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Establishment of 20 Sorghum Hybrids Fingerprints Using SSR Fluorescent Marker

利用SSR荧光标记构建20个高粱品种指纹图谱



全 文 :作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2015, 41(4): 658665 http://zwxb.chinacrops.org/
ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9 E-mail: xbzw@chinajournal.net.cn

本研究由国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-06-01-01)和酿造专用高粱育种及利用山西省科技创新重点团队(2014131015)项
目资助。
* 通讯作者(Corresponding author): 张福耀, E-mail: zfy5607@163.com, Tel: 13835425607
第一作者联系方式: E-mail: wangrui989@163.com, Tel: 13834864933
Received(收稿日期): 2014-10-08; Accepted(接受日期): 2015-02-06; Published online(网络出版日期): 2015-03-02.
URL: http://www.cnki.net/kcms/detail/11.1809.S.20150302.0301.002.html
DOI: 10.3724/SP.J.1006.2015.00658
利用 SSR荧光标记构建 20个高粱品种指纹图谱
王 瑞 1 张福耀 1,* 程庆军 1 田承华 1 凌 亮 2
1山西省农业科学院高粱研究所 / 高粱遗传与种质创新山西省重点实验室, 山西榆次 030600; 2山西省农业科学院食用菌研究所, 山西
太原 030031
摘 要: 为建立高粱种子纯度及真实性鉴定技术体系, 构建高粱栽培品种 DNA指纹图谱数据库是必要的。利用 SSR荧
光标记技术筛选出 36对 SSR荧光标记引物, 构建我国高粱杂种优势利用以来中晚熟区主推的 20个品种的 SSR指纹图
谱。36对 SSR引物共扩增出 235个等位基因, 平均每个等位基因检测到多态性位点 7个, 多态性位点变化范围为 2~12
个。20个高粱品种 36个 SSR位点的遗传多样性指数和多态性信息量的变化范围分别为 0.3490~0.8813和 0.3144~0.8696,
平均值分别为 0.6976和 0.6571。从 36对 SSR引物中筛选到多态性丰富的 2对引物作为高粱品种鉴定的特征引物, 2对
SSR特征引物组合可区分所有供试品种。20个高粱品种的 SSR指纹图谱互不相同, 可以作为各品种特定的图谱, 为品种
鉴别提供依据。
关键词: 高粱; 品种鉴定; SSR荧光标记; 指纹图谱
Establishment of 20 Sorghum Hybrids Fingerprints Using SSR Fluorescent
Marker
WANG Rui1, ZHANG Fu-Yao1,*, CHENG Qing-Jun1, TIAN Cheng-Hua1, and LING Liang2
1 Sorghum Institute, Shanxi Academy of Agricultural Sciences / Key Laboratory of Genetic and Germplasm Innovation in Sorghum for Shanxi Pro-
vince, Yuci 030600, China; 2 Institute of Edible Fungi, Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Taiyuan 030031, China
Abstract: To establish a standard technical system for purity and authenticity identification of sorghum seeds, it is necessary to
construct a DNA fingerprinting database of major sorghum hybrids. The fluorescent marker detection of simple sequence repeat
(SSR) was used to establish SSR fingerprints of 20 sorghum hybrids that are popularized in medium and late-maturing areas in
China since heterosis has been utilized. Thirty-six pairs of SSR primers were screened and 235 alleles were amplified with the set
of primers. The number of alleles per locus ranged from two to twelve with an average of seven. The range of gene diversity and
polymorphism information content (PIC) at 36 SSR loci of 20 hybrids were 0.3490–0.8813 and 0.3144–0.8696, with an average
of 0.6976 and 0.6571, respectively. Among 36 SSR primers, two primer pairs with high polymorphism were identified as the spe-
cific primers for distinguishing the all 20 sorghum hybrids, resulting in the fingerprints for the 20 sorghum hybrids. The presented
data and technology provides an important basis for hybrids identification in sorghum.
Keywords: Sorghum; Hybrid identification; SSR fluorescent marker; Fingerprint
高粱是一种重要的旱粮作物 , 在我国旱作农业生产
中占有重要地位。目前, 我国生产上推广应用的高粱品种
都是杂交种。由于种子生产、经营管理以及环境等方面因
素, 容易导致假杂种或种子混杂, 从而降低种子纯度, 给
农业生产造成损失。此外, 由于种子市场无序竞争, 品种
存在同名异物、同物异名等现象, “杂、多、乱、小、散”
的种子市场状况给品种的识别、鉴定带来诸多困难, 因此,
建立早期(苗期)、快速、准确的高粱种子纯度和品种真实
性检测技术, 对控制高粱种子质量、保护种子公司和农民
合法利益 , 保障高粱产业可持续健康发展具有十分重要
的意义。传统的种子纯度鉴定技术主要靠田间种植鉴定,
耗时长 , 且易受环境条件的影响。因此 , 建立新品种的
DNA 指纹图谱, 快速、准确地鉴定品种基因型(真实性)
及种子纯度是十分必要的。
第 4期 王 瑞等: 利用 SSR荧光标记构建 20个高粱品种指纹图谱 659


随着分子生物学技术的飞速发展 , 新的有效的分子
标记方法不断涌现 , 这无疑给作物品种基因型鉴定开辟
了一条新的发展途径。SSR标记呈共显性遗传, 多态性丰
富, 技术简单, 稳定性好, 已被广泛用于大豆[1]、玉米[2]、
小麦[3]、水稻[4-5]、棉花[6]、马铃薯[7]、甘蓝[8]和油菜[9-10]
等农作物品种指纹图谱的构建及杂交种子纯度鉴定研究。
在高粱指纹图谱研究方面, 詹秋文等[11]用 3 对核心 SSR
引物构建 42份高粱和苏丹草的 SSR数字指纹, 同时利用
其中 1对 SSR引物 txp18, 构建了 2个高粱–苏丹草杂交种
的 SSR 指纹图谱; 王黎明等[12]用 11 对 SSR 引物构建了
142份甜高粱品种的分子身份证。
常规的 SSR 检测方法主要利用放射性标记或银染技
术, 难以读取扩增片段大小, 尤其在大规模、多批次的数
据收集和分析时存在相当大的难度 , 如不同等位变异的
准确识别及不同批次反映数据的统一。本研究将荧光测序
技术[13]与 SSR 检测技术相结合, 克服银染法的不足, 实
现数据收集和自动处理。利用国内中晚熟区高粱杂交种,
建立 20份高粱材料的分子身份证, 为高粱DNA指纹图谱的
构建和品种鉴定提供一种更加快速、准确的检测方法, 为在
分子水平上区分高粱杂交种和知识产权保护提供依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
选用 1970 年代以来高粱不同生产阶段最具代表性的
中晚熟区杂交种为试验材料(表 1)。为了保证种子纯度, 于
2011 年在山西省农业科学院高粱研究所试验田(榆次)对
20 个杂交种进行了重新组配, 花期严格套袋, 每组合杂
交授粉 4~5穗, 保证收获 3穗, 单穗收获、脱粒, 2012在
田间种植鉴定纯度, 小区面积 1 m×5 m, 每区留苗 100株,
3次重复。

表 1 自杂种优势利用以来中晚熟区主推高粱杂交种
Table 1 The main hybrids since heterosis utilization in medium and late-maturing area
编号
Code
杂交种
Hybrid
组合
Cross combination
审定年份(年)
Released year
1 晋杂 5号 Jinza 5 A1Tx3197×三尺三 A1Tx3197×Sanchisan 1973
2 晋杂 1号 Jinza 1 A1Tx3197×晋辐 1号 A1Tx3197×Jinfu 1 1973
3 晋杂 6号 JInza 6 A1Tx3197×忻粱 52 A1Tx3197×Xinliang 52 1973
4 晋杂 7号 Jinza 7 A1Tx3197×忻粱 7号 A1Tx3197×Xinliang 7 1973
5 晋杂 4号 Jinza 4 A1Tx3197×晋粱 5号 A1Tx3197×Jinliang 5 1973
6 辽杂 1号 Liaoza 1 A1Tx622×晋辐 1号 A1Tx622×Jinfu 1 1983
7 晋中 405 Jinzhong 405 A1Tx378×晋粱 5号 A1Tx378×Jinliang 5 1987
8 晋杂 11 Jinza 11 A1Tx623×忻粱 7号 A1Tx623×Xinliang 7 1987
9 沈杂 5号 Shenza 5 A1Tx622×0-30 1988
10 抗四 Kang 4 A1Tx622×晋粱 5号 A1Tx622×Jinliang 5 1988
11 晋杂 12 Jinza 12 A2V4×1383-2 1992
12 锦杂 93 Jinza 93 A1 232E×5-27 1993
13 辽杂 5号 Liaoza 5 A1Tx622×LR115 1994
14 辽杂 10号 Liaoza 10 A2 7050×LR9198 1997
15 晋杂 18 Jinza 18 A1Tx378×R111 1999
16 锦杂 100 Jinza 100 A2 7050×JZ9544 2001
17 辽杂 18 Liaoza 18 A1 038×LR2381 2004
18 锦杂 103 Jinza 103 A1 232E×JZ858 2005
19 晋杂 23 Jinza 23 A1泸 45×SX-30 A1 Lu 45×SX-30 2008
20 晋杂 102 Jinza 102 A2SX44×SX-30 2009

1.2 基因组 DNA的提取与引物合成
取幼苗叶片, 采用酚-氯仿法提取 DNA[14]。利用 36
对引物对 20 份材料进行扩增, 引物网址 http://sorgblast3.
tamu.edu/。本试验所用 SSR引物共分两类, 一类为荧光引
物, 由 ABI (Applied Biosystems, Foster City, USA)公司合
成; 另一类为普通引物, 由生工生物工程(上海)股份有限
公司合成, 用加 M13 通用引物的方法检测, 即在引物前
导链的 5端添加 M13序列, M13序列为 5-CACGACGTT
GTAAAACGAC-3 [15-16]。
1.3 试验程序
PCR体系 15 μL, 包括 8.08 μL H2O、1.5 μL 10×buffer
(Mg2+)、0.12 μL dNTPs (25 mmol L–1)、0.1 μL Taq (5 U
μL–1)、0.2 μL Primer1 (携带 M13尾巴)(4 mmol L–1)、1 μL
Primer2 (4 mmol L–1)、0.8 μL M13 (4 mmol L–1)和 2 μL
DNA (20 ng μL–1)。反应程序为 94℃ 5 min; 94℃ 45 s, 退
火温度 45 s, 72℃ 45 s, 30个循环; 94℃ 45 s, 53℃ 45 s,
72℃ 45 s, 8个循环; 72℃ 10 min; 15℃保存。在 PTC-225
(MJ Research)基因扩增仪上运行 PCR。
660 作 物 学 报 第 41卷


表 2 36对 SSR引物在 20份供试材料中的扩增
Table 2 Amplification with 36 SSR primes in 20 tested hybrids
引物
Primer
等位基因频率
Allelic frequency
等位基因数目
No. of allele
基因多样性
Gene diversity
多态性信息量
PIC
Xtxp1 0.2750 12 0.8425 0.8262
Xtxp3 0.4211 8 0.7562 0.7295
Xtxp7 0.4250 5 0.6425 0.5732
Xtxp8 0.1750 10 0.8763 0.8635
Xtxp12 0.3421 7 0.7701 0.7382
Xtxp14 0.3250 5 0.7675 0.7297
Xtxp15 0.5000 3 0.6200 0.5478
Xtxp17 0.5750 8 0.6300 0.6030
Xtxp18 0.4250 4 0.6663 0.5995
Xtxp19 0.5500 6 0.6313 0.5889
Xtxp21 0.5500 4 0.6288 0.5841
Xtxp31 0.3750 11 0.7988 0.7791
Xtxp33 0.1750 12 0.8813 0.8696
Xtxp43 0.3250 5 0.7613 0.7212
Xtxp45 0.3000 9 0.8338 0.8156
Xtxp88 0.7500 4 0.4150 0.3894
Xtxp141 0.1944 8 0.8472 0.8283
Xtxp145 0.4000 8 0.7438 0.7081
Xtxp159 0.3250 7 0.7675 0.7312
Xtxp177 0.3250 5 0.7238 0.6724
Xtxp211 0.4250 6 0.7375 0.7034
Xtxp212 0.5000 3 0.5238 0.4103
Xtxp225 0.5500 2 0.4950 0.3725
Xtxp229 0.7895 3 0.3490 0.3144
Xtxp230 0.3500 8 0.7875 0.7600
Xtxp284 0.3500 5 0.7500 0.7094
Xtxp294 0.4250 6 0.7450 0.7142
Xtxp298 0.3889 10 0.7963 0.7783
Xtxp303 0.5250 5 0.6463 0.6002
Xtxp316 0.3750 8 0.7213 0.6784
Xtxp320 0.4500 8 0.7425 0.7180
Xtxp327 0.4000 9 0.7738 0.7495
Xtxp340 0.5000 4 0.6013 0.5246
Xtxp355 0.7000 4 0.4650 0.4205
Xtxp302 0.5750 7 0.6200 0.5859
Xtxp267 0.3250 6 0.7563 0.7159
平均Mean 0.4267 7 0.6976 0.6571

第 4期 王 瑞等: 利用 SSR荧光标记构建 20个高粱品种指纹图谱 661


表 3 20个高粱品种在 36个 SSR位点的指纹数据
Table 3 Fingerprint data at 36 SSR loci of 20 sorghum hybrids
编号 Code Xtxp1 Xtxp3 Xtxp7 Xtxp8 Xtxp12 Xtxp14 Xtxp15 Xtxp17 Xtxp18
1 198/206 209/249 233/241 149/174 203/213 154/174 218/229 206/181 243
2 199 209/249 233 174 203/213 172/174 218 181 243
3 199/222 233/249 233/241 149/174 203/213 154/174 218/229 181/207 243
4 199/228 — 207/201 149 203/213 153 218/229 181/203 247/273
5 199/228 209/249 233/241 151/174 204 154 218/229 181/205 247/273
6 198/230 209/249 233/251 170 203/213 168/172 218/234 181 243
7 199/228 209/251 233/241 151/179 205/213 153/172 218/229 181/205 247/273
8 228 209/219 241/251 149/170 203/213 153/168 229/234 183/203 247/273
9 208/230 209/219 241/251 168/177 203/213 172/168 218/234 181 247/273
10 228 209/219 241/251 151/170 205/213 153/168 229/234 204/183 247/273
11 224 209/219 233/241 153/146 205/213 154/168 229/234 187 243/273
12 199/215 253/253 233 153/179 203/211 172 218 181 243
13 228 209/219 241/251 151/168 203/213 154/168 229/234 181 247/273
14 208 209/244 233/241 179 197/225 154/172 218/229 183 243
15 199/207 209/253 233/241 179 197/213 172 218 181/205 247/273
16 209/226 244/255 233/241 160/179 197/225 154/172 218/229 183 243
17 198/208 209/253 233/241 151/177 — 154/172 218/229 181/205 234/243
18 199/209 209/253 233/241 177 197/211 153 218 181 247
19 228 209/251 241 146 203/211 172/168 218/234 181 247
20 226 209/219 233/241 151 203/213 172/168 218/234 181 243/273
编号 Code Xtxp19 Xtxp21 Xtxp31 Xtxp33 Xtxp43 Xtxp45 Xtxp88 Xtxp141 Xtxp145
1 297 189 238/254 206/241 188 167/222 155 176 255
2 297 189 238/254 206/240 188 167 155 176 255/263
3 297 189 217/238 241/255 190 144 126 176 232/255
4 297 189/194 222/238 240 190/194 147 126 173 232/255
5 297/340 189 238/261 203/241 186 197 126 168/176 232/255
6 297 189/198 238/254 206/240 190 167 159 178/182 254/262
7 297/340 189 238/262 182/203 186/190 172 114 — 232/255
8 297/315 194/198 222/238 241 184/194 174 126 173/182 232/255
9 300 189/198 238 210/241 184 197 126 178/182 232/254
10 304/340 189/198 238/261 203/240 184 172 126 168/182 232/254
11 300 189/198 226/238 213/255 186 197/222 126 167 232/243
12 297 189/208 238/254 182 188 210 126 178/184 254/263
13 304/340 189/198 238/258 206/240 184 197 126 168/182 232/254
14 300 208 254 211/252 186 167 126 167/178 232/263
15 297/340 189/194 238/261 182/203 186/190 174 126 168/184 232/255
16 128/297 208 242 205/252 186 167/222 126 167/178 232/263
17 297/340 189 230/261 203/241 186/190 167 126 168/180 232/257
18 297 189 236 182 188 222 114 — 255/263
19 297 194 236/261 211 184/188 170 126 178/182 232/260
20 300 194/198 226/261 211/247 186 167 126 167/178 232
662 作 物 学 报 第 41卷


(续表 3)
编号 Code Xtxp159 Xtxp177 Xtxp211 Xtxp212 Xtxp225 Xtxp229 Xtxp230 Xtxp267 Xtxp284
1 201 187 199/233 171/181 123/148 192 198/219 266 235/240
2 201 189 233 171 123/148 192 198/218 266 235/240
3 184/201 187 199/233 171 148 192 198/216 266 235/246
4 184/201 182/189 233 171 123/148 192 198/219 288 235/246
5 184/201 187 201/233 171 148 — 198/218 260 235/240
6 186/202 185/189 233 171 123 192 208/218 266 235/240
7 184/198 187/191 201/234 173 123/148 192 198/219 260 228/240
8 184 182/185 233 173 123/148 192 198/219 288 235/246
9 184 185/189 196/233 171 123/148 192 198/216 263 235/246
10 184 185 201/233 173 123 192 198/219 260 235/240
11 188/201 185/189 199/233 173 123/148 190 214 263/266 240/249
12 198 189 199/234 171 123/148 192 196 254/263 228/246
13 186/202 185 236/233 173 123/148 192 198/219 266 235/240
14 184/201 189 199/236 171 123/148 192 216 263 240/246
15 198 189 201/234 173 123/148 192 198 260 228/240
16 184/198 185/189 199/236 173 148 190 196/216 263/266 240
17 198 187 199/234 173 148 190 196/219 260 228/240
18 184/198 185/191 199/234 173 123/148 192 198/216 254/266 228/240
19 186/198 187 233 171 123/148 186 198/216 263 235/246
20 186/193 185 201/236 173 123/148 192 189/216 263/270 249
编号 Code Xtxp294 Xtxp298 Xtxp302 Xtxp303 Xtxp316 Xtxp320 Xtxp327 Xtxp340 Xtxp355
1 349 216/236 198/226 165/168 346/449 287/292 161/170 203/217 307
2 350 — 198/226 165/168 339/346 287/292 170 203/217 307
3 358/350 210/216 198/226 165/168 346/446 287/292 171 203/217 307
4 358/350 207/216 198/226 165/168 339/346 287/292 165/170 203/217 307
5 350/359 216/227 198/232 165/168 339/346 287/292 163/170 203/217 307
6 350 216/236 198/226 165/180 339/346 292/304 170/174 203/217 307
7 350/358 216/227 198/232 165/182 339/346 292 163/170 203/217 307
8 350/358 207/216 198/226 165/180 339/346 292/304 165/174 203/217 307
9 350 236 198/235 165/180 346/443 296/304 170/175 203/217 304
10 359 216/227 198/232 165/180 339/346 292/304 163/174 203/217 307
11 357 204/236 198/210 165/171 339/375 282 163/175 203/209 312
12 350 216 198 165/180 339/346 292 170 203/217 307
13 350/358 — 198/232 165/180 339/346 292/304 163/174 203/217 307
14 357 182 198 165/168 339/438 292/298 170 203/212 307
15 350/358 216/227 198/232 165/182 339/346 292 163/170 203/217 304
16 357 218 198 165 339 292/298 171 203/212 307
17 349 216 198/232 165/180 339/438 272 163/170 203/217 307
18 350/358 216/236 198 165/180 346/443 294 170 203/217 309
19 350 221 198/223 165/180 438/446 282 160/171 203/212 304
20 350 204/221 216/223 165/171 366/446 282/292 164/175 203/209 304
“-”为未获得等位基因的位点。“-”means non-amplification SSR loci.
第 4期 王 瑞等: 利用 SSR荧光标记构建 20个高粱品种指纹图谱 663


1.4 扩增产物的纯化及自动荧光检测
由于毛细管电泳对 DNA 纯度要求很高, 所以需要对
PCR 产物进行纯化, 去除残留的蛋白质、盐分等。在 96
孔上样板的每个孔中分别加 1 μL纯化的 PCR产物, 8.5 μL
甲酰胺和 0.03 μL的分子内标, 离心, 然后 95℃变性 5 min,
利用 DNA 测序仪 ABI3730 (Applied Biosystems, Foster
City, USA)进行自动荧光检测。待电泳结束后 , 利用
Genemapper 3.1软件收集数据, 并根据引物筛选时确定的
分子量范围及引物的颜色进行条带分子量的确定。用
Powermarker 3.25[17]软件分析等位变异数和多态性信息含
量(polymorphism information content, PIC),
2
1
PIC=1
i
ij
j
p


式中, pij表示位点 i的第 j个等位变异出现的频率, 反
映每个 SSR位点的多态性水平。
2 结果与分析
2.1 纯度鉴定结果
田间鉴定表明, 20 个杂交组合 3 次重复的 60个穗行
中, 有 58个穗行田间表现整齐一致, 未发现杂株, 纯度达
100%。试验选用纯度达 100%的种子培育幼苗取样。
2.2 SSR分子标记检测结果
用 36 对引物对 20 份材料进行扩增(表 2), 共得到多
态性等位基因变异 235个, 平均每个等位基因检测到多态
性位点 7 个, 多态性位点变化范围为 2~12 个。供试材料
标记位点的基因多样性指数和多态性信息量的变化范围
分别为 0.3490~0.8813 和 0.3144~0.8696, 平均值分别为
0.6976和 0.6571。
2.3 高粱品种的指纹图谱构建与品种鉴定
利用筛选出的 36 对 SSR 荧光引物对 20 个高粱品种
进行扩增 , 准确获得不同材料在不同位点的等位基因的
片段大小(表 3)。其中引物Xtxp8可区分 16个高粱品种, 另
外的 4 个品种用引物 Xtxp1、Xtxp3、Xtxp17、Xtxp31、
Xtxp33、Xtxp43、Xtxp45、Xtxp145、Xtxp159、Xtxp212、
Xtxp230、Xtxp284、Xtxp294、Xtxp298、Xtxp316和 Xtxp327
都可以区分开。因此, 利用 2对引物可区分所有供试品种。
20 个高粱品种的 SSR 指纹图谱互不相同, 可以作为各品
种特定的图谱, 为品种鉴别提供依据。
3 讨论
在利用银染法聚丙烯酰胺凝胶电泳检测时 , 同一胶
板上所有样品带谱间相对位置的识别以及不同胶板得到
的SSR数据的整合会给数据收集和分析带来很大的困难[18]。
SSR荧光标记毛细管电泳法是基于 DNA测序仪为平台的
检测方法, 具有快速、高效、精确、灵敏等技术优势。实
现了数据收集和处理的自动化, 克服了银染法的不足, 能
区分大小相差 1~2个碱基的片段之间的差异。郝晨阳等[18]、
易红梅等[19]、陈雅琼等[20]和程本义等[21]于小麦、玉米、
烟草、水稻中比较得出在同一检测成本上, 荧光标记技术
检测效率远高于银染法, 结果更为精确、灵敏, 更适用于
高通量材料的指纹图谱构建和品种鉴定研究。本研究采用
的 SSR 荧光标记毛细管电泳检测方法, 依据 PCR 扩增产
物与同一泳道的内标比对, 直接读出目标 DNA 片段的准
确大小, 其检测数据更为精确可靠[10,22], 建立的分子指纹
更为科学客观。
利用分子标记进行 DNA 指纹鉴定或构建 DNA 指纹
图谱 , 遵循的原则之一是利用尽量少的标记分开尽量多
的品种, 以降低成本和提高检测效率, 这就要求所用的标
记多态性要好。本研究选用了具有不同遗传基础的 20 份
杂交种为试材, 筛选出扩增带型稳定, 多态性丰富的 36
个标记, 共检测到 235 个等位变异, 每个标记位点的等位
变异个数为 2~12, 平均每个位点等位变异数为 7 个。36
个位点的 PIC 值范围为 0.3144~0.8696, 平均 0.6571。王
黎明等[12]利用 41个 SSR标记, 在 142份甜高粱种质资源
中检测到 189个等位变异, 每个标记位点的等位变异个数
为 2~11, 平均为 4.6 个。引物位点的 PIC 变幅为 0.089~
0.850, 平均 0.543。本研究 36个标记的等位变异数和 PIC
值都高于后者。而等位变异的数量和 PIC值是衡量标记多
态性的指标。本研究筛选出的引物在中国育成品种中具有
较高的多态性, 能够满足鉴定中国高粱育成品种的需要。
唯一性是 DNA指纹图谱的终极目标。由于研究对象
的遗传背景、供试材料份数及其所选引物的多态性等因素
的影响与限制, 在构建 DNA 指纹图谱过程中, 往往用 1
对引物达不到唯一性这个要求。我们用 2对引物组合来绘
制高粱的指纹图谱。但有限的引物只能适用于一定数量的
样品群体, 对于所有的高粱品种或出现新品种时, 可能会
出现同一引物在不同品种间谱带相同的现象 , 此时应采
用不同的引物组合或者筛选新的 SSR 引物将其区别开,
以补充和扩展现已建立的初步指纹图谱。
品种鉴别和鉴定是生产和科研的基础 , 而分子指纹
图谱构建是将品种间基因差别表型化、可视化的相对简单
而重要的手段。利用 SSR 荧光标记技术可以准确获得高
粱品种不同 SSR位点的指纹图谱, 并且互不相同, 所获得
的指纹图谱可以甄别一个碱基的差别。本试验中构建的指
纹图谱可以应用到生产或科研中 , 以及同名异物或同物
异名的品种鉴别。
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