作 者 :陈冬菊
期 刊 :福建农林大学 2011年 12期 页码:67
关键词:深度测序;小RNA;miRNA;拟南芥种子发育;表达模式;
摘 要 :小分子非编码RNA,包括microRNA (miRNA)和siRNA,在植物的转录后水平上起着重要的调控作用。利用深度测序技术检测模式植物中重要的小RNA,分析它们的表达模式和功能,是当前发现和研究植物小RNA的一条重要途径。 为了探究小RNA,(特别是miRNA)在拟南芥种子发育中所起到的作用,本研究对拟南芥种子三个发育时期(9 DAP,12 DAP,15 DAP)的小RNA深度测序数据进行生物信息学分析,主要结果如下: (1)三个种子发育时期的样品经SOLiD测序共获得8,630,738条能完全定位到拟南芥基因组上的小RNA序列,其中2,799,643条为唯一序列,表明拟南...