全 文 :书拟南芥高亲和性犓+载体蛋白基因犮犇犖犃
克隆及其序列特征分析
王丽1,2,3,张俊莲1,3,4,张金文1,3,4,刘玉汇1,3,白江平1,3,4,
余斌1,3,杨宏羽1,3,4,王蒂1,3,4
(1.甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃 兰州730070;2.甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃 兰州730070;
3.甘肃省干旱生境作物学重点实验室,甘肃 兰州730070;4.甘肃农业大学农学院,甘肃 兰州730070)
摘要:以NaCl胁迫处理的拟南芥幼苗叶片为材料,用RNA提取试剂盒抽提总RNA,通过RT-PCR技术和DNA
序列测定分析,证实获得了拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因(犃狋犎犓犜1)的cDNA序列。该cDNA全长1521bp,
包括506个氨基酸和1个终止密码子序列,且与原序列(accessionnumberAF237672)同源性为99.34%,但与其他
科植物犎犓犜1基因同源性较低,注册该基因到GenBank中,注册号为AY685182。利用生物信息学相关软件分析
预测犃狋犎犓犜1基因蛋白质功能和结构,结果发现,该蛋白分子量为57.45kD,理论等电点为9.33;氨基酸序列中第
1~40个氨基酸属信号肽序列;第152~500个氨基酸属TrkH阳离子转运体蛋白保守结构域,并存在蛋白激酶C,
酪氨酸蛋白激酶,依赖cAMP/cGMP蛋白激酶磷酸化,糖基化和豆蔻酰化等功能位点;该基因编码的蛋白有10个
跨膜结构,N末端、C末端及中部等多个跨膜区具疏水性,符合载体类运输蛋白特点。表明本研究获得了拟南芥
犃狋犎犓犜1基因。
关键词:拟南芥;高亲和性K+载体蛋白;RT-PCR技术;生物信息学分析
中图分类号:Q943.2 文献标识码:A 文章编号:10045759(2013)06023009
犇犗犐:10.11686/cyxb20130629
钾是植物生长发育必需的大量元素,参与植物许多生理生化过程,包括酶活性调节、蛋白质合成及渗透调节
等,保持胞质内较高K+/Na+对植物生长起着非常重要的作用[1]。盐胁迫时,大量Na+从根部进入植物体内,抑
制K+的吸收,K+/Na+降低,导致植物受害[2]。研究表明,植物的耐盐性与其维持体内K+、Na+平衡的能力密
切相关,具有高K+/Na+的植物有较强的耐盐性[3]。因此,限制Na+吸收、增加Na+外排,同时保证K+吸收,维
持细胞质高K+/Na+可抵御过量的Na+对植物造成的伤害[4]。HKT(highaffinityK+transporter)类蛋白属于
一个广泛存在于植物、真菌、真细菌和古细菌中的K+转运体超级家族,具有可以调节植物体内K+/Na+平衡的
能力[5]。
自1994年Schachtman和Schroeder[6]从小麦(犜狉犻狋犻犮狌犿犪犲狊狋犻狏狌犿)幼苗根cDNA表达文库中克隆到第1个
高亲和性K+载体蛋白基因Ta犎犓犜1以来,陆续在拟南芥(犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪)[7]、碱蓬(犛狌犪犲犱犪狊犪犾狊犪)[5]、芦
苇(犘犺狉犪犵犿犻狋犲狊犪狌狊狋狉犪犾犻狊)[8]、水稻(犗狉狔狕犪狊犪狋犻狏犪)[9]、冰叶日中花(犕犲狊犲犿犫狉狔犪狀狋犺犲犿狌犿犮狉狔狊狋犪犾犾犻狀狌犿)[10]、桉树
(犈狌犮犪犾狔狆狋狌狊犮犪犿犪犾犱狌犾犲狀狊犻狊)[11]、大麦(犎狅狉犱犲狌犿狏狌犾犵犪狉犲)[12]、商陆(犘犺狔狋狅犾犪犮犮犪犪犮犻狀狅狊犪)[13]、海蓬子(犛犪犾犻犮狅狉狀犻犪
犫犻犵犲犾狅狏犻犻)[14]等多种植物中克隆了其同源蛋白基因。早期研究认为,犎犓犜1蛋白是Na+吸收和运输的载体,降低
犎犓犜1的表达,可能会提高植物抗盐性,如Laurie等[15]研究发现,表达反义犎犓犜1基因的小麦植株较野生型耐
盐胁迫能力更强;Horie等[16]比较耐盐水稻和盐敏感水稻时发现,抗盐性高的水稻犎犓犜1基因的表达量在盐胁
迫时降低,而盐敏感型水稻犎犓犜1的表达量一直维持在很高水平;Rus等[17]研究发现拟南芥犃狋犎犓犜1基因在
230-238
2013年12月
草 业 学 报
ACTAPRATACULTURAESINICA
第22卷 第6期
Vol.22,No.6
收稿日期:20121024;改回日期:20121115
基金项目:高等学校博士学科点专项基金项目(20106202110007),国家科技支撑计划项目(2012BAD06B03),甘肃省干旱生境作物学重点实验室
开放基金(GSCS201212)和甘肃农业大学科技创新基金项目(GAUCX1024)资助。
作者简介:王丽(1981),女,甘肃兰州人,讲师,在读博士。Email:39726821@qq.com
通讯作者。Email:zhangjl@gsau.edu.cn,wangd@gsau.edu.cn
sos31突变体的过量表达增强了突变体植株在低K+环境下对Na+的敏感性及植株的缺K+症状,犃狋犎犓犜1基
因可转运Na+进入细胞、调控根部Na+的吸收。然而近期更多的研究证明,犃狋犎犓犜1转运蛋白在提高植物耐盐
性中可能具有重要的积极作用,如Mser等[18]认为拟南芥犃狋犎犓犜1基因参与调控Na+在根和地上部分的分配;
Berthomieu等[19]认为犃狋犎犓犜1参与Na+通过韧皮部汁液从地上部分至根部的再循环过程,降低叶中 Na+积
累;Sunarpi等[20]认为在高盐环境下,犃狋犎犓犜1基因调节 Na+从根部木质部卸载。特别是最近的研究又发现,
犃狋犎犓犜1基因既不调控Na+从地上部到根部的再循环,也不调节Na+以内流的形式进入根部,而是将Na+直接
滞留在根的木质部中,加载Na+进入根部液泡,从而降低Na+从根到茎的运输[2126]。由此可见,犃狋犎犓犜1基因
在植株中的耐盐表达调控机制仍有争议,目前尚未见利用该基因改良作物耐盐性的报道。
为了研究犃狋犎犓犜1基因参与植物耐盐调控机制,更好地发挥其作用,本研究以拟南芥为材料,利用RT-
PCR技术,在盐胁迫条件下进行犃狋犎犓犜1基因的分离克隆。进一步通过该基因编码蛋白特性及结构分析,初步
确定该基因功能和特点,为进一步研究该基因功能及改良作物耐盐性奠定基础。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料 拟南芥种子用70%酒精浸泡30s,0.1% HgCl2 处理5min,无菌水冲洗5次后接入MS基本
培养基上,在25℃、12h/d光照下培养。当幼苗生长至14d时,将160mmol/L的NaCl水溶液倒入培养基上,胁
迫幼苗12h待用。本试验在2004年进行。
1.1.2 菌株和载体 大肠杆菌(犈狊犮犺犲狉犻犮犺犻犪犮狅犾犻)菌株为DH5α的感受态细胞;T载体为pGEM?TEasyVec
tor(购自Promega公司),抗性标记为氨苄青霉素(Ampr)。
1.1.3 酶和试剂 SuperscriptⅡ逆转录试剂盒购自Promega公司;各种限制性内切酶、PyrobestTMDNA聚合酶
和T4DNA连接酶购自TaKaRa公司;TaqDNA聚合酶和TRIzol一步法RNA提取试剂盒购自鼎国公司;DNA
凝胶回收试剂盒购自上海开瑞公司;其他生化试剂为国产分析纯。
1.2 犃狋犎犓犜1基因cDNA克隆
1.2.1 逆转录合成cDNA第1链 1)总RNA提取。用TRIzol一步法RNA提取试剂盒抽提盐胁迫下的拟南
芥叶片总RNA,提取方法见试剂盒说明书。提取的总RNA在经焦碳酸二乙酯(DEPC)处理的1%琼脂糖凝胶上
电泳,EB染色后检查RNA完整性;2)cDNA第1链合成。在提取的7.5μLRNA中加入1μLOligo(dT),65℃
加热8min,室温自然冷却;向上述混合液中加入4μL25mmol/L的 MgCl2、4μL5×buffer、2μL10mmol/L
dNTP和0.5μL的 RNase,混匀后加入 AMV反转录酶,再次混匀后42℃下保温30min,99℃下煮5min,
-20℃保存。
1.2.2 PCR扩增 根据已发表的拟南芥犃狋犎犓犜1基因序列(accessionnumberAF237672),设计1对引物,即
上游引物p1:5′CGGGATCC(BamHⅠ)ATGGACAGAGTGGTGGCAAAAATAG3′和下游引物p2:5′CG
GAGCTC(SacⅠ)TTAGGAAGACGAGGGGTAAAGTATCC3′,由北京赛百盛公司合成。扩增反应体系为25
μL,由1μLcDNA模板、2.5μL10×buffer、1μLdNTP(10mmol/L)、1μL引物p1(10μmol/L)、1μL引物p2
(10μmol/L)、0.5μLPyrobest
TMDNA聚合酶、18μLddH2O组成。扩增条件为:94℃预变性1min后,进行
94℃50s、53℃50s、72℃120s的35个循环,再在72℃下延伸10min。扩增产物EB染色后进行1%琼脂糖凝
胶电泳检测。
1.2.3 犃狋犎犓犜1基因cDNA与T载体连接 扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳分离后回收,回收方法见上海开
瑞公司凝胶回收试剂盒说明书。扩增产物利用TaqDNA聚合酶对其加A,然后与T载体相连,连接产物转化感
受态细胞。
1.3 重组质粒的鉴定
将转化细胞涂在含50μg/mLAmp
r、20mg/mL5溴4氯3吲哚βD半乳糖苷(Xgal)和100mg/mL异丙
132第22卷第6期 草业学报2013年
基βD硫代半乳糖苷(IPTG)的 LB平板上进行蓝白斑筛选。对所获得的白斑通过滞后质粒、PCR 扩增、
犅犪犿犎Ⅰ和犛犪犮Ⅰ双酶切鉴定,-80℃保存菌株。
1.4 序列测定及分析
送鉴定后的白斑菌株到上海博亚公司测序,所测序列用DNAMANvirsion6.0软件进行分析。然后通过
NCBI网站的BlastX和BlastP程序进行序列相似性分析;利用InterProScan(http://www.ebi.ac.uk/Tools/
InterProScan/)进行信号肽分析和氨基酸保守性预测;用 MEGA4.0软件进行氨基酸序列比对和HKT类蛋白质
序列系统进化树分析;链接至http://expasy.org/tools/protparam.html网站进行蛋白质理化性质分析;利用
PredictProteinServer(http://www.predictprotein.org/)进行蛋白质结构域分析;利用 TMHMMServerv2.0
(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM2.0)程序分析蛋白质序列跨膜区;利用ProtScale(http://ex
pasy.org/tools/protscale.html)分析氨基酸序列的疏水性。
2 结果与分析
2.1 拟南芥犃狋犎犓犜1基因的分离
图1 拟南芥总犚犖犃
犉犻犵.1 犜狅狋犪犾犚犖犃狅犳犃.狋犺犪犾犻犪狀犪
1,2:总RNATotalRNA.
利用TRIzol一步法RNA提取试剂盒提取盐胁
迫下的拟南芥叶片总RNA,琼脂糖凝胶电泳显示,总
RNA5S、18S和28S三条带清晰、完整(图1),说明
RNA完整性良好。利用 RT-PCR试剂盒进行cD
NA第1链合成后,利用1对特异性引物及Pyrobe
stTMDNA聚合酶,以cDNA为模板进行目的基因扩
增,期望获得约1521bp大小的DNA片段。对扩增产
物电泳检查结果表明,扩增产物与预期片段的大小基
本一致(图2),说明可能获得了犃狋犎犓犜1基因的cD
NA克隆。
2.2 重组菌株获得
因pGEM?TEasyVector载体多克隆位点位于犔犪犮犣基因编码区,外源基因插入将改变犔犪犮犣基因编码序
列的完整性,影响β半乳糖苷酶活性,致使重组子在Xgal/IPTG平板上呈白色,而非重组子呈蓝色。选取白色
菌株进行滞后质粒筛选(图3),初步淘汰假阳性,然后对阳性菌株进行PCR(图4)及双酶切(犅犪犿犎Ⅰ和犛犪犮Ⅰ)
鉴定(图5)。结果显示,扩增到或切下约1521bp大小的DNA片段,说明可能获得了携带有犃狋犎犓犜1基因的重
组菌株。
图2 拟南芥犃狋犎犓犜1基因的犘犆犚扩增
犉犻犵.2 犘犆犚犪犿狆犾犻犳犻犮犪狋犻狅狀狅犳犃狋犎犓犜1犵犲狀犲
M:MakerⅤ分子量标记DNAMakerⅤ;1,2:PCR扩增
产物AmplificationproductbyPCR.
图3 犜载体上滞后质粒筛选
犉犻犵.3 犐犱犲狀狋犻犳犻犮犪狋犻狅狀狅犳犱犲犾犪狔犲犱狆犾犪狊犿犻犱狅犳犜狏犲犮狋狅狉
1~3:蓝斑Bluecolorplasmid;4:白斑 Whitecolorplasmid.
232 ACTAPRATACULTURAESINICA(2013) Vol.22,No.6
图4 白斑滞后质粒犘犆犚鉴定
犉犻犵.4 犐犱犲狀狋犻犳犻犮犪狋犻狅狀狅犳狑犺犻狋犲犮狅犾狅狉狆犾犪狊犿犻犱犫狔犘犆犚
M:MakerⅤ分子量标记DNAmarkerⅤ;1~5:白斑滞后
质粒 Whitecolorplasmid.
图5 白斑滞后质粒犅犪犿犎 Ⅰ和犛犪犮Ⅰ酶切鉴定
犉犻犵.5 犐犱犲狀狋犻犳犻犮犪狋犻狅狀狅犳狑犺犻狋犲犮狅犾狅狉狆犾犪狊犿犻犱犫狔犅犪犿犎 Ⅰ犪狀犱犛犪犮Ⅰ
M:MakerⅤ分子量标记DNAMakerⅤ;1,2:白斑滞后质粒的犅犪犿犎Ⅰ和
犛犪犮Ⅰ酶切鉴定Identificationofwhitecolorplasmidby犅犪犿犎Ⅰand犛犪犮Ⅰ.
2.3 犃狋犎犓犜1基因cDNA序列及蛋白序列分析
2.3.1 cDNA序列特征分析 将经鉴定的重组菌株交上海博亚生物技术公司测序。将测序结果与原序列(ac
cessionnumberAF237672)比较,发现二者同源性高达99.34%。对测序结果分析后发现,其开放阅读框架为
1521bp(图6),包括506个氨基酸编码区和1个终止密码子(TAA)。该基因登记在GenBank中(accessionnum
berAY685182)。
用DNAMAN软件对该序列与GenBank中登记的部分物种的犎犓犜1基因的cDNA序列进行同源性比较。
结果发现,该序列与其他学者登录的拟南芥犃狋犎犓犜1基因同源性都很高,达99.34%以上,与同科盐芥同源性较
高,为84.00%,与其他科植物同源性低,为48.47%~57.34%(表1),说明同科植物特别是同种植物,该基因的
保守性强,而不同科植物的犃狋犎犓犜1基因间差异较大。
2.3.2 蛋白质进化特征分析 系统进化树分析发现,10个物种的21个 HKT蛋白被聚为9个类群,拟南芥
犃狋犎犓犜1和同科的盐芥犜犺犎犓犜1聚为一类,亲缘关系最近;禾本科水稻犗狊犎犓犜3、犗狊犎犓犜9、犗狊犎犓犜7、犗狊犎
犓犜4聚为一类;禾本科水稻犗狊犎犓犜1、犗狊犎犓犜2和芦苇犘犺犪犎犓犜1为一类;禾本科大麦 犎狏犎犓犜1和小麦
犜犪犎犓犜1为一类;番杏科冰花犕犮犎犓犜2、桃金娘科赤桉犈犮犎犓犜1、犈犮犎犓犜2和藜科碱蓬犛狊犎犓犜1为一类;禾本
科水稻犗狊犎犓犜8、犗狊犎犓犜6、番杏科冰花犕犮犎犓犜1、藜科海蓬子犛犫犎犓犜1单独聚为一类,基本表现为同科尤其
是同种同源性高、种间相对低的特点(图7)。
2.3.3 蛋白理化性质及结构域分析 Protparam软件预测犃狋犎犓犜1蛋白分子式为C2657H4126N648O725S22,分子
量57.45kD,理论等电点为9.33,带正电荷氨基酸残基数(Arg+Lys)为47,带负电荷氨基酸残基数(Asp+Glu)
为41,不稳定系数为34.19,为稳定碱性蛋白。该蛋白在第1~40个氨基酸残基处有1个信号肽序列(图6,用
“·”表示)。在第152~500个氨基酸处有1个TrkH阳离子转运体蛋白保守结构域(图6,用“[]”表示)。分别
在第70~73,128~131,138~141,185~188,191~194,260~263,318~321,339~342,411~414个氨基酸残基
处有9个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(图6,用“□”表示),表明该蛋白是一种真核细胞中普遍存在的信使非依赖性
丝/苏氨酸蛋白激酶,在细胞生存、生长、增殖及凋亡过程中具有重要功能。在第48~50,185~187,191~193,
260~262,282~284,413~415,492~494和495~497个氨基酸处具有8个蛋白激酶C磷酸化位点(图6,用“■”
表示),能将靶蛋白的Ser/thr磷酸化,从而激活细胞质中某些酶的活性,参与生化反应调控;还可与核中转录因
子相互作用,参与基因表达调控。该蛋白在第225~228个氨基酸处有1个依赖cAMP/cGMP蛋白激酶磷酸化
位点[图6,用“()”表示],能在ATP存在的情况下使许多蛋白质特定的丝/苏氨酸残基磷酸化,调节细胞的物质
代谢和基因表达。此外,在第261~267个氨基酸处[图6,用“{}”表示],该蛋白具有1个酪氨酸蛋白激酶磷酸化
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位点,可将自身的酪氨酸磷酸化或将各种不同靶蛋白的酪氨酸磷酸化来实现信号传递,其转导的信号通常与细胞
生长、繁殖、分化、生存有关。位于第429~432个氨基酸处该蛋白具有1个N端糖基化位点(图6,用“=”表示),
使蛋白质能够抵抗消化酶的作用、赋予蛋白质传导信号的功能、或某些蛋白只有在糖基化之后才能正确折叠。此
外,3个N端豆蔻酰化位点分别在第122~127,394~399,459~464个氨基酸处(图6,用“-”表示)。
图6 拟南芥犃狋犎犓犜1基因的犮犇犖犃序列及其推测的氨基酸序列
犉犻犵.6 犖狌犮犾犲狅狋犻犱犲狊犲狇狌犲狀犮犲犪狀犱犱犲犱狌犮犲犱犪犿犻狀狅狊犲狇狌犲狀犮犲狅犳犃狋犎犓犜1犮犇犖犃狅犳犃.狋犺犪犾犻犪狀犪
·:信号肽Signalpeptide;[]:蛋白保守区Proteinconservedregion;□:酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点CaseinkinaseIIphosphorylationsite;■:蛋
白激酶C磷酸化位点ProteinkinaseCphosphorylationsite;():依赖cAMP/cGMP蛋白激酶磷酸化位点cAMPandcGMPdependentproteinkinase
phosphorylationsite;{}:酪氨酸蛋白激酶磷酸化位点Tyrosinekinasephosphorylationsite;=:N端糖基化位点Nglycosylationsite;-:豆蔻酰化
位点Nmyristoylationsite.
2.3.4 蛋白跨膜性及疏水性分析 经TMHMMServerv2.0软件分析推测,AtHKT1蛋白有10个跨膜区
(21~43,82~104,158~180,195~217,230~252,285~307,343~365,395~412,425~447,467~486),其中
395~412区域的跨膜螺旋长度为18个氨基酸残基,467~486区域的跨膜螺旋长度为20个氨基酸残基,其余区
域均为23个氨基酸残基(图8)。利用ProtScale软件的KyteandDoolittle算法对AtHKT1蛋白进行亲水/疏水
性分析(图9)。在347~359区域的疏水性最强(最大值达3.467),疏水性较强的区域有13个,分别位于第22~39,
58~68,80~93,157~164,170~181,199~206,231~238,245~256,283~306,326~328,397~411,430~434,
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476~484个氨基酸处;在372~390区域的亲水性最强(分值为-2.900),其次有5个区域(45~52,127~131,
139~141,259~276,415~422)具有较强的亲水性。就整体来看,该蛋白疏水性氨基酸均匀分布在整个肽链中,
占总氨基酸组成的46.64%,疏水区域大于亲水区域,N末端、C末端及中部等多个跨膜区均具有疏水性,整个多
肽链表现为疏水性,可认为拟南芥AtHKT1蛋白是疏水性蛋白,符合载体类运输蛋白特点,表明获得了跨膜运输
蛋白基因———犃狋犎犓犜1基因。
表1 拟南芥犃狋犎犓犜1基因犮犇犖犃与其他植物犎犓犜1基因犮犇犖犃序列同源性比较
犜犪犫犾犲1 犃犾犻犵狀犿犲狀狋狅犳狀狌犮犾犲狅狋犻犱犲狊犲狇狌犲狀犮犲狅犳犃狋犎犓犜1犵犲狀犲狑犻狋犺狅狋犺犲狉犺狅犿狅犾狅犵狌犲狊
犎犓犜1基因的来源
cDNAsourcesof犎犓犜1gene
所属科属
Familygenus
GenBank登记号
AccessionnumberinGenBank
同源性
Identities(%)
拟南芥犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪 十字花科鼠耳芥属Cruciferae,犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊 AF237672 99.34
拟南芥犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪 十字花科鼠耳芥属Cruciferae,犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊 NM_117099 99.67
盐芥犜犺犲犾犾狌狀犵犻犲犾犾犪犺犪犾狅狆犺犻犾犪 十字花科盐芥属Cruciferae,犜犺犲犾犾狌狀犵犻犲犾犾犪 EF025500 84.00
桉树犈狌犮犪犾狔狆狋狌狊犮犪犿犪犾犱狌犾犲狀狊犻狊 桃金娘科桉属 Myrtaceae,犈狌犮犪犾狔狆狋狌狊 AF176035 57.34
碱蓬犛狌犪犲犱犪狊犪犾狊犪 藜科碱蓬属Chenopodiaceae,犛狌犪犲犱犪spp. AY530754 56.36
海蓬子犛犪犾犻犮狅狉狀犻犪犫犻犵犲犾狅狏犻犻 藜科盐角草属Chenopodiaceae,犛犪犾犻犮狅狉狀犻犪 HM099661 54.38
芦苇犘犺狉犪犵犿犻狋犲狊犪狌狊狋狉犪犾犻狊 禾本科芦苇属Gramineae,犘犺狉犪犵犿犻狋犲狊 AB234305 52.62
冰叶日中花犕犲狊犲犿犫狉狔犪狀狋犺犲犿犮狉狔狊狋犪犾犾犻狀狌犿 番杏科日中花属Aizoaceae,犕犲狊犲犿犫狉狔犪狀狋犺犲犿狌犿 AF367366 52.30
大麦犎狅狉犱犲狌犿狏狌犾犵犪狉犲 禾本科大麦属Gramineae,犎狅狉犱犲狌犿 AM000056 52.30
小麦犜狉犻狋犻犮狌犿犪犲狊狋犻狏狌犿 禾本科小麦属Gramineae,犜狉犻狋犻犮狌犿 U16709S71776 51.67
水稻犗狉狔狕犪狊犪狋犻狏犪 禾本科稻属Gramineae,犗狉狔狕犪 AB061311 51.64
玉米犣犲犪犿犪狔狊 禾本科玉米属Gramineae,犣犲犪 HQ845286 48.47
图7 犃狋犎犓犜1蛋白与其他物种 犎犓犜类蛋白构建的系统进化树分析
犉犻犵.7 犘犺狔犾狅犵犲狀犲狋犻犮狋狉犲犲犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳犃狋犎犓犜1犳狅狉犿犃.狋犺犪犾犻犪狀犪狑犻狋犺狅狋犺犲狉狉犲狆狅狉狋犲犱犎犓犜狆狉狅狋犲犻狀狊
Os:水稻犗狉狔狕犪狊犪狋犻狏犪;Pha:芦苇犘犺狉犪犵犿犻狋犲狊犪狌狊狋狉犪犾犻;Hv:大麦 犎狅狉犱犲狌犿狏狌犾犵犪狉犲;Ta:小麦犜狉犻狋犻犮狌犿犪犲狊狋犻狏狌犿;Th:盐芥犜犺犲犾犾狌狀犵犻犲犾犾犪犺犪犾狅
狆犺犻犾;At:拟南芥犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪;Mc:冰叶日中花犕犲狊犲犿犫狉狔犪狀狋犺犲犿狌犿犮狉狔狊狋犪犾犾犻狀狌犿;Ec:赤桉犈狌犮犪犾狔狆狋狌狊犮犪犿犪犾犱狌犾犲狀狊犻狊;Ss:盐地碱蓬犛狌犪犲
犱犪狊犪犾狊犪;Sb:海蓬子犛犪犾犻犮狅狉狀犻犪犫犻犵犲犾狅狏犻犻.
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图8 犃狋犎犓犜1蛋白跨膜区分析
犉犻犵.8 犜犺犲犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳狋狉犪狀狊犿犲犿犫狉犪狀犲狅犳犃狋犎犓犜1狆狅犾狔狆犲狆狋犻犱犲
图9 犃狋犎犓犜1氨基酸序列疏水性分析
犉犻犵.9 犜犺犲犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳犺狔犱狉狅狆犺狅犫犻犮犻狋狔狅犳犃狋犎犓犜1狆狅犾狔狆犲狆狋犻犱犲
3 讨论
已有研究表明犃狋犎犓犜1基因参与Na+的转运,与植物耐盐性有关,但关于其具体功能,不同研究者存在着
不同观点。早期研究认为,犃狋犎犓犜1基因的过量表达可增加植株的盐敏感性[17],近期部分学者对该基因的作用
有新解,认为犃狋犎犓犜1基因可调节Na+在根和茎中的分配以及从茎到根部的再循环[1820],AtHKT1蛋白如果在
拟南芥根部的中柱鞘及维管束过量表达,会增加Na+在根部木质部薄壁组织及皮层中滞留,减少Na+由根部转
运至叶,从而降低叶片中Na+浓度,表明该基因在根部的过量表达可提高拟南芥植株的耐盐性,但如果由组成型
35S启动子驱动犃狋犎犓犜1基因在整个植株中的过量表达却导致了转基因植株的盐敏感性,说明犃狋犎犓犜1基因
的组织特异性表达与植株耐盐性关系密切[2426]。本研究根据GenBank中拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因序列
(AF237672)设计引物,利用RT-PCR方法,从拟南芥总RNA中扩增出目的cDNA片段。序列分析发现,该
cDNA片段的开放阅读框架为1521bp,包括506个氨基酸编码区和1个终止密码子(TAA)。该片段与Gen
Bank中其他学者发表的拟南芥该基因cDNA序列(NM_117099)同源性为99.67%,与同科盐芥(EF025500)cD
NA同源性为84.00%,蛋白质同源性为78%,与其他科植物cDNA序列同源性较低,为48.47%~57.34%,蛋白
质序列同源性为42.00%~51.00%。说明同一物种中该基因保守,但不同物种间差异明显,这与其他研究者对
不同基因或不同物种同源性分析时的结论是一致的,即属内同源性高,属间相对低[2729],可见高亲和性K+载体
蛋白在进化上也存在多样性。
本研究对克隆到的犃狋犎犓犜1基因的cDNA片段利用相关软件进行了分析,发现其具有1个TrkH阳离子
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转运体蛋白保守结构域和1个信号肽序列,存在蛋白激酶C、酪氨酸蛋白激酶、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化、依赖
cAMP/cGMP蛋白激酶磷酸化、糖基化、豆蔻酰化等功能位点,表明该基因具有阳离子转运功能。王景艳等[30]认
为植物通过离子外排和区域化降低Na+的毒害与植物跨膜运输蛋白有密切关系,AtHKT1蛋白疏水性及跨膜性
分析表明,该蛋白有10个跨膜区,是疏水性蛋白,符合载体类跨膜运输蛋白特点,推测其与钾和钠离子的转运相
关。本研究为该基因进一步功能研究奠定了基础。
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OocytesandNa+ uptakein犛犪犮犮犺犪狉狅犿狔犮犲狊犮犲狉犲狏犻狊犻犪犲[J].PlantPhysiology,2000,122:12491259.
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犆犾狅狀犻狀犵犪狀犱犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳狊犲狇狌犲狀犮犲犮犺犪狉犪犮狋犲狉犻狊狋犻犮狊狅犳犮犇犖犃犲狀犮狅犱犻狀犵狋犺犲
犃狋犎犓犜1犵犲狀犲犳狉狅犿犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪犾犲犪狏犲狊
WANGLi1,2,3,ZHANGJunlian1,3,4,ZHANGJinwen1,3,4,LIUYuhui1,3,BaiJiangping1,3,4,
YUBin1,3,YANGHongyu1,3,4,WANGDi1,3,4
(1.GansuKeyLaboratoryofCropGenetic&GermplasmEnhancement,Lanzhou730070,China;2.Colege
ofLifeSciencesandTechnology,GansuAgriculturalUniversity,Lanzhou730070,China;
3.GansuProvincialKeyLabofAridlandCropScience,Lanzhou730070,China;
4.ColegeofAgronomic,GansuAgriculturalUniversity,
Lanzhou730070,China)
犃犫狊狋狉犪犮狋:Thefullengthcodingsequenceof犃狋犎犓犜1wasclonedviaRTPCR(reversetranscriptionpolymer
asechainreaction)fromtheleavesof犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪seedlingunderNaClstress.ThefullengthcDNA
contained1521bpandencodedapolypeptideof506aminoacidsandaterminationcodon.Thesequenceshared
99.34%homologywiththereportedsequence(accessionnumberAF237672),butthehomologieswerevery
lowcomparedwithsimilargenesfromotherplants.ThegenewassubmittedtoGenBankandwasgiventhe
registrationnumberAY685182.Bioinformaticssoftwareswereusedtopredictandanalyzetheproteinfunction
andstructureofthe犃狋犎犓犜1genecDNAsequence.Themolecularweightofthededucedpolypeptideof犃狋犎
犓犜1was57.45kD.ThetheoreticalpIwas9.33.TheNterminalaminoacidsfrom1to40formedaclassicsig
nalpeptidesequence.Thepeptidefrom152to500wasaTrkHcationtransporterconserveddomain.Itmight
alsocarryproteinkinaseC,tyrosinekinase,cAMPandcGMPdependentproteinkinasephosphorylation,gly
cosylation,Nmyristoylationsitesandotherfunctionsites.Thededucedpeptidecontained10transmembrane
domains.ThetransmembranedomainsneartheNterminus,theCterminusandthemiddlepartofthepeptide
displayedhighhydrophobicity.Therefore,itissuggestedthatthegeneproductof犃狋犎犓犜1mightplayrolesin
facilitatingcationtransportation.
犓犲狔狑狅狉犱狊:犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪;highaffinitypotassiumtransporter;RTPCR;bioinformaticanalysis
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