全 文 :书植物科学学报 2013,31(2):178~185
PlantScienceJournal
DOI:10.3724/SP.J.1142.2013.20178
嗜热藻 BP1中几个蓝细菌光敏色素结构域体内
重组及光化学性质研究
刘冰冰1,陈 煜2,邓明刚3,赵开弘3,周 明3
(1.华中农业大学生命科学技术学院,武汉430070;2.华中科技大学环境科学与工程学院,武汉 430074;
3.华中农业大学农业微生物学国家重点实验室,武汉430070)
摘 要:通过蛋白质序列同源性比对分析,在嗜热藻(ThermosynechococcuselongatusBP1)里面找到了与已知
的Pb/Pg型蓝细菌光敏色素TePixJ和TeTlr0924同源的3个基因tlr0911、tlr1215和tlr1999。通过分子克隆技术
把它们的GAF结构域分别构建在 pET30a(+)表达载体上,与可生成藻蓝胆素(PCB)的质粒 pACYCDuetho1
pcyA在大肠杆菌BL21(DE3)体内重组,生成重组蛋白,利用亲和层析柱分离纯化,纯化后的蛋白质经过锌荧光和
蛋白质酸性尿素变性以及荧光光谱和吸收光谱等实验分析鉴定,结果表明,Tlr0911GAF存在蓝光吸收态 Pb406nm
和绿光吸收态Pg527nm之间的可逆光转换,它可共价结合两种藻胆色素,即藻紫胆素(PVB)和藻蓝胆素(PCB),
Tlr1999GAF则存在蓝光吸收态 Pb417nm和青光吸收态 Pt496nm之间的可逆光转换,它同样共价结合 PVB和 PCB,
而Tlr1215GAF1和Tlr1215GAF2不能自发结合藻胆色素,不具有光活性。
关键词:蓝细菌光敏色素;可逆光转换;体内重组
中图分类号:Q71 文献标识码:A 文章编号:20950837(2013)02017808
ReconstitutioninvivoandPhotochemicalPropertiesofSeveral
CyanobacteriochromeDomainsfromThermosynechococcus
elongatusBP1
LIUBingBing1,CHENYu2,DENGMingGang3,ZHAOKaiHong3,ZHOUMing3
(1.ColegeofLifeScienceandTechnology,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan430070,China;2.Colegeof
EnvironmentScienceandEngineering,HuazhongUniversityofScienceandTechnology,Wuhan430074,China;
3.StateKeyLaboratoryofAgriculturalMicrobiology,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan 430070,China)
Abstract:ByproteinsequencehomologycomparisonwiththePb/Pgtypecyanobacterio
chromeTePixJandTeTlr0924,threehomologousgenestlr0911,tlr1215andtlr1999from
ThermosynechococcuselongatusBP1werefound.Bymolecularcloningtechniques,theGAF
domainsofthosegeneswereclonedintoexpressionvectorpET30a(+),respectively.TheE.
colistrainBL21(DE3)harboringtheexpressionplasmidandthepACYCDuetho1pcyAplas
midforphycocyanobilin(PCB)wereinducedtogeneraterecombinantproteins.Theex
pressedproteins(His)6taggedattheNterminuswerepurifiedwithnickelafinityHisTrap
chelatingcolumn.Thepurifiedproteinswereidentifiedwithzincinducedfluorescence,acidic
ureadenaturation,fluorescenceandabsorptionspectrum.ResultsshowedthatTlr0911GAF
containedtwocovalentlyboundbilinchromophores,phycoviolobilin(PVB)andphycocyano
bilin(PCB),andexhibitedreversiblephotoconversionbetweenablueabsorbingform at
406nm(Pb406nm)andagreenabsorbingformat527nm(Pg527nm).Tlr1999GAFwasalso
covalentlyboundwithPVBandPCB,andreversiblephotoconversionexistedbetweenablue
收稿日期:20120706,修回日期:20121119。
基金项目:国家自然科学基金资助项目(21072068;31110103912)。
作者简介:刘冰冰(1987-),女,河南三门峡人,硕士研究生,主要从事蓝细菌光合作用和蛋白质工程研究。
通讯作者(Authorforcorespondence.Email:zhouming321@126.com)。
absorbingformat417nm(Pb417nm)andatealabsorbingformat496nm(Pt496nm).Neither
Tlr1215GAF1norTlr1215GAF2couldbespontaneouslyboundwithbilinchromophore.
Keywords:Cyanobacteriochrome;Reversiblephotoconversion;AssemblyinEscherichiacoli
植物光敏色素是一种光感受器,它是一种含有
线性四吡咯生色团的水溶性蛋白质,存在两种不同
的形态:红光吸收形态(Pr)和远红光吸收形态
(Pfr)[1]。植物光敏色素的这两种光形态可以发生
可逆光转换,它调节植物体内一系列的生理反
应[2]。在细菌中也发现了与植物光敏色素相似的
蛋白质[3]。
近年来更多的植物光敏色素的远缘族群已经被
分离出来,蓝细菌光敏色素是一类最近被鉴定可以
感受多种不同波长光线的光受体家族,它只存在于
蓝细菌内[4]。植物光敏色素 N末端的光受体组件
包括PAS(per/ARNT/sim)结构域,GAF(cGMP磷
酸二酯酶/腺苷酸环化酶/FhlA蛋白)结构域和PHY
(光敏色素亚结构域)结构域[5]。而蓝细菌光敏色
素特殊光响应的发生只需要与植物光敏色素近缘的
GAF结构域[6]。
蓝细菌光敏色素存在相当多变的光谱特性,它
们的光谱变化几乎覆盖了近紫外和可见光区[4]。
在体外,第一个被发现具有蓝光吸收态(Pb)和绿光
吸收态(Pg)之间的可逆光转换的蓝细菌光敏色素是
SyPixJ1,它是一个蓝光趋化调节子,随后Pb/Pg型
的蓝细菌光敏色素开始被集中研究,例如 SyPixJ1、
TePixJ和TeTlr0924的研究[6-9]。这3种蛋白显示
出一个新奇的处在 Pb态(蓝光吸收峰在 425~
435nm)和Pg态(绿光吸收峰在531~535nm)之间
的可逆光转换。同时蓝细菌光敏色素也可能涉及到
昼夜节律和细胞聚集的光感应重新组合[10]。
本实验主要集中研究嗜热的嗜热藻(Thermo
synechococcuselongatusBP1),通过和已知的
Pb/Pg型蓝细菌光敏色素 TePixJ和 TeTlr0924进
行同源比对,找出了和它们具有同源性的两个可能
的蓝细菌光敏色素 Tlr0911和 Tlr1999,而 Tlr1215
和这两个可能的蓝细菌光敏色素具有同源性。因此
取这3个基因的GAF结构域在体外构建质粒,与可
生成藻蓝胆素(PCB)的质粒 pACYCDuetho1
pcyA在大肠杆菌体内重组,生成重组蛋白,然后通
过荧光发射光谱、吸收光谱、SDSPAGE等方法,对
重组蛋白的光化学特性和生物学特性进行分析鉴
定。蓝细菌光敏色素的研究对了解光敏色素及光敏
色素类似蛋白的进化关系有着重要的意义。
1 材料和方法
1.1 材料与试剂
大肠杆菌(Escherichiacoli)菌株 BL21(DE3)
为本实验室保存;表达载体 pET30a(+)、pACYC
Duet1购自Novagen公司;重组质粒pACYCDuet
ho1pcyA由本实验室构建保存;DNA回收试剂盒、
T4DNA连接酶和限制性内切酶 BamHⅠ、EcoRⅠ、
HindⅢ、SalⅠ为 MBI公司产品。Taq酶为 Biostar
公司产品;IPTG是 SIGMA公司产品;亲和层析介
质购自 AmershamPhamaci公司。嗜热藻(Ther
mosynechococcuselongatusBP1)由中国科学院
化学研究所赵井泉老师赠予。引物合成以及测序由
南京金斯瑞生物科技有限公司完成。
1.2 结构域分析
通过 SMART(htp:/smart.emblheidelberg.
de/)确定 Tlr0911、Tlr1215和 Tlr1999这3个假定
的蓝细菌光敏色素的结构域构成[11]。运用 Clustal
X183软件对它们和 TePixJ、TeTlr0924的同源性
进行比对分析。
1.3 引物设计和合成
以嗜热藻(T.elongatusBP1)基因组 DNA序
列为模板,设计克隆引物(见表1)。在上下游引物的
表1 本实验中设计的引物
Table1 Primersdesignedinthisstudy
tlr0911GAF P3:5′TCTGGATCCACTCAAGCTGAACTC3′
P4:5′ATAGTCGACTTATTCCTGATGTAGCGC3′
tlr1215GAF1P5:5′CCCGAATTCAACTGTGAGGAGATTTTG3′
P6:5′CGCGTCGACCTAACTTTCCACAACTAG3′
tlr1215GAF2P7:5′CAAGGATCCCGCATTCGCCAAACCCTG3′
P8:5′CGCAAGCTTCTAGATCGCCACCTGAGTCGC3′
tlr1999GAF P9:5′CCCGAATTCCTCACTCCTAACCTGCTG3′
P10:5′CGCGTCGACTTAATTGGGTAAATGGGT3′
注:表中带下划线的碱基序列为添加的限制性内切酶的酶切位点。
Note:Introducedendonucleasesitesareunderlined.
971 第2期 刘冰冰等:嗜热藻BP1中几个蓝细菌光敏色素结构域体内重组及光化学性质研究
5′端分别引入不同的限制性内切酶位点以及3个保
护碱基。
1.4 质粒的克隆和重组菌株的构建
来源于嗜热藻(T.elongatusBP1)的基因组总
DNA作为模板,用表1中相应的引物分别采用降落
PCR扩增出目的片段,然后将合成片段直接连接到
表达载体pET30a(+),转化到大肠杆菌 BL21感受
态细胞,在含有卡那霉素的平板上筛选阳性克隆子。
根据质粒酶切图谱初步确定阳性克隆子后,将初步
鉴定正确的菌种进行测序。
质粒 pACYCDuetho1pcyA中的两个基因的
表达产物为血红素氧化酶和胆绿素还原酶,在这两
种酶的作用下,大肠杆菌体内的血红素被逐步催化
生成PCB。
将表达载体 pETtlr0911GAF、pETtlr1215
GAF1、pETtlr1215GAF2和 pETtlr1999GAF分
别与可以产生 PCB的质粒 pACYCDuetho1pcyA
共同转化到大肠杆菌 BL21感受态细胞,用含有卡
那霉素和氯霉素的平板筛选重组菌株。
1.5 在大肠杆菌中蛋白质的表达和提纯
表达载体pET30a(+)的T7启动子下游含有6
个组氨酸的密码子,由此构建的质粒在大肠杆菌中
诱导表达得到的外源融合蛋白 N端都带有 Histag
标签,故可采用镍离子亲和层析法进行提纯。
将重组菌株接种在含有20μg/mL卡那霉素和
20μg/mL氯霉素的300mLLB培养基中,37℃培
养至OD600nm =05~06,置于冰水混合物里冰浴
30~60min,加入终浓度为1mmol/L的 IPTG,摇
床转速设置为150r/min,在黑暗条件下20℃诱导
表达12h。离心5min(6500r/min,4℃)收集细
胞,蒸馏水洗涤细胞2次,尽可能洗去残留的培养
液,然后用5mLStartBufer缓冲液(500mmol/L
NaCl,20mmol/L磷酸钾缓冲液,pH72)重悬细胞,
用超声波细胞破碎仪超声破碎100次(功率200W),
细胞匀浆离心30min(10000r/min,4℃)得到澄净
的上清液。将重组蛋白上清液加入镍离子亲和层析
柱,先用3倍柱体积的 StartBufer平衡层析柱,然
后采用含50mmol/L咪唑的Bufer洗脱杂蛋白,最
后收集重组蛋白采用含500mmol/L咪唑的Bufer。
提纯产物用透析液(50mmol/L磷酸钾缓冲液,
500mmol/LNaCl,pH72)透析过夜,以去除咪
唑,消除咪唑对重组蛋白的影响。
1.6 重组蛋白SDSPAGE和锌荧光实验
从提纯的蛋白质溶液中取出20
!
L,按照1∶1
的比例向蛋白质样品中加入上样缓冲液和巯基乙醇
(9∶1),混合均匀后,置100℃沸水中煮沸10min,
制成聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDSPAGE)蛋白质样
品。电泳前,要先将样品离心30min(9000r/min,
4℃),弃沉淀取上清液,用12%的分离胶进行SDS
PAGE。因要做锌荧光实验,将蛋白胶置于15mol/
L醋酸锌溶液里至被浸末,室温黑暗中染色5min
后,用 Biorad电泳凝胶成像系统分析并照相。醋
酸锌染色完成之后改用考马斯亮蓝 R250染色,脱
色完全后用凝胶成像系统分析并照相。
1.7 光谱分析
采用DU800紫外可见光谱仪测取吸收光谱,
狭缝宽度为10nm,扫描速度为800nm/min,扫
描范围是 200~800nm。荧光光谱采用 Perkin
ElmerLS55型荧光光谱仪测定,狭缝宽度为
100nm,扫描速度为 1000nm/min,扫描范围是
300~800nm。
在蓝光照射时,是来自卤素灯的光线透过一个
λmax=420nm、半带宽 =75nm的干涉滤光器。
在青光照射时,是来自卤素灯的光线透过一个λmax=
510nm、半带宽=75nm的干涉滤光器。在绿光照
射时,是来自卤素灯的光线透过一个λmax=560nm、
半带宽=75nm的干涉滤光器。在红光照射时,
是来自卤素灯的光线透过一个 >610nm的截止型
滤光器。
1.8 重组蛋白变性实验
为了确定重组蛋白结合藻胆色素的种类,需要
进行酸性尿素(8mol/L,pH20)变性实验。在变
性条件下,脱辅基蛋白和藻胆色素的结合松散,藻胆
色素基本上呈游离状态,重组蛋白的吸收光谱和游
离藻胆色素的吸收光谱很相似,可以从其吸收特征
峰的位置确定藻胆色素的种类。通常情况下,取
400
!
L透析蛋白样品,加入036g尿素和32
!
L
的浓盐酸,充分混匀后,黑暗中4℃反应30min,离
心30min(9000r/min,4℃),取上清液测其吸收
光谱。
2 结果与分析
2.1 蓝细菌光敏色素结构域分析
根据 SMART模块分析结构域可知(见图1),
081 植 物 科 学 学 报 第31卷
Tlr0911和 Tlr1999均包括 1个蓝细菌光敏色素
GAF结构域,而 Tlr1215含有2个 GAF结构域,将
氨基酸序列为 28~180位的 GAF结构域命名为
Tlr1215GAF1,而将氨基酸序列为 323~470位的
GAF结构域命名为 Tlr1215GAF2。GAF结构域作
为蓝细菌光敏色素的感光区域,其它的信号传导结
构域包括EAL结构域、GGDEF结构域、组氨酸激酶
(HisKA+HATPAse_c)结构域。
通过将 Tlr0911、Tlr1215和 Tlr1999的 GAF结
构域的氨基酸序列与已经发现的蓝细菌光敏色素
TePixJ和 TeTlr0924的氨基酸序列比对,发现
Tlr0911和Tlr1999的GAF结构域均包括1个保守
的[D/E]XCF模块和CH残基。
Tlr0911
Tlr1215
Tlr1999
GAF GGDEF EAL HisKA
HATPase_c
100 residue
图1 根据SMART模块分析得到的Tlr0911、Tlr1215和
Tlr1999的结构域组成
Fig.1 DomainarchitectureofTlr0911,Tlr1215and
Tlr1999obtainedaccordingtomotif
analysisbySMART
2.2 克隆质粒构建和重组菌株表达的鉴定
参照13和14中实验方法构建得到的质粒
用设计引物时引入的限制性内切酶做双切检测,
质粒 pETtlr0911GAF、pETtlr1215GAF1、pET
tlr1215GAF2和 pETtlr1999GAF酶切后得到的
片段理论大小依次为513、435、426、669bp,根
据质粒酶切图谱初步确定阳性克隆子,选定测序
正确的菌株。然后参照14、15和16中的实验
方法,将重组菌株表达后,取1mL细胞制取蛋白质
样品,用SDSPAGE分离检测,从考马斯亮蓝 R250
染色的结果可以直观地看到目的蛋白的表达。脱辅
基蛋白 Tlr0911GAF、Tlr1215GAF1、Tlr1215GAF2
和 Tlr1999GAF的 大 小 分 别 为 2485、2202、
2179、3158kD,聚丙烯酰胺凝胶电泳条带大小与
预期符合(图2)。
2.3 重组蛋白的吸收光谱和荧光光谱分析
参照1.5中的实验方法,得到在大肠杆菌体内
诱导表达的重组蛋白。通过吸收光谱和荧光光谱检
1 2 3 4 M
66
45
36
29
24
19
kD
1.Tlr0911GAF细胞样品;2.Tlr1999GAF细胞样品;
3.Tlr1215GAF1细胞样品;4.Tlr1215GAF2细胞样品;M.
蛋白质标准分子量。
1.Tlr0911GAFexpressedinE.coli;2.Tlr1999GAFex
pressedinE.coli;3.Tlr1215GAF1expressedinE.coli;
4.Tlr1215GAF2expressedinE.coli;M.Markerproteins.
图2 细胞中重组蛋白的考马斯亮蓝染色电泳图
Fig.2 SDSPAGEstainedwithCoomassieblue
ofrecombinantproteinsfromcel
测各体内重组体系得到的重组蛋白,由其光谱特征
可判断重组蛋白的光学活性以及偶联色素的种
类等。
Tlr0911GAF从大肠杆菌细胞中提纯后,得到
可溶的均质的蛋白质溶液。纯化的Tlr0911GAF在
蓝光的照射下,它的吸收光谱有2个明显的吸收峰
(见图3:A1),其最大吸收峰分别位于406nm和
527nm,这个光吸收状态被命名为 Pg527nm;当
Pg527nm被绿光照射后,最大吸收峰位于406nm处
的吸收峰值上升,而527nm处的吸收峰几乎消失,
这个光吸收状态被命名为 Pb406nm。在这2个光吸
收状态的吸收光谱中,在592nm处有1个小的吸
收峰,它不受光照的影响。在Pb/Pg型的蓝细菌光
敏色素 TePixJ和 TeTlr0924的吸收光谱中也检测
到1个光钝化峰。在 Pg527nm转换为 Pb406nm时,它
的吸收光谱在 406nm处吸收值上升至最高,在
521nm处吸收值下降至最低(见图3:A2中吸收
差减光谱)。Pg527nm共有2个荧光发射峰,其最大
荧光发射峰值分别位于572nm和648nm;Pb406nm
共有 2个荧光发射峰,它有 1个位于 572nm和
633nm的双荧光发射峰,此位置荧光发射峰的高
低随着吸收峰的高低变化而变化,而它位于648nm
的荧光发射峰与 Pg527nm的荧光发射峰高低几乎一
致(见图3:A3中荧光发射光谱)。因此得出结论:
181 第2期 刘冰冰等:嗜热藻BP1中几个蓝细菌光敏色素结构域体内重组及光化学性质研究
0 3.
0 2.
0 1.
0 0.
A
b
s
o
r
p
t
i
o
n
300 400 500 600 700 800
Wavelength (nm)
406 nm
527 nm
592 nm
Pg
527 nm
Pb
406 nm
A-1
B-2
0 3.
0 2.
0 1.
0 0.
A
b
s
o
r
p
t
i
o
n
300 400 500 600 700 800
Wavelength (nm)
417 nm
415 nm
496 nm
612 nm
Pt
496 nm
Pb
417nm
B-1
Pb -minus-Pt
417 n 96 nm
m
4
0 16.
0 08.
0 00.
-0 16.
A
b
s
o
r
p
t
i
o
n
300 400 500 600 700 800
Wavelength (nm)
-0 08.
417 nm
496 nm
90
60
30
0
F
l
u
o
r
e
s
c
e
n
c
e
500 600 700 800
Wavelength (nm)
563 nm
644 nm
Pt
496 nm
Pb
417 nm
Pt
496 nm
Pb
417 nm
180
120
60
0
F
l
u
o
r
e
s
c
e
n
c
e
Wavelength (nm)
Pg
527 nm
Pb
406 nm
Pg
527 nm
Pb
406 nm
648 nm
572 nm
A-3
500 600 700 800
B-3
A
b
s
o
r
p
t
i
o
n
300 400 500 600 700 800
Wavelength (nm)
0 03.
0 00.
-0 03.
-0 06.
0 06.
521 nm
A-2
633 nm
Pb -minus-Pg
406 n nm
m
527
406 nm
A1:Tlr0911GAF的吸收光谱;A2:Tlr0911GAF的Pb406nm差减Pg527nm的吸收差减光谱;A3:Tlr0911GAF的荧光发射
光谱;B1:Tlr1999GAF的吸收光谱;B2:Tlr1999GAF的Pb417nm差减Pt496nm的吸收差减光谱;B3:Tlr1999GAF的荧光
发射光谱。
A1:AbsorptionspectraofPg527nmandPb406nmofTlr0911GAF;A2:DiferenceabsorptionspectrumofPb406nmminus
Pg527nm ofTlr0911GAF;A3:FluorescenceemissionspectraofPg527nm andPb406nm ofTlr0911GAF;B1:Absorption
spectraofPt496nmandPb417nmofTlr1999GAF;B2:DiferenceabsorptionspectrumofPb417nmminusPt496nmofTlr1999
GAF;B3:FluorescenceemissionspectraofPt496nm andPb417nm ofTlr1999GAF.
图3 Tlr0911GAF和Tlr1999GAF的吸收光谱和荧光发射光谱
Fig.3 AbsorptionandfluorescenceemissionspectraofTlr0911GAFandTlr1999GAF
527nm处的吸收峰产生572nm处的荧光发射峰,
而648nm处的荧光发射峰是由不受光照影响的
592nm处的吸收峰产生的。光转换在绿光吸收状
态Pg527nm和蓝光吸收状态 Pb406nm之间是可逆的。
相比其它已知的 Pb型蓝细菌光敏色素,Pb406nm的
吸收峰蓝移了20nm左右。
Tlr1999GAF的吸收光谱和荧光发射光谱与
Tlr0911GAF的光谱性质大致上是一致的(见图3:
B1、B2和B3)。在蓝光照射后,它的吸收光谱有
2个明显的吸收峰,其最大吸收峰分别位于415nm
和496nm,这个光吸收状态被命名为 Pt496nm;当
Pt496nm被绿光照射后,最大吸收峰位于417nm处
的吸收峰值上升,相比 Pt496nm的对应吸收峰红移了
2nm,而496nm处的吸收峰几乎消失,这个光吸收
状态被命名为 Pb417nm。类似于 Tlr0911GAF在
592nm有1个光钝化峰,Tlr1999GAF的2个光吸
收状态的吸收光谱中,在612nm处有1个小的吸
收峰,它同样不受光照的影响。在 Pt496nm转换为
Pb417nm时,它的吸收光谱在417nm处吸收值上升
至最高,在496nm处吸收值下降至最低(见图3:
B2中吸收差减光谱)。Pt496nm共有2个荧光发射
峰,其最大荧光发射峰值位于563nm和644nm;
Pb417nm共有2个荧光发射峰,它位于563nm的荧
光发射峰的高低随着吸收峰的高低变化,而它位于
644nm的荧光发射峰与 Pt496nm的荧光发射峰的高
低基本上是一致的(见图3:B3中荧光发射光谱)。
根据以上 Tlr1999GAF的光谱性质得出结论:
496nm处的吸收峰产生563nm处的荧光发射峰,
而644nm处的荧光发射峰是由不受光照影响的
612nm 处的吸收峰产生的。在青光吸收状态
Pt496nm和蓝光吸收状态 Pb417nm之间存在可逆的光
转换。值得注意的是,Pt496nm的吸收峰是目前所有
已经发现的蓝细菌光敏色素里峰形最尖锐的,并且
它的吸收峰相比其它已知的 Pg型的蓝细菌光敏色
素蓝移了约30nm。
从图 4可以看出,Tlr1215GAF1和 Tlr1215
GAF2的吸收光谱没有特征性的吸收峰,它们不能
自发和藻胆色素结合。
281 植 物 科 学 学 报 第31卷
0 12.
0 08.
0 00.
A
b
s
o
r
p
t
i
o
n
300 400 500 600 700 800
Wavelength (nm)
0 04.
Tlr1215-GAF1
A
0 12.
0 08.
0 00.
A
b
s
o
r
p
t
i
o
n
300 400 500 600 700 800
Wavelength (nm)
0 04.
B
Tlr1215-GAF2
A:Tlr1215GAF1的吸收光谱;B:Tlr1215GAF2的吸收光谱。
A:AbsorptionspectrumofTlr1215GAF1;B:AbsorptionspectrumofTlr1215GAF2.
图4 Tlr1215GAF1和Tlr1215GAF2的吸收光谱
Fig.4 AbsorptionspectraofTlr1215GAF1andTlr1215GAF2
2.4 重组蛋白变性实验结果
参照18中的实验方法,将上述有光活性的蓝
细菌光敏色素Tlr0911GAF和Tlr1999GAF不同的
光吸收状态分别做酸性尿素变性实验。
酸性尿素变性的绿光吸收状态 Pg527nm吸收光
谱有2个吸收峰位于560nm和655nm,因为光照
射后重组蛋白Tlr0911GAF的蛋白质结构发生了改
变,导致与它连接的藻胆色素的空间构象发生了扭
曲,在变性条件下,藻胆色素呈现游离状态,但是扭
曲的构象无法恢复到天然构象,导致吸收峰出现异
常(见图5:A1,A2)。经绿光照射后,它的吸收特
征峰则恢复到 597nm 和 661nm,因此可知
Pg527nm中共结合了两种不同的藻胆色素,即藻紫胆
素PVB和藻蓝胆素 PCB。酸性尿素变性的蓝光吸
收状态 Pb406nm吸收光谱的吸收特征峰和游离的
PVB及PCB的吸收光谱是吻合的。根据上述的光
谱特征可以准确地得知,Tlr0911GAF共价的结合
着PVB和 PCB,且它的构型在 Pg527nm是包含着
C15E的藻胆色素,在 Pb406nm是包含着 C15Z的
藻胆色素,这与之前所发现的Pb/Pg型蓝细菌光敏
色素TePixJ是一样的。
Tlr1999GAF同 Tlr0911GAF一样,也共价结
合着PVB和 PCB(见图5:B1,B2),并且它们的
空间构型也是一致的,青光吸收状态 Pt496nm是包含
着C15E的藻胆色素,蓝光吸收状态 Pb417nm是包
含着C15Z的藻胆色素。
Tlr0911GAF和Tlr1999GAF的变性吸收光谱
特征,解释了Pg527nm和Pb406nm与Pt496nm和Pb417nm
之间的可逆光转换现象是由光驱动而引起与脱辅基
蛋白共价结合藻胆色素的 C15/16双键的 Z/E异
构造成的。
2.5 重组蛋白的SDSPAGE和锌荧光实验结果
参照16中的实验方法,在聚丙烯酰胺凝胶电
泳后,通过醋酸锌染色和考马斯亮蓝 R250染色,可
检测到目的蛋白的表达(见图6)。藻胆色素可与
Zn2+形成螯合物,在一定波长光激发下可发射荧光。
通过重组蛋白的锌荧光实验,可以发现在紫外光照
射下,电泳条带中重组蛋白发出荧光,这证明在体内
重组过程中脱辅基蛋白和藻胆色素是共价偶联的,
这和酸性尿素变性实验的结果是吻合的。
3 讨论
在本实验中,从嗜热藻(T.elongatusBP1)中
共找到3个基因,通过结构域分析推测,它们可能是
蓝细菌光敏色素。通过实验验证,Tlr0911GAF存
在蓝光吸收态Pb406nm和绿光吸收态Pg527nm之间的
可逆光转换,它可共价结合2种藻胆色素 PVB和
PCB,Tlr1999GAF则存在蓝光吸收态 Pb417nm和青
光吸收态Pt496nm之间的可逆光转换,它同样共价结
合 PVB和 PCB。而 Tlr1215GAF1和 Tlr1215
GAF2不能自发结合藻胆色素,不具有光活性。
令人惊奇的是,本实验还发现了2个新型的蓝
细菌光敏色素 Tlr0911GAF和 Tlr1999GAF,相比
其它已知的Pb型蓝细菌光敏色素,Pb406nm的吸收
峰蓝移了20nm左右,Pt496nm的吸收峰是所有已经
发现的蓝细菌光敏色素里峰形最尖锐的,并且它的
吸收峰相比其它已知的Pg型的蓝细菌光敏色素蓝
移了约30nm。它们进一步扩大了蓝细菌光敏色素
多变的光谱特性,提供了一个关于蓝细菌光敏色素
的光化学性质的新认识。
381 第2期 刘冰冰等:嗜热藻BP1中几个蓝细菌光敏色素结构域体内重组及光化学性质研究
0 24.
0 16.
0 00.
A
b
s
o
r
p
t
i
o
n
300 400 500 600 700 800
Wavelength (nm)
0 08.
A-1
0 24.
0 16.
0 00.
A
b
s
o
r
p
t
i
o
n
300 400 500 600 700 800
Wavelength (nm)
0 08.
Dark form
Illuminated form
Dark form
A-2
0 27.
0 18.
0 00.
A
b
s
o
r
p
t
i
o
n
300 400 500 600 700 800
Wavelength (nm)
0 09.
B-1
0 27.
0 18.
0 00.
A
b
s
o
r
p
t
i
o
n
300 400 500 600 700 800
Wavelength (nm)
0 09.
Dark form
Illuminated form
Dark form
B-2
A1:变性的 Tlr0911GAF的 Pg527nm的吸收光谱;A2:变性的 Tlr0911GAF的 Pb406nm的吸收光谱;B1:变性的
Tlr1999GAF的Pt496nm的吸收光谱;B2:变性的Tlr1999GAF的Pb417nm的吸收光谱。
A1:AbsorptionspectraofdenaturedPg527nm ofTlr0911GAF;A2:Absorptionspectrum ofdenaturedPb406nm of
Tlr0911GAF;B1:AbsorptionspectraofdenaturedPt496nm ofTlr1999GAF;B2:Absorptionspectrumofdenatured
Pb417nm ofTlr1999GAF.
图5 变性的Tlr0911GAF和Tlr1999GAF的吸收光谱
Fig.5 AbsorptionspectraofdenaturedTlr0911GAFandTlr1999GAF
M 1 2 M 1 2
a b
24
29
66
36
kD
1.Tlr0911GAF的锌荧光(b)和考马斯亮蓝(a)染色凝胶电泳图;
2.Tlr1999GAF的锌荧光(b)和考马斯亮蓝(a)染色凝胶电泳图;
M.蛋白质标准分子量。
1.SDSPAGEstainedwithzincinducedfluorescence(b)and
Coomassieblue(a)ofTlr0911GAF;2.SDSPAGEstainedwith
zincinducedfluorescence(b)andCoomassieblue(a)of
Tlr1999GAF;M:Proteinmarkers.
图6 Tlr0911GAF和Tlr1999GAF的锌荧光和
考马斯亮蓝染色凝胶电泳图
Fig.6 SDSPAGEstainedwithzincinduced
fluorescenceandCoomassieblueof
Tlr0911GAFandTlr1999GAF
蓝细菌光敏色素作为脱辅基蛋白在大肠杆菌体
内与作为辅基的藻胆色素共表达生成重组蛋白,在
这个实验中加入的是可以生成藻蓝胆素 PCB的质
粒 pACYCDuetho1pcyA,但是 Tlr0911GAF和
Tlr1999GAF所结合的辅基色素均有2种,即藻紫
胆素PVB和藻蓝胆素PCB,而PVB是PCB的同分
异构体。
到目前为止,PVB只在一些丝状蓝藻的藻红蛋
白的 α亚基中出现过,未曾发现 PVB的生物合成
酶。Mastigocladuslaminosus中的 PecE/F蛋白
可以在藻红蛋白的 α亚基与 PCB体外重组时将
PCB异构为 PVB[12-14]。如文献9中报道,Ikeuchi
等将TePixJ的GAF结构域与 PCB在大肠杆菌体
内共表达,最后得到的重组蛋白所结合的色素是
PCB与 PVB的混合体。将 TePixJ的 GAF结构域
单独表达,与单独表达得到的PCB进行体外重组实
验,可以很清楚地看到 PCB与 GAF结构域的共价
偶联在几分钟之内完成,结合在 GAF结构域上的
PCB再缓慢地异构为 PVB。该实验表明 TePixJ的
GAF结构域具有3个功能:自催化裂合酶、自催化
异构酶、光致异构化,但是这些功能的实现还需要蓝
细菌中其他因子的辅助。由此可以得知,Tlr0911和
Tlr1999的GAF结构域可能也具有这3个功能。
根据之前的相关报道所知,GAF结构域内保守
的半胱氨酸 Cys通过硫醚键共价结合藻胆色素发
色团,这个保守的 Cys称之为色素结合位点,而对
481 植 物 科 学 学 报 第31卷
于Pb/Pg型可逆光转换的蓝细菌光敏色素中位于
[D/E]XCF模块中的 Cys的具体作用机理还没有
被明确阐明,关于Cys的作用目前有两个相反的模
型,光可逆结合模型和稳定双键模型。在接下来的
实验中,主要致力于这两个Pb/Pg型蓝细菌光敏色
素中Cys的具体机理的研究。
在植物光敏色素的研究中,比较困难的问题在
于缺少简单的光敏色素模型,同时还必须考虑到植
物体内各种光敏色素及其它光受体的相互作用。与
植物光敏色素相比,蓝细菌光敏色素的分子结构更
加简单,制备也更为方便,是深入研究光敏色素对植
物发育调控的理想材料。
参考文献:
[1] RockwelN C,SuYS,LagariasJC.Phyto
chromestructureandsignalingmechanisms[J].
AnnuRevPlantBiol,2006,57:837-858.
[2] QuailPH.Phytochromephotosensorysignaling
networks[J].NatRevMolCelBiol,2002,3:
85-93.
[3] RockwelNC,LagariasJC.Abriefhistoryof
phytochromes[J].Chemphyschem,2010,11:
1172-1180.
[4] IkeuchiM,IshizukaT.Cyanobacteriochromes:a
new superfamilyoftetrapyrolebindingphotore
ceptorsincyanobacteria[J].PhotochemPhoto
biolSci,2008,7:1159-1167.
[5] HughesJ.Phytochromethreedimensionalstruc
turesandfunctions[J].Biochem SocTrans,
2010,38:710-716.
[6] RockwelNC,NjugunaSL,RobertsL,Castilo
E,ParsonVL,DwojakS,LagariasJC,SpilerS
C.AsecondconservedGAFdomaincysteineis
requiredfortheblue/greenphotoreversibilityofcy
anobacteriochromeTlr0924from Thermosynecho
coccuselongates[J].Biochemistry,2008,47:
7304-7316.
[7] YoshiharaS,ShimadaT,MatsuokaD,ZikiharaK,
KohchiT,TokutomiS.Reconstitutionofblue
greenreversiblephotoconversionofacyanobacte
rialphotoreceptor,PixJ1,inphycocyanobilinpro
ducingEscherichiacoli[J].Biochemistry,2006,
45:3775-3784.
[8] IshizukaT,NarikawaR,KohchiT,KatayamaM,
IkeuchiM.CyanobacteriochromeTePixJofTher
mosynechococcuselongatusharborsphycoviolo
bilinasachromophore[J].PlantCelPhysiol,
2007,48:1385-1390.
[9] IshizukaT,ShimadaT,OkajimaK,YoshiharaS,
OchiaiY,KatayamaM,IkeuchiM.Characteriza
tionofcyanobacteriochromeTePixJfrom ather
mophilic cyanobacterium Thermosynechococcus
elongatusstrainBP1[J].PlantCelPhysiol,
2006,47:1251-1261.
[10] SchmitzO,KatayamaM,WiliamsSB,KondoT,
GoldenSS.CikA,abacteriophytochromethatre
setsthecyanobacterialcircadianclock[J].Sci
ence,2000,289:765-768.
[11] LetunicI,CopleyRR,PilsB,PinkertS,Schultz
J,BorkP.SMART5:domainsinthecontextof
genomesandnetworks[J].NucleicAcidsRes,
2006,34:257-260.
[12] StorfM,ParbelA,MeyerM,Strohmann B,
ScheerH,DengMG,ZhengM,ZhouM,ZhaoK
H. Chromophore atachment to biliproteins:
specicityofPecE/PecF,alyaseisomerasefor
thephotoactive3(1)cysalpha84phycoviolobilin
chromophoreofphycoerythrocyanin[J].Bioche
mistry,2001,40:12444-12456.
[13] ZhaoKH,WuD,ZhouM,ZhangL,Bohm S,
BubenzerC,ScheerH.Aminoacidresiduesas
sociatedwithenzymaticactivitiesoftheisomer
izingphycoviolobilinlyasePecE/F[J].Biochemis
try,2005,44:8126-8137.
[14] BohmS,EndresS,ScheerH,ZhaoKH.Bilipro
tein chromophore atachment: chaperonelike
functionofthePecEsubunitofalphaphycoeryth
rocyaninlyase[J].JBiolChem,2007,282:
25357-25366.
(责任编辑:王豫鄂)
581 第2期 刘冰冰等:嗜热藻BP1中几个蓝细菌光敏色素结构域体内重组及光化学性质研究