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Cloning and Prokaryotic Expression of p38β MAPK from Lutjanus sanguineus

红笛鲷p38β MAPK基因的克隆及原核表达



全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2014年第12期
丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein
kinase,MAPK)是生物体内一类重要的丝氨酸 / 苏
氨酸蛋白激酶[1],它可通过磷酸化作用将胞外信号
转化到胞内,从而激活一系列的转录因子或其他效
应分子,使机体产生对外界刺激的应答[2]。MAPKs
包括 4 个亚家族 :细胞外调节激酶(ERK)、c-jun
收稿日期 : 2014-03-27
基金项目 :广东省国际合作项目(2012B050600029),广东高校国际合作创新平台项目(2013gjhz0008)
作者简介 :夏洪丽,女,硕士,研究方向 :水产动物病害防治 ;E-mail :xiahongli0427@163.com
通讯作者 :鲁义善,男,博士,硕士生导师,研究方向 :水产动物免疫学及病害防治 ;E-mail :fishdis@163.com
红笛鲷 p38β MAPK 基因的克隆及原核表达
夏洪丽1,2,3  蔡佳1,2,3  鲁义善 1,2,3  简纪常1,2,3  吴灶和2,3,4
(1. 广东海洋大学水产学院,湛江 524088 ;2. 广东省水产动物病原生物学及流行病学重点实验室,湛江 524088 ;3. 广东省教育厅水产经济
动物病害控制重点实验室,湛江 524088 ;4. 仲恺农业工程学院,广州 510225)
摘 要 : 鱼类 p38 MAPK 基因在宿主免疫调控及抵御病原侵染的过程中具有重要作用。利用 RACE 技术克隆了红笛鲷 p38β
MAPK 基因(Ls-p38β,GenBank 登录号为 KJ502277)。序列分析结果显示,Ls-p38β cDNA 全长 1 628 bp,开放阅读框 1 086 bp,可
编码 361 个氨基酸,预测其编码蛋白的分子量为 41.6 kD,理论等电点为 5.74。该基因推导的氨基酸序列含有 p38 MAPK 家族保守
的双磷酸化激活环(TGY),与尼罗罗非鱼的 p38β 有 97% 的相似性。将此基因定向插入原核表达载体构建重组表达质粒 pET32-
p38β 后导入 BL21(DE3)菌株,利用 IPTG 进行诱导表达。SDS-PAGE 与 Western blot 分析显示约在 60 kD 出现特异蛋白条带,与
预期分子量大小相符,说明 Ls-p38β 融合蛋白表达成功。
关键词 : 红笛鲷 p38β 丝裂原活化蛋白激酶 原核表达
DOI :10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2014.12.030
Cloning and Prokaryotic Expression of p38β MAPK from
Lutjanus sanguineus
Xia Hongli1,2,3 Cai Jia1,2,3 Lu Yishan1,2,3 Jian Jichang1,2,3 Wu Zaohe2,3,4
(1. Fisheries College,Guangdong Ocean University,Zhanjiang 524088 ;2. Guangdong Provincial Key Laboratory of Pathogenic Biology and
Epidemiology for Aquantic Economic Animals,Zhanjiang 524088 ;3. Key Laboratory of Control for Disease of Aquatic Animals of Guangdong
Higher Education Institutes,Zhanjiang 524088 ;4. Zhongkai University of Agriculture and Engineering,Guangzhou 510225)
Abstract: Humphead snapper(Lutjanus sanguineus)p38β MAPK(Ls-p38β)was cloned using RACE method. The GenBank
accession number is KJ502277. The full-length cDNA of p38β MAPK was 1 628 bp containing an open reading frame of 1 086 bp, encoding
361 amino acids with an estimated molecular weight of 41.6 kD and a theoretical pI of 5.74. Amino acid alignment indicated that Ls-p38β
possessed a Thr-Gly-Tyr(TGY)dual phosphorylation motif of p38 MAPK family and shared 97% similarity with Oreochromis niloticus p38β.
The prokaryotic expression vector pET-p38β was constructed and then transformed into BL21(DE3). SDS-PAGE and Western blotting
analysis indicated that the recombinant protein of Ls-p38β was successfully expressed and molecular weight of expressed fusion protein was
60 kD.
Key words: Lutjanus sanguineus p38β MAPK Prokaryotic expression
氨基末端激酶(JNK)、p38 MAPK 和大丝裂素活化
蛋白激酶 1(BMK1)。其中 p38 MAPK 能在宿主受
到紫外线照射、热激、高渗透压、炎症因子和生长
因子等外界刺激时被激活,进而参与炎症、细胞生长、
细胞分化和细胞死亡等多个生理过程[3]。
目 前, 已 报 道 的 p38 MAPK 基 因 包 括 p38α、
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2014年第12期178
p38β、p38γ、p38δ 四 种 亚 型[4,5-8], 其 中 p38α 和
p38β 几乎在所有组织都表达,p38γ 和 p38δ 只在肌
肉、胰腺、肠和肾等组织中表达[6,7,9]。该家族的
所有成员均具有“T-G-Y” 结构域[10],在 经典的
三级级联反应中,MAPK 激酶的激酶(MAPKKK)
和 MAPK 激酶(MAPKK)可以同时磷酸化激活环
“T-G-Y”中的 T(苏氨酸)和 Y(酪氨酸),从而
活化 p38 MAPK[11],调控下游基因的表达。哺乳动
物中 p38 MAPKs 参与了多种炎症因子,如 TNF-α、
IL-6 和 IL-2 的诱导表达,与机体炎症反应的调节
有关[12-15];此外,病毒感染也能激活哺乳动物 p38
MAPKs, 如 柯 萨 奇 病 毒 B3 型(coxsackievirus B3)
的感染能激活机体 p38,从而可抑制 p38 的磷酸化
并能够减少病毒诱导的细胞死亡以及病毒粒子的释
放[16];而在 2 型猪圆环病毒(PCV2)的感染中,
抑制 p38 MAPK 的激活能降低病毒诱导的 Caspase 活
性[17]。以上结果表明哺乳动物的 p38 MAPK 在宿主
免疫反应中发挥着重要作用。
目前,鱼类 p38 MAPK 仅在斑马鱼[18]、大西
洋鲑[19]和点带石斑鱼[20]等少数物种中有报道。红
笛鲷(Lutjanus sanguineus)是我国南方重要的海水
养殖鱼类,但近年来由于养殖密度的提高与养殖环
境的恶化,红笛鲷养殖中病害频发[21]。鉴于鱼类
p38 MAPK 在免疫调控及抵御病原侵染发挥着重要
的作用[19,20,22-24],且目前学术界尚未见红笛鲷 p38
MAPK 的相关研究报道,本研究通过同源克隆与
RACE-PCR 扩增得到了红笛鲷 p38β cDNA 全长序列
(Ls-p38β),并成功获得了体外表达的重组蛋白,为
后续该基因的功能研究奠定坚实的基础。
1 材料与方法
1.1 材料
试验用鱼(500 g 左右)购于湛江市东风市场 ;
克隆载体 pMD18-T Vector 购自 TaKaRa 公司 ;UNIQ-
10 柱式 Trizol 总 RNA 抽提试剂盒购自上海生工生物
技术有限公司 ;Ex Taq DNA 聚合酶、PrimeSTARTM
HS(Premix)、Reverse Transcriptase M-MLV 购自 Ta-
KaRa 公司 ;SMARTerTM RACE 试剂盒购自 CLONTE-
CH ;DNA 胶回收试剂盒购自 Thermo 公司 ;限制性核
酸内切酶 EcoR I 和 Xho I、T4 DNA 连接酶购自 NEB
公司 ;PCR 引物均由上海生工生物技术有限公司合
成 ;Eschericia coli DH5α 和 BL21(DE3) 菌 株、 原
核表达载体 pET-32a(+)Vector 由本实验室保存。
1.2 方法
1.2.1 总 RNA 的提取 无菌操作取红笛鲷脾脏组织
10-20 mg,加入 1 mL Trizol,研磨处理,按的 UNIQ-
10 柱式 Trizol 总 RNA 抽提试剂盒(上海生工)说明
书提取红笛鲷脾脏组织的总 RNA。
1.2.2 片段扩增 利用所得到的 mRNA,按照 Ta-
KaRa 公司的 Reverse Transcriptase M-MLV 说明书进
行 cDNA 第一链的合成,根据已报道的人类(NP_0-
02742)、小家鼠(NP_035291)、斑马鱼(NP_001002095)
和点带石斑鱼(JN408833)p38β 基因设计简并引物
p38-F 和 p38-R(表 1),以上述 cDNA 为模板,在下
列缓冲体系中 :模板 1 μL,引物 p38-F、p38-R 各 1
μL,Ex Taq buffer 2.5 μL,dNTP 2 μL,Ex Taq 0.2 μL,
ddH2O 补足至 25 μL。按照如下程序进行 PCR 反应 :
94℃预变性 3 min ;94℃ 30 s,60℃ 30 s,72℃ 30 s,
共 34 个循环,72℃延伸 10 min。电泳检测 PCR 产
物,将目的条带切胶回收,回收产物连接 pMD18-T
载体,转化到 DH5α 感受态细胞中,挑取单菌落,
利用菌落 PCR 鉴定,将阳性克隆送到上海生工测序。
1.2.3 RACE PCR 扩增 p38β 的全长 根据所得基因
片段,设计 3RACE 特异性引物 3-1、3-2 和 5RACE
特异性反向引物 5-1、5-2(表 1),RACE PCR 模板
的制备参照 CLONTECH 的 SMARTerTM RACE 试剂盒
说明书。利用 3/5 cDNA 一链,特异引物 3-1/5-1
和 UPM Mix 进行第一轮 PCR 扩增,反应体系如下 :
3/5 cDNA 一链 1 μL,UPM Mix 1 μL,3-1/5-1 1 μL,
Primer Star Mix 10 μL,ddH2O 补足至 20 μL。PCR 反
应条件 :98℃预变性 3 min ;94℃ 30 s,72℃ 2 min,
4 个循环 ;94℃ 30 s,70℃ 30 s,72℃ 1 min 4 个循
环 ;94℃ 30 s,68℃ 30 s,72℃ 1 min,24 个循环 ;
72℃延伸 10 min 。将第一轮的 PCR 产物稀释 10 倍
作为模板,进行巢式 PCR,反应体系如下 :模板
1 μL,引物 3-2、5-2 各 1 μL,LA Taq buffer 2.5 μL,
dNTP 2 μL,LA Taq 0.2 μL,ddH2O 补足至 25 μL。反
应条件为 98℃预变性 3 min ;94℃ 30 s,68℃ 30 s,
72℃ 1 min,34 个循环,72℃延伸 10 min。3 巢式
2014年第12期 179夏洪丽等 :红笛鲷 p38β MAPK 基因的克隆及原核表达
PCR 产物的切胶回收,连接,转化,菌落 PCR 鉴定,
测序同 1.2.2。
表 1 本试验所用引物
引物 序列(5-3)
p38-F CAGGAGVTVAMYAARAVATHTGGGAGGT
p38-R ACATTWTCRTGYYTCATRTGYTTGAG
3-1 CCGGAGCGGTACCAGAACCTG
3-2 GATGTCGTCCTGCGGCAGAAG
5-1 CAGGTTCTGGTACCGCTCCGG
5-2 ACCTCCCAGATGGTCTTATTGA
UPM MIX CTAATACGACTCACTATAGGGC
NUP AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT
pET-p38-F CGGAATTCATGTCCGCCAGACCAGGATTTT
pET-p38-R CCGCTCGAGTTACTGCTCCACCTGAAGGCTATCA
1.2.4 序列分析 测序结果经 DNAMAN 软件拼接
得到的 cDNA 序列在 NCBI 上进行同源比对和相似
性 分 析 ;利 用 NCBI 的 ORF finder 确 定 ORF, 利
用 Genetyx 7.0 翻译得到氨基酸序列 ;利用 Clustal X
2.0 进行氨基酸多重序列比对 ;利用 Clustal X 2.0 和
MEGA 5.0 构建系统进化树。
1.2.5 构建重组质粒 根据测序结果,设计 p38β
基因的开放阅读框的引物。在引物的 5 和 3 端分
别加上 EcoR I 和 Xho I 酶切位点。扩增红笛鲷 p38β
的 ORF, 所 得 PCR 产 物 切 胶 回 收 后 与 T 载 体 连
接、转化、阳性克隆鉴定方法同 1.2.2。将构建成
功的质粒命名为 pMD18-p38β,根据全式金公司的
EasyPure Plasmid MiniPrep Kit 说明书提取 pET-32a 以
及 pMD18-p38β 质粒。利用 EcoR I 和 Xho I 分别对其
进行双酶切,将酶切产物用 T4 连接酶连接,其余步
骤同 1.2.2。将测序正确的克隆命名为 pET-p38β,扩
大培养后提取质粒转化到 BL21 感受态细胞,阳性
克隆鉴定同 1.2.2。
1.2.6 重组蛋白的诱导表达 阳性克隆菌液接种于
50 mL LB 液体培养基(Amp+),37℃,200 r/min 培
养过夜,次日按 1∶100 接种到新的 LB 培养基(Amp+)
中,37℃培养至 OD 值为 0.4-0.6 时,加入 IPTG 至
终浓度为 0.7 mmol/L,37℃继续振荡培养,6 h 后离
心收集沉淀,用 PBS 重悬菌体,置于冰上进行超声
破碎,SDS-PAGE 检测蛋白表达情况。
1.2.7 Western blot 分析 使用 Bio-Rad 公司的蛋白
印迹装置将 pET-p38β 蛋白的电泳产物转印到 PVDF
膜上,用 6-His-Tag 单克隆抗体作为一抗,37℃孵育
2 h ;TBST 清洗 4 次,每次 10 min ;HRP-标记的羊
抗鼠 IgG 作二抗,孵育 2 h,TBST 清洗 4 次,每次
10 min ;加入 DAB 显色液至有清晰的目的条带出现,
用 ddH2O 终止反应,并冲洗 10 min 以终止显色,拍
照记录。
2 结果
2.1 红笛鲷p38β基因的克隆
红笛鲷 p38β 基因 cDNA 序列全长 1 628 bp,包
括 5UTR 108 bp、3UTR 434 bp 和 ORF 1 086 bp,
可 编 码 361 个 氨 基 酸( 图 1), 预 测 蛋 白 分 子 量
41.6 kD。
2.2 序列分析
氨基酸的比对结果(图 2)显示 Ls-p38β 的氨基
酸序列与尼罗罗非鱼(O.niloticus)、斑马鱼(D.rerio)、
青鳉(O.latipes)、点带石斑鱼(E.coioides)、红鳍东
方鲀(T.rubripes)高度同源(图 3),其中与尼罗罗
非鱼的氨基酸序列相似度高达 97%。
2.3 原核表达
SDS-PAGE 电 泳( 图 4) 表 明, 重 组 质 粒
pET32-p38β 在大肠杆菌 BL21 中表达,表达的融合
蛋白分子量约 60 kD,和理论值相符。Western blot
检测结果和 SDS-PAGE 电泳结果一致。
3 讨论
p38 MAPK 是一类真核生物中高度保守的信号
转导因子,在多种生理及病理过程中扮演着重要角
色。目前 p38MAPK 的功能研究主要集中在大西洋
鲑[19]和点带石斑鱼[20]中,在其他鱼类的研究中还
相对较少。本试验克隆得到了红笛鲷 p38β MAPK 基
因(Ls-p38β),氨基酸序列比对结果显示,Ls-p38β
与其他鱼类的 p38β 相似度较高,进化分析显示 Ls-
p38β 与其他鱼类的 p38β 聚为一枝,与哺乳类 p38β
蛋白进化距离较远,表明鱼类 p38β 具有高度保守性。
氨基酸序列分析表明 Ls-p38β 具有该家族保守
的“T-G-Y”结构域和“ATRW”底物结合位点。两
者在 p38 MAPK 的磷酸化以及与底物的相互作用中
都具有重要作用。“T-G-Y”三肽序列存在于蛋白
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2014年第12期180
图中用灰色阴影标记的氨基酸表示“T-G-Y”结构域和“ATRW”底物结合位点 ;黑体字和 * 分别代表起始和终止密码子
图 1 红笛鲷 p38β 基因 cDNA 全长及编码的氨基酸序列
激酶第Ⅶ和第Ⅷ结构域之间,该区域被称作 T 环
(L12 环状结构),由于 T 环最接近激活位点,是决
定 MAPK 激酶活性的关键部分,T 环的长度会影
响其底物的特异性和自主磷酸化作用[25]。研究表
明,哺乳动物 p38β 的 T 环结构较短,使得 Y(酪氨
酸)位点难以被磷酸化。经典的 MKK 途径通过同
时磷酸化活化环上的苏氨酸和酪氨酸位点而激活人
类 p38 信号,但是 p38 活化还存在非经典的激活方
式。2005 年,Salvador 等[26]发现,在活化的人类 T
细 胞 中,ZAP-70 磷 酸 化 p38α 和 p38β 的 Tyr323 以
后,引起 Thr180 和 Tyr182 发生自身磷酸化,从而
导致 p38 信号被激活。近年来越来越多的研究表明,
p38 MAPK 在炎症反应和细胞因子表达的调控中都
发挥着关键作用[27],姜勇和 Chen 等[28-31]通过 p38
MAPK 无活性突变体以及负显性突变技术,发现哺
乳类 p38 MAPK 发挥生物功能依赖于“T-G-Y”结构
域 和 Thr180、Tyr182 位 点。2011 年,Ulli 等[32] 通
过研究大西洋鲑的 p38α 的结构及其新的功能域交
换的二聚活化模式,发现 Tyr323 的磷酸化及二聚化
能够活化 p38α 信号,揭示鱼类 p38 MAPK 的激活能
够通过一种非经典的磷酸化传导构象来完成。而本
研究中红笛鲷 p38β MAPK 是否也具备相似的特征还
有待于进一步的研究。而在本研究中鉴定的红笛鲷
p38β MAPK 也含有 p38 MAPK 家族保守的功能结构
2014年第12期 181夏洪丽等 :红笛鲷 p38β MAPK 基因的克隆及原核表达
L. sanguine :
O. niloticu :
E. coioides :
O. latipes :
T. rubripes :
D. rerio :
H. sapiens :
M. musculus:
L. sanguine :
O. niloticu :
E. coioides :
O. latipes :
T. rubripes :
D. rerio :
H. sapiens :
M. musculus:
L. sanguine :
O. niloticu :
E. coioides :
O. latipes :
T. rubripes :
D. rerio :
H. sapiens :
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O. niloticu :
E. coioides :
O. latipes :
T. rubripes :
D. rerio :
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H. sapiens :
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:79
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:80
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ED site TGY motif Substrate bindine site
:239
:239
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:240
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:320
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:361
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:364
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:159
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:159
:160
:160
箭头表示保守的氨基酸识别位点,方框表示“T-G-Y”磷酸化结构域和保守的底物结合位点“ATRW”
图 2 红笛鲷 p38β 与其他物种 p38β 氨基酸序列比对结果
M.musculus
H.sapiens
T.rubripes
X.maculatus
▲L.sanguineus
O.latipes
E.coioides
O.niloticus77
72
75
43
97
D.rerio
100
0.02
116.0
kD
M 1 2 3 4 5 6
66.2
45.0
35.0
25.0
18.4
▲表示红笛鲷 p38βMAPK 的氨基酸序列
图 3 红笛鲷 p38β 的进化分析
M :蛋 白 分 子 Marker ;1 :未 诱 导 pET32-p38β ;2 :诱 导 pET32-p38β ;
3 :pET32-p38β 诱导,超声分离的上清 ;4 :pET32-p38β 诱导、超声分离的沉
淀 ;5 :纯化的蛋白 ;6 :pET32-p38β 免疫印迹
图 4 pET32-p38β 重组蛋白的纯化与免疫印迹检测
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2014年第12期182
域“T-G-Y”,但是其作用模式及作用机制尚不清楚,
今后我们将通过定点突变、RNA 干扰等技术进一步
去验证,为阐明鱼类 p38 MAPK 的作用机制提供理
论依据。
pET 载体是目前应用最广泛的原核表达系统,
pET-32a 作为宿主菌,能够特异性地识别 T7 启动
子,并且该载体含有 His-Tag 标签,便于蛋白的分
离纯化。刘召民等[33]利用文昌鱼的 p38 重组蛋白
制备的(Amphi-p38)抗体进行了免疫组化试验,发
现 Amphi-p38 在体表皮、肠和肛盲囊都有强烈的表
达信号,这些组织和外界环境直接接触,是文昌鱼
抵御病原侵入的第一道防线,推测文昌鱼的 p38 可
能参与了机体的免疫防御过程。本试验通过构建原
核表达载体 pET32-p38β,成功获得了体外重组蛋白。
以上研究为进一步了解 Ls-p38β 在细胞中的分布和
功能奠定了坚实的基础。
4 结论
本研究从红笛鲷脾脏组织中克隆得到 p38β 基
因;Ls-p38β 具有保守的“T-G-Y”结构域和“ATRW”
底物结合位点,和其他已报道的 p38β 基因高度同源;
构建了原核表达载体 pET32-p38β,转化大肠杆菌,
通过诱导表达获得了大小约 60 kD 的 p38β重组蛋白。
参 考 文 献
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(责任编辑 李楠)