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激光捕获显微切割技术及其在植物研究中的应用



全 文 :植物生理学通讯 第42卷 第4期,2006年8月 695
激光捕获显微切割技术及其在植物研究中的应用
聂玉哲 张晓磊 李玉花*
东北林业大学花卉生物工程研究所,哈尔滨150040
Laser Capture Microdissection and Its Application in the Research of Plant
Science
NIE Yu-Zhe, ZHANG Xiao-Lei, LI Yu-Hua*
Institute of Flower Biotechnology, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China
提要 若要获得植物特定类型细胞的准确信息,首要的是获得同质的目标细胞。近年发展起来的激光捕获显微切割技术
能够在显微镜下准确、快捷地获得所需要的目标细胞群甚至是单个细胞,从而成功地解决了组织中细胞异质性问题。文
章概述了激光捕获显微切割技术的原理、注意的问题以及在植物科学研究中的应用和前景。
关键词 激光捕获显微切割;植物;同质细胞
收稿 2005-11-14 修定  2006-05-29
资助  国家自然科学基金(30371189)和国家“863”计划
(2001AA246102)。
*通讯作者(E-mail: lyhshen@126.com, Tel: 0451-82191783)。
植物体是由彼此相互联系的多种类型细胞所
构成,正是由于这种结构上的复杂性,目前多数
的研究都是通过分析混合组织样品来获得数据。
虽然这些研究提供了一些有用的信息,但是有时
对某些结果却不能做出很好的解释,尤其是某一
种类型细胞占组织的主要部分,而研究对象只是
暂时存在其中或细胞数量相对很少时的情况,从
而具有很大的局限性。因此,为了获得特定类型
细胞的准确信息,分离出同质的目标细胞就显得
非常重要。
已报道过的从植物中分离同质细胞样品的方
法至少有 3 种。一种方法是从其中分离原生质
体,这种方法能够获得很多同一种类型的细胞,
但可能导致基因或蛋白表达发生不可思议的变化
(Grosset等1990;Celis等1999) 。另一种方法是
用毛细管从植物活体中获得植物细胞组分(Tomos
等 1994),所获得的细胞样品体积在皮升级,虽
然能进行部分代谢(Tomos和Sharrock 2001)、基
因表达(Laval 等 2002;Brandt 等 1999,2002;
Richert等1996;Karrer等1995)和蛋白表达的分析
(Roy 等 2003),但数量上的限制使得应用这种方
法采集到足够数量的单纯种类细胞样品来进行全局
分析(尤其对 RN A 和蛋白质)将是很困难的。此
外,为了保持细胞特定的生理状态,样品可以在
固定、包埋、切片后,从冰冻或者石蜡包埋的
组织中分离,分离技术包括直接手工分离(Outlaw
和 Zhang 2001)和激光显微切割分离(Roberts
2002;Schüitze 和 Lahr 1998;Emmert-Buck 等
1996)。激光捕获显微切割技术与以上其它方法相
比,能够精确、快捷地获得大量的特定种类细胞
样品,显现出极大的优越性。
1 激光捕获显微切割的原理
自1996年激光捕获显微切割技术首次采用以
来,已经有多种激光捕获显微切割系统得到开
发,文献报道中经常使用的是Arcturus Engineer-
ing公司的PixCell Ⅱ系统(http://www.arctur.com)和
P.A.L.M. Microlaser Technologies公司的PALM
Microbeam系统(http://www.palm-microlaser.
c o m )。
PixCell Ⅱ系统属于经典的激光捕获显微切割
技术,它的原理很容易理解。在显微镜下,用
激光束照射特殊的转移膜使其熔化,粘附组织切
片上的靶细胞,提起转移膜,粘附的靶细胞即和
所有非靶细胞分离。其主要操作步骤为:将制备
好的切片放在倒置显微镜载物台上,调整表面贴
附有一层乙烯乙酸乙烯酯(EVA)膜的塑料帽,使
技术与方法 Techniques and Methods
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其覆于切片的组织表面,并使目的细胞(群)位于
视野中心;发射激光束,瞬间升温使 E V A 膜局
部熔化,渗透到目的细胞周围,随即迅速冷却固
化,EVA 膜即与其下方的细胞紧密粘合在一起;
揭起EVA 膜,被捕获的目的细胞与 EVA 膜一起脱
离切片上的其它组织(图1)。透明的热塑性EVA膜
含有吸收近红外线的特殊染料,在整个激光捕获
切割过程中发挥着重要的作用。它不吸收显微镜
所使用的可见光,但当使用波长与该染料所特异
吸收的光波长相一致的激光束照射时,激光的能
量绝大部分被 E V A 膜吸收。随着温度的升高,
EVA 膜的黏滞度急剧下降,这一特性可保证 EVA
膜局部的轻度加热就能使其渗透到细胞间隙,并
迅速冷却,固化成牢固的连接,足以使目的细胞
脱离切片。
玻片到管盖逆重力飞行,可保证样品不受污染。
由于这种技术更具优势,因此,近年来得到了越
来越广泛的应用。
此外,还有一些文献报道中应用较少的激光
捕获显微切割系统,如Cell Robotics公司的Laser-
Scissors Pro300系统(http://www.cellrobotics.
com),Leica Microsystems公司的Leica AS LMD
系统(http://www.leica-microsystems.com),MMI AG
公司的mCUT系统(http://www.mmi-micro.com)等。
2 植物样品激光捕获显微切割技术
激光捕获显微切割包括以下几个步骤:材料
的固定、包埋、切片、脱水和激光捕获显微切割。
为了从显微解剖材料中获得最佳的核酸或蛋
白回收率,从材料的固定开始就必须特别注意。
材料的准备必须平衡组织形态和样品质量的关系,
也就是在显微镜下要能够分辨出目标细胞的特征,
而同时也要争取获得最大的高质量核酸或蛋白的回
收率。在激光捕获显微切割中,载玻片上方没有
盖玻片,这就使组织的识别变得更困难,所以,
组织在形态上要保存得更完好。一些靶细胞群需
要进行染色才能保证区分出来,但是有些染色步
骤不仅会增加生物分子的降解,而且还可能会导
PALM Microbeam系统的原理是利用激光光压
将分离的样品弹入装有裂解液的管盖中,具体分
3 种情况:当组织细胞间是相互分离的时候,可
以直接用光压弹射;若用激光切割的组织较小的
时候,在切割完成时,样品在切割激光作用力下
直接飞入装有裂解液的管中;若切割组织比较
大,则在切割完成后要再加一次激光脉冲将样品
弹入装有裂解液的管中(图2)。这种技术相对于经
典的激光捕获显微切割技术来说,有以下优点:
(1)不需要特制的贴附有EVA膜的塑料帽,可减小
试验消耗;(2)采用激光压力弹射技术使样品从载
图2 激光压力弹射的过程
引自 Asano 等(2002)并作修改。
图1 激光捕获显微切割的过程
引自Schnable 等(2004)并作修改。
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致不期望的细胞组分的改变(A h r a m 等 20 0 3;
Okuducu 等 2003)。在用固定液固定时,采用改
变大分子结构来固定形态的方法可能会影响其完整
性及可提取性(Goldsworthy等1999)。经验证明,
沉淀固定剂像乙醇或丙酮比交联固定剂(例如乙醛
和福尔马林)效果要好,能够得到更高的核酸和蛋
白回收率(Ahram等 2003;Goldsworthy等 1999;
Kerk 等 2003)。
在激光捕获显微切割中,对于人类和动物的
组织,低温固定是获取材料的推荐方法。尽管如
此,冰冻常常在组织内产生大的冰晶而破坏组织
学鉴别的特征,这在植物中尤为突出,这是因为
植物的大多数组织中有大的液泡和空隙(Casson等
2005)。因此,如果研究的器官或组织部分受冰
晶影响不大,可以直接通过冷冻处理准备样品;
若影响较大,则需要在冰冻之前经过冰冻保护剂
处理,通常采用的冰冻保护剂是添加了 10% 蔗糖
的磷酸盐缓冲溶液(137 mmol·L-1 NaCl、8.01
mmol·L-1 Na2HPO4、2.68 mmol·L-1 KCl 和 1.47
mmol·L-1 KH2PO4,pH 7.3)和添加 15% 蔗糖的磷
酸盐缓冲溶液,依次分别抽真空15 min渗入,在
4℃环境中摇床摇动 1 h。处理后的样品包埋于
Tissue-TekÒ OCT基质中(Sakura Finetek公司,美
国),液氮冷冻后保存于 -80℃中(Nakazono 等
2003)。
对于在Tissue-TekÒ OTC基质中冰冻固定和包
埋的样品,在 -20℃下制备10 mm 冷冻切片,并
用CryoJane切片转移系统(Instrumedics公司,美
国)将其粘贴在有黏性的载玻片上。用360 nm 紫
外光瞬间照射后,可以将切片牢牢地固定在黏性
载玻片上。切片固定好以后,在冰上用乙醇逐级
脱水,再在二甲苯中浸泡 2 次即可进行激光显微
切割。在激光显微切割以前,可以将样品保存在
新鲜的二甲苯中(Nakazono等 2003)。
样品除了冰冻包埋以外,还可以用石蜡包
埋。固定后用石蜡进行包埋,已经广泛应用于动
物和植物中,并且与乙醇固定配合使用能够非常
好地保存组织的形态(Ahram 等 2003;Kerk 等
2003;Gillespie等2002)。将材料放入Farmer’s固
定液(乙醇:乙酸 =3:1),在 4℃固定16 h;然后,
通过逐级浓度(75%、85%、100%、100%、100%)
的乙醇在室温脱水,每级 3 h;接着,逐级渗入
二甲苯(乙醇:二甲苯 =75:25、50:50、25:75、
0:100、0:100、0:100) ;最后,在室温加入液态
的Paraplast X-Tra (Fisher Scientific公司,加拿
大),在58℃换2次Paraplast X-Tra基质,随后
在4℃使Paraplast X-Tra固化。使用旋转式切片
机切出10 mm 的切片。42℃热水中展片,粘贴在
载玻片上,空气中干燥,将粘有切片的载玻片经
二甲苯浸泡2次(每次5 min)进行脱蜡,随后便可
以进行激光捕获显微切割(Murata 和 De Luca
2005)。
与冰冻组织相比,虽然石蜡包埋会导致提取
的RNA 和蛋白质总量降低(Ahram 等 2003),但还
是可以从动物和植物组织中获得足够数量的材料用
于反转录 P C R 扩增和 R N A 表达的全局分析
(Kabbarah等 2003)。此外,几百种蛋白质已经被
成功地从乙醇固定、石蜡包埋的组织切片中提取
出来,最后得到的蛋白表达谱与从冰冻组织中获
得的高度相似,并且并不妨碍其后的分析和应
用,如蛋白水解消化和质谱测定等( A h r a m 等
2003)。由于它在保持形态上比冰冻切片有一定的
优越性,因此,对于许多样品来说,采用石蜡
包埋是一个理想的折中方法。
3 激光捕获显微切割在植物学研究中的应用
3.1 组织特异表达基因的寻找 Nakazono等(2003)
应用激光捕获显微切割方法,从冰冻切片中分离
玉米表皮细胞和维管束组织。从这些细胞中分离
的 RNA 经过线性 PCR 扩增,然后与玉米的 cDNA
基因芯片杂交。经过比较,大约有 1.5% (130/
8 791)的 cDNA 在表皮细胞中偏爱表达,大约有
1.5% (137/8 791)的 cDNA 在维管束中偏爱表达。
试验中发现,表皮或维管束鞘细胞中偏爱表达的
一些基因与以前报道中认为主要表达在表皮细胞或
维管束细胞中的基因一致,这也验证了这一试验
的可靠性。
Asano等(2002)将改进的激光捕获显微切割系
统成功地应用于获得水稻叶片中与周围细胞在形态
上有明显区别的韧皮部组织细胞,从这些显微切
割获得的韧皮部细胞(大约 15 0 个)中提取出总
RNA,这些 RNA 经过 T7 RNA 聚合酶扩增以后,
用来建立 cDNA 文库。从文库中随机挑选 413 个
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克隆进行序列测定的结果表明,大约有 37% 的克
隆含有新基因,而其它大约有 63% 的克隆所含有
的基因,或者与已经报道的多种植物中位于韧皮
部的已知基因同源,或者与其它已知基因同源。
原位杂交表明,推定的氨基酸通透酶在韧皮部特
异表达。
3.2 在植物胚胎发育研究中的应用 为了鉴别在受
精后玉米二细胞胚顶细胞或基细胞上调或下调的基
因,Okamoto 等(2005)应用激光捕获显微切割技
术,从二细胞胚中分离顶细胞和基细胞,然后从
顶细胞、基细胞、卵细胞、二细胞胚和多细胞
胚中合成 cDN A。以这些 cDNA 为模板,应用随
机扩增多态 DNA (RAPD)引物进行 PCR。特异的
基因表达模式得到鉴定,随后将这些表达模式分
成6组:(1)配子融合后只在顶细胞上调表达的基
因;(2)配子融合后只在基细胞上调表达的基因;
(3)配子融合后在顶细胞和基细胞中都上调表达的
基因;(4)配子融合后只在顶细胞下调表达的基
因;(5)配子融合后只在基细胞下调表达的基因;
(6)在卵细胞和胚胎中持续表达的基因。其后的试
验表明,在顶细胞或基细胞中上调表达的基因在
早期的合子中已经表达,假如是这样的话,那
么,这些基因的转录产物就可以推定是定位于合
子顶部或基部区域的,或者在合子细胞分裂后的
一个子细胞中迅速降解。
3.3 研究植物与病原体的相互作用 根结线虫是一
类在农作物上危害极大的植物病原线虫,它能够
在寄主根部诱导特定的称为巨细胞的饲喂细胞。
由于以往获得纯的巨细胞很困难,所以,分析巨
细胞的形成和分化的分子机制受到很多限制。
Ramsay等(2004)应用激光显微切割技术,从
番茄根部诱导4 d的含有巨细胞的石蜡切片中收集
巨细胞,并从这些样本中分离总 R N A ,然后用
RT-PCR 研究巨细胞中细胞周期基因的表达。在
巨细胞中,相对于其它细胞来说,2种 D- 型细胞
周期蛋白基因LeCyc-D3;2和 LeCycD3;3可以高水
平表达,表明细胞周期的G1 期诱导可能是对线虫
感染刺激的反应。
4 结语
激光捕获显微切割技术对研究复杂异质组织
中的不连续细胞中所发生的分子和生化过程来说是
一个有力的工具。它操作简单、重复性好、精
确、快速,并且能同时采集大量细胞特异性材
料。许多动物组织的试验结果表明,由激光捕获
显微切割得到的样品可以被成功地应用在基因组、
转录组和蛋白质组分析中。目前,激光捕获显微
切割技术的局限在于它要求靶细胞在形态上容易辨
认,这会导致分离与周围细胞在形态上区分不明
显的异质细胞变得比较困难,但目前已经发展出
一些可以用来协助识别某些特定细胞的方法,例
如免疫组织化学(Fend 等 1999;Murakami 等
2000)、荧光原位杂交(Klitgaard等 2005)等。相
信,随着激光捕获显微切割技术在医学和动物研
究中被越来越广泛而深入地应用,植物领域研究
中也可以得到更多的借鉴,现在已有了一些方法
应用到了植物的研究领域中,这项技术还会深入
到植物组织或细胞水平中去。
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