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Cloning of replication fragment from Gluconacetobacter

葡糖酸醋杆菌内源复制片段的克隆



全 文 :第9卷第3期
2011年5月
生 物 加 工 过 程
ChineseJournalofBioprocessEngineering
Vol.9No.3
May2011
doi:10.3969/j.issn.1672-3678.2011.03.010
收稿日期:2010-12-20
基金项目:福建省科技项目(2005Q007)
作者简介:颜彩玲(1985—),女,福建泉州人,硕士研究生,研究方向:生物大分子;黄建忠(联系人),教授,Email:hjz@fjnu.edu.cn
葡糖酸醋杆菌内源复制片段的克隆
颜彩玲,李 欣,黄建忠
(福建师范大学 生命科学学院 福建省现代发酵技术工程研究中心
工业微生物教育部工程研究中心,福州 350108)
摘 要:采用改进的碱裂解法提取GluconacetobacterhanseniATCC23769自发不产膜突变体的内源隐蔽质粒。用不
同的限制性内切酶对混合质粒直接进行酶切,酶切后的片段混合物与pUC18载体连接构建重组载体。重组载体回
转入G.hanseniATCC23769获得隐蔽质粒上具有复制能力的片段,序列结果分析表明:该片段上没有某些其他质
粒所具有的Rep蛋白。利用该片段,构建了能同时在大肠杆菌和葡糖酸醋杆菌中复制的质粒载体,体内的抗生素
抗性实验证明该载体具有良好的稳定性。
关键词:葡糖酸醋杆菌;混合质粒;复制
中图分类号:Q785    文献标志码:A    文章编号:1672-3678(2011)03-0047-05
CloningofreplicationfragmentfromGluconacetobacter
YANCailing,LIXin,HUANGJianzhong
(EngineeringResearchCenterofIndustrialMicrobiologyoftheMinistryofEducation,EngineeringResearchCenterof
FujianModernFermentationTechnology,ColegeofLifeScience,FujianNormalUniversity,Fuzhou350108,China)
Abstract:TheendogenouscrypticplasmidsofGluconacetobacterhanseniATCC23769spontaneous
celulosenegativewereextractedbymodifiedalkalinelysismethod.Theplasmidsweredirectly
digestedbycertainrestrictionendonucleases,andthedigestedfragmentswereligatedtopUC18
vectortoconstructtherecombinantvectors.Therecombinantvectorswereretransformedinto
G.hanseniATCC23769toobtainthereplicationfragmentofthecrypticplasmids.Thesequence
analysisshowedthatthisfragmentdidnotcontaintheRepprotein.Thevectorreplicatedinboth
E.coliandGluconacetobacterwasconstructed,anditsgoodstabilitywasconfirmedinantibioticre
sistantexperiments.
Keywords:Gluconacetobacter;plasmidmixture;replication
  细菌纤维素(bacterialcelulose,简称 BC)是很
多细菌分泌的一种胞外多糖,它是由 β D 葡萄糖
通过β 1,4 糖苷键结合而成的直链,直链间彼此
平行,无分支结构,又称为 β 1,4 葡聚糖。
Brown[1]发现在需氧条件下静置培养时,木醋杆菌
Acetobacterxylinus(现在命名为木葡糖酸醋杆菌Glu
conacetobacterxylinus)在培养基的气 液界面形成一
层细胞外纤维素薄膜。细菌纤维素具有高的机械
强度、良好的生物相容性和生物降解性等,这些特
性使之能广泛应用于食品、医药、纺织、造纸、电子
等行业[2]。此外,利用细菌纤维素制备人造皮肤、
人造血管、创伤敷料、软骨组织工程支架、哺乳动物
细胞培养基质等方面的研究正成为人们关注的热
点[3]。但是由于细菌纤维素产率低,导致生产成本
高,目前仅用于高附加值产品。通过提高细菌的生
产能力是降低成本的一个重要途径。DNA重组技
术是改造细菌的最有效的方法之一,因此,发展宿
主载体系统对该细菌进行基因工程操作十分必要。
葡糖酸醋杆菌具有复杂内源质粒DNA系统,这
些质粒的功能目前还不是很清楚,有的质粒可能与
纤维素膜的产生有关,因为某些不产纤维素的自发
突变菌株丢失了部分内源质粒[4];某些内源质粒与
宿主DNA发生相互作用,导致其携带有染色体上的
DNA片段[5]。利用这些内源质粒,已经构建得到穿
梭质粒载体[6-8]。这些穿梭载体为研究和改造细菌
纤维素生产菌提供了极大的便利,如利用穿梭载体
pSA19载体研究了 A.xylinumBPR2001的纤维素合
酶启动子的功能[9];而利用 pSA19在 A.xylinum
BPR2001中表达了绿豆的蔗糖合酶提高了其纤维
素的产量[10]。
传统的质粒提取方法是通过 CsCl密度梯度超
速离心分离得到单个质粒,然后将其完整地插入其
他载体骨架上,以获得穿梭载体。然而,CsCl超速
离心费时,对设备和操作要求高,且插入整个内源
质粒导致重组载体大,影响后续基因工程的操作。
由于G.hanseniATCC23769自发不产膜突变株生长
快,并且能够消除细胞外纤维素的影响,笔者选取
其作为提取质粒的菌株。通过对提取的 G.hanseni
混合质粒直接进行酶切,酶切产物直接连入 pUC18
载体,来克隆质粒上具有复制能力的片段。
1 材料与方法
11 质粒及菌种
汉氏葡糖酸醋杆菌(Gluconacetobacterhanseni)
ATCC23769购于美国ATCC,大肠杆菌 EcoliDH5α
和pUC18质粒由福建师范大学工业微生物教育部
工程研究中心保存。
12 培养基
Ecoli用 LB培养基,37℃培养;G.hanseni
ATCC23769不产膜突变体用 HS培养基(g/L):葡
萄糖20,蛋白胨 5,酵母浸出物 5,柠檬酸 114,
Na2HPO4·12H2O068;28℃培养。
13 G.hanseniATCC23769抗生素耐受性实验
选取含50~500μg/mL不同质量浓度的氨苄
青霉素的HS培养基对 G.hanseniATCC23769进行
处理,确定原始菌株对抗生素的敏感度。将原始菌
株分别涂布于不同浓度的抗生素板上,每个抗生素
浓度做3个平行实验,倒置于28℃培养3d,观察它
们的生长状况。
14 质粒DNA的提取和重组质粒构建
E.coli质粒的提取方法参照文献[11]。
为消除细胞外细菌纤维素膜对质粒提取的影
响,葡糖酸醋杆菌质粒的提取采用 G.hanseni
ATCC23769自发不产膜突变体,提取方法为改进的
碱裂解法[12]。
选择常见的几种限制性内切酶 EcoRI、Hind
II、PstI、XbaI,对提取的 G.hanseniATCC23769混
合质粒分别进行随机酶切过夜,各取2μL酶切混合
物进行琼脂糖凝胶电泳检测。选取合适的酶切产
物,用相对应限制性内切酶对 pUC18载体进行单酶
切并去磷酸化,两者连接,转化E.coliDH5α得到重
组质粒。
15 葡糖酸醋杆菌电转化
将重组质粒加入葡糖酸醋杆菌感受态细胞中,
轻轻搅拌混匀,转入 01cm冰预冷的电转杯中
(BioRad),用GenePulserIapparatus(BioRad)电
击,使用如下参数:18kV,200Ω,25μF。电击后加
入1mL新鲜的HS培养液,于28℃、80r/min振荡
培养15h,涂布相应浓度的抗生素平板,倒置于
28℃培养。
16 载体稳定性的测定
将待测菌株的阳性单菌落接种到新鲜无抗生
素HS液体培养基中摇瓶培养,待细菌长到一定浓
度,每隔24h按1%的比例接种到新鲜无抗生素的
HS液体培养基中,转接3次后(约70代),稀释划
线于无抗生素HS固体平板上,28℃培养长出单菌
落后,随机挑取单菌落至HS(Amp200μg/mL)液体
培养基中培养,观察细菌生长情况。
2 结果与讨论
21 抗性验证结果
G.hanseniATCC23769原始菌株对 50~500
μg/mL之间不同质量浓度的氨苄青霉素的抗性结
果如表1所示。由表1可知:当培养基中的氨苄青
霉素浓度达到 200μg/mL,G.hanseniATCC23769
已经不能生长,因此后续的实验使用氨苄青霉素的
质量浓度均采用200μg/mL。
84 生 物 加 工 过 程   第9卷 
表1 葡糖酸醋杆菌对氨苄青霉素的抗性验证
Table1 Gluconacetobacter′sresistancetoAmpicilin
ρ(Amp)/(μg·mL-1) 50 100 150 200 250 500
抗性结果 + + + - - -
 注:+表示生长;-表示死亡。
22 G.hanseni内源质粒的随机酶切结果
用常用的限制性内切酶 EcoRI、HindII、PstI
和XbaI对提取的 G.hanseniATCC23769混合质粒
进行酶切,酶切结果如图1所示。由图1可知:与原
始的混合质粒相比,EcoRI和 XbaI的酶切产物看
不出明显的条带变化,而 HindII和 PstI的酶切图
谱出现了许多相对分子质量较小的条带,因此后续
实验选用HindII和PstI的酶切产物。
1—λHindIIdigestedDNAmarker;2~5—plasmidsmixture
digestedbyEcoRI,HindII,PstIandXbaI;
6—plasmidsmixtureextractedfromG.hanseniATCC23769
图1 G.hanseniATCC23769混合质粒的酶切图谱
Fig.1 PlasmidsmixtureextractedfromG.hanseni
ATCC23769anddigestedbydiferent
restrictionendonucleases
23 克隆 G.hanseniATCC23769内源质粒具有
复制能力的片段
  选择HindII和PstI对G.hanseniATCC23769
的混合质粒分别进行酶切,并分别连接到相应酶切
的pUC18载体上,得到各种不同的 pUC1823769混
合重组质粒,重组质粒混合物分别转化 DH5α,从转
化板上随机挑取几个克隆提取质粒,对它们用相应
的酶进行酶切鉴定,酶切结果(图 2)显示插入到
pUC18载体中的片段大小各不相同。
将这些含有外源片段的重组质粒电击转化进
1—λHindIIdigestedDNAmarker;
2~6—pUC1823769recombinantplasmidsdigestedbyHindII;
7~8—pUC1823769recombinantplasmidsdigestedbyPstI
图2 G.hanseniATCC23769重组质粒pUC1823769
的HindIII和PstI酶切鉴定
Fig.2 RecombinantplasmidspUC1823769from
G.hanseniATCC23769digestedby
HindIIIandPstI
G.hanseniATCC23769突变体中,涂布于 HS(Amp
200μg/mL)平板筛选,发现含有较大片段的重组质
粒几乎都能在含抗生素的 HS平板上长出单克隆
体。为了方便后续的研究,选取插入片断较小(约
33kb)的一个重组质粒(图2中第2泳道)进行进
一步研究,并将此质粒命名为pUC18 H1,结果如图
3所示。由图3可知:G.hanseniATCC23769原始
菌和转入 pUC18空载体的 G.hanseniATCC23769
均不能在含氨苄青霉素的 HS平板上生长,而转入
pUC18 H1的G.hanseniATCC23769则能长出单菌
落,说明转入的质粒赋予了葡糖酸醋杆菌氨苄青霉
素的抗性。
通过对pUC18 H1进行测序,获得了H1片段的
核苷酸序列,结果如图4所示。由图4可知:该片段
长度为3338bp。利用 NCBI的 ORFFinder软件分
析,在该序列中发现了23个开放阅读框,其中开放
阅读框大小在100个氨基酸以上的有 10个,根据
Blast比对分析发现其中存在一个可能的 ABC转运
蛋白编码框(位于1369~3189bp之间)和一个可
能的内切核酸酶II编码框(位于1006~299bp,反
向互补序列),内切核酸酶 II编码框可能参与了质
粒的复制。但是在该序列中没有发现编码复制起
始蛋白(Rep蛋白)的编码框,可能该片段的复制并
不依赖于自身编码的Rep蛋白。
94 第3期 颜彩玲等:葡糖酸醋杆菌内源复制片段的克隆
图3 pUC18和pUC18H1电转G.hanseniATCC23769的结果
Fig.3 ResultsofplasmidspUC18andpUC18H1electrotransformedintoG.hanseniATCC23769
图4 H1片段序列
Fig.4 SequencesofH1fragment
24 载体稳定性的测定
将G.hanseniATCC23769(pUC18 H1)阳性克
隆接入新鲜的空白 HS(Amp0μg/mL)液体培养基
中,转接3次后(每24h一次),细菌增殖大约70代
后,于空白HS平板上划线得到单克隆体,随机挑取
20个单克隆体转入 HS(Amp200μg/mL)培养液
中,结果如图 5所示。由图 5可知:挑取的所有
G.hanseni仍然具有氨苄青霉素抗性,说明细菌在传
05 生 物 加 工 过 程   第9卷 
代许多代后,该质粒载体在细菌中仍旧稳定存在,
该载体具有良好的稳定性。
图5 载体的稳定性实验
Fig.5 Thestabilitytestofthevector
3 结论
通过对提取的质粒混合物进行随机酶切的方
法,成功克隆到 G.hanseniATCC23769内源隐蔽质
粒中一段具有自主复制能力的片段H1,该片段的大
小仅为33kb左右,小于用其他传统方法克隆得到
的具有复制能力片段的长度,由此构建得到的质粒
载体能够容纳更大的外源基因片段。利用H1片段,
构建了能够在大肠杆菌和葡糖酸醋杆菌中进行增
殖的质粒载体,该载体在大肠杆菌和葡糖酸醋杆菌
中能够稳定存在和复制,并能通过筛选标记氨苄青
霉素抗性来筛选转化子,为在葡糖酸醋杆菌中进行
基因工程操作提供了良好的载体工具。该片段的
克隆不仅有助于对葡糖酸醋杆菌进行后续的基因
工程操作,而且有助于进一步分析葡糖酸醋杆菌隐
蔽质粒内部具有复制能力片段的结构,为了解该细
菌隐蔽质粒的复制情况提供良好的材料。
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15 第3期 颜彩玲等:葡糖酸醋杆菌内源复制片段的克隆