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Genetic analysis and SSR markers of wheat stripe rust resistance gene YrElm derived from Elymus mollis (Trin.) Hara

源于柔软滨麦草抗小麦条锈病基因YrElm的遗传分析与SSR标记



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  44(6): 641 ̄650(2014)
收稿日期: 2014 ̄01 ̄06ꎻ 修回日期: 2014 ̄08 ̄14
基金项目: 国家“973”项目(2013CB127705)ꎻ国家“863”子课题(2012AA101503)ꎻ陕西省科技统筹项目(2012KTCL02 ̄10)ꎻ国家自然科学
基金项目(31000846ꎻ31101396)ꎻ高等学校学科创新引智计划(No. B07049)资助
通讯作者: 王保通ꎬ教授ꎬ主要从事小麦病害综合治理研究ꎻTel:029 ̄87092601ꎬE ̄mail:wangbt@nwsuaf.edu.cn
李强ꎬ副研究员ꎬ主要从事小麦抗病遗传机制研究ꎻE ̄mail:qiangli@nwsuaf.edu.cn
第一作者: 张玉ꎬ女ꎬ山东省潍坊市人ꎬ硕士研究生ꎬ主要从事植物抗病性遗传研究ꎻE ̄mail:zhangyu_929@163.comꎮ
doi:10.13926 / j.cnki.apps.2014.06.011
源于柔软滨麦草抗小麦条锈病基因 YrElm的遗传
分析与 SSR标记
张 玉ꎬ 巢凯翔ꎬ 高 旭ꎬ 柳泽光ꎬ 姚未远ꎬ 李 强∗ꎬ 王保通∗
(旱区作物逆境生物学国家重点实验室 /西北农林科技大学植物保护学院ꎬ杨凌 712100)
摘要:M852-1 是由柔软滨麦草和普通小麦 7182 经杂交和回交培育的易位系ꎮ 苗期抗病性鉴定结果表明ꎬM852 ̄1 对
CYR29、CYR31、CYR32、CYR33、Su11 ̄4、Su11 ̄7和 V26等 7个中国小麦条锈菌主要生理小种或新的致病类型均表现免疫
至高抗ꎬ是一个较好的抗条锈资源材料ꎮ 用条锈菌流行小种 CYR33 对 M852 ̄1与铭贤 169 杂交 F1、F2、F3和 BC1代进行抗
性鉴定与遗传分析ꎬ发现 M852 ̄1对 CYR33的抗条锈性由 1对隐性基因控制ꎬ暂定名为 YrElmꎮ 以 F2代分离群体构建作图
群体ꎬ利用集群分离分析法ꎬ筛选到与 YrElm 连锁的 5 个 SSR 标记:Xcfd35、Xgwm161、Xwmc630、Xgwm533 和 Xcfd34ꎬ并将
YrElm定位于小麦染色体 3DS上ꎮ YrElm两侧最近 2个 SSR标记 Xcfd35与 Xgwm161的遗传距离分别为 6.5 cM和4.2 cMꎮ
抗锈性鉴定、系谱分析以及分子标记检测结果表明ꎬ该抗病基因来源于柔软滨麦草ꎮ 综合基因来源、分子检测及染色体位
点等方面的分析ꎬ认为 YrElm可能是一个新的抗条锈病基因ꎮ 用该基因两侧最近两个标记 Xcfd35 和 Xgwm161 检测 68 个
甘肃和黄淮麦区小麦品种(系)ꎬ10个(14.7%)品种能扩增出与 M852 ̄1相同的条带ꎮ 进一步进行抗病性及系谱分析表明ꎬ
这 10个品种均不含 YrElmꎮ 本研究结果为利用 YrElm进行分子标记辅助育种和进一步的精细定位奠定了基础ꎮ
关键词:小麦条锈病ꎻ 柔软滨麦草ꎻ 抗病基因ꎻ 遗传分析ꎻ SSR标记
Genetic analysis and SSR markers of wheat stripe rust resistance gene YrElm
derived from Elymus mollis ( Trin.) Hara   ZHANG Yuꎬ CHAO Kai ̄xiangꎬ GAO Xuꎬ Liu
Ze ̄guangꎬ Yao Wei ̄yuanꎬ LI Qiangꎬ WANG Bao ̄tong   ( State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid
Areas / College of Plant Protectionꎬ Northwest A&F UniversityꎬYangling 712100ꎬ China)
Abstract: Wheat stripe rustꎬ caused by Puccinia striiformis f. sp. tritici (Pst)ꎬ is one of the most important
diseases of wheat worldwideꎬ especially in China. Wheat relatives are important donors of resistance genes
against this disease in wheat breeding program. M852 ̄1ꎬ a wheat ̄Elymus mollis translocation lineꎬ is highly
resistant to seven main Pst races or new pathotype of China (CYR29ꎬ CYR31ꎬ CYR32ꎬ CYR33ꎬ Su11 ̄4ꎬ Su11 ̄
7 and V26)ꎬ and is a preferable stripe rust resistant material. F1ꎬ F2ꎬ F3 and BC1generations derived from cross
M852 ̄1 / Mingxian169 were tested with prevalent Pst race CYR33. The genetic analysis results indicated that the
resistance of M852 ̄1 to CYR33 was controlled by a single recessive geneꎬ tentatively designated as YrElm. The
resistance gene was mapped using a F2 population from M852 ̄1/ Mingxian169 and bulked segregant analysis
(BSA) . YrElm was linked with five simple sequence repeat (SSR) markersꎬ Xcfd35ꎬ Xgwm161ꎬ Xwmc630ꎬ
Xgwm533 and Xcfd34ꎬ which were located on wheat chromosome 3DS. The genetic distances of the closest
 
植物病理学报 44卷
flanking markersꎬ Xcfd35 and Xgwm161ꎬ were 6.5 cM and 4.2 cMꎬ respectively. Pedigree analysisꎬ chromosomal
location and molecular test suggested that YrElm might be a novel stripe rust resistance gene which was derived
from Elymus mollis. Two closest flanking SSR markersꎬ Xcfd35 and Xgwm161ꎬ were used to test 68 wheat
cultivars from Gansu and Huanghuai wheat region. The results showed that ten (14.7%) cultivars had the same
polymorphic bands as M852 ̄1. Howeverꎬ resistance identification and pedigree analysis suggested that these ten
cultivars might not carry the stripe rust resistance gene YrElm. The polymorphic SSR markers identified in this
research can be useful in wheat molecular marker select breeding and fine mapping.
Key words: wheat stripe rustꎻ Elymus mollis (Trin.) Haraꎻ resistance geneꎻ genetic analysisꎻ SSR makers
中图分类号: S435.12          文献标识码: A          文章编号: 0412 ̄0914(2014)06 ̄0641 ̄10
    小麦条锈病是由小麦条锈菌(Puccinia striifor ̄
mis f. sp. tritici)引起的主要的世界性小麦病害ꎬ可
随高空气流远距离传播ꎬ给小麦生产造成重大损失ꎮ
中国是世界上最大且相对独立的小麦条锈病流行
区ꎬ主要分布在西北、西南和黄淮海等冬麦区和西北
春麦区[1 ~ 3]ꎮ 在条锈病流行年份可导致小麦减产
20%~ 30%ꎬ特大流行年份减产 50%以上ꎬ甚至绝
收[2]ꎮ 1999~2009年ꎬ平均每年受灾的小麦面积约
为 400万 hm2[4]ꎮ 国内外研究以及生产实践表明ꎬ
培育和推广抗病品种是防治小麦条锈病最经济、有
效和安全的措施ꎮ 然而由于目前大面积推广抗病品
种的抗源单一以及条锈菌毒性变异频繁ꎬ致使种植
小麦的抗锈性屡屡“丧失”ꎮ 20 世纪 50 年代至今ꎬ
我国小麦条锈病主要流行区已经因品种抗病性“丧
失”进行了 7次大规模的品种更替[ 2ꎬ 5ꎬ6]ꎮ
    小麦抗条锈病基因的挖掘是培育和合理利用
抗病品种的基础ꎮ 因此ꎬ寻找新的抗源ꎬ发掘和利
用小麦抗条锈病新基因ꎬ丰富抗病基因的遗传背景
成为小麦育种工作者的首要任务ꎮ 由于栽培小麦
品种所携带的抗条锈基因有限ꎬ科研人员已经开始
利用小麦近缘种属的外源基因来解决这一难题ꎮ
目前ꎬ在国际上正式命名的 50 多个抗小麦条锈病
基因中ꎬYr5、Yr8、Yr9、Yr15、Yr17、Yr19、Yr26、Yr28、
Yr35、Yr36、Yr37、Yr38、Yr40 和 Yr42 均来自小麦近
缘种属ꎬ说明近缘种属在抗条锈病基因挖掘上具有
巨大的应用潜力[7]ꎮ 柔软滨麦草 (Elymus mollis
(Trin.) Hara JJNN 2n = 28)是禾本科大麦亚族
(Hordinae)赖草属(Elymus)的一个异源四倍体野
生种ꎬ具有抗干旱、耐盐碱、茎秆粗壮、大穗多花和
对小麦条锈病等多种病害有良好抗性等优良性状ꎬ
因此引起国内外很多研究者的关注ꎮ Guo 等[8]对
柔软滨麦草及普通小麦(Triticum aestivum L.)7182
杂交后代的组织病理学研究发现ꎬ柔软滨麦草的抗
锈性在普通小麦 ̄柔软滨麦草异染色体系中仍可高
效表达ꎬ为利用柔软滨麦草抗条锈基因提供了理论
依据ꎮ 目前ꎬ已经定位和命名的来源于柔软滨麦草
的抗条锈病基因有 YrElm2、 YrElm4、 YrElm1 ̄4、
YrLm2和 YrM97ꎬ分别定位于小麦染色体 4BL、
5AS、2AS、4AL 和 1DS 上[9~14]ꎮ 充分挖掘和利用
柔软滨麦草中的抗条锈基因ꎬ可以拓宽小麦的抗条
锈性遗传基础ꎬ对利用多种抗条锈基因保持小麦的
抗病性及持久性具有重要意义ꎮ
    近年发展起来的各种分子标记技术ꎬ如
RFLP、RAPD、AFLP、SSR、STS 和 SNP 等ꎬ已广泛
应用于基因分子定位、遗传多样性分析、小麦遗传
作图、克隆和分子标记辅助育种等领域ꎮ 在这些分
子标记中ꎬSSR因其实验成本低、多态性高、重复性
好和已定位的序列丰富等优点而应用最广[15]ꎮ 本
研究拟对普通小麦 ̄柔软滨麦草易位系 M852 ̄1 进
行遗传分析ꎬ明确其所含抗条锈基因的数量、类型
及其互作关系ꎮ 进一步利用 SSR 分子标记技术ꎬ
对 M852 ̄1抗 CYR33的 1 对隐性基因 YrElm 进行
分子标记ꎬ并对 68 个甘肃和黄淮麦区小麦品种
(系)进行分子检测ꎬ以期为 YrElm 的分子标记辅
助育种和精细定位奠定基础ꎮ
1  材料和方法
1.1  植物材料和条锈菌系
    普通小麦-柔软滨麦草易位系 M852 ̄1(属内
部交流材料)及其供体亲本柔软滨麦草和受体亲
本 7182ꎬ均由原中国科学院西北植物研究所提供ꎮ
感病小麦品种铭贤 169ꎬ铭贤 169 与 M852 ̄1 杂交
F1、F2、F3和 BC1代群体ꎬ用于分子检测的 68个小麦
246
 
  6期 张 玉ꎬ等:源于柔软滨麦草抗小麦条锈病基因 YrElm的遗传分析与 SSR标记
品种(系):中梁 96289、天选 45、兰天 17、兰天 18、天
94-3、西峰 20、天选 46、兰天 10、中梁 30、天选 43、小
偃 325、西农 65、小偃 22、陕 481、西农 129、陕农 28、
西农 979、长武 415、西农 291、远丰 175、西农 339、西
农 291、陕 876、小偃 282、长武 131、陕 448、西农 20、
小偃 216、秦农 26、晋麦 54、晋农 170、泛麦 8号、中原
6号、郑麦 7698、长河 25、百农 207、浚麦 35、新麦 19、
新麦 26、豫麦 18、郑麦 9023、新麦 23、豫麦 13、周麦
12、偃展 4110、周麦 18、烟农 15、泰农 8681、山农
055843、济麦 6097、河农 130 ̄12、衡 5364、冀麦 38、冀
麦 37、邯 894、衡 4422、石 H083 ̄366、冀麦 112、皖科
06209、皖麦 19、扬麦 5 号、明天 07112、绵阳 2000-
34、绵阳 28、中麦 175、京冬 8 号、农大 212 和京花 9
号ꎬ均由西北农林科技大学植物保护学院植物抗病
遗传研究室提供ꎮ
    小麦条锈菌生理小种为 CYR29、 CYR31、
CYR32、CYR33、Su11 ̄4、Su11 ̄7 和 V26(V26 是新
发现的对 Yr24 / Yr26有毒性的新菌系[16] )ꎬ由西北
农林科技大学植物保护学院植物抗病遗传研究室
提供ꎮ 所有供试菌种均经国内鉴别寄主鉴定确认
后ꎬ在感病品种铭贤 169上扩繁备用ꎮ
1.2  抗条锈性鉴定及遗传分析
    苗期抗条锈性鉴定在西北农林科技大学植物
保护学院植物抗病遗传研究室温室进行ꎮ 挑选
M852 ̄1、铭贤 169、柔软滨麦草和 7182 健康饱满籽
粒各 15 ~ 20 粒ꎬ用 1%双氧水浸泡 24 h 消毒ꎮ 在
20℃条件下催芽 24 h 后ꎬ均匀播种于 10 cm 的花
盆中ꎮ 播种后大约 10 dꎬ待幼苗第 1 叶充分展开、
第 2叶刚刚露出时ꎬ轻轻脱去第 1 叶表面的蜡质ꎬ
采用涂抹法分小种接种 7 个条锈菌单孢菌系:
CYR29、CYR31、CYR32、CYR33、Su11 ̄4、Su11 ̄7和
V26ꎮ 10℃、黑暗条件下保湿 24 h 之后ꎬ将接菌的
植物材料置于温室潜育发病ꎮ 温室温度为 15 ~
18℃(昼) / 10 ~ 13℃ (夜)ꎬ每日光照 15 ~ 16 hꎬ光
照强度 9 000 Luxꎬ相对湿度 60% ~ 80%ꎮ 待感病
对照铭贤 169 充分发病后(接种后约 15 d)ꎬ采用
0、0ꎻ、0ꎻ+、1、1+、2、2+、3-、3、3+、4 等 11 级分级标
准ꎬ调查接种材料的反应型ꎮ 根据双亲及杂交后代
反应型级别及各级反应型数目ꎬ将 0 ~ 2+型划为抗
病类型ꎬ3- ~4划为感病类型[17]ꎮ
    成株期抗病性鉴定在西北农林科技大学植物
保护学院植物抗病遗传研究室条锈病圃进行ꎮ
M852 ̄1、柔软滨麦草和 7182各播种 1行ꎬ每行 10~
15粒ꎬ行长 1 mꎬ行距 25 cmꎬ株距 10 cmꎮ 在鉴定
材料周围播种 2 行铭贤 169 作为诱发行和对照ꎮ
在小麦拔节期ꎬ采用抖孢子法接种 CYR32 和
CYR33的混合菌系ꎬ用塑料膜覆盖保湿 12 hꎬ此后
按一般麦田管理ꎮ 在铭贤 169 充分发病时(5 月下
旬)ꎬ按照 11级标准调查成株期反应型ꎮ
    根据苗期抗条锈性鉴定结果ꎬ选择条锈菌优势
流行小种 CYR33 对 M852 ̄1进行遗传分析ꎮ 亲本
和 F1代各 15~ 20 粒ꎬF2代材料每份约 160 粒ꎬBC1
代材料每份约 30 粒ꎬF3代家系每家系 15 ~ 20 粒ꎮ
消毒、催芽后分别播种于 10 cm 的花盆内ꎬ每盆 15
~20粒ꎬ接种、培养和调查方法同苗期抗条锈性鉴
定ꎮ 根据双亲以及杂交后代的反应型及株数ꎬ统计
F1、F2、F3和 BC1代的抗感分离比例ꎬ进行卡方检
验ꎬ以确定 M852 ̄1 所含的抗条锈病基因数目、显
隐性及互作方式[1 8 ꎬ1 9]ꎮ
1.3  基因组 DNA的提取以及抗、感病池的构建
    对M852 ̄1和铭贤 169杂交 F2代群体分单株采取
叶片ꎬ用改良的苯酚 ̄氯仿法提取基因组 DNA[ 20]ꎮ 采
用集群分离分析法(BSA)ꎬ从 F2代群体中选取 10株
高抗(反应型为 0~0ꎻ)单株的 DNA等量混合构建抗
病基因池(Br)ꎬ10 株高感(反应型为 3
+ ~ 4)单株的
DNA等量混合构建感病基因池(Bs)ꎮ
1.4  SSR分子标记分析
    根据 Röder 等[2 1 ]、Somers 等[2 2 ]报道的引物
序列ꎬ同时参照 http: / / wheat.pw.usda.gov /上提供
的引物信息ꎬ随机选取分布于小麦 21 条染色体上
的 534 对 SSR引物ꎬ由北京奥科生物工程有限公
司合成ꎮ 利用 BSA法ꎬ对亲本、抗感池和 F2代群体
依次进行筛选ꎮ
    PCR 反应体系为:共 15 μLꎬ其中 10 × PCR
buffer 1.5 μLꎬ50 ng􀅰 μL-1模板 DNA 2.1 μLꎬ25
mmol􀅰L- 1 MgCl2 1.2 μLꎬ 2.5 mmol􀅰L
-1 dNTPs
1.2 μLꎬ5 μmol􀅰L-1上下游引物各 1.5 μLꎬ5 U
Taq DNA聚合酶 0.15 μLꎬ灭菌双蒸水 5.85 μLꎮ
PCR 扩增程序为:94℃预变性 4 minꎬ94℃变性 1
minꎬ50~65℃退火 1 min(依不同引物确定退火温
度)ꎬ72℃延伸 1 minꎬ共 35个循环ꎬ最后 72℃延伸
346
 
植物病理学报 44卷
10 minꎮ 扩增反应在 S1000 PCR 仪(Bio-Radꎬ美
国)上进行ꎮ 扩增产物用 6%变性聚丙烯酰胺凝胶
电泳ꎬ经硝酸银染色显色后读带分析ꎮ 抗病亲本带
型记为 A带型ꎬ感病亲本带型记作 B 带型ꎬAB 的
杂合带型记作 H带型ꎮ
1.5  连锁性分析及遗传图谱构建
    对筛选的 SSR标记ꎬ统计 F2代分离群体中每个
单株的带型ꎮ 应用 Microsoft Office Excel 2003中的
“Chiest”程序计算筛选到的 SSR标记在 F2代作图群
体中的分离比例ꎮ 用 Mapmaker 3.0b 软件分析 SSR
标记与抗病基因之间的连锁性(LOD = 3.0ꎬmax
Distance 50.0)ꎬ用 Kosambi函数将重组率转化为遗传
距离ꎬ用Mapdraw 2.1绘制遗传连锁图谱[23]ꎮ
1.6  甘肃及黄淮麦区小麦品种(系)分子检测
    为了明确抗病基因两侧最近 2 个 SSR 标记在
分子标记辅助选择育种中的有效性ꎬ用其对 68 个
甘肃和黄淮麦区的主栽小麦品种及新育成小麦品
种(系)进行分子检测ꎮ
2  结果与分析
2.1  M852 ̄1抗条锈性鉴定
    抗条锈性鉴定结果表明ꎬ易位系 M852 ̄1及其
供体亲本柔软滨麦草苗期对 7 个供试条锈菌生理
小种和成株期对 CYR32 和 CYR33 的混合菌系均
表现免疫至高抗ꎬ而其受体亲本 7182 和感病对照
铭贤 169 对供试条锈菌生理小种在苗期和成株期
均表现高感(表 1)ꎮ 初步推测ꎬM852 ̄1 的抗条锈
基因可能来源于柔软滨麦草ꎮ
2.2  M852 ̄1抗条锈性遗传分析
    对M852 ̄1与铭贤 169杂交 F1、F2、BC1和 F3代
群体接种 CYR33ꎬ结果(表 2)表明ꎬ正、反交的 F1代
群体均表现感病ꎮ F1与抗病亲本M852-1回交的 27
个 BC1代群体抗感分离比经卡方检验符合 1R:1Sꎬ
F1与感病亲本铭贤 169 回交的 29 个 BC1代群体均
表现感病ꎮ 正交的 148个 F2群体中ꎬ抗病株 35 株ꎬ
感病株 113 株ꎬ经卡方检验符合 1R ∶ 3S 的分离比
例ꎮ 反交的 128个 F2群体中ꎬ抗病株 29 株ꎬ感病株
99株ꎬ经卡方检验亦符合 1R ∶ 3S的分离比例ꎮ 143
个正交 F3家系接种 CYR33之后ꎬ纯抗家系:分离家
系:纯感家系的比例为 33 ∶ 75 ∶ 35ꎬ经卡方检验符合
1 ∶ 2 ∶ 1 的分离比例ꎮ 综合上述分析ꎬM852 ̄1 对
CYR33的抗条锈性由 1 对隐性基因控制ꎬ属核遗
传ꎬ将该抗条锈基因暂定名为 YrElmꎮ
2.3  YrElm的 SSR分子标记与染色体定位
    用 M852 ̄1与铭贤 169 正交 F2的 148 个单株
构建作图群体ꎬ用 BSA 法进行 SSR 标记筛选ꎮ 随
机选取分布于小麦 21 条染色体上的 534 对 SSR
引物ꎬ对亲本、抗感池和 F2群体依次进行筛选ꎮ
    有 16 对 SSR 引物可分别在抗病亲本 M852 ̄1
及抗病池与感病亲本铭贤 169 及感病池之间稳定
扩增出一致的多态性条带ꎮ 随后从 F2代群体中随
机挑选 40 个单株进行扩增ꎬ其中有 5 对 SSR 引
物: Xcfd35、 Xgwm161、 Xwmc630、 Xgwm533 和
Xcfd34可以在抗病单株和感病单株上扩增出稳定
的多态性条带(图 1)ꎮ 初步推测这 5 个 SSR 标记
与 YrElm基因是连锁的ꎬ除 Xcfd34 是显性标记外ꎬ
其余 4 个均为共显性标记ꎮ 根据 Röder 等[21]、
Somers等[22]报道的引物序列ꎬ同时参照 http: / /
wheat.pw.usda.gov /上提供的引物信息ꎬ这 5 个标
记均位于小麦染色体 3DS 上ꎬ据此推断 YrElm 基
因位于小麦染色体 3DS上ꎮ
Table 1  Seedling and adult plant infection types on M852 ̄1 and its parents to tested Pst races
Cultivar
Infection type in seedling
CYR29 CYR31 CYR32 CYR33 Su11 ̄4 Su11 ̄7 V26
Infection type in adult
plant
Mixed races
(CYR32 and CYR33)
M852 ̄1 0 0~0ꎻ 0 0ꎻ 0ꎻ 0ꎻ 1 0ꎻ
Elymus mollis 0ꎻ 0ꎻ 0ꎻ 0 0 0 0 0ꎻ
7182 3+ 3+ 4 4 4 4 4 4
Mingxian169 4 4 4 4 4 4 4 4
  Note: Infection type between 0 and 2+ are resistant and between 3- and 4 are susceptible.
446
 
  6期 张 玉ꎬ等:源于柔软滨麦草抗小麦条锈病基因 YrElm的遗传分析与 SSR标记
Table 2  Segregation ratios of stripe rust response in different generations of crosses between
M852 ̄1 and Mingxian169 after inoculated with Pst race CYR33 at seedling
Parent
and cross
Generation
Infection type
0 0ꎻ 0ꎻ+ 1 1+ 2 2+ 3- 3 3+ 4
Total
Expected
Ratio
(R ∶ S)
χ2 P
M852 ̄1 P1 17 17
Mingxian169 P2 18 18
P1 / P2 F1 3 16 19
P2 / P1 F1 5 13 18
P1 / P2 / / P1 BC1 2 12 2 11 27 1 ∶ 1 0.233 0.879
P1 / P2 / / P2 BC1 2 27 29
P1 / P2 F2 ̄1 7 10 4 8 4 2 1 33 65 14 148 1 ∶ 3 0.144 0.704
P2 / P1 F2 ̄2 3 11 2 5 7 1 3 34 53 9 128 1 ∶ 3 0.375 0.540
P1 / P2 F3 33(HR) ∶ 75(Seg) ∶ 35(HS) 143 1 ∶ 2 ∶ 1 0.399 0.819
  Note: Infection type between 0 and 2+ are resistant and between 3- and 4 are susceptible.
F2-1: F2 lines of direct crossꎻ F2-2: F2 lines of reciprocal crossꎻ F3 families were derived from F2-1 plantsꎻ
R: Resistant plantsꎻ S:Susceptible plants. Values for significance at P = 0.05 are 3.84 for 1 df and 5.99 for 2 df.
HRꎬ Seg and HS: Homozygous resistantꎬ Segregating and Homozygous susceptible.
Fig. 1  PCR amplification of Xcfd35 (a) and Xgwm161 (b) in partial
F2 plants from the cross M852 ̄1 / Mingxian169
M: DNA markerⅠ ꎻ P1: M852 ̄1ꎻ P2: Mingxian 169ꎻ Br: Resistant bulkꎻ Bs: Susceptible bulkꎻ
R: Resistant plantꎻ S: Susceptible plantꎻ
A: Resistant banding typeꎬ B: Susceptible banding typeꎬ H: Heterozygous banding type.
2.4  SSR分子标记连锁性分析与遗传图谱的绘制
    为了进一步确定位于 3DS 上的这 5 对引物与
YrElm基因的遗传连锁性ꎬ用这 5对引物对 F2代分
离群体的 148个单株进行 PCR扩增ꎮ 发现大部分
抗病单株能够扩增出与抗病亲本 M852 ̄1 一致的
带型ꎬ而大部分感病单株能扩增出与感病亲本铭贤
169一致的带型ꎮ 带型统计结果表明ꎬ经卡方检验
符合 1 ∶ 2 ∶ 1 或者 1 ∶ 3 的比例(表 3)ꎬ因此用其
构建 YrElm 的 遗 传 连 锁 图 谱 是 可 靠 的 ꎮ 用
546
 
植物病理学报 44卷
Table 3  The banding type of F2 individual plant tested with five linked SSR markers
SSR maker
Number of
resistant plant
A H B
Number of
susceptible plant
A H B
Expected ratio
(A:H:B or A:B)
χ2 value P ̄value
Xcfd35 32 2 1 6 66 41 1 ∶ 2 ∶ 1 1.189 0.551
Xgwm161 32 1 2 3 70 40 1 ∶ 2 ∶ 1 0.905 0.636
Xwmc630 32 1 2 4 69 40 1:2:1 0.919 0.632
Xgwm553 31 1 3 7 64 42 1:2:1 2.851 0.240
Xcfd34 28 - 7 15 - 98 1 ∶ 3 1.297 0.254
Note: A: Resistant banding typeꎻ B: Susceptible banding typeꎻ H: Heterozygous banding type.
Values for significance at P = 0.05 are 3.84 for 1 df and 5.99 for 2 df.
 
Mapmaker 3.0b软件进行连锁性分析ꎬXcfd35、Xg ̄
wm161、Xwmc630、Xgwm533 和 Xcfd34 与 YrElm 的
遗传距离分别为 6.5、4.2、4.9、7.7 和 15.7cM(图
2)ꎮ 参照 Somers 等[22] 报道遗传图谱ꎬ 以及
http: / / wheat.pw.usda.gov / 发表的引物信息ꎬ将
YrElm定位于小麦染色体 3DS上ꎬ位于标记 Xcfd35
和 Xgwm161 之间ꎮ 据此ꎬ用 Mapdraw 2.1 绘制了
YrElm遗传连锁图谱(图 2)ꎮ
2.5  抗病基因来源分析
    用与基因 YrElm 两侧遗传距离最近 2 个引物
Xcfd35和 Xgwm161对M852 ̄1、铭贤 169、柔软滨麦
草和 7182进行 PCR 扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳
分析ꎮ 结果发现柔软滨麦草可扩增出与抗病材料
M852 ̄1相同的带型ꎬ而 7182的带型与感病对照品
种铭贤 169一致(图 3)ꎮ 苗期抗条锈鉴定(表 1)
和分子检测结果显示ꎬM852 ̄1 中的抗条锈基因
YrElm来源于柔软滨麦草ꎮ
Fig. 2  Linkage map of YrElm constructed
with SSR markers on wheat chromo ̄
some 3DS
3DS: Short arm of wheat chromosome 3Dꎻ C:
Centromere.
Fig. 3  PCR amplification of M852 ̄1ꎬ Mingxian169ꎬ Elymus mollis
and 7182ꎬ detected with Xcfd35 (a) and Xgwm161 (b)
M: DNA markerⅠꎻ 1: M852 ̄1 ꎻ 2: Mingxian 169 ꎻ 3: Elymus mollis ꎻ 4: 7182.
646
 
  6期 张 玉ꎬ等:源于柔软滨麦草抗小麦条锈病基因 YrElm的遗传分析与 SSR标记
2.6  甘肃及黄淮麦区小麦品种(系)分子检测
    挑选 68个甘肃和黄淮麦区的主栽小麦品种和
新育成小麦品种(系)ꎬ用 YrElm 基因两侧最近 2
个分子标记 Xcfd35 和 Xgwm161 进行分子检测ꎮ
在这些小麦品种(系)中ꎬ20 个(占 29. 4%)能在
Xcfd35位点扩增出与 M852 ̄1 相同的带型ꎬ15 个
(占 22.1%)能在 Xgwm161 位点扩增出与 M852 ̄1
相同的带型ꎬ 10 个 (占 14. 7%) 能在 Xcfd35 和
Xgwm161位点同时扩增出与 M852 ̄1 相同的带型
(表 4)ꎮ
3  讨论
    2002年以来ꎬ新的条锈菌生理小种 CYR32 和
CYR33已成为我国当前最主要的毒性小种ꎮ 2007
和 2008 年ꎬCYR33 的出现频率分别为 23. 1%和
27.9%ꎬ而且频率在逐年攀高ꎬ已超过 CYR32 成为
我国第一位流行的条锈菌生理小种[24]ꎬ目前只有
少数小麦品种对 CYR32 和 CYR33 具有抗病性ꎮ
此外ꎬ已经发现对我国小麦抗病育种中应用较为广
泛的抗条锈基因 Yr10和 Yr24 / 26 有毒性的条锈菌
新菌系ꎬ含有 Yr10 和 Yr24 / 26 血缘的品种已经或
正面临抗性丧失 [25]ꎮ 因此ꎬ我国目前正处于条锈
病再度流行的威胁中ꎬ寻找和挖掘新的小麦条锈病
抗源迫在眉睫[ 26 ]ꎮ 本研究结果表明ꎬ普通小麦 ̄柔
软滨麦草易位系 M852 ̄1 苗期对我国 7 个小麦条
锈菌生理小种 CYR29、CYR31、CYR32、CYR33、
Su11 ̄4、Su11 ̄7和 V26均表现免疫至高抗ꎬ这在当
前大多数抗源对我国流行和新出现的条锈菌生理
小种丧失抗性的形势下极为珍贵ꎬ应当将其作为选
育抗条锈病小麦新品种的重要抗源ꎮ M852 ̄1 对
CYR33的抗病性由 1 对隐性基因控制ꎬ暂命名为
YrElmꎮ
    多年室内和田间试验鉴定证明ꎬ M852 ̄1苗期
和成株期对我国条锈菌生理小种 CYR33均表现高
抗至免疫ꎬ因此 YrElm 应为全生育期抗条锈病基
因ꎮ M852 ̄1是原中国科学院西北植物研究所由柔
软滨麦草和普通小麦品种 7182经多次杂交和回交
选育的易位系材料ꎮ 柔软滨麦草对 CYR33表现抗
病ꎬ而 7182 对 CYR33 表现感病ꎮ 此外ꎬ用 YrElm
两侧最近 2 个标记 Xcfd35 和 Xgwm161ꎬ对 M852 ̄
1、铭贤 169、柔软滨麦草和 7182 进行分子检测ꎬ结
果发现柔软滨麦草均可扩增出与抗病材料 M852 ̄1
相同的带型ꎬ而 7182 的带型与感病对照品种铭贤
169一致ꎮ 因此ꎬ综合系谱分析、抗病性鉴定和分
子检测结果ꎬ该基因来源于柔软滨麦草ꎮ
    利用 SSR 分子标记结合 BSA 法ꎬ筛选到与
YrElm 连锁的 5 个 SSR 标记ꎬ分别是 Xcfd35、Xg ̄
wm161、Xwmc630、Xgwm533 和 Xcfd34ꎬ根据 SSR
标记的锚定性将 YrElm 定位到小麦染色体 3DS
上ꎮ 目前ꎬ已经定位并暂命名的来源于柔软滨麦草
的抗条锈病基因有 YrElm2、YrElm4、YrElm1 ̄4、Yr ̄
Lm2和 YrM97ꎬ分别定位于小麦 4BL、5AS、2AS、
4AL和 1DS上ꎬ载体品种分别是 M853 ̄2、M853 ̄4、
M8657 ̄1、M853 ̄2 和 M97[10~14 ]ꎮ 用与 YrElm 连锁
的 SSR 标记 Xcfd35 和 Xgwm161 对这些载体品种
进行分子检测ꎬ均不能扩增出与 M852 ̄1一致的多
态性条带ꎮ 从染色体位点以及与分子标记检测方
面分析ꎬYrElm与上述基因可能不同ꎬ但还需要进
一步的等位性测验来确定ꎮ 此外ꎬ国际上已经正式
命名的位于小麦 3D 上的抗条锈病基因只有
Yr45[2 7]ꎮ 从系谱看ꎬYr45 来源于 Afghanistan 的普
通小麦品种 PI 181434ꎬ而 YrElm 来源于小麦野生
近缘种属柔软滨麦草ꎻ从染色体位点来看ꎬYr45 位
于小麦 3D 染色体长臂上ꎬ而 YrElm 位于小麦 3D
染色体短臂上ꎻ用与 Yr45 连锁的 2 个 SSR 标记
Xbarc6和 Xwmc656 对 M852 ̄1 进行检测ꎬ未扩增
出 Yr45的特异性条带ꎮ 因此从小麦的遗传背景、
染色体位点及分子检测结果来分析ꎬYrElm 是小麦
染色体 3DS上不同于 Yr45的新抗条锈基因ꎮ
    利用目标基因两侧的分子标记能显著地提高
检测的有效性ꎬ当使用的标记与目的基因的距离小
于 20 cM 时ꎬ能使检测的有效性≥ 70%[28]ꎮ 用
YrElm两侧最近的 SSR 标记 Xcfd35 和 Xgwm161
对甘肃和黄淮麦区的 68 个主栽及后备小麦品种
(系)进行检测ꎬ仅有 10 个能扩增出 YrElm 基因的
特异性片段ꎬ分别是兰天 10号、中梁 30、长武 415、
陕 876、郑麦 9023、豫麦 13、周麦 18、泰农 8681、衡
4422和冀麦 112ꎮ 用 CYR33在温室苗期和田间成
株期对这些品种进行抗条锈性鉴定ꎬ结果显示ꎬ长
武 415、豫麦 13 和冀麦 112 这 3 个品种表现为抗
病ꎬ其余 7个表现为感病ꎮ 此外ꎬ从系谱上分析ꎬ兰
天 10 号是由甘肃兰州农业学校用 76 ̄89 ̄13 为母
本、西峰 16为父本选育的品种ꎬ其系谱和 M852 ̄1
(柔软滨麦草 / 7182)完全不同ꎬ没有柔软滨麦草血
746
 
植物病理学报 44卷
Table 4  Molecular detection of 69 wheat cultivars( lines) from Gansu and Huanghuai
region with YrElm closest flanking markersꎬ Xcfd35 and Xgwm161
Number Cultivar
Breading
area
Xcfd
35
Xgwm
161
Number Cultivar
Breading
area
Xcfd
35
Xgwm
161
1 Zhongliang 96289 Gansu - - 35 Changhe 25 Henan - +
2 Tianxuan 45 Gansu - - 36 Bainong 207 Henan - -
3 Lantian 17 Gansu - - 37 Junmai 35 Henan - -
4 Lantian 18 Gansu - - 38 Xinmai 19 Henan - -
5 Tian 94 ̄3 Gansu - - 39 Xinmai 26 Henan - -
6 Xifeng 20 Gansu - - 40 Yumai 18 Henan - -
7 Tianxuan 46 Gansu - - 41 Zhengmai 9023 Henan + +
8 Lantian 10 Gansu + + 42 Xinmai 23 Henan - -
9 Zhongliang 30 Gansu + + 43 Yumai 13 Henan + +
10 Tianxuan 43 Gansu - + 44 Zhoumai 12 Henan - -
11 Xiaoyan 325 Shanxi - - 45 Yanzhan4110 Henan - -
12 Xinong 65 Shanxi - - 46 Zhoumai 18 Henan + +
13 Xiaoyan 22 Shanxi + - 47 Yannong 15 Shandong - -
14 Shan 481 Shanxi - - 48 Tainong 8681 Shandong + +
15 Xinong 129 Shanxi - - 49 Shannong 055843 Shandong - -
16 Shannong 28 Shanxi - - 50 Jimai 6097 Shandong - -
17 Xinong 979 Shanxi + - 51 Henong 130 ̄12 Hebei + -
18 Changwu 415 Shanxi + + 52 Heng 5364 Hebei - -
19 Xinong 291 Shanxi + - 53 Jimai 38 Hebei - -
20 Yuanfeng 175 Shanxi - - 54 Jimai 37 Hebei - -
21 Xinong 339 Shanxi - - 55 Han 894 Hebei + -
22 Xinong 291 Shanxi - - 56 Heng 4422 Hebei + +
23 Shan 876 Shanxi + + 57 Shi H083 ̄366 Hebei - -
24 Xiaoyan 282 Shanxi - - 58 Jimai 112 Hebei + +
25 Changwu 131 Shanxi + - 59 Wanke 06209 Anhui - -
26 Shan 448 Shanxi - - 60 Wanmai 19 Anhui + -
27 Xinong 20 Shanxi + - 61 Yangmai 5 Jiangsu - -
28 Xiaoyan 216 Shanxi - - 62 Mingtian 07112 Jiangsu - +
29 Qinnong 26 Shanxi - - 63 Mianyang 2000 ̄34 Sichuan - -
30 Jinmai 54 Shanxi - - 64 Mianyang 28 Sichuan - +
31 Jinnong 170 Shanxi - - 65 Zhongmai 175 Beijing - -
32 Fanmai 8 Henan + - 66 Jingdong 8 Beijing + -
33 Zhongyuan 6 Henan - - 67 Nongda 212 Beijing - -
34 Zhengmai 7698 Henan - - 68 Jinghua 9 Beijing - +
Note:+ : Amplification fragment present ꎻ -: Amplification fragment absent. 
846
 
  6期 张 玉ꎬ等:源于柔软滨麦草抗小麦条锈病基因 YrElm的遗传分析与 SSR标记
缘ꎮ 郑麦 9023(小偃 6号 /西农 65 / / 83 (2) 3 ̄3 / 84
(14) 43 / 3 / /陕 213)、中梁 30(holdfast /中梁 22)、
周麦 18(内乡 185 /周麦 9号)、豫麦 13(百农 3217 /
9612 ̄2)和衡 4422(衡 7228 /曲农 96 ̄1)等小麦品种
的系谱中也均不含有柔软滨麦草的血缘ꎮ 综合以
上分析ꎬ初步推断这 10 个小麦品种中均不含有抗
病基因 YrElmꎬ更确切的结论还需通过进一步的等
位性杂交来加以确认ꎮ 从检测结果看ꎬ抗条锈基因
YrElm在甘肃和黄淮麦区小麦品种(系)中还没有
应用ꎬ其在小麦抗条锈病育种中具有一定的应用前
景ꎮ
    本研究表明 M852 ̄1携带来自柔软滨麦草的 1
个隐性抗条锈病基因 YrElmꎬ位于小麦染色体 3DS
上ꎬ所获得的 5 个 SSR 标记将为其分子标记辅助
育种和精细定位奠定基础ꎮ
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责任编辑:张宗英  曾晓葳
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