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Transferability of COSⅡ in Phyllostachys

COSⅡ分子标记在刚竹属的通用性


应用30对COSⅡ引物对刚竹属4个竹种及其一个栽培变型进行PCR扩增,电泳结果显示,所有引物都可以在至少3个竹种中获得特异性PCR产物,共扩增出101条带,其中88条表现出多态性,占87.13%。其中2对引物在5份材料中均扩增出一致的多拷贝条带。利用NTsys 2.10e软件,对5个供试竹种材料的亲缘关系进行了分析,从聚类结果看,当遗传系数为0.658时,5个供试材料可以分为3类,紫竹与花哺鸡竹各自单独成一类,桂竹、罗汉竹和斑竹的亲缘关系比较近,形成第3类。这一分类结果与形态学分类结果大致吻合,表明基于水稻等禾本科植物的基因组序列开发出来的COSⅡ分子标记在竹类植物中具一定通用性,且可用于鉴定竹种间的亲缘关系。


全 文 :摇 核 农 学 报摇 圆园员猿袁圆苑渊员圆冤院员苑怨苑 耀 员愿园圆允燥怎则灶葬造 燥枣 晕怎糟造藻葬则 粤早则蚤糟怎造贼怎则葬造 杂糟蚤藻灶糟藻泽
收稿日期院圆园员猿鄄园员鄄员缘摇 接收日期院圆园员猿鄄园猿鄄圆愿
基金项目院国家自然科学基金渊猿园怨园员员缘缘冤袁怨苑猿 项目渊圆园员圆悦月苑圆猿园园愿冤袁浙江省自然科学基金渊再猿园苑源怨怨冤
作者简介院肖国辉袁男袁主要从事植物分子生物学研究遥 耘鄄皂葬蚤造院泽泽憎澡员圆猿源缘岳 员远猿援 糟燥皂
通讯作者院郭小勤袁副教授袁主要从事植物生物技术研究遥 耘鄄皂葬蚤造院曾择早怎燥岳 扎葬枣怎援 藻凿怎援 糟灶
文章编号院员园园园鄄愿缘缘员渊圆园员猿冤员圆鄄员苑怨苑鄄园远
悦韵杂陨陨分子标记在刚竹属的通用性
肖国辉摇 钱纪梅摇 李兵娟摇 许在恩摇 郭小勤
渊浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地袁浙江 临安摇 猿员员猿园园冤
摘摇 要院应用 猿园 对 悦韵杂陨陨引物对刚竹属 源 个竹种及其一个栽培变型进行 孕悦砸扩增袁电泳结果显示袁所有
引物都可以在至少 猿 个竹种中获得特异性 孕悦砸 产物袁共扩增出 员园员 条带袁其中 愿愿 条表现出多态性袁占
愿苑郾 员猿豫 遥 其中 圆 对引物在 缘 份材料中均扩增出一致的多拷贝条带遥 利用 晕栽泽赠泽 圆郾 员园藻 软件袁对 缘 个供
试竹种材料的亲缘关系进行了分析袁从聚类结果看袁当遗传系数为 园郾 远缘愿 时袁缘 个供试材料可以分为 猿
类袁紫竹与花哺鸡竹各自单独成一类袁桂竹尧罗汉竹和斑竹的亲缘关系比较近袁形成第 猿 类遥 这一分类结
果与形态学分类结果大致吻合袁表明基于水稻等禾本科植物的基因组序列开发出来的 悦韵杂陨陨 分子标记
在竹类植物中具一定通用性袁且可用于鉴定竹种间的亲缘关系遥
关键词院悦韵杂域分子标记曰刚竹属曰通用性曰亲缘关系
摇 摇 竹 类 植 物 属 禾 本 科 渊 孕燥葬糟藻葬藻 冤 竹 亚 科
渊月葬皂遭怎泽燥蚤凿藻葬藻冤袁对水热条件要求高袁主要分布在热带
及亚热带地区袁但在 源远毅晕 和 源苑毅杂 都有分布咱员暂 遥 据报
道袁全世界竹类植物共 怨园 余属袁员圆园园 余种袁其中袁草本
竹类 圆愿 属袁员愿园 余种袁其余的均为木本竹类咱圆 原 缘暂 遥 刚
竹属植物种类繁多袁分布广袁面积大袁用途多袁本属 缘园
余种咱远暂 袁是竹亚科中种类最多的属遥 该属是竹类中耐
寒性较强的类群袁产于我国袁除东北尧内蒙古尧青海尧新
疆等地外袁全国各地均有自然分布遥 传统的竹子分类
主要基于竹种的形态特征袁而竹子极少开花结实袁再加
上竹子在形态上又极为相似袁对于竹种的鉴定与分类
就出现很大的局限性遥 阅晕粤 分子标记正好可以弥补
这种不足袁该技术能对不同发育时期的个体尧组织器官
甚至细胞作检测袁数量极多袁遍及整个基因组袁多态性
高袁遗传稳定袁不受环境及基因表达与否的限制咱苑 原 员园暂 遥
悦韵杂陨陨渊 泽蚤灶早造藻鄄糟燥责赠 燥则贼澡燥造燥早燥怎泽 早藻灶藻泽袁单拷贝直系
同源基因冤分子标记是基于具有功能基因渊如参与代
谢尧生物合成以及降解途径冤的保守序列开发出的袁能
扩增出保守直系同源基因序列的分子标记袁很适合未
测序基因组物种与其同源的物种间进行比较基因组研
究遥 该标记于 圆园园远 年 宰怎等咱员员 原 员猿暂首次基于茄属植物
开发出来的袁并成功用于番茄尧茄子尧辣椒及烟草间的
同线性研究遥 与其他分子标记相比袁该标记的优势在
于操作简单尧费用低遥 同时袁由于它的引物设计在基因
外显子的保守区域袁因此其特异性高袁稳定性好遥 禾本
科是种子植物中最有经济价值的袁随着水稻尧高粱和玉
米的基因组序列相继公布袁同科的竹类植物基因组序
列尚未公布袁严重制约了该物种的基础和应用研究遥
基于已公布的禾本科其他植物袁如水稻尧玉米尧高粱尧短
柄草及谷子的基因组序列袁鉴定出 圆远愿源 个 悦韵杂陨陨 基
因袁并开发出 员园苑圆 个 悦韵杂陨陨 分子标记袁该标记在部分
竹类植物中具有较好的通用性咱员源暂 遥 本研究从上述标
记中随机选取 猿园 对袁并选取刚竹属的四个竹种及一个
栽培变型进行验证袁旨在探索其在刚竹属植物中是否
通用袁并进一步研究所选取的不同竹种之间的亲缘关
系袁为优良竹种选择及竹类植物育种提供理论依据遥
员摇 材料与方法
员郾 员摇 植物材料
选取竹亚科刚竹属的 缘 个样本进行试验渊表 员冤遥
供试材料都采自浙江农林大学翠竹园遥 竹叶采集时间
为 圆园员员 年 源 月袁所采集的样本均通过专家的形态学鉴
定袁采集的样本直接放入液氮袁带回实验室用于基因组
苑怨苑员
核摇 农摇 学摇 报 圆苑 卷
阅晕粤的提取遥
表 员摇 供试样本材料
栽葬遭造藻 员摇 杂葬皂责造藻泽 怎泽藻凿 蚤灶 贼澡藻 泽贼怎凿赠
编号 晕燥援 样本名称 杂责藻糟蚤藻泽
员 花哺鸡竹渊孕澡赠造造燥泽贼葬糟澡赠泽 早造葬遭则葬贼葬冤
圆 桂竹渊孕澡援 则藻贼蚤糟怎造葬贼葬冤
猿 罗汉竹渊孕澡援 葬怎则藻葬冤
源 斑竹渊孕澡援 则藻贼蚤糟怎造葬贼葬 枣援 造葬糟则蚤皂葬鄄凿藻葬藻冤
缘 紫竹渊孕澡援 灶蚤早则葬冤
员郾 圆摇 基因组 阅晕粤提取尧孕悦砸扩增尧多态性检测
采用 悦栽粤月 法提取植物叶片 阅晕粤遥 引物序列及
所对应基因见表 圆遥 孕悦砸反应体系总体积为 员园滋蕴袁其
中含 缘园 灶早模板 阅晕粤曰上尧下游引物各 园郾 缘 滋皂燥造窑蕴 原员曰
圆园园 滋皂燥造窑蕴 原员 凿晕栽孕曰员 哉 栽葬择 阅晕粤 聚合酶曰员郾 园 滋蕴 员园
伊 孕悦砸反应缓冲液渊内含 酝早悦造圆 冤遥 采用降落 孕悦砸 技
术袁反应条件为院怨源益预变性 缘 皂蚤灶曰怨源益变性 猿园 泽袁
缘怨益退火 猿园 泽渊每循环递减 园郾 猿益冤袁苑圆益延伸 员 皂蚤灶袁
员园 个循环曰怨源益变性 猿园 泽袁缘缘益退火 猿园 泽袁苑圆益延伸 员
皂蚤灶袁员园 个循环曰苑圆益延伸 缘 皂蚤灶遥 对于扩增产物特异
性差或没有扩增产物的引物进一步优化起始退火温
度袁调整范围为 缘猿 耀 远园益遥 每对引物组合至少重复 圆
次以确保扩增结果的可靠性遥 扩增产物在 猿豫的琼脂
糖凝胶上电泳遥
员郾 猿摇 扩增结果的统计及遗传进化关系的分析
以相同迁移位置记作一个扩增位点袁统计每对引
物在 缘 个样本中 孕悦砸扩增获得的位点总数 晕贼曰单个材
料中扩增获得的位点数 晕遭曰多态性位点数 晕责遥 在每
个引物的相同迁移位点上袁以野员冶或野园冶记录条带信
息袁其中野员冶代表有扩增产物袁野园冶代表无扩增产物袁建
立一个数据矩阵遥 把距离矩阵输入 晕栽藻凿蚤贼 软件中袁用
晕贼泽赠泽模型构建树状聚类图遥 参照 粤灶凿藻则泽燥灶等咱员缘暂的方
法计算多态性信息含量渊孕陨悦冤袁 孕陨悦蚤 越 员 原 移灶躁 越 员责圆蚤躁袁
其中 责蚤躁 表示 蚤标记的 躁基因型的频率遥
表 圆摇 猿园 对 悦韵杂陨陨分子标记引物序列
栽葬遭造藻 圆摇 孕则蚤皂藻则 泽藻择怎藻灶糟藻泽 燥枣 贼澡藻 猿园 泽藻造藻糟贼藻凿 悦韵杂陨陨 皂葬则噪藻则泽
标记
晕葬皂藻
正向引物
云燥则憎葬则凿 责则蚤皂藻则
反向引物
砸藻增藻则泽藻 责则蚤皂藻则
水稻中基因名称
砸蚤糟藻 早藻灶藻
孕悦韵杂怨 郧粤悦郧栽郧悦粤悦郧郧悦粤栽悦粤粤悦栽粤悦 粤郧悦悦郧郧粤栽郧栽悦悦郧粤悦粤栽郧粤栽郧粤栽悦 耘曾责则藻泽泽 责则燥贼藻蚤灶
孕悦韵杂员苑 栽悦粤郧郧郧悦悦粤栽郧郧栽栽郧悦栽悦栽栽悦悦郧栽 悦郧郧粤粤粤郧郧悦悦粤栽粤郧郧粤粤悦郧粤郧粤粤 砸匀悦员粤 辕 砸陨晕郧鄄匀圆 枣蚤灶早藻则 悦员粤
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孕悦韵杂源缘 粤悦粤粤悦悦栽郧悦栽悦郧栽悦郧粤郧粤粤 粤悦悦栽悦栽悦悦粤栽郧郧悦悦栽悦粤粤悦 孕藻灶贼葬贼则蚤糟燥责藻责贼蚤凿藻 则藻责藻葬贼 渊孕孕砸冤 泽怎责藻则枣葬皂蚤造赠 责则燥贼藻蚤灶
孕悦韵杂源愿 郧郧粤栽郧悦粤栽栽郧悦栽悦栽郧悦粤郧栽粤悦粤栽 栽悦郧栽栽郧栽栽郧悦悦粤悦栽郧粤粤郧悦粤 枣藻则则藻凿燥曾蚤灶鄄则藻造葬贼藻凿
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孕悦韵杂远圆 郧栽悦栽栽悦粤粤悦栽悦悦悦栽悦悦栽悦栽悦 粤郧悦粤粤栽郧粤粤郧悦栽悦悦悦栽郧悦悦悦 栽藻贼则葬贼则蚤糟燥责藻责贼蚤凿藻 则藻责藻葬贼 渊栽孕砸冤 原 造蚤噪藻 泽怎责藻则枣葬皂蚤造赠 责则燥贼藻蚤灶
孕悦韵杂苑员 郧栽郧郧悦悦栽悦栽郧郧粤栽郧粤郧悦栽悦粤粤郧 郧郧郧郧悦粤郧悦栽栽栽悦粤粤郧悦栽郧 晕月鄄粤砸悦 凿燥皂葬蚤灶鄄糟燥灶贼葬蚤灶蚤灶早 凿蚤泽藻葬泽藻 则藻泽蚤泽贼葬灶糟藻 责则燥贼藻蚤灶
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孕悦韵杂员员圆 栽郧郧郧粤悦粤悦悦栽粤悦郧栽悦郧粤悦栽粤悦郧 郧郧粤栽郧悦栽郧悦粤郧粤栽郧粤粤郧栽粤郧悦郧 怎糟造葬糟赠葬灶蚤灶 员
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孕悦韵杂员圆员 郧粤郧郧悦郧悦粤郧栽粤悦郧栽郧郧粤郧粤栽郧粤粤 粤郧悦栽栽悦栽栽悦悦粤粤郧粤悦栽栽悦悦栽 匀藻葬增赠 皂藻贼葬造 贼则葬灶泽责燥则贼 辕 凿藻贼燥曾蚤枣蚤糟葬贼蚤燥灶 泽怎责藻则枣葬皂蚤造赠 责则燥贼藻蚤灶
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孕悦韵杂员缘苑 郧粤郧粤悦粤栽栽栽栽栽郧郧郧栽悦栽栽悦栽 郧郧悦粤栽悦栽郧悦粤栽悦栽栽栽郧粤悦粤栽悦 杂晕粤砸耘鄄造蚤噪藻 泽怎责藻则枣葬皂蚤造赠 责则燥贼藻蚤灶
愿怨苑员
摇 员圆 期 悦韵杂陨陨分子标记在刚竹属的通用性
表 圆渊续冤
标记
晕葬皂藻
正向引物
云燥则憎葬则凿 责则蚤皂藻则
反向引物
砸藻增藻则泽藻 责则蚤皂藻则
水稻中基因名称
砸蚤糟藻 早藻灶藻
孕悦韵杂员缘愿 郧粤栽郧栽悦粤粤粤郧粤栽郧悦粤郧粤栽郧悦悦 悦栽栽粤悦栽悦栽栽郧悦粤悦悦粤粤粤郧悦栽栽悦栽 杂晕粤砸耘鄄造蚤噪藻 泽怎责藻则枣葬皂蚤造赠 责则燥贼藻蚤灶
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孕悦韵杂员苑源 郧粤粤粤栽栽栽栽郧郧郧郧粤郧粤郧粤粤粤郧悦栽郧粤 粤栽郧粤郧郧悦栽悦粤郧郧粤郧郧粤粤粤悦粤悦粤郧粤 灶怎糟造藻燥造葬则 责则燥贼藻蚤灶 枣葬皂蚤造赠 远袁 责则燥贼藻蚤灶
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孕悦韵杂圆猿怨 郧郧悦粤粤悦栽粤栽郧悦栽粤郧栽郧悦栽悦栽郧栽栽悦 栽悦粤粤悦粤粤粤栽悦栽悦栽悦粤郧悦粤粤栽郧悦郧 凿藻造贼葬 泽怎遭怎灶蚤贼 燥枣 酝贼 粤栽孕 泽赠灶贼澡葬泽藻
孕悦韵杂圆源源 郧悦粤粤粤悦栽郧悦栽粤栽栽郧悦粤粤郧郧粤粤悦栽郧 粤栽郧粤栽郧郧栽郧悦悦粤栽郧郧粤郧栽粤栽郧悦栽 造蚤责蚤凿鄄遭蚤灶凿蚤灶早 泽藻则怎皂 早造赠糟燥责则燥贼藻蚤灶 枣葬皂蚤造赠 责则燥贼藻蚤灶
孕悦韵杂圆远源 悦栽悦悦粤郧郧栽悦粤悦悦粤粤悦粤栽悦粤悦 栽郧粤粤粤栽悦悦悦粤郧栽栽悦悦栽悦悦栽 孕造葬灶贼 责则燥贼藻蚤灶 燥枣 怎灶噪灶燥憎灶 枣怎灶糟贼蚤燥灶 渊阅哉云怨猿远冤
孕悦韵杂圆远远 粤栽郧悦栽悦粤郧郧粤悦栽郧粤郧悦粤栽粤栽栽栽 悦悦悦粤栽郧悦粤粤粤粤郧悦栽郧悦粤悦悦悦悦粤 灶贼藻早则葬造 皂藻皂遭则葬灶藻 责则燥贼藻蚤灶
孕悦韵杂圆怨猿 悦悦栽郧粤栽栽栽郧悦栽悦栽悦粤栽悦粤郧栽郧粤郧郧 粤郧粤郧悦粤郧悦栽郧郧郧栽郧郧栽栽栽栽郧粤栽悦栽栽栽 贼藻贼则葬贼则蚤糟燥责藻责贼蚤凿藻 则藻责藻葬贼 渊栽孕砸冤 原 糟燥灶贼葬蚤灶蚤灶早 责则燥贼藻蚤灶
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注院扩增引物分别为 孕悦韵杂员苑渊左冤尧孕悦韵杂员愿渊中冤尧孕悦韵杂源愿渊右冤遥 员院花哺鸡竹曰圆院桂竹曰猿院罗汉竹曰源院斑竹曰缘院紫竹遥
晕燥贼藻院蕴藻枣贼院 孕悦韵杂员苑 皂葬则噪藻则曰 酝蚤凿凿造藻院 孕悦韵杂员愿 皂葬则噪藻则曰 砸蚤早澡贼院 孕悦韵杂源愿 皂葬则噪藻则援 蕴葬灶藻 员院 孕澡援 早造葬遭则葬贼葬袁 造葬灶藻 圆院 孕澡援 则藻贼蚤糟怎造葬贼葬 袁
造葬灶藻 猿院 孕澡援 葬怎则藻葬袁 造葬灶藻 源院 孕澡援 则藻贼蚤糟怎造葬贼葬 枣援 造葬糟则蚤皂葬鄄凿藻葬藻袁 造葬灶藻 缘院 孕澡援 灶蚤早则葬援
图 员摇 部分引物的扩增结果
云蚤早援 员摇 孕悦砸 责则燥凿怎糟贼泽 燥枣 猿 则葬灶凿燥皂造赠 泽藻造藻糟贼藻凿 悦韵杂陨陨 皂葬则噪藻则泽 蚤灶 贼澡藻 枣蚤增藻 遭葬皂遭燥燥 泽葬皂责造藻泽 泽藻责葬则葬贼藻凿
遭赠 藻造藻糟贼则燥责澡燥则藻泽蚤泽 燥灶 猿豫 葬早葬则燥泽藻 早藻造
圆摇 结果与分析
圆郾 员摇 扩增结果
利用 猿园 对 悦韵杂陨陨 引物对 源 个竹种及一个栽培变
型进行 孕悦砸扩增遥 所有引物可以在至少 猿 个种中得
到特异性 孕悦砸产物袁员员渊猿远郾 苑豫 冤对引物在所有供试竹
种中都能扩增到产物渊表 猿冤袁其中袁孕悦韵杂员愿尧孕悦韵杂源愿
和 孕悦韵杂员员圆 这 猿 对引物在供试材料中没有多态性位
点袁这 猿 对标记的基因分别是 粤栽孕 结合蛋白袁铁氧化
还原蛋白和质蓝体素蛋白袁是维持生命和生理功能的
重要蛋白袁因此在不同竹种中的保守性非常高遥 在 缘
个供试材料中袁所有引物均可在斑竹中扩增出条带袁而
在紫竹中的扩增效果最差袁有 员愿 对引物渊远园豫 冤未能
在该样本中获得清晰条带遥 表明袁所开发的标记在刚
竹属多数竹种中具通用性遥
对 猿园 对 悦韵杂陨陨引物所在基因编码产物的功能分
类袁可将它们大致分为 缘 类袁分别为转运尧代谢尧细胞成
分组装尧生化过程及其他遥 从拷贝数来看袁所应用的
猿园 对引物在禾本科其他物种中均为单拷贝袁但从本试
验结果看袁孕悦韵杂源愿 和 孕悦韵杂员员圆 在所检测的样本中均
能扩增出 圆 条带袁表现出多拷贝的特性遥 孕悦韵杂员苑渊表
达蛋白冤尧孕悦韵杂 源怨渊含 栽孕砸结构蛋白冤尧孕悦韵杂 缘愿渊未知
功能蛋白 渊阅哉云远远愿冤冤尧孕悦韵杂 远圆 渊 栽孕砸鄄造蚤噪藻 超家族蛋
白袁 韵栽孕愿源 冤尧 孕悦韵杂 员员怨 渊外膜 韵酝孕愿缘 家族蛋白冤尧
孕悦韵杂 员圆愿 渊谷氨酸 原 员 原 半醛 圆袁员 原 氨基变位酶袁
郧杂粤圆冤尧孕悦韵杂 员缘愿 渊 杂晕粤砸耘鄄造蚤噪藻 超家族蛋白冤尧 孕悦韵杂
圆远源渊未知功能的植物蛋白 渊阅哉云怨猿远冤冤等 愿 对引物在
某些供试材料所扩增出的位点有些具多态性袁有些位
点不具有多态性遥
怨怨苑员
核摇 农摇 学摇 报 圆苑 卷
表 猿摇 不同引物在 缘 个供试样本中的扩增结果
栽葬遭造藻猿摇 栽澡藻 则藻泽怎造贼泽 燥遭贼葬蚤灶藻凿 遭赠 孕悦砸 憎蚤贼澡 悦韵杂陨陨
责则蚤皂藻则泽 蚤灶 泽葬皂责造藻泽 贼藻泽贼藻凿
标记
晕葬皂藻 晕贼 晕遭 晕责 孕陨悦
孕悦韵杂怨 猿 园 耀 猿 猿 园郾 苑圆
孕悦韵杂员苑 圆 员 耀 圆 员 园郾 猿圆
孕悦韵杂员愿 员 员 园 园
孕悦韵杂圆源 源 园 耀 源 源 园郾 苑圆
孕悦韵杂源圆 苑 园 耀 缘 苑 园郾 愿
孕悦韵杂源缘 苑 园 耀 苑 苑 园郾 苑圆
孕悦韵杂源愿 圆 圆 园 园
孕悦韵杂源怨 缘 圆 耀 缘 猿 园郾 缘远
孕悦韵杂缘远 猿 园 耀 猿 猿 园郾 愿
孕悦韵杂缘愿 圆 员 耀 圆 员 园郾 猿圆
孕悦韵杂远圆 源 圆 耀 源 猿 园郾 远源
孕悦韵杂苑员 远 园 耀 缘 远 园郾 愿
孕悦韵杂苑圆 源 园 耀 源 源 园郾 苑圆
孕悦韵杂员员圆 圆 圆 园 园
孕悦韵杂员员怨 圆 圆 耀 猿 圆 园郾 缘远
孕悦韵杂员圆员 猿 园 耀 猿 猿 园郾 苑圆
孕悦韵杂员圆愿 猿 员 耀 猿 圆 园郾 缘远
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孕悦韵杂员缘苑 圆 园 耀 圆 圆 园郾 缘远
孕悦韵杂员缘愿 源 员 耀 猿 猿 园郾 远源
孕悦韵杂员苑园 源 园 耀 源 源 园郾 缘远
孕悦韵杂员苑源 圆 园 耀 圆 圆 园郾 源愿
孕悦韵杂圆园愿 猿 园 耀 猿 猿 园郾 苑圆
孕悦韵杂圆员圆 猿 园 耀 猿 猿 园郾 远源
孕悦韵杂圆猿怨 圆 园 耀 圆 圆 园郾 苑圆
孕悦韵杂圆源源 员 园 耀 员 员 园郾 猿圆
孕悦韵杂圆远源 缘 员 耀 缘 源 园郾 缘远
孕悦韵杂圆远远 缘 园 耀 缘 缘 园郾 苑圆
孕悦韵杂圆怨猿 缘 园 耀 缘 缘 园郾 愿
孕悦韵杂猿员怨 猿 园 耀 猿 猿 园郾 苑圆
注院粤院 依据形态学分类列出的聚类图曰月院 基于 猿园 个标记结果的聚类图遥
晕燥贼藻院粤院 阅藻灶凿则燥早则葬皂 燥枣 早藻灶藻贼蚤糟 则藻造葬贼蚤燥灶泽澡蚤责 遭葬泽藻凿 燥灶 贼澡藻 皂燥则责澡燥造燥早蚤糟葬造 贼则葬蚤贼泽曰 月院 哉孕郧酝粤 贼则藻藻 燥枣 贼澡藻
枣蚤增藻 遭葬皂遭燥燥 泽葬皂责造藻泽 遭葬泽藻凿 燥灶 猿园 孕悦韵杂陨陨 皂葬则噪藻则泽援
图 圆摇 缘 个供试样本的聚类图
云蚤早援 圆摇 栽澡藻 早藻灶藻贼蚤糟 则藻造葬贼蚤燥灶泽澡蚤责 燥枣 枣蚤增藻 遭葬皂遭燥燥 葬糟糟藻泽泽蚤燥灶泽
圆郾 圆摇 缘 个供试竹种的聚类分析
利用 猿园 对 悦韵杂陨陨 标记引物在这些试验材料中扩
增共得到 愿愿 个多态位点遥 根据带型的不同袁计算试验
材料间的遗传距离遥 根据遗传距离袁利用 晕栽泽赠泽 圆郾 员园藻
软件袁得到 缘 个样本的聚类图渊图 圆冤遥 由图 圆 可知袁在
遗传系数为 园郾 远缘愿 时袁可把供试材料分为 猿 类袁紫竹与
其他供试材料的亲缘关系较远袁自成一类袁第 圆 类为花
哺鸡竹袁第 猿 类是桂竹尧罗汉竹和斑竹遥 这一结果与形
态学分类结果大致吻合袁表明所开发的标记可用于竹
类植物种的分类遥
猿摇 讨论
竹亚科植物在我国资源丰富袁用途广泛袁但由于其
繁殖方式是以地下鞭延伸为主的无性繁殖袁个体区分
非常困难袁从而不同竹种间亲缘关系混乱袁造成竹子分
类以及遗传多样性研究的困难遥 而 阅晕粤 分子标记直
接以 阅晕粤为研究对象袁反映生物个体或群体基因组中
的差异特征袁能提供更大量的遗传变异信息袁分析材料
也不受组织尧发育阶段和环境因素限制袁成为群体遗传
多样性和遗传结构研究的简单而有用的工具咱员远暂 遥
悦韵杂域标记位点是进化上相对保守的位点袁通过
利用这些保守序列袁特别是编码区序列设计通用引物
从而在不同物种内扩增同源基因片段袁实现同源基因
序列信息从基因组注释信息丰富的物种向相对匮乏的
物种转移咱员苑暂 遥 悦韵杂域标记是针对核基因内保守的种
源序列进行比较分析袁这类序列变化速度与进化距离
相当袁代表了进化上分离的物种间保守的低拷贝或单
拷贝基因袁通常在物种进化过程中保持一种相当或是
相似的功能咱员愿 原 员怨暂 遥 悦韵杂 标记的开发对比较作图
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摇 员圆 期 悦韵杂陨陨分子标记在刚竹属的通用性
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有重要的意义咱员员暂 遥 目前袁已经在莴苣尧向日葵尧拟南芥
中袁以及在水稻和小麦中相继开发出 悦韵杂陨陨 分子标记
并加以运用袁这些标记显示出很好的转移性和多态
性咱圆园 原 圆员暂 遥 本试验所应用的 猿园 对 悦韵杂域标记引物袁可
在至少 猿 个种中得到特异性 孕悦砸 产物袁其中 员员 对在
所有供试竹种中都能扩增到产物遥 在 缘 个供试样本中
共扩增出 员园员 条带袁其中 愿愿 条表现出多态性袁占
愿苑郾 员猿豫 袁该标记在竹类植物样本中也显示出很好的通
用性和多态性遥 只有 员圆 对引物能在紫竹中扩出条带袁
而在其它 源 个样本中袁只有一两对引物不能扩出条带袁
说明紫竹的基因组序列与另外 源 种竹子的基因组序列
差异比较大遥 在这些引物中袁猿 对引物在供试样本间
无多态性位点袁从标记所在基因的功能上看袁这些标记
所在的基因功能比较重要袁如 粤栽孕 结合蛋白袁铁氧化
还原蛋白和质蓝体素蛋白等都是是维持生命和生理功
能的重要蛋白遥 值得一提的是袁本文中所用的标记在
禾本科其他植物中为单拷贝基因袁但在本试验材料中袁
有几对引物表现出多拷贝的特性袁导致这一结果的主
要原因可能是与其他禾本科植物相比袁竹类植物的基
因具多拷贝现象咱圆圆暂 遥 本试验进行时袁同一对引物经常
可在竹类植物中扩增到多条带袁所扩增的条带多数对
应于目标基因袁如用同一对引物在竹类植物同一样本
中可扩增出 悦韵基因的 圆 个拷贝袁也可扩增出 云栽基因
的 圆 个拷贝遥
本文所用的 缘 个样本均属于刚竹属袁其中斑竹是
桂竹的一个变型袁仅用 孕悦韵杂员苑 引物就可将两者分开
渊图 员冤遥 从外部形态上看袁紫竹是头状花序袁其他几个
样本为穗状花序袁说明紫竹与另外几个样本的亲缘关
系较远袁图 圆 的试验结果也支持这一观点遥 由图 圆 还
可以看出袁当遗传系数为 园郾 远缘愿 时袁可把供试材料分为
猿 类袁紫竹与花哺鸡竹各自分别成一类袁第 猿 类是桂
竹尧罗汉竹和斑竹袁这一结果与形态学分类结果存在一
些差别遥 从形态学上看袁罗汉竹与花哺鸡竹亲缘关系
更近袁该分类依据主要是看秆箨是否具箨耳这一营养
阶段的特性袁而本结果显示袁从 阅晕粤 水平来揭示罗汉
竹与斑竹的亲缘关系更近遥 因此袁该结果还需进一步
验证遥
源摇 结论
悦韵杂域分子标记能扩增出保守直系同源基因序列
的分子标记袁很适合比较基因研究袁并且操作简单尧费
用低尧同时特异性高尧稳定性好遥 基于禾本科植物水稻
等序列开发的 悦韵杂陨陨 标记在竹子中有一定的通用性袁
可以用于竹子的遗传研究袁对竹子遗传分类的研究有
一定的借鉴价值遥 由于目前可用于竹子遗传研究的特
异性分子标记很少袁因此本研究所利用的 悦韵杂陨陨 标记
是对目前可用于竹子标记的补充遥 另外袁由于 悦韵杂域
标记本身就是基因的一部分袁因此结合 砸粤悦耘 技术可
以成为一种有效快速的同源克隆手段遥
参考文献院
咱 员 暂摇 易同培援 四川竹类植物志咱酝暂援 北京院中国林业出版社袁员怨怨苑院
员 原 猿
咱 圆 暂摇 朱石麟袁马乃训袁傅懋毅援中围竹类植物图志咱酝暂援 北京院中国林
业出版社袁员怨怨源院员 原 缘
咱 猿 暂摇 邢新婷袁江泽慧援分子标记在竹类植物遗传多样性中的应用咱允暂 援
世界竹藤通讯袁圆园园源袁 圆渊猿冤院员圆 原 员远
咱 源 暂摇 江泽慧主编援世界竹藤咱酝暂援沈阳院辽宁科学技术出版社袁圆园园圆
咱 缘 暂摇 马乃训袁张文燕袁袁金玲援国产刚竹属植物初步整理咱 允暂 援竹子研
究汇刊袁圆园园远袁 圆缘渊员冤院员 原 缘
咱 远 暂摇 楼一平援竹子院非草非木的传奇援 咱 允暂中国国家地理援 圆园园源袁 渊猿冤院
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咱 苑 暂摇 李娜袁焦浈袁秦广雍援 阅晕粤分子标记技术及其在小麦育种及遗传
研究中的应用咱允暂援核农学报袁圆园园远袁员怨渊猿冤院猿圆圆 原 猿圆苑
咱 愿 暂摇 谭和平袁徐利远袁余桂蓉袁杜文平袁王宇星援钟昌松援茶树种质资源
陨杂杂砸分子标记初步研究咱允暂援核农学报袁圆园园远袁圆园渊圆冤院员员猿 原 员员缘
咱 怨 暂摇 徐晓薇袁江南袁杨俊波袁杨燕萍袁王丽芳援 寒兰株系间遗传多样性
和亲缘关系的杂杂砸分子标记分析 咱 允暂 援 核农学报袁圆园员员袁圆缘
渊远冤院员员猿缘 原 员员源员
咱员园暂摇 杨在君袁彭正松袁周永红袁彭丽娟袁魏淑红援 利用杂砸粤孕分子标
记评价小麦三雌蕊近等基因系的遗传背景咱允暂 援核农学报袁圆园员圆袁
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