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Identification and TEF-1α sequence analysis of Fusarium wilt pathogens from Dajiao

大蕉枯萎病病原菌鉴定及TEF-1α序列分析



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  44(4): 337 ̄348(2014)
收稿日期: 2013 ̄04 ̄14ꎻ 修回日期: 2014 ̄03 ̄06
基金项目: “948”计划项目(2011 ̄G16)ꎻ广东省科技计划项目(2011B020410004)ꎻ广东省科技计划项目(2012B020410005)ꎻ2009年广东省
良种培育和引进专项ꎻ东莞市高等院校、科研机构科技计划项目(2011108101014)
通讯作者: 刘文清ꎬ高级农艺师ꎬ主要从事香蕉蔬菜病害防控研究ꎻTel:0769 ̄22276315ꎬE ̄mail:lwq010101@sina.com
第一作者: 吕顺ꎬ男ꎬ广西博白人ꎬ高级农艺师ꎬ硕士ꎬ主要从事香蕉蔬菜病害防控研究ꎻE ̄mail:shunlv@qq.comꎮ
doi:10.13926 / j.cnki.apps.2014.04.001
大蕉枯萎病病原菌鉴定及TEF ̄1α序列分析
吕 顺1ꎬ 曾莉莎1ꎬ 刘文清1∗ꎬ 王 芳1ꎬ 赵志慧2ꎬ 周建坤1ꎬ 李洪波1ꎬ
杜彩娴1ꎬ 陈 石1ꎬ 韩秀香1ꎬ 向欣叶1
( 1广东省东莞市香蕉蔬菜研究所ꎬ东莞 523061ꎻ 2大连民族学院环境与资源学院ꎬ大连 116600)
摘要:近年来ꎬ大蕉枯萎病在广东省东莞市发生严重ꎬ为了有效控制病害发生蔓延ꎬ生产上急需明确大蕉枯萎病的病原ꎮ 本
研究收集了我国华南地区的 12株大蕉枯萎病病原菌及 19株包括 1号及 4号生理小种的单孢菌株ꎬ以来源于澳大利亚的 1
号、2号、3 号和亚热带 4 号生理小种以及 4 株非病原尖孢镰孢菌作对照ꎬ通过病原菌形态鉴定、致病性测定、4 号小种
(Foc 4)及热带 4号小种(TR4)的分子特异检测、以及基于翻译延伸因子(TEF ̄1α)序列的系统发育分析ꎬ对大蕉枯萎病病
原菌进行鉴定ꎮ 同时ꎬ对我国华南地区不同来源的香蕉枯萎病病原菌的遗传发育关系及致病性分化情况进行了研究ꎮ 结
果表明:(1)引起大蕉枯萎病的病原菌主要是 1 号生理小种或者是与 1 号生理小种亲缘关系较近的一个新的系统发育谱
系ꎬ该谱系可能为 1 号生理小种变异演化而来ꎻ(2)大蕉枯萎病病原菌对大蕉和粉蕉都有较强的致病力ꎬ但不能侵染香蕉ꎻ
我国的 1号小种存在一定的分化ꎬ其中有一个类群只能感染粉蕉ꎬ另一个类群既能感染粉蕉也能感染大蕉ꎻ(3)大蕉与粉蕉
枯萎病的病原菌在致病性及遗传发育关系上都存在一定的交叉和分化ꎮ
关键词:大蕉枯萎病ꎻ 尖孢镰孢菌古巴专化型ꎻ 生理小种ꎻ 鉴定ꎻ 翻译延伸因子基因
Identification and TEF ̄1α sequence analysis of Fusarium wilt pathogens from Dajiao
LV Shun1ꎬ ZENG Li ̄Sha1ꎬ LIU Wen ̄Qing1ꎬ WANG Fang1ꎬ ZHAO Zhi ̄Hui2ꎬ ZHOU Jian ̄Kun1ꎬ LI Hong ̄
bo1ꎬ Du Cai ̄xian1ꎬ Chen Shi1ꎬ Han Xiu ̄xiang1ꎬ Xiang Xin ̄ye1   ( 1Dongguan Banana and Vegetable Research Institu ̄
teꎬ Dongguan 523061ꎬ Chinaꎻ 2Dalian Nationalities Universityꎬ College of Environment and Resourcesꎬ Dalian 116600ꎬ China)
Abstract: In recent yearsꎬ Fusarium wilt of Dajiao has been becoming one of the most damaging diseases in
Dongguanꎬ Guangdong Province. In order to control the spread of this disease effectivelyꎬ it is necessary to in ̄
vestigate the causal agent of Fusarium wilt of Dajiao. Howeverꎬ few of studies have focused on this new disease
so far. In this studyꎬ a total of 31 Foc (Fusarium oxysporum f. sp. cubense)isolates from diseased tissues of ba ̄
nana plants were analyzedꎬ including 12 Foc isolates from diseased Dajiao and 4 standard isolates from Australia
which represent race 1ꎬ race 2ꎬ race 3 and subtropical race 4ꎬ respectively. What’s moreꎬ four non ̄pathogenic
F. oxysporum isolates were also involved in the study for comparison. Pathogen of Dajiao was identified through
pathogenicity testsꎬ morphological studiesꎬ molecular specific detection for race 4 and tropical race 4ꎬ and phylo ̄
genetic analysis based on TEF ̄1α sequences. In additionꎬ genetic relationship and pathogenic differentiation a ̄
mong the Foc strains were also investigated. The results showed that: ( i) The wilt pathogen of Dajiao is Foc
race 1 or a new lineage within Foc which is genetically close to race 1ꎬ and might be evolved from Foc race 1.
( ii) The pathogen can seriously infect both Dajiao and Fenjiaoꎬ but can not infect Cavendish. Genetic differenti ̄
ation was present among Chinese Foc race 1 isolatesꎬ and there were two subgroups in Chinese Foc race 1 iso ̄
lates (one could only infect Fenjiao (Musa ABB Fenjiao)ꎬ the other could infect both Dajiao and Fenjiao) .
 
植物病理学报 44卷
(iii) The evolutionary relationship of Foc is complex. Both the pathogenicity tests and molecular phylogeny re ̄
sults showed that there may be some overlap and differentiation within the pathogens of Dajiao and Fenjiao.
Key words: Fusarium wilt of Dajiaoꎻ Fusarium oxysporum f. sp. cubenseꎻ physiological raceꎻ identifica ̄
tionꎻ TEF ̄1α
中图分类号: S436.67          文献标识码: A          文章编号: 0412 ̄0914(2014)04 ̄0337 ̄12
    香蕉镰孢菌枯萎病(巴拿马病)是一种侵染香
蕉植株维管束的毁灭性病害ꎬ由尖孢镰孢菌古巴专
化型(Fusarium oxysporum f. sp. cubenseꎬ Foc)引
起[1]ꎬ世界上已报道 Foc 有 4 个生理小种ꎬ其中
1 号小种世界范围分布ꎬ侵染香蕉的栽培种“大蜜
啥” (Gros michelꎬAAA)、龙牙蕉 (AAB)、粉蕉
(ABB)以及 Apple (AAB)、台湾拉屯旦 (Taiwan
LatundanꎬAAB)、IC2(AAAA)等香蕉品系ꎬ但矮香
蕉(dwarf CavendishꎬAAA)较抗病ꎻ2 号小种在中
美洲分布ꎬ能感染三倍体杂种棱指蕉 (Bluggoe
ABB)ꎻ3 号小种仅感染野生的羯尾蕉属(Heliconia
spp. )ꎻ4 号小种主要分布在澳大利亚、非洲以及部
分亚洲国家ꎬ可感染“大蜜啥”、矮香蕉、台湾拉屯
旦、Pisang Lilin (AA)、棱指蕉、野蕉(BB)和香牙
蕉(Cavendishꎬ AAA)ꎬ故危险性和毁灭性最大ꎬ引
起种植香蕉国家和地区的高度重视[2~7]ꎮ 我国大
陆现有 1 号和 4 号生理小种[8~11]ꎮ
    近年来ꎬ基于 4 号小种在热带地区或亚热带地
区对香蕉栽培品种 Cavendish (AAA)的致病性ꎬ又
将其进一步分为热带 4 号小种 ( tropical race 4ꎬ
TR4)和亚热带 4号小种( subtropical race 4ꎬST4)ꎬ
前者主要感染马来西亚、印度尼西亚、菲律宾和澳
大利亚北部等国家和地区的香蕉 ( Cavendishꎬ
AAA)品种ꎬ后者主要感染南非、澳大利亚南部及
加那利群岛等地区的香蕉 (CavendishꎬAAA)品
种[6ꎬ 12ꎬ 13]ꎮ 2010年ꎬLi 等[9]利用 AFLP 指纹图谱
分析及 TR4特异检测引物证明了我国华南地区和
台湾的香蕉枯萎病 4 号小种属于热带 4 号生理小
种(TR4)ꎮ
    广东省东莞市是我国的传统香蕉产区之一ꎬ种
植香蕉占全市耕地面积 10%ꎮ 由于香蕉及粉蕉枯
萎病发病严重ꎬ近些年蕉农开始大量种植大蕉
(Musa ABB Dajiao)ꎮ 随着大蕉种植面积的扩大ꎬ
过去曾零星发生的大蕉死株现象逐渐加重ꎬ目前严
重的地块达 30%以上ꎮ 关于大蕉的死株ꎬ虽其症
状极像枯萎病(当地蕉农也称其枯萎病)ꎬ但因过
去发生少而不被注意ꎬ对其病原菌尚没有科学的鉴
定报道ꎮ 为了有效控制病害发生和蔓延ꎬ生产上急
需明确大蕉枯萎病菌种类及生理小种的类型ꎮ 本
研究以来源于澳大利亚的 1号、2号、3号和亚热带
4号生理小种以及我国大陆的 1 号、4 号小种作对
照ꎬ通过致病性测定、病原菌形态鉴定ꎬ4 号小种
(Foc 4)及热带 4 号小种(TR4)的分子特异检测、
以及基于翻译延伸因子( translation elongation fac ̄
tor 1 alphaꎬTEF ̄1α)序列的系统发育分析ꎬ对大蕉
枯萎病病原菌种类及所属的生理小种进行了鉴定ꎮ
同时ꎬ对我国华南地区不同来源的香蕉枯萎病菌的
遗传发育关系及致病性分化情况进行了研究ꎮ
1  材料与方法
1.1  标本的采集及症状观察
    2011 年 6 月 ~ 2012 年 10 月ꎬ多次在广东东
莞、番禺、珠海、广西玉林、海南儋州、福建漳州等地
采集香蕉、粉蕉、大蕉枯萎病病害标本ꎬ剖开病株假
茎观察维管束病变情况ꎬ描述症状及拍照ꎮ 其中ꎬ
大蕉枯萎病病害标本采自东莞市麻涌镇、洪梅镇、
望牛墩镇、沙田镇等传统蕉区ꎮ
1.2  试验菌株
    8个菌株为同行专家惠赠ꎬ4 个菌株来自香蕉
果实ꎬ1个菌株来自健康的香蕉植株ꎬ剩余 23 菌株
则是采用常规组织分离法[14]自病株假茎组织分离
纯化的单孢菌株ꎬ菌株来源及编号见表 1ꎮ
1.3  病原菌形态鉴定
    在 PDA培养基上观察自大蕉分离的病原菌菌
落形态、颜色及生长速度ꎬ在 SNA 培养基(Spez ̄
ieller Nährstoffarmer agar)及 CLA 培养基( carna ̄
tion leaf ̄piece agar)上观察气生菌丝上小型分生孢
子的着生状态ꎬ小型分生孢子的大小、形状ꎬ分生孢
子座上的大孢子以及厚垣孢子的形态ꎬ并对分生孢
子梗长、分生孢子长宽进行显微测量[15~17]ꎮ
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  4期 吕 顺ꎬ等:大蕉枯萎病病原菌鉴定及 TEF ̄1α序列分析
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1.
043
 
  4期 吕 顺ꎬ等:大蕉枯萎病病原菌鉴定及 TEF ̄1α序列分析
1.4  致病性测定
    选 6~8叶期的健康组培香蕉苗(巴西蕉ꎬMusa
AAA Cavendish var. Brazil)、粉蕉苗 (广粉 1 号ꎬ
Musa ABB var. Guangfen ̄1)和大蕉苗(东莞中把大
蕉ꎬMusa ABB var. Dongguan zhongba dajiao)ꎬ采用
伤根淋菌液法进行接种[18]ꎬ伤根后每株香蕉苗淋枯
萎病菌孢子悬浮液(1×l06个􀅰mL-1)15~ 20 mLꎬ以
清水做对照ꎬ将淋菌后的香蕉苗置于温度为 25℃ ~
30℃的温室中ꎬ15 d 后观察结果ꎮ 每个菌株分别接
种香蕉苗、粉蕉苗和大蕉苗各 30株ꎮ 其中部分菌株
的生理小种类型为前期试验所鉴定(表 1)ꎮ
1.5  4 号小种(Foc 4)及热带 4 号小种(TR4)的
分子特异检测
    根据致病性测定的结果ꎬ为明确大蕉枯萎病病
原菌是否 4号小种ꎬ作者采用香蕉枯萎病菌 4号小种特
异检测引物 Foc ̄1(CAGGGGATGTATGAGGAGGCT)
和 Foc ̄2(GTGACAGCGTCGTCTAGTTCC)[19]ꎬ以及热
带 4 号小种 ( TR4 ) 特异检测 引 物 FocTR ̄F
(CACGTTTAAGGTGCCATGAGAG ) 和 FocTR ̄R
(CGCACGCCAGGACTGCCTCGTGA) [20]ꎬ对分离
自大蕉的枯萎病病原菌进行 PCR 扩增ꎬ试验以非
致病性尖孢镰孢菌 AB ̄2 ̄8、TOW ̄19 ̄3及甘蔗镰孢
菌(F. sacchari) FJ ̄22 ̄2 作为阴性对照ꎬ同时以
TEF ̄1α 引物 EF1H / EF2T 的扩增结果为阳性对
照ꎮ 引物由上海英俊生物技术有限公司合成ꎬPCR
反应体系及扩增程序分别参照 Lin 等[19]及 Dita
等[20]的描述ꎮ
1.6  TEF ̄1α序列扩增
    采用翻译延伸因子(TEF ̄1α)引物 EF1H(AT ̄
GGGTAAGGAAGACAAGAC) 和 EF2T (GGAAG ̄
TACCAGTGATCATGTT)扩增病原菌基因组总
DNA[21ꎬ 22]ꎮ 引物由上海英俊生物技术有限公司合
成ꎬPCR反应体系参照 Geiser等[23]的描述ꎮ 反应程
序为:94℃预变性 2 minꎻ94℃变性 1 minꎬ55℃退火 1
minꎬ72℃延伸 1 minꎬ共 35个循环ꎻ最后 72℃延伸 5
minꎮ 扩增产物经 1%琼脂糖凝胶电泳分离ꎮ 目的片
段经 DNA 胶回收试剂盒回收纯化后克隆到
pMD18 ̄T载体(TaKaRa)中ꎬ阳性克隆由 Invitrogen
生物工程技术有限公司广州分公司测序ꎮ
1.7  基于 TEF ̄1α基因的系统发育分析
    登陆 NCBI 网站(http: / / blast.ncbi.nlm.nih.gov /
Blast.cgi)及 Fusarium ̄ID[23](http: / / isolate. fusarium ̄
db.org / index.php)进行 BLAST 搜索ꎬ找出最近似序
列ꎬ分析序列相似程度ꎬ初步确定病原菌的种类ꎮ
    用于分析香蕉枯萎病病原菌遗传多样性的供试
验菌株包括分离自华南地区不同香蕉品种的发病香
蕉组织上的 31株香蕉枯萎病病原菌ꎬ4株为香蕉果
实上分离的非病原尖孢镰孢菌ꎬ以及 1 株甘蔗镰孢
菌(F. sacchari)FJ ̄22 ̄2ꎮ 以甘蔗镰孢菌 FJ ̄22 ̄2 为
外群ꎬ用软件 ClustalX进行对位排列(alignment)ꎬ目
视检查并手动调节错读漏读碱基ꎮ 用 Sequin 软件
将基因序列登录到 GenBankꎮ 使用软件Mega4.0采
用邻接法(Neighbor ̄joining)构建系统发育树ꎮ
2  结果与分析
2.1  田间大蕉枯萎病症状
    大蕉枯萎病与香蕉枯萎病植株症状相似ꎮ 全生
育期均可发病ꎬ早期发病植株整株枯死ꎻ晚期发病ꎬ
果实发育缓慢ꎬ若最上一片叶保持绿色ꎬ有可能收到
果实ꎮ 发病初期植株下部老叶一侧叶缘先出现黄
化ꎬ从叶缘向中脉逐渐黄化、变褐干枯ꎬ叶片自下而
上相继发病ꎬ并随近叶鞘处叶柄的折曲而下垂ꎻ部分
病株假茎基部开裂ꎻ横切发病植株的球茎ꎬ可见褐色
或红棕色斑点状坏死病变ꎻ纵剖病株假茎ꎬ其维管束
组织变为褐色或红褐色ꎬ根系也呈褐色坏死(图 1)ꎮ
2.2  大蕉枯萎病菌的形态特征
    从发病的大蕉球茎或假茎上共分离到 12株分
离物(表 1)ꎬ这些分离物在 PDA 培养基上菌落生
长速度中等ꎬ气生菌丝丰富ꎬ羊绒状ꎬ初期为白色至
灰白色ꎬ后期产生浅紫色至深紫色色素ꎬ有时产生
紫蓝色色素ꎮ 在 SNA 培养基上ꎬ产孢梗多为单生
的单瓶梗ꎬ少见分枝ꎮ 分生孢子梗短ꎬ一般短于
25 μmꎬ瓶形或安瓶形ꎬ领口较明显ꎮ 产孢细胞大小为
8.92(5.26~12.41) μm×3.50 (2.40~5.03) μmꎮ 小型分
生孢子长椭圆形、纺锤形、直或略弯曲成肾形等ꎬ假头
生ꎬ大小为 7.3×3.71 (4.36~10.08 × 3.02~4.95) μmꎮ
大型分生孢子直至轻微弯曲、细胞壁薄、两端渐尖ꎬ有
时顶细胞微弯曲呈钩状、足细胞较明显ꎬ多为 3~5分
隔ꎬ大小为 35.44×4.48 (27.65~49.01×2.96~5.30) μmꎮ
厚垣孢子较易形成ꎬ数量多ꎬ球形或亚球形ꎬ细胞壁光
滑或略粗糙ꎬ单生、对生、顶生、间生ꎬ近无色透明ꎬ直
径 9.11 (5.86~11.24) μm(图 2)ꎮ 以上形态学特征符
合尖孢镰孢菌(F. oxysporum)的形态描述[24]ꎮ
143
 
植物病理学报 44卷
Fig. 1  Symptoms of Fusarium wilt of Dajiao
A: Symptom of initial diseased plantꎻ B: Yellowing from one side of the leafꎻ C ̄D: Symptom of later stage diseased plantꎻ
E: Symptom of dissilient pseudostemꎻ F: Symptom of pseudostem longisectionꎻ G: Symptom of corm transaction.
Fig. 2  Morphological characteristics of Fusarium oxysporum
A. Microconidia in the aerial myceliumꎻ B. Short monophialides in the aerial myceliumꎻ
C. Macroconidiaꎻ D. Chlamydosporesꎻ Magnification bar= 20 μm.
243
 
  4期 吕 顺ꎬ等:大蕉枯萎病病原菌鉴定及 TEF ̄1α序列分析
2.3  致病性测定结果
    不同菌株接种香蕉、粉蕉和大蕉组培苗的表型
不同(表 2)ꎬ若发病则多在接种病原菌 15 d 后开
始显现黄叶病状ꎬ30 d 枯萎病症状明显ꎬ纵剖球茎
可见褐色至红褐色的坏死ꎬ严重时整个球茎全部变
褐色ꎬ分离病株可获得与接种菌株相同的病原菌ꎮ
部分发病轻的蕉苗叶片无黄化现象ꎬ但纵剖球茎可
见褐色至红褐色的坏死斑点ꎬ发病重的蕉苗叶片出
现黄化现象ꎬ纵剖球茎可见褐色至红褐色的坏死ꎬ
严重时整个球茎全部变褐色ꎮ 不同菌株回接致病
力的调查结果如表 2所示ꎮ
    由表2可知ꎬ从大蕉上分离的病原菌株( the
Table 2  Pathogenicity of different Foc strains
Isolate No. Race
Phylogenetic
lineages
Disease incidence
of Baxi
(Musa AAA) / %
Disease incidence
of Dajiao
(Musa ABB) / %
Disease incidence
of Fenjiao
(Musa ABB) / %
BobaiFJ Race 1 Ⅲ 0.00 0.00 100.00
Bw1 Race 1 Ⅲ 0.00 0.00 96.67
Bw4 Subtropical race 4 VII 50.00 25.53 50.00
DBDJ Unknown Ⅰ 0.00 96.00 100.00
DJ ̄11 ̄1 Unknown Ⅱ 0.00 63.33 100.00
DJ ̄12 ̄1 Unknown Ⅱ 0.00 76.67 100.00
DJ ̄13 ̄3 Unknown Ⅰ 0.00 90.00 80.00
DJ ̄6 ̄12 Unknown Ⅰ 0.00 90.00 83.11
DJ ̄7 ̄12 Unknown Ⅰ 0.00 93.33 100.00
DJ ̄7 ̄13 Unknown Ⅰ 0.00 86.67 100.00
DJ ̄7 ̄14 Unknown Ⅰ 0.00 90.00 100.00
DJ ̄8 ̄12 Unknown Ⅱ 0.00 53.33 100.00
DJ ̄8 ̄13 Unknown Ⅱ 0.00 60.67 100.00
DJ ̄9 ̄2 Unknown Ⅱ 0.00 66.67 100.00
FJ ̄2 ̄1 Race 1 Ⅱ 0.00 35.00 100.00
FJ ̄4 ̄7 Race 1 Ⅱ 0.00 30.00 96.67
FJ ̄9 ̄3 Race 1 Ⅱ 0.00 36.67 100.00
FJ ̄23 ̄2 Race 1 Ⅱ 0.00 32.33 98.67
FJZ1 Race 1 Ⅱ 0.00 46.67 95.00
FOC1 Race 1 Ⅱ 0.00 53.33 90.00
FOC4 Race 4 VIII 96.67 0.00 100.00
HN 1 Race 1 Ⅲ 0.00 0.00 90.67
HN 4 Tropical race 4 VIII 100.00 22.25 97.22
NKYDJ Unknown Ⅱ 0.00 93.33 93.33
race 2 Race 2 VI 0.00 0.00 23.33
race 3 Race 3 IX 0.00 0.00 0.00
XJ ̄1 ̄7 Tropical race 4 VIII 100.00 0.00 100.00
XJ ̄2 ̄3 Tropical race 4 VIII 93.50 0.00 100.00
XJ ̄3 ̄2 Tropical race 4 VIII 100.00 0.00 100.00
XJ 24 Tropical race 4 VIII 100.00 0.00 100.00
XJ 37 Tropical race 4 VIII 100.00 0.00 100.00
343
 
植物病理学报 44卷
unknown race)对大蕉和粉蕉都有较强的致病力ꎬ
但不能侵染香蕉ꎻ8 个 4 号小种菌株( race 4)除来
自澳大利亚的菌株 Bw4(subtropical race 4)和来自
海南的菌株 HN4 外ꎬ其它 6 个菌株均对香蕉和粉
蕉有强的致病力而不能侵染大蕉ꎬ但菌株 Bw4 和
HN4对大蕉有弱的致病性ꎻ9 个 1 号小种菌株
( race 1)均对粉蕉有强的致病性而不能侵染香蕉ꎬ
但来源不同地区的菌株对大蕉致病力不同ꎬ来源于
广东和福建的菌株能侵染大蕉ꎬ来源于广西、海南
和澳大利亚的菌株不侵染大蕉ꎻ2 号和 3 号生理小
种都不能侵染大蕉ꎮ 此结果表明ꎬ大蕉与粉蕉的病
原菌在致病性上存在一定的交叉和分化ꎬ大蕉枯萎
病的病原菌可能是 Foc 1 号生理小种或者是自 1
号生理小种演化出的一个新的致病类群ꎮ
2.4  4 号小种(Foc 4)及热带 4 号小种(TR4)的
分子特异检测
    分子检测结果见图 3ꎮ 热带 4 号小种特异引
物 FocTR ̄F / FocTR ̄R扩增的结果表明ꎬ所有来源
于我国的 4 号小种均能扩增出一个片段大小为
463 bp的条带ꎬ而大蕉枯萎病菌株、来自澳大利亚
的亚热带 4号小种 Bw4及其他尖孢镰孢菌菌株不
能扩增出此条带ꎻ所有致病力测定确定为 4号生理
小种的香蕉枯萎病菌株经 4 号小种特异引物 Foc ̄
1 / Foc ̄2扩增后ꎬ均获得了片段大小为 242 bp 的条
带ꎬ而大蕉枯萎病菌株及其它 1号小种的菌株均不
能产生此条带ꎮ 此结果表明ꎬ大蕉枯萎病的病原菌
不是 4号小种ꎮ
2.5  TEF ̄1α序列测定
    表 1中列举的所有镰孢菌均能由引物 EF1H /
EF2T扩增出片段大小约 650 bp条带ꎬ所获得的 36
个菌株的 TEF ̄1α 核苷酸序列均已在 GenBank 核
酸序列数据库中注册( http: / / www. ncbi. nlm. nih.
gov)ꎬ 序 列 登 录 号 为 JX294959 ̄JX294966 和
KC889004 ̄KC889031(Table 1)ꎮ
    将供试菌株的 TEF ̄1α 序列在 GenBank 数据
库和Fusarium  ̄ ID(镰孢菌数据库 )中进行同源
Fig. 3  Electrophoresis patterns of PCR amplification products using primer
set FocTR4 ̄F / FocTR4 ̄R (upper image) and Foc ̄1 / Foc ̄2 (middle image)
Lane 1: DBDJꎻ 2: DJ ̄6 ̄12ꎻ 3: DJ ̄7 ̄13ꎻ 4: DJ ̄8 ̄12ꎻ 5: DJ ̄9 ̄2ꎻ 6: DJ ̄11 ̄1ꎻ 7: FJ ̄4 ̄7ꎻ 8: FJ ̄23 ̄2ꎻ 9: FJZ1ꎻ 10: HN 1ꎻ
11: Bw1ꎻ 12: race 2ꎻ 13: race 3ꎻ 14: TOW ̄19 ̄3ꎻ 15: AB ̄2 ̄8ꎻ 16: Bw4ꎻ 17: XJ ̄1 ̄7ꎻ 18: XJ ̄2 ̄3ꎻ 19: XJ ̄3 ̄2ꎻ 20: XJ 24ꎻ
21: XJ 37ꎻ 22: HN 4ꎻ 23: FJ ̄22 ̄2ꎻ TEF ̄1α primers EF1H / EF2T were used for PCR as the positive control ( lower image) .
443
 
  4期 吕 顺ꎬ等:大蕉枯萎病病原菌鉴定及 TEF ̄1α序列分析
序列搜索ꎬ除 FJ ̄22 ̄2(Fusarium sacchari)外ꎬ其他
菌株与尖孢镰孢菌(F. oxysporum)的同源性最高ꎬ
达 99%以上ꎬ可见基于 TEF ̄1α序列比对的结果也
支持大蕉枯萎病的病原菌为尖孢镰刀菌ꎮ
2.6  基于 TEF ̄1α基因的系统进化分析
    以甘蔗镰孢菌(F. sacchari)的菌株 FJ ̄22 ̄2为
外群ꎬ将 12 株大蕉枯萎病病原菌株的 TEF ̄1α 序
列与 23株其它尖孢镰孢菌(表 1)的 TEF ̄1α 序列
进行聚类分析ꎬ得到香蕉上尖孢镰孢菌(F. oxyspo ̄
rum)的系统发育树(No. of Sites = 585ꎬ Bootstrap
Reps= 1 000)如图 4所示ꎮ
    35株分离自香大蕉上的尖孢镰孢菌共形成 9
个系统发育谱系(Lineage I ̄IX)ꎬ12 株分离自大蕉
的大蕉枯萎病病原菌聚于谱系 I 和 II 中ꎬ其中的 6
株形成一个独立的谱系 Iꎬ该 6 菌株对大蕉致病性
强ꎬ病株率达 87%以上ꎻ另 6 株与 1 号小种聚在一
起形成谱系 IIꎬ此 6 个菌株对大蕉致病性较谱系 I
弱ꎬ病株率分别为 61%、53%、63%、67%、77%和
93%ꎮ 9个 1号小种菌株位于 2个谱系( IIꎬIII)中ꎬ
其中 6个来自广东及福建的 1 号小种菌株与 6 个
分离自大蕉菌株同聚在谱系 II 中ꎬ该 6 个菌株均
可侵染大蕉ꎻ而来源于广西、海南及澳大利亚的 1
号小种聚在谱系 III 中ꎬ此 3 个菌株不能使大蕉致
病(表 2)ꎮ 2 号小种( race 2)、3 号小种( race 3)、
来源于澳大利亚的亚热带 4 号小种(ST4)以及来
源于我国的热带 4 号小种(TR4)分别形成 4 个独
立的系统发育谱系(VI、IX、VII、VIII)ꎮ 4 株分离
自香蕉果实的非病原尖孢镰孢菌形成两个独立的
谱系( IV和 V)ꎮ
Fig. 4  The NJ tree of Foc inferred from partial TEF ̄1α sequences data
Note: Only bootstrap >50% are shown. “◆” indicates the pathogenic strains of Fusarium wilt of Dajiao(Musa ABB)ꎻ
“▲” indicates the pathogenic strains of Fusarium wilt of banana from Australiaꎻ “○” indicates the nonpathogenic
F. oxysporum strains recovered from banana fruitsꎻ The others were pathogenic strains of Fusarium wilt of banana
in China. The various F. oxysporum f. sp. cubense lineages ( I to IX) were indicated to the right of the tree.
543
 
植物病理学报 44卷
    上述结果表明ꎬ大蕉枯萎病菌与 1号生理小种
的亲缘关系近ꎬ但在遗传发育关系上也存在一定的
交叉和分化ꎬ引起大蕉枯萎病的病原菌是由 1号小
种变异演化而产生ꎮ
3  讨论
    香蕉枯萎病(巴拿马病)是一种毁灭性病害ꎬ
由 F. oxysporum f. sp. cubense(Foc)侵染香蕉植株
维管束引起ꎬ自 1996 年以来对我国华南地区的很
多香蕉产区产生了严重的危害[8ꎬ 10ꎬ 11]ꎮ 基于对不
同香蕉品种的毒力专化性ꎬFoc 可以分为 4 个不同
的小种ꎬ即 1 号小种、2 号小种、3 号小种及 4 号小
种( race 1、race 2、race 3和 race 4)ꎮ 基于系统进化
研究或 VCG(营养亲和群ꎬvegetative compatibility
groups)分析ꎬFoc又可分为 8个不同的单系群或超
过 24个不同的 VCG[2ꎬ 21ꎬ 25]ꎬ但是关于我国大陆的
Foc属于哪个系统发育谱系或 VCG仍未见报道ꎮ
    尖孢镰孢菌古巴专化型(F. oxysporum f. sp.
cubense)生理小种的划分主要是依据侵染的宿主
品种不同进行的ꎬ国内许多学者[8ꎬ 26]对香蕉枯萎
病菌生理小种的鉴定主要采用分离物对粉蕉和巴
西蕉致病性来判断ꎬ有的学者还结合采用 Komada
培养基上菌落形态来鉴定[8ꎬ 27]ꎮ 本研究首先采用
形态学分类鉴定方法对分离自具有枯萎病症状大
蕉的分离物进行鉴定ꎬ初步将其鉴定为尖孢镰孢菌
(F. oxysporum)ꎬ同时基于 TEF ̄1α 序列的聚类分
析也将其中分离物与其它尖孢镰孢菌菌株聚类在
同一分枝上ꎬ从分子水平上支持其为尖孢镰孢菌ꎮ
此外ꎬ笔者对大蕉枯萎病病原菌进行致病性测定发
现ꎬ大蕉枯萎病病原菌株( race unknown)能侵染大
蕉和粉蕉ꎬ不能侵染香蕉ꎻ4号小种( race 4)主要侵
染香蕉和粉蕉ꎬ不能侵染大蕉或对大蕉致病力很
弱ꎻ1 号小种( race 1)中的部分类群能侵染大蕉ꎮ
由此ꎬ我们推断大蕉枯萎病的病原菌不是 Foc 4 号
生理小种ꎬ可能是 Foc 1 号生理小种或者是尖孢镰
孢菌古巴专化型 ( F. oxysporum f. sp. cubenseꎬ
Foc)中分化出来的一个新的致病类群ꎮ
    TEF ̄1α是目前镰孢菌系统发育研究中应用最
多的基因片段ꎬ一是该基因具有丰富的信息量ꎬ二
是还未发现不存在该基因序列的镰孢菌类群ꎬ三是
该基因的通用引物易于设计ꎮ 目前ꎬ许多学者采用
该基因片段开展 Fusarium 种类鉴定[28~30]ꎮ 1998
年ꎬO’Donnell 等[21]利用 TEF ̄1α 和 mtSSU rDNA
序列ꎬ分析了 28 个不同寄主来源的病原尖孢镰孢
菌(包括 9 株 Foc)ꎬ将 Foc 分为 5 个不同的单系
群ꎬ证明香蕉枯萎病菌有多个独立的进化起源ꎮ
2009年ꎬO’Donnell等[31]采用 TEF ̄lα 和 IGS 两个
基因片段对来源于植物和人类的病原尖孢镰孢菌
(F. oxysporum)进行了系统分析ꎬ认为 TEF ̄lα 是
适用于 Fusarium 群体遗传多样性分析的基因片
段ꎮ Fourie 等[25]利用 TEF ̄1α、mtSSU rRNA 等基
因片段ꎬ将来自世界各地的 20 个 VCGs 的 Foc 菌
株分为两大进化枝共 8 个谱系ꎮ 本文通过基于
TEF ̄1α的系统发育分析表明ꎬ引起大蕉枯萎病的
病原菌包括两个遗传发育谱系ꎬ其中一个与 1号生
理小种聚类在同一个系统进化枝上ꎬ另一个为尖孢
镰孢菌古巴专化型(F. oxysporum f. sp. cubenseꎬ
Foc)中的一个新的系统发育类群ꎬ该分子系统发
育分析结果与致病性测定结果相符ꎮ
    基于 Foc在热带地区或亚热带地区对香蕉栽
培品种 Cavendish (Musa AAA)的致病性ꎬ4 号小
种又进一步划分为热带 4 号小种( tropical race 4ꎬ
TR4) 和亚热带 4 号小种 ( subtropical race 4ꎬ
ST4) [9ꎬ 13]ꎮ 2009 年ꎬLin 等[18]通过对 Foc 不同生
理小种的随机扩增多态性(RAPD)分析ꎬ发明了用
于特异检测香蕉枯萎病 4号小种的 PCR 快速检测
引物ꎮ 2010年ꎬDita 等[20]对来自不同香蕉产区的
Foc代表菌株的 TEF ̄1α和 IGS基因序列差异进行
了分析ꎬ发明了用于检测热带 4 号小种(TR4) 的
PCR快速诊断技术ꎮ 本研究中ꎬ笔者利用 4 号小
种(Foc 4)及热带 4号小种(TR4)的分子特异检测
引物对大蕉枯萎病菌进行鉴定表明ꎬ大蕉枯萎病的
病原菌不是热带 4号小种(TR4)也不是 4 号小种ꎬ
进一步验证了致病性测定的结果ꎮ
    关于引起大蕉枯萎病的病原菌ꎬ过去一直存在
较大的争议ꎬ有些学者认为ꎬ大蕉枯萎病的病原菌
为 4号生理小种或 2 号生理小种[27]ꎬ但是ꎬ根据作
者多年的田间观察及东莞当地的蕉农反映ꎬ大蕉枯
萎病的重病田块重新种植巴西蕉ꎬ巴西蕉通常表现
为不发病ꎮ 此外ꎬ从大蕉枯萎病发病史看ꎬ在 4 号
生理小种入侵中国大陆前ꎬ东莞大蕉已有少量枯萎
病发生ꎮ 本文通过对大蕉枯萎病病原菌的致病性
测定及基于 TEF ̄1α 序列的遗传发育分析表明ꎬ其
与 1号小种关系较近ꎬ在致病性及遗传发育关系上
643
 
  4期 吕 顺ꎬ等:大蕉枯萎病病原菌鉴定及 TEF ̄1α序列分析
都存在一定的交叉和分化ꎬ应为 1号小种变异演化
而来ꎮ
    香蕉枯萎病病原菌存在较复杂的遗传发育关
系ꎬ其中 1号小种包括两个类群ꎬ1 个类群能侵染
大蕉和粉蕉ꎬ另一个类群只能侵染粉蕉不能侵染大
蕉ꎮ 过去我国大陆常以是否侵染香蕉(Cavendishꎬ
AAA)和粉蕉作为区分 4 号和 1 号生理小种的依
据ꎬ笼统地将不侵染香蕉而侵染粉蕉的定义为 1 号
小种ꎬ忽略了对大蕉的测定ꎬ这可能会掩盖了病原
菌潜在的遗传多样性ꎮ 为了方便对 1 号生理小种
中这两个类群进行区分及日后对这两个类群的进
一步研究ꎬ作者建议将 1号生理小种进一步分为大
蕉 1号生理小种(Dajiao race 1ꎬ DR1)及粉蕉 1 号
生理小种(Fenjiao race 1ꎬ FR1)ꎬ并且建议建立一
套较完善的不同生理小种和类群的鉴别品种ꎮ
参考文献
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