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Phage display of endoglucanase Ⅰ from Trichoderma reesei and its cellulose-binding domain

瑞氏木霉内切葡聚糖酶Ⅰ及其CBD的噬菌体表面展示系统的构建



全 文 : 万方数据
·22· 生物加工过程 第4卷第1期
个带有0一糖基化的连接肽(Linker)连接‘1J。纤维素
酶的吸附结构域和催化结构域之间有着密切的联
系。去掉吸附结构域的纤维素酶,催化降解纤维素
的活性明显降低怛,3I。虽然目前已揭示了CBD有引
导纤维素酶到纤维素表面和破坏纤维素结晶结构的
作用[4],并且对吸附结构域点突变的研究结果表明,
吸附结构域对纤维素吸附特性的改变将影响整个酶
的催化活性15j,但是目前纤维素酶的酶活性和吸附
特性之间相互关系的机制并不清楚。
过去的十几年中,噬菌体表面展示技术在抗体
工程和肽的亲和性筛选方面取得了极大的成功怕’71。
道。为研究吸附特性和催化活性之间的关系,并进
而通过定向进化技术对酶性质进行改造,本研究首
次构建了瑞氏木霉内切葡聚糖酶及其吸附结构域的
噬菌体表面展示系统。该系统的建立将为利用噬菌
体展示系统可进行高效亲和筛选的特点,来研究纤
维素酶吸附和催化之间的关系及进行酶分子改造打
下基础。
1材料和方法
1.1材料
近几年该技术也开始应用于酶分子改造的研究领 1.1.1菌株和质粒
埘8,9|,但该技术在纤维素酶工程中的应用还未见报 本实验所用菌株和质粒见表1。
表1本研究所用的菌株和质粒
rI址le1 StIainsa11dplasrnidusedintIlisresearch
1.1.2酶和试剂
限制性内切酶靳I、Ⅳ0f工,连接试剂盒,
dN’I髑,ATP和凝胶回收试剂盒购自Tak锄公司;
AB偈购自上海生物工程中心;HRP/Anti.M13Mono.
c10nalConiugate购自Ame璐h锄Phannacia公司;其它
常规试剂采用进口分装或国产分析纯。
1.2 PCR扩增EG工及其CBD序列
根据EG工的DNA序列,设计了3个PCR引物,
用以得到EG工基因和EGI的CBD基因。
EG工引物序列为:
P1:5’rrI.;GACCACGGCCCAGCCGGCCATllG3
7
P2:5’GTCAGCGGCCGCAAGGCATrGCGAGTAG3’
反应条件:94℃3IIlin预变性,94℃1rIlin,65℃
1 rnin,72℃1.5min,35个循环。
CBD引物序列为:
P3:5’rIT】阢GGCCCAGCCGGCCllGCACGCAGACTCA3
7
P2:5
7GTCAGCGGCCGCAAGGCA,r:盼CGAGTAG3’
反应条件:94℃3min预变性,94℃1min,
68℃1IIlin,72℃20s,3 个循环。
扩增后的目的片断经限制性内切酶靳I、Ⅳ0t
I酶切,经T4DNA连接酶作用定向连接到噬菌粒
展示载体pcANr】rAB5E上。
1.3噬菌体制备及其计数
根据fuPAsE)【pressmoduleⅪt操作指南制备噬
菌体。噬菌体的滴度是指1mL培养液中所含活噬
菌体的数量,滴度测定的方法采用双层琼脂平板法。
因为有少数活的噬菌体可能未引起感染,所以为了
准确地表达噬菌体悬液的浓度,本实验采用了噬菌
斑形成单位(Plague.fbnningunit,pfu)而不是克隆形
成单位(colony—f0ⅡninguIlit,cfu)。
1.4酶联免疫反应测定亲和性
为确定噬菌体展示的EG工及其CBD的吸附特
性,本实验的EuSA方法是以纤维素滤纸黏附于96
孔板底部作为固定相。用含脱脂牛奶的封闭缓冲液
万方数据
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·24· 生物加工过程 第4卷第1期
(a)1:egI的PCR产物;2:DL2000marker;
(b)1:DL2000marker;2:cbd的PCR产物
图2 PCR反应扩增EG工基因及EGI—CBD基因的凝胶电泳图
Fig.2蹦qu龃titationofPCR砌pljIiedegIan茎1妻耋.i萋
:§i主l雾+纵驯蠹妄;垂矗;!!刑;!蔷羹i雾羹塞雩耋襄鍪囊恺至薹;萋!篷
霎;雩;剂蠢珏誊囊
ov释n(Wisconsin,USA.);菌种
E.c0如DH5a购自于Clontech(Heidelberg,G m锄y);
吲哚,靛蓝购自于nug公司;色谱级别。
1.2 易错PCR构建P450BM.3突变体库
根据易错PCR定向进化的原理HJ,对P450
BM.3的单加氧酶的基因进行随机突变,然后将该突
变基因 片段连接到具有同样酶切的线性质粒中并且
转化到具有高转化率的感受态细胞E.co丘DH5a
中,涂布到含有30肛∥mL卡那霉素的LB琼脂平板
上,37℃过夜培养。在上述得到克隆的平板上加
2mL的LB液体培养基用刮布器轻轻地刮取并收集
细胞,然后提取质粒并转化至E.co如BL21中,涂布
到含有30叫n1L卡那霉素的LB琼脂平板上,37℃
过夜培养,获得具有表达突变酶的突变文库。
1.3 饱和定点突变构建突变文库
根据易错PCR定向进化的结果,利用Stmtagene
公司的 QuikChangeKit_5J,对模板质粒pET28a(+)
P450BM-3进行PCR扩增,然后转化到大肠杆菌
E.c如Novablue(DE3),涂布到含有30皑/mL卡那霉
素的LB琼脂平板上,37℃过夜培养得到突变文库。
1.4 突变文库的筛选
从平板上挑取蓝色的克隆,并接种到200姐含
有30弘∥mL卡那霉素的LB液体培养基的96微孔
板中,37℃过夜培养,取20血该过夜培养液加入到
一个新的200皿、含有30肛∥mL卡那霉素LB液体
培养基的96微孔板中,在37℃培养∞锄为0.5~
0.7时加入IPTG(终浓度0.5眦ml/L)诱导并在30℃
继续培养48h,得到蓝色的细胞,用DMSO提取该蓝
色物质bj,在630啪处测定其吸收值,将活力高于
亲本酶 的菌株挑选出来并提取质粒进行全自动
DNA;!贝9序。
1.5 P450BM.3含量的测定
采用co.差示光谱分析,按参照文献[6]进行。
2结果与分析
2.1 易错PCR定向进化的结果
通过对三千多个克隆的多次96微孔板筛选,最
终挑选 3个克隆进行全自动DNA测序,并将其序列
翻译到氨基酸水平,发现这3个克隆都具有有义突
变位点 (1433MK434G,D168NA225VK440 ,E435D),
从而在基因水平上表征了突变酶的获得,进一步用
蛋白质模拟技术对新突变位点在蛋白质三级结构中
的位置进行模拟,发现突变位点具有无规性,有些突
变是位于活性中心空穴内,有些突变是远离活性中
心(图1)。
o.o9
007
飞 O.05

万方数据
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