全 文 :第 34 卷第 11 期
2014年 11月
环 境 科 学 学 报
Acta Scientiae Circumstantiae
Vol.34,No.11
Nov.,2014
基金项目:国家自然科学基金项目(No. 41201256)
Supported by the National Natural Science Foundation of China (No. 41201256)
作者简介:郑有坤(1990—) ,男,E-mail:zyktmx@ 163.com;* 通讯作者(责任作者),E-mail:gungyf@ 163.com
Biography:ZHENG Youkun (1990—) ,male,E-mail:zyktmx@ 163.com;* Corresponding author,E-mail:gungyf@ 163.com
DOI:10.13671 / j.hjkxxb.2014.0658
郑有坤,任丹,卢圣鄂,等.2014.铅锌矿区蜈蚣草内生放线菌的多样性及群落结构[J].环境科学学报,34(11) :2832-2838
Zheng Y K,Ren D,Lu S E,et al. 2014.Diversity and community structure of endophytic actinomycetes of Pteris vittata in a Pb-Zn mining area[J].Acta
Scientiae Circumstantiae,34(11) :2832-2838
铅锌矿区蜈蚣草内生放线菌的多样性及群落结构
郑有坤1,2,任丹1,卢圣鄂1,李小林1,张小平1,辜运富1,*
1. 四川农业大学资源环境学院,成都 611130
2. 云南大学,云南省微生物研究所,西南微生物多样性教育部重点实验室,昆明 650091
收稿日期:2014-01-11 修回日期:2014-03-11 录用日期:2014-03-12
摘要:为了认识重金属累积对植物内生菌的影响,采用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术及序列分析对四川
汉源铅锌矿区蜈蚣草内生放线菌的多样性进行了研究,并分析了内生放线菌多样性与 Pb、Zn、Cu和 Cd 等主要重金属之间的相互关系.结果表
明,蜈蚣草不同部分内生放线菌的群落结构和多样性存在一定的差异,多样性指数在 2.79~3.29之间,与其他非重金属污染环境植物内生放线
菌的多样性指数相似,说明在重金属污染地区仍然存在较为多样的内生放线菌类群.相关分析表明,蜈蚣草内生放线菌多样性指数与 Cu、Cd和
Pb的含量之间存在显著负相关. DGGE 条带序列系统发育显示,链霉菌(Streptomyces)、假诺卡氏菌(Pseudonocardia)、小单孢菌
(Micromonospora)、Xianggella为蜈蚣草内生放线菌优势类群,拟诺卡氏菌(Nocardiopsis)、小双孢菌(Microbispora)、马杜拉放线菌
(Actinomadura)、弗兰克氏菌(Frankia)以及一些未培养放线菌也在蜈蚣草中存在.研究表明铅锌矿区蜈蚣草内生放线菌存在丰富的多样性,重
金属的累积影响了内生放线菌的分布.
关键词:铅锌矿区;蜈蚣草;内生放线菌;群落结构;多样性
文章编号:0253-2468(2014)11-2832-07 中图分类号:X172 文献标识码:A
Diversity and community structure of endophytic actinomycetes of Pteris vittata
in a Pb-Zn mining area
ZHENG Youkun1,2,REN Dan1,LU Shenge1,LI Xiaolin1,ZHANG Xiaoping1,GU Yunfu1,*
1. College of Environmental and Resource Science,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130
2. Key Laboratory of Microbial Diversity in Southwest China,Ministry of Education,Yunnan Institute of Microbiology,Yunnan University,
Kunming 650091
Received 11 January 2014; received in revised form 11 March 2014; accepted 12 March 2014
Abstract:To better understand the impact of heavy metal accumulation on plant endophytes,this study employed both denaturing gradient gel
electrophoresis (DGGE)and sequencing techniques to investigate the diversity of endophytic actinomycetes in the Pteris vittata isolated from a zinc-lead
mine in Hanyuan of Sichuan Province,China. The relationship between the diversity of endophytic actinomycete community and the major heavy metals
like Pb,Zn,Cu and Cd was also examined. The results indicated that the diversity and community structure of endophytic actinomycetes varied among
different plant tissue parts. The value of Shannon-Wiener diversity index of endophytic actinomycetes,ranging from 2.79 to 3.29 and similar to those in
other unpollution environments,suggested that a high diversity of actinomycete species still occurred inside the P. vittata growing in areas contaminated by
heavy metal. Correlation analysis revealed a significant negatively correlation between the diversity index and the concentrations of Cu,Cd and Pb.
Phylogeny analysis of the DGGE bands showed that Streptomyces,Pseudonocardia,Micromonospora and Xianggella were the predominant species,and
Nocardiopsis,Microbispora,Actinomadura,Frankia and some uncultured actinomycetes could also colonize the P. vittata. Study results suggested that a
relatively high diversity of endophytic actinomycetes of the P. vittata in the zinc-lead mining area,and heavy metal accumulation affected the distribution
of endophytic actinomycetes.
Keywords:zinc-lead mining area;Pteris vittata;endophytic actinomycetes;diversity;community structure
11期 郑有坤等:铅锌矿区蜈蚣草内生放线菌的多样性及群落结构
1 引言(Introduction)
植物内生菌是指那些在其生活史的一定或全
部阶段生活于健康植物组织内部,而不使宿主植物
表现出明显感染症状的微生物菌群(邹文欣和谭仁
祥,2001).其广泛分布于植物的根、茎、叶、花、果
实、种子中,在促进植物生长、增强宿主抗逆性、强
化植物重金属富集能力等方面起着重要作用(Luo
et al.,2011;Ma et al.,2011;Shen et al.,2013;
Chen et al.,2014).因此,利用植物内生菌来进行重
金属污染土壤的修复,不仅可以克服微生物单独修
复时生物量小、难以存活、收集困难的缺点,而且还
能有效改善植物修复效果,具有较大的应用潜力
(姜敏等,2007).
近年来,有关植物内生菌与宿主植物联合修复
重金属污染土壤的研究也取得了一些进展,但主要
都集中在利用纯培养手段分析内生菌促进宿主生
长和重金属累积上,鲜有利用分子生物学技术从遗
传种群结构上探讨宿主植物重金属累积对内生菌
的影响(张新成,2012;Shen et al.,2013;刘莉华
等,2013;Chen et al.,2014).而对某一环境中微生
物的群落结构的认识是研究该环境微生物生态功
能的基础(肖炜等,2013).放线菌作为一类重要的
微生物类群,在重金属污染环境中亦广泛分布,且
对不同重金属具有吸附作用(Polti et al.,2007;Sun
et al.,2010).有研究表明,链霉菌可通过分泌具有
生物活性的代谢产物使水中的胶体悬浮物相互沉
淀,从而降低重金属的毒性(Nies,1999). Luo 等
(2011)从镉超富集植物龙葵(Solanum nigrum)中分
离得到 30株镉耐受性细菌,所有细菌都能促进宿主
植物生长和重金属富集,其中以放线菌门为主,占
所有菌株的 43%,揭示了放线菌在重金属污染修复
应用中具有极大的应用潜力.
铅锌矿区土壤重金属含量高,结构不良,养分
贫瘠,植物难以生长,极大的限制了矿区的修复工
作(张汉波等,2004).蜈蚣草(Pteris vittata)作为一
种砷超富集植物,不仅具有较强的砷富集能力,而
且对铅锌等重金属也具有一定的富集能力,在铅锌
矿区广泛分布,在重金属污染土壤的生物修复中具
有很好的应用价值和潜力(Ma et al.,2001;刘月莉
等,2009;谢景千等,2010).本文以采集自四川汉
源铅锌矿区的蜈蚣草为研究对象,利用变性梯度凝
胶电泳 (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,
DGGE)从免培养角度分析了蜈蚣草内生放线菌的
种群结构和多样性,以期为挖掘重金属污染地区植
物内生放线菌资源,为深入认识重金属污染环境下
内生菌与植物之间的互作机制提供科学依据.
2 材料与方法(Materials and methods)
2.1 样品采集
蜈蚣草及土壤样品采自四川省汉源县万顺铅
锌矿区.该矿区位于四川省流沙河下游左岸,地理位
置为 N 29°2317″ ~ 29°2358″,E 102°3802″ ~ 102°
3814″,海拔在 800~1200 m之间,四季分明,年平均
气温 17.9 ℃,年均降雨量 780 mm,无霜期 300 d.野
外调查发现,蜈蚣草在该矿区广泛分布.根据矿区污
染情况,距离尾矿堆积区不同距离采样.4 个采样区
分别位于尾矿堆积区、选矿区、弃渣场、进山口,编
号依次为 H1 ~ H4.随机多株采集生长良好的蜈蚣
草,装入无菌密封塑料袋中,贴上标签,立即带回实
验室,置于 4 ℃冰箱保存.采样区土壤理化性质及部
分重金属含量如表 1所示.
表 1 采样区土壤基本理化性质及部分重金属含量(李小林等,2011)
Table 1 Part of the soil physicochemical properties and heavy metal content
土样编号 采样点 pH 含水率
全氮 /
(g·kg-1)
有机碳 /
(g·kg-1)
有效态 Cu /
(mg·kg-1)
有效态 Cd /
(mg·kg-1)
有效态 Zn /
(mg·kg-1)
有效态 Pb /
(mg·kg-1)
H1 尾矿区 7.71 3.88% 0.10 4.73 3.40 8 790 883
H2 选矿区 7.63 6.73% 0.11 5.10 0.53 1 81 60
H3 弃渣场 7.78 7.15% 0.09 3.85 0.72 2 133 78
H4 进山口 7.78 3.32% 0.12 5.67 0.88 5 200 324
2.2 蜈蚣草重金属含量的测定
将蜈蚣草按根、叶柄和羽叶分开,先用蒸馏水
洗净,再用去离子水冲洗数遍,自然风干后置于烘
箱 105 ℃杀青 30 min,80 ℃烘干至恒重,研磨,过
筛,经 HNO3-HClO4(体积比 4∶1)消化后,采用 ICP-
AES(IRIS Intrepid)光谱分析仪测定 Pb、Zn、Cu 和
Cd的全量.
3382
环 境 科 学 学 报 34卷
2.3 蜈蚣草内生放线菌群落结构分析
2.3.1 蜈蚣草总 DNA的提取 蜈蚣草总 DNA的提
取参照 Tian 等(2007)的方法进行.经 1.5%的琼脂
糖凝胶电泳检测后置于-20 ℃保存备用.
2.3. 2 内生放线菌 16S rRNA 基因扩增 应用
S1000TM Thermal Cycler (BIO-RAD,USA)进行 PCR
扩增.以提取的总 DNA 为模板,F243 (GGATGA
GCCCGCGGCCTA)(5 3,下同)和 R1378 (CGGT
GTGTACAAGGCCCGGGAACG)(Heuer et al.,1997)
为引物进行巢氏 PCR 第一轮扩增. PCR 体系(50
μL):2× Taq PCR Master Mix 25 μL (TIANGEN) ,
引物 1 (10 μmol·L-1)和引物 2 (10 μmol·L-1)各
1.0 μL,10倍稀释的 DNA模板 1 μL,ddH2O 补足至
50 μL.扩增程序:94 ℃预变性 5 min;94 ℃变性 1
min,63 ℃—53 ℃退火 50 s (每个循环温度降低 0.5
℃),72 ℃延伸 1.5 min,20个循环;然后 94 ℃变性 1
min,53 ℃退火 50 s,72 ℃延伸 1.5 min,15 个循环,
72 ℃延伸 10 min.第二轮 PCR 扩增以第一轮 PCR
产物稀释 100 倍为模板,所用引物为 R1378 和
F984GC (gc-AACGCGAAGAACCTTAC)(Heuer et al.,
1997) ,gc 夹子序列为(5- CGCCCGGGGCGCGCCC
CGGGCGGGGCGGGGGCACGGG-GGG-3) (Heuer
et al.,1997). PCR 体系和条件与第一轮相同.产物
于 1. 5%琼脂糖凝胶电泳检测后用上海生工的
SanPrep柱式 PCR 产物纯化试剂盒对 PCR 产物进
行纯化.
2.3.3 变性梯度凝胶电泳 将纯化后的 PCR 产物
用 BIO-RAD公司的凝胶电泳仪进行变性梯度凝胶
电泳(DGGE).聚丙烯酰胺凝胶(丙烯酰胺:双丙烯
酰胺 = 37. 5 ∶ 1)浓度为 8%,变性剂浓度范围为
30%~60% (100%的变性剂为 7 mol·L-1尿素,40%
甲酰胺),电泳缓冲液为 1×TAE,150 V 电压下,60
℃恒温电泳 6 h,银染.染色后用照相机拍照.
2.3.4 DGGE条带的回收测序及系统发育分析 将
特征条带进行产物回收,以此为模版,用不带 gc 夹
子的引物 F984 /R1378进行 PCR 扩增,PCR 体系及
条件按 1.3.2节所述方法进行.用 SanPrep 柱式 PCR
产物纯化试剂盒(上海生工)对 PCR产物进行纯化.
将纯化后的 PCR 产物用 pMD19-T Vector(TaKaRa)
进行连接,转化大肠杆菌感受态细胞 DH5α,挑选阳
性克隆子,进行菌株 PCR 检测.测序由上海生工生
物技术服务有限公司完成.所有测序结果去除载体
序列,在 GenBank 中进行 BLAST 分析(http:/ /blast.
ncbi.nlm.nih.gov /),将获得的同源序列和测定序列
用 Clustal X 进行分析,采用 MEGA 5.0 软件包中的
Kimura2-Parameter Distance 模型进行序列匹配,用
邻接法(neighbor-joining)构建系统发育树,自展值
(Bootstrap)为 1000(Tamura et al.,2011).共获得 9
个有效序列,在 NCBI 数据库中的序列登录号:
KF285432-KF285440.
2.4 数据处理与分析
DGGE图谱采用 Quantity One 软件(BIO-RAD)
分析.以多样性指数(H)、丰富度指数(S)和均匀度
指数(EH)等指标来评估蜈蚣草各器官中内生放线
菌的物种多样性(Hill et al.,2003).
H =-∑Pi·lnPi (1)
EH = H /Hmax =H / lnS (2)
式中,Pi是蜈蚣草某个器官中单一条带的强度在该
器官中所有条带强度的比率,S 是蜈蚣草某个器官
中所有条带数目的总和.
采用 SPSS 17.0(SPSS Inc.,Chicago)软件对数
据进行相关分析以及方差分析和显著性检验.
3 结果与分析(Results and analysis)
3.1 蜈蚣草中重金属含量分析
对采自汉源铅锌矿区的蜈蚣草体内的 4种重金
属含量分析结果表明(表2),蜈蚣草对土壤重金属
表 2 蜈蚣草不同器官重金属含量
Table 2 Heavy metal concentrations in different organs of P. vittata
样点编号 分析部位
Cu /
(mg·kg-1)
Cd /
(mg·kg-1)
Zn /
(mg·kg-1)
Pb /
(mg·kg-1)
H1 根 65±7a 36±3a 981±25c 587±59a
叶柄 58±2ab 33±9a 1266±221b 528±19b
羽叶 12±7e 15±2c 1261±16b 137±5f
H2 根 56±5b 32±1a 1021±88c 449±28c
叶柄 50±3b 26±3b 1240±20b 466±7c
羽叶 36±2c 24±2b 1020±6c 291±3e
H3 根 41±9c 26±2b 996±3c 364±38d
叶柄 23±4d 14±3c 1223±2b 281±2e
羽叶 11±3e 11±2c 1720±96a 104±8g
H4 根 33±2c 20±3bc 981±7c 362±20d
叶柄 14±2e 9±2d 1212±10b 164±6f
羽叶 24±6d 21±1b 1290±55b 320±10e
注:表中的数据为均值±3个重复的标准差;数据间的差异程度采用 LSD
法检验,同列数值后标注的不同字母代表差异显著(p 0.05),下表同.
Note:Data in table are average ± SD of three replicates. Different letters
following the means within a column indicate significantly difference at 5% level
using LSD test. The same here in after.
4382
→
11期 郑有坤等:铅锌矿区蜈蚣草内生放线菌的多样性及群落结构
的吸收差异比较显著.与土壤中 4 种重金属元素相
比,蜈蚣草各部分的重金属含量均相对较高,表明
蜈蚣草对 4种重金属元素均有一定的富集能力.与
一般植物的平均含量相比(Pb 5 mg·kg-1;Zn 100
mg·kg-1;Cd 0 mg·kg-1;Cu 10 mg·kg-1) (何兰兰等,
2009) ,蜈蚣草 Pb含量是一般植物的 21~117倍,Zn
为 10~17倍,Cu 是 1 ~ 6 倍,Cd 含量也较高.但所有
重金属含量均未达到超富集植物的标准(何兰兰
等,2009).Pb、Cd、Cu 3 种重金属元素均呈地下部
分高于地上部分的趋势,而 Zn 的含量则相反,即蜈
蚣草对 Pb、Cd、Cu 3 种重金属元素的转移能力较
低,而对 Zn元素的转移能力较高.
3.2 蜈蚣草内生放线菌 16S rRNA基因的 DGGE图
谱分析
微生物群落的多样性可以通过 DGGE 条带的
多少在一定程度上得以反映(Gu et al.,2009).蜈蚣
草内生放线菌 16S rRNA 基因的 DGGE 图谱如图 1
所示.从 DGGE图谱可以看出,每个泳道能检测到数
目不等的条带,且各泳道条带的迁移率和亮度也不
相同,表明铅锌矿区不同重金属污染程度土壤上生
长的蜈蚣草各部位内生放线菌存在一定的差异.条
带 1R2、3S1 和 3S2 为所有泳道中共有的条带,表明
这些条带所代表的内生放线菌类群为该矿区蜈蚣
草优势内生放线菌类群.
图 1 蜈蚣草内生放线菌 16S rRNA基因的 DGGE图谱(注:1R
~4R,1S~4S,1L ~ 4L 分别代表蜈蚣草样品 H1 ~ H4 的
根,叶柄和羽叶)
Fig.1 DGGE analysis of endophytic actinomycetes 16S rRNA PCR
products in P. vittata (Note:1R ~ 4R,1S ~ 4S,1L ~ 4L
represent root, petiole and leatherleaf of the P. vittata
isolated from sampling site of H1 to H4,respectively)
3.3 DGGE 条带的多样性指数(H)、丰富度指数
(S)和均匀度指数(EH)
根据 DGGE 图谱对蜈蚣草内生放线菌多样性
指数(H)、丰富度指数(S)和均匀度指数(EH)进行
计算,结果见表 3.从表 3可以看出,4 份蜈蚣草样品
不同部位内生放线菌多样性指数、丰富度指数以及
均匀度指数在一定程度上都存在差异,多样性指数
在 2.79~3.29 之间,丰富度指数在 6 ~ 14 之间,均匀
度指数在 0.99 ~ 1.47 之间.其中多样性指数和丰富
度指数均为地上部分大于地下部分,部分差异显著
(p<0.05) ,而 4 份样品的均匀度指数之间没有显著
的差异.
表 3 蜈蚣草内生放线菌的多样性指数、丰富度指数和均匀度指数
Table 3 Shannon-Wiener diversity index(H) ,Evenness(EH)and
Richness(S)of endophytic actinomycetes in P. vittata
样点编号 部位
多样性指数
(H)
丰富度指数
(S)
均匀度指数
(EH)
H1 根 2.79±0.03f 9±0.33d 0.99±0.01a
叶柄 2.85±0.02f 9±0.58d 1.24±0.04a
羽叶 3.12±0.04bc 14±1.0ab 0.99±0.01a
H2 根 2.82±0.03f 6±0.58e 0.99±0.01a
叶柄 2.89±0.01ef 13±0.58b 1.04±0.04a
羽叶 2.88±0.03ef 10±1.0cd 1.43±0.02a
H3 根 2.88±0.03ef 10±0.67cd 1.24±0.05a
叶柄 3.06±0.06c 12±0.58bc 1.47±0.04a
羽叶 3.29±0.03a 12±0.58bc 1.44±0.03a
H4 根 2.91±0.02def 8±0.58d 1.40±0.01a
叶柄 3.16±0.06b 11±0.58c 1.40±0.10a
羽叶 2.96±0.08d 15±0.58a 0.99±0.01a
3.4 系统发育分析
将不同条带切胶回收并测序,共得到 9 条有效
序列(序列编号对应条带见图 1).将所得序列进行
系统发育分析,构建系统发育树(图 2).
系统发育分析显示,蜈蚣草内生放线菌主要与链
霉菌(Streptomyces)、假诺卡氏菌(Pseudonocardia)、拟诺
卡氏菌(Nocardiopsis)、小单孢菌(Micromonospora)、小
双孢菌(Microbispora)、马杜拉放线菌(Actinomadura)、
弗兰克氏菌(Frankia)、Xianggella 以及一些未培养放
线菌之间的相似性最近.在 16S rRNA 序列分析中,
所有序列与 GenBank中已知序列的相似性在 97%~
100%之间.
条带 1R2、3R1、3S1 和 3S2 是所有样品共有的
序列,分别与小单孢菌、Xiangella、假诺卡氏菌和链
霉菌相似性最高,代表了蜈蚣草内生放线菌共有的
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环 境 科 学 学 报 34卷
类 群. 条 带 1R2 与 Micromonospora sp. 41766
(JQ885666)相似性最高,为 99%,条带 3S1 与
Pseudonocardia petroleophila (JN180178)的相似性
为 98%,条带 3R1 与 Xiangella phaseoli(JQ073732)
具有 99%的相似性,3S2与未培养放线菌 Uncultured
Streptomyces sp. Sp11(AY707846)相似性达 100%,
表明蜈蚣草中尚存在未培养的放线菌类群.值得注
意的是,Xiangella 是最近才从菜豆 (Phaseolus
vulgaris)根内分离到的一个新属(Wang et al.,
2013) ,而该菌在蜈蚣草中广泛分布,表明该属放线
菌可能具有特殊的生态功能.条带 4L1仅在 H4样品
的叶中检测到,序列分析结果表明其与未培养放线
菌 Uncultured Frankia sp. (JF516159)相似性最高,
为 99%.
图 2 蜈蚣草内生放线菌 16S rRNA DGGE条带系统发育分析
Fig.2 Phylogenetic analysis of 16S rRNA gene sequences of endophytic actinomycetes in P. vittata from DGGE bands. Bootstrap values were
calculated from 1000 replications of Kimura 2-parameter,and bootstrap values higher than 50% are shown. The scale bar represents 0.05
changes per sequence position
3.5 蜈蚣草重金属含量与内生放线菌多样性指数
的相关性分析
从表 4 可见,蜈蚣草内生放线菌多样性指数和
蜈蚣草中 Cu、Cd和 Pb的含量之间存在显著负相关
(p<0.05) ,而与 Zn 的含量呈正相关,但未达到显著
水平.
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11期 郑有坤等:铅锌矿区蜈蚣草内生放线菌的多样性及群落结构
表 4 蜈蚣草重金属含量与内生放线菌多样性指数的相关性分析
Table 4 Correlation analysis between the heavy metal amounts and
Shannon-Wiener diversity index (H ) of endophytic
actinomycetes in P. vittata
Cu Cd Zn Pb
H -0.811* -0.839* 0.613 -0.819*
注:* 表示在 0.05的水平上达到显著差异.
Note:* mean significantly different at 0.05 levels.
4 讨论(Discussion)
本文采用免培养手段 PCR-DGGE 研究了四川
汉源铅锌矿区优势植物蜈蚣草内生放线菌类群,并
分析了蜈蚣草重金属累积对放线菌类群的影响.群
落结构分析表明,链霉菌、假诺卡氏菌、拟诺卡氏
菌、小单孢菌、小双孢菌、马杜拉放线菌等放线菌类
群在蜈蚣草中均有分布,这与之前对其他非矿区植
物内生放线菌的研究结果相似,表明这些放线菌群
具有广泛的生态适应性(Qin et al.,2011).相关分
析表明,汉源铅锌矿区蜈蚣草内生放线菌多样性与
Cu、Cd 和 Pb 的含量之间存在显著负相关(p <
0. 05) ,而与含量最高的 Zn 之间相关性却不显著,
推测这可能与放线菌对各重金属离子的耐受能力
不同有关.这也从另一方面说明在长期受到重金属
污染的自然环境中,不同重金属浓度对微生物多样
性的影响可能并非简单的线性关系(谢学辉等,
2012).
DGGE分析结果表明,蜈蚣草内生放线菌地下
部分的多样性普遍低于地上部分(表 3) ,这与之前
关于植物地下部分内生放线菌通常多于地上部分
的结果刚好相反(赵珂等,2011).结合蜈蚣草重金
属含量分析(表 2)和内生放线菌多样性指数与重金
属含量之间的相关性分析(表 4) ,可以初步推断出
现这种现象的原因可能是由于根中重金属的累积
影响了内生放线菌的定殖和分布.而这一结果与之
前对矿区植物内生真菌的研究结果也一致,说明重
金属的富集确实改变了植物内生菌的分布格局(郑
有坤等,2013).
物种多样性是指群落中物种种类的多少,是衡
量群落规模和重要性的基础.一般来说,种类越多,
分布越均匀,物种多样性指数越大(王慧等,2006).
汉源铅锌矿区蜈蚣草内生放线菌的多样性指数在
2. 79~3.29 之间(表 3) ,与已报道的非矿区植物内
生放线菌多样性指数相比并不算低.如张波等
(2013)报道四川甘孜地区药用植物花苜蓿
(Medicago ruthenica)内生放线菌的多样性指数在
2. 39~2.74 之间,Qin 等(2012)报道西双版纳热带
雨林植物滇南美登木(Maytenus austroyunnanensis)
根茎叶内生放线菌的多样性指数在 2.24 ~ 3.40 之
间.可以看出,矿区植物内生放线菌多样性还是相当
高的.由此可以推测在重金属污染地区仍然存在多
种重金属耐受的内生放线菌类群,这些内生放线菌
的存在可能对矿区土壤的生态修复具有重要意义.
但是,在多种重金属富集植物中均分离到的具有较
强重金属耐受性放线菌如节杆菌(Arthrobacter)和微
杆菌(Microbacterium)在本研究中却未检测到(Sun
et al.,2010;Luo et al.,2011;张新成,2012).因
此,在今后的研究中可以结合纯培养手段和高通量
测序来全面认识铅锌矿区蜈蚣草的内生放线菌种
群资源,对这些内生放线菌资源的生理生化特性、
特殊代谢产物和特殊功能基因进行深入研究,以便
深入认识蜈蚣草内生放线菌资源在重金属胁迫环
境中的生态功能.
5 结论(Conclusions)
本文通过免培养手段分析了铅锌矿区蜈蚣草
内生放线菌的种群结构特征,结果发现蜈蚣草根、
叶柄和羽叶中内生放线菌的群落结构和多样性存
在一定的差异,其中根部的多样性指数最低,这与
重金属在根中的累积密切相关.内生放线菌多样性
指数与 Cu、Cd 和 Pb 的含量之间存在显著负相关
(p<0.05).链霉菌、假诺卡氏菌、拟诺卡氏菌、小单孢
菌、小双孢菌、马杜拉放线菌等放线菌在蜈蚣草中
均有分布,显示出蜈蚣草内生放线菌具有明显多样
性特征.
责任作者简介:辜运富,男,博士,副教授,博士学位.主要从
事土壤分子生态学科研工作.
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