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新疆三芒草DREB基因片段的克隆



全 文 :新疆三芒草 DREB基因片段的克隆
梁红艳1,2 (1.三门峡职业技术学院生化工程系,河南三门峡 472000;2.石河子大学农学院,新疆石河子 832003)
摘要 [目的]克隆新疆三芒草 DREB基因片段。[方法]利用 PCR技术和 RACE技术,从新疆沙漠边缘抗旱植物三芒草中克隆抗旱相
关基因 DREB片段。[结果]研究克隆到了 4个 DREB基因片段。[结论]该研究为进一步获得 DREB基因全序列和研究植物抗旱分子
机理、培养抗旱作物品种奠定了基础。
关键词 新疆三芒草;DREB;克隆
中图分类号 S544 + . 9 文献标识码 A 文章编号 0517 -6611(2013)11 -04725 -02
DREB Gene Fragments Clone of Aristida pennata in Xinjiang
LIANG Hong-yan (Biochemical Engineering Department,Sanmenxia Polytechnic,Sanmenxia,Henan 472000)
Abstract [Objective]The paper was to clone DREB gene fragments of Aristida pennata in Xinjiang. [Method]Using the PCR and RACE tech-
nology,the segments of drought - resistant related gene DREB were cloned from A. pennata at the edge of desert in Xinjiang. [Result]Four
DREB gene fragments were cloned. [Conclusion]The study laid a foundation for the further obtainment of complete sequence of DREB gene,
study of drought - resistant molecular mechanism of plants and cultivation of drought - resistant crops varieties.
Key words Aristida pennata in Xinjiang;DREB;Clone
作者简介 梁红艳(1978 - ),女,山西忻州人,讲师,硕士,从事生物技
术方面的研究,E-mail:hongyanliang2001@ aliyun. com。
收稿日期 2013-03-18
水资源短缺可严重影响植物的生长发育,造成作物减产
和生态环境恶化,是制约我国内陆地区农业生产的主要因素
之一[1]。提高作物的抗旱能力,积极培育耐旱作物品种及高
效利用有限的淡水资源是现代植物育种工作急需解决的
问题。
DREB(干旱应答元件结合蛋白)转录因子能调控多个与
干旱、高盐及低温耐性有关的功能基因表达[2],所以可利用
DREB转录因子来改良作物的抗旱性能。目前,人们已在烟
草[3]、小麦[4]、大麦[5]、水稻[6]、玉米[7]、番茄[8]等植物中找到
了相似的转录因子,为 DREB转录因子在改良植物抗逆性基
因工程中的应用创造了条件。
三芒草(Aristida pennata)为禾本科(Poaceae)三芒草属
植物,主要分布于我国新疆、内蒙古等省(区),抗旱能力极
强[9],可作饲料,且抗高温、耐盐碱,是重要的沙漠草本植物
之一。目前,尚未见对三芒草进行 DREB 基因克隆的报道。
笔者以新疆三芒草为研究材料,利用 PCR 技术和 RACE 技
术,克隆抗旱相关基因 DREB 片段,为进一步获得该基因全
序列,研究植物抗旱分子机理、培育抗旱作物品种奠定基础。
1 材料和方法
1. 1 材料 供试三芒草植株采自北疆沙漠边缘,冻存后用
于总 RNA的提取;RNA提取试剂盒、反转录试剂盒、回收试
剂盒均购自上海生工生物工程技术服务有限公司(上海生
工),EcoRⅠ限制性内切酶、T4 连接酶、Marker 等试剂材料由
三门峡职业技术学院生化工程系实验室提供,所用 T载体为
pGEM-T,购自 Promaga公司。
1. 2 引物设计与合成 利用小麦、山羊草等禾本科植物
DREB基因的保守区设计简并引物,引物设计软件为 Prime
Premier5. 0,引物序列为 5-GNTTYMGNGGNGTNMGNCA-3和
3-CGNRANCGNKCNTGNTTR-5,由上海生工生物工程技术
服务有限公司合成。
1. 3 DREB基因片段的克隆 用 RNA 提取试剂盒提取三
芒草的总 RNA,具体步骤参考试剂盒说明书,略加改动;总
RNA经琼脂糖凝胶电泳检测后,通过反转录试剂盒,按表 1
体系和步骤获取 cDNA第 1链;再按表 2 的反应体系和程序
进行 PCR,PCR反应产物置于 -20 ℃保存。
表 1 反转录体系及步骤
试剂 用量 操作步骤
总 RNA 0. 1 ~0. 5 μg 混匀,离心 3 ~ 5 s 后,70℃
水浴 5 min,置于冰上冷却,
离心机收集液体
Oligo(dT)18 primer (0. 5
μg /μl)
1 μl
DEPC H2O 补足至 10 μl
5 × reaction buffer 4 μl 冰上加入左侧成份,混匀,
离心 3 ~ 5 s,37 ℃水浴 5
min
RibolockTM inhibito (20
U /μl)
1 μl
10 mmol /L dNTPs 2 μl
反转录酶(200 U /μl) 1 μl 42 ℃水浴 60 min 后,70 ℃
水浴 10 min,停止反应,置
于冰上
ddH2O 补足至 20 μl
表 2 PCR扩增体系及程序
反应体系 用量∥μl 扩增程序
primer(20 ng /μl) 1. 0 94 ℃预变性,2 min→
Oligo(dT)18(0. 5 μg /μl) 3. 0 (94 ℃变性 30 s→退火温
Mg2 + 15 mmol /L 1. 0 度,1 min→72 ℃延伸 45
10 × PCR Buffer 2. 5 s),39个循环→72 ℃延
dNTPs(10 mmol /L) 0. 5 伸 10 min→4 ℃备用
cDNA 0. 5
Taq酶(5 U /μl) 0. 5
ddH2O 16. 0
安徽农业科学,Journal of Anhui Agri. Sci. 2013,41(11):4725 - 4726,4728 责任编辑 朱琼琼 责任校对 况玲玲
DOI:10.13989/j.cnki.0517-6611.2013.11.122
琼脂糖电泳检测 PCR 产物后,先用试剂盒回收特异片
段;再依次进行大肠感受态细胞的制备(GaCl2 法)、连接反
应(回收片段 4 μl + 2 × Lig Buffer 5 μl + T载体 0. 5 μl +连接
酶)和热击转化;然后在 LB平板上通过蓝白斑挑阳性克隆,
提取质粒并进行质粒酶切(体系为 EcoRⅠ1 μl + 10 × Buffer 2
μl +质粒 5 μl + ddH2O补足至 20 μl),酶切完毕进行琼脂糖
电泳检测,经鉴定的阳性克隆可进行序列测定。
2 结果及分析
2. 1 三芒草 DNA、总 RNA 的提取及 cDNA 的获得 利用
RNA提取试剂盒提取了新疆三芒草的总 RNA(图 1),在此
基础上反转录获得了 cDNA。
图 1 新疆三芒草总 RNA的提取
2. 2 三芒草 DREB基因特异片段的获得 以三芒草的 cD-
NA为模板,用设计的 DREB简并引物进行扩增,扩增产物用
1. 2%琼脂糖凝胶进行电泳,结果如图 2 所示。扩增产物条
带分布范围较大,不能有效区分扩增片段的数量,因此改用
分辨率更高的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)进行检测(图
2),发现扩增产物包含 4 个特异片段,分子量在 600 ~ 1 000
bp之间。
图 2 琼脂糖凝胶电泳(左)和 PAGE电泳(右)结果
2. 3 三芒草 DREB 基因片段的克隆 用试剂盒回收琼脂
糖电泳检测的 PCR产物,经与 T载体连接后,转化至大肠杆
菌感受态细胞中,筛选到 4个阳性克隆,提取其中的质粒,并
进行酶切和检测,结果如图 3 所示,筛选的 4 个阳性克隆中
的基因片段分子量并不相同,印证了前述聚丙烯酰胺凝胶电
泳的结果。
注:M. DNA Marker;h4为 4个阳性克隆的酶切产物。
图 3 重组质粒的酶切结果
3 结论与讨论
该研究从北疆沙漠边缘抗旱植物三芒草中提取了总
RNA,利用 PCR技术和 RACE技术,克隆到了 4 个与抗旱相
关的 DREB基因片段。
近年来,很多学者对 DREB 转录因子进行了研究,如潘
孝武等[10]利用拟南芥 DREB1序列在水稻全基因组中进行检
索,得到 9 个同源基因。其中,有 3 个基因的保守区域与
DREB1存在较高相似性。李聪等[11]通过 RT-PCR技术对转
OjDREB基因的烟草进行研究结果表明过量表达 OjDREB基
因可提高烟草的耐盐能力,与野生型对照相比,转基因烟草
的叶绿素含量和 SOD酶活性大幅增大,而 MDA含量和电解
质渗透率却下降近一半。王源等[7]将用玉米 ZmDREB3 基
因参与构建的植物表达载体转化玉米自交系吉 444、Mo17,
并对 7株草甘膦抗性植株进一步进行 PCR-Southern检测,得
到 2个同时整合 EPSPS标记基因和 ZmDREB3 目的基因的
转基因株系。文益东等[12]对转 AtDREB2A基因苜蓿的研究
发现,AtDREB2A基因的超量表达提高了转基因苜蓿的耐碱
能力,在碱胁迫(100 mmol /L,pH 8. 5)下,相对质膜透性及丙
二醛含量显著降低,叶绿素含量和根系活力明显提高。
DREB主要由 DREB1 和 DREB2 2 个亚家族成员组成,
分别受低温和干旱诱导,是调控植物对多种非生物逆境胁迫
相关基因表达的转录因子之一[13]。因此,运用分子生物技
术,通过转化 DREB类转录因子进行作物抗逆性改良,有着
广阔的前景,是今后抗性育种的重要方向。
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(下转第 4728页)
6274 安徽农业科学 2013 年
随着消毒时间的增加,外植体污染率降低,成活率升高,当消
毒时间为 11 min 时,成活率开始降低,为 73. 33%。
表 1 不同消毒时间对‘盛夏红酒’成活率的影响
消毒时间
min
处理
瓶数
污染数

污染率
%
成活数

成活率
%
8 45 21 46. 67 a 21 46. 67 c
9 45 16 35. 56 b 27 60. 00 d
10 45 8 17. 78 c 37 82. 22 a
11 45 9 20. 00 c 33 73. 33 b
注:同列不同小写字母表示差异显著(P <0. 05),下同。
2. 2 不同浓度 6-BA对‘盛夏红酒’愈伤诱导的影响 由表
2可看出,‘盛夏红酒’在③号培养基上愈伤组织诱导率显著
高于其他 3 种培养基,愈伤组织诱导率最高,达 57. 14%。
①、②和④ 3 种培养基的愈伤组织诱导率差异不显著。因
此,‘盛夏红酒’初代培养最佳培养基为 MS + 6-BA 2. 0 mg /L
+ IBA 0. 2 mg /L。
表 2 不同培养基对‘盛夏红酒’愈伤诱导的影响
培养基
编号
接种数

成活数

愈伤块
数∥块
愈伤组织
诱导率∥%
① 30 22 7 31. 82 b
② 30 19 6 31. 57 b
③ 30 21 12 57. 14 a
④ 30 18 8 44. 44 b
2. 3 不同培养基对‘盛夏红酒’增殖的影响 将诱导出的愈
伤组织转入含不同激素配比的继代培养基中,1周后,淡黄色
的愈伤组织逐渐变绿,开始产生许多新生芽点。由表 3 可
知,‘盛夏红酒’在MS +6-BA 1. 5 mg /L + IBA 0. 2 mg /L培养
基上的繁殖系数最高,达 4. 9,且芽体健壮。因此确定 MS +
6-BA 1. 5 mg /L + IBA 0. 2 mg /L为最佳的增殖培养基。
表 3 不同浓度生长调节剂对‘盛夏红酒’继代培养的影响
增殖培养基 繁殖系数 不定芽生长状况
MS +6-BA 1. 5 mg /L + IBA 0. 2 mg /L 4. 9 叶翠绿,较健壮
MS +6-BA 2. 0 mg /L + IBA 0. 2 mg /L 3. 5 叶翠绿,苗弱
MS +6-BA 2. 5 mg /L + IBA 0. 2 mg /L 3. 0 叶翠绿,苗细,弱
2. 4 生根培养 从表 4可看出,NAA 0. 5 mg /L为‘盛夏红
酒’最适生根浓度,此时生根率、平均根数和平均根长度最
高,分别达 92. 5%、3. 35 条、3. 75 cm。当 NAA 的浓度超过
0. 5 mg /L时,生根率降低,因此最佳生根培养基为 1 /2MS +
NAA 0. 5 mg /L。
表 4 附加不同浓度生长调节剂对‘盛夏红酒’生根的影响
生根培
养基
接种数

生根
株数

生根率
%
每苗平
均根数

平均根
长度
cm
1 /2MS + NAA 0. 1 mg /L 80 60 75. 0 b 2. 45 3. 14
1 /2MS + NAA 0. 3 mg /L 80 62 77. 5 b 2. 87 3. 35
1 /2MS + NAA 0. 5 mg /L 80 74 92. 5 a 3. 35 3. 75
1 /2MS + NAA 0. 7 mg /L 80 56 70. 0 b 2. 55 2. 30
2. 5 炼苗和移栽 表 5结果表明,移栽苗在蛭石∶草炭体积
比1∶ 1基质中的成活率高于草炭和蛭石处理,达 95%,因此蛭
石∶草炭 =1∶ 1是最佳的移栽基质。
表 5 不同基质类型对‘盛夏红酒’出苗的影响
基质类型 出苗率∥% 死亡率∥%
草炭 90 10
蛭石 91 9
蛭石∶草炭 = 1∶ 1 95 5
3 结论
试验以大花萱草‘盛夏红酒’健壮花梗为外植体进行组
织培养,发现:0. 1%升汞消毒 10 min 是最佳的处理时间,成
活率为 82. 22%;初代培养最佳培养基为 MS + 6-BA 2. 0
mg /L + IBA 0. 2 mg /L;MS +6-BA 1. 5 mg /L + IBA 0. 2 mg /L
为最佳增殖培养基;1 /2MS + NAA 0. 5 mg /L是最佳生根培养
基,生根率达 92. 5%;移栽基质采用蛭石∶草炭 = 1∶ 1最好,成
活率高,达 95%。
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