全 文 :新疆三芒草 DREB基因片段的克隆
梁红艳1,2 (1.三门峡职业技术学院生化工程系,河南三门峡 472000;2.石河子大学农学院,新疆石河子 832003)
摘要 [目的]克隆新疆三芒草 DREB基因片段。[方法]利用 PCR技术和 RACE技术,从新疆沙漠边缘抗旱植物三芒草中克隆抗旱相
关基因 DREB片段。[结果]研究克隆到了 4个 DREB基因片段。[结论]该研究为进一步获得 DREB基因全序列和研究植物抗旱分子
机理、培养抗旱作物品种奠定了基础。
关键词 新疆三芒草;DREB;克隆
中图分类号 S544 + . 9 文献标识码 A 文章编号 0517 -6611(2013)11 -04725 -02
DREB Gene Fragments Clone of Aristida pennata in Xinjiang
LIANG Hong-yan (Biochemical Engineering Department,Sanmenxia Polytechnic,Sanmenxia,Henan 472000)
Abstract [Objective]The paper was to clone DREB gene fragments of Aristida pennata in Xinjiang. [Method]Using the PCR and RACE tech-
nology,the segments of drought - resistant related gene DREB were cloned from A. pennata at the edge of desert in Xinjiang. [Result]Four
DREB gene fragments were cloned. [Conclusion]The study laid a foundation for the further obtainment of complete sequence of DREB gene,
study of drought - resistant molecular mechanism of plants and cultivation of drought - resistant crops varieties.
Key words Aristida pennata in Xinjiang;DREB;Clone
作者简介 梁红艳(1978 - ),女,山西忻州人,讲师,硕士,从事生物技
术方面的研究,E-mail:hongyanliang2001@ aliyun. com。
收稿日期 2013-03-18
水资源短缺可严重影响植物的生长发育,造成作物减产
和生态环境恶化,是制约我国内陆地区农业生产的主要因素
之一[1]。提高作物的抗旱能力,积极培育耐旱作物品种及高
效利用有限的淡水资源是现代植物育种工作急需解决的
问题。
DREB(干旱应答元件结合蛋白)转录因子能调控多个与
干旱、高盐及低温耐性有关的功能基因表达[2],所以可利用
DREB转录因子来改良作物的抗旱性能。目前,人们已在烟
草[3]、小麦[4]、大麦[5]、水稻[6]、玉米[7]、番茄[8]等植物中找到
了相似的转录因子,为 DREB转录因子在改良植物抗逆性基
因工程中的应用创造了条件。
三芒草(Aristida pennata)为禾本科(Poaceae)三芒草属
植物,主要分布于我国新疆、内蒙古等省(区),抗旱能力极
强[9],可作饲料,且抗高温、耐盐碱,是重要的沙漠草本植物
之一。目前,尚未见对三芒草进行 DREB 基因克隆的报道。
笔者以新疆三芒草为研究材料,利用 PCR 技术和 RACE 技
术,克隆抗旱相关基因 DREB 片段,为进一步获得该基因全
序列,研究植物抗旱分子机理、培育抗旱作物品种奠定基础。
1 材料和方法
1. 1 材料 供试三芒草植株采自北疆沙漠边缘,冻存后用
于总 RNA的提取;RNA提取试剂盒、反转录试剂盒、回收试
剂盒均购自上海生工生物工程技术服务有限公司(上海生
工),EcoRⅠ限制性内切酶、T4 连接酶、Marker 等试剂材料由
三门峡职业技术学院生化工程系实验室提供,所用 T载体为
pGEM-T,购自 Promaga公司。
1. 2 引物设计与合成 利用小麦、山羊草等禾本科植物
DREB基因的保守区设计简并引物,引物设计软件为 Prime
Premier5. 0,引物序列为 5-GNTTYMGNGGNGTNMGNCA-3和
3-CGNRANCGNKCNTGNTTR-5,由上海生工生物工程技术
服务有限公司合成。
1. 3 DREB基因片段的克隆 用 RNA 提取试剂盒提取三
芒草的总 RNA,具体步骤参考试剂盒说明书,略加改动;总
RNA经琼脂糖凝胶电泳检测后,通过反转录试剂盒,按表 1
体系和步骤获取 cDNA第 1链;再按表 2 的反应体系和程序
进行 PCR,PCR反应产物置于 -20 ℃保存。
表 1 反转录体系及步骤
试剂 用量 操作步骤
总 RNA 0. 1 ~0. 5 μg 混匀,离心 3 ~ 5 s 后,70℃
水浴 5 min,置于冰上冷却,
离心机收集液体
Oligo(dT)18 primer (0. 5
μg /μl)
1 μl
DEPC H2O 补足至 10 μl
5 × reaction buffer 4 μl 冰上加入左侧成份,混匀,
离心 3 ~ 5 s,37 ℃水浴 5
min
RibolockTM inhibito (20
U /μl)
1 μl
10 mmol /L dNTPs 2 μl
反转录酶(200 U /μl) 1 μl 42 ℃水浴 60 min 后,70 ℃
水浴 10 min,停止反应,置
于冰上
ddH2O 补足至 20 μl
表 2 PCR扩增体系及程序
反应体系 用量∥μl 扩增程序
primer(20 ng /μl) 1. 0 94 ℃预变性,2 min→
Oligo(dT)18(0. 5 μg /μl) 3. 0 (94 ℃变性 30 s→退火温
Mg2 + 15 mmol /L 1. 0 度,1 min→72 ℃延伸 45
10 × PCR Buffer 2. 5 s),39个循环→72 ℃延
dNTPs(10 mmol /L) 0. 5 伸 10 min→4 ℃备用
cDNA 0. 5
Taq酶(5 U /μl) 0. 5
ddH2O 16. 0
安徽农业科学,Journal of Anhui Agri. Sci. 2013,41(11):4725 - 4726,4728 责任编辑 朱琼琼 责任校对 况玲玲
DOI:10.13989/j.cnki.0517-6611.2013.11.122
琼脂糖电泳检测 PCR 产物后,先用试剂盒回收特异片
段;再依次进行大肠感受态细胞的制备(GaCl2 法)、连接反
应(回收片段 4 μl + 2 × Lig Buffer 5 μl + T载体 0. 5 μl +连接
酶)和热击转化;然后在 LB平板上通过蓝白斑挑阳性克隆,
提取质粒并进行质粒酶切(体系为 EcoRⅠ1 μl + 10 × Buffer 2
μl +质粒 5 μl + ddH2O补足至 20 μl),酶切完毕进行琼脂糖
电泳检测,经鉴定的阳性克隆可进行序列测定。
2 结果及分析
2. 1 三芒草 DNA、总 RNA 的提取及 cDNA 的获得 利用
RNA提取试剂盒提取了新疆三芒草的总 RNA(图 1),在此
基础上反转录获得了 cDNA。
图 1 新疆三芒草总 RNA的提取
2. 2 三芒草 DREB基因特异片段的获得 以三芒草的 cD-
NA为模板,用设计的 DREB简并引物进行扩增,扩增产物用
1. 2%琼脂糖凝胶进行电泳,结果如图 2 所示。扩增产物条
带分布范围较大,不能有效区分扩增片段的数量,因此改用
分辨率更高的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)进行检测(图
2),发现扩增产物包含 4 个特异片段,分子量在 600 ~ 1 000
bp之间。
图 2 琼脂糖凝胶电泳(左)和 PAGE电泳(右)结果
2. 3 三芒草 DREB 基因片段的克隆 用试剂盒回收琼脂
糖电泳检测的 PCR产物,经与 T载体连接后,转化至大肠杆
菌感受态细胞中,筛选到 4个阳性克隆,提取其中的质粒,并
进行酶切和检测,结果如图 3 所示,筛选的 4 个阳性克隆中
的基因片段分子量并不相同,印证了前述聚丙烯酰胺凝胶电
泳的结果。
注:M. DNA Marker;h4为 4个阳性克隆的酶切产物。
图 3 重组质粒的酶切结果
3 结论与讨论
该研究从北疆沙漠边缘抗旱植物三芒草中提取了总
RNA,利用 PCR技术和 RACE技术,克隆到了 4 个与抗旱相
关的 DREB基因片段。
近年来,很多学者对 DREB 转录因子进行了研究,如潘
孝武等[10]利用拟南芥 DREB1序列在水稻全基因组中进行检
索,得到 9 个同源基因。其中,有 3 个基因的保守区域与
DREB1存在较高相似性。李聪等[11]通过 RT-PCR技术对转
OjDREB基因的烟草进行研究结果表明过量表达 OjDREB基
因可提高烟草的耐盐能力,与野生型对照相比,转基因烟草
的叶绿素含量和 SOD酶活性大幅增大,而 MDA含量和电解
质渗透率却下降近一半。王源等[7]将用玉米 ZmDREB3 基
因参与构建的植物表达载体转化玉米自交系吉 444、Mo17,
并对 7株草甘膦抗性植株进一步进行 PCR-Southern检测,得
到 2个同时整合 EPSPS标记基因和 ZmDREB3 目的基因的
转基因株系。文益东等[12]对转 AtDREB2A基因苜蓿的研究
发现,AtDREB2A基因的超量表达提高了转基因苜蓿的耐碱
能力,在碱胁迫(100 mmol /L,pH 8. 5)下,相对质膜透性及丙
二醛含量显著降低,叶绿素含量和根系活力明显提高。
DREB主要由 DREB1 和 DREB2 2 个亚家族成员组成,
分别受低温和干旱诱导,是调控植物对多种非生物逆境胁迫
相关基因表达的转录因子之一[13]。因此,运用分子生物技
术,通过转化 DREB类转录因子进行作物抗逆性改良,有着
广阔的前景,是今后抗性育种的重要方向。
参考文献
[1]BAO W. The impact of arid climate change on agriculture of dry valley in
Southwest China and its adaptive countermeasures[J]. Agricultural Sci-
ence & Technology,2011,12(5):733 -736.
[2]刘强,赵南明. DREB转录因子在提高植物抗逆性中的作用[J].科学通
报,2000(1):11 -16.
[3]冯锋.烟草中 DREB转录因子的克隆和功能分析[D].长沙:河南农业
大学,2008.
[4]梁欣欣.利用 DREB转录因子改良小麦耐盐性的研究[D].北京:中国
农业科学院,2004.
[5]周磊.野生型与耐盐型短芒大麦基因序列差异和盐碱胁迫条件下基因
表达差异的研究[D].长春:吉林大学,2010.
(下转第 4728页)
6274 安徽农业科学 2013 年
随着消毒时间的增加,外植体污染率降低,成活率升高,当消
毒时间为 11 min 时,成活率开始降低,为 73. 33%。
表 1 不同消毒时间对‘盛夏红酒’成活率的影响
消毒时间
min
处理
瓶数
污染数
个
污染率
%
成活数
个
成活率
%
8 45 21 46. 67 a 21 46. 67 c
9 45 16 35. 56 b 27 60. 00 d
10 45 8 17. 78 c 37 82. 22 a
11 45 9 20. 00 c 33 73. 33 b
注:同列不同小写字母表示差异显著(P <0. 05),下同。
2. 2 不同浓度 6-BA对‘盛夏红酒’愈伤诱导的影响 由表
2可看出,‘盛夏红酒’在③号培养基上愈伤组织诱导率显著
高于其他 3 种培养基,愈伤组织诱导率最高,达 57. 14%。
①、②和④ 3 种培养基的愈伤组织诱导率差异不显著。因
此,‘盛夏红酒’初代培养最佳培养基为 MS + 6-BA 2. 0 mg /L
+ IBA 0. 2 mg /L。
表 2 不同培养基对‘盛夏红酒’愈伤诱导的影响
培养基
编号
接种数
个
成活数
个
愈伤块
数∥块
愈伤组织
诱导率∥%
① 30 22 7 31. 82 b
② 30 19 6 31. 57 b
③ 30 21 12 57. 14 a
④ 30 18 8 44. 44 b
2. 3 不同培养基对‘盛夏红酒’增殖的影响 将诱导出的愈
伤组织转入含不同激素配比的继代培养基中,1周后,淡黄色
的愈伤组织逐渐变绿,开始产生许多新生芽点。由表 3 可
知,‘盛夏红酒’在MS +6-BA 1. 5 mg /L + IBA 0. 2 mg /L培养
基上的繁殖系数最高,达 4. 9,且芽体健壮。因此确定 MS +
6-BA 1. 5 mg /L + IBA 0. 2 mg /L为最佳的增殖培养基。
表 3 不同浓度生长调节剂对‘盛夏红酒’继代培养的影响
增殖培养基 繁殖系数 不定芽生长状况
MS +6-BA 1. 5 mg /L + IBA 0. 2 mg /L 4. 9 叶翠绿,较健壮
MS +6-BA 2. 0 mg /L + IBA 0. 2 mg /L 3. 5 叶翠绿,苗弱
MS +6-BA 2. 5 mg /L + IBA 0. 2 mg /L 3. 0 叶翠绿,苗细,弱
2. 4 生根培养 从表 4可看出,NAA 0. 5 mg /L为‘盛夏红
酒’最适生根浓度,此时生根率、平均根数和平均根长度最
高,分别达 92. 5%、3. 35 条、3. 75 cm。当 NAA 的浓度超过
0. 5 mg /L时,生根率降低,因此最佳生根培养基为 1 /2MS +
NAA 0. 5 mg /L。
表 4 附加不同浓度生长调节剂对‘盛夏红酒’生根的影响
生根培
养基
接种数
个
生根
株数
条
生根率
%
每苗平
均根数
条
平均根
长度
cm
1 /2MS + NAA 0. 1 mg /L 80 60 75. 0 b 2. 45 3. 14
1 /2MS + NAA 0. 3 mg /L 80 62 77. 5 b 2. 87 3. 35
1 /2MS + NAA 0. 5 mg /L 80 74 92. 5 a 3. 35 3. 75
1 /2MS + NAA 0. 7 mg /L 80 56 70. 0 b 2. 55 2. 30
2. 5 炼苗和移栽 表 5结果表明,移栽苗在蛭石∶草炭体积
比1∶ 1基质中的成活率高于草炭和蛭石处理,达 95%,因此蛭
石∶草炭 =1∶ 1是最佳的移栽基质。
表 5 不同基质类型对‘盛夏红酒’出苗的影响
基质类型 出苗率∥% 死亡率∥%
草炭 90 10
蛭石 91 9
蛭石∶草炭 = 1∶ 1 95 5
3 结论
试验以大花萱草‘盛夏红酒’健壮花梗为外植体进行组
织培养,发现:0. 1%升汞消毒 10 min 是最佳的处理时间,成
活率为 82. 22%;初代培养最佳培养基为 MS + 6-BA 2. 0
mg /L + IBA 0. 2 mg /L;MS +6-BA 1. 5 mg /L + IBA 0. 2 mg /L
为最佳增殖培养基;1 /2MS + NAA 0. 5 mg /L是最佳生根培养
基,生根率达 92. 5%;移栽基质采用蛭石∶草炭 = 1∶ 1最好,成
活率高,达 95%。
参考文献
[1]王学勇,徐振华,储博彦.大花萱草栽培管理技术[J].河北林业科技,
2002(2):49 -50.
[2]刘志洋,李海涛,朱祥春,等.大花萱草组织培养研究[J].东北农业大
学学报,2008,39(1):43 -45.
[3]赵玉芬,储博彦,尹新彦,等.大花萱草草工厂化快繁技术研究[J].北
方园艺,2011(2):152 -155.
[4]杨永花. 金娃娃萱草组织培养技术研究[J].甘肃农业科技,2003(12):
33 -35.
[5]杨丽莉,王德平,张晓,等. 以子房为外植体的‘金娃娃’萱草组织培养
技术的研究[J].中国农学通报,2012,28(25):184 -190.
[6]李秀华,杜贞,武银玉,等.大花萱草组培快繁体系的研究[J].植物研
究,2009,29(6):757 -762.
[7]王晓娟,金樑,陈家宽.大花萱草不同外植体诱导愈伤组织的比较研究
[J].生命科学研究,2005,9(3):242 -246.
[8]彭广霖,姜宁,潘仕梅,等.大花萱草的花梗组织培养与快速繁殖[J].
安徽农业科学,2012,40(17):9203 -9205.
[9]何琦,高亦珂.四倍体萱草减数分裂观察与花粉育性研究[J].华北农
学报,2011(S1):
檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪
47 -50.
(上接第 4726页)
[6]张亚洲.转 DREB1A基因水稻耐盐抗旱性鉴定及生理生化分析[D].
长沙:湖南农业大学,2010.
[7]王源,黄丛林,张秀海,等.转录因子基因 ZmDREB3 转化玉米的研究
[J].作物杂志,2012(3):58 -61.
[8]李峰,曹刚强,梁秋霞,等.农杆菌介导 Prd29A:DREB1A基因转化番茄
的研究[J].江苏农业科学,2008(4):68 -71.
[9]郭选政.典型沙生植物———三芒草[J].新疆畜牧业,1990(2):71.
[10]潘孝武,黎用朝,李小湘,等. CBF调节子在水稻品种日本晴和 93 -11
低温驯化过程中的差异调控机制[J].中国水稻科学,2012(5):521 -
528.
[11]李聪,郭梦阳,韩烈保,等.转 OjDREB基因提高烟草耐盐能力的研究
[J].中国烟草学报,2012(4):72 -76.
[12]文益东,才华,柏锡,等.转 AtDREB2A基因苜蓿的耐碱性分析[J].作
物杂志,2012(3):32 -35.
[13]王舟,刘建秀. DREB/CBF类转录因子研究进展及其在草坪草和牧草
抗逆基因工程中的应用[J].草业学报,2011(1):222 -236.
8274 安徽农业科学 2013 年