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Divetsity of endophytic fungi associatedwith Bletilla striata

白及内生真菌多样性研究



全 文 :  Guihaia  Jul. 2016ꎬ 36(7):832-836
http: / / journal.gxzw.gxib.cn
http: / / www.guihaia-journal.com
DOI: 10.11931 / guihaia.gxzw201512004
韦艳梅ꎬ周雅琴ꎬ李力ꎬ等. 白及内生真菌多样性研究 [J]. 广西植物ꎬ 2016ꎬ 36(7):832-836
WEI YMꎬ ZHOU YQꎬ LI Lꎬ et al. Divetsity of endophytic fungi associated with Bletilla striata [J]. Guihaiaꎬ 2016ꎬ 36(7):832-836
白及内生真菌多样性研究
韦艳梅ꎬ 周雅琴ꎬ 李  力ꎬ 谭小明∗
( 西南濒危药材资源开发国家工程实验室ꎬ 广西药用植物园ꎬ 南宁 530023 )
摘  要: 白及(Bletilla striata)是兰科地生型多年生植物ꎬ也是我国传统中药材之一ꎮ 利用菌根技术进行白及
的保护和人工栽培ꎬ需要获得白及可培养的内生真菌ꎮ 该研究以广西野生的白及根和叶为材料ꎬ采用分离培
养法分离内生真菌ꎬ并结合真菌形态特征ꎬ及其核糖体的转录间隔区(ITS)序列分析ꎬ确定内生真菌的分类地
位ꎮ 结果表明:从 2株白及植物 90块组织中分离获得 37株内生真菌ꎬ鉴定为 15个分类单元ꎬ由 9个属组成ꎬ
分属于 2门 4纲 7目 8科ꎬ包括锤舌菌纲(Leotiomycetes)、座囊菌纲(Dothideomycetes)和粪壳菌纲(Sordariomy ̄
cetes)ꎬ伞菌纲(Agaricomycetes)ꎮ 从根中分离获得内生真菌 12 种ꎬ蜡壳菌属为优势属ꎻ从叶中分离获得内生
真菌 3种ꎬ刺盘孢属为优势属ꎻ刺盘孢菌属(Colletotrichum)和蜡壳菌属(Sebacina)真菌的相对多度值均达到
20%ꎻ4株担子菌均分布于根中ꎬ叶组织中未有分布ꎮ 根组织中内生真菌的多样性指数(H= 1.863)高于叶组织
(1.098)ꎮ 该研究结果及其所分离培养的担子菌类真菌ꎬ为更好地利用菌根技术进行白及等兰科植物资源的
保护与可持续利用奠定了基础ꎮ
关键词: 白及ꎬ 可培养内生真菌ꎬ蜡壳菌属ꎬ 多样性ꎬ 鉴定
中图分类号: Q943    文献标识码: A    文章编号: 1000 ̄3142(2016)07 ̄0832 ̄05
Divetsity of endophytic fungi associated
with Bletilla striata
WEI Yan ̄Meiꎬ ZHOU Ya ̄Qinꎬ LI Liꎬ TAN Xiao ̄Ming∗
( National Engineering Laboratory of Southwest Endangered Medicinal Resources Developmentꎬ National Development and
Reform Commissionꎬ Guangxi Botanical Garden of Medicinal Plantꎬ Nanning 530023ꎬ China )
Abstract: Bletilla striataꎬ as atraditional Chinese herbal medicineꎬ is a terrestrial and perennial medicinal plant. It is
necessary to obtain the culturable endophytic fungi in the application of mycorrhizal technology for the protection and ar ̄
tificial cultivation of B. striata. The independent fungal isolates were isolated from the roots and leaves of B. striataꎬ and
identified based on the fungal morphological characteristics and the analysis of the fungal internal transcribed spacer
(ITS) of rDNA sequences. The results showed that thirty ̄seven independent fungal isolates were obtained from forty ̄five
root tissues and forty ̄five leaf tissues of two wild plants of B. striata. The isolates were identified to 15 taxaꎬ belonging to
nine generaꎬeight familiesꎬ seven ordersꎬ four classesꎬ and two phyla. The four classes are corresponding to Leotiomyce ̄
tesꎬ Dothideomycetesꎬ Sordariomycetes and Agaricomycetes. Twelve endophytic fungi were isolated from the rootsꎬ and
Sebacina were dominant genus. Three endophytic fungi were isolated from the leavesꎬ and Colletotrichum were dominant
genus. The relative abundance of Sebacina or Colletotrichum was 20%. Four basidiomycetes all were not isolated from the
收稿日期: 2015 ̄12 ̄03    修回日期: 2016 ̄04 ̄14
基金项目: 广西自然科学基金(2015GXNSFDA139012)ꎻ广西药用植物园科研基金(桂药基 201401)[Supported by the Natural Science Foundation of
Guangxi(2015GXNSFDA139012)ꎻResearch Fund of Guangxi Medicinal Botanical Garden(201401)ꎮ]
作者简介:韦艳梅(1983 ̄)ꎬ女(壮族)ꎬ广西都安人ꎬ硕士ꎬ工程师 /助理研究员ꎬ主要从事园林景观建设、植物栽培研究ꎬ(E ̄mail) weiyanmei99@ 126.comꎮ
∗通讯作者: 谭小明ꎬ博士ꎬ副研究员ꎬ主要从事药用植物菌根生物学研究ꎬ(E ̄mail) txm1978@ 126.comꎮ
leavf tissues but the roots. The diversity index of endophytic fungi in roots (H′= 1.863) was higher than that in leaves
(H′=1.098). The positive results in this report demonstrated that fungi isolated from B. striata could be used for the pro ̄
tection and artificial cultivation of the host. Moreoverꎬ these Basidiomycetous fungi simultaneously clould be used as a
valuable candidate sources for the protection and sustainable utilization of orchid resources by mycorrhizal technology.
Key words: Bletilla striataꎬ culturable endophytic fungiꎬ Sebacinaꎬ diversityꎬ identification
    白及(Bletilla striata)为兰科(Orchidaceae)白及
属(Bletilla Reichb. f.)地生型多年生植物ꎬ其花色艳
丽ꎬ极具观赏价值ꎬ还是目前我国濒危紧缺的中药材
之一ꎬ其根茎中富含药用成分白及胶质ꎬ具有收敛止
血、清热解毒、消肿生肌等作用(国家药典委员会ꎬ
2015)ꎬ疗效确切ꎬ经济价值很高ꎮ 但是ꎬ由于白及
种子无胚乳ꎬ自然条件下难以萌发ꎬ仅靠无性繁殖ꎬ
繁殖系数极低ꎻ加之近年来野生白及栖息地环境恶
化和多年来的乱采乱挖ꎬ导致野生白及资源几近枯
竭ꎬ市场供不应求ꎬ严重限制了其在医药、食品、化状
品及其他方面的应用(刘光斌等ꎬ 2005)ꎮ 因此ꎬ如
何实现白及资源的保护与资源再生ꎬ是一个重要而
急切的课题ꎮ
研究表明ꎬ所有兰科植物均与内生真菌形成互
惠互利的菌根共生关系ꎬ这种关系在兰科植物的生
活史中扮演着重要作用ꎮ 首先ꎬ菌根真菌能促进兰
科植物种子萌发ꎮ 兰科植物种子仅有原胚ꎬ自身贮
存的营养物质有限ꎬ自然条件下萌发困难ꎬ需依靠真
菌的侵染提供营养才能萌发ꎮ Bernard 首次从兰科
鸟巢兰属(Neottia)植物中发现促进兰科植物种子萌
发的菌根真菌ꎬ并提出了兰科植物种子自然条件下
靠消化菌根真菌才能萌发的经典的共生萌发理论
(Selosse et alꎬ 2011)ꎮ Tan et al(2014)从 120 多种
兰科植物中分离并筛选获得了 12 种促进铁皮石斛
种子萌发的菌根真菌ꎬ其中金钗石斛菌根真菌 JC ̄
02和 JC ̄05ꎬ可显著促进铁皮石斛种子萌发和幼苗
的生长ꎮ 这些优良菌根真菌的发现ꎬ为今后有效利
用真菌进行田间栽培试验奠定了菌种基础ꎮ 其次ꎬ
菌根真菌能促进兰科植物幼苗生长和发育ꎮ Guo &
Cao(2000)率先利用菌根共生技术解决石斛属植物
的资源再生难题ꎬ先后从石斛属植物中发现 7 种可
与铁皮石斛幼苗共生的真菌ꎬ对幼苗具有显著促生
作用ꎮ 同时ꎬ菌根真菌也是植物组培苗产生药用成
分的重要诱导因子(Selosse et alꎬ 2011)ꎮ
目前ꎬ通过组织培养繁育白及的研究已取得一
定的进展(鲁光耀ꎬ 2015)ꎬ但试管苗存在着退化、移
栽成活率低、生长缓慢、活性成分偏低等诸多现实问
题ꎮ 近年来ꎬ国内外针对白及的研究主要集中在化
学、药理、组织培养和引种驯化等方面ꎬ而对于白及
内生真菌分离鉴定及多样性研究的报道较少ꎮ 本研
究通过对白及内生真菌及多样性进行研究ꎬ旨在为
深入研究白及与内生真菌的共生关系提供可利用的
菌种资源ꎬ为在生产实践中有效地利用白及内生真
菌提供理论依据ꎮ
1  材料与方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料  供试材料为 2株野生白及ꎬ采自广西
桂林市资源县(海拔 1 350 mꎻ 110°63′ Eꎬ26°03′ N)ꎮ
1.1.2 分离培养基  采用马铃薯葡萄糖(PDA)培养
基分离培养内生真菌ꎮ PDA 培养基的配方及制作:
马铃薯 200 gꎬ洗净后去皮切成小块ꎬ开水煮 30 minꎬ
4层纱布过滤ꎬ取滤液加入葡萄糖 20 gꎬ琼脂 15 gꎬ
加热至完全溶解ꎬ加入蒸馏水定容 1 000 mLꎬpH 自
然ꎮ 121 ℃灭菌 20 minꎬ备用ꎮ
1.2 方法
1.2.1 内生真菌的分离方法  选取健康白及植物的
根和叶ꎬ在自来水下冲洗干净ꎬ 切成 1 cm 的小段ꎮ
在无菌条件下ꎬ先用 70%的酒精浸泡 30 sꎬ再用 2%
次氯酸钠浸泡消毒 3~5 minꎬ无菌水冲洗 3~5次ꎬ去
除残留的次氯酸钠ꎮ 用无菌滤纸ꎬ吸取材料表面的
水分ꎬ然后用手术刀将材料切成 5 mm(根)或 5 mm ×
5 mm(叶)ꎬ接种至含有硫酸链霉素(50 mg􀅰L ̄1)和
四环素(50 mg􀅰L ̄1)的 PDA 培养基ꎬ25 ℃暗培养
7~15 dꎮ 每皿接种组织块 9块ꎬ根和叶均重复 5皿ꎬ
每个器官接种 45块组织ꎮ
1.2.2 内生真菌的纯化及保藏  待组织块边缘长出
真菌菌丝ꎬ及时将菌丝接种至新鲜的 PDA培养基上
进行纯化培养ꎻ当菌落长至培养基的 2 / 3面积时ꎬ根
据菌落的形态特征(生长速度、颜色、气生菌丝有无
等)ꎬ合并相同菌株ꎻ将形态各异纯化后的内生真菌
菌株分为两部分ꎬ一部用于 4 ℃或-80 ℃保藏ꎬ另一
部分用于真菌形态鉴定ꎮ
3387期                        韦艳梅等: 白及内生真菌多样性研究
表 1  白及根和叶可培养内生真菌种群组成
Table 1  Culturable endophytic fungi isolated from roots and leaves of Bletilla striata

Phyla

Class

Order

Family

Genus
相对多度
Relative abundance
(RB) (%)
锤舌菌纲
Leotiomycetes
柔膜菌目
Helotiales
背芽突霉属
Cadophora
6.67
座囊菌纲
Dothideomycetes
葡萄座腔菌目
Botryosphaeriales
球壳孢科
Phyllostictaceae
球座菌属
Guignardia
6.67
小丛壳菌目
Glomerellales
小丛壳菌科
Glomerellacea
刺盘孢菌属
Colletotrichum
20.00
子囊菌亚门
Ascomycotina
丛赤壳科
Nectriaceae
柱孢菌属
Cylindrocarpon
13.33
粪壳菌纲
Sordariomycetes
肉座菌目
Hypocreales
丛赤壳科
Nectriaceae
镰孢菌属
Fusarium
13.33
麦角菌科
Clavicipitaceae
轮枝孢菌属
Verticillium
6.67
海球藻科
Halosphaeriaceae
黑团孢霉属
Periconia
6.67
担子菌亚门
Basidiomycotina
伞菌纲
Agaricomycetes
蜡壳菌目
Sebacinales
蜡壳菌科
Sebacinaceae
蜡壳菌属
Sebacina
20.00
伞菌纲
Agaricomycetes
鸡油菌目
Cantharellales
胶膜菌科
Tulasnellaceae
胶膜菌属
Tulasnella
6.67
1.2.3 内生真菌的形态学鉴定  主要参考«真菌鉴定
手册»及其他已发表的文献资料 (魏景超ꎬ1979ꎻ
Ellisꎬ 1971ꎻ Bailey & Jegerꎬ 1992ꎻ Nontachaiyapoom
et alꎬ 2010ꎻ Chen et alꎬ 2010)ꎬ根据宏观的菌落特
征和显微特征ꎬ对分离到的白及内生真菌进行鉴定ꎬ
确定真菌的分类地位ꎮ
1.2.3.1 显微特征观察  采用透明胶带粘取菌丝ꎬ置
于表面加有 1 滴 10% KOH 的载玻片上ꎬ在生物显
微镜下ꎬ观察分生孢子和孢子梗的大小、形状、颜色、
表面纹饰、产孢方式等ꎬ并进行测量和拍照ꎮ 为了观
察自然生长的菌丝形态ꎬ可以用插片法在 PDA培养
基上培养真菌ꎮ
1.2.3.2 繁殖结构的诱导  内生真菌大多数不产生
分生孢子ꎬ往往需要诱导产孢ꎮ 本研究采用低温诱
导法、紫外线照射法等培养真菌ꎬ促使真菌产生繁殖
结构和分生孢子ꎬ进行形态学鉴定ꎮ
1.2.4 内生真菌的分子鉴定  利用 ITS ̄rDNA进行内
生真菌分子鉴定ꎮ 参照真菌 DNA 提取试剂盒的使
用指南进行总 DNA 的提取(E. Z. N. ATM Fungal
DNA KitꎬOmega BioTekꎬDoravilleꎬGeorgiaꎬUSA)ꎻ采
用真菌通用引物 ITS1 ( 5′ ̄TCCGTAGGTGAACCTG ̄
CGG ̄3′) 和 ITS4 ( 5′ ̄TCCTCCGCTTATFGATATGC ̄
3′)扩增 ITS1ꎬ5.8S 和 ITS2 全序列ꎮ 50 μL PCR 扩
增反应体系:Mix 25 μLꎻ引物各 2 μL (5 μmol􀅰
L ̄1)ꎻ模板 2~ 10 μLꎻddH2O 补足 50 μLꎮ PCR 扩增
反应条件:94 ℃ 预变性 3 minꎻ94 ℃变性 30 sꎻ55 ℃
退火 30 sꎻ72 ℃延伸 25 sꎻ共 30 个循环后ꎬ72 ℃再
延伸 7 minꎬ4 ℃保存ꎮ 取 5 μL PCR 扩增产物ꎬ用
0.8%琼脂糖凝胶电泳检测ꎮ 电泳结束后ꎬ在紫外灯
下观察ꎬ有条带的 PCR产物送上海生工生物工程公
司测序ꎮ 测序所用引物与扩增反应相同ꎮ 将获得的
目标 ITS序列在 GenBank数据库中进行网上比对分
析ꎬ利用 Clustal W1.6 软件进行全序列比对ꎬ并用
MEGA 4.0.2软件进行聚类分析ꎬ构建 NJ 系统发育
树ꎬ对内生真菌进行分子鉴定ꎮ
1.3 内生真菌多样性分析
本研究采用相对多度和多样性指数度量白及根
和叶组织中内生真菌的丰度ꎮ 内生真菌相对多度可
以反映某种内生真菌在该物种中出现的频率ꎻ多样
性指数则能反映白及内生真菌种群的丰富程度ꎬ用
来分析其物种的多样性ꎮ
相对多度( relative abundanceꎬRB)是指分离得
到的某种内生真菌菌株数量占该植物内生真菌总菌
株数量的百分率ꎮ
内生真菌的多样性参照香农多样性指数(Shan ̄
non ̄Wiener diversity indexꎬH′)的公式进行计算ꎬ公
438 广  西  植  物                                  36卷
图 1  基于 rDNA ̄ITS 建立的 NJ系统进化发育树ꎬ显示 15株白及内生真菌与其他相关类群真菌的系统发育关系
以 Armillaria sinapina为外类群ꎮ Bootstrap值≥50%显示在每个分支的节点上ꎮ
Fig. 1  Phylogenetic relationships among fifteen endophytic fungi from B. striata and fungi associated with other related taxa
Armillaria sinapina was used as the outgroup. Bootstrap values (≥50%) are indicated along to relevant nodes.
式如下:
H′= -∑ki=1Pi ln Pi
式中ꎬk代表内生真菌的总分离株数ꎻPi 代表某
种内生真菌占总菌株数的百分比(Pielouꎬ 1975)ꎮ
2  结果与分析
2.1 白及内生真菌的分离与鉴定
采用组织块分离法从野生白及叶和根中ꎬ分离
获得 37株可培养的内生真菌ꎬ经菌落特征和真菌显
微特征的观察ꎬ分为 15 个分类单元ꎮ 然而ꎬ这些内
生真菌往往不产生分生孢ꎬ影响了进一步的分类鉴
定ꎮ 因此ꎬ基于 ITS ̄rDNA序列信息ꎬ以 Armillaria si ̄
napina为外类群ꎬ构建白及内生真菌与其他相关真
菌类群的 NJ系统发育树(图 1)ꎮ
通过分析系统发育树ꎬ可将这 15 株真菌分为 9
个属ꎬ涉及 2门 4纲 7目 8科ꎮ 子囊菌亚门真菌有 7
种ꎬ担子菌亚门真菌有 2 种ꎮ 这些子囊菌包括锤舌
菌纲(Leotiomycetes)、座囊菌纲(Dothideomycetes)和
粪壳菌纲(Sordariomycetes)ꎮ 其中ꎬ粪壳菌纲的种类
最多ꎮ 刺盘孢菌属(Colletotrichum)和蜡壳菌属(Se ̄
bacina)真菌为优势菌群ꎬ均占总分离菌株数的 20%
(表 1)ꎮ
2.2 白及根和叶中内生真菌的分布
4种担子菌均分离于根中ꎬ其中ꎬ蜡壳菌属(Se ̄
bacina sp.1)(BS11)、Sebacina sp.2(BS12)、Sebacina
sp.3 ( BS13) 等 3 种和胶膜菌属 ( Tulasnella sp.)
(BS14)1 种ꎮ 另外ꎬ2 种镰孢菌属(Fusarium sp.1)
5387期                        韦艳梅等: 白及内生真菌多样性研究
(BS7)和 sp. 2 (BS8)、1 种背芽突霉属(Cadophora
sp.) (BS1)、2 种刺盘孢菌属(Colletotrichum sp. 1)
(BS2)和 Colletotrichum sp.2 (BS3)、2 种柱孢菌属
(Cylindrocarpon sp. 1) ( BS5)、 Cylindrocarpon sp. 2
(BS6)和 1 种轮枝孢菌属(Verticillium sp.) (BS15)
由根组织中分离获得ꎮ 从叶片分离到 1种刺盘孢菌
属(Colletotrichum sp. 3) ( BS3)、1 种黑团孢霉属
(Periconia sp.) (BS10)、1 种球座菌属(Guignardia
sp.) (BS9)ꎮ
2.3 白及内生真菌多样性
内生真菌的 Shannon ̄Wiener 多样性指数 H =
1.483ꎬ其中ꎬ根组织中内生真菌的 Shannon ̄Wiener
多样性指数 H= 1.8638ꎬ叶组织中 Shannon ̄Wiener多
样性指数 H= 1.098ꎮ
3  讨论与结论
对广西野生白及根和叶组织中内生真菌的分离
和鉴定结果表明ꎬ不同组织器官中的内生真菌的数
量和种类及多样性存在较大的差异ꎮ 这种差异性的
出现在以往的研究中得到证实ꎮ 谭小明等(2014)
从濒危药用植物八角莲根茎叶中分离到内生真菌以
根中最多ꎮ 而陈佳昕等(2008)从药用植物茅苍术
叶中分离到 14 株内生真菌ꎬ而根和茎各只有一株ꎻ
周雅琴等(2015)对广西野生南方红豆杉内生真菌
进行了分离ꎬ从茎中分离获得的内生真菌比根和叶
多ꎮ 这种差异性与不同植物内生真菌对营养需求的
特殊性可能相关ꎻ不同植物生长的宏观因素ꎬ如季
节、年限、干湿等ꎬ以及植物体内微环境如化学成分
组成及植物结构ꎬ也可能是影响植物内生真菌种群
和数量及多样性的重要因子ꎮ
组织块分离法是植物内生真菌多样性研究的方
法之一ꎮ 这一方法可以获得可以培养的内生真菌ꎬ
但由于人工合成培养基的局限性ꎬ不是所有的内生
真菌都能够在人工合成的培养基上生长ꎬ这一类内
生真菌被称为未培养真菌ꎮ Amann et al(1995)的研
究表明ꎬ自然界中有 85% ~ 99.9%的内生真菌是无
法在培养基上进行纯培养的ꎮ 近年来ꎬ分子生物学
技术如宏基因组测序方法也常应用于内生真菌多样
性的研究ꎬ让人们能更全面地认识植物内生真菌的
种类和多样性ꎬ当然也包括未培养内生真菌ꎻ但无法
获得可用于培养的内生真菌ꎮ 因此ꎬ组织块分离法
还是目前植物内生真菌研究的主要方法ꎮ
所有兰科植物都与菌根真菌存在密切的共生关
系ꎮ 这些菌根真菌大多属于担子菌ꎮ 在本研究中ꎬ
从根中分离获得 3种蜡壳菌属真菌和 1种胶膜菌属
(Tulasnella)真菌ꎮ 研究表明ꎬ蜡壳菌属和胶膜菌属
真菌是兰科植物菌根真菌中常见的种类 ( Non ̄
tachaiyapoom et alꎬ 2010)ꎬ这些真菌有的可以促进
植物种子的萌发ꎬ有的可以促进植物生物量的增加ꎬ
或增强植物的抗逆能力ꎮ 因此ꎬ开展蜡壳菌属和胶
膜菌属真菌与白及植物的共生关系研究ꎬ将是下一
步工作的重点ꎮ
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