作 者 :王清明Organ-单位: 四川农业大学
期 刊 :四川农业大学 2015年 07期 页码:54
关键词:桃;蔷薇科;转录组;表达序列标签;简单重复序列;批量开发;通用性;
摘 要 :桃是世界上重要的经济果树和园林树种,同时也是蔷薇科木本模式植物,研究桃的种质资源和遗传背景具有重大意义。在当前,SSR标记仍然是研究植物物种种质资源和遗传背景的重要手段之一。然而,桃的可用SSR引物数量稀少,蔷薇科其他物种的SSR引物数量更是寥寥无几。2013年,Verde等人基于桃的不同器官进行了转录组测序,汇总先前的研究后共提交到NCBI公共数据库有80797条无冗余ESTs序列,为桃EST-SSR引物的大规模开发提供了丰富的序列资源。本研究先利用MISA软件对来自NCBI数据库的80797条EST序列进行SSR位点挖掘,然后利用primer3模块批量设计SSR引物,最后,采用PCR技术在...