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Ｃｌｏｎｉｎｇ，ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎｏｆｐｒｏｍｉｓｉｎｇ２ｄｅｏｘｙＤｒｉｂｏｓｅ
５ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅｆｒｏｍＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓＮ３１５
ＨＡＮＬｅｉ，ＣＨＥＮＸｉ，ＦＥＮＧＪｉｎｈｕｉ，ＷＵＱｉａｑｉｎｇ，ＺＨＵＤｕｎｍｉｎｇ
（ＮａｔｉｏｎａｌＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇＬａｂｏｒａｔｏｒｙｆｏｒＩｎｄｕｓｔｒｉａｌＥｎｚｙｍｅｓ，ＴｉａｎｊｉｎＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＩｎｄｕｓｔｒｉａｌＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，
ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｔｉａｎｊｉｎ３００３０８，Ｃｈｉｎａ）
Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＴｈｅｇｅｎｏｍｅｍｉｎｉｎｇｗａｓｕｓｅｄｔｏｆｉｎｄａｐｒｏｍｉｓｉｎｇＤＥＲＡｓｆｒｏｍｔｈｅｇｅｎｏｍｉｃｄａｔａｂａｓｅ．Ａｆｔｅｒｔｈｅ
ｏｐｔｉｍｉｚａｔｉｏｎｏｆｔｈｅｃｏｄｏｎｓ，ａＤＥＲＡｆｒｏｍＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓＮ３１５（ＳａＤＥＲＡ）ｗａｓｏｖｅｒｅｘｐｒｅｓｓｅｄｉｎＥ．
ｃｏｌｉＢＬ２１（ＤＥ３），ｐｕｒｉｆｉｅｄ，ａｎｄｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚｅｄ．ＴｈｅｐｕｒｉｆｉｅｄＳａＤＥＲＡｗａｓｏｂｔａｉｎｅｄａｆｔｅｒａｓｉｍｐｌｅｏｎｅｓｔｅｐ
ｓｉｍｐｌｅｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ．Ｔｈｅｈｏｍｏｄｉｍｅｒｉｃｅｎｚｙｍｅ（５７ｋＤａ）ｈａｓｔｈｅｏｐｔｉｍａｌａｃｔｉｖｉｔｙａｔｐＨ７７ａｎｄ４５℃．Ｉｔ
ｓｈｏｗｅｄｑｕｉｔｅｈｉｇｈｓｔａｂｉｌｉｔｙａｔａｌｋａｌｉｎｅｐＨ（ｐＨ１１．０）ａｎｄ８９％ ｏｆａｃｔｉｖｉｔｙｒｅｍａｉｎｅｄａｆｔｅｒｉｎｃｕｂａｔｉｏｎ（２５℃
ｆｏｒ２４ｈ）．Ｉｔｓｈｏｗｅｄａｒｅｓｉｓｔａｎｃｅｔｏａｃｅｔａｌｄｅｈｙｄｅａｎｄｍｏｒｅｔｈａｎ７０％ ｏｆａｃｔｉｖｉｔｙｒｅｍａｉｎｅｄａｆｔｅｒｅｘｐｏｓｕｒｅ
ｔｏ０３ｍｏｌ／Ｌａｃｅｔａｌｄｅｈｙｄｅｆｏｒ３０ｍｉｎａｔ２５℃．Ｔｏｃｏｎｆｉｒｍｉｔｓｓｙｎｔｈｅｔｉｃｐｏｔｅｎｔｉａｌ，ｔｈｅｄｏｕｂｌｅａｌｄｏｌ
ｐｒｏｄｕｃｔｗａｓｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅｄ，ｐｕｒｉｆｉｅｄａｎｄｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ．
Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：２ｄｅｏｘｙｄｒｉｂｏｓｅ５ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅ；ｇｅｎｏｍｅｍｉｎｉｎｇ；Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓ
　　
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３４０）［１３］，ＴｈｅｒｍｏｃｏｃｃｕｓｋｏｄａｋａｒａｅｎｓｉｓＫＯＤ１（ＢＡＣ６７７
０８）［１４］、Ｔｈｅｒｍｏｔｏｇａ ｍａｒｉｔｉｍａ（ＡＡＤ３６６２５）［１３］、
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Ｔｈｅｒｍｏｔｏｇａ ｍａｒｉｔｉｍａ（ＴｍＤＥＲＡ）［１３］、Ｐｙｒｏｂａｃｕｌｕｍ
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［１］　ＢｒｏｖｅｔｏＭ，ＧａｍｅｎａｒａＤ，ＭｅéｎｄｅｚＳＰ，ｅｔａｌ．ＣＣｂｏｎｄｆｏｒｍｉｎｇ
ｌｙａｓｅｓｉｎｏｒｇａｎｉｃｓｙｎｔｈｅｓｉｓ［Ｊ］．Ｃｈｅｍ Ｒｅｖ，２０１１，１１１（７）：
４３４６４４０３．
［２］　ＳａｍｌａｎｄＡ，ＳｐｒｅｎｇｅｒＧ．ＭｉｃｒｏｂｉａｌａｌｄｏｌａｓｅｓａｓＣＣｂｏｎｄｉｎｇ
ｅｎｚｙｍｅｓ：ｕｎｋｎｏｗｎｔｒｅａｓｕｒｅｓａｎｄｎｅｗｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｓ［Ｊ］．Ａｐｐｌ
ＭｉｃｒｏｂｉｏｌＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌ，２００６，７１（３）：２５３２６４．
［３］　ＭａｃｈａｊｅｗｓｋｉＴＤ，ＷｏｎｇＣＨ．Ｔｈｅｃａｔａｌｙｔｉｃａｓｙｍｍｅｔｒｉｃａｌｄｏｌ
ｒｅａｃｔｉｏｎ［Ｊ］．ＡｎｇｅｗＣｈｅｍＩｎｔＥｄ，２０００，３９（８）：１３５２１３７５．
［４］　ＣｈｅｎＬＲ，ＤｕｍａｓＤＰ，ＷｏｎｇＣＨ．Ｄｅｏｘｙｒｉｂｏｓｅ５ｐｈｏｓｐｈａｔｅ
ａｌｄｏｌａｓｅａｓａｃａｔａｌｙｓｔｉｎａｓｙｍｍｅｔｒｉｃａｌｄｏｌｃｏｎｄｅｎｓａｔｉｏｎ［Ｊ］．ＪＡｍ
ＣｈｅｍＳｏｃ，１９９２，１１４（２）：７４１７４８．
［５］　ＧｉｊｓｅｎＨ ＪＭ，ＷｏｎｇＣＨ．Ｕｎｐｒｅｃｅｄｅｎｔｅｄａｓｙｍｍｅｔｒｉｃａｌｄｏｌ
ｒｅａｃｔｉｏｎｓｗｉｔｈ ｔｈｒｅｅ ａｌｄｅｈｙｄｅ ｓｕｂｓｔｒａｔｅｓ ｃａｔａｌｙｚｅｄ ｂｙ ２
ｄｅｏｘｙｒｉｂｏｓｅ５ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅ［Ｊ］．ＪＡｍＣｈｅｍＳｏｃ，１９９４，１１６
（１８）：８４２２８４２３．
［６］　ＧｒｅｅｎｂｅｒｇＷＡ，ＶａｒｖａｋＡ，ＨａｎｓｏｎＳＲ，ｅｔａｌ．Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆａｎ
ｅｆｉｃｉｅｎｔ，ｓｃａｌａｂｌｅ，ａｌｄｏｌａｓｅｃａｔａｌｙｚｅｄｐｒｏｃｅｓｓｆｏｒｅｎａｎｔｉｏｓｅｌｅｃｔｉｖｅ
ｓｙｎｔｈｅｓｉｓｏｆｓｔａｔｉｎｉｎｔｅｒｍｅｄｉａｔｅｓ［Ｊ］．ＰＡＮＳ，２００４，１０１（１６）：
５７８８５７９３．
［７］　ＭａｃｈａｊｅｗｓｋｉＴＤ，ＷｏｎｇＣＨ．Ｃｈｅｍｏｅｎｚｙｍａｔｉｃｓｙｎｔｈｅｓｉｓｏｆｋｅｙ
ｅｐｏｔｈｉｌｏｎｅｆｒａｇｍｅｎｔｓ［Ｊ］．Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（Ｓｔｕｔｇａｒｔ），１９９９（Ｓｕｐ）：
１４６９１４７２．
［８］　ＧｉｊｓｅｎＨＪＭ，ＷｏｎｇＣＨ．Ｓｅｑｕｅｎｔｉａｌｏｎｅｐｏｔａｌｄｏｌｒｅａｃｔｉｏｎｓ
ｃａｔａｌｙｚｅｄｂｙ２ｄｅｏｘｙｒｉｂｏｓｅ５ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅａｎｄｆｒｕｃｔｏｓｅ１，
６ｄｉｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅ［Ｊ］．ＪＡｍＣｈｅｍＳｏｃ，１９９５，１１７（１０）：
２９４７２９４８．
［９］　ＧｉｊｓｅｎＨＪＭ，ＷｏｎｇＣＨ．Ｓｅｑｕｅｎｔｉａｌｔｈｒｅｅａｎｄｆｏｕｒｓｕｂｓｔｒａｔｅ
ａｌｄｏｌｒｅａｃｔｉｏｎｓｃａｔａｌｙｚｅｄｂｙａｌｄｏｌａｓｅｓ［Ｊ］．ＪＡｍＣｈｅｍＳｏｃ，
１９９５，１１７（２９）：７５８５７５９１．
［１０］　ＳａｋｕｒａｂａＨ，ＴｓｕｇｅＨ，ＳｈｉｍｏｙａＩ，ｅｔａｌ．Ｔｈｅｆｉｒｓｔｃｒｙｓｔａｌｓｔｒｕｃｔｕｒｅ
ｏｆａｒｃｈａｅａｌａｌｄｏｌａｓｅ：ｕｎｉｑｕｅｔｅｔｒａｍｅｒｉｃｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆ２ｄｅｏｘｙＤ
ｒｉｂｏｓｅ５ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅｆｒｏｍｔｈｅｈｙｐｅｒｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｉｃａｒｃｈａｅａ
Ａｅｒｏｐｙｒｕｍ ｐｅｒｎｉｘ［Ｊ］．ＪＢｉｏｌＣｈｅｍ，２００３，２７８（１２）：
１０７９９１０８０６．
［１１］　ＶａｌｅｎｔｉｎＨａｎｓｅｎＰ，ＢｏｅｔｉｕｓＦ，ＨａｍｍｅｒＪｅｓｐｅｒｓｅｎＫ，ｅｔａｌ．Ｔｈｅ
ｐｒｉｍａｒｙｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａｃｏｌｉＫ１２２ｄｅｏｘｙｒｉｂｏｓｅ５
ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅ［Ｊ］．ＥｕｒＪＢｉｏｃｈｅｍ，１９８２，１２５（３）：５６１５６６．
［１２］　Ｋｉｍ Ｙ Ｍ，ＣｈｏｉＮ Ｓ，Ｋｉｍ Ｙ Ｏ，ｅｔａｌ．Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ａｎｄ
ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎｏｆａｎｏｖｅｌｄｅｏｘｙｒｉｂｏｓｅ５ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅｆｒｏｍ
Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｕｓｓｐ．ＥＡ００１［Ｊ］．ＪＭｉｃｒｏｂｉｏｌＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌ，２０１０，２０
（６）：９９５１０００．
［１３］　ＳａｋｕｒａｂａＨ，ＹｏｎｅｄａＫ，ＹｏｓｈｉｈａｒａＫ，ｅｔａｌ．Ｓｅｑｕｅｎｔｉａｌａｌｄｏｌ
ｃｏｎｄｅｎｓａｔｉｏｎｃａｔａｌｙｚｅｄｂｙｈｙｐｅｒｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｉｃ２ｄｅｏｘｙＤｒｉｂｏｓｅ５
ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅ［Ｊ］．ＡｐｐｌＥｎｖｉｒｏｎｍ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ，２００７，７３
（２２）：７４２７７４３４．
［１４］　ＲａｓｈｉｄＮ，ＩｍａｎａｋａＨ，ＦｕｋｕｉＴ，ｅｔａｌ．Ｐｒｅｓｅｎｃｅｏｆａｎｏｖｅｌ
ｐｈｏｓｐｈｏｐｅｎｔｏｍｕｔａｓｅａｎｄａ２ｄｅｏｘｙｒｉｂｏｓｅ５ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅ
ｒｅｖｅａｌｓａｍｅｔａｂｏｌｉｃｌｉｎｋｂｅｔｗｅｅｎｐｅｎｔｏｓｅｓａｎｄｃｅｎｔｒａｌｃａｒｂｏｎ
ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ ｉｎ ｔｈｅｈｙｐｅｒｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｉｃａｒｃｈａｅｏｎ Ｔｈｅｒｍｏｃｏｃｃｕｓ
ｋｏｄａｋａｒａｅｎｓｉｓ［Ｊ］．ＪＢａｃｔｅｒｉｏｌ，２００４，１８６（１３）：４１８５４１９１．
［１５］　ＫｉｍＹＭ，ＣｈａｎｇＹＨ，ＣｈｏｉＮＳ，ｅｔａｌ．Ｃｌｏｎｉｎｇ，ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ａｎｄ
ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎｏｆａｎｅｗｄｅｏｘｙｒｉｂｏｓｅ５ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅｆｒｏｍ
Ｙｅｒｓｉｎｉａｓｐ．ＥＡ０１５［Ｊ］．ＰｒｏｔｅｉｎＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎａｎｄＰｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ，
２００９，６８（２）：１９６２００．
［１６］　ＳａｍｂｒｏｏｋＪ，
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ｉｎｔｅｒｍｅｄｉａｔｅｓｉｎａｎｅｎｚｙｍｅｍｅｃｈａｎｉｓｍａｔａｔｏｍｉｃｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ［Ｊ］．
Ｓｃｉｅｎｃｅ，２００１，２９４（５５４１）：３６９３７４．
［１８］　ＤｅｓａｎｔｉｓＧ，ＬｉｕＪＪ，ＣｌａｒｋＤＰ，ｅｔａｌ．Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｂａｓｅｄｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ
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ｄｅｏｘｙｒｉｂｏｓｅ５ｐｈｏｓｐｈａｔｅａｌｄｏｌａｓｅ［Ｊ］．ＢｉｏｏｒｇＭｅｄＣｈｅｍ，２００３，
１１（１）：４３５２．
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