全 文 ：生态科学2005年11月第24卷第4期 ECoLoGICSC ENCENoV，2005，24(4)：368～372
微卫星位点筛选方法综述
曾庆国1，陈艺燕2(1．宁波市海洋渔业研究院，宁波315012；2暨南大学水生生物研究所，广卅『510632)
【摘要】 微卫星标记因其丰富的多态性和共显性等特点，已得到了广泛的应用。应用微卫星标记首先需要歌得微卫
星位点的序列信息，用来设计引物。获得擞卫星位点的方法有多种，本文综述了获得和富集微卫星侥点的常用方法。
虽简便、最省时的方法是从公共数据库(如EMBL、Genb龃k、EsT数据库等)或已发表的文献中查找到微甲星位点，
但只限于已经有序列数据发布的物种。第二种方法是种问转移扩增，即从相近物种的数据库中查找微卫星位点，或使
用已有数据发表的遗传距离相近物种的微卫星标I己。第三种方法是从基因组DNA中筛选微卫星何点，其中用于富集微
卫星的方法有引物法、磁珠杂交法、尼龙膜杂交法以及RAPD技术法。
关键词I微卫星；EsT_ssRs：种间转移扩增；磁珠杂交：尼龙膜杂叟：RAPD
中图分类号：075 文献标识码：A 文章编号：1008_8873(2005)04—368一05
TheMe山0dsO“∞IatingMicrosatemteL0ci
ZENGOing．gu01，CHENYi．y粕1(1．NingboInstitutcsfbrOcea工IandFlsheries。Nin曲o315012；2．InstituteofHydroblologv，
Jin趾Unive疆i毗Guangzhou510632，ChiⅡa)
AbstractMicrosalelliteDNAhasbeenshowntobehi曲1ypolymolphicatldcodominalltndmereforequ№use龟lasagood
genedcmarkeLHowever，tIlewideunllza60nofmlcmsaIell他markerishindcr dbythedi茁cultyofobtainingmicros砷：lliIe
10cif如mintere啦ingspeciesR cently，m卸ymenlo出baveeend velopedfortheis01adonofmicmsatell沁loci．Amongthese
methods，databasese rchingisthemostconvenjentm thodf rob诅iningnewmicros如11ite0ci，such嬲acqui—ngp一1tlers
丘伽l叫blished1n ra协I℃s．Infecent”ars，withthemcreaseofESTda诅base，SSRsexplored舶mdbEST11aveb enusedin
m蚰yspeciesInaddition，meconservationofrepeatsequenceandnankingre ionsacmsstaxamakesit possiblethat
mlcrosateUitepnmersfromonespeciescaIlbeusedtodetectpolymorphismathom01090惦sitesinrelatedspeciesThe1嬲t
mc协odistoexploitm crosatelliteIocif如mgenomicDNA，mcludingmeⅡaditionalmethodofgen舢如libraryandmenovel
aDDroachfennchedlibmrysuchasmagrleticbeadhvbndizationandnyloⅡmeⅡ山ranehyb打diza廿叽．
Keywords：Microsacell沁(ssR)；EsT_SsRs；Interspeci矗ctmrlsferaInp|incation；Magneticb髓dhybdd 2ation；Nylon
membmehvb五dl盈tiOn：RAPD
微卫星(Microsatellite)，又称为简单序列重复
(simplesequenceRepeat，ssR)，短串联重复(short
ThdcmRc口eatSTR)，是以少数几个核苷酸(一般2～
4个)为重复单位的串联重复DNA序列。微卫星位点
广泛分布于真核生物的基因组中⋯，在植物基因组中
平均每33Kb存在一个20bD长的微卫星位点，而在
哺乳动物中每6Kb存在一个20b口长的微卫星位
点【“。webre和Mav对Genbank数据库中人类
(肋ⅢDJ印耙H)的(cA)。微卫星序列进行了系统研究，
在检测的8个位点中有7个产生了重复数日上的变化，
显示了极高的多态性。
微卫星标记具有高度的多态性和丰富的信息含
量。Powell用RFLP、RAPD、AFLP和sSR标记进行
了大豆种质分析，结果微卫星标记显示出最高的期卓
杂合度¨J。微卫星标记共显性的特点使它能够用于研
究等位基因，区分二倍体(或多倍体)的纯合体或杂
合体，这是AFLP、RAPD等显性标记所无法做到的。
另外，微卫星的特异性引物扩增具有良好的重复性和
保真性，方便各实验室间的交流。目前，微卫星标记
已被广泛应用到基因连锁与遗传图谱构建”l、遗传多
样性研究口J、谱系和发育研究【6J、疾病检测口1以及品种
鉴定、亲本分析与个体、纯系检验lⅢ4J。
微卫星标记分离最大的困难是引物的获得。同
RAPD、AFLP等遗传标记不同，微卫星研究首先需要
获知位点的序列信息，以便从重复序列两端侧翼的保
守序列中设计引物。目前已知微卫星位点的物种很有
限，这是因为微卫星位点的获得需经过克隆、杂交筛
选、测序等步骤，因此需花费。定的人／b、金钱，这
限制了微p星标记的大量使用。但近年来发展起来
的各种微卫星位点富集技术已在一定程度上解决了
收稿日期：2005．07_ol收稿，2005一ll一13接受
基金项目：宁波科技局青年基金资助项目(No2005A620026)
作者简介：曾庆国(1977)，男，倾士，主璺从事海洋生物遗传艟分千
生物学研究，E—mall：2qg叫@yaboocom．cn
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372 生态科学 24卷
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微卫星位点筛选方法综述
作者： 曾庆国， 陈艺燕， ZENG Qing-guo， CHEN Yi-yan
作者单位： 曾庆国,ZENG Qing-guo(宁波市海洋渔业研究院,宁波,315012)， 陈艺燕,CHEN Yi-yan(暨南
大学水生生物研究所,广州,510632)
刊名： 生态科学
英文刊名： ECOLOGIC SCIENCE
年，卷(期)： 2005,24(4)
被引用次数： 9次

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