全 文 ：第 ３５ 卷第 ２４ 期
２０１５年 １２月
生 态 学 报
ＡＣＴＡ ＥＣＯＬＯＧＩＣＡ ＳＩＮＩＣＡ
Ｖｏｌ．３５，Ｎｏ．２４
Ｄｅｃ．，２０１５
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
基金项目：林业公益性行业科研专项（２０１３０４４０２）
收稿日期：２０１４⁃０９⁃１９； 网络出版日期：２０１５⁃０５⁃２１
∗通讯作者 Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇ ａｕｔｈｏｒ．Ｅ⁃ｍａｉｌ： ｇｙｚｈｏｕ２１１８＠ １６３．ｃｏｍ
ＤＯＩ： １０．５８４６ ／ ｓｔｘｂ２０１４０９１９１８５６
杨菁，周国英，田媛媛，刘倩丽，刘成锋，杨权，周洁尘．降香黄檀不同混交林土壤细菌多样性差异分析．生态学报，２０１５，３５（２４）：８１１７⁃８１２７．
Ｙａｎｇ Ｊ， Ｚｈｏｕ Ｇ Ｙ， Ｔｉａｎ Ｙ Ｙ， Ｌｉｕ Ｑ Ｌ， Ｌｉｕ Ｃ Ｆ， Ｙａｎｇ Ｑ， Ｚｈｏｕ Ｊ Ｃ．Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｉｎ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ ｏｆ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ
ｏｄｏｒｉｆｅｒａ．Ａｃｔａ Ｅｃｏｌｏｇｉｃａ Ｓｉｎｉｃａ，２０１５，３５（２４）：８１１７⁃８１２７．
降香黄檀不同混交林土壤细菌多样性差异分析
杨 菁， 周国英∗，田媛媛， 刘倩丽， 刘成锋， 杨 权， 周洁尘
经济林培育与保护教育部重点实验室，中南林业科技大学，长沙 ４１０００４
摘要：为探讨降香黄檀不同混交林土壤细菌的多样性及其与土壤性质的关系，应用高通量测序技术，比较降香黄檀（Ｄａｌｂｅｒｇｉａ
ｏｄｏｒｉｆｅｒａ Ｔ． Ｃｈｅｎ）分别与奥氏黄檀（Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｌｉｖｅｒｉ）、大果紫檀（Ｐｔｅｒｏｃａｒｐｕｓ ｍａｃａｒｏｃａｒｐｕｓ）、檀香（ Ｓａｎｔａｌｕｍ ａｌｂｕｍ Ｌ．）和母生
（Ｈｏｍａｌｉｕｍ ｈａｉｎａｎｅｎｓｅ Ｇａｇｎｅｐ．）混交的 ４种模式土壤细菌多样性，并结合土壤的理化、酶活进行了相关性分析。 结果表明，①４
种混交林土壤的理化、酶活均存在差异。 其中降香黄檀与檀香混交林土壤的含水量、有机质、全氮、有效钾和脲酶含量最高，分
别为：５．２４％、２７．５ ｇ ／ ｋｇ、０．８５ ｍｇ ／ ｇ、３７．４６ ｍｇ ／ ｋｇ和 ０．３２ ｍｇ ／ ｋｇ，降香黄檀与大果紫檀混交林土壤的 ｐＨ、有效磷和多酚氧化酶含
量最高，分别为：４．４８、６．０４ ｍｇ ／ ｋｇ、４．１９ ｍｇ ／ ｋｇ。 ②通过高通量测序表明四种混交模式土壤细菌的丰富度为：降香黄檀×檀香 ＞
降香黄檀×大果紫檀 ＞ 降香黄檀×奥氏黄檀 ＞ 降香黄檀×母生，土壤细菌多样性为： 降香黄檀×大果紫檀 ＞ 降香黄檀×奥氏黄檀
＞降香黄檀×檀香 ＞ 降香黄檀×母生。 其中，变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、绿弯菌门和厚壁菌门为 ４ 种混交模式中的主要菌
群。 ③经冗余分析和相关性分析表明，影响降香黄檀混交林土壤细菌群落结构和细菌多样性的主要土壤理化因子为：ｐＨ 值、脲
酶、多酚氧化酶和有机质。
关键词：降香黄檀；混交林；土壤细菌群落；高通量测序；多样性
Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｉｎ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ ｏｆ
Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ
ＹＡＮＧ Ｊｉｎｇ， ＺＨＯＵ Ｇｕｏｙｉｎｇ∗， ＴＩＡＮ Ｙｕａｎｙｕａｎ， ＬＩＵ Ｑｉａｎｌｉ， ＬＩＵ Ｃｈｅｎｇｆｅｎｇ， ＹＡＮＧ Ｑｕａｎ， ＺＨＯＵ Ｊｉｅｃｈｅｎ
Ｍｉｎｉｓｔｒｙ ｏｆ Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｃｕｌｔｉｖａｔｉｏｎａｎｄ Ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ ｆｏｒ Ｎｏｎ⁃Ｗｏｏｄ Ｆｏｒｅｓｔ Ｔｒｅｅｓ， Ｃｅｎｔｒａｌ Ｓｏｕｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ ａｎｄ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｃｈａｎｇｓｈａ
４１０００４， Ｃｈｉｎａ
Ａｂｓｔｒａｃｔ： Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ Ｔ． Ｃｈｅｎ ｉｓ ｏｎｅ ｏｆ Ｃｈｉｎａ′ｓ ｅｎｄａｎｇｅｒｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ． Ｉｔ ｉｓ ａｌｓｏ ａｎ ｅｎｄｅｍｉｃ ｓｐｅｃｉｅｓ ｔｈａｔ ｍａｉｎｌｙ
ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｅｓ ｉｎ Ｈａｉｎａｎ， Ｇｕａｎｇｄｏｎｇ， Ｆｕｊｉａｎ， ｅｔｃ． Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ｈａｓ ｇｒｅａｔ ｖａｌｕｅｓ ｉｎ ｍｅｄｉｃｉｎｅ， ｅｃｏｎｏｍｉｃｓ ａｎｄ ｅｃｏｌｏｇｙ，
ａｎｄ ｉｔｓ ｍｅｄｉｃｉｎａｌ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ ａｒｅ ｓｐｅｃｉｆｉｅｄ ｉｎ ｔｈｅ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｐｏｅｉａ． Ｂｕｔ ｔｈｅ ｒｅｓｏｕｒｃｅ ｗａｓ ｒｅｄｕｃｅｄ ａｎｄ ｔｈｅ ｐｒｏｄｕｃｔｉｖｉｔｙ
ｗａｓ ｄｅｃｌｉｎｅｄ ｄｕｅ ｔｏ ｙｅａｒｓ ｏｆ ｄｅｆｏｒｅｓｔａｔｉｏｎ． Ｄｅｖｅｌｏｐｉｎｇ ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ ｏｆ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ｈａｓ ｂｅｅｎ ｂｅｃｏｍｉｎｇ ａ ｍａｊｏｒ ｔｒｅｎｄ
ｏｆ Ｃｈｅｎｇｍａｉ ｆａｒｍ ｉｎ Ｈａｉｎａｎ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ， ｂｅｃａｕｓｅ ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ ｃａｎ ｎｏｔ ｏｎｌｙ ａｄｊｕｓｔ ｔｈｅ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ ａｎｄ ｒｅｌａｔｉｖｅ ｈｕｍｉｄｉｔｙ ｏｆ
ｗｏｏｄｌａｎｄ， ｂｕｔ ａｌｓｏ ｉｍｐｒｏｖｅ ｓｏｉｌ ｆｅｒｔｉｌｉｔｙ． Ｓｏｉｌ ｃａｎ ｐｒｏｖｉｄｅ ｎｕｔｒｉｔｉｏｎ ｆｏｒ ａｂｏｖｅｇｒｏｕｎｄ ｖｅｇｅｔａｔｉｏｎｓ， ａｓ ｗｅｌｌ ａｓ ｓｏｉｌ
ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ． Ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａ， ａｓ ｏｎｅ ｏｆ ｔｈｅ ｋｅｙ ｍｅｍｂｅｒｓ ｏｆ ｓｏｉｌ ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ， ｐｌａｙｓ ａｎ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｒｏｌｅ ｉｎ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ
ｏｒｇａｎｉｃ ｍａｔｔｅｒ ｄｅｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ， ａｃｃｅｌｅｒａｔｉｎｇ ｍｉｎｅｒａｌ ｎｕｔｒｉｔｉｏｎ ｃｙｃｌｅ， ｍａｉｎｔａｉｎｉｎｇ ａｎｄ ｉｍｐｒｏｖｉｎｇ ｓｏｉｌ ｆｅｒｔｉｌｉｔｙ． Ｐｅｏｐｌｅ ｃａｎ
ｕｎｄｅｒｓｔａｎｄ ｔｈｅ ｓｏｉｌ ｓｔａｔｕｓ ｂｅｔｔｅｒ ｂｙ ａｎａｌｙｚｉｎｇ ｔｈｅ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｂｅｔｗｅｅｎ ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ ａｎｄ ｓｏｉｌ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ， ａｎｄ
ｆｉｎａｌｌｙ ｄｅｖｅｌｏｐ ａ ｍｅｔｈｏｄ ｔｏ ｉｍｐｒｏｖｅ ｔｈｅ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ｐｌａｎｔａｔｉｏｎ． Ｈｏｗｅｖｅｒ， ｏｎｌｙ ａｂｏｕｔ １％ ｂａｃｔｅｒｉａ ｃｏｕｌｄ ｂｅ ａｓｓａｙｅｄ
ｂｙ ｔｒａｄｉｔｉｏｎａｌ ｍｅｔｈｏｄｓ． Ｈｉｇｈ⁃ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｉｓ ａ ｎｅｗ ｍｅｔｈｏｄ ｔｈａｔ ｃａｎ ｇｅｔ ｔｈｅ ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ｓｏｉｌ
ｂａｃｔｅｒｉａ ｍｏｒｅ ｃｏｎｖｅｎｉｅｎｔｌｙ ａｎｄ ａｃｃｕｒａｔｅｌｙ， ａｎｄ ａｖｏｉｄ ｔｈｅ ｌｉｍｉｔａｔｉｏｎｓ ｏｆ ｔｒａｄｉｔｉｏｎａｌ ｍｅｔｈｏｄｓ． Ｔｈｉｓ ｍｅｔｈｏｄ ｈａｓ ｂｅｅｎ ｗｉｄｅｌｙ
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
ｕｓｅｄ ｉｎ ｓｔｕｄｙｉｎｇ ｓｏｉｌ ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ． Ｗｅ ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｄ ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｉｎ ｆｏｕｒ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ ｏｆ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ
ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ｐｌａｎｔａｔｉｏｎ， ｉ．ｅ． Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ｍｉｘｅｄ ｗｉｔｈ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｌｉｖｅｒｉ， Ｐｔｅｒｏｃａｒｐｕｓ ｍａｃａｒｏｃａｒｐｕｓ， Ｓａｎｔａｌｕｍ ａｌｂｕｍ Ｌ．
ａｎｄ Ｈｏｍａｌｉｕｍ ｈａｉｎａｎｅｎｓｅ Ｇａｇｎｅｐ．， ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ， ｉｎ Ｃｈｅｎｇｍａｉ Ｃｏｕｎｔｙ， Ｈａｉｎａｎ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ ｉｎ Ｃｈｉｎａ． Ａ ｈｉｇｈ⁃ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ
ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ ｗａｓ ｕｓｅｄ ｔｏ ａｎａｌｙｚｅ ｔｈｅ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ａｎｄ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓ ａｍｏｎｇ ｔｈｅｓｅ ｆｏｕｒ ｐｌｏｔｓ ｔｏ ｆｉｎｄ ａ ｗａｙ ｔｈａｔ ｃｏｕｌｄ
ｉｍｐｒｏｖｅ ｓｏｉｌ ｆｅｒｔｉｌｉｔｙ ｏｆ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ｐｌａｎｔａｔｉｏｎ． Ａｆｔｅｒ ａｎａｌｙｓｅｓ， ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｓｏｉｌ ｐｈｙｓｉｃａｌ⁃ｃｈｅｍｉｃａｌ
ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ａｎｄ ｓｏｉｌ ｅｎｚｙｍｅ ａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ ｗｅｒｅ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｉｎ ｔｈｅ ｆｏｕｒ ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔ， ｉ．ｅ． ｔｈｅ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ａｎｄ Ｓａｎｔａｌｕｍ
ａｌｂｕｍ Ｌ． ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ ｗｉｔｈ ｈｉｇｈｅｒ ｍｏｉｓｔｕｒｅ ｃｏｎｔｅｎｔ， ｏｒｇａｎｉｃ ｍａｔｔｅｒ， ｔｏｔａｌ Ｎ， ａｖａｉｌａｂｌｅ Ｋ ａｎｄ Ｕｒｅａｓ； Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ
ａｎｄ Ｐｔｅｒｏｃａｒｐｕｓ ｍａｃａｒｏｃａｒｐｕｓ ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ ｗｉｔｈ ｈｉｇｈｅｒ ｐＨ， ａｖａｉｌａｂｌｅ Ｐ ａｎｄ ｐｏｌｙｐｈｅｎｏｌ ｏｘｉｄａｓｅ． Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｏｆ ｈｉｇｈ⁃
ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ａｂｕｎｄａｎｃｅｓ ｏｆ ｔｈｅｓｅ ｆｏｕｒ ｐｌａｎｔａｔｉｏｎｓ ｗｅｒｅ： Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ × Ｓａｎｔａｌｕｍ
ａｌｂｕｍ Ｌ． ＞ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ × Ｐｔｅｒｏｃａｒｐｕｓ ｍａｃａｒｏｃａｒｐｕｓ ＞ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ × Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｌｉｖｅｒｉ ＞ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ×
Ｈｏｍａｌｉｕｍ ｈａｉｎａｎｅｎｓｅ Ｇａｇｎｅｐ．， ａｎｄ ｔｈｅ ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ｔｈｅｓｅ ｆｏｕｒ ｍｉｘｅｄ ｍｏｄｅｌｓ ｗｅｒｅ： Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ×
Ｐｔｅｒｏｃａｒｐｕｓ ｍａｃａｒｏｃａｒｐｕｓ ＞ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ × Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｌｉｖｅｒｉ ＞ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ × Ｓａｎｔａｌｕｍ ａｌｂｕｍ Ｌ． ＞ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ
ｏｄｏｒｉｆｅｒａ × Ｈｏｍａｌｉｕｍ ｈａｉｎａｎｅｎｓｅ Ｇａｇｎｅｐ．． Ｔｈｅ ｄｏｍｉｎａｎｔ ｂａｃｔｅｒｉａ ｔａｘａ ｉｎ ｔｈｅ ｆｏｕｒ ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ ｗｅｒｅ Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ，
Ａｃｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａ， Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ， Ｃｈｌｏｒｏｆｌｅｘｉ ａｎｄ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ． Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｏｆ ｒｅｄｕｎｄａｎｃｙ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ
ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｐＨ， Ｕｒｅａｓ， ｐｏｌｙｐｈｅｎｏｌ ｏｘｉｄａｓｅ ａｎｄ ｏｒｇａｎｉｃ ｍａｔｔｅｒ ｗｅｒｅ ｔｈｅ ｍａｉｎ ｆａｃｔｏｒｓ ｔｈａｔ ｈａｄ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｅｆｆｅｃｔ ｏｎ ｔｈｅ
ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ ｉｎ ｔｈｉｓ ｆｏｕｒ ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ． Ｏｕｒ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｂａｃｔｅｒｉａ １６Ｓ ｒＲＮＡ⁃ｂａｓｅｄ
ｄａｔａｓｅｔ ｓｈｏｗｅｄ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓ ｉｎ ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｍｏｎｇ ｆｏｕｒ ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ ｏｆ Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ． Ｂｕｔ ｆｕｒｔｈｅｒ
ｒｅｓｅａｒｃｈ ｉｓ ａｌｓｏ ｎｅｅｄｅｄ ｔｏ ｇｅｔ ｍｏｒｅ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｉｎ ｓｏｉｌ ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ．
Ｋｅｙ Ｗｏｒｄｓ： Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ； ｍｉｘｅｄ ｆｏｒｅｓｔｓ； ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ； ｈｉｇｈ⁃ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ； ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ
细菌作为土壤微生物中重要的组成部分，具有含氮量高，含碳量低的特点，对土壤养分的形成与分解有促
进作用。 土壤细菌的微生物多样性越高，则越有利于土壤的可持续利用和抗压力［１⁃２］。 但目前只有 １％左右
的主要细菌菌群能被检测到［３］。 采用成本低、通量高、速度快并且覆盖深度高的第二代高通量测序技术进行
实验，对微生物的多样性分析是十分有利的［４⁃５］。
高通量测序技术（Ｈｉｇｈ⁃ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）又称为新一代测序技术或第二代测序，该测序技术相对于
传统的测序技术而言，具有极大的优势，主要表现在［６⁃８］：①测序通量高，可以检测分析到样品中的痕量微生
物；②实验过程简化；③速度快；④准确率高，实验结果更能全面的反应环境中群落的特点。 目前，高通量测序
已广泛的应用于土壤微生物的研究。
降香黄檀（Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ Ｔ． Ｃｈｅｎ）是我国濒危树种，国家二级保护野生植物［９］，也是海南省珍贵乡土
树种。 降香黄檀具有药用价值和经济价值，另外，降香黄檀落叶量大、根系发达，能改良土壤，具有很大的生态
效益［１０］。 但历史上人们对降香黄檀的过度砍伐利用，导致其资源减少，生产力下降。 近年来，海南省虽对降
香黄檀进行了人工栽培，但在树种的合理配置、良种选育等方面仍存在问题。 目前，国外对降香黄檀的研究甚
少，国内大多集中于降香黄檀多样性［１１⁃１２］、栽培技术［１３］以及活性物质提取［１４⁃１５］等方面的研究，针对其土壤的
研究较少。 已有研究表明［９］，在营造降香黄檀人工林时，不宜发展人工纯林，应考虑与其他树种混交，以短养
长，同时也能提高林木的抗逆性。
本研究针对海南珍贵乡土树种降香黄檀的不同混交林，应用 Ｍｉｓｅｑ 高通量测序的方法，结合土壤的物理
化学性质及土壤酶活性，对土壤的细菌群落结构进行分析，以研究降香黄檀不同混交林细菌群落的多样性及
其与环境因子的关系，为降香黄檀人工林的合理配置及健康经营提供参考。
１ 研究区域概况
试验样地位于海南省澄迈国营林场（海南省澄迈县东南部的太平乡），地处 １９°１１′ Ｎ，１１１°１′ Ｅ，海拔为
８１１８ 生 态 学 报 ３５卷
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
１１８ ｍ，属热带季风气候类型，年平均日照时数 ２０５９ ｈ，年平均气温 ２３．８ ℃，相对湿度 ８４％，年均降雨量 １７８６．１
ｍｍ，全年基本无霜。 研究区面积约为 ２．６６７ｈｍ２，地貌以低丘陵和台地为主。 成土母岩主要有玄武岩和砂页
岩，成土母质以河流冲积物发育而成的砂壤土为主，研究区的土壤主要为砂壤。
２ 材料与方法
２．１ 样地设置及样品采集
该实验区于 ２０１２年上旬造林。 造林时，选用的降香黄檀苗木株高为（５０±１０） ｃｍ，奥氏黄檀为（４０±１０）
ｃｍ，大果紫檀为（４５±１０） ｃｍ，檀香为（４０±１０） ｃｍ，母生为（３０±１０） ｃｍ。 ４ 个样地的造林密度均为 ６６７ 株 ／
６６６．７ｍ２，行株距为 １ ｍ×１ ｍ。
于 ２０１４年 ３月采样，且采样前一个月内降雨量很少，基本处于干旱状态。 样地的选择是在林场内选择立
地条件相似的降香黄檀不同混交模式样地（表 １）。 在每个样地内设置 ５ 个标准地，大小为 １０ ｍ×１０ ｍ，每个
标准地内分别设置 ３个样点，每个采样点的土壤均是除去地表植被和枯枝落叶后采集 ０—２０ ｃｍ土层的土壤。
用于测定细菌多样性的土壤于－８０ ℃保存备用，用于理化性质测定的土样，作风干过筛处理。
表 １ 样地基本情况
Ｔａｂｌｅ １ Ｂａｓｉｃ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ｓａｍｐｌｅｓ ｐｌｏｔｓ
样地
Ｐｌｏｔ
混交比例
Ｍｉｘｅｄ ｐｒｏｐｏｒｔｉｏｎ
郁闭度
Ｃａｎｏｐｙ ｄｅｎｓｉｔｙ
林下主要植被
Ｕｎｄｅｒｇｒｏｗｔｈ ｍａｉｎ ｓｐｅｃｉｅｓ
Ｄａｌ ０ ３ ∶１ ０．４ 墨苜蓿 Ｒｉｃｈａｒｄｉａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ Ｇｏｍｅｚ、飞机草 Ｅｕｐａｔｏｒｉｕｍ ｏｄｏｒａｔｕｍ Ｌ．、菊芩 Ｅｒｅｃｈｉｔｉｔｅｓｖａｌｅｒｉａｎａｅｆｏｌｉａ、藿香蓟 Ａｇｅｒａｔｕｍ ｃｏｎｙｚｏｉｄｅｓ、龙葵 Ｓｏｌａｎｕｍ ｎｉｇｒｕｍ Ｌ．
Ｄａｌ １ ３ ∶１ ０．６
巴西含羞草 Ｍｉｍｏｓａ ｉｎｖｉｓａ Ｍａｒｔ． ｅｘ Ｃｏｌｌａ、墨苜蓿 Ｒｉｃｈａｒｄｉａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ Ｇｏｍｅｚ、筒轴茅
Ｒｏｔｔｂｏｅｌｌｉａ ｅｘａｌｔａｔａ、菊芩 Ｅｒｅｃｈｉｔｉｔｅｓ ｖａｌｅｒｉａｎａｅｆｏｌｉａ、藿香蓟 Ａｇｅｒａｔｕｍ ｃｏｎｙｚｏｉｄｅｓ、飞机草
Ｅｕｐａｔｏｒｉｕｍ ｏｄｏｒａｔｕｍ Ｌ．、龙爪草 Ｏｔｔｅｌｉａ ａｌｉｓｍｏｉｄｅｓ、龙葵 Ｓｏｌａｎｕｍ ｎｉｇｒｕｍ Ｌ．
Ｄａｌ ２ ３ ∶１ ０．５ 巴西含羞草 Ｍｉｍｏｓａ ｉｎｖｉｓａ Ｍａｒｔ． ｅｘ Ｃｏｌｌａ、墨苜蓿 Ｒｉｃｈａｒｄｉａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ Ｇｏｍｅｚ、筒轴茅Ｒｏｔｔｂｏｅｌｌｉａ ｅｘａｌｔａｔａ、菊芩 Ｅｒｅｃｈｉｔｉｔｅｓ ｖａｌｅｒｉａｎａｅｆｏｌｉａ、藿香蓟 Ａｇｅｒａｔｕｍ ｃｏｎｙｚｏｉｄｅｓ
Ｄａｌ ３ ２ ∶１ ０．３ 巴西含羞草 Ｍｉｍｏｓａ ｉｎｖｉｓａ Ｍａｒｔ． ｅｘ Ｃｏｌｌａ、墨苜蓿 Ｒｉｃｈａｒｄｉａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ Ｇｏｍｅｚ、筒轴茅Ｒｏｔｔｂｏｅｌｌｉａ ｅｘａｌｔａｔａ、菊芩 Ｅｒｅｃｈｉｔｉｔｅｓ ｖａｌｅｒｉａｎａｅｆｏｌｉａ、藿香蓟 Ａｇｅｒａｔｕｍ ｃｏｎｙｚｏｉｄｅｓ
Ｄａｌ ０：降香黄檀×奥氏黄檀 Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ × Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｌｉｖｅｒｉ；Ｄａｌ １：降香黄檀×大果紫檀 Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ × Ｐｔｅｒｏｃａｒｐｕｓ ｍａｃａｒｏｃａｒｐｕｓ；Ｄａｌ
２：降香黄檀×檀香 Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ×Ｓａｎｔａｌｕｍ ａｌｂｕｍ Ｌ．；Ｄａｌ ３：降香黄檀×母生 Ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ×Ｈｏｍａｌｉｕｍ ｈａｉｎａｎｅｎｓｅ Ｇａｇｎｅｐ．
２．２ 研究方法
２．２．１ 土壤理化性质与酶活的测定
土壤含水量采用 ＴＺＳ⁃ＩＷ型土壤水分温度测量仪现场测定；土壤 ｐＨ值采用 １ ｍｏｌ ／ Ｌ ＫＣｌ浸提用 ｐＨ计进
行测定；土壤有机质采用水合热重铬酸钾⁃硫酸⁃比色法；土壤全氮含量测定采用半微量凯式定氮法；土壤有效
磷含量采用 ＮａＨＣＯ３浸提，全自动间断化学分析仪测定；土壤有效钾含量测定采用火焰光度法［１６］。
土壤过氧化氢酶活性的测定采用高锰酸钾滴定法（０．１ｍｏｌ ／ Ｌ 高锰酸钾 ｍＬ－１）；土壤多酚氧化酶的测定采
用邻苯三酚比色法；土壤脲酶活性的测定采用苯酚钠⁃次氯酸钠比色法［１７⁃１８］。
２．２．２ 土壤总 ＤＮＡ的提取与测序
使用 Ｅ． Ｚ． Ｎ． Ａ ｓｏｉｌ ＤＮＡ 土壤 ＤＮＡ 提取试剂盒 （ ＯＭＥＧＡ ） 提取土壤总 ＤＮＡ， 以 ３３８Ｆ （ ５′⁃
ＡＣＴＣＣＴＡＣＧＧＧＡＧＧＣＡＧＣＡ⁃３′）为正向引物， ８０６Ｒ （ ５′⁃ＧＧＡＣＴＡＣＨＶＧＧＧＴＷＴ ＣＴＡＡＴ⁃３′）为反向引物［１９］。
ＰＣＲ反应体系如下，共 ２０ μＬ：５×ＦａｓｔＰｆｕ Ｂｕｆｆｅ ４ μＬ，２．５ ｍｍｏｌ ／ Ｌ ｄＮＴＰｓ，２ μＬ；Ｆｏｒｗａｒｄ Ｐｒｉｍｅｒ（５ μｍｏｌ ／ Ｌ），
０．４μＬ；Ｒｅｖｅｒｓｅ Ｐｒｉｍｅｒ（５ μｍｏｌ ／ Ｌ），０．４ μＬ；ＦａｓｔＰｆｕ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ，０．４ μＬ；Ｔｅｍｐｌａｔｅ ＤＮＡ，１０ ｎｇ；补充 ｄｄＨ２Ｏ 至
２０ μＬ。 ＰＣＲ反应条件为：１×（９５ ℃，２ ｍｉｎ）；２５×（９５ ℃，３０ ｓ；５５ ℃，３０ ｓ；７２ ℃，４５ ｓ；７２ ℃，１０ ｍｉｎ）；４℃ 保
存。 每个样品取 ３ μＬ，进行检测（１％琼脂条凝胶电泳），每个样品 ３个重复将同一样品的 ＰＣＲ 产物混合后用
２％琼脂糖凝胶电泳检测，使用 ＡｘｙＰｒｅｐＤＮＡ 凝胶回收试剂盒（ＡＸＹＧＥＮ 公司）切胶，回收 ＰＣＲ 产物，Ｔｒｉｓ⁃ＨＣｌ
９１１８ ２４期 杨菁 等：降香黄檀不同混交林土壤细菌多样性差异分析
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
洗脱；２％琼脂糖电泳检测。 之后进行荧光定量，Ｍｉｓｅｑ文库构建及 Ｍｉｓｅｑ测序。
２．２．３ 数据处理
Ｍｉｓｅｑ测序得到的 ＰＥ ｒｅａｄｓ首先根据 ｏｖｅｒｌａｐ关系进行拼接，同时对序列质量进行质控和过滤，区分样品
后进行 ＯＴＵ聚类分析和物种分类学分析。 基于 ＯＴＵ聚类分析的结果，对 ＯＴＵ进行多种多样性指数分析。
２．２．４ 数据分析
采用 Ｍｏｔｈｕｒ等软件对获得的数据进行分类分析和多样性计算；通过 Ｒ 软件对初始结果进行相对丰度制
图；利用 ＳＰＳＳ １９进行方差分析（Ｄｕｎｃａｎ）及相关性分析（Ｐｅａｒｓｏｎ），利用 Ｃａｎｏｃｏ ｆｏｒ ｗｉｎｄｏｗｓ ４．５ 进行冗余
分析。
３ 结果与分析
３．１ 土壤理化性质与土壤酶活性
不同样地的土壤理化、酶活分析结果见表 ２，样地的土壤类型主要属于酸性砂壤（ｐＨ均小于 ４．５），且不同
混交林土壤的 ｐＨ值存在极显著性差异（Ｐ＜０．００１），其中 Ｄａｌ ２和 Ｄａｌ ３ 的 ｐＨ 均值最低。 不同混交林土壤的
有机质、全氮、有效钾 ３个方面存在极显著的差异（Ｐ＜０．００１），其中 Ｄａｌ ２含量均最高，分别为 ２７．５９ ｍｇ ／ ｇ、０．８５
ｍｇ ／ ｋｇ和 ３７．４６ ｍｇ ／ ｋｇ。 ４个样地土壤的有效磷含量存在极显著性差异（Ｐ 值均小于 ０．００１），其中 Ｄａｌ １ 含量
最高，为 ６．０４ｍｇ ／ Ｋｇ。 酶活方面，过氧化氢酶和多酚氧化酶（Ｐ＝ ０．０３２）存在显著性差异（Ｐ ＝ ０．０１７），脲酶存在
极显著性差异（Ｐ＜０．００１）。
表 ２ 不同样地的理化性质及酶活的单因素方差分析
Ｔａｂｌｅ ２ Ｔｈｅ ＡＮＯＶＡ ｏｆ ｐｈｙｓｉｃｏ⁃ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ａｎｄ ｅｎｚｙｍａｔｉｃ ａｃｔｉｖｉｔｙ ｉｎ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｓａｍｐｌｅ ｐｌｏｔｓ
样地
Ｐｌｏｔ
含水量
Ｍｏｉｓｔｕｒｅ
ｃｏｎｔｅｎｔ ／
％
ｐＨ
有机质
Ｏｒｇａｎｉｃ
ｍａｔｔｅ ／
（ｇ ／ ｋｇ）
全氮
Ｔｏｔａｌ Ｎ ／
（ｍｇ ／ ｇ）
有效钾
Ａｖａｉｌａｂｌｅ Ｋ ／
（ｍｇ ／ ｋｇ）
有效磷
Ａｖａｉｌａｂｌｅ Ｐ ／
（ｍｇ ／ ｋｇ）
过氧化氢酶
Ｃａｔａｌａｓｅ ／
（ｍｌ ／ ｇ）
脲酶
Ｕｒｅａｓ ／
（ｍｇ ／ ｇ）
多酚氧化酶
Ｐｏｌｙｐｈｅｎｏｌ
ｏｘｉｄａｓｅ ／
（ｍｇ ／ ｇ）
Ｄａｌ ０ ４．２６±１．９２ａ ４．１８±０．０２ｂ １６．４０±０．８１ａ ０．５２±０．０５ａｂ ３４．２９±１．３６ａ ５．７３±０．０７ｂ ０．８６±０．７６ｂ ０．２０±０．１２ｂ ２．７９±０．６４ａｂ
Ｄａｌ １ ２．９６±２．１８ａ ４．４８±０．０４ｃ ７．０９±０．８１ｂ ０．４３±０．０１ａ ２９．４１±０．４１ｂ ６．０４±０．０１ｃ ０．７５±０．０７ａ ０．０１±０．０１ａ ４．１９±１．２３ｂ
Ｄａｌ ２ ５．２４±１．７６ａ ４．０３±０．０２ａ ２７．５９±１．６２ｃ ０．８５±０．０９ｃ ３７．４６±０．４６ｃ ５．８９±０．１９ｂｃ ０．７５±０．０７ａ ０．３２±０．５２ｃ １．８４±０．５２ａ
Ｄａｌ ３ ２．５２±１．４８ａ ４．０２±０．１９ａ １９．７５±０．２３ｄ ０．５５±０．０４ｂ ３２．１５±１．５２ｄ ５．１７±０．０３ａ ０．７７±０．６０ａ ０．２８±０．１８ｃ ２．６８±０．３５ａｂ
表 ３ １６ｓ 有效序列的数量及分布
Ｔａｂｌｅ ３ Ｔｈｅ ｎｕｍｂｅｒ ａｎｄ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｏｆ ｖａｌｉｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ １６ｓ
长度
Ｌｅｎｇｔｈ ／ （ｂｐ）
序列数
Ｎｏ． ｏｆ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ％
１—３００ ５ ０
３０１—４００ ３９ ０．０１
４０１—５００ ２９３６３０ ９９．９８
３．２ 土壤细菌多样性
３．２．１ 测序数据分析
通过 Ｍｉｓｅｑ高通量测序并优化后，４ 个样地共获得
２９３６７７条序列，总碱基数为 １２７５０４４０１ｂｐ，平均碱基长
度为 ４３４．１７ｂｐ，其中 ４０１—５００ｂｐ 的碱基占总序列数的
９９．９８％，如表 ３所示。
采用对测序获得的序列进行随机抽样的方法，以抽
到的序列数与它们所代表的 ＯＴＵ数目构建稀释性曲线（图 １），从图中可以看出，４ 个样地的稀释性曲线均趋
于平坦，表明测序数据合理，更多的测序数据对发现新的 ＯＴＵ贡献率较小。
３．２．２ 土壤细菌群落结构分析
在相似水平为 ９７％的条件下，通过与 Ｓｌｉｖａ 数据库对比，对序列进行归类分析［２０⁃２１］。 结果表明，变形菌门
（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、酸杆菌门（Ａｃｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａ）、放线菌门（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、绿弯菌门（Ｃｈｌｏｒｏｆｌｅｘｉ）和厚壁菌门
（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）这 ５个菌门为主要菌群（图 ２）所示。
对不同样地中相对丰度超过 １％的菌群进行单因素方差分析（表 ４），结果表明，变形菌门、酸杆菌门、放线
菌门、绿弯菌门、厚壁菌门、疣微菌门、蓝藻菌门和浮霉菌门在降香黄檀不同混交模式中分布比较均匀，不存在
０２１８ 生 态 学 报 ３５卷
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
图 １ 不同样地土壤细菌 ＯＴＵ稀释曲线
Ｆｉｇ． １ ＯＴＵ ｒａｒｅｆａｃｔｉｏｎ ｃｕｒｖｅｓ ｏｆ ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａ ｉｎ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｐｌｏｔｓ
显著性差异。 而厚壁菌门（Ｐ ＝ ０．００３）、拟杆菌门（Ｐ ＝
０．０２６）和芽单胞菌门（Ｐ ＝ ０．０１９）在各样地间存在显著
性差异， Ｄａｌ １中这 ３ 个菌门的相对丰度均高于其他 ３
个样地。
为了更加深入的了解降香黄檀不同混交林中土壤
细菌群落结构的分布及差异，去除以上的 １０ 个相对丰
度超过 １％的菌群后，对剩余菌群作了相对丰度分析
（图 ３ ）。 单因素方差分析结果表明， 装甲菌门
（Ａｒｍａｔｉｍｏｎａｄｅｔｅｓ ）、 绿 菌 门 （ Ｃｈｌｏｒｏｂｉ ）、 迷 踪 菌 门
（Ｅｌｕｓｉｍｉｃｒｏｂｉａ）、纤维杆菌门（Ｆｉｂｒｏｂａｃｔｅｒｅｓ）、硝化螺旋
菌门（Ｎｉｔｒｏｓｐｉｒａｅ）和热袍菌门（Ｔｈｅｒｍｏｔｏｇａｅ）在降香黄
檀不同混交模式中存在差异（表 ５）。 其中，纤维杆菌门
（Ｐ＝ ０．００２）和热袍菌门（Ｐ ＝ ０．００２）在不同样地间存在
极显著性差异，装甲菌门（Ｐ ＝ ０．０４）和迷踪菌门（Ｐ ＝
０．０５）在不同样地间存在显著性差异。 相较于 ４ 个样
地，纤维杆菌门在 Ｄａｌ ２中最多，而不存在于 Ｄａｌ ３中。 热袍菌门在 Ｄａｌ ０ 中最多，在其他 ３ 个样地中无差异。
装甲菌门和迷踪菌门在 Ｄａｌ １中最少，在其他样地中无差异。
图 ２ 不同样地土壤细菌的群落结构
Ｆｉｇ． ２ Ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ ｏｆ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｓａｍｐｌｅ ｐｌｏｔｓ
３．２．３ 土壤细菌群落结构多样性分析
通过对各样地进行多样性的计算，并通过 ＳＰＳＳ进行单因素方差分析（表 ６）。 ４个样地间，ａｃｅ（Ｐ＝ ０．０１３）
和 ｃｈａｏ（Ｐ＝ ０．０２）指数具有显著性差异，而 ｓｈａｎｎｏｎ（Ｐ＝ ０．１３３）和 ｓｉｍｐｓｏｎ（Ｐ＝ ０．４１）指数无显著性差异。 其中
Ｄａｌ ３的 ａｃｅ和 ｃｈａｏ指数均低于其他样地。
１２１８ ２４期 杨菁 等：降香黄檀不同混交林土壤细菌多样性差异分析
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
表 ４ 不同样地细菌主要菌群相对丰度的单因素方差分析
Ｔａｂｌｅ ４ Ｔｈｅ ＡＮＯＶＡ ｏｆ ｒｅｌａｔｉｖｅ ａｂｕｎｄａｎｃｅ ｏｆ ｄｏｍｉｎａｔｅ ｂａｃｔｅｒｉａ ｉｎ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｓａｍｐｌｅ ｐｌｏｔｓ
分类 Ｔａｘｏｎ
相对丰度 Ｒｅｌａｔｉｖｅ ａｂｕｎｄａｎｃｅｓ ／ ％
Ｄａｌ ０ Ｄａｌ １ Ｄａｌ ２ Ｄａｌ ３
变形菌门 Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ ３０．０±２．７ａ ３０．８±４．７ａ ３３．７±７．６ａ ３５．２±１．７ａ
酸杆菌门 Ａｃｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａ ２５．０±１．５ａ ２０．８±３．４ａ ２０．２±０．６ａ ２４．３±１．２ａ
放线菌门 Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ １３．５±０．４ａ １２．５±３．０ａ １２．８±３．０ａ １３．７±０．７ａ
厚壁菌门 Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ ５．０±０．４ａ １０．４±１．２ｂ ３．７±１．１ｂｃ ２．４±０．３ｃ
浮霉菌门 Ｐｌａｎｃｔｏｍｙｃｅｔｅｓ １．１±０．４ａ １．０±１．０ａ ２．８±１．８ａ １．９±０．６ａ
绿弯菌门 Ｃｈｌｏｒｏｆｌｅｘｉ １６．３±３．７ａ ８．３±１．３ａ １４．０±５．６ａ ８．９±０．３ａ
疣微菌门 Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ ２．２±０．８ａ ２．５±２．２ａ ４．７±３．２ａ ４．３±１．３ａ
蓝藻菌门 Ｃｙａｎｏｂａｃｔｅｒｉａ ２．０±０．２ａ ２．３±１．１ａ ２．６±１．３ａ ２．９±１．１ａ
拟杆菌门 Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ １．２±０．２ｂ ２．４±０．７ａ １．２±０．４ｂ １．７±０．３ｂ
芽单胞菌门 Ｇｅｍｍａｔｉｍｏｎａｄｅｔｅｓ １．１±０．５ｂ ２．６±０．５ａ １．３±０．２ｂ １．２±０．２ｂ
图 ３ 剩余菌群的群落结构
Ｆｉｇ． ３ Ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ ｏｆ ｒｅｊｅｃｔｉｎｇ ｒｅｌａｔｉｖｅ ａｂｕｎｄａｎｃｅ ｏｆ ｍｏｒｅ ｔｈａｎ １％
表 ５ 剩余菌群群落结构相对丰度的方差分析
Ｔａｂｌｅ ５ Ｔｈｅ ＡＮＯＶＡ ｏｆ ｒｅｊｅｃｔｉｎｇ ｒｅｌａｔｉｖｅ ａｂｕｎｄａｎｃｅ ｏｆ ｍｏｒｅ ｔｈａｎ １％
分类 Ｔａｘｏｎ
相对丰度 Ｒｅｌａｔｉｖｅ ａｂｕｎｄａｎｃｅｓ ／ ％
Ｄａｌ ０ Ｄａｌ １ Ｄａｌ ２ Ｄａｌ ３
装甲菌门 Ａｒｍａｔｉｍｏｎａｄｅｔｅｓ ３．６±０．１ａｂ １．２±０．７ａ ５．７±０．６ｂ ５．７±１．９ｂ
衣原体门 Ｃｈｌａｍｙｄｉａｅ ８．１±４．１ａ １３．０±６．７ａ ９．６±２．７ａ １８．７±２．０ａ
绿菌门 Ｃｈｌｏｒｏｂｉ ２．２±０．６ａｂ １．７±０．０ａ ２．５±０．７ａｂ ４．４±１．６ｂ
迷踪菌门 Ｅｌｕｓｉｍｉｃｒｏｂｉａ ９．３±０．４ｂ ３．０±０．５ａ ６．６±３．０ａｂ ７．９±０．２ｂ
纤维杆菌门 Ｆｉｂｒｏｂａｃｔｅｒｅｓ ０．２±０．０ｂ ２．２±０．５ａ ０．１±０．１ｂ ０ ｂ
硝化螺旋菌门 Ｎｉｔｒｏｓｐｉｒａｅ １４．３±２．１ａｂ ２３．８±５．６ｂ １４．６±６．８ａｂ ８．３±１．７ａ
热袍菌门 Ｔｈｅｒｍｏｔｏｇａｅ １３．２±１．２ａ ３．２±０．５ｂ ５．８±１．４ｂ ３．９±０．８ｂ
候选门 Ｃａｎｄｉｄａｔｅ＿ｄｉｖｉｓｉｏｎ ３５．１±２．５ａ ３５．７±２．０ａ ３４．４±１３．７ａ ３５．９±２．７ａ
未分类 Ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ ６．９±０．１ａ ４．３±０．２ａ ７．４±３．２ａ ４．２±０．９ａ
其他 Ｏｔｈｅｒｓ ７．１±３．３ａ １２．２±３．１ａ １３．３±４．６ａ １１．６±１．４ａ
２２１８ 生 态 学 报 ３５卷
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
表 ６ 各样地细菌群落的多样性分析（相似度为 ９７％）
Ｔａｂｌｅ ６ Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｉｎｄｅｘ ｏｆ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ ｏｆ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｓａｍｐｌｅ ｐｌｏｔｓ （Ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ ｉｓ ９７％）
样地 Ｐｌｏｔ 序列数 Ｒｅａｄｓ ＯＴＵ
多样性指数 Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｉｎｄｅｘ
ａｃｅ ｃｈａｏ ｓｈａｎｎｏｎ ｓｉｍｐｓｏｎ
Ｄａｌ ０ ３１３２２±１１０４７ａ １７０２．５±９２．６ａ １９２８．５±５１．６ｂ １９５９．５±３０．４ｂ ６．１２±０．０５ａｂ ０．００５８±０．０００１ａ
Ｄａｌ １ ２４５０２±５８８８ａ １７４０．０±１．４ａ １９３９．０±１１．３ｂ １９７４．５±１２．０ｂ ６．３８±０．０６ｂ ０．００４３±０．０００３ａ
Ｄａｌ ２ ３４９３３±７０２８ａ １７２０．０±２８．３ａ １９６７．５±７．８ｂ １９７５．０±１４．１ｂ ６．０８±０．２１ａｂ ０．００６１±０．０００２ａ
Ｄａｌ ３ ３２３６３±１０６４１ａ １６９０．４±８０．１ａ １７９７．０±１７．０ａ １８０３．０±７．１ａ ６．０５±０．０６ａｂ ０．００６±０．０００３ａ
３．２．４ 土壤细菌群落结构与土壤性质的关系
冗余分析（ＲＤＡ）主要应用于分析影响生物［２２］、植被［２３］、景观分布［２４］的关键环境因子。 ＲＤＡ分析能够有
效的对多个环境指标进行统计学检验，经过一系列的转换、筛选，能够有效的简化变量个数，为进一步研究的
分析创造条件［２２］。
本次试验分析了土壤细菌主要菌群和非主要菌群与土壤性质的 ＲＤＡ 排序图，第一轴可以解释所有信息
的 ５２．０％，第二轴可以解释 ３４．１％（图 ４）。 经 Ｃａｎｏｃｏ的 ｆｏｒｗａｒｄ 分析表明，ｐＨ 值、脲酶、多酚氧化酶和有机质
对土壤细菌群落结构的影响最为显著，影响程度为：ｐＨ值＞ 脲酶 ＞ 多酚氧化酶 ＞ 有机质。 从图中可以看出，
受此四种因子影响较为显著的菌群有：迷踪菌门、浮霉菌门、装甲菌门、厚壁菌门、硝化螺旋菌门、纤维杆菌门
和芽单胞菌门。 分析四个样地间的欧几里德距离，可以看出 Ｄａｌ １ 的细菌群落结构与其他 ３ 个样地差异较
大，Ｄａｌ ０、Ｄａｌ １与 Ｄａｌ ３也具有较大差异，相较之下，Ｄａｌ ２与 Ｄａｌ ３的群落结构差异较小。
图 ４ 土壤菌群与土壤性质的 ＲＤＡ分析
Ｆｉｇ． ４ Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｆｒｏｍ ＲＤＡ ｔｏ ｅｘｐｌｏｒｅ ｔｈｅ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｂｅｔｗｅｅｎ ｂａｃｔｅｒｉａ ａｎｄ ｓｏｉｌ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ
Ｐｒｏｔｅｏｂａ： 变形菌门， Ａｃｉｄｏｂａｃ： 酸杆菌门，Ａｃｔｉｎｏｂａ： 放线菌门，Ｆｉｒｍｉｃｕｔ： 厚壁菌门，Ｐｌａｎｃｔｏｍ： 浮霉菌门，Ｃｈｌｏｒｏｆｌ： 绿弯菌门，Ｖｅｒｒｕｃｏｍ： 疣微
菌门，Ｃｙａｎｏｂａｃ： 蓝藻菌门， Ｂａｃｔｅｒｏｉ： 拟杆菌门， Ｇｅｍｍａｔｉｍ： 芽单胞菌门， Ａｒｍａｔｉｍｏ： 装甲菌门， Ｃｈｌａｍｙｄｉ： 衣原体门， Ｅｌｕｓｉｍｉｃ： 迷踪菌门，
Ｆｉｂｒｏｂａｃ： 纤维杆菌门， Ｎｉｔｒｏｓｐｉ： 硝化螺旋菌门， Ｔｈｅｒｍｏｔｏ： 热袍菌门， Ｃｈｌｏｒｏｂｉ： 绿菌门，Ｃａｎｄｉｄａｔ： 候选门， ＯＭ： 有机质，ＭＣ： 含水量， ＴＮ：
全氮， ＡＰ： 有效磷， ＡＫ： 有效钾， ＰＰＯ：多酚氧化酶
３．２．５ 细菌群落结构的多样性分析及其与土壤理化的相关性
经过 ＳＰＳＳ分析计算样地土壤性质与细菌多样性指数的相关性（表 ７），结果表明过氧化氢酶与细菌多样
性指数无显著相关；有效磷与 ａｃｅ指数、ｃｈａｏ指数呈显著正相关； ｐＨ 值、有效磷、多酚氧化酶与 ｓｈａｎｎｏｎ 指数
呈显著正相关，与 ｓｉｍｐｓｏｎ指数呈显著负相关；有机质、全氮、有效钾、脲酶与 ｓｈａｎｎｏｎ 指数呈显著负相关，与
ｓｉｍｐｓｏｎ指数呈显著正相关。 其中，ｐＨ值、有机质、脲酶和多酚氧化酶与 ｓｈａｎｎｏｎ 指数和 ｓｉｍｐｓｏｎ 指数的相关
３２１８ ２４期 杨菁 等：降香黄檀不同混交林土壤细菌多样性差异分析
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
性为极显著，说明土壤细菌的多样性主要受该 ４个指标的影响。
表 ７ 土壤理化、酶活与细菌多样性的相关性分析
Ｔａｂｌｅ ７ Ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｍｏｎｇ ｐｈｙｓｉｃｏ⁃ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ， ｅｎｚｙｍａｔｉｃ ａｃｔｉｖｉｔｙ ａｎｄ ｂａｃｔｅｒｉａ
指标
Ｉｎｄｅｘ
ａｃｅ
指数
ａｃｅ
ｉｎｄｅｘ
ｃｈａｏ
指数
ｃｈａｏ
ｉｎｄｅｘ
ｓｈａｎｎｏｎ
指数
ｓｈａｎｎｏｎ
ｉｎｄｅｘ
ｓｉｍｐｓｏｎ
指数
ｓｉｍｐｓｏｎ
ｉｎｄｅｘ
含水量
Ｍｏｉｓｔｕｒｅ
ｃｏｎｔｅｎｔ
ｐＨ值
ｐＨ
有机质
Ｏｒｇａｎｉｃ
ｍａｔｔｅ
全氮
Ｔｏｔａｌ
Ｎ
有效钾
Ａｖａｉｌａｂｌｅ
Ｋ
有效磷
Ａｖａｉｌａｂｌｅ
Ｐ
过氧化
氢酶
Ｃａｔａｌａｓｅ
脲酶
Ｕｒｅａｓｅ
多酚
氧化酶
Ｐｏｌｙｐｈｅｎｏｌ
ｏｘｉｄａｓｅ
ａｃｅ指数
ａｃｅ ｉｎｄｅｘ １
ｃｈａｏ指数
ｃｈａｏ ｉｎｄｅｘ ０．９７４
∗∗ １
ｓｈａｎｎｏｎ指数
ｓｈａｎｎｏｎ ｉｎｄｅｘ ０．４５５ ０．５１５ １
ｓｉｍｐｓｏｎ指数
ｓｉｍｐｓｏｎ ｉｎｄｅｘ
－０．２７３ －０．３３２ －０．９７６∗∗ １
含水量
Ｍｏｉｓｔｕｒｅ ｃｏｎｔｅｎｔ ０．５８６
∗ ０．５６５ －０．３０８ ０．４３１ １
ｐＨ ０．４４２ ０．４５９ ０．９７５∗∗ －０．９６６∗∗ －０．３２９ １
有机质
Ｏｒｇａｎｉｃ ｍａｔｔｅ
－０．２１５ －０．２０３ －０．８８４∗∗ ０．９０９∗∗ ０．５９４∗ －０．９２８∗∗ １
全氮
Ｔｏｔａｌ Ｎ ０．０８７ ０．１４７ －０．５７９
∗ ０．６３９∗ ０．７７６∗∗ －０．６６１∗ ０．８５１∗∗ １
有效钾
Ａｖａｉｌａｂｌｅ Ｋ ０．１５９ ０．１２４ －０．６８９
∗ ０．７５２∗∗ ０．８４９∗∗ －０．７０２∗ ０．８５９∗∗ ０．８５２∗∗ １
有效磷
Ａｖａｉｌａｂｌｅ Ｐ ０．８３８
∗∗ ０．８６７∗∗ ０．６５８∗ －０．５５０ ０．４７３ ０．６２４∗ －０．３５８ ０．００９ ０．０３４ １
过氧化氢酶
Ｃａｔａｌａｓｅ ０．１４６
－０．０４３ －０．２１２ ０．２２４ ０．０９８ －０．０７０ －０．０５１－．１６１ ０．２１７ －０．０３４ １
脲酶 Ｕｒｅａｓｅ －０．４１７ －０．４０２ －０．８９０∗∗ ０．８６１∗∗ ０．４４０ －０．９１９∗∗ ０．９３５∗∗ ０．８０８∗∗ ０．７５０∗∗ －０．４８８ －０．０２８ １
多酚氧化酶
Ｐｏｌｙｐｈｅｎｏｌ
ｏｘｉｄａｓｅ
０．２０９ ０．２３０ ０．７３８∗∗ －０．７２４∗∗ －０．５３６ ０．７６５∗∗－０．７９０∗∗ －０．７４３∗∗ －０．７２０∗∗ ０．２６５ －０．１３５ －０．８２４∗∗ １
４ 讨论
混交林不仅对林地的温度、水分有所改善，而且增添了更为丰富的植物枯落物，从而增加了土壤的营养
物，提高土壤通透性，增强保水能力，并且能够增加土壤微生物的数量和土壤酶活，到达提高林地土壤肥力的
效果［２５］。
本课题组之前使用传统的方法研究了降香黄檀混交林土壤微生物的分布、数量，已证明降香黄檀混交林
的土壤微生物多样性优于纯林。 本次试验在此基础上，根据试验样地的实际情况，选择立地条件基本一致的
降香黄檀混交林进行研究。
４．１ 土壤理化性质
４种混交林土壤的含水量偏低，这主要是由于所选样地的土壤属于砂壤，保水能力差，且采样前半个月处
于干旱状态，造成了土壤含水量总体偏低，４个样地在含水量上无显著性差异。
土壤 ｐＨ值是影响土壤微生物群落结构的重要因素之一，ｐＨ值的变化对土壤的有机质分解与合成，Ｎ、Ｐ、
Ｋ营养元素的合成与转化有着重要的作用［２６］。 在此次四种混交模式中， Ｄａｌ １的 ｐＨ值最高，其次是 Ｄａｌ ０，而
Ｄａｌ ２和 Ｄａｌ ３ 在 ｐＨ值方面无显著性差异。
有机质含量与土壤肥力存在着密切的关系，有机质为植物提供了一定有营养物质，促进了植物的生长发
育，同时可改变土壤的物理性质，促进土壤微生物的活动［２７］。 本研究中，可能由于与混交林不同树种的生长
４２１８ 生 态 学 报 ３５卷
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
习性、落叶和分泌物不同，造成了土壤有机质含量的差别。 相关性分析表明，有机质与土壤含水量存在显著的
正相关，这可能是由于土壤有机质自身能够吸收、保持一定的水分，当有机质含量增多时，土壤中有机胶体的
含量也增多［２８］，另一方面有机质多的土壤团粒结构多，并且含有大量的毛管孔隙，可吸收并保持水分，从而导
致土壤的含水量增多。 但总体来看，四个样地的有机质含量也偏低，这也与土壤类型有很大的关系。
土壤中的全氮、有效磷、有效钾是衡量土壤氮素、磷素和钾素供应状况的重要指标，在此次试验中，四种混
交模式的全氮、有效钾的变化趋势与有机质变化趋势相同，与有机质呈正相关。 这可能与氮元素和钾元素在
土壤中存在的形式有关系。
在土壤酶活性方面，过氧化氢酶能在一定程度上反应出土壤微生物的强度［２９］，实验结果表明，在四个混
交模式中，土壤微生物强度无显著性差异。 脲酶能促进土壤中有机质分子的水解，而多酚氧化酶则是促进土
壤中的芳香族化合物转化为腐殖质［２５］，因而研究结果与理论相符，脲酶与多酚氧化酶呈极显著的负相关，有
机质与脲酶呈极显著正相关，与多酚氧化酶呈极显著负相关，与熊汉锋［３０］，田昆［３１］和 Ｂｅｒｉ［３２］的研究结果相
一致。
４．２ 土壤细菌群落结构
在本研究中发现，四种降香黄檀混交林共存在 １８ 个细菌门的分类。 其中，变形菌门、酸杆菌门、放线菌
门、绿弯菌门和厚壁菌门为四种混交模式中的主要菌群，而绿菌门、厚壁菌门、硝化螺旋菌门、拟杆菌门、芽单
胞菌门、纤维杆菌门、热袍菌门、装甲菌门和迷踪菌门 ９ 个菌门在 ４ 种混交模式中的相对丰度存在显著性差
异，这可能是由于不同树种的生长代谢及根系分泌物不同，引起了土壤理化性质的发生不同程度的改变，导致
了菌群的差异。
多样性分析 ａｃｅ指数表明细菌群落的 ＯＴＵ数目的种类为：Ｄａｌ ２ ＞ Ｄａｌ １ ＞ Ｄａｌ ０ ＞ Ｄａｌ ３；ｃｈａｏ指数表明各
样地细菌的物种总数为：Ｄａｌ ２ ＞ Ｄａｌ １ ＞ Ｄａｌ ０ ＞ Ｄａｌ ３。 结合土壤理化性质分析，Ｄａｌ ２ 在有机质、全氮、有效
磷、有效钾方面含量均最高，说明了降香黄檀与檀香混交，能够提高土壤的肥力，丰富土壤细菌群落结构。 反
之，降香黄檀与母生混交土壤的理化、酶活均最低，且 ＯＴＵ数目和细菌物种总数也最低。
４．３ 土壤细菌多样性及其与土壤性质的关系
根据 ｓｈａｎｎｏｎ指数和 ｓｉｍｐｓｏｎ指数，可以看出各样地细菌群落的多样性为：Ｄａｌ １ ＞ Ｄａｌ ０ ＞ Ｄａｌ ２ ＞ Ｄａｌ ３。
也就是说，虽然 Ｄａｌ ２的细菌物种总数多，但是多样性却不如 Ｄａｌ １，Ｄａｌ ０。 可能是因为与降香黄檀混交树种
中，Ｄａｌ １中的大果紫檀和 Ｄａｌ ０中的奥氏黄檀属于豆科，树种本身具有固氮能力，可以为更多种类的微生物提
供更好的生长环境。 而 Ｄａｌ ２中的檀香，其自身不能健康生长，需依靠根上的吸盘从假蒿、山毛豆、降香黄檀
处吸取营养和水分，虽然有豆科植物山毛豆作为伴生树，但绝大部分营养成分供檀香生长。 从实验结果来看，
这 ３个样地的多样性都优于 Ｄａｌ ３，这也说明了固氮植物能够提高土壤细菌的多样性。
通过分析理化性质与细菌多样性系数的相关性，结果表明与土壤细菌多样性 ｓｈａｎｎｏｎ 指数和 ｓｉｍｐｓｏｎ 指
数有极显著相关的理化性质为 ｐＨ值、有机质，酶活为脲酶和多酚氧化酶，与之前的研究结果一致［３３］，也有研
究表明，在门的分类水平上，ｐＨ值、有机质能强烈的影响微生物菌群［８，３４］。 说明土壤 ｐＨ 值影响着土壤菌群
群落的代谢活动，从而引起土壤有机质和酶活的变化，而这些变化又进一步影响土壤细菌的群落结构。
４．４ 土壤细菌群落结构与降香黄檀混交林
４种降香黄檀混交林中，降香黄檀×大果紫檀、降香黄檀×檀香、降香黄檀×奥氏黄檀对土壤的改良效果较
好，而降香黄檀×母生效果最差。
从冗余分析中可知，厚壁菌门、纤维杆菌门和硝化螺旋菌门与 ｐＨ呈正相关，说明此 ３ 类菌门的生长代谢
能够影响土壤的 ｐＨ。 ４个样地中，降香黄檀×大果紫檀混交林土壤的 ｐＨ值最高，此 ３种菌群的相对丰度也最
高，表明降香黄檀×大果紫檀能够改善土壤酸化状况。
迷踪菌门与土壤脲酶、全氮、有机质也呈正相关，表明该菌门在有机质、氮素等的转化过程中扮演了重要
角色，且降香黄檀×檀香土壤中的有机质、全氮、有效钾和脲酶含量最高，说明降香黄檀×檀香能够改善土壤贫
５２１８ ２４期 杨菁 等：降香黄檀不同混交林土壤细菌多样性差异分析
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
瘠的状况，提高土壤肥力。
绿弯菌门、热袍菌门与含水量、过氧化氢酶呈正相关，且此两种菌门在降香黄檀×奥氏黄檀混交模式中相
对丰度最高，说明降香黄檀×奥氏黄檀能够提高土壤的蓄水能力，降低过氧化物对生物体造成的伤害。
５ 结论
（１）降香黄檀不同混交模式土壤理化性质、酶活均存在不同程度的差异。 其中降香黄檀与檀香混交林土
壤的含水量、有机质、全氮、有效钾、脲酶高于其他样地。 降香黄檀与大果紫檀混交林土壤的 ｐＨ 值、有效磷、
多酚氧化酶高于其他样地。
（２）高通量测序技术的结果表明，４ 种不同模式降香黄檀混交林的土壤细菌的丰富度为：降香黄檀×檀
香 ＞ 降香黄檀×大果紫檀 ＞ 降香黄檀×奥氏黄檀 ＞ 降香黄檀×母生；各样地的土壤细菌多样性为：降香黄檀×
大果紫檀 ＞ 降香黄檀×奥氏黄檀 ＞ 降香黄檀×檀香 ＞ 降香黄檀×母生。
（３）４种降香黄檀混交林土壤细菌群落结构的分布及多样性主要受 ｐＨ 值、有机质、脲酶和多酚氧化酶的
影响。
参考文献（Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅｓ）：
［ １ ］ Ｋａｓｃｈｕｋ Ｇ， Ａｌｂｅｒｔｏｎ Ｏ， Ｈｕｎｇｒｉａ Ｍ． Ｑｕａｎｔｉｆｙｉｎｇ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ ｌａｎｄ ｕｓｅｓ ｏｎ ｓｏｉｌ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｂｉｏｍａｓｓ ａｎｄ ａｃｔｉｖｉｔｙ ｉｎ Ｂｒａｚｉｌｉａｎ
ｂｉｏｍｅｓ： ｉｎｆｅｒｅｎｃｅｓ ｔｏ ｉｍｐｒｏｖｅ ｓｏｉｌ ｑｕａｌｉｔｙ． Ｐｌａｎｔ ａｎｄ Ｓｏｉｌ， ２０１１， ３３８（１ ／ ２）： ４６７⁃４８１．
［ ２ ］ Ｚｈｏｕ Ｊ Ｚ， Ｘｉａ Ｂ Ｃ， Ｔｒｅｖｅｓ Ｄ Ｓ， Ｗｕ Ｌ Ｙ， Ｍａｒｓｈ Ｔ Ｌ， Ｏ′Ｎｅｉｌｌ Ｒ Ｖ， Ｐａｌｕｍｂｏ Ａ Ｖ， Ｔｉｅｄｊｅ Ｊ Ｍ． Ｓｐａｔｉａｌ ａｎｄ ｒｅｓｏｕｒｃｅ ｆａｃｔｏｒｓ ｉｎｆｌｕｅｎｃｉｎｇ ｈｉｇｈ
ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｉｎ ｓｏｉｌ． Ａｐｐｌｉｅｄ ａｎｄ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ， ２００２， ６８（１）： ３２６⁃３３４．
［ ３ ］ Ｆｒｏｍｉｎ Ｎ， Ｈａｍｅｌｉｎ Ｊ， Ｔａｒｎａｗｓｋｉ Ｓ， Ｒｏｅｓｔｉ Ｄ， Ｊｏｕｒｄａｉｎ⁃Ｍｉｓｅｒｅｚ Ｋ， Ｆｏｒｅｓｔｉｅｒ Ｎ， Ｔｅｙｓｓｉｅｒ⁃Ｃｕｖｅｌｌｅ Ｓ， Ｇｉｌｌｅｔ Ｆ， Ａｒａｇｎｏ Ｍ， Ｒｏｓｓｉ Ｐ． Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ
ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｄｅｎａｔｕｒｉｎｇ ｇｅｌ ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ （ＤＧＥ） ｆｉｎｇｅｒ ｐｒｉｎｔｉｎｇ ｐａｔｔｅｒｎｓ． Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ， ２００２， ４（１１）： ６３４⁃６４３．
［ ４ ］ Ｐｒａｋａｓｈ Ｔ， Ｔａｙｌｏｒ Ｔ Ｄ． Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ａｓｓｉｇｎｍｅｎｔ ｏｆ ｍｅｔａｇｅｎｏｍｉｃ ｄａｔａ： ｃｈａｌｌｅｎｇｅｓ ａｎｄ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ． Ｂｒｉｅｆｉｎｇｓ ｉｎ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ， ２０１２， １３（ ６）：
７１１⁃７２７．
［ ５ ］ Ｊｉａｎｇ Ｂ， Ｌｉａｎｇ Ｘ Ｊ， Ｃｈｅｎ Ｙ， Ｍａ Ｔ， Ｌｉｕ Ｌ Ｙ， Ｌｉ Ｊ Ｆ， Ｊｉａｎｇ Ｒ， Ｃｈｅｎ Ｔ， Ｚｈａｎｇ Ｘ Ｇ， Ｌｉ Ｓ． Ｉｎｔｅｇｒａｔｉｎｇ ｎｅｘｔ⁃ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎｄ ｔｒａｄｉｔｉｏｎａｌ
ｔｏｎｇｕｅ ｄｉａｇｎｏｓｉｓ ｔｏ ｄｅｔｅｒｍｉｎｅ ｔｏｎｇｕｅ ｃｏａｔｉｎｇ ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ． Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｒｅｐｏｒｔｓ， ２０１２， ２： ９３６⁃９３６．
［ ６ ］ 秦楠， 栗东芳， 杨瑞馥． 高通量测序技术及其在微生物学研究中的应用． 微生物学报， ２０１１， ５１（４）： ４４５⁃４５７．
［ ７ ］ 张彩霞． 新一代高通量测序技术研究土壤微生物群落结构对环境条件的响应［Ｄ］． 南京： 南京农业大学， ２０１２．
［ ８ ］ Ｆｉｅｒｅｒ Ｎ， Ｊａｃｋｓｏｎ Ｒ Ｂ． Ｔｈｅ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎｄ ｂｉｏｇｅｏｇｒａｐｈｙ ｏｆ ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｉｅｓ． Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｕｎｉｔｅｄ
Ｓｔａｔｅｓ ｏｆ Ａｍｅｒｉｃａ， ２００６， １０３（３）： ６２６⁃６３１．
［ ９ ］ 邱治军， 周光益， 陈升华． 海南特有珍贵红木树种———降香黄檀． 林业实用技术， ２００４， （６）： ４１⁃４２．
［１０］ 梁建平． 广西珍稀濒危树种． 南宁： 广西科学技术出版社， ２００１： ２２４⁃２２５．
［１１］ 余敏． 降香黄檀与多裂黄檀木材 ＤＮＡ提取及其 ｒＤＮＡ⁃ＩＴＳ序列分析［Ｄ］． 合肥： 安徽农业大学， ２０１２．
［１２］ 杨新全， 冯锦东， 魏建和， 李榕涛， 何明军， 杨成民． 我国特有濒危药用植物降香黄檀遗传多样性研究． 世界科学技术———中医药现代
化， ２００７， ９（２）： ７３⁃７６．
［１３］ 伍庆均． 降香黄檀培育技术． 广东林业科技， ２０１４， ３０（１）： ７４⁃７７．
［１４］ 黄星． 降香黄檀籽黄酮的提取分离及生理活性研究［Ｄ］． 无锡： 江南大学， ２０１２．
［１５］ Ｚｈａｏ Ｘ Ｂ， Ｍｅｉ Ｗ Ｌ， Ｇｏｎｇ Ｍ Ｇ， Ｚｕｏ Ｗ Ｊ， Ｂａｉ Ｈ Ｇ， Ｄａｉ Ｈ Ｆ． Ａｎｔｉｂａｃｔｅｒｉａｌ ａｃｔｉｖｉｔｙ ｏｆ ｔｈｅ ｆｌａｖｏｎｏｉｄｓ ｆｒｏｍ ｄａｌｂｅｒｇｉａ ｏｄｏｒｉｆｅｒａ ｏｎ ｒａｌｓｔｏｎｉａ
ｓｏｌａｎａｃｅａｒｕｍ． Ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ， ２０１１， １６（１２）： ９７７５⁃９７８２．
［１６］ 刘鸿雁， 黄建国． 缙云山森林群落次生演替中土壤理化性质的动态变化． 应用生态学报， ２００５， １６（１１）： ２０４１⁃２０４６．
［１７］ 刘善江， 夏雪， 陈桂梅， 卯丹， 车升国， 李亚星． 土壤酶的研究进展． 中国农学通报， ２０１１， ２７（２１）： １⁃７．
［１８］ 毛志刚， 谷孝鸿， 刘金娥， 任丽娟， 王国祥． 盐城海滨湿地盐沼植被及农作物下土壤酶活性特征． 生态学报， ２０１０， ３０（１８）： ５０４３⁃５０４９．
［１９］ Ｐｅｒｅｉｒａ Ｌ Ｂ， Ｖｉｃｅｎｔｉｎｉ Ｒ， Ｏｔｔｏｂｏｎｉ Ｌ Ｍ Ｍ． Ｃｈａｎｇｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ ｏｆ ｓｏｉｌ ｆｒｏｍ ａ ｎｅｕｔｒａｌ ｍｉｎｅ ｄｒａｉｎａｇｅ ｃｈａｎｎｅｌ． Ｐｌｏｓ Ｏｎｅ， ２０１４， ９
（５）： ｅ９６６０５．
［２０］ 王圣洁， 刘君昂， 何苑皞， 周国英， 谭益民， 周洁尘． 基于焦磷酸测序的杉木人工林微型土壤动物多样性． 应用生态学报， ２０１４， ２５（６）：
１６６１⁃１６６８．
［２１］ 何苑皞， 周国英， 王圣洁， 李河． 杉木人工林土壤真菌遗传多样性． 生态学报， ２０１４， ３４（１０）： ２７２５⁃２７３６．
６２１８ 生 态 学 报 ３５卷
ｈｔｔｐ： ／ ／ ｗｗｗ．ｅｃｏｌｏｇｉｃａ．ｃｎ
［２２］ Ｎｏｂｅｓ Ｋ， Ｕｔｈｉｃｋｅ Ｓ， Ｈｅｎｄｅｒｓｏｎ Ｒ． Ｉｓ ｌｉｇｈｔ ｔｈｅ ｌｉｍｉｔｉｎｇ ｆａｃｔｏｒ ｆｏｒ ｔｈｅ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｏｆ ｂｅｎｔｈｉｃ ｓｙｍｂｉｏｎｔ ｂｅａｒｉｎｇ ｆｏｒａｍｉｎｉｆｅｒａ ｏｎ ｔｈｅ Ｇｒｅａｔ Ｂａｒｒｉｅｒ
Ｒｅｅｆ？． Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｍａｒｉｎｅ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｅｃｏｌｏｇｙ， ２００８， ３６３（１ ／ ２）： ４８⁃５７．
［２３］ Ｈｉｅｔｅｌ Ｅ， Ｗａｌｄｈａｒｄｔ Ｒ， Ｏｔｔｅ Ａ． Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ ｍｏｄｅｌｉｎｇ ｏｆ ｌａｎｄ⁃ｃｏｖｅｒ ｃｈａｎｇｅｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｋｅｙ ｓｏｃｉｏ⁃ｅｃｏｎｏｍｉｃ ｉｎｄｉｃａｔｏｒｓ． Ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ Ｅｃｏｎｏｍｉｃｓ， ２００７，
６２（３ ／ ４）： ４９６⁃５０７．
［２４］ Ｂｅｎｊａｍｉｎ Ｋ， Ｂｏｕｃｈａｒｄ Ａ， Ｄｏｍｏｎ Ｇ． Ａｂａｎｄｏｎｅｄ ｆａｒｍｌａｎｄｓ ａｓ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓ ｏｆ ｒｕｒａｌ ｌａｎｄｓｃａｐｅｓ： Ａｎ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｐｅｒｃｅｐｔｉｏｎｓ ａｎｄ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔａｔｉｏｎｓ．
Ｌａｎｄｓｃａｐｅ ａｎｄ Ｕｒｂａｎ Ｐｌａｎｎｉｎｇ， ２００７， ８３（４）： ２２８⁃２４４．
［２５］ 林先贵． 土壤微生物研究原理与方法． 北京： 高等教育出版社， ２０１０： ２４３⁃２６２．
［２６］ Ｎｄｏｕｒ Ｎ Ｔ Ｂ， Ａｃｈｏｕａｋ Ｗ， Ｃｈｒｉｓｔｅｎ Ｒ， Ｈｅｕｌｉｎ Ｔ， Ｂｒａｕｍａｎ Ａ， Ｃｈｏｔｔｅ Ｊ Ｌ． Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｈａｂｉｔａｔｓ ｉｎ ａ ｔｒｏｐｉｃａｌ ｓｏｉｌ ｓｕｂｊｅｃｔ ｔｏ
ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｆａｌｌｏｗ ｍａｎａｇｅｍｅｎｔ． Ａｐｐｌｉｅｄ Ｓｏｉｌ Ｅｃｏｌｏｇｙ， ２００８， ３８（１）： ５１⁃６１．
［２７］ 李志洪， 赵兰坡， 窦森． 土壤学． 北京： 化学工业出版社， ２００８： ８０⁃８５．
［２８］ 艾海舰． 土壤持水性及孔性的影响因素浅析． 干旱地区农业研究， ２００２， ２０（３）： ７５⁃７９．
［２９］ 戴万宏， 黄耀， 武丽， 俞佳． 中国地带性土壤有机质含量与酸碱度的关系． 土壤学报， ２００９， ４６（５）： ８５１⁃８６０．
［３０］ 熊汉锋， 黄世宽， 陈治平， 廖勤周， 谭启玲． 梁子湖湿地土壤酶初步研究． 生态环境， ２００６， １５（６）： １３０５⁃１３０９．
［３１］ 田昆， 陆梅， 常凤来， 莫剑锋， 黎良才， 杨永兴． 云南纳帕海岩溶湿地生态环境变化及驱动机制． 湖泊科学， ２００４， １６（１）： ３５⁃４２．
［３２］ Ｂｅｒｉ Ｖ， Ｂｒａｒ Ｓ Ｓ． Ｕｒｅａｓｅ ａｃｔｉｖｉｔｙ ｉｎ ｓｕｂｔｒｏｐｉｃａｌ， ａｌｋａｌｉｎｅ ｓｏｉｌｓ ｏｆ Ｉｎｄｉａ． Ｓｏｉｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ， １９７８， １２６（６）： ３３０⁃３３５．
［３３］ 张薇， 魏海雷， 高洪文， 胡跃高． 土壤微生物多样性及其环境影响因子研究进展． 生态学杂志， ２００５， ２４（１）： ４８⁃５２．
［３４］ Ｃｈｕ Ｈ， Ｆｉｅｒｅｒ Ｎ， Ｌａｕｂｅｒ Ｃ Ｌ， Ｃａｐｏｒａｓｏ Ｊ Ｇ， Ｋｎｉｇｈｔ Ｒ， Ｇｒｏｇａｎ Ｐ． Ｓｏｉｌ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｉｎ ｔｈｅ Ａｒｃｔｉｃ ｉｓ ｎｏｔ ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌｌｙ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｆｒｏｍ ｔｈａｔ
ｆｏｕｎｄ ｉｎ ｏｔｈｅｒ ｂｉｏｍｅｓ． Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ， ２０１０， １２（１１）： ２９９８⁃３００６．
７２１８ ２４期 杨菁 等：降香黄檀不同混交林土壤细菌多样性差异分析