作 者 ：张帆
期 刊 ：吉林大学 2012年 09期 页码：60
关键词：基因芯片；基因表达数据；特征选择；SVM-RFE；差异表达基因；抗旱；
摘 要 ：本文针对拟南芥抗旱基因预测这一差异表达问题，用不同的特征选择方法基于基因芯片数据进行实验分析，以获得准确且有效的研究与农艺性状相关的特征基因的方法。分别从算法本身以及实验结果两方面进行了深入探讨。 首先通过传统的T-test和Fold change方法对拟南芥基因芯片数据的应用，分析传统方法存在的弊端。其次，对于高通量的基因芯片数据，难免掺杂一些噪声数据和界外值。故从度量基因表达数据变化幅度的角度，用平均绝对差（MADV）和改进的平均绝对差（IMADV）差异系数方法来寻找抗旱基因，模拟实验结果表明，其效果优于传统方法。 最后，针对植物芯片数据样本量小的问题，提出了用交叉验证方法改进...