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Dwarfing Mechanism of Dwarfed Walnut Cultivar ‘Liaoning 2‘

‘辽宁2号‘核桃品种矮化机制初探



全 文 :林业科学研究 2015,28(6):910 915
ForestResearch
  文章编号:10011498(2015)06091006
‘辽宁2号’核桃品种矮化机制初探
宋晓波1,陈凌娜1,王红霞2,裴 东1
(1.中国林业科学研究院林业研究所,国家林业局林木培育重点实验室,北京 100091;
2.河北农业大学山区研究所,河北 保定 071001)
收稿日期:20150722
基金项目:国家自然科学基金项目“核桃埋干复幼促根过程中生长素响应基因的CpG岛甲基化重编程研究(31171933)”
作者简介:宋晓波(1986—),男,博士研究生.主要研究方向:经济林树种遗传改良.Email:songxiaoboo@126.com
 通讯作者:研究员,博士生导师.主要从事核桃栽培与育种研究.Email:peigu@caf.ac.cn
关键词:核桃;辽宁2号;矮化;SSR位点;JrGAI
中图分类号:S792.13 文献标识码:A
DwarfingMechanismofDwarfedWalnutCultivar‘Liaoning2’
SONGXiaobo1,CHENLingna1,WANGHongxia2,PEIDong1
(1.ResearchInstituteofForestry,ChineseAcademicofForestry,KeyLaboratoryofTreeBreedingandCultivation,StateForestryAdministration,
Beijing 100091,China;2.MountainAreasResearchInstituteofHebeiProvince,AgriculturalUniversityofHebei,
Baoding 071001,Hebei,China)
Abstract:‘Liaoning2’isadwarfwalnutvarietybredbyChinesescientiststhroughartificialhybridization,butlit
tleisknownaboutitsdwarfingmechanism.Inthisstudy,thedwarfingmechanismof‘Liaoning2’isdiscussed
throughthecomparisonofbiologicalcharacteristics,genomicsandtheexpressionofgrowthrelatedgeneJrGAI,with
agrowthnormaly,closelyrelated(halfsibfamilies)varietyof‘Liaoning1’ascontrol.Byobservingthephenolo
gyandtreephenotypes,itwasfoundthattherewasnosignificantdiferenceinphenologicalphasebetween‘Liaon
ing1’and‘Liaoning2’,but‘Liaoning2’wasobviouslydwarf,theheight,crownandtrunkdiameterweresmal
ler,theaveragelengthofinternodereducedsignificantly,buttherewasnosignificantdiferenceinthenumberof
developmentbranchinternode.Thedwarfphenotypeof‘Liaoning2’ismainlycausedbyintershortening.The
qRTPCRtechniquewasperformedtoanalyzetheexpressionofGAnegativeregulationgeneJrGAIandtheresults
showedthatduringtheshootdevelopment,theexpressionofJrGAIgeneexhibiteddecreasingexpressionintheshoot
rapidgrowingperiodinbothvarietiesandthedeclinein‘Liaoning1’wasremarkablyreduced.TheSSRanalysis
with25pairsofprimersshowedthatSSRlocioftwovarietieswerediferent,especialythehomozygosityof‘Liaon
ing2’SSRlociwashigher.ItisconcludedthatdiferentexpressionsofJrGAIgeneandhomozygosityofSSRloci
couldbeimportantinternalreasonsofdwarfphenotypeof‘Liaoning2’.
Keywords:walnut;‘Liaoning2’;dwarfing;SSRloci;JrGAI
核桃是我国重要的经济树种,在发展山区经济、
退耕还林和保障粮油安全等方面扮演重要的角色。
在植物学和树木分类学中核桃属植物通常被定义为
高达乔木,自然生长情况下,成年树树高可达25
30m[1-2]。目前,核桃栽培较多采用大冠稀植或乔
化密植,致使树冠郁闭,果实品质差,栽培管理难度
增大,经济效益降低。矮化是高等作物育种的重要
农艺性状,因其可改善种植密度、充分利用空间和土
地、增强光合效率提高产量、降低管理难度、抗倒伏
而受到越来越多的重视[3]。矮化密植栽培也成为果
第6期 宋晓波,等:‘辽宁2号’核桃品种矮化机制初探
树及其他经济树种集约化经营发展的趋势。
‘辽宁1号’和‘辽宁2号’是1980年由辽宁省
经济林研究所刘万生等通过人工杂交育成。母本分
别为河北昌黎大薄皮(晚实)优株10103和10104,
父本同为新疆纸皮核桃(早实)优株11001。二者属
于半同胞家系,亲缘关系十分相近,但在生长特性方
面却表现出明显的差异。‘辽宁2号’树冠紧凑、树
体矮化,5年生树高仅1.5 2.0m左右,而8年生
‘辽宁1号’树高可达8m左右[1]。通常认为,植物
的矮化与下列因素有关:在表型上,矮化植株表现为
节间长度的缩短或节数的减少,或者二者同时发生。
节间的缩短又分为各节间均匀缩短或特定节间的缩
短[4];在细胞水平上,茎秆节间部分细胞数目的减少
或单细胞平均长度的减少是造成植物矮化的主要原
因[5];在生理方面,激素对植株高的调控作用十分重
要,各种激素的作用不同又相互联系,其中,赤霉素
和油菜素内酯类激素在植物的株高调控方面发挥主
要作用[6-9],细胞分裂素的主要生理功能是促进细
胞分裂和芽的分化,对细胞的伸长具有抑制作用,乙
烯和脱落酸通过与赤霉素的互作抑制细胞的纵向伸
长,使节间缩短,阻碍植物高生长[10-13]。激素调控
株高最著名的例子是20世纪,矮杆小麦、水稻在世
界范围内大面积推广引发的“绿色革命”[14-15];在
遗传上,异交繁殖占优势的植物出现近交时,通常会
导致子代在适应性、生长势等方面发生不同程度的
衰退[16-18],表现出生长缓慢、植株矮化等现象[19]。
近交引起这种现象的原因是多方面的,广泛被人们
接受的假说认为,近交降低种内遗传变异,导致后代
群体的遗传组成趋于纯合从而使隐性基因得以
表现[19-21]。
‘辽宁2号’树体矮化、丰产性强,育成至今已在
全国多个省市进行栽植,但对于致矮机制的研究尚
未见报道。本研究通过与生长正常且亲缘关系十分
接近的‘辽宁1号’品种比较,从生物学特性、基因组
及生长密切相关的基因 JrGAI的表达等方面对‘辽
宁2号’的致矮机制进行探讨,结果对深入认识核桃
矮化性状的形成机制和科学利用提供理论基础和
指导。
1 材料与方法
1.1 试验材料
试验地点位于河北省定州市德胜农林公司品种
评比园(38°33′49.42″N、114°58′32.86″E)。试验材
料为9年生早实核桃品种:‘辽宁1号’(河北昌黎
大薄皮10103×新疆纸皮11001)和 ‘辽宁2号’(河
北昌黎大薄皮10104×新疆纸皮11001)。立地条件
和管理水平相同,并通过人工疏花疏果保持单位空
间内果实负载量基本一致。
1.2 试验方法
1.2.1 物候期及树体生长特性的比较研究 分别
选取‘辽宁1号’和‘辽宁2号’树势一致的树体各3
棵,进行物候期及树体生长特性的调查。调查方法
参照《植物新品种特异性、一致性、稳定性测试指南
-核桃属》进行[22]。物候期观测于 2014年进行。
使用测高器、米尺和围尺进行树高、冠幅和地径(地
面以上20cm处的测量值)的测量,选取树冠外围东
至南侧正常生长的一年结果枝和发育枝各30个,采
用米尺测量其长度,数出30个枝条上的节数,总长
度除以总节数,得到结果枝和发育枝平均节间长度。
1.2.2 生长负调控基因 JrGAI在新梢发育过程中
的表达分析 分别于萌芽前、展叶期、新梢速长期和
新梢停长期采集2个品种发育枝的顶端叶芽、新梢
顶端第1节位及茎尖组织,每个品种采集3棵。参
照何富强等[23]的 方法进行 RNA提取,Nano
Drop2000微量分光光度计测定浓度,将同一时期3
次重复的RNA进行等量混合并反转录为cDNA。根
据前期研究得到的核桃DELLA蛋白编码基因 JrGAI
(Genebank:JF766606)cDNA全长设计基因特异性
引物,以18SrRNA为内参基因设计引物(表1),实
时荧光定量qRTPCR检测JrGAI基因在新梢发育过
程中的表达模式。实时荧光定量qRTPCR20.0μL
反应体系为:SYBRPremix(2X)10.0μL,上游引物
(10μmol·L-1)0.4μL,下游引物(10μmol·L-1)
0.4μL,cDNA2.0μL,ddH2O7.2μL,每样本3次技
术重复。采用两步法 PCR标准扩增程序,以2-ΔΔCT
法进行定量数据分析。
表1 引物列表
引物名称 引物序列(5′3′)
qJrGAIF AGCGAACCACAACGGACCAGT
qJrGAIR ACCTTGTCCTGATTGCTCACGGAT
18SrRNAF AGAGGCCTACAATGGTGGTG
18SrRNAR CTCCAATGGATCCTCGTTA
1.2.3 基因组位点的 SSR分析 于展叶期采集2
个品种的叶片,改良 CTAB法[24]分别提取2个品种
的基因组 DNA。经琼脂糖凝胶电泳和分光光度法
检测基因组DNA的浓度和质量后,稀释至25ng·
119
林 业 科 学 研 究 第28卷
uL-1的工作浓度。利用25对从核桃(前缀:WJR)和
黑核桃(前缀:WGA)中筛选得到的稳定性好、多态
性高SSR引物[25],以‘辽宁1号’和‘辽宁2号’的
基因组DNA为模板进行扩增,分析2个品种的基因
组纯合情况。PCR反应体系(20μL)为:Bufer(10
×)2.0μL,dNTPs(2.5mmol·L-1)1.6μL,引物
(10μmol·L-1)1.6μL,ExTaq(5U·μL-1)0.3
μL,DNA(25ng·μL-1)2.0μL,ddH2O补足
200μL。反应程序:94℃,5min;94℃,45s,52
56℃,45s,72℃,45s,40个循环;72℃,7min。扩
增产物利用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,高
压电泳75W恒定功率,预电泳45min,上样75W
电泳 1h。电泳后参照 McCouch[26]的方法银染显
色,数码相机拍照记录。根据扩增条带的相对迁移
位置绘制扩增结果示意图,同一引物在不同品种中
扩增条带在模式图中水平位置一致,则代表该引物
检测的SSR位点在供试品种中具有相同等位基因,
判定其来源于同一亲本或不同亲本相同染色体的同
一区段。如果一对引物扩增出 2条带则为杂合位
点,扩增出1条带则为纯合位点。
1.2.4 数据处理 试验数据采用SPSS18.0统计软
件进行0.05水平Duncan’s差异显著性检验。
2 结果与分析
2.1 物候期及生长特性的比较
物候期的观测结果(表 2)显示:‘辽宁2号’和
‘辽宁1号’的萌芽期在 4月上旬,‘辽宁 2号’比
‘辽宁1号’早5d;5月中旬进入新梢停长期,‘辽宁
2号’比‘辽宁1号’早4d;落叶期一般在11月中下
旬,‘辽宁2号’比‘辽宁1号’早7d;在物候期方面
‘辽宁2号’比‘辽宁1号’整体提前2 7d,没有明
显差异。树体生长情况调查及方差分析结果(表 3)
表明:9年生‘辽宁2号’的树高平均为3.83m,为
‘辽宁1号’树高的60.5%,冠幅和地径等也显著低
于‘辽宁1号’;‘辽宁2号’的当年生发育枝节间数
与‘辽宁1号’的差异不显著,但其平均节间长度明
显较短,为3.28cm,仅为‘辽宁1号’的63.1%。
表2 不同核桃品种物候期的对比
核桃品种
萌芽期
雄花
盛花期
雌花
盛花期
新梢
停长期
果实
成熟期
落叶

时间(月-日)
‘辽宁1号’04-09 04-22 04-30 05-17 09-19 11-22
‘辽宁2号’04-04 04-20 05-03 05-13 09-15 11-15
表3 不同核桃品种‘辽宁1号’和‘辽宁2号’树体生长特性对比
品种 树高/m 地径/cm
冠幅/m
东西/m 南北/m
小叶数/片
结果枝平均
节间长/cm
发育枝平均
节间长/cm
发育枝
结间数/个
‘辽宁1号’ 6.33a 14.87a 4.93a 4.77a 5 7 1.17a 5.20a 9.71a
‘辽宁2号’ 3.83b 12.47b 3.97b 3.95b 5 7 1.12a 3.28b 9.38a
  注:同列不同小写字母表示差异显著(P<0.05),下同。
2.2 生长负调控基因 JrGAI在枝条发育过程中的
表达模式
  实时荧光定量PCR结果显示:在‘辽宁2号’和
‘辽宁1号’的新梢生长发育过程中,JrGAI基因在2
个品种中的表达水平呈相同的变化模式(图1):Jr
GAI基因在未萌发的芽中具有较高的表达水平,随
着芽的萌发和新梢的迅速伸长而降低,至新梢停长
后恢复较高的表达水平。在展叶期和新梢速长期,
JrGAI基因在‘辽宁1号’中的表达量下降,与叶芽期
的差异均显著,分别为叶芽期的79.5%和568%,
而在‘辽宁2号’中的表达量则相对稳定,分别为叶
芽期的80.5%和79.5%。
2.3 基因组纯合度的SSR鉴定
25对SSR引物在‘辽宁1号’和‘辽宁2号’中
扩增的条带数量及位置示意图见图2。1对引物扩
图1 JrGAI基因在不同核桃品种新梢发育过程中的表达分析
增出2条带为杂合位点,扩增出1条带则为纯合位
点。同一引物扩增产物的条带水平位置相同,代表
该引物在供试品种中具有相同等位基因。以引物
WJR022在‘辽宁1号’和‘辽宁2号’扩增条带模式
219
第6期 宋晓波,等:‘辽宁2号’核桃品种矮化机制初探
为例,在2个品种中,该引物检测的位点均为杂合,
“”标注的等位基因为二者共有等位基因,推测其
来自二者共同的父本新疆纸皮核桃单株11001。在
检测的25个 SSR位点中,19个位点在‘辽宁1号’
和‘辽宁2号’至少有1个共有等位基因,来自于相
同父本新疆纸皮核桃单株 11001;引物 WJR087、
WJR294、WJR309、WGA070、WGA089和 WGA331所
检测的SSR位点,‘辽宁1号’和‘辽宁2号’无共有
等位基因。‘辽宁1号’扩增出25个位点的37个等
位基因,其中,13个位点为纯合。‘辽宁2号’扩增
出25个位点的32个等位基因,其中,18个位点为纯
合。‘辽宁1号’和‘辽宁2号’纯合等位基因的比
例分别为52%和72%,‘辽宁2号’的SSR位点纯合
度明显高于‘辽宁1号’。
图2 25对SSR引物在核桃品种‘辽宁1号’和‘辽宁2号’中扩增的条带数量及位置
3 结论与讨论
物候期及树体生长特性的比较研究发现,‘辽宁
2号’株高降低主要由节间长度的缩短引起,这与在
桃和梨的矮化机制研究中得到的结论一致,即矮化
类型资源主要是由于节间长度的缩短造成[27-28]。
在柑橘的矮生和矮化效应预选指标的研究也发现,
实生植株的节间长度与株高呈极显著正相关[29],而
在陆地棉矮化突变体的研究中发现,突变体的株高、
节间数和节间长度都显著低于野生型,突变体的矮
化表型是由节间数和节间长度共同作用的结果[30]。
在矮化管理措施的研究中发现,通过施用植物生长
调节抑制剂获得的矮化绿竹植株则主要由节间数目
的减少造成[31]。
实时荧光定量PCR结果发现,在新梢发育过程
中,JrGAI基因在2个品种中均表现出展叶期和新梢
速长期表达量下降的特点,且在‘辽宁1号’中2个
时期表达量的下降均达显著水平,而在‘辽宁2号’
中的表达量则相对稳定。因此,JrGAI基因在2个品
种新梢发育过程中表达水平的差异可能是造成‘辽
宁2号’矮化性状的原因之一。JrGAI基因编码的
DELLA蛋白家族成员[32-33]是赤霉素的信号转导通
路中一个重要的负调控基因,其超量表达或 DELLA
功能结构域的突变均会导致植株赤霉素不敏感的矮
化表型[14,34]。在柱形苹果短枝、矮化特性的研究
中,MdGAI基因在柱型和普通型苹果春、夏和秋季的
新梢茎尖均能表达,且同一时期,普通型苹果新梢茎
尖的表达量明显较低,说明柱型苹果的生长分枝特
性可能与 MdGAI基因的表达差异有关[35]。在 GAI
基因功能验证方面,拟南芥 GAI基因转化苹果、杨
树[36],苹果MdRGLa基因转化烟草均获得具有矮化
表型的植株,且转基因植株的矮化程度与基因表达
量显著相关[37]。
SSR扩增结果显示:2个品种的 SSR位点存在
较大差异,较为突出的特征是,‘辽宁2号’的 SSR
位点纯合度增加。这种现象可能是由于育种亲本
的亲缘关系较近引起的近交所致。异交在核桃属
植物交配系统中占绝对优势,近交通常会因为有害
等位基因的结合导致子代抗逆性下降、生长缓慢等
衰退表现[38]。在其他木本植物的研究中,梨[39]近
交后代同样表现出了树体矮化、生活力下降等近交
衰退现象。在 SSR技术对不同交配组合鹅掌楸子
代的研究中也得到一致的结论,即近交(自交)组
合子代的纯合子比例显著增加,且这部分子代在生
长量和存活率方面表现出显著的降低[40];所以,在
生产中,利用‘辽宁2号’时要注意加强土肥水管
理,合理控制果实负载量并选择生长势强的砧木来
避免树势过早衰退,甚至死亡。另外,本研究仅从
生物学特性、基因组 SSR位点纯合度及赤霉素负
调控基因 JrGAI表达方面对‘辽宁2号’矮化机制
进行了初步的探索,更深层次的致矮机理还需要从
其他生长相关激素及全基因组水平进行更广泛和
深入的研究。
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