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作 者 ：董小宝

期 刊 ：中国农业大学 2015年 07期 页码：105

关键词：植物免疫；三型效应蛋白；网络生物学；机器学习；

摘 要 ：细胞中复杂的基因互作可以通过网络生物学的理论加以明确表述。在有效的植物免疫响应的背后是众多免疫相关基因之间的精密协作。因此网络生物学的手段可以用于详细地解析植物中不同类型的免疫响应之间的异同之处。病原体相关分子模式激发的免疫(PTI)和效应蛋白激发的免疫(ETI)是植物对抗病原体入侵的两种主要的免疫响应类型。但是在全基因组的尺度,关于基因网络是如何组织并导致PTI和ETI之间的定量差异仍然尚未明确。作者结合先进的机器学习算法和模块化的网络分析,试图在三个网络尺度上系统地刻画拟南芥中PTI和ETI的组织原理。在单个网络节点或者边的水平,作者依据每个基因和基因互作在区分植物免疫响应和正常生长状态上...

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