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A new method of instantly measuring leaf area in large batches:a case study of Spartina alterniflora

大批量测定植物(互花米草)叶面积的一种新方法


叶面积的准确测定是评价生态系统能流、碳流和水分利用的重要基础.目前常用的叶面积测定方法都有其局限性,有些方法快捷、准确,但仅适用于小批量测定;大多数方法很难在较短时间内准确进行大批量测定.本文以互花米草叶面积测定为例,探讨了以扫描仪和叶片干重为基础,结合PHOTOSHOP图像处理技术,大批量、快捷、准确测定植物叶面积的方法——扫描-干重法.结果表明:虚拟正方形叶片边长与叶子像素成幂函数曲线关系,公式为419.85x1.9693,R≈1.00;用此公式验证扫描-干重法,相对误差仅为3.651%.用扫描-干重法测得的结果与方格法相比无显著差异(P=0.473),表明该方法是可行的.

Accurate measurement of leaf area is a foundation for evaluating energy flux, carbon flux, and water using of ecosystem. Current methods for measuring leaf area have various limitations and scope of use. Some of them are easy-to-use and accurate, but can only be used for small batches. It is very difficult for most methods to measure leaf areas in large batches in a relatively short period of time. In this study, we took Spartina alterniflora as an example to discuss a method based on scanner and dry-leaves weight, combined with Photoshop image processing technology, which can measure leaf areas instantly in large batches. Tested by a known power function relation between leaf length (y) and leaf pixel (x), ie. y=419.85x1.9693 (R≈1.00), our new method only yielded 3.651% (n=30) relative error. There were no significant difference between this method and a classic square method (P=0.473). It is concluded that this method can be used to measure leaf area in large batches in a relatively short period of time, and to measure various shapes of leaves with little change in the vein.


全 文 :第26卷第4期
2007年8月
生态
Ecological
科学
Science
26(4):327-331
Aug.2007
大批量测定植物(互花米草)叶面积的一种新方法
赵聪蛟,邓自发,周长芳,陈 琳,刘静娜,安树青+,申瑞玲
南京大学生命科学学院,湿地生态研究所,南京210093
【摘要】 叶面积的准确测定是评价生态系统能流、碳流和水分利用的重要基础。目前常用的叶面积测定方法都有其局
限性,有些方法快捷、准确,但仅适用于小批量测定;大多数方法很难在较短时间内准确进行大批量测定。本文以互花
米草叶面积测定为例,探讨了以扫描仪和叶片干重为基础,结合PHOTOSHOP图像处理技术,大批量、快捷、准确测定
植物叶面积的方法一一扫描.干重法。结果表明:虚拟正方形叶片边长与叶子像素成幂函数曲线关系,公式为Y=
419.85x1.9693)R≈1.00;用此公式验证扫描.干重法,相对误差仅为3.651%。用扫描.干重法测得的结果与方格法相比
无显著差异俨=0.473),表明该方法是可行的。
关键词:扫描仪;互花米草;叶面积;像素;叶面积曲线
中图分类号:Q94.3 文献标识码:A 文章编号:1008—8873(2007)04—327-05
Anewmethodofinstantlymeasuringleafareainlargebatches:acasestudyof
Spartinaalterniflora
,。
ZHAOCong-jiao,DENGZi—fa,ZHOUChang-fang,CHENLin,LIUJing—na,ANShu-qing*,SHENRui-ling
SchoolofLjfeScienceandInstituteofWetlandEcology,NanjingUniversity,Nanjing210093,China
Abstract:Accuratemeasur mentofl afareaisafoundationforevaluatingenergyflux,carbonflux,andwaterusingof
ecosystem.Currentmethodsformeasuringleafreah vevariouslimitationsandscopeofuse.Somefthemareasy—to-useand
accurate.butcanonlybeusedforsmallbatches.ItiSverydi饿cultformostmethodstomeasureleafareasinlargebatchesina
relativelyshortperiodoftime.Inthistudy,wetookSpartinaalternifloraasanexampletodiscussamethodbasedonscanner
andry—leavesweight,combinedwithPhotoshopimagerocessingtechnology,whichcanmeasureleafareasinstantlyinlarge
batches.Testedbyaknownpowerfunctionrelationbetweenl aflength(y)andleafpixel(X),ie.Y=419.85x1.9693(R≈1.00),our
newmethodonlyyielded3.651%fn=30)relativeerror.Therew nosignificantdifferencebetweenthismethodandaclassic
squaremethodrP=O.473).ItisconcludedthatthismethodCanbeusedtomeasureleafreainlargebatchesinarelativelyshort
periodoftime,andtomeasurevariousshapesofleaveswithlittlechangeinthevein.
Keywords:scanner;Spaninaalterniflora;leafa ea;pixel;leafareacurve

收稿日期:2007.06.03-收稿,2007.07.20接受
基金项目;国家自然科学基金资助项目(30400054)
作者简介:赵聪蛟(1981一),男,河北省柏乡县人,硕士研究生,主要研究方向为湿地生态学、生物入侵生态学
+通讯作者,Tel:025.83594560
万方数据
328 生态科学EcologicalScience 26卷
3主要仪器及软件(Instrumentsandsoftware)
1前言(Introduction)
叶片是生态系统中气、水和能量交换的重要结
构平刽Ij;叶面积的准确测定对于评价生态系统的碳
流、光能和水分利用起到关键作用;光合、蒸腾、
呼吸以及光获取(1ightinterception)都直接涉及到叶
面积,而这些又是计算植物生物量和叶面积指数
(LAI)的基础【23】。叶面积总量影响生态系统中的
许多进程,尤其是影响生态系统的初级生产力;叶
面积还可以用于不同生态系统之间的比较研究【4】。叶
面积的大小对植物生长发育、抗逆性等生理功能有
很大影响,是评价环境因子效应的重要生长指标【5J。
树叶面积的大小是造林经营、理想株型选育和造林
密度的重要研究内容,叶片总面积也是农作物的产
量和品质的评价指标蚓,测定害虫食叶面积也是研究
害虫危害损失、经济阈值的重要内犁¨。因此叶面积
的快速、准确测量是研究叶面积的前提。目前常用
的叶面积测定方法主要有:方格法、叶面积仪法、
求积仪法、图形分解法、抛物线法、系数法、回归
方程法、图像处理法等瞄J。每种方法都有其局限性和
使用范围,针对不同的植物、不同品种和不同目的,
选择合适的测量方法是必不可少的【5J。
本文以互花米草叶面积测定为例,探讨了以扫描
仪和叶片干重为基础,结合PHOTOSHOP图像处理技
术,大批量、快捷、准确测定植物叶面积的方法一
扫描.干重法,并与其他测定方法进行了比较,以期为
研究植物的叶面积及其生态学特征提供方法依据。
2实验材料(Materials)
互花米草(SpartinaalternifloraLoisel.)为多年
生草本,具有耐盐耐淹[9】、根系发达、繁殖力强等特
点,种群扩张迅速,通常是海滨盐沼优势种【1叫到。
我国于1979年自美国引进互花米草,由于气候等条
件的适宜,使其迅速蔓延;目前,北起天津南至广
西的沿海滩涂,均可见广阔的互花米草盐沼ll3’㈧,
互花米草在中国东南沿海各省的爆发已成为近年来
’我国有关生物入侵问题中争论的焦点【15|,米草属植
物也因此成为研究生物入侵生态学、入侵与全球变
化互作和入侵遗传学特征的模式植物¨6|。
实验材料取自南京大学浦口校区生态智能温
室。2006年9月从互花米草人工种群随机取30株单
株茎叶,带回实验室分析。
平台式扫描仪PiustekOpticPro1236P(或其他
型号),普通台式电脑(可安装扫描仪并运行
Photoshop软件即可);标准坐标纸;软件Photoshop
9.0,SPSS13.0,Excel。
4测定方法(Methods)
4.1扫描.千重法(w1)
4.1.1单叶面积测定原理
用扫描仪扫描单片叶子,可得到单叶像素(DS)。
如果在扫描叶子的同时,将已知面积的标准参照与
叶予同时扫描,得到参照像素(CS),就可以算出单
片叶子的面积。
4.1.2操作
取一张白色A4复印纸,作为试验用标准背景板,
在左上角精确绘出边长5cmX5cm的正方形,并涂
成黑色,作为标准参照,参照面积为CJ=25cm2。把
扫描仪正确连接到电脑,将每一株互花米草的第三个
全展叶片(从上到下数)平铺在扫描仪玻璃板上(互花
米草的叶子较长,人为将其裁成3~5段,再平铺在
玻璃板上),盖上标准背景板,使标准参照面朝下(注
意叶片不要与标准参照交叉重叠)。打开Photoshop
CS2(9.0版本),设置RGBColor(彩色)模式,取
分辨率为100dpi,扫描得到单叶像素和标准参照像
素,记录数据。扫描后的叶子做80土1℃烘干48h处
理,分析天平(d=0.1mg)称取干重。由此,分别
获得单株单叶干重(DZ)与单株全叶干重(QZ)。
4.1.3叶面积计算
单株单叶面积(DJ)=DS÷CSxCJ ①
单株全部叶面积(QJ)=QZ÷DZ×DJ②
4.2叶面积曲线法(w2) 。
用以验证用全株叶子干重计算全株叶面积的可
行性,方法如下:
扫描仪所获图像由许多像素点组成,像素点越
多,表示叶片的面积就越大【7,|7】。取边长为1cm、2cm、
3cm、4cm、5cm、6cm的正方形纸片(代表叶片)
各三个,进行扫描。可得出叶片边长与像素点的相
关关系。添加趋势线进行拟合,可得到虚拟正方形
叶片边长x与叶子像素y的关联函数曲线,即叶面
积曲线,并得出由x计算Y的公式I。把公式I变
形,反推出由叶子像素Y计算叶片边长X的公式II,
万方数据
4期 赵聪蛟,等:大批量测定植物叶面积的一种新方法——以互花米草叶面积测定为例 329
表1扫描-千重法(W1)和叶面积曲线法Or2)测得的互花米草全株叶面积(n=30)
塑垒望!兰竺丛苎翌墅!!璺唑!竺丝竺丝竺竺!璺!坚堡垒坠羔叟!苎坚璺!!鱼三三壁!:
序号sequenceWI W2 序号sequenceW1 W2 序号sequenceWl W2
number(cm2)(cm2)number(cm2)(cm2)number (cm2)(cm2)
1 148.6244152.8329 11 233.8283242.1541 21 396.285413.7848
298.8908
390.4004
139.9682
169.6869
269.0376
317.6905
201.0482
260.4087
242.3635
341.5659
255.9586
255.4963
181.8694
316.6722
353.2978
303.9130
251.193l
464.0797
把全株叶子像素带入公式II,算出X,进而计算出全
株叶面积。
4.3方格法(w3)
将互花米草叶片平铺于标准坐标纸(最小方格
的规格为1mmX1 mm)上,用铅笔描出叶片的形
状,统计叶片图形所占的方格数(大于1/2时按一个
方格计,不足1/2则忽略不计[2,71),再乘以每个方格
的面积,即得到叶片面积。
考虑到方格法费时费力,只从30株互花米草中
随机选取7株,用W3测定全株叶面积,并用t检验
比较Wl与W2结果差异的显著性。用以检验Wl
测定结果的准确性。
4.4扫描像素法(w4)
本试验是用第三个全展叶片(从上到下数)代
表每株互花米草的全株叶子,通过干重算出全株叶
面积。然而,叶龄不同,积累干物质的多少不同,
同一面积的新叶和老叶干重应当有所差异。为了考
察差异的大小,把30株互花米草每株的全株叶子
全部扫描得到像素,用参照像素(CS)和参照面积
(CJ)计算得出全株叶面积,即为扫描像素法。再
用Wl与之对比,验证wI中第三片叶子干重的代
表性。
5结果与分析(Resultsandanalysis)
5.1用扫描.干重法测定全株叶面积及其与叶面积曲
线法结果的比较
扫描.干重法:用公式①计算得出单叶面积;用
公式②计算得出全株叶面积,结果见表1中的W1。
叶面积曲线法:按照3.2中的方法,得出叶面积曲线,
如图1。
16000
12000
.苎8000
D_
.!瞄;

4000
0
O 2 4 6 8
虚拟正方形叶片边长
Leaflengthofdummysquare-edge(cm)
圈1叶面积与像素之间的幂函数关联曲线
Fig.1Thepowerfunctioncnlwcsbetweenleaflengthand
scanningp xel
由图1可以得出结论:正方形叶片边长X与叶
子像素Y成幂函数曲线关系,公式为
v=419.85z
1‘如93
I
用以测定互花米草的叶面积时,X为虚拟正方
形叶片边长,即将互花米草的狭长叶片折算成虚拟
正方形,Y为虚拟正方形像素。相关系数R≈1.00,
说明X与Y之间呈高度正相关,所以用公式I得到
的结果是可信的。
反推由像素计算叶面积的公式II: 公式I变
形,得到虚拟正方形叶片边长x的计算公式lI:
2
O
O
8
2
7
8
4
7
5
1
7●5
O
9
7
9
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3
Oo
3,O
3
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1
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l挖为M笱拍”勰凹如
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4坨B心b坫”掩侈加
2
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6●O
7
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1
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2
2
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4
5
6
7
8
9“
万方数据
d969疡磊 II
式中戈、Y同公式I。
DZ、QZ称量获得(同3.1.2),DS扫描获得,
单株全叶像素(QS)由OZ、DZ和DS算出,再把
QS带入公式II,得出互花米草虚拟正方形叶片边
长x,进而计算得到单株互花米草的全株叶面积,
见表1中的W2。
由表1可以看出,扫描.干重法(W1)计算得出
的30株互花米草单株全株叶面积都略小于验证值
W2,其中第4株和第1株的计算结果最接近,仅相差
3.670cm2和4.209cm2,相对误差分别为2.622%和
2.754%:第27株和第’20株的计算结果相差最大,分
别相差21.650cm2和20.408cm2,相对误差分别为
4.463%和4.398%。由表1可知第27株和第20株的全
株叶面积比第4株和第1株大得多,说明较大的差异
是由叶面积增大引起试验误差增大造成的。30组计算
结果的平均相对误差只有3.651‰相对误差的绝对值
越小,表明两种方法计算的结果近似程度越高。所以
用全株叶子干重计算全株叶面积的的方法是可行的。
t
o
g


3



400
C| 脑 、 t嫒1 一 万手 耗}’茚3

雾 雾

l .r蹙
1 Z 3 4 10 l I 18
彦号sequencenurNoer
Wl:扫描.干重法them thodbasedonscannerandry.1eaves
weight;W3:方格法Squaredmethod
图2扫描-千重法orl)和方格法(w3)涓得的互花米草全
株叶面积比较m=7)
Fig.2ComparisonofleafreasofSpartinaalterniflora
measuredbyWlandW3(n=7).
5.2用方格法测定全株叶面积
用W3测定全株叶面积,并与Wl比较,结果见
图2。图中第l、3、ll株用wl法测定结果略大于
W3,第2、4、10、18株则是W3法略大于W1;其
中第4株相差最小(该结果与表1结果相同),仅相差
1.592cm2,相对误差为1.155%;第18株相差最大,
差值为14.668cm2,相对误差为4.776%。总体来说,
两种方法测出的结果十分接近,t检验结果表明用两
种方法计算的结果差异不显著俨=0.473)。
500
400
8300
qo
3200


音100
O
5 】0 15 20 25 30
序号sequencenumber
4
W1:扫描一干重法themethodbasedonscarlilerandry-leaves
weight;W4:扫描像素法theme odbasedonscannerand
leaves’pixels
图3扫描.干重法fWl)与扫描像素法fw4)蔫得的互花米
草全株叶面积比较(n=30)
Fig.3ComparisonofleafareasofSpartinaalterniflora
measuredbyWlandW4佃=30).
5.3互花米草第三全展叶片的代表性
用3.4中的方法验证W1中第三片叶子干重的代
表性。结果见图3。30组测定结果中,有14组为
Wl法测定结果略大于W4,其中第27株和第7株
相差最大,分别为21.816cm2和14.116cm2,相对误
差分别为4.939%和4.844%;有16组为W4法略大
于W1,其中第28株和第18株相差最大,分别为
18.091cm2和15.896cm2,相对误差分别为5.746%
和5.155%。第22、29、4、13株相差较小,都小于
3.000cm2,相对误差均在1.700%以内;其中第22
株互花米草的叶面积用两种方法测得的结果仅仅相
差0.358cm2,其相对误差为0.107%
总体来说,扫描一干重法(w1)与扫描像素法
(W4)测得的30株互花米草的全株叶面积结果基本
一致,进一步分析得出两种方法的相对值为0.9962
(30组数据的平均值),平均相对误差仅为0.3824%。
因此用互花米草的第三个全展叶片干重代表全叶干
重是完全可行的。



o
3
2
0
万方数据
4期 赵聪蛟,等:大批量测定植物叶面积的一种新方法——以互花米草叶面积测定为例 331
6讨论(Discussion) 参考文献(References)
6.1与其他叶面积测定方法比较
目前的叶面积测定方法,大体上可分为手工操
作法和数字处理法两类。前者如方格法、图形分解
法、系数法。后者又可分为仪器法(叶面积仪、求
积仪)和数字图像处理法(抛物线法、回归方程法、
图像处理法等)。手工操作法往往工作量大并需要很
长的工作时间,有的还需要计算校正系数18’18】,误差
主要由人为因素造成。叶面积仪、求积仪要求严格
按照使用指导,避免叶片卷曲;价格昂贵,维修困
难。数字图像处理法多数以手工操作法为基础,再
通过数学公式或数字图像处理得出结果。它克服了
手工操作法的两个缺点,测定准确,重复性高,但
通常需要有一定面积的对照物和合理的算法。每种
方法都有其局限性和使用范围,有些方法快捷、准
确,但仅适用于小批量测定,大多数方法很难在较
短时间内准确进行大批量测定。
本实验方法自动扫描叶片,PhotoShop平台获取
数据,操作简单,省工省力,结果准确,适合大批
量测定。试验误差主要来自两方面:一是叶子末端
缺水卷曲造成结果偏小;二是扫描时的容差设置易
造成叶子末端像素大小波动。因此扫描过程中,叶
片一定要展平,扫描后用魔棒选取叶子图像时,建
议采用同一个容差值(如60或100),以减少误差。
研究表明,叶面积仪、求积仪、方格法测量精
度最高,可作为叶面积测量中的对照,其次为图像
处理法、回归法,然后是系数法、图形分解法和抛
物线法【8】。本试验用方格法为对照,扫描.干重法与
之对比,检验结果没有显著差异,P=0.473。
6.2适用性
本方法有两个关键步骤,一是扫描叶片得出像
素,二是用叶子干重计算面积。第一步由计算机自
动识别叶片边缘记录数据,不受叶片形状的限制;
第二步当叶子具有粗大叶脉时,用单片叶子代表全
部叶子可能会造成较大误差,因此对于具有粗大叶
脉的叶子,本方法适用性较低。但不受叶片形状、
叶缘状态、叶龄的影响。因此本方法适用于测量各
种形状、叶子叶脉变化不大的各科属植物,尤其适
用于大批量测定。对于具有粗大叶脉的叶子面积的
测量,有待进一步研究,并对本方法加以完善。
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万方数据
大批量测定植物(互花米草)叶面积的一种新方法
作者: 赵聪蛟, 邓自发, 周长芳, 陈琳, 刘静娜, 安树青, 申瑞玲, ZHAO Cong-jiao,
DENG Zi-fa, ZHOU Chang-fang, CHEN Lin, LIU Jing-na, AN Shu-qing, SHEN Rui-
ling
作者单位: 南京大学生命科学学院,湿地生态研究所,南京,210093
刊名: 生态科学
英文刊名: ECOLOGICAL SCIENCE
年,卷(期): 2007,26(4)
被引用次数: 1次

参考文献(18条)
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本文链接:http://d.g.wanfangdata.com.cn/Periodical_stkx200704007.aspx