全 文 ：植物生理学通讯 第 45卷 第 12期，2009年 12月 1221
收稿 2009-10-23 修定 　2009-11-23
资助 国家自然科学基金(3 0 7 7 1 7 5 9、3 0 9 7 2 3 8 8 )、广东省
自然科学基金团队项目(9351064201000002)和华南农
业大学校长基金(2 00 9 X0 14 )。
* 通讯作者(E-ma i l : xychen@scau .edu.cn; Tel : 02 0 -
8 5 2 8 0 0 0 1 )。
EST-SSR标记在木本植物中的开发和应用
林元震 1, 郭海 2, 刘纯鑫 1, 刘天颐 1, 黄少伟 1, 陈晓阳 1,*
1华南农业大学林学院, 广州 510642; 2水利部水土保持植物开发管理中心, 北京 100038
Development and Application of EST-SSR Markers in Woody Plants
LIN Yuan-Zhen1, GUO Hai2, LIU Chun-Xin1, LIU Tian-Yi1, HUANG Shao-Wei1, CHEN Xiao-Yang1,*
1College of Forestry, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China; 2Plant Materials Center for Soil and Water
Conservation, Ministry of Water Resources, Beijing 100038, China
提要: 本文简述EST-SSR的开发策略, 重点就其在木本植物遗传研究中的遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建、比较作图
以及种质资源鉴定的应用现状和存在问题作介绍, 并对其应用前景作了展望。
关键词: 木本植物; EST-SSR; 遗传多样性; 遗传图谱; 种质资源鉴定
简单序列重复(simple sequence repeat, SSR),
也称微卫星(microsatellite), 是指以1~6个核苷酸为
单位在基因组中多次串联重复的DNA序列(Akkaya
等 1992)。SSR标记与其它分子标记技术相比, 具
有易检测、共显性遗传、重复性好、数量丰富
和多态性高以及遍布整个基因组等优点, 因此在植
物遗传研究的众多方面受到重视( S c h l o t t e r e r
2004)。SSR可分为基因组 SSR和 EST-SSR。基
因组 SSR标记一般是经过基因组DNA文库构建、
重复序列克隆的识别和筛选以及测序等实验流程获
得, 开发过程繁琐、时间长、成本高, 而且效率
低(Roder等 1998)。此外, 基因组 SSR往往具有物
种特异性, 重复基序也限制在 2~3个核苷酸, 从而
极大地限制了基因组 SSR 的应用范围(Chen等
2006)。近些年来, 随着植物基因组与功能基因组
研究的发展, 大规模植物基因的测序产生了大量的
EST序列, 并上传到核酸公共数据库, 而且 EST的
数量仍在与日俱增, 已成为开发EST-SSR的一种资
源。EST序列开发的 EST-SSR标记比与传统的基
因组 SSR标记有很多优点, 如: EST-SSR标记在物
种间具有高通用性, 通常都代表着某种基因功能, 开
发过程简单、成本低, 还可反映出转录区的差异
(Pashley等 2006)。所以其在植物遗传图谱构建、
比较作图、种质遗传多样性评价和亲缘关系鉴定
的研究中有很高的使用价值。
目前, EST-SSR的开发已在农作物中广泛应
用, 在水稻、甘蔗、大麦、葡萄、苜蓿和小麦
中已有报道(李卫国等 2008), 而对于木本植物, 在
杏(Decroocq等 2003; Xu等 2004)、猕猴桃(Fraser
等 2004)、云杉(Rungis等 2004)、火炬松(Liewla-
ksaneeyanawin等 2004; 林元震等 2009)、柑橘
(Chen等 2006)、咖啡树(Poncet等 2006)、桉树
(Yasodha等 2008)、茶树(刘振等 2008)、杨树(杨
彦伶等 2008)、白桦(王艳敏等 2008)、鹅掌楸(胥
猛和李火根2008)和橡胶树(Feng等2009)等物种中
也有过报道。本文对 EST-SSR在木本植物中的遗
传图谱构建、种群多样性分析以及种质资源鉴定
的应用现状和存在问题作介绍, 并对其应用前景作
了展望。
1 EST-SSR标记的开发
(1) EST序列可来自实验室构建cDNA文库测
序, 或者公共序列数据库, 后者的EST不仅量大, 而
且可免费下载使用, 已成为开发EST-SSR的主要数
据来源。(2) EST序列的预处理一般采用 cross-
match或Vecscreen软件, 去除载体序列、低质量
EST序列后, 以 Phrap和 CAP3等软件进行聚类和
拼接, 从而得到无冗余的EST数据和尽可能长的重
叠序列。(3) EST-SSR搜索常用软件有 SSRIT、
MISA、SSR Finder和 Repeat Masker等, 用这些软
件可得到的信息有: ESTs的名称、重复碱基、重
复次数、重复碱基在 EST中开始和结束的位置。
(4) EST-SSR的检测。根据 SSR侧翼序列的保守
植物生理学通讯 第 45卷 第 12期，2009年 12月1222
性, 采用Primer 5或Oligo设计引物, 对研究材料进
行 PCR扩增, 然后通过电泳或者测序等方法检测,
并进行相关数据处理和分析。
2 EST-SSR标记在木本植物遗传育种研究中的应用
2.1 遗传连锁图谱的构建 遗传图谱的构建是遗传
学研究的重要领域之一, 也是研究种质资源、遗传
育种及基因定位、克隆的基础。基因组 SSR标记
由于标记数量少、物种特异性强, 很难获得高密度
的遗传连锁图, 而近年来 EST-SSR技术的不断发
展, EST-SSR位点已整合到原有的遗传图谱中, 为
构建高密度的多标记复合图谱提供了有力的新技术
手段。目前, EST-SSR 标记主要应用于构建大
麦、小麦、水稻、黑麦、黑麦草等农作物的遗
传图谱(Varshney等 2005)。Han等(2004)以种间回
交BC1 [(陆地棉TM-1×海岛棉Hai7124)×陆地棉
TM-1]为作图群体, 在554对亚洲棉的EST-SSRs引
物中, 有 99对引物检测到多态性, 共扩增到 118个
位点, 其中112个位点整合到原有棉花遗传图谱的
22个连锁群上, 这些位点不是随机地分布在棉花基
因组上, 有 72个位点位于A基因组, 另 37个位点
位于D基因组。Han等(2006)进一步开发了 489对
EST-SSR引物, 有114对引物在两个亲本之间检测
到多态性, 并用于作图群体的遗传图谱构建, 该图
谱整合所有新位点后, 就使原有棉花遗传图谱增加
至 907个位点, 获得了图距为 5 060 cM的遗传图
谱, 标记间的平均间距为 5.6 cM。Silfverberg-
Dilworth等(2006)采用148个新的苹果SSR标记(包
含 31个 EST-SSR)和 8个已知的苹果、梨和欧洲
花楸SSR标记在苹果(Malus×domestica Borkh.)参
考图谱基础上构建了复合遗传图谱, 这些SSR标记
给原参考图谱新增了 168个位点。同时为建立全
基因组作图有效方法, 他们进一步发现了86个可靠
性强和多态性高的SSR标记, 这些SSR标记均匀分
布在苹果基因组中, 覆盖约为 85%苹果基因组, 标
记间的平均间距为 15 cM。
功能基因图谱对于探讨基因组结构、功能与
进化, 以及进行基因克隆和分子标记辅助选择育种
等研究都很重要。由于 EST-SSR来源于基因组编
码区, 其与基因的功能可能密切相关, 因此可以用
于构建功能基因图谱。Guo等(2007)以种间回交
BC1 [(陆地棉 TM-1×海岛棉Hai7124)×陆地棉
TM-1]为作图群体, 采用在两个亲本之间存在多态
性的雷蒙德氏棉EST-SSR, 构建了高密度的遗传图
谱, 其包含 1 790个位点, 分属于26个连锁群, 连锁
标记覆盖的基因组总长为 3 425.8 cM, 标记间平均
间距为 1.91 cM。其所含的 71.96%标记位点具有
相关基因功能, 对1 122个EST-SSR位点相应的975
条EST进行功能预测的结果表明, 475条EST与生
物代谢过程、细胞组分和分子功能等有关, 并找到
一些与棉花纤维发育相关的重要功能基因, 这对进
一步开展棉花的基因组功能和改良其农艺性状等研
究都有意义。
2.2 物种间的通用性和作图比较 近年来的研究表
明, EST-SSR比基因组SSR在物种间具有更高的通
用性(Varshney等 2005)。基因组 SSR大多处于非
编码序列区域, 其侧翼序列往往具有明显的物种特
异性, 因此在不同物种间通用性较差( C hen 等
2006)。而 EST-SSR侧翼序列往往在物种之间高
度保守, 因此从一种植物中开发的EST-SSR可通用
于其它近缘物种, 这不但可丰富标记数量, 而且显
著提高标记的利用价值, 从而为植物功能基因组学
和比较基因组学研究提供新的思路和方法(Pashley
等 2006)。Decroocq等(2003)分别检测了杏(Prunus
armeniaca)和葡萄(Vitis vinifera)的EST-SSR引物各
自在蔷薇科和葡萄科内的转移性, 分析结果发现亲
缘关系越近, 扩增条带质量就越好, 多态性也越高。
此外, 葡萄EST-SSR引物在葡萄科内不同种属间的
转移效率都较高, 而杏EST-SSR引物的转移性仅适
合于李亚属内近缘种。Vendramin等(2007)从桃
(P. persica)的中果皮 cDNA文库序列中开发了 21
对EST-SSR引物, 其中 18对引物在 22个桃基因型
中均能有效扩增出条带, 同时还发现这18对引物在
李属(Prunus)的6个其它植物中均能扩增出预期条
带, 说明EST-SSR在李属近缘种植物之间具有高效
的通用性。胥猛和李火根(2008)用 66对表现多态
的北美鹅掌楸(Liriodendron tulipifera) EST-SSR引
物, 85%在中国鹅掌楸(Liriodendron chinense)中有
扩增, 54%在玉兰(Magnolia denudata)中有扩增, 表
明北美鹅掌楸 EST-SSR引物在中国鹅掌楸以及玉
兰物种之间具有较高的通用性。EST-SSR标记在
种内或种间的高通用性在棉花(Saha等 2003)、松
树(Liewlaksaneeyanawin等 2004)、云杉(Rungis等
2004)、咖啡树(Poncet等 2006)、桉树(Yasodha等
2008)、柑橘(Luro等 2008)和橡胶树(Feng等 2009)
植物生理学通讯 第 45卷 第 12期，2009年 12月 1223
等物种中也得到了证实。
EST-SSR在物种间的转移成功率与物种之间
的亲缘远近有关, 除了在近缘植物种间有较高的转
移率以外, 也有学者报道EST-SSR可在植物不同属
间转移。杨彦伶等(2008)用杨树(Populus)的 48对
基因组SSR引物及48对EST-SSR引物对 6个苏柳
(Salix)品种进行了通用性分析的结果表明, 杨树
EST-SSR引物在柳树中的通用性达 54.2%, 而基因
组 SSR的通用性仅有 10.4%。可见, 杨树EST-SSR
标记完全可以用于柳树群体或品种间的群传多样性
分析, 而且杨树EST-SSR对柳树的通用性明显高于
基因组 S SR。Feng等(2 009 )从橡胶树(Hev ea
brasiliensis)EST序列开发的EST-SSR引物中, 随机
挑选 30对引物进行木薯(Manihot utilissima)、篦
麻(Ricinus communis)和余甘子(Phyllanthus emblica)
等 3种植物的属间转移扩增的成功率为 73.3%, 说
明橡胶树 EST-SSR完全可通用于木薯等 3种属间
植物。Gasic等(2009)研究苹果(Malus×domestica)
的68对EST-SSR引物在蔷薇科中3个属14种植物
中可转移性的结果表明, 在所检测的 14种植物中,
扩增成功率在 25%~59%之间, 在属的水平上, 对
草莓的扩增转移率最高, 可达 49%。以上研究表
明, EST-SSR在近缘或远缘物种之间均有较好的通
用性, 因此可以认为EST-SSR将在植物基因组比较
作图、种质亲缘关系鉴定以及分子系统发育与进
化中有巨大的应用潜力。
EST-SSR在物种间有高通用性, 因此, 在比较
作图中表现出显著的优势。基因组比较作图是对
相关物种通过共同的遗传标记进行物理或遗传作
图, 并分析这些标记在不同物种基因组中的分布特
征, 揭示不同物种基因组间的同源性和差异性, 从
而更好地了解不同物种的基因组结构和基因组进化
历程(覃瑞等 2004)。Chen等(2008)用甜橙(Citrus
sinensis)和枳橙(Poncirus trifoliata)的杂交F1代, 分
离出141个具有多态性的甜橙EST-SSR标记, 分别
构建了甜橙 775.8 cM和枳橙 425.7 cM的遗传图
谱。分析和比较这两张遗传图谱的结果显示, 两个
物种图谱中相应的连锁群之间有明显的共线性, 为
进一步研究甜橙近缘物种的比较作图奠定了基础。
2.3 种群遗传多样性的评价和种质资源的鉴定 遗
传多样性是种群遗传结构特性的重要组成部分, 是
生态系统多样性和物种多样性的基础, 也是物种对
环境适应性的体现, 进行遗传多样性评价对有效保
护、开发和利用种质资源都有极其重要的意义(朱
振东和贾继增2003)。然而对于自然生态环境分布
的野生植物, 尤其是高大木本植物, 其遗传背景往
往是高度杂合, 以往一般多采用 RAPD、AFLP和
ISSR等显性标记, 但不能有效区分杂合体, 从而直
接影响了种群遗传多样性的准确评价(Ellis和Burke
2007)。基因组 SSR虽然是共显性标记, 但因其开
发成本高而导致其应用受到很大限制。由于EST-
SSR在物种间具有高通用性, 通常又代表着某种基
因功能, 还可反映出转录区的差异, 因此用EST-SSR
分析种群遗传多样性时, 有可能将某些外在形态性
状、生理生化特征甚至某个特定的环境适应型与
EST-SSR标记直接联系(Pashley等 2006)。
Xu等(2004)在用21个EST-SSR和8个基因组
SSR分析中国杏树和地中海杏树的系统发育中, 共
检测到112个多态位点, 其中28个位点是中国杏树
特有的, 经聚类分析后, 36份杏树划分为 2个亚类,
其中中国杏树和 1个未知起源的品种聚为一个群,
而其余起源于地中海的杏树则聚为另一个群。这
说明中国杏树的进化历程有别于地中海杏树。Xie
等(2006)采用基因组 SSR和 EST-SSR各 8对分析
了中国扁桃栽培品种(23个)、国际扁桃栽培品种
(15个)、桃和杏的杂交种(2个)以及桃品种(3个)的
遗传多样性的结果表明, EST-SSR平均每对引物扩
增出 7.8个等位基因, 每个位点的观测杂合度(Ho)
为 0.678, 略高于基因组 SSR的扩增。聚类分析表
明, 中国品种和国际品种分别聚成单独的两个群, 而
桃和杏的杂交种与桃品种共同聚成第三个群, 表明
EST-SSR标记是分析植物亲缘关系的有效方法。
刘振等(2008)采用31对EST-SSR引物分析60份西
南茶区茶树遗传多样性和亲缘关系的结果显示, 31
对引物共检测到等位位点137个, 遗传多态性信息
含量(PIC)在 0.09~0.85之间, 观测杂合度(Ho)在
0.07~0.94之间, 说明西南茶区茶树资源的遗传多样
性非常丰富, 从而为茶树育种材料的选择、遗传起
源鉴定和核心种质的分子验证等提供了新的功能标
记和更科学的分析手段。
随着EST-SSR标记的不断开发、发展和应用,
植物种质资源和品种鉴定的方法不断更新。金基
强等(2007)采用 EST-SSR分子标记技术对 42个茶
树进行品种资源分析, 结果显示13对引物可扩增出
植物生理学通讯 第 45卷 第 12期，2009年 12月1224
预期条带, 其中 10对引物具有多态性, 平均 PIC值
为0.730, 共检测到84种等位基因型和74个等位变
异, 并将 42个茶树品种划分为3个亚类, 表明EST-
SSR标记是分析茶树资源和品种鉴定的有效方法。
Bassil和Postman (2009)采用梨属的10个EST-SSR
对 81个西洋梨(Pyrus communis)、13个沙梨(P.
pyrifolia)和20个山梨(P. ussuriensis)进行品种鉴定,
UPGMA聚类分析表明, 这114份梨属材料分为2个
大类群, 其中81个西洋梨聚为欧洲梨大类群, 13个
沙梨聚成小组再和 20个山梨聚为亚洲梨大类群。
聚类的结果与梨树来源共同的祖先、地理起源或
成熟时间的事实相一致。说明高通用性的 EST-
SSR非常适合于分析梨树种质资源、鉴定品种以
及寻找梨树嫁接失败的缘由。
3 结语
迄今, 木本植物 EST-SSR的开发尚处于起始
阶段, 其应用范围仍有限, 而且还存在一些不足: (1)
EST-SSR标记与基因组 SSR标记相比, 多态性较
低, 对于基因型高度相似的辨别不如后者(Varshney
等 2005); (2) EST-SSR标记的开发只能限于那些
已知具有大量高质量EST序列的物种(Varshney等
2005); (3) EST-SSR预测软件以及引物设计软件存
在一定的局限性, 因而也影响了EST-SSR标记的准
确性(王艳敏等 2008; Riju等 2009)。
截止2009年10月2日, 美国国立生物技术信息
中心(NCBI)的dbEST公共数据库中共有63 044 586
条 EST, 其中木本植物, 主要集中在松树(Pinus)、
杨树(Populus)、橡胶(Hevea)、柑橘(Citrus)、桉
树(Eucalyptus)、苹果(Malus)、杉树(Picea)、李
树(Prunus)和梨树(Pyrus)等植物上。如此量大而
丰富的 EST序列, 不仅可以发现、分离新基因, 也
可制备DNA芯片用于基因表达和比较基因组的研
究, 而且还可开发分子标记(尤其是 EST-SSR)用于
遗传连锁图谱构建、基因定位等研究。木本植物
EST-SSR研究起步较晚, 但进展相当迅速。有理
由相信, 随着植物基因组学与功能基因组学的不断
发展和研究的深入, 以及生物信息学的逐渐完善, 高
通用性的 EST-SSR必将在构建植物功能基因图
谱、开展基因定位与克隆、研究比较基因组学、
分析种质资源与鉴定品种、揭示植物基因型的环
境适应性等问题中发挥更大和更多的作用。
参考文献
金基强, 崔海瑞, 龚晓春, 陈文岳, 忻雅(2007). 用 EST-SSR标记对
茶树种质资源的研究. 遗传, 29 (1): 103~108
李卫国, 常天俊, 龚红梅(2008). EST-SSR及其在植物基因组学研
究中的应用. 生物技术, 4: 90~93
林元震, 郭海, 刘纯鑫, 黄少伟, 陈晓阳(20 09). 火炬松热胁迫
cDNA文库的 EST-SSR 预测. 华南农业大学学报, 30 (3):
41~44
刘振, 王新超, 赵丽萍, 姚明哲, 王平盛, 许玫, 唐一春, 陈亮(2008).
基于 EST-SSR的西南茶区茶树资源遗传多样性和亲缘关系
分析. 分子植物育种, 6 (l): 100~l10
覃瑞, 宋发军, 宋运淳(2004). 植物基因组比较作图研究进展. 细
胞生物学杂志, 26 (2): 157~161
王艳敏, 魏志刚, 杨传平(2008). 白桦 EST-SSR信息分析与标记
的开发. 林业科学, 44 (2): 78~64
胥猛, 李火根(2008). 鹅掌楸 EST-SSR引物开发及通用性分析. 分
子植物育种, 6 (3): 615~618
杨彦伶, 张亚东, 张新叶(2008). 杨树 SSR标记在柳树中的通用性
分析. 分子植物育种, 6 (6): 1134~1138
姚利华, 滕元文(2008). EST-SSR标记及其在果树研究中的应用.
果树学报, 25 (2): 219~222
朱振东, 贾继增(2003). 小麦 SSR 标记的发展及应用. 遗传, 25
(3): 355~360
Akkaya M, Bhagwata A, Cregan B (1992). Length polymorphisms
of simple repeat DNA in soybean. Genetics, 132: 1131~1139
Bassil N, Postman JD (2009). Identification of European and Asian
pears using EST-SSRs from Pyrus. Genet Resour Crop Ev,
DOI 10.1007/s10722-009-9474-7
Chen C, Zhou P, Choi YA, Huang S, Gmitter FG (2006). Mining
and characterizing microsatellites from Citrus ESTs. Theor
Appl Genet, 112: 1248~1257
Chen CX, Bowman KD, Choi YA, Dang PM, Rao MN, Huang S,
Soneji JR, McCollum TG, Gmitter FG (2008). EST-SSR ge-
netic maps for Citrus sinensis and Poncirus trifoliate. Tree
Gen Genom, 4 (1): 1~10
Decroocq V, Fave MG, Hagen L, Bordenave1 L, Decroocq S
(2003). Development and transferability of apricot and grape
EST microsatellite markers across taxa. Theor Appl Genet,
106: 912~922
Ellis JR, Burke JM (2007). EST-SSRs as a resource for population
genetic analyses. Heredity, 99: 125~132
Feng SP, Li WG, Huang HS, Wang Y, Wu YT (2009). Development,
characterization and cross-species/genera transferability of
EST-SSR markers for rubber tree (Hevea brasiliensis). Mol
Breed, 23: 85~97
Fraser LG, Harvey CF, Crowhurst RN, DeSilva HN (2004). EST-
derived microsatellites from Actinidia species and their po-
tential for mapping. Theor Appl Genet, 108: 1010~1016
Gasic K, Han YP, Kertbundit S, Shulaev V, Iezzoni AF, Stover EW,
Bell RL, Wisniewski ME, Korban SS (2009). Characteristics
and transferability of new apple EST-derived SSRs to other
Rosaceae species. Mol Breed, 23 (3): 397~411
Guo WZ, Cai CP, Wang CB, Han ZG, Song XL, Wang K, Niu XW,
Wang C, Lu KY, Shi B et al (2007). A microsatellite-based,
植物生理学通讯 第 45卷 第 12期，2009年 12月 1225
gene-rich linkage map reveals genome structure, function and
evolution in Cossypium. Genetics, 176: 527~541
Han ZG, Guo WZ, Song XL, Zhang TZ (2004). Genetic mapping
of EST-derived microsatellites from the diploid Gossypium
arboreum in allotetraploid cotton. Mol Gen Genom, 272:
308~327
Han ZG, Wang CB, Song XL, Guo WZ, Gou JY, Li CH, Chen XY,
Zhang TZ (2006). Characteristics, development and map-
ping of Gossypium hirsutum derived EST-SSRs in allotetra-
ploid cotton. Theor Appl Genet, 112: 430~439
Liewlaksaneeyanawin C, Ritland CE, El-Kassaby YA, Ritland K
(2004). Single-copy, species-transferable microsatellite mark-
ers developed from loblolly pine ESTs. Theor Appl Genet,
109: 361~369
Luro FL, Costantino G, Terol J, Argout X, Allario T, Wincker P,
Talon M, Ollitrault P, Morillon R (2008). Transferability of
the EST-SSRs developed on Nules c lementine (Citrus
clementina Hort ex Tan) to other Citrus species and their
effectiveness for genetic mapping. BMC Genomics, 9: 287
Pashley CH, Ellis JR, McCauley DE, Burke JM (2006). EST
databases as a source for molecular markers: lessons from
Helianthus. J Hered, 97: 381~388
Poncet V, Rondeau M, Tranchant C (2006). SSR mining in coffee
tree EST databases: potential use of EST-SSRs as markers for
the Coffea genus. Mol Gen Genom, 276: 436~449
Riju A, Rajesh MK, Sherin PT, Chandrasekar A, Apshara SE,
Arunachalam V (2009). Mining of expressed sequence tag
libraries of cacao for microsatellite markers using five com-
putational tools. J Genet, 88 (2): 217~225
Roder MS, Korzun V, Wendehake K, Plaschke J, Tixier MH, Leroy
P, Ganal MW (1998). A microsatellite map of wheat. Genetics,
149: 2007~2023
Rungis D, Berube Y, Zhang J, Ralph S, Ritland CE, Ellis BE, Douglas
C, Bohlmann J, Ritland K (2003). Robust simple sequence
repeat markers for spruce (Picea spp.) from expressed se-
quence tags. Theor Appl Genet, 109: 1283~1294
Saha S, Karaca M, Jenkins JN, Zipf AE, Reddy OU, Kantety RV
(2003). Simple sequence repeats as useful resources to study
transcribed genes of cotton. Euphytica, 130: 355~364
Schlotterer C (2004). The evolution of molecular markers- just a
matter of fashion. Nat Rev Genet, 5: 63~69
Silfverberg-Dilworth E, Matasci1 CL, Van de Weg WE, Van
Kaauwen MPW, Walser M, Kodde LP, Soglio V, Gianfranceschi
L, Durel CE, Costa F et al (2006). Microsatellite markers
spanning the apple (Malus×domestica Borkh.) genome. Tree
Gen Genom, 2: 202~224
Varshney RK, Graner A, Sorrells ME (2005). Genic microsatellite
markers in plants: features and applications. Trends Biotech,
23 (1): 48~55
Vendramin E, Dettori MT, Giovinazzi J, Quarta R, Verde I (2007).
A set of EST-SSRs isolated from peach fruit transcriptome
and their transportability across Prunus species. Mol Ecol
Notes, 7 (2): 307~310
Xie H, Sui Y, Chang FQ, Ma RC (2006). SSR allelic variation in
almond (Prunus duleis Mil1.). Theor Appl Genet, 112:
366~372
Xu Y, Ma RC, Xie H, Liu JT, Cao MQ (2004). Development of SSR
markers for the phylogenetic analysis of almond trees from
China and the Mediterranean region. Genome, 47 (6): 1091~1104
Yasodha R, Sumathi R, Chezhian P, Kavitha S, Ghosh M (2008).
Eucalyptus microsatellites mined in silico : survey and
evaluation. J Genet, 87 (1): 21~25