带有这些指纹,最终引起
一些辅助因子的动力学特性发生变化(Lebreton等
1997;Avilan等 1997;Lebreton和Gontero 1999;
Graciet等 2002)。Mouche等(2002)采用多重技术
相结合的方法研究衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)
中GAPDH和RPK组成的多酶复合体的结果表明,
二聚体的RPK在与四聚体的GAPDH结合和分离的
循环过程中的活性有显著变化;低温电子显微镜
观察表明分离的和模型化的RPK二聚体和整个复
合体的三维结构的对应体之间在结构上有显著变
化。RPK与GAPDH之间相互结合,并可以利用
原初反应和氧释放、光合磷酸化和电子传递反应
中产生的ATP和NADPH,此种双酶复合体中2个
酶之间相互协同调控,定义为一个“控制单位”
——Calvin循环是光、pH和代谢物调控的一个起
始点。因此认为,RPK与GAPDH之间的蛋白质 -
RPK
Rubisco PGK
GAPDH
RPI
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蛋白质相互作用可更好地调控Calvin循环(Lebreton
和 Gontero 1999)。
近 2年来还发现,GAPDH和 RPK组成的多
酶复合体还可与 CP12共同组成一个多酶复合体,
CP12是一个核基因编码的分子量为 8.5 kDa的叶
绿体蛋白,在超分子复合体装配中起蛋白连接子
的作用(Graciet等 2003),GAPDH、RPK和 CP12
的组装模型如图 2所示,首先GAPDH与CP12相
互结合,解离常数接近 0.44 nmol·L-1,这种结合
可能使GAPDH构象发生改变,而后GAPDH/CP12
复合体与RPK相互结合,其解离常数为 60 nmol·L-1,
最终形成半个复合体,定义为一个单位。这个单
位以二聚体形式最终形成包括2个二聚体的RPK,
2个四聚体的GAPDH,可能是 2个单体 CP12的
复合体。Graciet等(2004)曾对GAPDH/CP12/RPK
组成的复合体的动力学、调控特性及其在 CO2同
化中的作用作了详细综述。Marri等(2005)也曾对
拟南芥进行体外重组得到GAPDH/CP12/RPK相互
结合的复合体,其分子量为 640 kDa。
磷酸酶(SBPase, EC 3.1.3.37)、铁氧还蛋白NADP
还原酶(FNR, EC 1.18.1.1)的多酶复合体,其分子
量为 900 kDa。这一复合体在低离子强度溶液中
比较稳定,Calvin循环酶形成催化链,以 5-磷酸
核糖为底物,经过多步连续酶促反应合成 3-磷酸
甘油酸,这种“底物穿梭”可大幅度的增加催
化效率。Jebanathirajah和 Coleman (1998)用快速
蛋白液相色谱(fast protein liquid chromatography,
FPLC),从烟草叶绿体中分离得到碳酸酐酶(CA,
EC 4.2.1.1)与 Rubisco、RPK、RPI相结合的多酶
复合体,其分子量高于600 kDa,CA可能与Rubisco
结合在卡尔文循环多酶复合体的外侧,RPK位于
复合体中心,并与类囊体膜结合。
总之,这些体外研究的结果表明,大部分参
与 Calvin循环的酶均可以结合成为多酶复合体,
但不同复合体之间的酶组分则不完全相同,酶组
分之间没有确定的化学计量比(表 1)。Raul t 等
(1993)采用免疫化学和光密度分析相结合的方法研
究由 RPI、RPK、Rubisco、PGK和 GAPDH组
成的多酶复合体中酶组分的化学计量比时发现,
多酶复合体含有 RPK的 2个亚基、RPI的 2个亚
基、Rubisco的 2个大亚基(L)和 4个小亚基(S)、
PGK的1个亚基、GAPDH的 2个不同的亚基(α亚
基和 β亚基)。Hosur等(1993)分析Rubisco/RPK多
酶复合体的结晶和结构时,发现Rubisco是正常的
L8S8形式,但对其中一些晶体进行X-ray衍射的结
果表明,晶体 Rubisco除正常 L8S8形式之外还有
其他的形式,如上面所说的 L2S4的形式,这可能
是多酶复合体中其他酶影响造成的。根据不同实
验室的结果可以认为,其原因可能是采用的提取
和纯化程序不同造成的,也可能是多分子之间结
合的松紧程度不同和动态变化造成的。体内由基
质酶和膜结合的酶组成的蛋白复合体可能是蛋白网
络排列的,而不是按单个酶组分“无秩序的”随
机分布排列的,因此溶解于水介质中时的多酶复
合体会趋向解离,各组分分开,只有非常稳定的
酶复合体在提取之后才有可能在非生理的液相环境
中仍然保持结合状态,分离出来可用于特征研
究,否则就难以确定多酶复合体中酶组分的化学
计量比。
另外,分离 Calvin循环中酶复合体时也不能
排除实验操作过程中由于人为因素而引起部分游离
图 2 衣藻(C. reinhardtii)的GAPDH/RPK/CP12复合体组
装模型[根据Graciet等(2003)略加修改]
除了由 5个酶和 2个酶组成的多酶复合体之
外,人们还发现了由其他不同酶组分组成的
Calvin循环多酶复合体。Persson和 Johansson
(1989)用液体两相系统的逆流分配探测 6个Calvin
循环酶的共分配现象的结果表明这些酶之间存在蛋
白质 -蛋白质复合体趋势,这些酶包括 Rubisco、
PGK、GAPDH、丙糖磷酸异构酶(TPI, EC 5.3.1.1)、
醛缩酶、果糖 -1,6-二磷酸磷酸酶(FBPase, EC 3.
1 .3 .11)。Süss等(1993)分离出一个含有 RPI、
RPK、Rubisco、GAPDH、景天庚酮糖 -1,7-二
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酶自由组合成多酶复合体,应该采用灵敏度高的
检测方法证明新鲜细胞器提取物中的酶是聚合成复
合体而不是人为因素造成的。Süss等(1993)用限
制性蛋白酶水解和免疫印迹相结合的方法证实了这
一点。这个方法是建立在 Lys和Arg残基通常参
与寡聚蛋白蛋白交界面形成的基础之上的。如果
能够切割这 2种氨基酸的肽键进而使蛋白组分分
开,则所有的样品都可在同一介质中进行蛋白酶
水解,反过来,特定酶需要具有同一构型;与
单一酶相比,多肽的差异应该是由蛋白质 -蛋白
质之间的相互作用引起的。单独的酶可能更容易
受到特异性蛋白酶的影响和裂解,而如果这些组
分结合到多酶系统中就不易受蛋白酶水解的影响。
经证明,专一的裂解精氨酸和赖氨酸残基的胰蛋
白酶是这一实验中的常用品,有人用胰蛋白酶已
成功证明RPK和GAPDH在新鲜准备的基质提取物
中是相互结合的。此外,在不同离子强度下
Calvin循环酶复合体的解离也可采用这种技术加以
证明(Süss等 1993)。从这些结果中还可以看出,
基质提取物的任何处理都可能引起Calvin循环多酶
复合体的解离,这就可以解释为什么从同样的提
取物中分离的Calvin循环多酶复合体有组分的差异
和分子量高低之分。如同 Calvin循环一样,其他
代谢途径的连续酶也可以在叶绿体中结合成为多酶
复合体,这样所有代谢反应才可以在一个协调的
环境中进行,光反应也才可以更有效地利用能
量,产生还原力,有关其他代谢途径中酶组合的
信息尚少,还有待继续研究。
3 可溶性酶组合成多酶复合体的优势及其与类囊
体膜的结合
植物体内的一些代谢途径可以共享同样的代
谢中间产物,并同时在特定的时间内于拥挤的环
境中进行,因此将酶之间代谢途径的细微区域化
与底物通道连接起来研究是非常必要的,这就可
以将这些代谢途径的共同底物和辅助因子之间的竞
争降到最低,代谢过程得以有效进行。Süss 等
(1993)提出,多酶组合能够使 CO2同化所需组分
和辅助因子(ATP和NADPH)更加便利的运输到催
化位点,还可以防止其他代谢途径的干扰。Rault
等(1993)研究 RPI、RPK、Rubisco、PGK 和
G A P D H 构成的复合体的动力学结果表明,
Rubisco以复合体形式存在时,其催化效率提高,
这可能是每一活化位点的Vmax增加和Km下降造成
的。Sainis和 Jawali (1994)在体外观察到,由
RPI、RPK、Rubisco组成的 Calvin循环多酶复合
体可以表现出以R-5-P为底物和依赖ATP的CO2固
定活性,可为中间代谢物提供通道,致使Rubisco
的催化反应更加便利。PGK和GAPDH在体外的
相互结合表明二者之间可以相互作用,并可为
1 , 3 - 二磷酸甘油酸的穿梭提供通道( W a n g 等
1996)。Brenda (2004)认为,酶结合成复合体后
的最大优势就是可使一些生物合成的代谢中间产物
更加便利的运输到催化位点,而不是在细胞内聚
成团,这种代谢通道在提高和调控细胞的生物化
表 1 不同植物体中含有包括不同亚基的复合体
植物 亚基数目 亚基种类 参考文献
斜生栅列藻 2 GAPDH, RPK Nicholson等 1987
衣藻 Lebreton等 1997
衣藻 Lebreton和 Gontero 1999
衣藻 Avilan等 1997
衣藻 Graciet等 2002
衣藻 Mouche等 2002
拟南芥 3 GAPDH, RPK, CP12 Marri等 2005
豌豆和菠菜 Rubisco, RPI, RPK Sainis和 Harris 1986,1987
烟草 4 CA, Rubisco, RPK, RPI Jebanathiraja和 Coleman 1998
菠菜 5 Rubisco, RPK, RPI, GAPDH, PGK Gontero等 1988
棉花 Babadzhanova等 2002,2006
菠菜 Rault等 1993
菠菜 Gontero等 1993
菠菜 6 Rubisco, PGK, GAPDH, TPI, 醛缩酶, FBPase Persson和 Johansson 1989
菠菜 RPI, RPK, Rubisco, GAPDH, SBPase, FNR Süss等 1993
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学反应中发挥作用。一般,多酶复合体可以为
“底物穿梭”提供更加便利的通道,从而提高酶
催化效率,同时还可增加酶结构的稳定性,其在
体内蛋白质拥挤的环境中的优势更明显。
除了可溶性酶之间可以相互作用结合成复合体
以外,可溶性酶还可与类囊体膜结合。已有的研
究表明,Rubisco、FBPase、RPK、GAPDH、
PGK和 RPI可结合在类囊体膜上(Mori等 1984;
Hermoso等 1989;Sainis和 Melzer 2005),H+-ATP
合酶可以为 Rubisco提供膜结合位点(Sainis和
Melzer 2005)。但实验过程中由于一些人工操作所
引起的酶吸附在类囊体膜上的假象不能被排除,
这一问题已可以通过低温固定叶切片和免疫电镜加
以解决。早期的免疫化学研究表明,Rubisco分
子随机分布在叶绿体基质中(Shaw和 Henwood
1985;Vaughn 1987),其他的卡尔文循环酶也是
均匀分布的,但有人用免疫电镜研究的结果对此
种假设提出了质疑,发现卡尔文循环中的酶,
如:RPK、GAPDH和 SBPase都结合在类囊体膜
上(Süss等1993)。此外,还有人发现微藻中的RPK
也结合在类囊体膜上(Mangeney等 1987),更有人
发现 FBPase和硫氧还蛋白也结合在类囊体膜上
(Hermoso等 1992)。在衣藻的叶绿体中用免疫电镜
可以观察到 Calvin循环酶,如 RPI、GAPDH、
FBPase、醛缩酶和 PGK在体内均与类囊体膜结合
(Süss等 1995)。豌豆叶片的免疫定位观察表明,
60%的GAPDH和 54%的 PGK结合于类囊体膜上
(Wang等 1996)。而Anderson等(1996)对豌豆叶片进
行免疫定位后发现大部分的 PGK、SBPase,一半
的GAPDH、RPK,小部分的 TPI、醛缩酶、CA
都是与类囊体膜结合的。此外Teige等(1998)报道
Calvin循环中的一些次要酶类型,如:核酮糖 -5-
磷酸差向异构酶、转酮酶也都结合在类囊体膜上。
FNR可与包括GAPDH在内的Calvin循环多酶
复合体一同分离得到(Süss等 1993),它也是与类
囊体膜结合的电子传递链的组分之一,因此推测
PSI和 Calvin循环之间有密切关系。GAPDH是卡
尔文循环中唯一依赖NAPDH的酶,但在基质提取
物的免疫亲和层析中用抗FNR和抗GAPDH的抗体
的结果表明二者是相互结合的(Sainis和Melzer
2005)。PSI的 E亚基是 FNR在类囊体膜上的主要
结合位点(Andersen等 1992)。这表明 FNR的功能
并不是简单的作为Calvin循环多酶复合体到PSI之
间的膜连接器,FNR与GAPDH的结合可以认为
是NADP+/NADPH的通道,这样光反应产生的还
原力NADPH就可更加便利的运输到暗反应,提高
光合速率。
总之,根据前人的研究可以推断,多酶复合
体与类囊体膜结合可以使膜上的代谢物通道更加通
畅,各类代谢途径可以互相连接,同时还可以用
以解释高等植物中有效的光合电子传递和CO2固定
之间的耦联。此外,非液相介质可以显著增加可
溶性酶的稳定性和周转数量,酶与膜结合后会限
制水在酶层中的分布,并在催化位点上产生一个
非极性的环境,从而促使酶的稳定性和周转数量
增加,进而更加便利的发挥其催化作用。酶与膜
结合还可以延长酶的寿命,二者结合后可以阻止
酶聚集和钝化(Bell等 1995),因此,Calvin循环
酶与类囊体膜结合的研究是有意义的。
4 结语
Calvin循环在植物合成代谢中是一个独特的过
程,在 CO 2 同化中起作用,它与绿色植物、藻
类和光合细菌的生物量和产量、温室气体减少等
有着密切的联系。迄今对 Calvin循环个体酶的研
究比较多,长期以来一直认为Rubisco是这一途径
的限速酶(Man 1999),因此,对 Rubisco在蛋白
和基因水平上做了大量研究(Spreitzer和 Salvucci
2002)。但Quick等(1992)对 Rubisco是限速酶这
一概念提出了质疑,Raines (2003)对 Calvin循环
的综述中也表明在各种环境条件下,Rubisco对碳
固定的影响很小,FBPase、RPK、GAPDH、醛
缩酶和转酮酶却有着不可忽视的作用,而 SBPase
是 Calvin循环的限速酶,并且要更加重视对酶复
合体的研究,特别是关于复合体中酶活性调控的
机制的研究。因此这就要求我们重新考虑代谢途
径的控制是否还将仍然停留在代谢途径单个酶的活
性上。
尽管Calvin-Benson循环多酶复合体已经得到
证实,但仍有很多问题没有解决。首先是各个实
验室得到的多酶复合体的组成有差异,不仅表现
在不同物种上,同一物种之间也有很大的差异,
这些差异需要用更多的材料作实验,这样才可在
更大范围的高等植物叶绿体中进行比较,验证其
普遍性;其次是揭示多酶复合体的空间结构特
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点,即各个酶是如何组装的,哪个酶在复合体的
内部,哪个酶在复合体的外部,它们是如何相互
作用的,其超分子的空间结构又是如何,迄今这
方面的报道还很少,只有一些结构模型的猜想(图
2),因此这也是未来研究 Calvin循环多酶复合体
可能要解决的问题;最后也是最本质的问题是多
酶复合体的生理意义和其结构功能的研究,其目
的都是为了揭示多酶复合体在生物体内的作用。
因此在光合作用机制和蛋白质结构的研究中,多
酶复合体的相互结合,并能表现出各个酶的催化
活性的探讨,无论是在体内或是体外进行验证都
有意义。
参考文献
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