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细菌脂肪酶分泌的研究进展



全 文 :·综述与专论· 2012年第4期
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
收稿日期 : 2011-08-26
基金项目 : 国家自然科学基金项目(30900839)
作者简介 : 郑小梅 , 女 , 博士研究生 , 研究方向 : 生物化学与分子生物学 ; E-mail: xiaomeizheng84@yahoo.cn
通讯作者 : 伍宁丰 , 女 , 研究员 , 硕士生导师 , 研究方向 : 微生物分子生物学与基因工程 ; E-mail: wunf@caas.net.cn
细菌为了生存、繁殖和扩散往往会向胞外分泌
一些蛋白,如脂肪酶等水解酶。由于许多外泌的脂
肪酶具有广泛的底物特异性、手性选择性、温度稳
定性及碱稳定性等优势,已被广泛应用于洗涤剂、
食品、油脂加工、化妆品和药品等工业化生产中。
对脂肪酶分泌的研究为提高细菌脂肪酶的高效分泌
表达等酶工程的改造奠定了理论基础。
革兰阳性细菌只具有一层质膜与一层厚厚的由
肽聚糖所组成的细胞壁 ;而革兰阴性细菌则有两层
生物膜,即内膜和外膜,并且在内膜与外膜之间为
周质空间。在革兰阳性细菌中,待分泌的蛋白只需
要在锚定信号的引导下,利用 Sec 依赖的分泌系统
(也可称为通用分泌系统,general secretory pathway,
GSP)跨过质膜就可释放到胞外完成分泌。在革兰
氏阴性细菌中,外泌蛋白在跨越内膜后,还必须进
行跨外膜转运。革兰阴性菌主要利用 I、II、III、 IV
与 V 型分泌系统来完成跨外膜转运(图 1)[1]。I 型
分泌系统较为简单,仅有 3 种蛋白参与,可将所分
泌的蛋白直接从胞质转运到胞外。II 型分泌系统常
被认为是 GSP 的主要末端,所分泌的蛋白先通过
Sec 依赖的分泌通道到达周质空间,在周质空间中
正确折叠后,再通过外膜上的通道蛋白跨外膜转运。
III 型分泌系统有一个复杂的跨越内膜与外膜的蛋白
质复合体,以类似注射器的方式,将所分泌的分子
细菌脂肪酶分泌的研究进展
郑小梅 伍宁丰 范云六
(中国农业科学院生物技术研究所,北京 100081)
摘 要: 细菌脂肪酶是一类重要的工业用酶,其分泌系统有着严谨的机制。革兰阳性细菌利用 Sec-转运系统使脂肪酶跨过质
膜完成分泌;革兰氏阴性细菌的外泌蛋白通过 Sec-转运系统、Tat-转运系统或其他机制跨越内膜后,还必须利用 I型、II型、III型、
IV型与 V型分泌系统来完成跨外膜分泌。详细介绍细菌脂肪酶分泌主要依赖的 Sec-或 Tat-跨内膜的转运系统及革兰氏阴性细菌的
I型、II型与 V型自分泌系统的 3种不同分泌方式。细菌脂肪酶分泌的研究对人们认识其分泌机制,并利用基因工程的手段提高其
外泌产量等具有重要的指导意义。
关键词: 细菌脂肪酶 蛋白分泌 I型分泌系统 II型分泌系统 V型自分泌系统
Research Progress on Bacterial Lipase Secretion
Zheng Xiaomei Wu Ningfeng Fan Yunliu
(Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081)
Abstract: Lipases represent the most important class of enzymes used in industry. Lipases secretion across the inner membrane of both
gram-positive and gram-negative organisms generally follows the same routes, involving the Sec-dependent pathway or twin-arginine translocation
(Tat) pathways. Translocation across the gram-negative inner membrane results in release of the protein into the periplasmic space. Therefore,
gram-negative bacteria have evolved I-V five dedicated secretion systems in order to achieve translocation of these proteins to the cell surface
and beyond. In this review, we comprehensively describe the Sec-dependent pathway, Tat translocation pathways, type I secretion system, type
II secretion system and type V secretion system involved in the lipases secretion. The researches on lipase secretion provide vital sources for
improving the secretion production of bacterial lipases by the genetic engineering methods.
Key words: Bacteria lipase Protein secretion Type I secretion system Type II secretion system Type V secretion system
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2012年第4期28
直接从胞质输送到宿主细胞内。IV 型分泌系统和质
粒的接合转移系统有关,主要转运一些大分子物质。
V 型分泌系统较为特殊,分泌的蛋白在跨外膜转运
过程中似乎不需要能量和辅助因子(蛋白)参与,
因此又被称为自主转运蛋白系统。
Jaeger 等[2]将脂肪酶分为 7 个不同的家族,其
中家族 1-3 (Family I-III) 来源于革兰氏阴性菌,家
族 1 (Family I)与家族 2 (Family II)分别来源于假
单胞杆菌与伯克霍尔德菌,分子量多在 30 kD 左右,
都包含一个二硫键,并在周质空间中需要脂肪酶特
异折叠酶的帮助来获得正确构象后才能通过 II 型分
泌系统来分泌到胞外[3]。但家族 3 (Family III) 的脂
肪酶多为 50 kD 主要通过 I 型分泌系统来分泌,与
家族 1 (Family I) 及家族 2 (Family II) 的脂肪酶相似
性较低[3]。而革兰氏阳性细菌的脂肪酶则属于家族
4-7 (Family IV-VII),主要通过 Sec 依赖的分泌系统
跨越内膜完成其分泌。此外,GDSL 家族的酯酶比较
特殊,可通过 V 型分泌系统进行自我转运[4]。
图 1 革兰氏阴性菌的 5种不同分泌途径示意图[1]
1 跨内膜转运系统
1.1 Sec-移位子介导的跨内膜转运
Sec-移位子广泛存在于原核与真核细胞中,是
转运胞外蛋白、内膜蛋白及内质网等细胞器膜的驻
留蛋白。大多数细菌脂肪酶是以依赖于 Sec-移位子
系统的转译后跨膜进行跨内膜转运。对于革兰氏阳
性菌脂肪酶来说,这一途径是进行胞外分泌的最
终途径。但对来源于革兰氏阴性菌如 Pseudomonas
2012年第4期 29郑小梅等 :细菌脂肪酶分泌的研究进展
aeruginosa、P. Alcaligenes、Burkholderia glumae、B.
cepacia与 Acinetobacter calcoaceticus等的脂肪酶而言,
通过 Sec-移位子系统进入周质空间后,还需要再经
由Ⅱ型分泌途径跨过外膜才能完成分泌[3]。
待分泌的脂肪酶以未折叠的形式转运,其 N-末
端含有信号肽。信号肽可以分为 3 个部分[5]:N 端
的正电荷区、中间的高度疏水区与 C 端包含信号肽
切割位点的极性区域。在跨膜转运时,信号肽会被
信号肽识别颗粒识别,完成跨膜后又被信号肽酶所
切割,使蛋白释放到内膜外。
Sec-移位子是较保守的[5]为由 SecY、SecE 与
SecG 所组成的异源三聚体 SecYEG 形成一个跨内膜
的通道。在翻译后转运的过程中,Sec-移位子还需
与胞质中的动力马达蛋白 SecA 互作,在能量供应
下完成转运。在膜蛋白的共转译转运中,Sec-移位
子则需与核糖体 - 新生多肽复合体互作,这一过程
也需要 SecDFyajC 复合体的辅助。 SecY 为 48 kD, 具
有较高的疏水性,其 α-螺旋可跨膜 10 次,是移位
子中最大的组分,对新生多肽的跨膜是必须的。在
E. coli中, SecE 只有 14 kD,是一个较小的膜整合
蛋白,其跨膜结构域跨膜 3 次,也是移位子所必须
的。SecY 在单独存在时对细胞有毒性,其过表达会
抑制细胞的生长与蛋白的转运。SecE 与 SecY 以等
分子形成复合体,SecE 可稳定 SecY,防止其被降解。
SecG 为 12 kD 具有两个跨膜结构域,可激活 SecYE,
促进新生蛋白的转运。在转运过程中,SecG 可能通
过瞬时的构象改变帮助马达蛋白 SecA 结合并插入到
移位子上。马达蛋白 SecA 为 ATPase,可与移位子
互作并为蛋白的跨膜转运提供能量。SecDFYajC 为
一个膜复合体,可与 Sec-移位子发生短暂的融合,
激活蛋白前体的转运。虽然 SecD 与 SecF 并不是必
须的,但是其缺失突变体的周质蛋白无法正常分泌
并且生长缓慢。YajC 在膜蛋白插入到内膜时发挥一
定的功能作用。此外,还有一些胞质分子伴侣,如
SecB 主要负责新生多肽在转运过程中的伸展状态,
防止未折叠区段的错误聚集。
在细菌中,内膜融合蛋白多采用共转译转运
途径,而需跨膜的蛋白如脂肪酶则一般利用转译后
转运途径。两者的分叉点在于转译的早期,即是新
生多肽刚刚从核糖体的出口出来时。信号肽识别颗
粒(signal recognition particle,SRP)就位于核糖体
的出口附近,可最先与新生多肽的信号肽(ribosome
nascent chain,RNC)相互识别而结合。共转译转运
途径 :如果新生多肽的信号肽具有较高的疏水性与
螺旋性(helicity),SRP 就会与之结合,并使转译暂
停,直到 SRP-RNC 复合体达到内膜上的位于移位子
旁边的 SRP 受体(FtsY)。SRP 与 FtsY 形成一个异
源二聚体,并触发自身的 GTPase 活性,水解 GTP,
使 RNC 转移到移位子上。核糖体的出口与移位子的
通道紧密相对,使多肽链延伸,并通过链内的驻留
信号而镶嵌在内膜里。在转译后转运中,如果信号
肽的疏水性不是那么强,则会与一个触发因子(trigger
factor)相结合,避免与 SRP 过早的结合,保证蛋白
在胞质内会转译为完整的多肽。新生多肽往往通过
与胞质内的分子伴侣 SecB 的结合来维持自身处于
未折叠状态。SecB 与新生多肽的复合体可通过 SecB
与 SecA 的相互作用而达到移位子附近。然后,释放
SecB,SecA 水解 ATP 供能使新生多肽转移到移位子
上。在 SecA 供能下,信号肽穿过内膜,并引导多肽
以伸展的状态进入周质空间中,信号肽会被内膜周
质空间侧的信号肽酶所切割,使多肽释放到周质中。
在跨膜过程中,SecA 会提供能量使多肽链去折叠,
移位子附近的分子伴侣也会阻止多肽的聚集。
1.2 Tat-介导的跨内膜转运
除 Sec-移位子介导的跨内膜转运方式外,许多病
原菌还会利用双精氨酸转运途径(twin-arginine trans-
location, Tat) 跨内膜转运一些毒性因子,如 Pseu-
domonas aeruginosa[7]与 Mycobacterium tuberculosis[8]
等通过 Tat 转运系统将磷脂酶转运到周质后,再经
由 II 分泌系统分泌到胞外,破坏宿主的细胞膜。
Tat 转运系统可依赖于内膜内外的质子动力势使
折叠后的蛋白跨越内膜进入周质空间[6]。带转运蛋
白的信号肽也是高度保守的,与 Sec 移位子所识别
的信号肽类似,Tat 也包括 3 部分:N 端的正电荷区、
中间的高度疏水区及 C 端包含信号肽切割位点的极
性区域。但与之不同的是具有一个独特的双精氨酸
基序 S/T-R-R-X-F-L-K(X 为任何极性氨基酸),可
被 Tat 转运蛋白特异识别。因此,这类信号肽特被
称为 Tat 信号肽,并且这两个精氨酸在识别过程中
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2012年第4期30
其重要作用。
E. coli的该转运系统主要由 TatA、TatB 及 TatC
组成,它会在待转运蛋白的诱导下形成大的通道[6]。
这种诱导机制可维持内膜的通透屏障与质子动力势。
TatC 是 Tat 转运系统中的最大的组分,较保守。E.
coli TatC 为具有 6 个跨膜结构域的内膜蛋白,其 N-
末端与 C-末端都朝向胞质侧。TatC 主要负责识别待
转运蛋白的信号肽互作,并且这种识别依赖于信号
肽中的双精氨酸基序。E. coli TatB 由 3 部分构成,N-
末端的跨膜结构域将 TatB 锚定在内膜上,中间为一
段铰链区,C-末端的亲水螺旋及一大段无规卷曲则
在胞质中。 C-末端的亲水螺旋对转运是必须的,但
无规卷曲在缺失后对转运无影响。TatB 可与 TatC 以
1 1 的比例互作形成一个膜复合体,TatB 负责维持
TatBC 复合体的稳定。此外,TatB 是 TatC 与 TatA
之间的中介者,使 TatC 的底物信号肽识别过程及底
物与 TatA 的结合联系起来。TatA 的数量最多,是
TatB 与 TatC 的 20 倍。其结构与 TatB 类似,比 TatB
少 89 个氨基酸,只含有更短的胞质螺旋与无规卷曲。
TatA 主要负责转运的最后阶段,可通过寡聚化形成
一个同源四聚体的 Tat 通道。TatA 的 N-末端跨膜结
构域可与 TatB 互作,其 C-末端的胞质结构在转运过
程中可能会插入到内膜中或者进入周质中。
Tat 转运系统的机制[6]可归结为 :首先,当新
生多肽在核糖体上合成后,Tat 特异的分子伴侣会与
信号肽结合,避免其他转运识别颗粒的错误结合 ;
待分泌蛋白部分折叠或完成折叠后,会在协同因子
(cofactors)的陪伴下,与内膜上 TatBC 复合体相互
识别 ;随后,引起内膜质子动力势的改变,使与待
分泌蛋白结合的 TatBC 复合体与 TatA 组成的通道组
装为活性的转运系统,使待分泌蛋白进入通道,在
信号肽被切除后就可进入周质空间。
2 革兰氏阴性菌的跨外膜分泌系统
2.1 I 型分泌系统 (type I secretion system)
I 型分泌系统[9]是通过跨越内膜与外膜的复
合体利用 ATP 水解的能量将目的蛋白直接从胞质
转运到胞外,属于 Sec-非依赖型的分泌系统。该系
统较简单,仅有 3 种蛋白参与构成 :位于内膜上的
ATPase、内膜融合蛋白(membrane fusion protein,
MFP)与外膜蛋白(outer membrane protein,OMP)。
依赖于此分泌系统的蛋白在 N 端无信号肽,但在 C-
末端则存在一个由保守基序 GGXGXD 重复序列所组
成的靶信号与一个两亲性的 α-螺旋,并且这类蛋白
在分泌过程中不会被加工,也不存在明显的周质空间
中间体。
目前,已发现来源于 Pseudomonas fluorescens
B52[9]和 P. fluorescens SIK W1 的脂肪酶 TliA[10]以
及 Serratia marcescens 的 脂 肪 酶[11] 都 是 通 过 I 型
分泌系统进行分泌的。在 P. fluorescens SIK W1[7],
ABC 转运蛋白的编码基因 tliDEF 位于脂肪酶的编
码基因 tliA 的上游,共同构成一个操纵子参与脂肪
酶 TliA 的分泌。tliD 编码 ABC 蛋白,由跨膜结构
域(transmembrane domain,TMD) 与 ATP 结 合 域
(ATP-binding cassette domain,ABC) 组成。跨膜结
构域 TMD 由 α-螺旋组成,负责将蛋白整合到内膜中;
ATP 结合域则暴露到胞质中,具有保守的 Walker A
基序 (GXXGXGKS)。两结构域在 TliD 中是以 TMD-
NBD-TMD-NBD 的顺序来进行排列的。tliE 编码膜融
合蛋白,通过 N 端的疏水结构域将蛋白锚定在内膜
上,其余部分则位于周质空间中 ;可分别与 ABC 蛋
白 TliD 和外膜蛋白 TliF 相互作用。tliF 编码外膜蛋
白,可通过三聚化在外膜上形成一个延伸到周质空间
的大通道,允许脂肪酶 TliA 的跨外膜转运。脂肪酶
TliA 分子量较大,为 49.9 kD,是一个热稳定性很好
的蛋白。
ABC 转运蛋白的分泌机制[9]是通过控制通道
对膜内外的开放与偶联 ATP 的水解来实现的,相当
于是一种依赖于 ATP-门控模式。在无等待分泌的蛋
白时,ABC 蛋白 TliD 的跨膜结构域是朝向胞质的。
当脂肪酶与 ABC 蛋白 TliD 通过跨膜结构域 TMD 的
识别位点结合后,会引起 ATP 结合域的构象改变形
成 ATP 开关,而结合 ATP 并将其水解。在这种动力
作用(power stroke)下,跨膜结构域 TMD 的构象也
会变化,形成一个朝向周质空间的亲水性裂缝,驱
动脂肪酶进入膜融合蛋白 TliE 三聚化形成的通道,
穿越周质空间,进入外膜蛋白 TliF 三聚化形成的通
道,最终分泌到胞外。
虽然目前对于转运机制中的细节问题,如跨膜
方式与 ATP 水解偶联机制等还尚不明确,但已有很
2012年第4期 31郑小梅等 :细菌脂肪酶分泌的研究进展
多研究者利用 ABC 转运系统来提高脂肪酶的分泌
量。Ahn 等[12]通过将 tliA 与 tliDEF 在 P. fluorescens
共表达,发现可大大提高脂肪酶的分泌量。Eom 等[13]
发现,TliDEF 也可使脂肪酶 TliA 在 Escherichia coli
中得到有效的分泌,并发现 TliDEF 的定向改造可增
加分泌效率。此外,Song 等[14]将操纵子 tliDEFA 在 S.
marcescens KCTC 2798 表达后,发现脂肪酶 TliA 的
分泌量是在原菌中的近 10 倍。
2.2 II 型分泌系统 (type II secretion system)
II 型分泌系统是 GSP 的主要末端分支(main
terminal branch),分泌蛋白时需要两步,蛋白首
先通过 Sec-移位子或 Tat-转运系统(twin-arginine
translocation)跨越内膜进入周质空间中 ;在周质
空间中获得正确构象后,再通过由 12-16 种不同蛋
白组成的复杂的分泌子(secreton)穿过外膜分泌
到胞外[15]。而折叠错误的脂肪酶会被周质空间中
的蛋白酶所降解。脂肪酶能否正确折叠是分泌的关
键,其折叠过程是在脂肪酶特异折叠酶与和二硫键
形成蛋白的共同参与下完成的。大多数细菌如 P.
aeruginosa、P. Alcaligenes、B. glumae、B. cepacia 和
Acinetobacter calcoaceticus等均采用分泌子介导的Ⅱ
型分泌途径分泌其脂肪酶[3]。
II 型分泌系统的分泌子最早是在 Klebsiella
oxytoca中发现的,是参与分泌普鲁兰酶的 Pul 系
统[18]。随后,在 P. aeruginosa 中发现一个由 12 基
因所组成的操纵子编码 Xcp-分泌子,该分泌子可
分泌不同的蛋白[15]。虽然目前已在不同的菌株中
发现功能相似的分泌子系统,如 Erwinia carotovora
中的 Out- 分泌系统,Vibrio cholerae中的 Eps-系统,
Burkholderia pseudomallei 中 的 Gsp-系 统 等[19], 但
对 Xcp-分泌子的研究最为详尽,所以接下来以 Xcp-
分泌子为代表来介绍 P. aeruginosa 中的 II 型分泌
系统[15]。
2.2.1 假纤毛系统(Pseudopilins) 在 P. aeruginosa
的 Xcp-分泌子中,存在一个特殊的蛋白 XcpA,其
编码基因并不在 Xcp 操纵子中而是位于 IV 型纤毛组
装所需的操纵子中,也可称为 PilD。XcpA/PilD 通过
8 个跨膜螺旋位于内膜上,是纤毛亚基前体的蛋白
酶,可切除纤毛亚基前体 N-末端的导肽使其变为成
熟的纤毛亚基,随后还可使成熟的纤毛亚基 N-末端
第一位上保守的苯丙氨酸甲基化。成熟的纤毛亚基
就可以通过疏水性 N-末端的互作螺旋式上升组装为
纤毛。XcpA/PilD 也通过类似的机制来使参与 II 分
泌系统的假纤毛成熟。由此可见,XcpA/PilD 是 IV
型纤毛组装与 II 分泌系统的假纤毛组装所共用的。
Xcp-分泌子的 5 个蛋白 XcpT-X 具有与 IV 型纤
毛亚基相似的 N-末端,故被称为假纤毛亚基。同样,
也可被 XcpA/PilD 切除导肽与甲基化苯丙氨酸而成
为成熟的假纤毛亚基,组装形成假纤毛。假纤毛可
以在内膜 ATPase (XcpR)的驱动下不断延伸穿越周
质达到分泌孔道;还可在周质中另一个ATPase (PilT)
的作用下发生解聚化再收缩回来。假纤毛的这种延
伸与收缩的机制保障了分泌蛋白的外泌,称为开关
运动(twitching motility)。
2.2.2 内膜平台(inner membrane plateform) Xcp-
分泌子中,许多内膜蛋白 XcpR、XcpS、XcpY 和
XcpZ 通过相互作用组合在一起,为假纤毛的组装提
供一个平台,特称为内膜平台。XcpR 为内膜 ATP
结合蛋白,具有典型的 Walker A 与 Walker B 基序,
主要为假纤毛亚基跨越内膜提供能量,可与 XcpY
结合。XcpS 通过 3 个跨膜螺旋整合在内膜上,具有
一个较小的周质 loop 与两个较大的胞质结构域,可
结合于 XcpR,还可与假纤毛亚基结合帮助其转位与
组装。XcpY 与 XcpZ 在结构上互补,可相互契合形
成一个稳定的亚复合体。研究发现,内膜平台的搭
建就是通过蛋白之间互作的级联反应来完成的。首
先,XcpZ 会决定平台搭建的位置,然后招募 XcpY
形成稳定复合体,再通过 XcpY 将 XcpR 招募过来完
成平台的搭建组装。
此外,还存在一个内膜锚定蛋白 XcpP,也可
通过锚定在内膜上的 N-末端与 XcpR、XcpY 发生瞬
间互作,但其位于周质的结构域的较大的 C-末端又
可与外膜上通道蛋白 XcpQ 相互作用。XcpP 可能参
与外泌蛋白的识别及外膜通道的精细调控。基于外
XcpP 的特殊结构,有研究者推测,外泌蛋白跨越外
膜通道的能量可能是由 XcpR 提供的,并通过内幕
平台与 XcpP 的构象改变而传递。
2.2.3 外膜通道复合体 (outer membrane complex)
XcpQ 也是分泌子的组分,是唯一位于外膜上的蛋白。
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2012年第4期32
其 C-末端较为保守,镶嵌于内膜上,负责 XcpQ 的
寡聚化与外膜通道的形成。12 个 XcpQ 亚基在 C-末
端的互作下形成一个直径为 100 Å的门控式通道,
可允许折叠好的蛋白通过。N-末端不像 C-末端那么
保守,负责与 XcpP 或外泌蛋白的结合,还可作为
通道的门拴决定通道的开关。外膜通道的开关机制
既可应答蛋白的分泌,又可防止外界有害物质进入
周质。
II 型分泌系统所分泌的蛋白在氨基酸序列上是
毫不相关的,可能在蛋白的高级结构中存在一个分
泌斑来与周质驻留蛋白相区别。虽然至今还未明确
鉴定到这样的分泌斑,但有研究者推测,XcpP 与
XcpQ 最有可能参与到分泌斑的识别。这两个蛋白是
II 分泌系统的“门卫”,决定分泌的特异性。Michel
等[20]通过鉴定了一对 XcpP-XcpQ 同源蛋白 XphA
与 XqhA 支持这样的观点。
2.2.4 II 型分泌系统的基本分泌机制 II 型分泌系
统分泌蛋白的模式,如图 2 所示。外泌蛋白首先通
过 Sec-或 Tat-跨内膜转运系统穿过内膜,切除信号
肽进入周质 ;在周质辅助蛋白的帮助下,获得正确
的成熟构象,同时可能也形成一个分泌斑 ;XcpP
的周质结构域识别分泌斑后构象改变,与外膜通道
XcpQ 互作,并将外泌蛋白转移至外膜通道中 ;与此
同时,XcpP 的构象改变也会触发内膜平台 XcpRSYZ
的搭建,使假纤毛亚基 XcpT-X 在被 XcpA 加工成熟
后,组装为假纤毛,并在 XcpR 的能量供应下,穿
过周质延伸至外膜通道中,使 XcpQ 的 N-末端构象
改变,通道打开释放处于孔道中的外泌蛋白,使其
分泌至胞外。随着外泌蛋白的释放,XcpQ 恢复构象,
激活假纤毛的解聚,整个分泌子装置回到原来的
构象。
对蛋白分泌机理的研究可使人们利用基因工程
图 2 P. aeruginosa Xcp-分泌子各编码基因的染色体定位与 II型分泌系统的细致示意图
B. II 型分泌系统的细致示意图,外泌蛋白首先通过 Sec-或 Tat-跨内膜转运系统穿过内膜,切除信号肽进入周质 ;在周质的辅助蛋白的帮助下,获
得正确的成熟构象后,可能也同时形成一个分泌斑 ;XcpP 的周质结构域识别分泌斑后构象改变,与外膜通道 XcpQ 互作,并将外泌蛋白转移至
外膜通道中 ;与此同时,XcpP 的构象改变也会触发内膜平台 XcpRSYZ 的搭建,使被 XcpA 加工成熟的假纤毛亚基 XcpT-X 组装为假纤毛,并
在 XcpR 的能量供应下,穿过周质延伸至外膜通道中,使 XcpQ 构象改变通道打开释放处于孔道中的外泌蛋白,使其分泌至胞外。OM 为 outer
membrane 的缩写,代表外膜 ; Peri 为 periplasm 的缩写,代表周质空间 ; IM 为 inner membrane 的缩写 ;Cyto 为 cytoplasm 的缩写,代表胞质 ;跨内
膜的转运系统为图中的浅灰色表示的 Sec-移位子系统与深灰色表示的 Tat 转运系统 ;Effector molecule 为待分泌蛋白
A. Xcp-分泌子各编码基因的染色体定位,除 xcpA/pilD 不位于同一个操纵子外,其他 xcp 基因都位于同一个操纵子中。xcpP 与 xcpQ 为同一读码方
向,其他基因的读码方向与之相反。xcpQ 编码的蛋白为外膜通道蛋白(secretin);xcpR 编码一个 ATP 水解酶(NTPase);xcpT-X 编码假纤毛亚基
(pseudopillins),而 xcpA/pilD 则编码纤毛亚基前体蛋白酶(prepillin peptidase);
2012年第4期 33郑小梅等 :细菌脂肪酶分泌的研究进展
的手段通过对相关蛋白的改造与修饰来提高蛋白的
分泌表达量,使其更好的工业化。如 P. alcaligenes
脂肪酶就以类似的方式进行分泌,当人为增加分泌
子在菌体内的拷贝数时,细胞外脂肪酶的分泌量可
显著增加[21]。由此可见,增加分泌子的拷贝数以提
高胞外脂肪酶的分泌是行之有效的。
2.3 V型分泌系统 (type V secretion system)
V 型分泌系统的分泌装置较简单,其分泌的蛋
白在跨外膜分泌时似乎不需要能量与其他辅助蛋白,
因此又被称为自分泌系统 (autotransporter)。这类蛋
白首先通过 Sec-移位子进行跨内膜转运,进入周质
后,再通过自身 C- 末端的结构域在外膜上形成一个
β 折叠桶组成的通道,使 N-末端穿过外膜,分泌到
胞外或锚定在外膜上[1]。根据结构或分泌机制的细
微差异,V 型分泌系统可分为 3 种亚型[1]:即自转
运蛋白系统(autotransporter system,Va 亚型)、双
组分转运系统(two partner secretion pathway,Vb 亚
型)和寡聚卷曲螺旋黏附素家族(oligomeric coiled-
coil adhesins,Vc 亚型)。分泌蛋白的氨基酸序列与
生物合成分泌途径具有显著的相似性,主要包括 3
个区域[1]:即位于 N-末端可被 Sec-转运系统所识别
的信号肽序列;N-端结构域即乘客结构域(passenger
domain)为分泌到胞外的区段 ;C-端结构域即自转
运结构域,包括由 α-螺旋组成的短链接区与反向平
行的两亲性的 β-折叠片层结构,其 β-折叠片层可插
入外膜形成 β-折叠桶状的跨膜通道,在无任何辅助
蛋白的协助下,可将乘客结构域分泌至外膜表面。
P. aeruginosa是重要的人类病原菌,可向胞外
分泌许多的脂类水解酶如磷脂酶 C、易水解长链甘
油酯的脂肪酶和易水解短链甘油酯的酯酶。Wilhelm
等[22] 在 P. aeruginosa PAO1 发 现 一 个 新 型 酯 酶
EstA,大小为 69.5 kD,具有自转运蛋白的结构特
点,N-末端的结构域具催化活性,暴露在细胞表面;
C-末端的结构域与自我转运蛋白的相似性较高,可
能负责将 EstA 转运到细胞外,但整个蛋白却如细
胞表面展示蛋白一样锚定在细胞上。利用 EstA 的
C-末端转运结构域的特性,成功地将具有较高工业
化应用价值的脂肪酶在 E. coli中进行了细胞表面展
示[23]。此外,来源于 Salmonella enterica的外膜酯
酶 ApeE[24]、Xenorhabdus luminescens 的 Lip-1[25]及
Moraxella catarrhalis的 McaP[26]等都属于 GDSL 酯
酶家族,分子量都在 70 kD 左右,与 EstA 相似都以
自转运系统来跨越外膜。
3 展望
细菌脂肪酶以其广泛的底物特异性、手性选择
性、温度稳定性及碱稳定性等特性在食品营养、油
脂化学品工业、造纸工业、洗涤和生物表面活性剂
的合成以及药物合成等许多领域都得到广泛应用。
从自然界中筛选得到的脂肪酶产生菌中,脂肪酶基
因受到较为严谨的调控,因此脂肪酶的生产量较少。
但工业应用需要脂肪酶的大规模的生产,因此,不
断深入研究细菌脂肪酶的表达与分泌的机制,可为
人们利用基因工程或代谢工程的手段来提高脂肪酶
的分泌量奠定理论基础。目前已通过增加分泌系统
的拷贝数等方法,成功提高了脂肪酶在同源表达或
异源表达系统中的分泌量。不同的脂肪酶的分泌方
式与结构特点的明确还有利于对其进行分子改造与
利用。例如,可利用P. aeruginosa PAO1中的EstA的C-
末端自转运结构域来对其他高价值的脂肪酶进行细
胞表面展示,制成具有高催化能力的菌剂等。此外,
脂肪酶作为一种毒性因子,在许多致病菌的繁殖与
定殖中起关键作用。脂肪酶的分泌机制及分泌系统
的调控机制的研究,对发现新的药物作用靶点与研
制新型抗菌药物具有较大的促进作用。总而言之,
对于细胞脂肪酶的分泌机制的深入研究,将使人们
更好地理解细菌的致病机制和进化过程,也将促进
相关研究在医药和生物技术领域具有更广阔的应用。
参 考 文 献
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(责任编辑 狄艳红)