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与南瓜短蔓基因连锁的分子标记



全 文 :园 艺 学 报 2011,38(增刊):2593 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com

收稿日期:2011–07–25
基金项目:广东省蔬菜新技术研究重点实验室项目
* 通信作者(E-mail:huhexu@21cn.com;Tel:13602797313)
与南瓜短蔓基因连锁的分子标记
王 瑞 1,黄河勋 1,*,林毓娥 1,梁肇均 1,陈清华 2
(1广东省农业科学院蔬菜研究所,广州 510640;2华南农业大学园艺学院,广州 510640)
矮生材料一直是作物育种中重要的种质资源。研究者在南瓜育种过程中发现了一个新的
短蔓印度南瓜(Cucurbita maxima D.)材料,为一对隐性核基因控制其矮生性状。
本试验中用 AFLP 技术拟寻找与该短蔓基因连锁的分子标记,希望为该矮生资源的分子
辅助育种提供理论依据。
供试材料为短蔓南瓜近等基因系,及母本多代自交系,F2代分离群体。在三叶期调查植株的长
蔓、短蔓性状,取长蔓植株和短蔓植株各 10株叶片,分别提取 DNA等量混合酶切连接,另外,F2
代分离群体全部植株分别采样,做好标记,提取 DNA。
采用 JoinMap V3.0软件分析所得 AFLP标记和短蔓基因之间的连锁关系。根据 F2代单株的长
蔓、短蔓田间调查记录,并按照 JoinMap V3.0 软件的规定进行命名:所得标记在 F2各单株电泳谱
带上的有无分别记作 d和 b。最终计算所得的 AFLP标记与矮生基因的遗传距离。
试验结果显示,用 64对 AFLP引物对两个相对基因池进行 PCR扩增,其中MCAG/ETT引物组
合在长蔓、短蔓池可以扩增出一条特异性条带。在杂合长蔓和纯合长蔓之间验证发现该条带在杂合
植株中稳定出现。进一步用MCAG/ETT在 F2代(69株)分离群体验证,其中有 4株短蔓植株没有
出现该特异条带。用 JoinMap V3.0分析软件进行分子标记连锁分析,计算MCAG/ETT与南瓜短蔓
基因之间的遗传距离,结果表明二者之间存在连锁关系,连锁距离为 11.3 cM。对引物MCAG/ETT
组合扩增得到的特异性片段进行回收、克隆、测序。测序结果显示,该片段去掉接头引物长 149 bp。
在 EBI数据库进行 BLAST分析,发现其与杨树的 CBL-interacting proteion kinase有 96%的同源
性。

关键词:南瓜;短蔓;分子标记
中图分类号:S 642.1 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)S-2593-01