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Arabidopsis VDAC3 participates in innate immunity

电压依赖性阴离子通道VDAC3参与拟南芥先天免疫



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  45(4): 395 ̄400(2015)
收稿日期: 2014 ̄09 ̄25ꎻ 修回日期: 2015 ̄03 ̄12
基金项目: 中国科学院院知识创新工程重要方向项目(KSCX2 ̄EW ̄N ̄06)
通讯作者: 邱金龙ꎬ研究员ꎬ主要从事植物免疫的分子机理以及生物技术通用方法研究ꎻTel:010 ̄64807398ꎬE ̄mail:qiujl@ im.ac.cnꎮ
第一作者: 王程程ꎬ女ꎬ硕士研究生ꎬ主要从事植物与病原微生物互作方面的研究ꎻE ̄mail:wangchengcheng9876@163.comꎮ
doi:10.13926 / j.cnki.apps.2015.04.008
电压依赖性阴离子通道 VDAC3参与拟南芥先天免疫
王程程1ꎬ 杜秋丽2ꎬ 伍 粲1ꎬ 郭 葳1ꎬ 邱金龙1∗
( 1中国科学院微生物研究所ꎬ北京 100101ꎻ 2 济宁学院生命科学与工程系ꎬ曲阜 273155)
摘要:线粒体外膜蛋白电压依赖性阴离子通道(VDAC)是动物细胞凋亡调控系统中的关键组分ꎬ但其在植物中的功能还不明
确ꎮ 拟南芥 VDAC家族有 4个成员ꎬ它们都能被病原菌诱导ꎬVDAC1在由病原菌所引起的超敏性细胞死亡中发挥作用已有
报道ꎬ但 VDAC家族其他成员是否参与植物免疫反应还未见报道ꎮ 本研究以拟南芥相关 T ̄DNA插入突变体为材料ꎬ研究了
VDAC3基因在植物抗病反应中的功能ꎮ 病原相关分子模式 flg22诱导的活性氧产生和胼胝质沉积在 VDAC3突变体中都显著
增强ꎬ表明VDAC3参与了病原相关分子模式触发的免疫反应ꎮ 此外ꎬ效应因子激发的超敏性细胞死亡在 vdac3突变体中也更
明显ꎬ显示 VDAC3也参与了效应子触发的免疫反应ꎮ 以上结果说明ꎬVDAC3在多个层面参与植物的抗病反应ꎮ
关键词:拟南芥ꎻ 电压依赖性阴离子通道ꎻ VDAC3ꎻ 先天免疫
Arabidopsis VDAC3 participates in innate immunity   WANG Cheng ̄cheng1ꎬ Du Qiu ̄li2ꎬ
WU Can1ꎬ GUO Wei1ꎬ QIU Jin ̄long1∗   ( 1 Institute of Microbiologyꎬ Chinese Academy of Sciencesꎬ Beijing 100101ꎬ
Chinaꎻ 2 Department of Life Science and Engineeringꎬ Jining Universityꎬ Qufu 273155ꎬChina)
Abstract: Mitochondrial outer membrane protein voltage ̄dependent anion channels (VDACs) play crucial roles
in mammalian apoptosis. Howeverꎬ the functions of VDACs in plants still need to be established. In Arabidopsis
thaliana genome there are four VDAC genes and all the four VDAC genes are up ̄regulated by pathogen
treatments. Previous studies revealed that Arabidopsis VDAC1 and VDAC4 are probably involved in hypersensi ̄
tive cell death. Nonethelessꎬ whether other VDAC members also involved in Arabidopsis immunity is still un ̄
clear. In this studyꎬ roles of VDAC3 in immunity were explored with T ̄DNA insertion mutants. The PAMP
flg22 ̄induced ROS bursts and callose deposition were both increased in vdac3 mutants. Interestinglyꎬ effector ̄
triggered hypersensitive cell death is also enhanced in vdac3 mutants. These results indicated that Arabidopsis
VDAC3 negatively regulates both PAMP ̄triggered immunity (PTI) and effector ̄triggered immunity (ETI) .
Key words: Arabidopsis thalianaꎻ voltage ̄dependent anion channelꎻ VADC3ꎻ innate immunity
中图分类号: S432.44          文献标识码: A          文章编号: 0412 ̄0914(2015)04 ̄0395 ̄06
    植物在与病原微生物长期的共同进化过程中ꎬ
形成了一套比较完善的免疫体系[1]ꎮ 这一体系大
致可以分为两个层面ꎮ 第一个层面是病原相关分
子模式触发的免疫 (pathogen ̄associated molecular
pattern ̄triggered immunityꎬPTI)ꎮ PTI 是基于植物
细胞表面比较保守的模式识别受体(pattern recog ̄
nition receptorsꎬPRRs)ꎬ它们可以识别病原微生物
表面保守的特定分子特征ꎬ即病原相关分子模式
(pathogen ̄associated molecular patternsꎬ PAMPs)ꎬ
进而将信号传入胞内启动下游的一系列抗病反应ꎮ
PTI可以阻止环境中绝大部分病原菌对植物细胞
的入侵ꎬ其标志性反应是活性氧的爆发和胼胝质沉
积等ꎮ 而为了自身的繁殖与生长ꎬ病原微生物进化
出效应蛋白(effector)ꎬ这些效应蛋白可以被分泌
 
植物病理学报 45卷
到植物细胞内抑制植物的 PTI 反应ꎮ 而植物也相
应的进化出可以直接或间接识别这些效应蛋白的
抗性蛋白( resistance protein)即 R 蛋白ꎬ进而触发
植物第二个层面的免疫反应ꎬ称之为效应子触发的
免疫( effector triggered immunityꎬETI)ꎬ其标志性
反应是病原菌侵染部位植物细胞的程序性死亡ꎬ即
超敏性反应 (hypersensitive responseꎬHR) [1 ̄3]ꎮ
    电压依赖型阴离子通道蛋白(voltage ̄depend ̄
ent anion channelꎬVDAC)于 1975 年首次被发现ꎮ
哺乳动物的 VDAC 主要定位于线粒体外膜上ꎬ它
不仅调控线粒体内外物质的进出ꎬ在能量代谢、细
胞凋亡、物质运输和维持胞内钙稳态等多个过程中
均起着重要作用[4 ̄6]ꎮ 而且ꎬVDAC 还在线粒体诱
导的细胞凋亡中也起到了重要的作用[5]ꎬ研究发
现ꎬVDAC一方面与 Bcl ̄2家族蛋白相互作用调控
细胞死亡ꎬ另一方面参与形成线粒体通透性转运孔
PTP(permeability transition pore)来调控线粒体内
外物质的进出ꎬ进而介导细胞凋亡[7ꎬ8]ꎮ
    现在已经从动物、植物、原生生物和真菌中均
分离到 VDAC 基因ꎬ它具有在真核生物中均高度
保守的一些性质ꎬ例如单通道传导性、选择性、电压
依赖性等ꎮ 与动物中的研究相比ꎬ植物 VDAC 的
研究相对滞后ꎬ之前的研究主要集中于 VDAC 在
生长发育中的作用ꎬ而已有的证据暗示ꎬVDAC 可
能也参与了植物抗病反应[7]ꎮ 已有文献报道ꎬ当
病原菌菊苣假单胞菌侵染烟草时ꎬNbVDAC 表达
量发生上调ꎻNbVDAC 沉默时ꎬ抗病防卫反应被抑
制[9]ꎮ 与此相似ꎬ拟南芥 VDAC 表达水平受到假
单胞杆菌(Pseudomonas syringae DC3000)侵染时
也大幅度提高ꎬ并伴随有 PR1蛋白的积累[10]ꎮ
    拟南芥 VDAC 家族有 4 个成员: VDAC1
( At3g01280 )、 VDAC2 ( At5g67500 )、 VDAC3
(At5g15090) 和 VDAC4 (At5g57490) [11]ꎮ 其中
VDAC1在由病原菌所引起的超敏性细胞死亡过程
(HR)中发挥作用已有报道ꎬ而且 vdac2 和 vdac4
突变体中一些病程相关(pathogenesis ̄relatedꎬPR)
基因也组成型表达ꎬ所以推测它们也可能参与了植
物抗病反应[12]ꎮ 此外ꎬVDAC2 参与水杨酸(SA)
的信号应答[13]ꎮ 有趣的是 vdac1、 vdac2、vdac4 突
变体和野生型相比都有生长迟缓ꎬ种子少且不饱满
等生长发育表型ꎬ然而 vdac3突变体却没有明显的
表型[12]ꎬ这表明 VDAC3 在植物中的主要作用可
能并不是参与了其生长发育方面的调控ꎮ 为了研
究基因 VDAC3是否参与了植物抗病反应ꎬ本研究
从拟南芥 VDAC3的 T ̄DNA插入突变体vdac3 ̄1和
vdac3 ̄2入手ꎬ研究了 VDAC3 在植物免疫中的功
能ꎮ 最终结果表明 VDAC3 在多个层面参与了植
物的抗病反应ꎮ
1  材料与方法
1.1  实验材料
1.1.1  植物材料  本研究所用的拟南芥生态型均
为 Col ̄0ꎮ
1.1. 2   试剂盒、工具酶及生化试剂   Taq DNA
polymerase等 PCR相关试剂、Trizol 均购自天根生
化科技(北京)有限公司ꎻ反转录试剂盒购自宝生
物工程(大连)有限公司ꎻLuminol 和 Peroxidase 购
自 Sigma ̄Aldrich 公司ꎻ flg22 (QRLSTGSRINSAK ̄
DDAAGLQIA)由 GenScript 公司合成ꎻ其他试剂均
为国产试剂分析纯ꎮ 引物合成以及测序工作均由
上海英骏生物技术有限公司完成ꎮ
1.2  实验方法
1.2.1  拟南芥生长条件  拟南芥种植在营养土和
蛭石以及珍珠岩(10 ∶ 4 ∶ 1)混合的土壤上ꎬ置于
21℃ꎬ75% 湿度ꎬ短日照(光照 8 hꎬ黑暗 16 h)的温
室中生长ꎮ 4~6周大的植物用于实验ꎮ
1.2.2  突变体基因型鉴定  用 CTAB 法提取突变
体叶片的基因组 DNAꎬ根据数据库提供的基因组
序列ꎬ在 VDAC3 基因上设计上下游引物 LP 和
RPꎬ在 T ̄DNA插入序列上设计引物 LBP(表 1)ꎬ
分别用 LP +RP 以及 LBP +RP 为引物对基因组
DNA进行 PCR扩增ꎬPCR反应条件:94℃预变性 3
minꎬ94℃ 30 sꎬ65℃ 35 sꎬ72℃ 1 min ( 35 个循
环)ꎬ72℃ 8 minꎮ PCR产物用 1%琼脂糖凝胶电泳
分析ꎬ如果 LP+RP 没有目的条带的扩增ꎬ而 LBP+
RP可以扩到大小正确的目的条带则说明突变体为
纯合突变体植株ꎮ
1.2.3  RT ̄PCR 分析  按照产品说明书提供的步
骤利用 Trizol 提取拟南芥叶片总 RNAꎮ 取 2 μg
总 RNA以 oligodT 为引物进行反转录ꎬ反应体系
及反应程序按照 Reverse Transcriptase M ̄MLV
(RNase H ̄)产品说明书进行ꎮ 反转所得的 cDNA
进行稀释后用 VDAC3 基因特异引物和拟南芥的
693
 
  4期 王程程ꎬ等:电压依赖性阴离子通道 VDAC3参与拟南芥先天免疫
内参 Actin7引物(表 1)进行 PCR 扩增ꎬPCR 反应
条件是:94℃预变性 3 minꎬ94℃ 30 sꎬ58℃ 30 sꎬ
72℃ 45 s (30个循环)ꎬ72℃ 8 minꎮ
1.2.4  ROS的测定   用打孔器取直径为 4 mm 的
拟南芥叶圆片放入 96孔板中ꎬ每个孔加入去离子水
200 μLꎬ室温下避光静止过夜ꎮ 轻轻吸去去离子水ꎬ
加入 200 μL 的 ROS 测定溶液ꎬ然后用酶标仪按 2
min一个单位ꎬ测量 30 min 记录相关吸光值ꎮ ROS
测定溶液:Luminol(1 μmol􀅰L ̄1)4 μL、Peroxidase
(1 μmol􀅰L ̄1) 2 μL最后加去离子水至 200 μL ꎮ
1.2.5  胼胝质沉积  用 1 μmol􀅰L ̄1 flg22 注射处理
5周的拟南芥叶片ꎮ 16 h 后将处理叶片用 95%酒精
浸泡 2 hꎬ然后用 70%的酒精浸泡至完全脱色ꎬ用蒸馏
水清洗并浸泡过夜ꎮ 再将脱色叶片置于含有 1%苯胺
蓝的 150 mmol􀅰L ̄1 K2HPO4溶液中避光处理 30 min~
1 hꎬ最后将处理好的叶片放在有60%的甘油醇的载玻
片上ꎬ在荧光显微镜下用紫外线照射观察ꎬ并用 Image
J (http: / / imagej.nih.gov / ij / )对图像进行统计处理ꎮ
1.2.6  超敏反应(HR)   将培养过夜携带有无毒
基因的丁香假单胞菌 DC3000 (avrRpt2)、DC3000
(avrRps4)、DC3000 ( avrRpm1)用 10 mmol􀅰 L ̄1
MgCl2悬浮并分别调至 OD600 为 0. 005、 0. 01、
0.05ꎬ然后注射在短日照条件下生长 4 周的拟南芥
叶片ꎬ48 h后观察叶片超敏死亡反应ꎮ
1.2.7  Trypan Blue 染色  用丁香假单胞菌无毒菌
株(OD600=0.2)注射短日照条件下生长 4 周的拟
南芥叶片ꎬ48 h 后取注射过的叶片放入 15 mL 管
中ꎬ加入 Trypan Blue至完全浸泡ꎬ然后煮沸 5 minꎬ
常温下放置过夜ꎬ用水合氯醛溶液处理至脱色完
全ꎬ最后保存于 50%的甘油中ꎬ显微镜观察ꎮ
2  结果与分析
2.1  VDAC3基因 T ̄DNA插入突变体的获得及鉴定
    为了研究拟南芥 VDAC3(AT5G15090)基因是否
参与抗病反应ꎬ我们从美国的拟南芥生物资源库
(The Arabidopsis Biological Resource CenterꎬOhio)订
购了 VDAC3的 T ̄DNA插入突变体 vdac3 ̄1(SALK_
127899C)和 vdac3 ̄2(CS872374)ꎬ它们的 T ̄DNA插入
方式分别是在 VDAC3基因的 5′UTR(vdac3 ̄1)和第 3
个外显子上(vdac3 ̄2)(图 1 ̄A)ꎮ 我们通过 PCR对购
买来的突变体进行基因型鉴定ꎬ以基因特异的引物
(LP和 RP)以及 LBP 配对对突变体基因组 DNA进
行扩增(图 1 ̄B)ꎮ 结果显示ꎬ在野生型中LP+RP有目
的条带的扩增ꎬ大小约 1 100 bpꎬLBP+RP未有目的条
带扩增ꎬ而在突变体中正相反ꎬLP+RP未有目的条带
扩增ꎬLBP +RP 扩增到了大小正确的目的片段ꎬ
vdac3 ̄1扩到约 500 bp 大小的带ꎬ而 vdac3 ̄2扩到约
700 bp大小的条带ꎬ这表明 vdac3 ̄1和 vdac3 ̄2均为
T ̄DNA插入的纯合突变体ꎮ 我们进一步检测了这些
突变体中 VDAC3基因的表达水平ꎮ 用位于 T ̄DNA
插入位点下游的 VDAC3 基因一对特异性引物
VDAC3 ̄F和 VDAC3 ̄R进行 RT ̄PCRꎮ RT ̄PCR结果
显示ꎬ以 ACTIN7基因为表达丰度参照ꎬ在 vdac3 ̄1和
vdac3 ̄2中 VDAC3转录水平较野生型均显著下调(图
1 ̄C)ꎬ该结果表明 vdac3 ̄1 和 vdac3 ̄2 为基因抑制
(knockdown)或为截断(truncation)突变体ꎮ
2.2   病原相关分子模式 flg22 诱导的反应在
vdac3突变体中显著增强
    多肽 flg22 是鞭毛蛋白氮端一段保守的 22个
Table 1  Primers for PCR
Primer name Sequence(5′ ̄3′)
vdac3 ̄1 ̄LP TGAATTTCTGGTCTCCTTGGTAATCCCTG
vdac3 ̄1 ̄RP AGAGTACACGGCCTGCTTTGCTTG
vdac3 ̄1 ̄LBP CCAAACTGGAACAACACTCAACCCTATC
vdac3 ̄2 ̄LP ATTTCTATCGGTCACGCTTAGGTCGTTG
vdac3 ̄2 ̄RP GAGGGAAGCAGTCAAATCATCCTTGGTG
vdac3 ̄2 ̄LBP GTCCGCAATGTGTTATTAAGTTGTCTAAG
VDAC3 ̄F AACAACTTCACTGCTGATGTCAAAG
VDAC3 ̄R CAACCTTGGCACTCTTATCGATC
Actin ̄F GGTGAGGATATTCAGCCACTTGTCTG
Actin ̄R TGTGAGATCCCGACCCGCAAGATC
793
 
植物病理学报 45卷
氨基酸ꎬ是被广泛证明的分子模式(PAMP)ꎮ 为了
检测 VDAC3是否参与了植物抗病的 PTI 过程ꎬ我
们用 flg22去处理拟南芥野生型和 vdac3突变体植
物叶片ꎮ 我们首先检测了 flg22 激发的活性氧
(ROS)的产生ꎬ与野生型相比较ꎬ在 vdac3 ̄1 和
vdac3 ̄2突变体中 flg22 诱导的活性氧的爆发都明
显增强(图 2 ̄A)ꎬ以 vdac3 ̄1突变体更为明显ꎮ 活
性氧爆发是植物细胞一个早期的应对PAMP的反
Fig. 1  Characterization of Arabidopsis VDAC3 T ̄DNA insertion lines
A: Schematic structure of Arabidopsis VDAC3 gene and the T ̄DNA insertion sites. Filled boxesꎬ exonsꎻ open regionsꎬ
untranslated regionsꎻ black linesꎬ introns. B. Genotyping of the VDAC3 mutants. Genomic DNAs were amplified with
PCR analysis using the specific LP+RP and LBP+RP primer pairs. C. Expression of VDAC3 gene determined
by semi ̄quantitative RT ̄PCR in VDAC3 mutant leaves. The level of ACTIN7 transcripts was used as a loading control.
Fig. 2  PAMP ̄triggered immunity is enhanced in Arabidopsis vdac3 mutants
A. ROS bursts elicited by flg22 in Arabidopsis leaf discs are shown in relative light units (RLU) . B. Representative
photographs of flg22 ̄induced callose deposition in Arabidopsis leaves as revealed by aniline blue staining.
C. Amounts of callose deposited per mm2 . Bar= 1 mm. Values are mean ± SD. ∗∗P<0.01 ( t ̄test) .
893
 
  4期 王程程ꎬ等:电压依赖性阴离子通道 VDAC3参与拟南芥先天免疫
Fig. 3  Effector ̄triggered immunity is enhanced in Arabidopsis vdac3 mutants.
A. Hypersensitive responses induced by avirulent Pst DC3000 strains in Arabidopsis leaves. Representative images of disease
symptoms were photographed at 48 h after local infection with avirulent Pst DC3000(avrRpt2ꎬavrRps4ꎬavrRpm1)
Bar= 1 cm. B. Trypan blue staining of the same leaves in A for cell death. Bar= 0.3 mm.
应ꎬ而胼胝质沉积( callose deposition)则是一个相
对晚期的 PTI 反应ꎮ 为了进一步验证 VDAC3 参
与了拟南芥抗病反应的 PTI过程ꎬ我们检测了胼胝
质沉积ꎮ 用 flg22 处理植物后ꎬ大约 16 h 后取叶
片ꎬ用苯胺蓝染色ꎬ荧光显微镜下紫外照射观察其
胼胝质沉积的情况ꎬ与野生型相比ꎬ在 vdac3 ̄1 和
vdac3 ̄2中 flg22 诱导的胼胝质沉积都显著增多
(图 2 ̄B)ꎬ与活性氧爆发相同ꎬ以 vdac3 ̄1 突变体
最为明显(图 2 ̄C)ꎮ 以上结果说明ꎬVDAC3 参与
了拟南芥的 PTI过程ꎮ
2.3  拟南芥 vdac3 突变体中无毒菌株所引起的
超敏反应加剧
    我们进一步研究了 VADC3 是否也参与了植
物的 ETI反应ꎮ 用携带有无毒基因的丁香假单胞
菌 Pst DC3000 ( avrRpt2 )、 DC3000 ( avrRps4 )、
DC3000(avrRpm1)注射在短日照条件下生长 4 周
的拟南芥野生型以及 vdac3 ̄1、vdac3 ̄2 突变体叶
片ꎬ48 h 后观察注射部位的超敏性细胞死亡ꎮ 结
果显示ꎬ与野生型相比ꎬ在 vdac3 ̄1和 vdac3 ̄2突变
体中三种非致病菌诱导的超敏性细胞死亡都加速
了(图 3 ̄A)ꎮ 台盼蓝用于对死细胞染色ꎮ 通过对
接菌 Pst DC3000 (avrRpm1)后的叶片进行台盼蓝
染色ꎬ进一步验证了 vdac3 ̄1 和 vdac3 ̄2 突变体中
细胞死亡的程度较野生型更加严重(图 3 ̄B)ꎮ 由
此可见ꎬVDAC3也参与了植物的 ETI过程ꎮ
3  讨论
    植物与病原菌长期进化过程中形成了 PTI 和
ETI两个层面的较为完善的免疫防卫体系ꎮ 越来越
多的证据表明阴离子通道在其中起着十分重要的作
用ꎮ 阴离子外流(anion efflux)是植物抗病早期反应
之一[14~16]ꎬ与一系列抗病早期反应如质膜去极化、钙
离子内流、活性氧爆发等相关ꎮ 另外发现使用阴离子
通道抑制剂可明显降低烟草悬浮细胞液泡加工蛋白
的转录水平ꎬ并显著抑制细胞超敏死亡[17]ꎮ 笔者在之
前的工作中也发现拟南芥的先天免疫中 R型(rapid
actived type)和 S型(slow actived type)的阴离子通道
起着相反的作用ꎬ抑制 R型阴离子通道可以增强 PTI
和 ETI反应ꎬ而抑制 S型阴离子通道则抑制这两个反
应[18]ꎮ 此外ꎬ研究证明拟南芥中氯离子通道 CLCd负
调控其 PTI反应ꎬ为阴离子通道参与植物免疫提供了
直接证据[19]ꎮ 研究发现除了氯离子通道 CLC外ꎬ电压
993
 
植物病理学报 45卷
依赖性阴离子通道(VDAC)也是非常重要的阴离
子通道家族ꎮ 在动物中 VDAC参与线粒体诱导的
细胞死亡ꎬ而最近发现植物 VDAC 不仅参与了植
物生长发育过程ꎬ也参与了植物抗病免疫方面的调
控[12]ꎮ 本研究以拟南芥 VDAC3 的两个 T ̄DNA
插入突变体为材料ꎬ发现 PTI和 ETI反应在 vdac3 ̄
1、vdac3 ̄2 突变体中均显著增强ꎬ表明拟南芥
VDAC3负调控植物免疫ꎮ 这为 VDAC3 阴离子通
道参与植物抗病免疫提供了证据ꎮ
    本研究初步表明 VDAC3在 PTI 和 ETI 两个层
面上参与了拟南芥先天免疫ꎬ但其具体的作用机理
仍需进一步的探索和研究ꎮ 已有研究发现 VDAC3
可以与拟南芥类驱动蛋白 KP1 互作共同调控低温
下种子萌发过程中的呼吸作用[20]ꎬ而且 VDAC3 与
ABA受体蛋白 RCAR1、RCAR3也均相互作用ꎬ推测
其可能参与了 ABA 信号途径[21]ꎬ这些都为研究
VDAC3调控植物抗病反应的机制提供了线索ꎮ
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责任编辑:曾晓葳
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