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Application of Genechip in Screening the Stem Differentiation-Related Genes

利用基因芯片筛选影响茎分化的相关基因


顶端分生组织的分化影响茎及根的生长,从而形成具有不同形态的植株,拟南芥因其在适当条件下与木本植物分生组织分化以及次生生长的共性而被运用到研究当中。花异常株系(AFDL)由于AP 1表达的显著降低导致分枝增多。用拟南芥基因芯片对AFDL的幼苗进行基因表达分析,结果显示在临近抽薹期,AFDL与野生型相比有111个变化倍数大于2且P<0.01的基因; 其中大部分参与对外界环境及内源刺激的感知和应答,表明AP 1下降可能是由于植株对内外环境刺激的过度反应所导致。从基因芯片中挑选出表达量变化显著的2个基因,分别构建相应的植物表达载体并转化拟南芥,其中AT1G56300基因的超表达植株及AT1G65490基因的抑制表达植株都出现了多茎融合、真叶萌发延迟且生长缓慢的表型,并且转基因植株的基因表达变化趋势与性状强弱程度相对应。上述结果初步表明这2个基因能影响茎的分化并作用于最终的形态建成。

The apical meristem differentiation influences the stem and root development, and the plant morphogenesis. In this study, Arabidopsis thaliana was used to investigate the stem secondary growth because it has similar meristem differentiation and secondary growth as woody species do. An Abnormal Flower Development Line (AFDL) produces more branches because of the remarkably reduced expression of AP 1. The genechip was used to identify the differentially expressed genes in this study, and the result showed that there were 111 genes whose changes were more than two folds (P<0.01) in the AFDL compared to wild-type before bolting. Most of these genes were involved in responses to the internal and the environmental stimulations. It was indicated that reduction in AP 1 expression of AFDL was due to the excessive response to the stimulations. Two genes with remarkable changes in their expression were chosen from the genechip analysis, the expression vectors were constructed, and they were transferring to Arabidopsis thaliana via GV3101. The overexpression transplants of AT1G56300 and the RNAi transplants of AT1G65490 showed a phenotype of multi-stems stacked or caespitose stems. In addition, the euphylla development was postponed. The gene expression in these transgenic plants was measured by RT-qPCR, and the level of genes in different line was coincidence with their phenotype. Our results indicated that the two genes would be related to the development and differentiation of the stem and play a role in the plant morphogenesis.


全 文 :第 !" 卷 第 ## 期
$ % # $ 年 ## 月
林 业 科 学
&’()*+(, &(-.,) &(*(’,)
./01!"!*/1##
*/23!$ % # $
收稿日期" $%#$ 4%" 4$!# 修回日期" $%#$ 4%6 4$#$
基金项目" %659&计划%木材形成的调控机制研究&项目’$%#$’7##!;%9( $
!卢孟柱为通讯作者$
利用基因芯片筛选影响茎分化的相关基因!
蒋:瑶#:戚晓利#!$:唐:芳#:赵树堂#:陈:军#:卢孟柱#
’#3林木遗传育种国家重点实验室:中国林业科学研究院林业研究所:北京 #%%%6##
$3佳木斯大学生命科学学院:佳木斯 #;!%%5(
摘:要! :顶端分生组织的分化影响茎及根的生长!从而形成具有不同形态的植株!拟南芥因其在适当条件下与木
本植物分生组织分化以及次生生长的共性而被运用到研究当中$ 花异常株系’,Z8-(由于 :DZ 表达的显著降低导
致分枝增多$ 用拟南芥基因芯片对 ,Z8-的幼苗进行基因表达分析!结果显示在临近抽薹期!,Z8-与野生型相比
有 ### 个变化倍数大于 $ 且 Ds%1%# 的基因# 其中大部分参与对外界环境及内源刺激的感知和应答!表明 :DZ 下
降可能是由于植株对内外环境刺激的过度反应所导致$ 从基因芯片中挑选出表达量变化显著的 $ 个基因!分别构
建相应的植物表达载体并转化拟南芥!其中 ,+#K;\9%% 基因的超表达植株及 ,+#K\;!6% 基因的抑制表达植株都
出现了多茎融合)真叶萌发延迟且生长缓慢的表型!并且转基因植株的基因表达变化趋势与性状强弱程度相对应$
上述结果初步表明这 $ 个基因能影响茎的分化并作用于最终的形态建成$
关键词" :基因芯片# 融合茎# 植物形态建成# 拟南芥
中图分类号! &5#"1!\& l6!91$:::文献标识码! ,:::文章编号! #%%# 45!"""$%#$### 4%%!$ 4%5
6$$3’.%1’")"*U,),.B’$’)-.&,,)’)C 1B,-1,#/’**,&,)1’%1’")MS,3%1,5U,),(
jA=>HM=/#:lAUA=/0A#!$:+=>HZ=>H#:G<=/&H#:’ jI>#:-I [B>HX’#B7+’+$#$%&’()*’+)*%),-*$$W$1$+0=9’1/ .*$$/012:<$’9$*=> ?19+0+4+$),8)*$9+*%! 3>01$9$:=’/$;%),8)*$9+*%:.$0@012 #%%%6##
$B3)5$2$),&0,$7=0$1=$9! [0’;490J106$*90+%:[0’;490#;!%%5(
67(1&%.1" :+SA=SA/> A>O0IB>RBFSQ C//SQB2B0/EDB>S! =>Q SSD/CEBFAF3
(> S’50’1’ T=FIFBQ S/A>2BFSAH=SBSQ=CLHC/TS< NBR=IFBAS<=FFADA0=CDBCAFSBD
QAOBCB>SA=SA/> =>Q FBR/>Q=CLHC/TS< =FT//QLFEBRABFQ/3,> ,N>/CD=0Z0/TBC8B2B0/EDB>S-A>B’,Z8-( EC/QIRBFD/CB
NC=>R /O:DZ3+BRSAOLSSA=0L
BVECBFFBQ HB>BFA> SQ SBFTHBFTBCBD/CBS<=> ST/O/0QF
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K.9#%#3+ SC=>FE0=>SF/O,+#K;\9%% =>Q SFE0=>SF/O,+#K\;!6% F/SLEB/O
DI0SA?FSBDFFS=RPBQ /CR=BFEAS/FBFSBDF3(> =QQASA/>! SST=FE/FSE/>BQ3+BBVECBFFA/> A>
SFHB>ARE0=>SFT=FDB=FICBQ NLh+?kY’h! =>Q SBFA> QAOBCB>S0A>BT=FR/A>RAQB>RBTAS< SE/SLEB3cICCBFI0SFA>QAR=SBQ S<=SSBFT/I0Q NBCB0=SBQ S/SS=>Q QAOBCB>SA=SA/> /OSQ
E0=L=C/0BA> SSD/CEBFAF3
8,2 9"&5(" :HB>BRSD/CEBFAF# :*’(0/)E909+>’50’1’
::植物个体的发育在形成种子时!新一代的植株
就已经完成了形态学上的初步分化$ 种子在适宜的
条件下经过一系列的生长发育!成为具有根)茎)叶
的幼苗 ’8/BC>BC! #666# &IFFBV! #6"6($ 这一过程
涉及到复杂的细胞分裂)组织分化和器官发生的生
物学过程$ 原分生组织衍生出维管植物根和茎的顶
端分生组织形成了顶端生长点$ 茎尖顶端分生组织
’&,[!F增殖和分化之间的平衡不断地产生地上器官!是植
物生长发育最基本的活动之一$ 对 &,[的研究已成
:第 ## 期 蒋:瑶等" 利用基因芯片筛选影响茎分化的相关基因
为发育生物学的研究热点’M=Q=2$+’53! $%#%(!该领
域研究不仅解释了对 &,[的分子调控机制!也为叶)
花及茎的器官发育机制奠定了基础’ZA>0=LF/> $+’5B!
$%#%($ 顶端分生组织的形成与分化不仅受到复杂基
因网络的调控!外界的各种环境刺激以及体内激素也
能影响分生组织的分化’K/>H$+’5B! $%%;($
近年来基因芯片应用广泛!可实现自动)快速)
平行地检测样品中上万基因的表达情况!并能检测
基因间的互作!寻找新的功能基因$ &BPA等’$%%#(
利用拟南芥 ’:*’(0/)E909+>’50’1’(基因芯片鉴定到
#6 个低温诱导基因和 66 个失水诱导基因!其中 "
个低温诱导基因和 99 个失水诱导基因是以前没有
报道过的# #$ 个压力诱导基因被鉴定是 8h)7#,
的靶基因!其中 \ 个是新基因$ 基因芯片还被运用
于检测突变体!并以此来确定某些特殊性状$
.0=R=FA/F等’$%%9(利用基因芯片研究了拟南芥
的功能基因 ’/’\(和 2=1]!并分析了这 $ 个基因的
+?8*,突变体在生长发育中表现出的多重表型$
除此之外!利用拟南芥来研究其他木本植物基因功
能已成为一种常用的研究手段!@=>H等’$%%6(用
拟南芥全基因组基因芯片分析了毛白杨次生维管再
生系统发育过程中不同时期的基因表达谱!并利用
相应基因的拟南芥突变体进行功能研究!充分利用
了拟南芥生长周期短)突变体资源丰富的优势$
本课题组在筛选木材形成相关基因的拟南芥突
变体时得到了一个株系 ,N>/CD=0Z0/TBC8B2B0/EDB>S
-A>B’,Z8-(!该植株的表型并不是由 +?8*,插入的
基因导致’lA$+’5B! $%##($ ,Z8-株系的花器官发育
异常!并且少数个体带有融合茎表型!基因表达分析
结果显示该株系中 :DZ 的表达量下降了约 6\ 倍!与
:DZ 相拮抗的 -8&Z 基因表达量上升了 !1\ 倍’未发
表(!因此花分生组织转变成花序分生组织!,Z8-的
融合茎可能是由顶端分生组织分化异常所导致的$
但是 ,Z8-中 :DZ 并没有发生基因突变!而是在表达
水平上受到调控’lA$+’5B! $%##(!,Z8-的突变表型
是由 :DZ 下降引起的$ 本研究以野生型拟南芥为对
照!对 ,Z8-进行了全基因表达谱分析!并从差异表
达基因中挑选了 $ 个候选基因进行研究!从而筛选出
对分生组织的建立与分化有重要作用的新基因!为揭
示顶端分生组织的机制以及探讨花发育与茎发育之
间的关系提供了研究基础$
#:材料与方法
:;:<材料
#1#1#:试验材料:野生型拟南芥及拟南芥花异常
株系 ,Z8-的种子来自于拟南芥突变体资源中心
’+H<=D ,C=NAQ/EFAF&S/RP ’B>SCB!*,&’(!
两者均为 -$*9型拟南芥$ 基因芯片采用 ,OLDBSCAV
公司 的 拟 南 芥 ,+J#?#$#;%# 全 基 因 组 芯 片$
K=SBT=L中间载体 E8c*h$$$1# 及 K=SBT=L表达载
体 E[89$)EJ5K由中国林业科学研究院陈军副研
究 员 提 供$ 农 杆 菌 ’ :2*)(’=+$*04; +4;$,’=0$19(
K.9#%# 均由中国林业科学研究院林木遗传育种国
家重点实验室保存$
#1#1$:试剂:R8*,合成与纯化及 Rh*,合成与纯
化试剂盒均购自 ,OLDBSCAV公司# YCADB&+,h+[
J& 8*,Y/0LDBC=FB)+=g=h=C+=k 等 8*,聚合酶及
定量试剂的 &M7h’ YCBDAV)U +=k+[ & 购自
+,g,h,公司# h*B=FL’ E0=>S[A>AgAS试剂盒)
h*=FB?OCBB8>=FB试剂盒)Y’h产物回收试剂盒
l(,kIARP KB0)VSC=RSA/> gAS)质粒小量提取试剂盒
l(,ECBE &EA> [A>AECBE gAS均购自lA=HB> 公司# 反转
录试剂盒 &IEBCFRCAES(((ZACFS?FSC=>Q gAS)K=SBT=L’ 7Y
’0/>=FB’ )>XLDB[AV及 K=SBT=L’ -h’0/>=FB’
)>XLDB[AV购自 (>2ASC/HB> 公司# 限制性内切酶购
自 *)7公司# g=>=DLRA>!&EBRSA>/DLRA> 及 &A0TBS?55
购自 &AHD=公司!JLHC/DLRA> 购自 hc’J)公司$ 其
他的常用化学试剂均为分析纯级$ 引物由上海英骏
公司合成$
:;=<研究方法
#1$1#:拟南芥种植及取材: 将野生型拟南芥及
,Z8-的种子用 5;e酒精灭菌!播种在 #b$[& 培养
基上!一半播种野生型!一半播种 ,Z8-$ ! o暗培
养春化 9 天!移至 ’$$ t$( o!#\ < 光照b" < 暗培
养!光照条件为 ##% (D/0+D4$ F4#的培养箱中$ 待
植物长至约 #% 片真叶时!取用整株去根幼苗为材
料!每组取材各 #%% DH!重复取材 $ 组$
#1$1$:h*,提取$R8*,和 Rh*,的合成及纯化:
取用 #%% DH拟南芥幼苗为材料!迅速投入液氮中并
研磨成粉末!h*,的提取按照总 h*,提取试剂盒
h*B=FL’ E0=>S[A>AgAS的操作说明书进行$ 按照
,OLDBSCAVc>B?RLR0BR8*,&L>S合成第 # 链 R8*,!并以此为模板合成第 $ 链
R8*,! 利 用 ,OLDBSCAVKB>B’IE
[/QI0B纯化 R8*,!并以纯化后的 R8*,为模板反
转录 Rh*,!该步骤依照 KB>B’HgAS
试剂盒说明书进行操作!检测 Rh*,质量并进行片
段化!变性胶检测 Rh*,片段化结果$
#1$19:芯片的杂交$洗涤及扫描:芯片的杂交)洗
涤及扫描均按照 ,OLDBSCAV的真核生物杂交流程进
9!
林 业 科 学 !" 卷:
行!芯 片 杂 交 试 验 设 $ 次 重 复$ 用 ,OLDBSCAV
JLNCAQAX=SA/> c2B> \!% 及 ,OLDBSCAVZ0IAQARF&S=SA/>
!;% 进 行 芯 片 杂 交! 采 用 ,OLDBSCAVKB>B’&R=>>BC9%%% 进行基因芯片扫描!获得信号值后根
据内标噪点等进行均一化处理$ 芯片数据通过
,OLDBSCAV[ARC/=CC=L&IASB.BCFA/> ;1% 进行处理!应
用 K’c& 软件将芯片信号转变成数字信号!并对通
过筛选条件的探针进行基因注释和功能分类!采用
公共 数 据 库 所 提 供 的 分 析 软 件 ’ =OLDBSCAV3R/Db=>=0LFAFbA>QBV3=OV# =NRR3>RAORCO3H/2bFIDD=CL3WFE( 进行分析$
#1$1!:载体构建及植物侵染$检测:从基因芯片结
果中挑选出 $ 个显著差异表达的基因!并构建相应
的植物表达载体!在 ,Z8-芯片分析结果中表达量
上升的基因构建超表达载体!而表达量下降的基因
则构建抑制表达载体$ 根据 +=AC网站发表的基因
全序列!分别设计 ;/端带有 ’+.序列的引物进行目
的基因片段扩增$
按照(>2ASC/HB> 公司K=SBT=L7Y’0/>=FB)>XLDB
[AV试剂说明书进行 7Y反应" 混匀目的片段 Y’h
产物及入门载体 E8c*h$$$1#!室温酶反应过夜!转
化并筛选阳性克隆!Y’h检测后送至上海英骏公司
测序$ 提取测序正确的阳性克隆质粒!用 [-i(单
酶切线性化后进行 -h反应" 混合 7Y线性化产物
及表达载体 E[8’9$ 或 EJ5K!目的片段在 +cYc酶
的作用下插入到表达载体的 ’+h序列间!转化并筛
选阳性克隆!提取质粒进行 Y’h及质粒大小检测#
将植物表达载体通过电击法导入农杆菌 K.9#%# 的
感受态菌株中!抗生素筛选并用 Y’h检测阳性转
化子$
按照 ’0/IH< 等’#66"(发表的花浸法转化野生
型拟南芥!将 +#代转基因拟南芥种子用含有 $; DH+
D-4#潮霉素的 #b$[& 培养基进行抗性筛选!大约 $
周后将阳性植株移至土壤中!长至临近抽薹时提取
莲座叶基因组 8*,并对插入的目的基因进行 Y’h
检测$
#1$1;:基因表达分析:对野生型拟南芥及转基因
植株进行基因表达分析!设计并合成目的基因及内参
基因:3-?K\ 的定量引物$ 分别以野生型及转基因植
株的莲座叶为材料!提取总 h*,并转录成第 # 链
R8*,!操 作 同 #1$1$$ 按 照 &M7h’ YCBDAV)U
+=k+[&使用说明进行 hB=0?SADBY’h!以稀释 $; 倍
的第 # 链R8*,为模板!采用 \% o退火!重复 !% 个循
环的两步法!并用相同退火温度进行溶解曲线扩增$
每种样品重复 9 次!每次做 ! ‘\ 个技术重复$
$:结果与分析
=;:<6I/N表型’总 SL6及芯片杂交质量分析
,Z8-拟南芥与野生型相比较主要差异表现在
花瓣缺失’图 # ’(!有强烈的花序!整株的形态饱满
紧凑’图 #7(!并且有少数个体出现了多主茎同时从
莲座叶中萌发或者多茎融合的表型’图 #’! 8(!这
些植株往往能形成更多的分枝$
用 ,HA0B>S$#%% 7A/=>=0LXBC检测野生型拟南芥
及 ,Z8-的总 h*,质量’图 $,(!结果表明总 h*,
质量合格!可用作下一步 Rh*,的制备$
本试验采用的 ,+J#?#$#;%# 全基因组芯片中
加入了内参基因" "?=RSA>)K,Y8J!杂交对照 NA/7)
NA/’)NA/8和 RCB!Y/0L?,对照 0LF)E7$ c0AH/YBCO/CD=>RB$ 在芯片杂交后整张芯片的扫
描图像呈现四周呈明暗交替的状态!并且左上角的
芯片名称清晰可见’图 $7($ 平均背景值的数值在
$% ‘#;% 之间!内参基因 "?=RSA> 及 K,Y8J探针组
的 9/b;/比值大于 9!该指标说明 h*,以及试验的
质量达标$ 杂交后能检测到杂交对照和 Y/0L?,对
照的信号并且均呈递增趋势!说明芯片的杂交)洗涤
以及扫描合格$ 样品表达 D值)芯片的背景平均值
以及噪点值均在适当的范围内!芯片数据可用于后
续分析$
=;=<苗芯片差异表达基因分析
整合重复样品的芯片数据!结果显示野生型
拟南芥与 ,Z8-的数据聚类具有明显差别 ’图
9,( !在幼苗芯片中共得到了 $$ "## 个探针的表
达信息!从芯片数据的散点分布图 ’图 97(可得
知" 在野生型拟南芥和 ,Z8-中大部分的基因表
达水平相似!! 对线分别代表变化倍数为 $!9!#%!
9%!对角线上下方的数据分别代表表达上升和表
达下降的基因$
对苗芯片中显著差异表达的基因进行统计’图
9’!8(!其中 Ds%1%;!变化倍数超过 $ 倍的基因有
#65 个!表达量上升的有 65 个!表达下降的有 #%%
个# Ds%1%#!变化倍数超过 $ 倍的基因有 ### 个!
其中上调的有 \5 个!下降的有 !! 个$ 差异表达基
因的变化倍数主要集中在 t$ 倍的范围内!该部分
变化的基因数目在 Ds%1%; 以及 Ds%1%# 分别达
到总数的 5"1#5e和 5%1$5e!基因表达变化范围在
4\15\" 9\ 倍至 "1%9; 9$ 倍之间$
将 ,Z8-幼苗芯片中表达差异极明显的基因
’Ds%1%#(进行 Kc分类!从参与的生物过程进行
了 分 析 ’ 表 # ($ 在 8,.(8 网 站 ZI>RSA/>=0
!!
:第 ## 期 蒋:瑶等" 利用基因芯片筛选影响茎分化的相关基因
,>>/S=SA/> 在线分析软件中导入芯片数据中差异表
达基因的,K(号’JI=>H$+’5B! $%%"# & $+’5B!
$%%6(!输出结果中有一部分基因没有被分类 ’*/
多项的统计$
图 #:野生型拟南芥),Z8-整株形态及 ,Z8-
融合茎表型
ZAH3#:+/SLEB/OSQ ,Z8-!
=>Q S,3野生型拟南芥 +’50’1’#
73,Z8-# ’!83,Z8-中的融合茎表型
+表 # 显示 ,Z8-幼苗芯片分析结果中极显著
差异表达基因主要参与了以下生物学过程" 对于外
界环境刺激的感应和应答!如氧气压力)温度)红光
等光刺激应答# 对日昼节律的感知和应答# 对水
分)盐及渗透压的应答以及对碳水化合物)无机物)
有机物)金属离子的应答# 对茉莉酸)脱落酸)乙烯
和赤霉素等内源激素应答$ 此外还有部分基因参与
了多糖)淀粉)碳水化合物以及葡聚糖的代谢过程!
差异表达基因大部分参与了对外界及内源刺激感知
和应答$
图 $:野生型及 ,Z8-的总 h*,质量检测)杂交芯片
ZAH3$:+ /OSQ SB
R>A>HO/CRC/FFA>HFAH>=0
-" [=CPBC#,$!,9"花的总 h*,+/S=0h*,/OO0/TBC#
,;!,\"苗的总 h*,+/S=0h*,/OFBBQ0A>H3
图 9:基因芯片数据整合及分析
ZAH39:+SBHC=SA/> =>Q =>=0LFAF/OSBR,3野生型及 ,Z8-芯片数据聚类#73,Z8-芯片数据散点图#’3,Z8-芯片数据变化倍数及数量#83,Z8-中变
化倍数大于 $ 且 Ds%1%# 的数据图$ ,3+ TA0Q?SLEB=>Q ,Z8-# 73&R=SBCHC=E< /O
,Z8-# ’3+HB=>Q =D/I>S/OQAOBCB>S0LBVECBFFBQ HB>BF# 83+ /OSQ
Ds%1%# A> ,Z8-3
;!
林 业 科 学 !" 卷:
表 :<苗的芯片中变化倍数大于 = 的极显著
基因参与的主要生物过程分类
+%7>:#= %)52]^ ;^: ’)(,,53’)C "*6I/N
分类
+BCD
数量
’/I>S
比例
YBCRB>S’e(
D
应答温度刺激
hBFE/>FBS/SBDEBC=SICBFSADI0IF
#; #91; #1\)4%"
应答非生物刺激
hBFE/>FBS/=NA/SARFSADI0IF
$; $$1; !1")4%"
低温应答
hBFE/>FBS/R/0Q
#$ #%1" #1#)4%5
应答渗透胁迫
hBFE/>FBS//FD/SARFSCBFF
## 616 %1%%% ##
盐胁迫应答
hBFE/>FBS/F=0SFSCBFF
#% 6 %1%%% 9
应答糖类刺激
hBFE/>FBS/R=CN/5 \19 %1%%# #
应答无机物刺激
hBFE/>FBS/A>/CH=>ARFINFS=>RB
## 616 %1%%# $
应答镉离子
hBFE/>FBS/R=QDAIDA/>
" 51$ %1%%9
应答有机物刺激
hBFE/>FBS//CH=>ARFINFS=>RB
#\ #!1! %1%%9 #
应答干旱
hBFE/>FBS/T=SBCQBECA2=SA/>
\ ;1! %1%%9 5
应答水胁迫
hBFE/>FBS/T=SBC
\ ;1! %1%%! 应答光刺激
hBFE/>FBS/0AH6 "1# %1%%; 6
应答辐射
hBFE/>FBS/C=QA=SA/>
6 "1# %1%%5 $
应答金属离子
hBFE/>FBS/DBS=0A/>
" 51$ %1%%5 $
应答内源刺激
hBFE/>FBS/B>Q/HB>/IFFSADI0IF
#9 ##15 %1%##
应答激素刺激
hBFE/>FBS/BFSADI0IF
#$ #%1" %1%#5
应答脱落酸刺激
hBFE/>FBS/=NFRAFAR=RAQ FSADI0IF
\ ;1! %1%$应答氧气压
hBFE/>FBS//VAQ=SA2BFSCBFF
\ ;1! %1%$5
=;@<载体构建’转基因植株表型及基因表达分析
在苗芯片结果中挑选了 $ 个表达量变化超过 $
倍及在分生组织中表达的基因’表 $(!并做了进一
步的研究$
根据 ,Z8-中基因表达的变化趋势!运用
K=SBT=L技术分别构建了基因超表达载体以及沉默
表达载体’图 !,! 7(!通过花浸法转化野生型拟南
芥! 其 中 经 Y’h 鉴 定 得 到 了 #" 株 超 表 达
,+#K;\9%% 的转基因植株以及 \% 株基因沉默
,+#K\;!6% 的转基因植株$
表 =<= 个差异表达的基因信息
+%7>=<+B,’)*"&#%1’")"*1B,= C,),(.B"(,)
*&"#1B,C,),.B’$
编号
*/3
变化倍数
Z/0Q?R<=>HB
D 推测的功能
,>>/S=SA/>
,+#K;\9%% ;1\;" %; %1%%% #6
含有 8*,j域并能结合热激蛋
白!在成熟的花药及花发育后
期的花瓣中高表达
J=2B=8*,jQ/D=A>! NA>QA>H
S! <=2B=
A> S =>Q
S,+#K\;!6% 4$1;#6 !6 %1%%# 9#
功能未知的基因!主要在莲座
叶)茎生叶)子叶及茎尖分生组
织中高表达
i>P>/T> HB>B! D=A>0LBVECBFFBQ
A> SB! R/SL0BQ/>
=>Q F,+#K;\9%% 及 ,+#K\;!6% 转基因植株的花器
官几乎与野生型拟南芥无异!但是分别有 \ 株及 ##
株表现出联体茎或丛生茎的表型!并且其真叶萌发
与野生型拟南芥相比明显延后$ 从中挑出茎融合表
型不同强弱的植株!其表型如图 ; 所示" 强烈的融
合茎从主茎下部就出现多条茎相互融合!并且还能
再次分成二级融合茎!形成了一分为二)二分为四的
指数分化模式’图 ;7!K(!这些融合的茎并没有表
现出主次关系# 表型稍弱的植株则在茎中部才能出
现明显的融合茎!且不能形成更高级的融合茎 ’图
;,! Z(# 表型最弱的植株则只在主茎靠近顶端处形
成了不明显的融合茎’图 ; 8(!表型稍弱的植株则
在主茎中部形成了较明显的融合茎’图 ;)($
选取不同强度的融合茎植株以及表型正常的转
基因植株进行基因表达分析!其基因表达情况如图
;(!j所示!由图可知在 ,+#K;\9%% 超表达转基因株
系中!表现出连体茎的植株中 ,+#K;\9%% 基因表达
量比正常茎的要高 $ 倍以上!并且连体程度越高的
表达量越高# 反之!在 ,+#K\;!6% 抑制表达转基因
植株中!连体茎植株的 ,+#K\;!6% 基因表达量比正
常茎的表达量低 9 ‘\ 倍!连体程度越高的植株基因
表达 量 越 低$ 由 此 可 见! 在 拟 南 芥 中 超 表 达
,+#K;\9%% 基因或抑制 ,+#K\;!6% 基因的表达都
能引起融合茎的表型!且表型强弱程度与基因表达
量相一致$
9:讨论及结论
本课题前期在利用拟南芥突变体筛选木材形成
相关基因的研究中得到了伴有多茎融合表型的花异
常株系 ,Z8-$ 本试验运用基因芯片对 ,Z8-进行
了全基因表达谱分析!芯片数据显示表达差异明显
\!
:第 ## 期 蒋:瑶等" 利用基因芯片筛选影响茎分化的相关基因
图 !:超表达载体’,(和 h*,A沉默载体’7(
ZAH3!:+
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图 ;:超表达及沉默表达的转基因植株表型及相应基因的定量分析
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株的基因表达分析#j3,+#K\;!6% 转基因植株的基因表达分析$ ,4’3+FE0=>SF/O/2BCBVECBFFA/>
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的基因主要参与感受外界刺激并作出应答的生物过
程!这些刺激包括温度)光线)水分)盐分胁迫以及内
源激素等!另外还有一些基因参与了多糖)淀粉)碳
水化合物以及葡聚糖的代谢过程$ 推测 ,Z8-突变
表型的形成与多种外部环境及内源刺激有关!植物
在抽薹前感应外界环境及内源刺激因子的刺激并产
生响应信号!整合的生物信号进一步影响顶端分生
组织的分化!最终形成特定的发育模式$ 整个过程
受多条调控途径相互制衡!因此某个’些(途径的改
变会导致异常植株表型$
5!
林 业 科 学 !" 卷:
在 ,Z8-花序中 :DZ 的表达量下降最显著!达
到了约 6\ 倍’lA$+’5B! $%##(!这是导致其产生多级
花序的主要原因!在研究 :DZ 与 8J& 以及 3:& 的相
互作用时也出现了相似的表型 ’ZBCC|>QAX$+’5B!
$%%%($ :DZ 启动子元件预测结果表明!在其启动子
内存在许多受到环境调控的作用元件$ 如水分胁迫
的应答因子# 应答光质)光周期等条件的调控元件#
受到 ,7,)K,以及乙烯诱导的调控因子以及盐胁
迫)金属离子胁迫)糖代谢诱导等应答因子都参与了
:DZ 表达的调控$ ,Z8-抽薹前的幼苗芯片结果显
示 ,Z8-中许多对环境刺激应答的基因表达水平都
发生了改变!因此推测 ,Z8-在幼苗期对外界刺激
产生不同于野生型拟南芥的应激信号!而这些信号
整合后抑制 :DZ 的表达!最终形成了多分枝的
表型$
从芯片中从挑选出 $ 个差异表达基因!其中
,+#K;\9%% 基因的超表达植株以及 ,+#K\;!6% 基
因的抑制表达植株均出现了多茎融合或丛生的表
型!连体茎表型强弱程度与基因表达水平相一致$
其次!在转基因植株萌发真叶时也表现出明显延后!
这说明了 ,+#K;\9%% 以及 ,+#K\;!6% 的异常表达
可能通过影响茎尖分生组织的分化来改变茎的形
态$ 有研究表明在胚胎发育时期形成的茎尖分生组
织以及胚后发育过程形成的腋分生组织决定了茎的
整体形态和结构’8/QFT/CS织分化初期!细胞分化功能受到影响就会造成茎的
分化紊乱’ZA>0=LF/> $+’5B! $%#%(!因此推测这 $ 个
基因在调节茎的分化上有重要的作用$
本研究利用基因芯片对抽薹前 ,Z8-幼苗进行
了基因表达分析!发现了一批显著变化基因均参与
了应答外界刺激的生物过程!其中 ,+#K;\9%% 以及
,+#K\;!6% 两个基因的转基因植株在真叶萌发以
及茎发育上表现出异常!它们很可能通过破坏分生
组织的分化来影响茎的发育和整株的形态$ 因此!
从花异常株系中筛选与组织分化及茎发育相关的新
基因!不仅为发掘花发育与茎发育之间的联系以及
推动研究木本植物同源基因的表达模式和功能打下
基础!也为树木形态建成的研究提供依据$
参 考 文 献
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!责任编辑:徐:红"
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