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柑橘砧木枳橙和香橙BOR2基因的克隆与缺硼胁迫下的表达分析



全 文 :2016 年第 57 卷第 1 期 65
檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪檪
表 2 4 个番茄品种的商品性状与产量表现
品种 株型 生长势 果形 果色 青肩 硬度 纵径 /横径 产量 / (t·hm -2)
钱塘红宝 无限生长 强 扁圆 大红 无 硬 0. 627 83. 98 a
钱塘明珠 无限生长 强 扁圆 大红 无 硬 0. 628 66. 15 b
钱塘旭日 无限生长 强 近圆 大红 无 硬 0. 844 69. 14 b
倍盈 (CK) 无限生长 强 扁圆 大红 无 硬 0. 617 68. 80 b
注:产量后无相同小写英文字母,表示其差异达显著水平。
3 小结
试验结果表明,4个番茄品种均适宜舟山地区越
冬种植,生长势强,果实硬度好,耐贮运,其中钱塘
红宝早熟性好,从播种到始收历时 154 d,采收期最
长,为 121 d,产量也最高,达到 83. 98 t·hm -2。
参考文献:
[1] 胡立军,王忠明,唐前虎,等. 番茄钱塘旭日的选育及栽
培技术 [J]. 浙江农业科学,2013 (7) :804-806.
[2] 应海良. 海岛推广蔬菜实用栽培技术 [M]. 北京:中国农
业科学技术出版社,2008:11.
[3] 杨新琴,赵建阳,胡美华,等. 高效蔬菜种植模式集萃
[M]. 浙江:浙江科学技术出版社,2010:9.
[4] 刘洁琪,张琴. 水肥一体化技术在小番茄上的应用效果
[J]. 浙江农业科学,2014 (11) :1702 - 1703.
(责任编辑:张才德)
收稿日期:2015-11-12
基金项目:高等学校博士学科点专项科研基金 (20130146110020)
作者简介:颜廷帅 (1989 -) ,男,山东临沂人,硕士,从事果树方面的研究工作,E-mail:yantingshuai@ kingenta. com。
文献著录格式:颜廷帅,罗庆,潘志勇,等. 柑橘砧木枳橙和香橙 BOR2 基因的克隆与缺硼胁迫下的表达分析 [J]. 浙江农业科学,2016,
57 (1) :65-68.
DOI:10. 16178 / j. issn. 0528-9017. 20160125
柑橘砧木枳橙和香橙 BOR2 基因的克隆与
缺硼胁迫下的表达分析
颜廷帅1,2,罗 庆1,潘志勇1,刘永忠1,彭抒昂1
(1. 华中农业大学 园艺植物生物学教育部重点实验室,湖北 武汉 430070;
2. 金正大生态工程集团股份有限公司 国家缓控释肥工程技术研究中心,山东 临沭 276700)
摘 要:以耐缺硼胁迫的枳橙 (Citrus sinensis (L.)Osb. × Poncirus trifoliata (L.)Raf.)和不耐缺硼胁迫的
香橙 (Citrus junos Sieb. ex Tanaka)为材料,克隆了拟南芥硼运输基因 AtBOR2 的同源基因枳橙 CpBOR2 和香橙
CjBOR2,进行相关生物信息学分析和缺硼胁迫下的表达分析。结果表明,CpBOR2 和 CjBOR2 的 ORF长度分别为
2 133 bp和 2 073 bp,CpBOR2 和 CjBOR2 蛋白都具有 7 个跨膜区域,且具有细胞膜极性定位和内吞降解的保守氨
基酸位点;缺硼胁迫下,CjBOR2 表达量与对照相比无显著变化,在前期降低,后期升高。
关键词:枳橙;香橙;BOR2;缺硼;克隆;qPCR
中图分类号:S666 文献标志码:A 文章编号:0528-9017(2016)01-0065-04
我国柑橘主产区主要位于南方多雨的山地丘陵
地区,土壤多为酸性的红黄壤,土壤状况较差,同
时南方湿润多雨,硼酸极易因淋溶作用而流失,因
此土壤缺硼的现象较普遍[1 - 2]。土壤缺硼易造成柑
橘老叶叶脉木栓化,树势早衰,果实产量和品质下
降,使产区农民遭受严重的经济损失[3]。
柑橘树体主要通过砧木根系吸收和转运硼,不
同的砧木可以影响树体的营养状况[4]。目前柑橘
砧木吸收和运输硼的机制还不清楚,最近在模式植
物拟南芥中发现 AtBOR2 在缺硼胁迫下硼的转运过
程中有重要作用:AtBOR2 定位于根部,转运共质
体的硼到质外体,促进细胞壁硼糖复合物的形成,
从而保证根部延长区细胞的正常伸长和硼向地上部
的转运,缺硼胁迫下 AtBOR2 表达量上升[5]。而柑
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橘砧木中 AtBOR2 的同源基因在缺硼胁迫下的作用
目前还不清楚,为了确定缺硼胁迫下不同柑橘砧木
中 AtBOR2 的同源基因表达量的变化,本试验所用
材料为耐缺硼胁迫的柑橘砧木枳橙和不耐缺硼胁迫
的柑橘砧木香橙[6],克隆枳橙 CpBOR2 和香橙
CjBOR2,并在缺硼胁迫下对水培条件下的枳橙和
香橙进行缺硼胁迫处理,通过 qPCR 技术,测定
CpBOR2 和 CjBOR2 表达量的变化,为进一步确定
柑橘吸收和转运硼的机制奠定基础。
1 材料与方法
1. 1 材料
试验材料为生长 3 个月的枳橙和香橙幼苗。
选取长势一致的枳橙和香橙幼苗转入 1 /2
Hoagland和 Aron (全浓度)溶液培养,每 2 h 通
气 15 min,在光周期为 16 h /8 h (L /D)和昼夜温
差为 28 ℃ /22 ℃的条件下,每 7 d 更换一次营养
液。待枳橙和香橙幼苗长出新根后分别随机分为两
组,分别移入含有 0 mg·L -1 (缺硼)和 0. 25 mg·
L -1 (对照)的 1 /2 Hoagland和 Aron (全浓度)溶
液培养 0 h,4 h,8 h,1 d,2 d,3 d 后采样,采
样部位分别为根、茎和叶,迅速置于液氮速冻,储
存于超低温冰箱 (- 80 ℃)备用。
1. 2 方法
1. 2. 1 CpBOR2 和 CjBOR2 的克隆
总 RNA的提取按照 Trizol 试剂盒 (Ambion 公
司)说明书进行。第一链 cDNA 的合成按照
PrimeScript RT reagent Kit (Perfect Real Time)试剂
盒 (TaKaRa 公 司)说 明 书 进 行。以 CsBOR2
(orange1. 1 t01735. 1)转录本序列为模板设计一对
引物 BOR2-F:CAGAACAATGGAAGAAAC 和 BOR2-
R: CTCCTGGAAAGTAGATAGATC, 以 第 一 链
cDNA为模板进行 PCR 扩增,扩增产物回收、纯
化,连接 pMD18-T 载体 (TaKaRa 公司) ,转化大
肠杆菌 DH5α 感受态细胞,筛选阳性克隆进行
测序。
1. 2. 2 生物信息学分析
生物信息学分析使用一系列在线服务工具和软
件,使用 ORF Finder 预测 ORF 区域 (http: / /
www. ncbi. nlm. nih. gov /gorf /gorf. html),使用 TMHMM
Server (http: / /www. cbs. dtu. dk /services /TMHMM/)
预测蛋白质跨膜区域,使用 ClustalW2 (http: / /
www. ebi. ac. uk /Tools /msa /clustalw2 /)进行蛋白质
多序列比对和一致性分析,使用 MEGA 5. 0 软件的
Neighbor-Joining算法构建蛋白质系统进化树[7-8]。
1. 2. 3 基因表达分析
以 β-Actin 为内参基因,定量引物为 Actin-F:
CCAAGCAGCATGAAGATCAA 和 Actin-R:ATCTGC
TGGAAGGTGCTGAG[9]。以测序所得基因转录本保
守序列为模板,设计一对引物 qBOR2-F:ATTCT
GCCCAAGTTTTTC和 qBOR2-R:GCACCCATCTGTG
TCTCT,以稀释 5 倍的样品 cDNA 为 qPCR 反应的
底物,按 照 SYBR Premix Ex Taq Ⅱ 试 剂 盒
(TaKaRa 公司)说明书进行反应,每个样品的
cDNA 扩增反应进行 4 次独立重复,利用 SPSS
16. 0 中 Duncan’s多重比较对结果进行显著性分析
(P < 0. 05)。
2 结果与分析
2. 1 CpBOR2 和 CjBOR2 的克隆与测序
CpBOR2 和 CjBOR2 的 PCR 扩增产物的电泳如
图 1,片段大小 2 000 ~ 3 000 bp。对 CpBOR2 和
CjBOR2 测序结果进行 ORF 预测发现 ORF 长度分
别为 2 133 和 2 073 bp。与甜橙数据库 CsBOR2
(orange1. 1t01735)的 ORF 序列进行相似性比对,
相似性分别为 99%和 99%,从而确定所克隆序列
为目的序列。
M表示 Marker,1表示 CpBOR2 PCR产物,2表示 CjBOR2 PCR产物
图 1 CpBOR2 和 CjBOR2 的 PCR扩增产物电泳图
2. 2 CpBOR2 和 CjBOR2 的生物信息学分析
CpBOR2,CjBOR2 和 CsBOR2 的多序列氨基酸
比对和跨膜区域预测表明 (图 2) ,CpBOR2 和
CjBOR2 都具有 7 个跨膜区域,CpBOR2 和 CjBOR2
都具有与 AtBOR1 相同的保守酪氨酸 (Y)位点和
赖氨酸 (K)位点[10-11],其中 CpBOR2 在第 41 ~
60 bp处比 CjBOR2 多出 20 bp。
构建 CpBOR2 和 CjBOR2 蛋白与其他植物
BOR2 蛋白的进化树 (图 3)表明,CpBOR2 和
CjBOR2 蛋白与甜橙 CsBOR2 蛋白的进化关系最近,
颜廷帅,等:柑橘砧木枳橙和香橙 BOR2 基因的克隆与缺硼胁迫下的表达分析 67
黑框所示为蛋白质跨膜区域,星号所示为保守酪氨酸位点,箭头所示为保守赖氨酸位点
图 2 枳橙 CpBOR2、香橙 CjBOR2 和甜橙 CsBOR2 蛋白氨基酸多序列比对和跨膜区域预测
所用序列的登录号为 AtBOR2 (NP_ 191786) ,OsBOR2 (DQ421408) ,
CsBOR2 (orange1. 1 t01735. 1) ,VvBOR2 (XP_ 002272575)
图 3 CpBOR2 和 CjBOR2 蛋白与其他植物
BOR2 蛋白的进化树分析
其次与同为多年生双子叶植物的葡萄 VvBOR2 进
化距离较近,与水稻 OsBOR2 蛋白的进化距离
最远。
2. 3 CpBOR2 和 CjBOR2 在缺硼胁迫下的表达
模式
为了确定 CpBOR2 和 CjBOR2 的表达情况,本
试验用 qPCR方法测定了 2 个基因在缺硼胁迫下各
个时期的表达量 (图 4)。缺硼胁迫下,CjBOR2 相
对于对照无显著变化;CpBOR2 在前期表达量显著
下降,8 h时最低,仅为对照的 0. 24 倍,后期表达
量上升,48 h 时最高,为对照的 5. 76 倍,且正常
硼浓度下 CpBOR2 的表达量变化也较 CjBOR2 表达
量变化剧烈。
3 讨论
缺硼是我国南方柑橘产区常见的现象,严重影
响南方柑橘产业的发展。最近发现拟南芥 AtBOR2
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A表示缺硼胁迫下根中 CjBOR2 表达量变化,B表示根中 CpBOR2 在缺硼胁迫下表达量变化
图 4 缺硼胁迫下根中 CpBOR2 和 CjBOR2 表达量的变化
可以应对一定程度的缺硼胁迫。柑橘为嫁接栽培,
主要通过砧木根系吸收和转运硼到地上部,本试验
以耐缺硼的砧木品种枳橙和不耐缺硼的砧木香橙为
材料,克隆了 AtBOR2 的同源基因 CpBOR2 和
CjBOR2,进行了相关生物信息学分析和缺硼胁迫
下的表达分析。
CjBOR2 较 CpBOR2 的氨基酸序列在 N 端缺失
了 20 bp,表明它们的蛋白质的功能可能出现了差
别。缺硼胁迫下耐缺硼胁迫的枳橙 CpBOR2 表达量
剧烈变化,响应缺硼胁迫,不耐缺硼的香橙
CjBOR2 的表达量与对照相比无显著变化,不响应
缺硼胁迫,表明 CpBOR2 在缺硼胁迫条件下可能参
与体内硼酸的运输从而调节体内硼浓度,而
CjBOR2 在香橙缺硼胁迫条件下的作用则不明显,
且正常情况下,CpBOR2 表达量的变化较 CjBOR2
更加剧烈。缺硼胁迫下 CjBOR2 与 CpBOR2 对植物
体内硼酸浓度调节能力的差异可能是造成 2 种砧木
耐缺硼能力的差异的原因之一。
参考文献:
[1] 刘秀红. 南丰和衢州柑橘园土壤与树体营养状况的分析
[D]. 武汉:华中农业大学,2014.
[2] 刘铮,朱其清,唐丽华. 我国缺硼土壤的类型和分布 [J].
土壤学报,1980,17 (3) :228-239.
[3] 张力田. 果树缺硼表现规律及土壤速效硼适宜含量探讨
[J]. 中国南方果树,1996,25 (1) :63.
[4] STOREY R,WALKER R R. Citrus and salinity [J]. Scientia
Horticulturae,1998,78 (1) :39-81.
[5] MIWA K,WAKUTA S,TAKADA S,et al. Roles of BOR2,a
boron exporter,in cross linking of rhamnogalacturonan Ⅱ and
root elongation under boron limitation in Arabidopsis [J].
Plant Physiology,2013,163 (4) :1699-1709.
[6] ZHOU G F,PENG S A,LIU Y Z,et al. The physiological and
nutritional responses of seven different citrus rootstock seedlings
to boron deficiency [J]. Trees,2014,28 (1) :295-307.
[7] SAITOU N,NEI M. The neighbor-joining method: a new
method for reconstructing phylogenetic trees [J]. Molecular
Biology and Evolution,1987,4 (4) :406-425.
[8] TAMURA K,PETERSON D,PETERSON N,et al. MEGA5:
molecular evolutionary genetics analysis using maximum
likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony
methods [J]. Molecular Biology and Evolution,2011,28
(10) :2731-2739.
[9] 雷莹. 柑橘果实化渣性研究 [D]. 武汉:华中农业大
学,2010.
[10] KASAI K,TAKANO J,MIWA K,et al. High boron-induced
ubiquitination regulates vacuolar sorting of the BOR1 borate
transporter in Arabidopsis thaliana [J]. Journal of Biological
Chemistry,2011,286 (8) :6175-6183.
[11] YOSHINARI A, KASAI K, FUJIWARA T, et al. Polar
localization and endocytic degradation of a boron transporter,
BOR1,is dependent on specific tyrosine residues [J]. Plant
Signaling and Behavior,2012,7 (1) :46-49.
(责任编辑:张 韵)