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Enhanced bioconversion of indene to cis-indandiol in an immersed membrane bioreactor with in situ adsorption

原位吸附浸没式膜生物反应器催化制备茚二醇



全 文 :第 12卷第 3期
2014年 5月
生  物  加  工  过  程
Chinese Journal of Bioprocess Engineering
Vol􀆰 12 No􀆰 3
May 2014
doi:10􀆰 3969 / j􀆰 issn􀆰 1672-3678􀆰 2014􀆰 03􀆰 001
收稿日期:2013-12-03
基金项目:国家自然科学基金(21306009)
作者简介:成喜雨(1980—),男,湖南长沙人,博士,讲师,研究方向:生物化工,E⁃mail:xycheng@ bjtu􀆰 edu􀆰 cn
原位吸附浸没式膜生物反应器催化制备茚二醇
成喜雨1,王  静2,柯  屾1
(1􀆰 北京交通大学 理学院 生命科学与生物工程研究院,北京 100044;
2􀆰 北京节能环保促进会,北京 100195)
摘  要:在浸没式膜反应器(IMB)中利用恶臭假单胞菌 ATCC 55687催化茚制备顺式茚二醇。 采用 25根膜丝制作
的膜组件,在茚为 3 g / L时,经过 24 h培养,IMB中顺式茚二醇产量达到悬浮细胞反应器(SCB)的 4倍多;进一步,
在培养开始阶段加入 10 g / L sp 207树脂进行原位吸附,IMB中顺式茚二醇产量最高达 709 mg / L,为 SCB产量的
660%,容积产率也从 SCB中的 6 mg / (L·h)提高到 30 mg / (L·h)。 在原位吸附 IMB中,中空纤维膜既可作为固定化
细胞载体,同时又可作为第二相吸附不溶性底物,降低底物和产物抑制,兼有固定化反应器和两相反应器的优点。
关键词:原位吸附;生物反应器;浸没式;顺式茚二醇;膜
中图分类号:Q815        文献标志码:A        文章编号:1672-3678(2014)03-0001-06
Enhanced bioconversion of indene to cis⁃indandiol in an
immersed membrane bioreactor with in situ adsorption
CHENG Xiyu1,WANG Jing2,KE Shen1
(1􀆰 College of Life Science and Bioengineering,School of Science,Beijing Jiaotong University,Beijing 100044,China;
2􀆰 Beijing Energy Conservation and Environmental Protection Promotionassociation,Beijing 100195,China)
Abstract:An immersed membrane bioreactor(IMB) with hollow fiber was fabricated for bioconversion of
indene to cis⁃indandiol by Pseudomonas putida ATCC 55687􀆰 Compared with suspension culture bioreactor
(SCB),an increase of more than four⁃fold of cis⁃indandiol at 3 g / L indene concentration was achieved for
24 h in the IMB with a module of 25 membranes􀆰 The performance of the IMB was further improved by in
situ adsorption and the highest product titer of 709 mg / L was achieved in the IMB with an addition of 10
g / L sp⁃207 resin at 0 h of fermentation,which was 660% of that in the SCB􀆰 The volumetric productivity
of 30 mg / (L·h) was also higher than that of the 6 mg / (L·h) in the SCB􀆰 The hollow fiber membranes in
the IMB served as a carrier to immobilize cells and a second phase to sequester insoluble reactant,thus
reducing inhibition of substrate as well as products and facilitating a more effective biotransformation by
combining with the advantages of the immobilized⁃cell bioreactor and the two⁃phase bioreactor􀆰
Key words:in situ adsorption;bioreactor;immersed;cis⁃indandiol;membrane
    全细胞生物催化是可持续药物生产过程中的
重要一环,该过程存在的一个主要问题是微生物所
面临的底物和产物抑制[1-3]。 恶臭假单胞菌催化茚
合成顺式茚二醇就是一个典型例子,在此过程中,
可以使用硅油建立液 液两相系统,降低茚对微生物
的抑制[4-5]。 但该过程存在的乳化问题,使下游产
物分离变得困难;也可以使用高分子聚合物建立
固 液两相系统,降低抑制的同时可以消除液 液两
相系统存在的乳化问题[6-7],然而,聚合物颗粒的大
量使用使过程复杂化,可能提高过程能耗和操作费
用。 膜反应器被报道可克服底物抑制,如利用中空
纤维膜固定化微生物,可以明显提高微生物对废水
中不同底物的耐受性[8-10]。
膜反应器用于废水处理已得到了广泛认可,由此
笔者提出采用浸没式膜反应器(IMB) 降低生物催化过
程中的抑制问题。 但在生物催化过程中底物的溶解
度、毒性均不同于废水组分,因此所提出的 IMB无论过
程操作还是机制都与传统的膜生物反应器不同。 在
IMB中,膜既作为载体固定化细胞,又可作为第二相来
吸附不溶性底物,从两方面降低过程抑制。 笔者对比
研究了 IMB和悬浮细胞反应器的性能,考察过程加强
机制,并进一步将原位吸附与 IMB耦合,以期提高过程
效率,为其在生物催化方面的应用打下基础。
1  材料和方法
1􀆰 1  试剂和菌株
茚购于 Sigma 公司,其中分析用的茚纯度为
98%,生物催化实验用的茚纯度为 90%;顺式茚二醇
购于美国 Wako 公司; TSA ( tryptic soy agar)、 TSB
(tryptic soy broth)培养基购于美国 BD Biosciences
公司;常规用化学试剂都购于 Sigma 公司或北京化
学试剂公司。
恶臭假单胞菌 ATCC55687 购于美国 ATCC 菌
种中心。 菌株用 TSA 斜面培养基传代保存。 种子
准备过程如下:从斜面挑取 1 环菌,接种于装有 150
mL TSB培养基的三角瓶中,三角瓶在 200 r / min、
30 ℃摇床上恒温培养过夜获得种子。
1􀆰 2  膜组件制备
实验用中空纤维膜为聚偏氟乙烯(PVDF)膜,
购于厦门鲲扬膜科技有限公司。 膜丝外径 2􀆰 2
mm,内有一聚酯支撑层,膜丝截面图见图 1。 其聚
酯支撑层由纤维细丝编网而成,纤维细丝间距 5
μm左右(图 1( b)和图 1( c))。 膜组件制备过程
如下:取一定数量 16 cm 长膜丝,将此组膜丝两端
长大约 2 cm 以内的膜丝之间均匀涂抹环氧树脂
胶,使 2 个端口的膜丝之间没有间隙,之后将这组
膜丝的两端置入长约 1􀆰 5 cm长的玻璃或者聚丙烯
小管内,将环氧树脂胶注入膜丝与小管之间间隙,
在恒温烘箱干燥 6 h 左右,直至胶完全干燥,用锋
利刀片切割两端获得平整断面,即获得膜组件。
取合适直径硅胶管连接小管和循环用管路,经过
灭菌后即可用于生物转化实验。
图 1  PVDF中空纤维膜扫描电镜照片
Fig􀆰 1  SEM images of PVDF hollow fiber membrane
2 生  物  加  工  过  程    第 12卷 
1􀆰 3  悬浮培养生物催化过程
实验采用悬浮细胞反应器(SCB) 作为 IMB 生物
催化过程的对照。 实验在装有 150 mL 培养基的 500
mL三角瓶中进行,压缩空气通过灭菌后的过滤器(美
国Milipore公司) 进行无菌过滤,然后以 75 mL / min的
速率通入三角瓶反应器中。 反应器的接种量为 2􀆰 5%
(体积分数),种子液吸光值约5。 生物催化反应所用培
养基为 MMG培养基[4],C 源为 20 g / L 葡萄糖。 茚作
为反应底物,在接种同时按照预定的浓度直接加入培
养基中,然后将三角瓶置于 200 r / min、30 ℃水浴摇床
进行反应,在设定的时间点取样 1 mL进行分析。
1􀆰 4  IMB生物催化过程
IMB实验装置如图 2所示。 IMB与 SCB相似,不
同的是三角瓶反应器加入了一个膜组件。 膜组件与
聚四氟乙烯(PTFE)循环管路连接,将膜组件浸入三
角瓶培养基中,然后用蠕动泵以 5 mL / min 速率将培
养基从三角瓶循环进入膜组件一端,从另一端返回三
角瓶中,其余所有操作条件同 SCB 反应器。 培养基
和器皿采用高温灭菌,而膜组件和循环管路采用 70%
乙醇溶液循环浸泡 5 h以上进行灭菌,之后用无菌蒸
馏水循环冲洗 6次以上,以去除酒精残留。
1—流量计;2—空气过滤器;3—水封瓶;
4—摇瓶反应器;5—膜组件;6—蠕动泵;7—PTFE管
图 2  IMB流程
Fig􀆰 2  Flow chart of the immersed
membrane bioreactor(IMB)
膜反应器中细胞固定化方法如下:将膜组件浸
入种子培养瓶中,连接循环管路,用蠕动泵将三角
瓶中种子液从膜组件一端泵入,种子液从膜组件另
一端返回三角瓶中,如此循环 12 h,使细胞吸附固定
到膜丝表面和内部聚酯纤维支撑层的细丝之间。
之后,将膜组件取出,用无菌蒸馏水轻轻淋洗表面,
再置入含 150 mL MMG 培养基的三角瓶反应器中,
同时将茚按照预定的浓度直接加入培养基中,然后
将三角瓶置于 200 r / min、30 ℃水浴摇床进行反应,
在设定的时间点取样 1 mL进行分析,每个实验设置
3个平行样。
原位吸收反应器设置与图 2 基本相同,不同的
是在反应开始时在反应器中添加 1个包含有灭菌树
脂的小包。 树脂 sp 207 购买自 Sigma 公司,树脂用
58 μm的尼龙布做成的小包包裹,采用 70%的酒精
溶液进行灭菌,之后用无菌蒸馏水清洗后用于生物
转化实验中。
1􀆰 5  分析
细胞浓度采用分光光度计测定,测定波长为
600 nm。 产物和副产物茚酮测定采用 HPLC 进行,
色谱条件如下:安捷伦 Zorbax RX C8色谱柱,紫外
检测器,检测波长为 220 nm,其余设置参照文献
[4]。 副产物茚酚市场上没有标准品,因此未进行
定量检测。 实验过程中收集一定量的样品,10 000
r / min离心 10 min,取上清,用 2 丙醇稀释,再使用
0􀆰 45 μm PVDF膜过滤后用于 HPLC分析。
茚不溶于水,同时反应过程可能吸附到膜组件
和反应器内壁,很难准确定量测定过程中茚浓度,
因此过程主要监测顺式茚二醇的浓度,最终通过产
物顺式茚二醇浓度和初始茚添加量计算产率。
2  结果和讨论
2􀆰 1  SCB中顺式茚二醇合成
首先对 SCB 中细胞生长和顺式茚二醇合成的
抑制情况进行了研究,作为 IMB 反应器运行结果的
对照,结果见图 3。 由图 3可知:在不添加底物茚的
MMG培养基中,恶臭假单胞菌 ATCC55687 生长几
乎没有延滞期,2 h 后开始对数生长,比生长速率达
0􀆰 6 h-1,8 h后生物生物量达到较高水平,之后进入
缓慢生长期,24 h 后 OD600达 5􀆰 3。 当反应器中加入
3 g / L茚作为底物,细胞生长受到明显抑制,比生长
速率降低到 0􀆰 4 h-1;当底物茚质量浓度增加到
6 g / L,细胞生长受到严重抑制,比生长速率降低到
0􀆰 3 h-1,24 h 后 OD600仅 1􀆰 6。
由图 3还可知:在茚质量浓度为 3 g / L时,4 h后
观察到顺式茚二醇的快速合成,12 h 后进入平台期,
18 h 后顺式茚二醇质量浓度达到 107 mg / L,平均容
积产率为 6 mg / (L·h),过程摩尔产率很低,只有 0􀆰 03
mol / mol(以 1 mol茚计)。 在 6 g / L茚条件下,顺式茚
二醇合成受到更严重抑制,顺式茚二醇质量浓度和摩
尔产率分别低至 84 mg / L和 0􀆰 01 mol / mol。
3  第 3期 成喜雨等:原位吸附浸没式膜生物反应器催化制备茚二醇
图 3  在 SCB中茚浓度对细菌生长和
顺式茚二醇合成的影响
Fig􀆰 3  Effects of indene on cell growth and cis⁃
indandiol biosynthesis in the SCB
在恶臭假单胞菌催化茚合成顺式茚二醇的模
式系统中,副产物比较多,这是其摩尔产率较低的
原因之一,同时,茚不溶于水,通气过程中气提作用
会造成底物损失,从而降低其产率[6]。 底物和产物
抑制是造成终产物浓度和摩尔产率降低的主要原
因之一[4],上述研究结果也表明,SCB 中细胞生长
和产物合成受到了明显抑制。
2􀆰 2  IMB中顺式茚二醇合成
进一步研究 IMB反应器降低上述全细胞催化过
程普遍存在的底物和产物抑制的效果。 IMB 中既有
固定化细胞(图 1(d)),又有悬浮细胞,因为膜组件上
吸附固定的微生物难以定量,因此对 IMB 中悬浮培
养物浓度进行了监测,评估 IMB 对微生物生长的影
响,结果见图 4。 由图 4可知:与 SCB相比,在使用 12
根膜丝的 IMB S中,即使在 6 g / L的高底物浓度下,
经过 4 h 的延滞期,细胞开始快速增长,比生长速率
在 0􀆰 4 h-1;24 h后细胞浓度为 4􀆰 5,明显高于 SCB 中
相应底物浓度下的水平(1􀆰 6)。 膜组件中膜丝数量的
调整也有利于降低底物对细胞生长的抑制,在使用
25根膜丝的 IMB L中,悬浮细胞生长更快,在 3 g / L
的高底物浓度下,8 h 左右 OD600水平达到 4􀆰 7,而在
IMB S中,达到相似水平需要到 18 h。
在 SCB中,在底物质量浓度分别为 3和 6 g / L时,
顺式茚二醇质量浓度分别为 107和 84 mg / L。 与之相
比,IMB S中产物合成量得到了明显的提高,分别达
358和 404 mg / L,摩尔产率则分别提高到 0􀆰 08和 0􀆰 05
mol / mol。 反应周期也从 SCB中的18 h延长到30 h,但
容积产率达 12 mg / (L·h),是 SCB中水平的 2倍。
膜组件分别包含 12和 25根 16 cm长膜丝
图 4  在 IMB中茚浓度下对细菌生长和
顺式茚二醇合成的影响
Fig􀆰 4  Effects of indene concentration on cell growth
and cis⁃indandiol biosynthesis in the IMB
由图 4还可知:通过增加膜组件中膜丝数量,顺
式茚二醇合成速率和终浓度都得到了进一步提高。
在底物为 3 g / L时,培养 18 h 后顺式茚二醇质量浓
度就达到 425 mg / L, 24 h后达到 461 mg / L,容积产
率达 19 mg / (L·h),较 IMB S提高 60%,是 SCB中
水平的 3倍。
IMB对顺式茚二醇过程的加强可能通过 2 种不
同的机制。 一方面,在 IMB 中固定化细胞可以提高
反应器中细胞浓度,通过细胞固定化,微生物可以
耐受更高浓度的底物[9]。 增加膜丝数量将增加固
定化微生物浓度,从而加强生物转化效率,在
IMB L中比在 IMB S中更高的产物浓度和容积产
率证实了这一点。 另一方面,用于 IMB 的 PVDF 膜
具有较强的疏水性,与疏水的不溶性底物茚具有较
好的亲和性,因而可以吸附茚,降低其对反应器中
悬浮细胞抑制的同时,使 IMB 中悬浮细胞液可以获
得很好生长,还可以减少通气过程造成的底物茚
损失。
Dafoe等[6]报道了 1 个两相反应器,采用聚合
物颗粒取代硅油作为第二相,过程效率得到大幅加
4 生  物  加  工  过  程    第 12卷 
强,指出聚合物颗粒对底物、副产物和产物的吸附
是过程加强的重要原因。 笔者的研究结果表明,膜
组件对可溶性产物和副产物亲和性较低。 在底物
为 3 g / L时,在 IMB S 中,发酵终点顺式茚二醇和
茚酮在膜相中分配比例分别为 3%和 27%(数据未
显示),其余部分存留在水相中;在 IMB L中,由于
膜丝数量增加,顺式茚二醇和茚酮在膜相中分配比
例增加到 6%和 46%。 由此可见,在 IMB中,膜组件
本身不能通过吸附移除产物来降低产物抑制,过程
加强应该是通过固定化来提高微生物耐受性与通
过膜组件对底物茚的吸附来降低底物茚的抑制的
共同作用完成的。 同时,膜组件对副产物茚酮具有
一定的吸附作用,这种吸附随着膜丝数量的增加而
得到增强,对过程加强将产生一定贡献。
2􀆰 3  原位吸附 IMB中顺式茚二醇合成
从上面结果知道,膜组件本身并不能吸附顺式
茚二醇,因此,进一步考察通过树脂原位吸附提高
过程效率的可能性。 在 3 g / L 底物质量浓度下,在
IMB L 中,于接种的同时分别加入 0􀆰 5%、1%、2%
和 4%的灭菌处理过的 sp 207树脂,考察原位吸附
对细胞生长和产物合成的影响,结果见图 5。 由图 5
(a)可知:树脂的添加量在 5~10 g / L时对生长过程
影响不大,而添加量增加到 20 ~ 40 g / L 时,生长明
显受到影响。
由图 5(b)可知:树脂的添加量在 5~10 g / L时,
顺式茚二醇总浓度随着树脂的添加量增加而增加;
进一步增加树脂,产物产量有所降低。 在 10 g / L 树
脂添加量下,顺式茚二醇总质量浓度最高,达 709
mg / L,比无树脂添加的 IMB L中产量提高 45%,是
SCB中产量的 6􀆰 6 倍。 相应地,摩尔产率从 SCB 的
0􀆰 03 提高到 0􀆰 18 mol / mol;容积产率提高到 30
mg / (L·h),是 SCB中水平的 5倍。
由图 5(b)可以发现:产物在水相、树脂相和膜
相的分布情况,根据该数据可以计算到产物顺式茚
二醇在各部分中的比例。 在 IMB L 中,因为膜本
身对产物吸附性能非常弱,94%的产物分布在水相
中,因此随着产物积累,其对微生物的抑制将不断
增强;在原位吸附 IMB L 中,树脂添加量为 5 ~ 40
g / L时,生成的产物中有 13%~67%的量转移到树脂
相中,通过树脂对产物的吸附,产物抑制一定程度
上得以降低,而且树脂用量越高,水相中产物浓度
占比越低,这可能是原位吸附 IMB 中生物转化效率
得到进一步的原因之一。
图 5  树脂添加量进行原位吸附对 IMB中细胞生长、
顺式茚二醇和茚酮合成的影响
Fig􀆰 5  Effects of in situ adsorption using resin at
different concentrations on cell growth,
cis⁃indandiol and indanone production
in the IMB at 3 g / L and 6 g / L indene
由图 5(c)可知:膜丝对茚酮有一定亲和性,在
IMB L中,46%的茚酮分布在膜相中,水相中茚酮比
例是 54%;在原位吸附 IMB L中,树脂添加量为 5~
40 g / L时,膜相中茚酮降低到 21% ~33%,而树脂中
茚酮占比例为 44%~77%,最终,水相中茚酮比例降低
到 2%~23%。 上述结果表明,树脂添加也能移除副
产物茚酮,移除能力随树脂添加量增加而增加。 通过
原位吸附,产物和副产物被部分或大部分移除,消除
抑制,从而使 IMB L的效率得到了进一步提高。
值得注意的是,在 4 个树脂添加量的 IMB 反应
过程中,当添加量为 40 g / L 时,在液相中无论产物
浓度还是副产物茚酮浓度,都处于最低水平,但顺
式茚二醇总产量比 10 g / L树脂添加量有所降低,这
5  第 3期 成喜雨等:原位吸附浸没式膜生物反应器催化制备茚二醇
可能与树脂添加对微生物活性影响和营养成分的
吸附有关,相似的结果在其他体系中也有所报
道[11-12]。 树脂袋的加入有可能对摇瓶反应器中传
质和供氧产生负面影响,从而影响转化效率。 然
而,此结果也预示在放大的反应器系统中,可能可
以取得比现有摇瓶反应器系统更好的转化效率,因
为通过放大,可以设置分离的扩张床系统,对产物
和副产物进行原位移除,同时又可以尽可能降低对
微生物活性和传质供氧的影响。
在相同的摇瓶反应器中,使用硅油的液 液两相
摇瓶系统,顺式茚二醇质量浓度在 10 和 12 h 分别
达到 210和 250 mg / L,通过过程优化,产量可以进
一步提高到 400 mg / L[4],低于本研究原位吸附
IMB L中所得的 709 mg / L的水平。 通过采用聚合
物颗粒替代硅油,研究者构建了基于机械搅拌式反
应器的固 液两相系统,终产物质量浓度从 0􀆰 29 g / L
提高到 1􀆰 29 g / L[6],高于 IMB L 中相应水平。 直
接比较上述固 液两相系统和基于摇瓶的 IMB 系统
的产量和产率水平很难对 2 个体系给出正确的评
价,因为搅拌式反应器允许前者采用优化的底物添
加策略、具有更好的传质和供氧,这些都必然对过
程产生很大影响。 值得注意的是,上述固 液两相系
统中,容积产率从对照的 29 mg / (L·h) 提高到 90
mg / (L·h),获得了 3 倍的提高;而采用 IMB 系统,
容积产率从对照的 6 mg / ( L·h ) 提高到 30
mg / (L·h),获得了 5 倍的提高。 另外,在此膜反应
器中,吸附于膜上的微生物和悬浮微生物都可以进
行生物转化,培养基在膜组件内部的连续循环也将
控制固定化微生物和悬浮微生物的数量,传统废水
处理膜生物反应器中经常碰到的膜污染问题在本
系统中并未观察到,从电镜照片可以看到 (图 1
(d)),微生物并未形成致密层影响传质和反应。 当
前的 IMB系统集成了固定化细胞反应器和两相反
应器的优点,其低的操作费用、巨大的优化空间为
全细胞生物催化过程提供了一个可供选择的重要
途径。
3  结  论
在原位吸附 IMB系统中,可通过细胞固定化以
及底物、产物和副产物的吸附降低茚生物转化过程
抑制,顺式茚二醇质量浓度和容积产率分别达到
709 mg / L和 30 mg / (L·h),与对照 SCB 相比,分别
提高 7和 5 倍。 IMB 系统操作简单灵活,可以通过
改变膜丝数量、膜结构、膜材料和循环过程等多种
方式对过程进行优化,进一步提高过程效率。 同
时,IMB容易放大,在全细胞生物催化制药领域具有
重要的应用前景。
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(责任编辑  荀志金)
6 生  物  加  工  过  程    第 12卷