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Application of hyperspectral data for soil organic matter estimation based on principle components regression analysis

基于主成分回归分析的土壤有机质高光谱预测与模型验证



全 文 :收稿日期:!""#$"#$%& 接受日期:!""’$"($"’
基金项目:国家“’&)”项目(!""&**%"*)"!)资助。
作者简介:卢艳丽(%+#&—),女,内蒙古赤峰市人,博士,主要研究高光谱遥感技术在精准农业中的应用。,-./01:12314 5//67 89: 7 58
!通讯作者 ;91:"%"$&’+%’&#),,-./01:31基于主成分回归分析的土壤有机质
高光谱预测与模型验证
卢艳丽,白由路!,杨俐苹,王红娟,孔庆波
(中国农业科学院农业资源与农业区划研究所,农业部植物营养与养分循环重点开放实验室,北京 %"""’%)
摘要:在室内条件下,利用 *=>!?""高光谱仪测定了风干土壤样品的光谱。通过相关分析对土壤有机质(=@A)光
谱敏感波段进行了初步筛选,利用逐步回归分析和主成分回归(BCD)分析等统计方法进行了显著性变量筛选、共
线性诊断、数据转换等处理,最终建立了东北黑土 =@A回归预测模型。模型所选的波段为均位于近红外波段。经
验证,模型预测值与实测值的决定系数 D! E "F’(",总均方根差 D=A, E "F!!&。
关键词:高光谱;土壤有机质;共线性诊断;主成分回归(BCD);模型
中图分类号:@!%!F%;=%?)F& G ! 文献标识码:* 文章编号:%""’$?"?H(!""’)"&$%"#&$"#
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_069 X9RX9660N8 /8/13606 /8Y QX0850Q19 5N.QN898:6 X9RX9660N8(BCD)/8/13606 7 ;\9 QX9Y05:08R .NY91 ZNX =@A 96:0./:0N8
_/6 Y9[91NQ9Y ZNX <1/5a 6N01 08 8NX:\9/6: C\08/7 ;\9 [/10Y/:0N8 X9621:6 6\N_9Y :\/: :\9 .NY91 06 9ZZ95:0[9 /8Y QX/5:05/<19
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.NY91
土壤信息化是精确农业中精确施肥、管理的前
提。利用光谱技术对土壤特性进行采集和分析是土
壤信息定量化研究的重点。土壤有机质是反映土壤
肥力的重要物质,而高光谱技术的发展为监测土壤
有机质含量提供了更为精确和详细的信息。高光谱
数据提供了连续窄带短波红外光谱信息,为土壤评
价与理化性状的监测提供了强有力的工具。该技术
已经被广泛应用在土壤中矿物成分定量鉴别、土壤
湿度、土壤有机质等方面[%$#]。早在 %+&? 年 LN_9X6
和 T/8a6就指出,影响土壤反射的因素主要有土壤
质地、表面粗糙度、氧化铁含量、土壤水分含量和有
机质含量。而腐殖质是影响土壤色调进而影响光谱
植物营养与肥料学报 !""’,%((&):%"#&$%"’!
""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
B1/8: O2:X0:0N8 /8Y ‘9X:010b9X =509859
反射特性的一个重要因素[!]。"#$%&#’(%等[)]研究表
明,土壤有机质含量与红光波段的反射率具有较强
的相关性,决定系数 *+ 可达 ,-.,);沙晋明等[/,]对
!个不同环境条件下形成的土壤样本剖面上的各个
土层进行光谱测量,发现有机质含量与土壤光谱在
紫外区的 01.-! $2波段、可见光区的 ./.-3 $2波段
和近红外区的 1+4-/ $2波段附近有较好的负相关
性。还有一些研究也确定了有机质影响波段范围在
.,,!!,, $2附近[//5/+]。何挺等[/0]运用光谱微分技
术、逐步回归分析等方法研究了土壤光谱反射特性
与土壤有机质之间的关系。结果表明反射率对数的
一阶微分对土壤有机质含量最为敏感并建立了相应
的回归预测模型。前人在利用多光谱或高光谱数据
对有机质反演的研究中,主要是利用敏感波段的反
射率及其特征参量的构建作为自变量进行回归分
析,进而获得土壤有机质的回归预测模型。如贺军
亮等[/4]利用 3,1!3// $2 波段范围 * 6 *43,!13,
作为诊断指数对 789进行了预测;何挺等[/0]利用
!4) $2、/.!/ $2、+/!1 $2 0个波段的反射率对数的
一阶微分为自变量构成的回归方程对 789进行了
预测。尽管这些模型在预测土壤有机质含量上都具
有一定的效果,但是还存在很多问题。首先,利用单
一的光谱参量容易造成信息的损失。构建包含多波
段信息的复杂光谱诊断指数不但增加了计算和理解
上的难度,而且还可能会导致有用信息被掩盖,使得
模型预测的稳定性不好。通过逐步回归等分析方法
构建的模型,尽管模型中入选的波段均被验证为对
789具有显著回归作用,但是却忽略了不同波段反
射参量之间存在的“多重共线性”即自变量之间的自
相关的问题。而多重共线性存在是我们求出的回归
系数的符号及其数值理论不一致的主要原因[/3]。
本研究通过相关分析确定了土壤有机质含量的敏感
波段。并且利用 7:77/0-, ;<= >($?<@% 通过主成分
回归分析的方法来解决多重共线性的问题,确定东
北黑土土壤有机质含量高光谱预测模型。
! 材料与方法
!"! 土样制备
本研究采用抽样的方式,所用土壤类型全部为
黑土。取样深度为 ,—+, A2,共 /44 个样点。样品
经风干、研磨并通过 / 22孔筛。采用四分法取样,
一式两份,一份用于实验室有机质测定,另一份用于
土壤光谱的测量。东北平原采样点的分布情况见图
/。
!"# 分析测试
/-+-/ 土壤有机质含量测定 采用油浴加热重铬
酸钾氧化—容量法测定:在加热条件下,用过量的
重铬酸钾5硫酸溶液氧化土壤有机碳,多余的重铬酸
钾用硫酸亚铁铵标准溶液滴定,以样品和空白消耗
重铬酸钾的差值计算出有机碳量。将测得的有机碳
图 ! 东北平原采样分布点
$%&’! ()* +%,-.%/0-%12 13 ,4567%2& %2 21.-)*4,- 13 8)%24
11,/.期 卢艳丽,等:基于主成分回归分析的土壤有机质高光谱预测与模型验证
乘以矫正系数 !"!,再乘以常数 !"#$%即为土壤有机
质含量。
!"$"$ 光谱仪 &’()*$+,, 便携式光谱仪光谱范
围为 -+,!$+,, ./。在 -+,!!,,, ./范围内采样
间隔为 !"% ./,在 !,,,!$+,, ./范围内为 $ ./,输
出波段数为 $!+,(重采样间隔为 ! ./)。
!"$"- 土壤反射率测量 将处理好的土样置于直
径 !+ 0/ 深 $ 0/ 的容器中,装满后将土壤表面刮
平,进行室内光谱反射率的测量,操作过程在四周为
漆黑的实验室进行,+ 度视场角的光纤探头固定在
支架上,探头距土壤样本表面 -, 0/。光源为能够提
供平行光的 !,,,1卤光灯,距土壤表面 +, 0/,光源
天顶角为 !+2。每个土样测定 !, 条光谱反射率曲
线,去掉异常线后取平均作为该土样的光谱反射率
值。以白色参考板获取绝对反射率。
!"# 主成分回归分析原理及过程
在多元线性回归分析中,自变量之间会存在一
定程度的相关性。若相关程度较高,则会使各回归
系数估计的方差很大,较严重的多重共线性会导致
不能准确地解释因变量的变化。主成分回归是可以
诊断自变量间的共线性,并给出最终回归预测方程。
其主要步骤为(图 $):
!)逐步回归,筛选回归显著的因子 3个。
$)诊断共线性。若不存在共线性,则建立因变
量 4与 3个自变量的回归方程;若存在共线性,则
进行主成分分析和数据标准化,消除共线性。
-)用标准化的因变量和主成分进行回归,进而
建立标准化线性方程。
%)通过对步骤(-)得到的回归方程参数重组,转
化为原因变量和自变量的表达式。
图 $ 主成分回归分析流程图
%&’($ %)*+ ,-./0 1*/ 2/&3,&2)4 ,*52*3430 /4’/466&*3
!"7 模型的建立和验证
建模样本和验证样本均来自东北黑土,其中
!,,个样本用来建立模型,另外 %%个样本用来验证
模型。采用 *’56法对模型进行检验。
$ 结果与分析
$"! 土壤有机质含量与光谱反射率不同变换形式
的一阶微分相关分析
对原始光谱求导数后对土壤有机质含量的变化
7#,! 植 物 营 养 与 肥 料 学 报 !%卷
敏感程度增强。土壤有机质含量与一阶导数光谱
(! " #$)在 %&’!()& *+波段范围内呈极显著负相
关关系,其相关最显著的中心点波长位置在 (,% *+
附近;而在 &’,!)-. *+、’/-)!’%’( *+和 ’(0%!
’,(- *+ 波段范围内表现为极显著的正相关关系,
其相关最显著的中心点波长位置分别是 &0, *+、
’-&/ *+和 ’,’/ *+。同时,本研究还分析了反射率
的对数、倒数和平方根三种变换形式的一阶导数[即
123(!)" #$、’ 4 ! " #$和 56! " #$]与 27的相关
性。从图 -可以看出,反射率对数形式的一阶导数
进一步增强了对土壤有机质含量的敏感程度。与
27相关达到显著水平的波段范围分别是 %-/!
%(/、((/!(&/、,&/!),/、’///!’-//、’(-/!’(,/和
’,//!’,)/ *+。
图 ! 土壤有机质含量与原始光谱反射率和一阶导数光谱相关分析
"#$%! &’(()*+,#’- +-+*./#/ ’0 ’($+-#1 2+,,)( 1’-,)-, +-3 ’(#$#-+* ()0*)1,+-1) +-3 #,/ 0#(/, 3)(#4+,#’-
565 基于反射率对数一阶导数(789: ; "<)土壤
有机质最优模型的选择
.8.8’ 逐步回归敏感变量的筛选和共线性诊断
选择反射率对数一阶导数与 27相关达到显著水平
的波段范围,并进行以 -/ *+或 (/ *+间隔对宽波
段的进一步细划,最终确定的波段范围分别是 %-/
!%(/、((/!(&/、,&/!0./、0.’!0(/、0(’!0&/、0&’
!&’/、&’’!&%/、&%’!&0/、&0’!)//、)/’!)-/、)-’
!),/、’///!’/(/、’/(’!’’//、’’/’!’’(/、’’(’!
’.//、’./’!’.(/、’.(’!’-//、’(-/!’(,/、’,//!
’,(/、’,(’!’,)/ *+。用以上波段的平均值(共 .’
个变量)与 27进行逐步回归分析。经过逐步回归,
确定了只有 0.’!0(/、&’’!&%/、&%’!&0/、)-’!
),/、’///!’/(/、’/(’!’’//、’./’!’.(/、’,//!
’,(/ *+共 &个波段的特征值对 27回归作用显著,
被留在模型中(表 .)。表 .还列出了逐步回归结果
的回归系数和共线性统计量。其中共线性统计量包
括:容差(9:;<=>*?<)和方差膨胀因子(@A#)。其中,
容差 B ’"!.。因此,容差越小(接近 /),该自变量几
乎是其他自变量的线性组合。而方差膨胀系数是容
差的倒数,小容差导致大 @A#,故某自变量的小容差
和大 @A#均提示其共线性存在。从表 . 看出,入选
的变量中(;:C!(&’/! &%/))D与(;:C!(&%’!&0/))D之间,(;:E
C!(’///! ’/(/))D与( ;:C!(’/(’"’’//))D之间存在高度共线
性。从其波长所在位置可以知道,这两组高度共线
性的变量的波长位置是相邻的。波段相邻或相近是
最容易发生高度共线性的一种情况。
.8.8. 最佳主成分回归模型的确定 由于逐步回
归选入模型中的变量存在高度共线性,必须将数据
进行标准化。因此,可通过主成分回归分析来完成。
表 -显示,& 个变量因子分析中的前 - 个主成分累
积解释的变异量为 )%8(’0F。由此可见,所选的 &
个变量在解释 27 时,可以用 - 个主成分来解释。
因此确定了用 -个主成分来代表 &个光谱变量包含
)0/’,期 卢艳丽,等:基于主成分回归分析的土壤有机质高光谱预测与模型验证
表 ! 回归系数及共线性诊断
"#$%& ! ’&()%*( +,-. (*&/01(& ,&2,&((1-3 #34 5-%%13&#,1*6 41#23-(*15(
参数
!"#"$%&%#
标准化回归系数(!)
’&"()"#)*+%) #%,#%--*.( /.%00*/*%(&(!)
! 值
! 1"23%
"值
" 1"23%
共线性诊断 4.22*(%"#*&5 )*",(.-&*/-
容差
6.2%#"(/%
方差膨胀系数(789)
7"#*"(/% *(02"&*.( 0"/&.#-(789)
!: ;<=>? :<:>?
(2.,@(AB>CAD:))E D?(2.,@(A>:CAB:))E C BA C G :<::: :<::D >=?<;:?
(2.,@(>:::C>:=:))E C ; C B :<::: :<:>> AD<=FA
(2.,@(>G::C>G=:))E :<=GF B<=;F :<::: :<>AG =(2.,@(D;>CD=:))E : :<::? :<;?A B<;:D
(2.,@(>>:>C>>=:))E C :<=G: C BD B<=FF
(2.,@(>;::C>;=:)) :F<:A=
(2.,@(>:=>C>>::))E C := GA<:BD
表 7 因子分析结果 8解释总变异量
"#$%& 7 9#5*-, #3#%6(1(:*-*#% ;#,1#35& &主成分
4.$H.(%(&
初始特征值
8(*&*"2 %*,%(1"23%-
平方和负荷量萃取
IJ&#"/&*.( -3$- .0 -K3"#%) 2.")*(,-
总和
6.&"2
方差百分数
L .0 7"#*"(/%
累积百分数
43$32"&*1%L
总和
6.&"2
方差百分数
L .0 7"#*"(/%
累积百分数
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> =; >GG? :><;F: FB<=>D :><;F: FB<=>D
B := :<:GA :G :<:;B :<;F= FF
D :<::A :<>:= FFA :<::? :<:?? >::<:::
的信息。最终建立的标准化主成分回归方程和转换
后有机质预测模型见式 >和式 ;。
最佳标准化主成分回归方程为:
M’N :<=>D4>C:<:B:4; O :<:=A4?(@; N GDB!!)(>)
转换后的 PQ预测模型为:
PQ(L)N C :<;?? O DB:( 2.,@(D;>CD=:))E O F>F( 2.R
,@(A>:CAB:))E O AG:( 2.,@(AB>CAD:))E O ABF( 2.,@(>:::C>:=:))E
O DG>(2.,@(>:=>C>>::))E O GA?(2.,@(>>:>C>>=:))E O >GDD(2.R
,@(>;::C>;=:))E O G?G(2.,@(>G::C>G=:))E(@; N GA>!!)(;)
!=7 模型检验
由图 B可见,反射率对数的一阶导数对土壤有
机质的预测值与实测值的决定系数 @; 为 :均方根差 @Q’I N :<;;G。将土壤有机质实测值(I-R
&*$"&%) PQ)和利用反射率对数的一阶微分(SPT@ C
9U)预测的土壤有机质含量(!#%)*/&%) PQ)进行 V#*,R
图 > ?@A预测值与实测值相关性比较
912B> C-./#,1(-3 -+ /,&415#*&4 #34 &(*1.#*&4 ?@A
*(,插值,比较有机质化学测定值与实测值空间分布
上的差异。从插值后的空间分布情况来看,预测值
均与实测值具有一定的相关性(图 =)。
:A:> 植 物 营 养 与 肥 料 学 报 >B卷
图 ! "#$预测值与实测值空间分布比较
%&’(! ")*+&*, -./)*0&1.2 .3 )045&-*+45 *25 41+&/*+45 "#$
6 讨论与结论
土壤反射光谱特性是土壤的基本特征之一,它
与土壤的物理性质有着密切的关系[!"]。土壤有机
质对土壤光谱反射率的影响在视觉上表现为暗黑色
的土壤比亮色的土壤有机质含量更高,这表明了土
壤有机质含量与可见光波段光谱反射率间的关
系[!#$!%]。高光谱以其高分辨率、信息量大的特点在
反演土壤有机质含量上表现出强大的优势。
&’()*++高光谱仪能够提供包括可见光和近红外光
谱在内较详细的地物光谱信息。土壤有机质含量的
差异在可见光和近红外波段的光谱反射率都会有所
体现。人们总是希望能够充分利用全波段内有用的
光谱信息使得模型能够更精确、更实际地反演
’,-。基于此,许多研究者做了很多相关的研究。
例如周清等比较了不同波段反射率入选后模型的决
定系数的大小,以入选波段少决定系数大的原则来
确定最终反演模型[!.]。主成分回归不但可以消除
变量间共线性的影响,在保留原有信息的基础上还
有降维的作用。而且本研究通过相关分析、回归分
析和主成分分析等多种统计方法相结合,通过敏感
波段的筛选,并按照相关显著程度进一步将敏感波
段按不同波宽分段进行平均;剔出对 ’,-回归不
显著的变量;对剔出后的变量进行共线性诊断;建
立标准化主成分回归方程等过程,这在以往的研究
中未见报道。本研究最终建立消除了自变量间共线
性影响,又保留了全部有用信息的预测 ’,-的多元
线性回归模型。经过验证,利用反射率对数的一阶
导数对土壤有机质的预测达到了比较好的效果;在
空间分布上预测值与实测值也具有较好的相关性。
出现偏离的样品主要与不同区域有关,即对某些地
区的土壤预测出现偏高或偏低的现象,这可能是由
于不同地区土壤受到影响因素不同以及受影响程度
不同,导致土壤表现出一定的差异,近而导致了预测
受到一定的影响。进一步说明,利用预测值与实测
值的空间分布有利于寻找影响预测偏差的地理因
素,有利于模型的进一步修正和完善,这也是下一步
工作的重点。
参 考 文 献:
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:L>6 植 物 营 养 与 肥 料 学 报 69卷