全 文 ：
摇 摇 摇 摇 摇 生 态 学 报
摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 (SHENGTAI XUEBAO)
摇 摇 第 31 卷 第 15 期摇 摇 2011 年 8 月摇 (半月刊)
目摇 摇 次
地面节肢动物营养类群对土地覆被变化和管理扰动的响应 李锋瑞,刘继亮,化摇 伟,等 (4169)………………
两种书虱微卫星富集文库的构建及比较 魏丹丹,袁明龙,王保军,等 (4182)……………………………………
菲律宾蛤仔 EST鄄SSRs标记开发及不同地理群体遗传多样性 闫喜武,虞志飞,秦艳杰,等 (4190)……………
菲律宾蛤仔大连群体不同世代的遗传多样性 虞志飞,闫喜武,杨摇 霏,等 (4199)………………………………
玻璃温室与田间栽培小麦幼穗分化的比较 姜丽娜,赵艳岭,邵摇 云,等 (4207)…………………………………
施用有机肥环境下盐胁迫小麦幼苗长势和内源激素的变化 刘海英,崔长海,赵摇 倩,等 (4215)………………
黄土高原半干旱区气候变化对春小麦生长发育的影响———以甘肃定西为例
姚玉璧,王润元,杨金虎,等 (4225)
……………………………………
……………………………………………………………………………
不同耕作模式下稻田水中氮磷动态特征及减排潜力 冯国禄,杨仁斌 (4235)……………………………………
大田环境下转 Bt基因玉米对土壤酶活性的影响 颜世磊,赵摇 蕾,孙红炜,等 (4244)…………………………
短期淹水培养对水稻土中地杆菌和厌氧粘细菌丰度的影响 朱摇 超,Stefan Ratering,曲摇 东,等 (4251)……
气候变化背景下广东晚稻播期的适应性调整 王摇 华,陈新光,胡摇 飞,等 (4261)………………………………
长期封育对不同类型草地碳贮量及其固持速率的影响 何念鹏,韩兴国,于贵瑞 (4270)………………………
黄土丘陵区两种主要退耕还林树种生态系统碳储量和固碳潜力 刘迎春,王秋凤,于贵瑞,等 (4277)…………
植物叶表面的润湿性及其生态学意义 石摇 辉,王会霞,李秧秧 (4287)…………………………………………
长白山北坡主要森林群落凋落物现存量月动态 郑金萍,郭忠玲,徐程扬,等 (4299)……………………………
古尔班通古特沙漠及周缘 52 种植物种子的萌发特性与生态意义 刘会良,宋明方,段士民,等 (4308)………
吉首蒲儿根的繁殖生态学特性及其濒危成因 邓摇 涛,陈功锡,张代贵,等 (4318)………………………………
栖息地永久性破坏的比例对物种多度稳定值影响的迭代算法 时培建,戈摇 峰,杨清培 (4327)………………
喷施多效唑提高麻疯树幼苗耐盐性的生理机制 毛轶清,郑青松,陈健妙,等 (4334)……………………………
阿尔山落叶松主要蛀干害虫的种群空间生态位 袁摇 菲,骆有庆,石摇 娟,等 (4342)……………………………
2009 年云南省白背飞虱早期迁入种群的虫源地范围与降落机制 沈慧梅,吕建平,周金玉 ,等 (4350)………
中华稻蝗长沙种群的生活史及其卵滞育的进化意义 朱道弘,张摇 超,谭荣鹤 (4365)…………………………
“518冶油桃主要害虫与其捕食性天敌的关系 施晓丽,毕守东,耿继光,等 (4372)………………………………
青藏东缘若尔盖高寒草甸中小型土壤动物群落特征及季节变化 张洪芝,吴鹏飞,杨大星,等 (4385)…………
青海可鲁克湖水鸟季节动态及渔鸥活动区分析 张国钢,刘冬平,侯韵秋,等 (4398)……………………………
排放与森林碳汇作用下云南省碳净排放量估计 刘慧雅,王摇 铮,马晓哲 (4405)………………………………
北京城市生态占水研究 柏樱岚,王如松,姚摇 亮 (4415)…………………………………………………………
专论与综述
植物水分传输过程中的调控机制研究进展 杨启良,张富仓,刘小刚,等 (4427)…………………………………
环境介质中的抗生素及其微生物生态效应 俞摇 慎,王摇 敏,洪有为 (4437)……………………………………
自然生态系统中的厌氧氨氧化 沈李东,郑摇 平,胡宝兰 (4447)…………………………………………………
研究简报
山东半岛南部海湾底栖动物群落生态特征及其与水环境的关系 张摇 莹,吕振波,徐宗法,等 (4455)…………
新疆乌伦古湖浮游甲壳动物的季节演替及与环境因子的关系 杨丽丽,周小玉,刘其根,等 (4468)……………
不同施肥与灌水量对槟榔土壤氨挥发的影响 卢丽兰,甘炳春,许明会,等 (4477)………………………………
学术信息与动态
水土资源保持的科学与政策:全球视野及其应用———第 66 届美国水土保持学会国际学术年会述评
卫摇 伟 (4485)
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期刊基本参数:CN 11鄄2031 / Q*1981*m*16*320*zh*P* ￥ 70郾 00*1510*34*
室室室室室室室室室室室室室室
2011鄄08
封面图说: 塞罕坝地处内蒙古高原南缘向华北平原的过渡带,地势分为坝上、坝下两部分。 解放初期,这里是“飞鸟无栖树,黄
沙遮天日冶的荒原沙丘,自 1962 年建立了机械化林场之后,塞罕坝人建起了 110 多万亩人工林,造就了中国最大的
人工林林场。 这是让人叹为观止的落叶松人工林海。
彩图提供: 陈建伟教授摇 国家林业局摇 E鄄mail: cites. chenjw@ 163. com
第 31 卷第 15 期
2011年 8月
生 态 学 报
ACTA ECOLOGICA SINICA
Vol. 31,No. 15
Aug. ,2011
http: / / www. ecologica. cn
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS鄄48)
收稿日期:2010鄄12鄄01; 摇 摇 修订日期:2011鄄04鄄26
*通讯作者 Corresponding author. E鄄mail: yanxiwu2002@163. com
虞志飞, 闫喜武, 杨霏, 王金海, 张跃环, 杨凤, 张国范.菲律宾蛤仔大连群体不同世代的遗传多样性.生态学报,2011,31(15):4199鄄4206.
Yu Z F, Yan X W, Yang F, Wang J H, Zhang Y H, Yang F, Zhang G F. Genetic diversity of different generations of the Dalian population of Manila clam
Ruditapes philippinarum through selective breeding . Acta Ecologica Sinica,2011,31(15):4199鄄4206.
菲律宾蛤仔大连群体不同世代的遗传多样性
虞志飞1, 闫喜武1,*, 杨摇 霏1, 王金海1, 张跃环1, 杨摇 凤1, 张国范2
(1.大连海洋大学 生命科学与技术学院,辽宁 大连摇 116023; 2. 中国科学院海洋研究所,山东 青岛摇 266071)
摘要:采用 12对有效微卫星引物对大连群体菲律宾蛤仔连续 4个选育世代(F1、F2、F3、F4)的 144 个个体进行了遗传多样性分析。
结果表明:共获 121个等位基因,每个位点的等位基因数在 2—6个不等,其大小在 101—273 bp之间;各个世代平均等位基因数在
3. 75—4. 58,平均观测杂合度在 0. 3391—0. 3860之间。 从 F鄄检验结果上看,所有世代内有 2 个位点遗传分化较弱,8 个位点遗传
分化中等,2个位点遗传分化较大;配对比较 Fst值(0. 05—0. 15)表明 4个世代群体间遗传分化程度中等。 Fis值表明有 2个世代位
点杂合度处于过剩状态;但对连续 4个世代而言,每个世代均表现出一定程度的杂合子缺失。 随着世代连续选育的进行,Nei氏遗
传相似性逐渐减小(0. 8203鄄0. 8107鄄0. 8031);遗传距离逐渐增大(0. 1918鄄 0. 2099鄄 0. 2129);不同世代群体间遗传相似性系数为
0郾 7873—0. 8685,遗传距离为 0. 141—0. 2391。 4个世代平均 PIC值为 0. 5055,表明选育后代遗传多样性较好,还有较大的选育潜
力,可以继续进行上选。
关键词:菲律宾蛤仔;微卫星;遗传多样性;遗传分化
Genetic diversity of different generations of the Dalian population of Manila clam
Ruditapes philippinarum through selective breeding
YU Zhifei1, YAN Xiwu1,*, YANG Fei1, WANG Jinhai1, ZHANG Yuehuan1, YANG Feng1, ZHANG Guofan2
1 The Institute of Life Science and Technology, Dalian Ocean University, Dalian 116023, China
2 Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China
Abstract: The present study examined the genetic structure and variation among different generations of Manila clam
Ruditapes philippinarum obtained through selective breeding by using 12 microsatellite markers. Four consecutive generations
(F1, F2, F3, and F4 ) were selected with 10% selection intensity from a wild population from Shihe, Dalian (Liaoning
Province, China). Thirty six individuals were sampled from each generation. Among the 12 microsatellite loci, 121 alleles
were detected. The number of alleles on each locus varied from 2 to 6 and the allele size ranged from 101 to 273 bp. Each
generation had average effective alleles of 3. 75 4. 58 and average observed heterozygosity of 0. 3391 0. 3860. Based on P
values of genotypes, all four generations deviated from the Hardy鄄Weinberg equilibrium with varying degrees. Of the 48
generation 伊 locus combinations (4 generations 伊 12 loci), 27 of which were not in an equilibrium state. Except the locus
Asari24, all polymorphic loci had positive inbreeding coefficients (Fis), indicating that high degree of inbreeding existed in
all four generations. The inter鄄generation fixation indices (Fst) varied from 0. 0338 to 0. 2136 and there was significant genetic
differentiation among the 12 polymorphic loci. The F鄄statistics showed that among all generations two loci had weak genetic
differentiation, eight loci had moderate, and the remaining two loci had high genetic differentiation. Pairwise Fst values ranged
from 0. 05 to 0. 15, which also indicated that the clam had moderate genetic differentiation among the generations. Based on
the Fis values, two out of four generations exhibited heterozygote excess, but all the generations in sequence showed some
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degree of heterozygote deficiency. The Nei忆s genetic similarity decreased (0. 8203寅0. 8107寅0郾 8031) and genetic distance
increased (0. 1918寅0. 2099寅0. 2129) from one generation to the next through selective breeding. The genetic similarity
coefficients among the different generations ranged from 0. 7873 to 0. 8685, and genetic distance varied from 0. 141 to 0. 2391.
These results demonstrated that there was moderate genetic differentiation among the four generations. In the present study,
overall average polymorphism information content (PIC) of 0. 5055 was observed, indicating that there is great potential for
future selections of Manila clam through selective breeding.
Key Words: Ruditapes philippinarum; microsatellite; genetic diversity; genetic differentiation
菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)广泛分布在我国南北沿海,是我国四大养殖贝类之一。 其生长迅速,养
殖周期短,适应性强,是一种适合于人工高密度养殖的优良贝类。 作为单产最高的经济软体动物,其 2009年产量
300多万吨,约占海水养殖贝类产量的 30%,近海水养殖总产量 20%,世界蛤仔总产量 90%以上[1]。 混合选择是
从原有品种的群体中,按照选育目标选出多数表型性状优良的个体,通过自由交配繁殖后代,并以原有品种和当
地品种作为对照,进行比较鉴定来选择的方法[2]。 由于操作简便,易于推广,广泛的应用在植物和陆生动物的品
种改良上,通过连续的混合选择,可以得到生长快、抗逆性强、出肉率高、产量高的养殖良种。 目前,对水产动物
而言,连续混合选择主要应用在鱼类[3]育种上,对贝类的研究有一些相关报道,如牡蛎[4鄄5]、海湾扇贝[6鄄7]、珍珠
贝[8]、菲律宾蛤仔[9]等。
从分子水平上看,已有研究报道认为经选育后的子代群体其遗传多样性与亲本群体相比往往要降低[10鄄14]。
因此,选育过程中,在进行表型性状监测工作的同时,应对选育群体遗传结构的变化进行分析。 随着分子生物学
技术的发展,相继开发出 RAPD、AFLP、ISSR、SSR和 SNP等多种分子标记技术,这些分子标记技术为生物遗传结
构的评估提供了新的途径。 微卫星(microsatellite)具有多态信息含量大、重复性好、基因座位数目大、共显性遗
传、突变率高等优点,因而被广泛应用于动植物种群的遗传多样性研究。 有关菲律宾蛤仔群体同工酶分析[15]、遗
传多样性 AFLP分析[16]和 28S rRNA分析[17]等已有研究,但尚未有菲律宾蛤仔世代选育群体遗传多样性分析的
报道。 本研究利用 SSR技术分析选育群体 4个世代遗传多样性的变化,旨在从分子水平上探讨选育对菲律宾蛤
仔养殖群体遗传结构的影响,为蛤仔种质资源的保护和可持续利用,以及为有效地开展遗传育种研究提供理论
依据。
1摇 材料与方法
1. 1摇 实验材料
菲律宾蛤仔选育基础群为大连石河近海的野生蛤仔,从 2006年起,开始按照 10%的选择强度,进行上选,每
个世代选择周期为 1 a[1]。 样品从每个世代上选组中随机选取 36 个,分别命名为 F1、F2、F3、F4。 活体运回后保
存在- 80 益下保存备用。
1. 2摇 实验方法
1. 2. 1摇 基因组 DNA的提取与检测
用常规的苯酚 /氯仿 /异戊醇法[18]抽提 DNA,F1、F2、F3、F4分别提取 36 个 DNA样品,挑选质量好的 DNA将
浓度稀释至 50 ng / 滋L, 置于-20 益保存备用。
1. 2. 2摇 PCR扩增
引物来源:前 6条引物为本实验室开发获得[19];后 6条引物为 Yasuda N等[20]开发所得。
PCR反应体系:总体积为 25 滋L,其中模板 DNA 1滋L,10伊PCR Buffer 2. 5 滋L,Taq 酶 0. 2滋L,上、下游引物各
1滋L,dNTP混合物 0. 5滋L,用 ddH20补足至 25滋L。
PCR反应程序:94 益预变性 5 min;然后 94 益变性 1 min;50—58 益退火 1 min;72 益延伸 40 s;30个循环;72
益延伸 10 min;4 益保存。
0024 摇 生摇 态摇 学摇 报摇 摇 摇 31卷摇
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扩增产物的检测:PCR 产物在 8%非变性聚丙烯凝胶下电泳,160 V 恒压 3 h。 0. 1%硝酸银染色,用美国
UVP凝胶成像系统(BioSpectrum誖 AC Imaging System,USA)成像。
表 1摇 微卫星标记核心序列、引物序列及其退火温度
Table 1摇 Core sequences, primer sequences and annealing temperatures of microsatellite DNA marker
微卫星位点
Loci
GenBank注册号
Registration No.
引物序列(5忆寅3忆)
Primer sequences(5忆寅3忆)
核心序列
Core sequences
PCR片段长度 / bp
fragment length
退火温度
Tm / 益
Rp鄄03 AM873616
Rp鄄05 AM872674
Rp鄄07 AM874000
Rp鄄08 AM873997
Rp鄄11 AM873203
Rp鄄12 AM875824
Asari16 AB257421
Asari24 AB257423
Asari54 AB257426
Asari55 AB257427
Asari62 AB257428
Asari 64 AB257429
F: 5忆 CCGCTGTGAGGAGACCAA 3忆
R: 5忆 CCGCCTATGTGACAAAATGA 3忆
F: 5忆 GGATCATAGCGTTGTTTG 3忆
R: 5忆 TAGTATTTCTCCGCCACC 3忆
F: 5忆 TATGGCTGGTTTGGACTG 3忆
R: 5忆 TCCCGTTACACTTACTTTCA 3忆
F: 5忆 AAGGTTTGGCTGTGAGGA 3忆
R: 5忆 TCCCGTTACACTTACTTTCATC 3忆
F: 5忆 CAAATGAAGTTGGGAAGT 3忆
R: 5忆 GCCTGGCTAAATAAGTAA 3忆
F: 5忆 TTTATTTACCAACGCTCCT 3忆
R: 5忆 TCCCCTATTTTCCATTCA 3忆
F: 5忆 GCTCGAGTCTGATTGGCTACTTGAA 3忆
R: 5忆 GGTATCTAGTCAGCTCTTGCAGTA 3忆
F: 5忆 CCTACGACATGTGGGTTATTT 3忆
R: 5忆 TGTTTTACCTGTCCATCATTCA 3忆
F: 5忆 AACGTCTTTTAATCATGGATGTGAA 3忆
R: 5忆CCATATATCATATCATGATATCATCTCTAGA 3忆
F: 5忆 TGGCTTTGTCAATTGTGTATTGTG 3忆
R: 5忆 GACAAATTGGCTTTATTTGGAGG 3忆
F: 5忆 AGTTGTACAGCAGCTCAGCAT 3忆
R: 5忆 CAAATAACTAAACATTTTCAGACTGC 3忆
F: 5忆 GTATCTGAATGGGTTGTTATTGTGAA 3忆
R: 5忆 GCAAAATCATTTCGTTTGATGC 3忆
(TTG)6 170-213 58
(AC)5 101-138 54
(AT)7 119-151 51
(AT)7 146-181 54
(TA)5 195-273 50
(AT)5 193-238 50
(CT)12 151-174 55
(GT)5
CT(GT)3 147-186 55
(CT)9 212-246 55
A9GCGTT(CTT)8 184-223 55
(CT)7C3(CT)5
(GA)3 196-272 55
(CT)12C2(GA)12 112-149 55
摇 摇 F:上游引物; R:下游引物
1. 3 摇 数据统计与分析
电泳凝胶经美国 UVP凝胶成像系统成像,结合凝胶电泳分析软件 Gel-Pro Analyzer 4. 0 根据标准 Marker
(大连 100)读出扩增片段长度的大小,确定个体的基因型。 利用 POPGENE 1. 31 软件进行数据处理。 计算 4
个世代每个标记位点的多态信息含量(Polymorphism information content,PIC) [21],以及各个样本的等位基因数
(Na)、有效等位基因数(Ne) [22]、观察杂合度(Ho)和预期杂合度(He) [23]等以及 F is、Fst值的 F鄄分析和基于基
因型的 P值[24]等参数,进行遗传多样性分析。 并计算群体间的遗传相似性系数、遗传距离和遗传分化系数。
具体参数的计算方法如下:
群体多态位点比例摇 P=多态位点总数 /位点总数
多态信息含量摇 PIC = 2移
n-1
i = 1
移
n
j = i+1
P iP j(1 - P iP j) , P i
式中 P j 分别为群体中第 i 、 j个等位基因频率, n为等位基因数。
有效等位基因数摇 Ne = 1 /移
n
i = 1
P i 2
式中, P i 为该位点上第 i个等位基因的频率。
观察杂合度摇 Ho = 杂合子观察数 / 观察个体总数 。
期望杂合度摇 He = 1 - 移P i 2
式中, P i 为该位点上第 i个等位基因的频率。
1024摇 15期 摇 摇 摇 虞志飞摇 等:菲律宾蛤仔大连群体不同世代的遗传多样性 摇
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群体间的相似性指数摇 I =移(X iYi) / {移 (X i) 2移 (Yi) 2} 1 / 2
式中, X i 、 Yi 分别为 X和 Y群体第 i个等位基因的频率。
群体间遗传距离 D =- lnI
固定指数( F is ) F is = 1 - (Ho / He)
F鄄统计量( Fst ) Fst = 滓2P / P(1 - P)
式中,P为某等位基因在整个群体中的平均频率; 滓2P为该等位基因在分群体之间的方差。
2摇 结果
2. 1摇 PCR扩增结果
从随机挑选的 22 对菲律宾蛤仔微卫星引物中筛选出 12 对有效扩增引物(表 1)。 用 8%非变性聚丙烯酰
胺凝胶电泳检测,得到清晰谱带。 图 1 为位点 Rp鄄11 对 F1—F44 个世代的扩增结果。
200
200
200
200100
100
F4
F3
F2
F1
100
100
图 1摇 微卫星位点 Rp鄄11 在 4 个世代中的扩增结果
Fig. 1摇 Expansion results of microsatellite loci Rp鄄11 in 4 generations of Manila clam
2. 2摇 各个基因位点的遗传多态性
对菲律宾蛤仔 4 个世代进行了 12 个多态位点的 PCR扩增,共得到 121 个等位基因。 每个位点得到的等
位基因数从 2—6 个不等,产物片段长度在 101—273 bp之间。 各个位点的 PIC值为 0. 1948—0. 7183。 4 个世
代的平均观测杂合度分别为 0. 3786、0. 3391、0. 3860、0. 3574。 通过计算基因型的 P 值检验,4 个世代的
Hardy鄄Weinberg平衡偏离常数均发生了不同程度的偏离,结果见表 2,偏离极其显著的群体位点用＊表示。 对
4 个世代、12 个多态位点进行 Hardy鄄Weinberg 平衡检测,发现检测的 48 个数据(4 个世代伊12 个位点)中,有
27 个偏离遗传平衡状态。
2. 3摇 世代间遗传变异与分化
除位点 Asari24 外,其余 11 个多态位点近交系数 F is值均为正值,表明 4 个世代的近交程度比较严重。 世
代间各位点遗传分化(Fst)值在 0. 0338—0. 2136 之间,显著性检验表明,4 个世代在 12 个多态位点表现出显
著的遗传分化。 从 F鄄检验的数据来看,4 个世代内有 2 个位点遗传分化较弱,8 个位点遗传分化中等,2 个位
点遗传分化较大(表 3);配对比较 Fst值(0. 05F is值的计算表明,有 7 个群体位点杂合子处于过剩状态,对整个世代而言,除位点 Asari24 外,其余各位点均
表现为一定程度的杂合子缺失。
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4 个世代
4 generations
Rp鄄03 0. 6461 0. 5444 0. 5135 0. 1589 0. 4516 0. 0581
Rp鄄05 0. 7649 1. 0000 0. 7143 0. 9471 0. 8668 0. 1406
Rp鄄07 0. 0109 -0. 0834 0. 1388 0. 5386 0. 1694 0. 0481
Rp鄄08 0. 5546 0. 2862 0. 2482 0. 8043 0. 5194 0. 2136
Rp鄄11 0. 6580 0. 4154 0. 2536 0. 5339 0. 4792 0. 0580
Rp鄄12 0. 1800 0. 7641 0. 4965 0. 5101 0. 4871 0. 1425
Asari16 0. 0423 -0. 1189 0. 1688 0. 3096 0. 1049 0. 0669
Asari24 0. 0357 -0. 1803 -0. 2095 -0. 1447 -0. 1254 0. 0338
Asari54 0. 5780 1. 0000 0. 5716 0. 2141 0. 4713 0. 0661
Asari55 0. 6303 0. 5445 0. 4127 0. 8494 0. 5933 0. 1273
Asari64 0. 1860 0. 1404 -0. 1636 -0. 1208 0. 0193 0. 1785
采用 Nei[23]的方法计算世代间的相似性系数和遗传距离(表 5)。 随着选育的进行,F1与后续世代的遗传
相似性逐渐减小(0. 8203—0. 8107—0. 8031),遗传距离逐渐增大(0. 1918—0. 2099—0. 2129)。 不同世代间
的遗传相似性系数为 0. 7873—0. 8685,遗传距离为 0. 141—0. 2391。 结果都表明 4 个世代间的遗传分化程度
不高。
摇 表 4摇 菲律宾蛤仔不同世代间 12 个微卫星位点
配对比较的 Fst值
Table 4摇 Comparison on Pairwise Fst values of Manila clam among
different generations at 12 microsatellite loci
世代 Generations F1 F2 F3 F4
F1 —
F2 0. 0718 —
F3 0. 0725 0. 0971 —
F4 0. 0624 0. 0565 0. 0654 —
摇 表 5 摇 F1—F4群体的 Nei 氏遗传距离(下三角)及遗传相似性系数
(上三角)
Table 5 摇 Nei忆 s genetic distance ( below ) and genetic identity
(above) between the F1—F4
世代 Pop ID F1 F2 F3 F4
F1 **** 0. 8203 0. 8107 0. 8031
F2 0. 1918 **** 0. 7873 0. 8685
F3 0. 2099 0. 2391 **** 0. 8371
F4 0. 2129 0. 1410 0. 1778 ****
3摇 讨论
3. 1摇 微卫星位点的高度多态性
菲律宾蛤仔选育基础群体 F1为大连石河近海的野生蛤仔,从 2006 年起,开始按照 10%的选择强度,进行
上选,每个世代选择周期为 1,连续上选的 3 个世代依次为 F2、F3、F4,因此对其各个世代进行遗传结构分析,
了解各世代间的遗传变化,对下一步制定育种策略具有很重要的意义。 目前,已有不少利用微卫星标记对世
代群体进行研究的报道[25鄄30]。 本研究中,选用的微卫星位点在 F1世代的多态性含量在 0. 2859—0. 7135,平均
为 0. 566。 每个位点的等位基因在 2—6 之间,平均等位基因数为 4. 5833。 具有较高的多态性水平。 根据
Barker[31]观点,带有 4 个或 4 个以上等位基因的微卫星位点才能很好的进行物种遗传多样性评估。 这说明这
12 对微卫星标记能很好的用于本研究。
在本研究中,每个位点的有效等位基因数从 1. 0571 到 4. 1013,与李旭光等[15]利用同工酶方法检测得到
的有效等位基因数为 1. 4891—1. 6325 相比是比较多的。 4 个世代的平均杂合度分别为 0. 3786、0. 3391、
0郾 3860、0. 3574。 也比同工酶所报道的高。 与同工酶等技术相比,微卫星位点的高度多态性,以及遗传标记以
孟德尔方式共显性遗传等优点,决定了 SSR标记被广泛应用于生物学研究的各个领域,尤其在亲缘关系相近
或地理位置相近群体的分子标记辅助育种中进行家系确定等起到非常重要的作用[32鄄34]。
3. 2摇 世代内的遗传多样性
群体的遗传多样性主要表现在杂合度和等位基因数两个方面[35鄄37]。 本研究的 4 个世代的平均观测杂合
度和期望杂合度分别为 0. 3391—0. 3860、0. 5042—0. 6274;从等位基因数来看,位点的基因型数为 2—15,而
各世代每个位点的等位基因数从 2—6 个不等,与闫喜武等[19]研究 3 个地理群体蛤仔的平均观测和期望杂合
4024 摇 生摇 态摇 学摇 报摇 摇 摇 31卷摇
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度(0. 2383—0. 4387 和 0. 5526—0. 6488)、位点的基因型数(3—17 个)相比,结果相差不大。 与 Yasuda N
等[20]的蛤仔群体中 Ho =0. 136—0. 909,He =0. 553—0. 954 的结果亦相差不大。 表明 4 个世代的遗传多样性
较高且群体内差异不显著。
世代内 85%近交系数 F is值为正值,说明世代内均表现出一定水平的近交,造成不同程度的杂合子缺失,
显著的杂合子缺失情况在很多海洋生物中被报道[35鄄37]。 4 个世代均有不同程度的杂合子缺失,通过 Hardy鄄
Weinberg平衡检验,发现在世代内杂合子过剩的微卫星位点偏离 Hardy鄄Weinberg 平衡。 Ball 等[38]发现哑等
位基因的存在可能是杂合子缺失现象不可缺少的因素之一。
3. 3摇 世代间的遗传与分化
从本研究的结果看,人工选育对选育群体的遗传结构产生显著的影响,世代总遗传分化指数为 0. 103,根
据Wright[34]对遗传分化指数的界定,Fst值在 0—0. 05 之间,群体遗传分化较弱;0. 05—0. 15 之间,群体遗传分
化中等;0. 15—0. 25 之间,表示群体遗传分化较大;当 Fst值大于 0. 25 时,表示分化极大。 表明所有世代遗传
分属于中等分化水平。 F4相对于 F1世代而言,等位基因数,平均观测杂合度等均有所下降,表明随着选育的
进行,世代的遗传基础趋向纯化。 本研究结果表明,世代间处于中等分化水平(0. 05间遗传距离和遗传相似性的计算结果显示,随着选育的进行,F1与 F2、F3、F4的遗传距离逐渐增大(0. 1918—
0郾 2129),遗传相似性逐渐缩小(0. 8203—0. 8031)。 表明随着选育的进行,选择压力在一定程度上改变了选
育群体的遗传结构,群体的遗传结构逐步趋向稳定。
本研究中所用样品均为野生型蛤仔后代,具有较高的遗传多样性,是开展品种培育的优良材料。 每代都
是从上一代中按照 10%选择强度繁育而来,故选育后代在生长性状方面有着优良的表现。 经连续上选的 F4
世代遗传多样性仍然较高,说明还具有一定得选育潜力。 以往的部分研究表明,选择是有极限的;但还有一部
分研究认为选择是无极限的,因为上选群体的个体在生长过程中,存在着遗传变异,本文研究结果支持后者。
因此,还可在此基础之上,进一步上选其生长性能,为蛤仔快速生长核心品系的开发提供理论基础。
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6024 摇 生摇 态摇 学摇 报摇 摇 摇 31卷摇
ACTA ECOLOGICA SINICA Vol. 31,No. 15 August,2011(Semimonthly)
CONTENTS
Trophic group responses of ground arthropods to land鄄cover change and management disturbance
LI Fengrui, LIU Jiliang, HUA Wei,et al (4169)
………………………………………
……………………………………………………………………………………
Construction and comparative analysis of enriched microsatellite library from Liposcelis bostrychophila and L. entomophila genome
WEI Dandan, YUAN Minglong, WANG Baojun, et al (4182)
……
……………………………………………………………………
Development of EST鄄SSRs markers and analysis of genetic diversities among different geographical populations of Manila clam
Ruditapes philippinarum YAN Xiwu, YU Zhifei, QIN Yanjie, et al (4190)………………………………………………………
Genetic diversity of different generations of the Dalian population of Manila clam Ruditapes philippinarum through selective breeding
YU Zhifei, YAN Xiwu, YANG Fei, et al (4199)
…
…………………………………………………………………………………
Comparative study of spike differentiation in wheat in the glasshouse and field
JIANG Lina, ZHAO Yanling, SHAO Yun, et al (4207)
…………………………………………………………
……………………………………………………………………………
Effects of organic fertilizer on growth and endogenous hormone contents of wheat seedlings under salt stres
LIU Haiying, CUI Changhai, ZHAO Qian, et al (4215)
……………………………
……………………………………………………………………………
Impacts of climatic change on spring wheat growth in a semi鄄arid region of the Loess Plateau: a case study in Dingxi, Gansu
Province YAO Yubi, WANG Runyuan,YANG Jinhu,et al (4225)…………………………………………………………………
Dynamic changes in nitrogen and phosphorus concentrations and emission鄄reduction potentials in paddy field water under different
tillage models FENG Guolu, YANG Renbin (4235)………………………………………………………………………………
Effects of planting and straw returning of transgenic Bt maize on soil enzyme activities under field condition
YAN Shilei, ZHAO Lei, SUN Hongwei, et al (4244)
…………………………
………………………………………………………………………………
Effects of short鄄term flooding on Geobacteraceae spp. and Anaeromyxobacter spp. abundance in paddy soil
ZHU Chao, Stefan Ratering, QU Dong, et al (4251)
……………………………
………………………………………………………………………………
Adaptative adjustments of the sowing date of late season rice under climate change in Guangdong Province
WANG Hua,CHEN Xinguang,HU Fei,et al (4261)
……………………………
…………………………………………………………………………………
Carbon and nitrogen sequestration rate in long鄄term fenced grasslands in Inner Mongolia, China
HE Nianpeng, HAN Xingguo, YU Guirui (4270)
………………………………………
…………………………………………………………………………………
Ecosystems carbon storage and carbon sequestration potential of two main tree species for the Grain for Green Project on China忆s
hilly Loess Plateau LIU Yingchun, WANG Qiufeng,YU Guirui, et al (4277)……………………………………………………
Wettability on plant leaf surfaces and its ecological significance SHI Hui, WANG Huixia, LI Yangyang (4287)……………………
Seasonal dynamics of litter accumulation in major forest communities on the northern slope of Changbai Mountain, Northeast China
ZHENG Jinping,GUO Zhongling,XU Chengyang,et al (4299)
………
………………………………………………………………………
A comparative study of seed germination traits of 52 species from Gurbantunggut Desert and its peripheral zone
LIU Huiliang, SONG Mingfang, DUAN Shimin, et al (4308)
………………………
………………………………………………………………………
The reproductive ecological characteristics of Sinosenecio jishouensis (Compositae) and its endangerment mechanisms
DENG Tao, CHEN Gongxi, ZHANG Daigui, et al (4318)
………………
…………………………………………………………………………
Iterative algorithm for analyzing the influence of the proportion of permanently destroyed sites on the equilibrium abundances of
species SHI Peijian,GE Feng,YANG Qingpei (4327)……………………………………………………………………………
Physiological mechanism of foliage spraying paclobutrazol on increasing salt tolerance of Jatropha curcas seedlings
MAO Yiqing, ZHENG Qingsong, CHEN Jianmiao, et al (4334)
……………………
…………………………………………………………………
Spatial ecological niche of main insect borers in larch of Aershan YUAN Fei,LUO Youqing,SHI Juan,et al (4342)…………………
Source areas and landing mechanism of early immigration of white鄄backed planthoppers Sogatella furcifera (Horv佗th) in Yunnan,
2009 SHEN Huimei, L譈 Jianping, ZHOU Jinyu , et al (4350)…………………………………………………………………
Life history and the evolutionary significance of egg diapause in Changsha population of the rice grasshopper, Oxya chinensis
(Orthoptera: Catantopidae) ZHU Daohong, ZHANG Chao, TAN Ronghe (4365)…………………………………………………
Relationships between main insect pests and their predatory natural enemies in “518冶 nectarine orchard
SHI Xiaoli,BI Shoudong,GENG Jiguang,et al (4372)
……………………………
………………………………………………………………………………
Dynamics of soil meso鄄 and microfauna communities in Zoig俸 alpine meadows on the eastern edge of Qinghai鄄Tibet Plateau, China
ZHANG Hongzhi, WU Pengfei, YANG Daxing, et al (4385)
………
………………………………………………………………………
Seasonal changes in waterbirds population and movements of Great Black鄄headed Gull Larus ichthyaetus at Keluke Lake of Qinghai,
China ZHANG Guogang, LIU Dongping, HOU Yunqiu, et al (4398)……………………………………………………………
Predictions of net carbon emissions based on the emissions and forest carbon sinks in Yunnan Province
LIU Huiya, WANG Zheng, MA Xiaozhe (4405)
………………………………
……………………………………………………………………………………
Ecological water depletion by human use in Beijing City BAI Yinglan, WANG Rusong, YAO Liang (4415)…………………………
Review and Monograph
Research progress on regulation mechanism for the process of water transport in plants
YANG Qiliang, ZHANG Fucang, LIU Xiaogang, et al (4427)
…………………………………………………
……………………………………………………………………
Antibiotics in environmental matrices and their effects on microbial ecosystems YU Shen, WANG Min, HONG Youwei (4437)……
Anaerobic ammonium oxidation in natural ecosystems SHEN Lidong, ZHENG Ping, HU Baolan (4447)………………………………
Scientific Note
Ecological characteristics of macrobenthic communities and their relation to water environmental factors in four bays of southern
Shandong Peninsula ZHANG Ying, L譈 Zhenbo, XU Zongfa, et al (4455)………………………………………………………
Seasonal succession of crustacean zooplankton in relation to the major environmental factors in Lake Ulungur, Xinjiang
YANG Lili,ZHOU Xiaoyu,LIU Qigen,et al (4468)
……………
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Effect of different fertilization and irrigation practices on soil ammonia volatilization of Arecanut (Areca catechu L. )
LU Lilan, GAN Bingchun, XU Minghui, et al (4477)
………………
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2009 年度生物学科总被引频次和影响因子前 10 名期刊绎
(源于 2010 年版 CSTPCD数据库)
排序
Order
期刊
Journal
总被引频次
Total citation
排序
Order
期刊
Journal
影响因子
Impact factor
1 生态学报 11764
2 应用生态学报 9430
3 植物生态学报 4384
4 西北植物学报 4177
5 生态学杂志 4048
6 植物生理学通讯 3362
7
JOURNAL OF INTEGRATIVE
PLANT BIOLOGY
3327
8 MOLECULAR PLANT 1788
9 水生生物学报 1773
10 遗传学报 1667
1 生态学报 1. 812
2 植物生态学报 1. 771
3 应用生态学报 1. 733
4 生物多样性 1. 553
5 生态学杂志 1. 396
6 西北植物学报 0. 986
7 兽类学报 0. 894
8 CELL RESEARCH 0. 873
9 植物学报 0. 841
10 植物研究 0. 809
摇 绎《生态学报》 2009 年在核心版的 1964 种科技期刊排序中总被引频次 11764 次,全国排名第 1; 影响因
子 1郾 812,全国排名第 14;第 1—9 届连续 9 年入围中国百种杰出学术期刊; 中国精品科技期刊
摇 摇 编辑部主任摇 孔红梅摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 执行编辑摇 刘天星摇 段摇 靖
生摇 态摇 学摇 报
(SHENGTAI摇 XUEBAO)
(半月刊摇 1981 年 3 月创刊)
第 31 卷摇 第 15 期摇 (2011 年 8 月)
ACTA ECOLOGICA SINICA
摇
(Semimonthly,Started in 1981)
摇
Vol郾 31摇 No郾 15摇 2011
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